近日，生物學(xué)家從博物館收藏的室溫保存的塔斯馬尼亞虎（袋狼）標(biāo)本中分離出了一個多世紀(jì)前的RNA分子并對其進(jìn)行了測序，這首次重建了一個已滅絕物種的皮膚和骨骼肌轉(zhuǎn)錄組。研究人員指出，他們的發(fā)現(xiàn)對國際上復(fù)活已滅絕物種（包括塔斯馬尼亞虎和長毛猛犸象）的努力以及研究導(dǎo)致大流行病的RNA病毒具有重要意義。

塔斯馬尼亞虎又稱袋狼，是一種歷史上的頂級食肉有袋類動物，曾經(jīng)分布于澳大利亞大陸和塔斯馬尼亞島。這種物種在歐洲殖民統(tǒng)治后最終滅絕，當(dāng)時它被宣布為農(nóng)業(yè)害獸，到1888年，每捕殺一只成年動物就會得到1英鎊的賞金。已知最后一只活著的塔斯馬尼亞虎于1936年死于塔斯馬尼亞霍巴特的博馬里斯動物園。

最近拯救滅絕物種的努力主要集中在塔斯馬尼亞虎身上，因為它在塔斯馬尼亞的自然棲息地大部分仍然保存完好，重新引進(jìn)它有助于恢復(fù)它最終消失后失去的生態(tài)系統(tǒng)平衡。然而，要重建一只功能正常的活體塔斯馬尼亞虎，不僅需要全面了解其基因組（DNA），還需要了解特定組織的基因表達(dá)動態(tài)和基因調(diào)控方式，而這些只有通過研究其轉(zhuǎn)錄組（RNA）才能實現(xiàn)。

科學(xué)生命實驗室的研究人員與瑞典自然歷史博物館和斯德哥爾摩大學(xué)合資成立的古遺傳學(xué)中心合作，最近在《基因組研究》雜志上發(fā)表了一項研究，該研究的第一作者埃米利奧·馬爾莫爾表示，復(fù)活塔斯馬尼亞虎或長毛猛犸象不是一件小事，需要深入了解這些著名物種的基因組和轉(zhuǎn)錄組調(diào)控，而這一切現(xiàn)在才剛剛開始揭示。

這項研究背后的研究人員首次對斯德哥爾摩瑞典自然歷史博物館室溫保存的130年前干燥的塔斯馬尼亞虎標(biāo)本的皮膚和骨骼肌組織的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測序。結(jié)果發(fā)現(xiàn)了組織特異性基因表達(dá)特征，與現(xiàn)存有袋動物和胎盤哺乳動物的基因表達(dá)特征相似。

恢復(fù)的轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量很高，可以識別肌肉和皮膚特異性蛋白質(zhì)編碼RNA，并根據(jù)MirGeneDB的建議對缺失的核糖體RNA和microRNA基因進(jìn)行注釋。

斯德哥爾摩大學(xué)溫納-格倫研究所分子生物科學(xué)系副教授馬克·弗里德蘭德和科學(xué)生命實驗室說：“這是我們第一次窺見一個多世紀(jì)前就已經(jīng)滅絕的、專門針對泰加動物的調(diào)控基因的存在。”

這項開創(chuàng)性的研究為探索全球各地博物館收藏的大量標(biāo)本和組織提供了新的機遇和意義，這些標(biāo)本和組織中的RNA分子可能正等待著我們?nèi)グl(fā)掘和測序。

斯德哥爾摩大學(xué)和古遺傳學(xué)中心的進(jìn)化基因組學(xué)教授洛夫·達(dá)倫說：“將來，我們可能不僅能從已滅絕的動物身上恢復(fù)RNA，還能從博物館收藏的蝙蝠皮和其他宿主生物身上恢復(fù)RNA病毒基因組，如SARS-CoV2及其進(jìn)化前體?！?/p>

這項研究的作者表示，他們對未來整合基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的整體研究發(fā)展感到興奮，希望能在DNA之外開創(chuàng)古遺傳學(xué)的新紀(jì)元。