黃湘平,吳玲,譚超超
胰腺癌是一種消化系統(tǒng)常見的惡性腫瘤,因其具有早期癥狀隱匿、惡性程度高、預(yù)后差等特點(diǎn),患者的五年生存率不到8%[1]。胰腺導(dǎo)管腺癌(pancreatic ductal carcinoma, PDAC)是最常見的胰腺腫瘤類型,占所有惡性胰腺腫瘤的80%~85%[2],該類患者生存率較低,確診晚,手術(shù)切除后預(yù)后效果不甚理想,腫瘤易復(fù)發(fā),而淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是患者術(shù)后腫瘤復(fù)發(fā)的主要原因之一[3],因此,早期發(fā)現(xiàn)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移對(duì)于改善患者預(yù)后、提高患者生存率具有重大的意義。
目前臨床診斷PDAC主要通過影像學(xué)和傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物檢查,影像學(xué)檢查在PDAC的早期階段敏感度和特異性較低[4]。代謝組學(xué)(metabolomics)是通過對(duì)參與疾病代謝的小分子物質(zhì)進(jìn)行研究,其價(jià)值從傳統(tǒng)的尋找疾病診斷和預(yù)測的生物標(biāo)志物到進(jìn)一步進(jìn)展為尋找異常的代謝通路,它能夠?qū)ο鄬?duì)分子質(zhì)量<1 000的內(nèi)源性代謝物進(jìn)行全面測量,是了解生理和病理反應(yīng)中已知的代謝途徑和生物功能改變的一種有效方法[5]。本研究擬采用代謝組學(xué)篩選出胰腺導(dǎo)管腺癌患者淋巴轉(zhuǎn)移差異代謝物,尋找異常代謝通路,探索胰腺導(dǎo)管腺癌淋巴轉(zhuǎn)移的潛在生物標(biāo)志物,為胰腺導(dǎo)管腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的早期診斷、治療提供參考依據(jù)。
甲醇(賽默飛世爾科技中國有限公司);乙腈(賽默飛世爾科技中國有限公司);蒸餾水(屈臣氏集團(tuán));EP管(湖州中銳精密科技有限公司);液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀(美國Thermo scientific公司);液相質(zhì)譜分析儀(美國Bruker公司);G-560E型漩渦振動(dòng)器(美國ThermoScientific公司);低溫高速臺(tái)式離心機(jī)(廣州吉迪儀器有限公司);-80℃超低溫冰箱(山東博科科學(xué)儀器有限公司)。
本試驗(yàn)采用前瞻性隊(duì)列研究,收集湖南省人民醫(yī)院2020年8月—2021年3月住院期間確診為胰腺導(dǎo)管腺癌的血清標(biāo)本40例,以及健康對(duì)照組血清標(biāo)本31例。本研究經(jīng)湖南省人民醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(批準(zhǔn)號(hào):{2022-}-21)。
胰腺導(dǎo)管腺癌患者納入標(biāo)準(zhǔn):(1)術(shù)后組織經(jīng)病理確診為PDAC;(2)無代謝性和免疫性疾?。ㄈ缣悄虿?、高血壓、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、甲狀腺功能亢進(jìn)等疾?。?;(3)既往無其他惡性腫瘤病史。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)有過術(shù)前放化療史;(2)病例資料缺失嚴(yán)重者;健康對(duì)照組:肝、腎、電解質(zhì)、血糖、血脂等體檢檢測結(jié)果正常,無明顯疾病、無胰腺相關(guān)疾病病史、無胰腺相關(guān)疾病家族史的健康成年人。胰腺導(dǎo)管腺癌患者是否出現(xiàn)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移均經(jīng)術(shù)后淋巴結(jié)組織病理結(jié)果證實(shí)。
1.3.1 標(biāo)本采集 收集患者術(shù)后24 h之內(nèi)采集的靜脈血3~4 ml,離心取血清,術(shù)后經(jīng)病理檢測證實(shí)為胰腺導(dǎo)管腺癌(均為4℃冰箱保存不超過7天的血清樣本)。
1.3.2 標(biāo)本處理 吸取100 μl血清樣本,加入10 μl內(nèi)標(biāo)(0.3 mg/ml的L-2-氯苯丙氨酸,甲醇配置),渦旋振蕩10 s;加入300 μl蛋白沉淀劑即甲醇-乙腈(2:1,v/v),渦旋振蕩1 min;在冰水浴中超聲提取10~15 min;-20℃冰箱中靜置30 min;4℃ 13 000 r/min離心15 min,取200 μl的上清液,作LC-MS分析。
1.3.3 質(zhì)控的制備 QC用于評(píng)價(jià)進(jìn)樣前的儀器、色譜質(zhì)譜系統(tǒng)和實(shí)驗(yàn)過程中系統(tǒng)的穩(wěn)定性,確保得到的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)真實(shí)可靠;所有樣品各吸取10 μl于EP管中,渦旋混勻10 s,分裝成每管100 μl,共6管,其余步驟按照1.3.2標(biāo)本處理的方法進(jìn)行處理。
以液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(liquid chromatographytandem mass spectrometry, LC-MS)作為代謝物分離檢測平臺(tái),研究胰腺導(dǎo)管腺癌患者與健康對(duì)照組血清的代謝差異,在質(zhì)譜正、負(fù)離子模式下收集數(shù)據(jù);液相色譜條件:AcclainmTMRSLC120-C18色譜柱(100 mm×2.1 mm), 柱溫保持在40℃,進(jìn)樣量3 μl。流動(dòng)相A0.1%(體積分?jǐn)?shù))甲酸/水(含2 mmol/L甲酸銨),流動(dòng)相B為0.1%(體積分?jǐn)?shù))乙腈/水,梯度設(shè)置:2%B持續(xù)0~2 min,50%B持續(xù)2~12 min,90%B持續(xù)10~30 min,98%B繼續(xù)持續(xù)作用30~60 min;流速維持在400 μl/min;質(zhì)譜條件為:電噴霧離子源(electrospray ion source, ESI±),采用正負(fù)離子模式檢測,使用高純N2輔助噴霧電離與脫溶劑,流速為1.2 L/min,質(zhì)量掃描范圍20~1 000 m/z,干燥氣溫度200℃。
為了檢驗(yàn)儀器的穩(wěn)定性和實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性,對(duì)本次實(shí)驗(yàn)的6份QC樣本進(jìn)行了驗(yàn)證,驗(yàn)證結(jié)果提示6份QC樣本的偏差均在2SD范圍內(nèi),說明儀器的穩(wěn)定性和實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性均較好,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)穩(wěn)定可靠且能反映不同組別之間代謝組學(xué)上的差異。
通過Metaboscape 3.0軟件對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行峰提取、除噪、標(biāo)準(zhǔn)化、導(dǎo)出等預(yù)處理,再將數(shù)據(jù)上傳至HMDB數(shù)據(jù)庫進(jìn)行匹配,最后得到代謝物的保留時(shí)間、質(zhì)荷比、峰值等信息。
將預(yù)處理得到的數(shù)據(jù)導(dǎo)入MetaboAnalyst 5.0進(jìn)行分析,首先對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化處理,使分析的數(shù)據(jù)呈現(xiàn)正態(tài)分布,以排除個(gè)體間差異和外界多重因素的影響,使各代謝物之間在數(shù)值上具有一定可比性;通過單變量分析,采用火山圖(Volcano Plot)顯示兩組樣本的差異性代謝物,通過t檢驗(yàn)即P<0.05和差異性倍數(shù)(FC)>1.5為標(biāo)準(zhǔn)篩選差異性代謝物;通過主成分分析(principal component analysis, PCA)來對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行概述和離群值檢測;然后構(gòu)建偏最小二乘判別分析(partial least squares-discriminant analysis, PLS-DA)模型來進(jìn)行分類,并通過K折交互驗(yàn)證和100次置換檢驗(yàn)對(duì)模型進(jìn)行評(píng)價(jià),了解模型的可靠性;通過PLS-DA得到的變量權(quán)重值(variable important in projection,VIP),以VIP>1.0篩選潛在的差異性代謝物;通過聚類分析評(píng)價(jià)不同代謝物的相關(guān)性及聚類程度;最終將得到的差異代謝物進(jìn)行代謝通路分析。
胰腺導(dǎo)管腺癌患者的臨床資料見表1,其中40例胰腺導(dǎo)管腺癌患者中,有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移18例,無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移22例。
表1 胰腺導(dǎo)管腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組與無轉(zhuǎn)移組臨床資料比較(n(%))Table 1 Comparison of clinical information between lymph node metastasis and non- metastasis groups of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma (n(%))
采用單變量統(tǒng)計(jì)學(xué)分析方法篩選健康對(duì)照組和PDAC患者中血清潛在差異性代謝物,在正、負(fù)離子模式下,分別篩選出123和37種差異代謝物;PDAC患者中有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的潛在差異性代謝物,各自篩選出4種差異代謝物,見圖1。
圖1 PDAC組與健康對(duì)照組(A, B)及PDAC組中淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與無轉(zhuǎn)移組(C, D)在正負(fù)離子模式下的差異代謝物火山圖Figure 1 Volcano plots of differential metabolites in PDAC and healthy control groups(A, B), lymph node metastasis and non-metastasis groups(C, D) under positive and negative ions
利用主成分分析方法對(duì)健康體檢組和PDAC患者血清樣本的代謝物輪廓進(jìn)行分析。在正、負(fù)離子模式下,健康體檢組和PDAC患者血清樣本的組內(nèi)代謝物差異比較小,且組間差異較顯著,兩組間的代謝輪廓存在明顯差異;利用PLS-DA方法對(duì)兩組之間的血清標(biāo)本代謝物輪廓進(jìn)行分析,結(jié)果顯示,正、負(fù)離子模式下,二者之間的代謝組學(xué)的組間存在顯著差異,見圖2。
圖2 胰腺導(dǎo)管腺癌與健康體檢組多變量統(tǒng)計(jì)分析散點(diǎn)圖Figure 2 Scatterplot of multivariate statistical analysis of pancreatic ductal adenocarcinoma and healthy control groups
對(duì)構(gòu)建好的模型進(jìn)行驗(yàn)證以評(píng)價(jià)模型的可靠性,以R2評(píng)價(jià)模型的解釋度,Q2評(píng)價(jià)模型的預(yù)測值,在正負(fù)離子下,R2、Q2均>0.5,說明模型擬合效果好,再對(duì)模型進(jìn)行100次置換檢驗(yàn),得到P值,P值均<0.1,提示不存在過擬合的情況。
在成功構(gòu)建了正、負(fù)離子下健康體檢組與PDAC患者的血清標(biāo)本模型下,進(jìn)一步根據(jù)VIP值來篩選潛在的差異性代謝物,在正、負(fù)離子模式下,分別篩選出差異代謝物92和46種。同樣條件下,在正、負(fù)離子模式下,分別篩選出PDAC有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組之間的差異代謝物12和8種。
對(duì)健康對(duì)照組和PDAC組、PDAC患者有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組的血清代謝組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析,從而更加直觀體現(xiàn)出血清差異代謝物的聚類程度。在正、負(fù)離子模式下,健康對(duì)照組和PDAC患者血清代謝物均呈現(xiàn)出較為明顯的聚類,而淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組與未轉(zhuǎn)移組聚類效果較好。
最終,在成功構(gòu)建了正、負(fù)離子模型下,以FC>1.5、P<0.05且VIP>1.0進(jìn)行篩選。
2.4.1 健康對(duì)照組與PDAC患者血清代謝物分析結(jié)果 在正離子模式下篩選出47種差異代謝物,其中升高的有30種:3-氨基-2-惡唑烷酮、L-苯丙氨酸、乙丙嗪、3-磷酸甘油、對(duì)稱二甲基精氨酸、單硝酸異山梨酯、3-羥基馬尿酸、2-吡咯烷酮、4-羥脯氨酸、苯基丙酮酸、L-辛?;鈮A、L-酪氨酸、蘋果酸、硫酸吲哚酚、氫化可的酯、尿囊素、槲皮素3_-硫酸鹽、D-α-氨基丁酸、L-精氨酸、4-羥基甲苯磺丁脲、磷酰膽堿、4-三甲基氨基丁酸、苯乙酸、乙基葡糖苷酸、2-丙基-2,4-戊二烯酸、半乳糖醇、3-_3-羥基苯基_-2-甲基乳酸、根皮素、鞘氨醇、2,3-丁二醇;降低的有17種:戊糖苷、前列腺素B2、加拉敏三硫醚、脯氨酸甜菜堿、丙烯酰肉堿、γ-亞麻酸、四氫脫氧皮質(zhì)酮、3-羥基丁酸、α-酮異戊酸、蛋氨酸亞砜、L-脯氨酸、十一烷二酸、氧烯洛爾、維生素A、丙酮、黃嘌呤酸、3-甲基組氨酸。
在負(fù)離子模式下最終得出29種差異代謝物:升高的有10種:8-羥基韋拉平葡萄糖醛酸、丙酮酸、11-氧代雄酮葡萄糖醛酸苷、苯丙氨酸、4-乙基苯基硫酸鹽、11-脫氫皮質(zhì)酮、前列腺素B2、降草酸、苯甲酸芐酯、雌酮;降低的有19種:2-羥基地昔帕明葡糖苷酸、硫酸雄酮、4-乙烯基苯酚硫酸鹽、丙氨酸、瓦拉尼酸、根皮素2_-O-葡糖苷酸、十五烷酸、3-硝基酪氨酸、L-組氨酸、rac-5,6-環(huán)氧-視黃酰-β-D-葡糖苷酸、2-苯基-1,3-丙二醇單氨基甲酸酯、羥基去甲基多塞平葡萄糖醛酸、5-十四碳烯酸、呋喃西林、索萊羅、6-硫尿酸、二氫黃豆苷元7-O-葡糖苷酸、二氫速甾醇、25-羥基維生素D2。
利用MetaboAnalyst 5.0對(duì)在正、負(fù)離子模式下篩選出的顯著差異性代謝物進(jìn)行代謝通路分析。依據(jù)KEGG數(shù)據(jù)庫,匹配到了26條代謝通路,再以-log(p)>0.5且Pathway impact值>0.05篩選出11條代謝通路,見表2;從圖3可以觀察到兩組之間差異代謝物濃度相差較大,重復(fù)性較好。
圖3 PDAC患者與健康對(duì)照組之間排前五的差異代謝物Figure 3 The top five differential metabolites between PDAC and healthy control groups
2.4.2 PDAC患者有無淋巴轉(zhuǎn)移兩組之間血清代謝物分析結(jié)果 在正離子模式下篩選出3種差異代謝物,其中升高的有乙丙嗪(Ethopropazine),降低的有四氫脫氧皮質(zhì)酮(Tetrahydrodeoxycorticoste rone)、氧烯洛爾(Oxprenolol);在負(fù)離子模式下篩選出1種差異代謝物,其中升高的是苯丙氨酸(Phenylalanine)。幾種差異代謝物的ROC曲線見圖4、表3,顯示兩組之間差異代謝物濃度相差較大,重復(fù)性較好。
表3 胰腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的差異代謝物的ROC診斷效能比較Table 3 Comparison of ROC diagnostic efficacy of differential metabolites for lymph node metastasis in pancreatic cancer
本研究基于LC-MS平臺(tái)對(duì)40例胰腺導(dǎo)管腺癌患者以及31例健康體檢組的血清學(xué)代謝組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)了76種差異代謝物和11條相關(guān)的差異代謝通路。其中戊糖苷、丙烯酰肉堿、前列腺素B2、苯乙酸、L-苯丙氨酸為排前五的血清差異代謝物,影響較大的兩條代謝通路為苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成和苯丙氨酸代謝,兩條差異代謝通路均匹配到了苯丙氨酸、L-苯丙氨酸、L-酪氨酸三種差異代謝物。
van Dijk等[6]研究表明胰腺癌患者基礎(chǔ)蛋白周轉(zhuǎn)率明顯高于健康體檢組,從而在胰腺癌患者中會(huì)出現(xiàn)高水平的L-苯丙氨酸和L-酪氨酸,這與本實(shí)驗(yàn)得出的結(jié)果L-苯丙氨酸在PDAC患者中水平升高相符合,癌細(xì)胞可能通過體內(nèi)高水平的蛋白合成與分解,促進(jìn)癌細(xì)胞的大量增殖從而加強(qiáng)其對(duì)淋巴和器官的侵潤能力。黏蛋白1(MUC1)是一種異常糖基化的膜結(jié)合糖蛋白,在大于80%的PDAC病例中過度表達(dá),與不良預(yù)后相關(guān),MUC1通過其胞質(zhì)尾(MUC1-CT)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)并與其他致癌信號(hào)分子相互作用,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展和轉(zhuǎn)移;Grover等[7]研究表明MUC1-CT中的酪氨酸突變?yōu)楸彼崮軌蛞种妻D(zhuǎn)化生長因子-β(TGF-β)誘導(dǎo)的腫瘤轉(zhuǎn)化,本研究中出現(xiàn)血清酪氨酸水平的升高和丙氨酸的降低,胰腺細(xì)胞是否也可通過此種突變從而誘導(dǎo)腫瘤的轉(zhuǎn)化尚需進(jìn)一步的研究。
本研究中,丙酮酸在胰腺癌患者中處于高表達(dá),并參與了4條差異代謝通路,糖酵解/糖代謝在胰腺癌細(xì)胞的生長中發(fā)揮重要的作用。腫瘤細(xì)胞能夠在氧氣充足的情況下,在相關(guān)催化酶的催化作用下消耗大量葡萄糖產(chǎn)生乳酸,這種現(xiàn)象被稱為Warburg效應(yīng)或有氧糖酵解[8]。研究表明[9],丙酮酸激酶M2(PKM2)在胰腺癌組織中過表達(dá),這可能是Warburg效應(yīng)發(fā)生的機(jī)制之一,同時(shí)糖酵解中高表達(dá)的關(guān)鍵酶如PKM2和乳酸脫氫酶A(LDHA)與胰腺癌的不良預(yù)后相關(guān)[10],這兩種酶活性在胰腺癌患者的表達(dá)增加,導(dǎo)致患者血清代謝物丙酮酸水平升高。Jiang等[11]研究發(fā)現(xiàn),胰腺癌患者LDHA的過度表達(dá)導(dǎo)致其丙酮酸和乳酸的水平異常,其中4種相關(guān)代謝物(葡萄糖、乳酸、丙酮酸和檸檬酸)能夠作為胰腺癌的早期診斷和療效監(jiān)測的生物標(biāo)志物。
在此基礎(chǔ)上,本研究通過進(jìn)一步對(duì)40例胰腺癌患者淋巴結(jié)出現(xiàn)轉(zhuǎn)移的血清代謝組學(xué)分析,得出了四種在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中存在差異的代謝物,其中在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者中升高的有:乙丙嗪、苯丙氨酸;降低的有:四氫脫氧皮質(zhì)酮、氧烯洛爾。四種差異代謝物的AUC值分別為:0.798、0.780、0.753、0.742,可見四種差異代謝物對(duì)于區(qū)分患者淋巴結(jié)是否轉(zhuǎn)移有較好的區(qū)分。苯丙氨酸的代謝能夠抑制T細(xì)胞參與的免疫反應(yīng),苯丙氨酸被IL-4誘導(dǎo)基因1(IL4I1)編碼的苯丙氨酸氧化酶氧化脫氨基,導(dǎo)致其減少和過氧化氫(H2O2)增加,進(jìn)一步導(dǎo)致T細(xì)胞增殖抑制,而T細(xì)胞是機(jī)體清除癌細(xì)胞和其他異常細(xì)胞的關(guān)鍵,因此,癌細(xì)胞可通過大量合成苯丙氨酸,從而逃脫T細(xì)胞的清除[12]。同時(shí),苯丙氨酸作為一種在原發(fā)性腫瘤中高度存在的保護(hù)性氨基酸,能夠加強(qiáng)腫瘤的浸潤和轉(zhuǎn)移的能力[13],而在本研究中,苯丙氨酸在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者中水平明顯升高,因此,苯丙氨酸可以作為二者之間一種較好的潛在標(biāo)志物。有研究表明[14]乙丙嗪能夠促進(jìn)小細(xì)胞肺癌中癌細(xì)胞的增殖,其可能的機(jī)制為乙丙嗪通過促進(jìn)膽堿轉(zhuǎn)運(yùn)體CTL1對(duì)乙酰膽堿的合成作用,從而為癌細(xì)胞的大量增殖提供物質(zhì)基礎(chǔ),而在本研究中,乙丙嗪在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者中的水平高于未轉(zhuǎn)移組,其具體的作用機(jī)制尚未明確,是否有可能通過這一機(jī)制導(dǎo)致癌細(xì)胞出現(xiàn)淋巴結(jié)的轉(zhuǎn)移需待進(jìn)一步的研究;在本研究中,四氫脫氧皮質(zhì)酮在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組處于低水平,代謝重編程為癌細(xì)胞的特性之一,各種因子,如信號(hào)蛋白(S)、miRNA和轉(zhuǎn)錄因子(TFs),通過加強(qiáng)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用以及代謝酶相互作用,在改變癌細(xì)胞的代謝狀態(tài)中發(fā)揮重要作用;有研究發(fā)現(xiàn)[15]子宮頸癌代謝物(L-賴氨酸和四氫脫氧皮質(zhì)酮)可在多種信號(hào)蛋白調(diào)節(jié)代謝酶的作用下改變代謝物的狀態(tài),這些信號(hào)蛋白是否可在PDAC患者中通過改變癌細(xì)胞的代謝狀態(tài),從而加強(qiáng)癌細(xì)胞的增殖以及轉(zhuǎn)移尚需證實(shí)。
關(guān)于PDAC的發(fā)生、發(fā)展以及預(yù)后相關(guān)的機(jī)制,尚需進(jìn)一步的研究,后續(xù)有望通過補(bǔ)充患者的胰腺癌組織標(biāo)本,對(duì)PDAC患者的代謝組學(xué)進(jìn)行更深一步的研究,尋找到更加有意義的生物標(biāo)志物,為PDAC的治療提供新靶點(diǎn)。
利益沖突聲明:
所有作者均聲明不存在利益沖突。