王叢旭,潘曉藝,周可欣,穆雪嬌,姚嘉赟,藺凌云,趙建華,沈錦玉*
(1.湖州師范學(xué)院 生命科學(xué)學(xué)院,浙江 湖州 313001;2.浙江省淡水水產(chǎn)研究所 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部淡水漁業(yè)健康養(yǎng)殖重點實驗室,浙江省魚類健康與營養(yǎng)重點實驗室,浙江 湖州 313001)
大口黑鱸(Micropterussalmoides)自20世紀(jì)80年代引入中國以后,養(yǎng)殖規(guī)模逐漸擴(kuò)大,現(xiàn)已成為中國第十大淡水養(yǎng)殖魚類[1]。然而,在養(yǎng)殖過程中一些疾病也陸續(xù)出現(xiàn),其中,大口黑鱸蛙虹彩病毒(Largemouth bass ranavirus,LMBV)是影響較大的病毒性病害之一。該病毒于1996年被Plumb等[2]分離和鑒定,并被歸為虹彩病毒科,后來經(jīng)過遺傳分析證實該毒株為LMBV[3]。2009年鄧國成等[4]首次報道了由虹彩病毒引起的大口黑鱸潰瘍病,經(jīng)電鏡觀察和序列分析確定為LMBV。雖然LMBV已出現(xiàn)多年,但至今尚無有效的預(yù)防和治療藥物。
疫苗免疫是進(jìn)行病毒性疾病預(yù)防最具性價比的手段之一。LMBV相關(guān)疫苗,如滅活疫苗[5]、核酸疫苗[6]和亞單位疫苗[7]等已開展研究,并表現(xiàn)出了一定的免疫保護(hù)率。Yi等[6]構(gòu)建的基于MCP基因的大口黑鱸DNA疫苗免疫保護(hù)率為63%,Jia等[7]研制的甘露糖修飾MCP亞單位疫苗免疫保護(hù)率達(dá)到78.94%。然而,針對LMBV的弱毒疫苗目前尚未見報道。LMBV的致弱通常以傳代致弱或者毒力基因的敲除為主要手段。通過在培養(yǎng)細(xì)胞中連續(xù)傳代致弱,是進(jìn)行病毒減毒最常見的方法,病毒在培養(yǎng)細(xì)胞的多次傳代過程中,常導(dǎo)致病毒基因中一個或多個突變的積累,從而導(dǎo)致減毒[8]。
病毒傳代致弱已在水產(chǎn)和畜禽弱毒疫苗研究中被廣泛應(yīng)用。通過查閱文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn)4個LMBV潛在的毒力基因,即E3、TNFR[9]、ICP18[10]和ICP46[11],根據(jù)NCBI已公布的蛙虹彩病毒全基因組中毒力基因序列,LMBV ORF046與預(yù)測的E3泛素連接酶(predicted E3 ubiquitin ligase domai,E3)結(jié)構(gòu)域的同源性較高,LMBV ORF057與腫瘤壞死因子受體(tumor necrosis factor receptor,TNFR)結(jié)構(gòu)域的同源性較高,LMBV ORF018與蛙虹彩病毒的感染細(xì)胞多肽ICP18(infected cell polypeptides 18)的同源性較高,LMBV ORF087與預(yù)測的感染細(xì)胞多肽ICP46的同源性較高。本研究中,通過對LMBV分離株LMBV-ZJDSS進(jìn)行連續(xù)傳代培養(yǎng),對不同代次的毒株進(jìn)行致病性比較、體外生長特性及組織分布研究,以期為LMBV弱毒疫苗研究提供科學(xué)參考。
健康大口黑鱸體質(zhì)量為(14±2)g,取自浙江省淡水水產(chǎn)研究所八里店基地。暫養(yǎng)兩周,水溫為28 ℃,pH為7.65,每日投喂兩次商品鱸飼料,且攝食良好。試驗前隨機(jī)抽取10尾魚檢測其LMBV、傳染性脾腎壞死病毒和彈狀病毒,確保均為陰性。EPC細(xì)胞、大口黑鱸LMBV-ZJDSS毒株由浙江省淡水水產(chǎn)研究所魚病室保存。
新生牛血清購自內(nèi)蒙古金源康生物工程有限公司,M199 培養(yǎng)基購自美國 Gibco 公司,青霉素、鏈霉素和 PBS 均購自北京索萊寶科技有限公司,2×Flash Hot Start MasterMix(Dye)購自康為世紀(jì)生物科技股份有限公司,2×SuperReal PreMix(Probe)購自天根生化科技(北京)有限公司,磁珠法核酸提取試劑盒(AS214)購自洛陽愛森生物科技有限公司。
1.2.1 引物設(shè)計與合成 根據(jù)NCBI登錄的LMBV Alleghany 12-343株(GenBank:MK681855.1)的全基因組,設(shè)計擴(kuò)增E3、TNFR、ICP18和ICP46基因的引物(表1),并由浙江尚亞生物技術(shù)公司合成。
表1 LMBV引物探針序列信息
1.2.2 LMBV-ZJDSS傳代 EPC細(xì)胞采用含10%血清和1%雙抗(均為體積分?jǐn)?shù),下同)的M199培養(yǎng)基于24 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。鋪滿單層后,棄培養(yǎng)液,接入病毒液1 mL,24 ℃培養(yǎng)箱孵育1 h后,吸出病毒液,加入細(xì)胞維持液(含2%血清和1%雙抗的M199培養(yǎng)基),于24 ℃培養(yǎng),每日觀察細(xì)胞病變效應(yīng) (cytopathic effect,CPE)情況,待CPE達(dá)到80%時,收集病毒液,于-80 ℃超低溫冰箱中保存。
進(jìn)行病毒傳代時,將上一代次的病毒液凍融兩次后,4 ℃下以8 000 r/min離心10 min,取上清液用0.45 μm濾器過濾,接種EPC細(xì)胞進(jìn)行病毒培養(yǎng)和傳代,每隔5代保存在液氮中備用,對F5、F35和F65代毒株進(jìn)行特性與毒力測定。
1.2.3 不同代次毒株的生長動力學(xué)曲線 取濃度為108.5TCID50/mL LMBV-ZJDSS的F5、F35和F65代毒株,分別接種于12孔板鋪滿單層的EPC細(xì)胞中,150 μL/孔,24 ℃培養(yǎng)箱孵育1 h,吸出病毒液,接入細(xì)胞維持液(2 mL/孔)。定時用顯微鏡觀察細(xì)胞病變形態(tài)并拍照記錄,分別在1、6、12、24、36、48、72、96、120、144、168 h取病毒培養(yǎng)上清液,每個時間點取3個平行樣,按照Reed-Muench法計算TCID50,并繪制生長動力學(xué)曲線。
1.2.4 不同代次毒株致病力的測定 取140尾健康大口黑鱸分為7組,包括6個試驗組和1個對照組,每組20尾。6個試驗組分別用3個代次毒株的兩種濃度進(jìn)行攻毒,兩種攻毒濃度分別為108.5、109.5TCID50/mL,攻毒劑量為0.1 mL/尾,對照組注射等量EPC細(xì)胞液,攻毒方式為腹腔注射。攻毒后每日早、晚觀察,共觀察15 d,并記錄大口黑鱸死亡率。
1.2.5 不同代次毒株在大口黑鱸器官組織中的分布 取50尾健康大口黑鱸分為兩組,分別用F5和F65代毒株進(jìn)行攻毒,濃度均為108.5TCID50/mL,攻毒劑量為0.1 mL/尾,且在攻毒后的4、8、12、24、48、72、96、120 h分別取兩個攻毒組魚的肝、脾、腎、鰓、腸、腦和心組織,每個組織大約取50 mg,每次隨機(jī)選取3尾魚,將各個組織加入無菌PBS中進(jìn)行研磨,采用磁珠法核酸提取試劑盒(AS214)提取DNA,測量DNA濃度,并將提取的DNA作為模板,用qPCR方法檢測病毒載量。
1.2.6 LMBV-ZJDSS不同代次全基因組測序 將LMBV-ZJDSS第5代和第65代毒株進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),收集病毒液,凍融3次,以12 000 r/min離心45 min,取上清液,再將病毒液加入50 mL離心管中,離心管中提前加入配制好的質(zhì)量分?jǐn)?shù)為30%的蔗糖溶液5 mL,配平后放入超速冷凍離心機(jī)中,4 ℃下以50 000 r/min離心3 h。離心完成后立即取出離心管,棄上清液,用150 μL無菌PBS沖洗管壁,懸浮病毒液,提取病毒DNA,送浙江尚亞生物技術(shù)公司進(jìn)行二代測序,并分析不同代次毒株基因組的差異性。
1.2.7 不同地區(qū)毒力基因序列分析 篩選4個蛙虹彩病毒毒力相關(guān)基因(E3、TNFR、ICP18和ICP46),其中,ly20912-14、ly20918-23、ly20918-25和ly20918-15為本實驗室分離并保存,Pine 14-204(登錄號:MK681856)、Alleghany 12-343(登錄號:MK681856)和NH-1609(登錄號:MG941005)序列參考NCBI數(shù)據(jù)庫(表2),通過設(shè)計引物(表1),對來自不同地區(qū)的臨床LMBV陽性樣品進(jìn)行4個基因的擴(kuò)增。反應(yīng)程序:95 ℃下預(yù)變性5 min;94 ℃下變性30 s,52 ℃下退火30 s,72 ℃下延伸100 s,共進(jìn)行35個循環(huán);最后在72 ℃下再延伸5 min。 PCR產(chǎn)物送浙江尚亞生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測序,并對4個毒力基因編碼蛋白采用MAGA 11軟件進(jìn)行比對分析。
表2 不同代次基因組差異Tab.2 Genomic differences among different generations
表2 蛙虹彩病毒毒株樣品編號及來源Tab.2 Sample numbering and origin of LMBV
將LMBV-ZJDSS毒株在EPC細(xì)胞中進(jìn)行傳代,圖1為F5、F35和F65代毒株接種EPC細(xì)胞后在48 h產(chǎn)生的CPE特征,隨著傳代次數(shù)的增加,出現(xiàn)CPE的時間變短。這表明,LMBV-ZJDSS毒株在相同病毒滴度下,F(xiàn)65和F35代毒株比F5代毒株表現(xiàn)出更強(qiáng)的致細(xì)胞病變能力。
圖1 不同代次毒株感染48 h后細(xì)胞的病變差異Fig.1 Difference in cytopathic effect caused by different generations of virus strains for 48 h infection in vitro
通過病毒的復(fù)制動力學(xué)曲線來比較不同代次LMBV的增值特性。從圖2可見:3個代次毒株的復(fù)制趨勢基本一致;3個代次毒株均在48~72 h時達(dá)到病毒最高滴度,其中,F(xiàn)5代毒株在72 h時達(dá)到最高滴度,為109.5TCID50/mL,F(xiàn)35代和F65代均在36~72 h時達(dá)到最高滴度(分別為109.6、109.8TCID50/mL);在病毒培養(yǎng)過程中,F(xiàn)5代在24 h時病毒滴度超過了F35和F65代,但在48 h時病毒滴度卻低于F35和F65代。
圖2 不同代次毒株的體外生長特性Fig.2 Growth curves of different generations of virus strains in vitro
從圖3可見:在相同攻毒濃度下,高代次毒株表現(xiàn)出更低的毒力;當(dāng)F5、F35和F65代毒株攻毒濃度為108.5TCID50/mL時,攻毒后15 d內(nèi),大口黑鱸死亡率分別為60%、25%和5%,而當(dāng)F5、F35和F65攻毒濃度為109.5TCID50/mL時,大口黑鱸死亡率分別為90%、70%和10%。這表明,LMBV病毒傳代可引起病毒對宿主致病力的減弱。
圖3 不同代次毒株的致病性比較Fig.3 Comparison of pathogenicity among different generations of virus strains
F5和F65代毒株均以108.5TCID50/mL濃度感染大口黑鱸后,對不同感染時間不同組織中的病毒含量進(jìn)行測定(圖4(a)~(g)),結(jié)果顯示,F(xiàn)5代毒株在感染大口黑鱸后4 h時就可在各臟器中被檢出,而F65代毒株在感染后8 h時才被檢出,表明F5代毒株在體內(nèi)復(fù)制更為迅速。
大口黑鱸被感染后不同組織中,F(xiàn)5代毒株在24~48 h時達(dá)到最高病毒載量,而F65代毒株在72~96 h時出現(xiàn)病毒載量峰值,F(xiàn)5代和F65代病毒載量最高的組織均為腸道組織,病毒載量分別達(dá)到105.6copies/ng和106.3copies/ng;兩個代次毒株載量在達(dá)到最高值后均開始下降(圖4(h))。
采用二代測序技術(shù)進(jìn)行病毒文庫序列測定,通過ORF預(yù)測與篩選,共獲得85個編碼框。F65相對于F5代毒株,變異點有8處,其中有3處可以引起氨基酸的改變,2處在ORF 069R區(qū)域,氨基酸由亮氨酸變?yōu)榧琢虬彼?,其編碼的蛋白為神經(jīng)絲三聯(lián)體h1樣蛋白(neurofilament triplet h1-like protein);1處在ORF 102L區(qū)域,第37位氨基酸由天冬氨酸變?yōu)槔野彼幔渚幋a的蛋白為感染細(xì)胞多肽ICP46(表2)。
通過對不同地區(qū)的7個LMBV陽性組織樣品進(jìn)行4個毒力基因的擴(kuò)增與測序,結(jié)果表明,E3基因編碼區(qū)在所有臨床毒株中序列完全相同(圖5(a)),與LMBV中國鱖分離株NH-1609(MG941005)完全一致,與LMBV美國分離株P(guān)ine 14-204(MK681856)和Alleghany 12-343(MK681856)僅相差一個堿基。
圖5 E3、TNFR和ICP18氨基酸序列的比對Fig.5 Amino acid sequence alignment of E3,TNFR and ICP18
ICP18基因編碼區(qū)序列比較發(fā)現(xiàn),國內(nèi)的毒株序列完全一致(圖5(b)),與美國株P(guān)ine 14-204株和Alleghany 12-343株相比,有7個位點的差異,其中2個位點是非同義變異,出現(xiàn)在第84位和103位,國內(nèi)流行株分別為丙氨酸和亮氨酸,美國株為蘇氨酸和苯丙氨酸。而ICP46基因編碼區(qū)國內(nèi)外的毒株序列完全相同(氨基酸序列圖略)。
TNFR基因編碼區(qū)表現(xiàn)出了較多的變異位點(圖5(c)),共有13個變異位點,13處變異位點均出現(xiàn)在不同的中國分離株中,其中,5處為同義變異,8處變異可引起氨基酸的改變,NH-1609株第168、180、184、188、199、220、222和232位氨基酸分別為絲氨酸、蘇氨酸、蘇氨酸、組氨酸、組氨酸、絲氨酸、絲氨酸和蘇氨酸,ly20912-14株第178、180、184、188、199、220、222和232位氨基酸分別為苯丙氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、脯氨酸、亮氨酸、脯氨酸和苯丙氨酸,ly20918-23株第168、180、184、222和232位氨基酸分別為苯丙氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸和苯丙氨酸,ly20918-15株和ly20918-25株第222和232位氨基酸分別為脯氨酸和苯丙氨酸。
蛙病毒是屬于虹彩病毒科的一種DNA病毒,虹彩病毒科包括7個屬,分別為蛙病毒屬(Ranavirus)、細(xì)胞腫大病毒屬(Megalocytivirus)、淋巴囊腫病毒屬 (Lymphocystivirus)、水蚤虹彩病毒屬(Daphniairidovirus)、虹彩病毒屬(Iridovirus)和綠虹彩病毒屬(Chloriridovirus),以及近年發(fā)現(xiàn)的十足目虹彩病毒屬(Decapodiridovirus)[12]。蛙虹彩病毒的感染范圍非常廣泛,可以感染魚類,如鱸和褐籃子魚[13],還可以感染兩棲類,如蠑螈和牛蛙。其中,LMBV自2009年在國內(nèi)首次出現(xiàn)之后,在國內(nèi)各地均有發(fā)現(xiàn),對養(yǎng)殖戶造成了較大的經(jīng)濟(jì)損失。本實驗室分離了一株LMBV,將該毒株在EPC細(xì)胞上進(jìn)行連續(xù)傳代致弱,目前已經(jīng)傳到第65代,并將其與第5代和第35代毒株進(jìn)行體外生長特性比較,結(jié)果表明,在連續(xù)傳代的過程中,增加了病毒的細(xì)胞適應(yīng)性,導(dǎo)致細(xì)胞病變的速度變快,當(dāng)病毒培養(yǎng)液達(dá)到最高病毒滴度時,被感染細(xì)胞釋放到上清液中的病毒粒子與上清液中失活的病毒粒子數(shù)量達(dá)到平衡,上清液中具有感染性病毒的數(shù)量達(dá)到最高值,此刻為最佳收獲病毒時間,而不同代次病毒的最高滴度并不會出現(xiàn)較大差異。本試驗中,通過腹腔注射的方式用3個代次的毒株感染大口黑鱸,每個代次分為兩個攻毒濃度,對其感染的大口黑鱸進(jìn)行為期15 d的觀察,發(fā)現(xiàn)F65代毒株感染的大口黑鱸死亡率要低于F5和F35代,這說明在連續(xù)傳代過程中,病毒的毒力有所減弱,也為病毒的減毒活疫苗開發(fā)提供了有益參考。
為比較LMBV不同代次毒株的感染性,筆者在對大口黑鱸攻毒試驗過程中,通過熒光定量檢測出LMBV在大口黑鱸各個器官組織中均存在,其中,腸的病毒載量最高,肝臟和脾臟的病毒載量也較高。F5代毒株攻毒后,在48 h內(nèi)各組織中病毒載量達(dá)到高峰期,之后病毒載量逐漸降低,而F65代毒株攻毒后,在96 h內(nèi)各組織中病毒載量達(dá)到高峰期。楊展展等[14]對LMBV在大口黑鱸體內(nèi)的動態(tài)分布研究表明,心臟在攻毒后4 h檢測出病毒,而腸、腦和鰓在攻毒24 h后才檢測出病毒,心臟的病毒載量最高。此結(jié)果與本試驗結(jié)果存在一定的差異,可能與攻毒時魚體大小、病毒的濃度及攻毒劑量有關(guān)。劉丹等[15]對大鯢蛙病毒(CGSRV)在體內(nèi)組織分布的研究表明,在各個組織中均能檢測到病毒,其中,肝臟中的病毒載量最高。彭超等[16]運(yùn)用原位雜交和熒光定量方法,對人工感染蛙病毒(FV3)后鞍帶石斑魚體內(nèi)不同組織中的分布進(jìn)行分析,原位雜交結(jié)果表明,脾臟和肝臟都有信號,而腦組織中無信號;熒光定量結(jié)果表明,脾臟、腎臟和心臟的病毒載量最多。Cunningham等[17]研究表明,林蛙感染FV3后,肝臟和腎臟中的病毒載量較高。綜上所述,蛙病毒的感染性較強(qiáng),可以侵染到宿主的各個器官組織且感染范圍廣,對很多物種都具有感染性。同時,通過病毒的連續(xù)傳代,病毒侵染大口黑鱸的速度逐漸變慢。
為比較不同地區(qū)LMBV毒力基因的差異及其遺傳穩(wěn)定性,本研究中,對不同地區(qū)毒力基因序列進(jìn)行比對,結(jié)果表明,E3與NCBI上的中國株序列一致,與美國株僅有一個堿基差異;ICP18與美國株相比,僅有2處變異;TNFR與美國株相比,有1處變異點,但在國內(nèi)株之間出現(xiàn)了8個變異點;ICP46與國內(nèi)外毒株則無任何變異點。TNFR變異點較多的原因,可能是病毒宿主所處的地域不同所致,E3與ICP18出現(xiàn)的變異點可能是國內(nèi)外毒株的差異[18]。至于變異點突變前后的氨基酸,表達(dá)出的蛋白質(zhì)功能是否相同,還有待進(jìn)一步研究。TNFR樣病毒因子在淋巴囊腫病毒中被認(rèn)為是一種病毒感受器,其可以與魚類細(xì)胞因子TNF結(jié)合,并中和其作用[19]。ICP18與ICP46是虹彩病毒科蛙病毒屬的核心基因之一,都屬于立即早期基因(immediate early gene,IE),IE基因轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)生的病毒蛋白對病毒復(fù)制和細(xì)胞周期進(jìn)程具有重要影響[20]。本研究中,對不同代次毒株全基因組序列分析結(jié)果表明,F(xiàn)65代毒株與F35代毒株相比,編碼ICP46的一個氨基酸發(fā)生突變,此突變可能導(dǎo)致ICP46的功能發(fā)生改變,使毒株毒力減弱。夏立群等[21]對SGIV ICP46中一段富含亮氨酸的潛在核輸出信號進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)NES對ICP46輸出細(xì)胞核具有決定性作用。隨著對LMBV的不斷研究,也發(fā)現(xiàn)了一些新的問題,毒力減弱后的毒株是否還保留免疫原性,是否可以作為減毒活疫苗候選毒株,本研究中選擇的4個毒力基因是否為LMBV的必需毒力基因,這些問題將在后續(xù)試驗中進(jìn)行驗證。
1)通過對LMBV的連續(xù)傳代,并將不同代次毒株進(jìn)行體外生長特性、致病性、感染大口黑鱸后病毒在組織內(nèi)的載量變化及全基因組測序分析,表明隨著病毒代次的增高,病毒的毒力下降,致病性降低,病毒載量在組織內(nèi)達(dá)到峰值的時間變慢。
2)通過對LMBV傳代致弱進(jìn)行研究,表明高代次基因組氨基酸的改變可能是毒株毒力下降的原因,而不同地區(qū)毒株毒力基因的差異主要集中在TNFR基因上。