王瑩,張明暉
赤峰市醫(yī)院腫瘤內(nèi)三科,內(nèi)蒙古赤峰024000
肺癌是嚴(yán)重威脅我國(guó)居民健康的主要公共衛(wèi)生問(wèn)題之一。據(jù)統(tǒng)計(jì),2020年我國(guó)肺癌新發(fā)病例約82萬(wàn)例、死亡病例約72萬(wàn)例,其發(fā)病率和死亡率均居我國(guó)惡性腫瘤首位。非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)是肺癌最常見(jiàn)的組織學(xué)類型,占所有肺癌的80%~85%,根據(jù)病理學(xué)類型可分為腺癌、鱗癌、大細(xì)胞癌三個(gè)亞型[1]。NSCLC早期癥狀不典型,大多數(shù)患者發(fā)現(xiàn)時(shí)已是中晚期,5年生存率較低[2]。但目前NSCLC的發(fā)病機(jī)制仍不完全清楚??勺兗羟惺侵敢粋€(gè)mRNA前體通過(guò)不同的剪接方式(選擇不同的剪接位點(diǎn))產(chǎn)生不同mRNA剪接異構(gòu)體的過(guò)程,主要包括可變啟動(dòng)子(AP)、可變終止子(AT)、外顯子跳躍(ES)、可變供體位點(diǎn)(AD)、可變受體位點(diǎn)(AA)、內(nèi)含子保留(RI)和外顯子互斥(ME)七種可變剪切事件[3]??勺兗羟惺钦{(diào)節(jié)基因表達(dá)和產(chǎn)生蛋白質(zhì)組多樣性的重要機(jī)制,也是真核生物轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性和多樣性的重要原因。以往研究報(bào)道,可變剪切基因異常幾乎與腫瘤細(xì)胞的所有特征表型有關(guān),能夠參與包括NSCLC在內(nèi)的多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展以及治療耐藥[4]。本文結(jié)合文獻(xiàn)就可變剪切基因在NSCLC中作用的研究進(jìn)展作一綜述。
可變剪切是指一個(gè)mRNA前體通過(guò)不同的剪接方式(選擇不同的剪接位點(diǎn))產(chǎn)生不同mRNA剪接異構(gòu)體的過(guò)程。mRNA從前體到成熟需要去除內(nèi)含子及連接外顯子,其中順式作用元件與反式作用因子相互作用,影響剪切位點(diǎn),使得某些mRNA改變了原始閱讀框架,導(dǎo)致一個(gè)基因產(chǎn)生多種不同的異構(gòu)體,從而編碼不同結(jié)構(gòu)或功能的蛋白質(zhì)[5]。前體mRNA的可變剪切過(guò)程是多細(xì)胞生物中基因表達(dá)調(diào)控的普遍模式之一,涉及多序列基序與同源蛋白質(zhì)的相互作用,其錯(cuò)誤調(diào)節(jié)能夠影響細(xì)胞的增殖、凋亡以及血管生成和能量代謝等??勺兗羟谢蚧钚愿淖兪菒盒阅[瘤中可變剪切失調(diào)的重要原因之一,特定基因的剪切變體可直接介導(dǎo)惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展,如BRCA1、p53等[6]。
可變剪切能夠使一個(gè)基因產(chǎn)生多個(gè)mRNA,最終產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。腫瘤細(xì)胞在可變剪切過(guò)程中具有腫瘤類型特異性及亞型特異性。有學(xué)者對(duì)包括肺癌在內(nèi)的32種不同腫瘤可變剪切基因分析發(fā)現(xiàn),絕大多數(shù)可變剪切基因只存在于腫瘤組織中[7]。一項(xiàng)生存分析發(fā)現(xiàn),可變剪切事件與肺腺癌或肺鱗癌患者的總生存期顯著相關(guān)[8]。LIU等[9]研究報(bào)道,肺腺癌預(yù)后相關(guān)的可變剪切事件與免疫細(xì)胞浸潤(rùn)程度、腫瘤突變負(fù)荷、免疫檢查點(diǎn)表達(dá)水平以及免疫應(yīng)答高度一致。以上研究表明,可變剪切在NSCLC的發(fā)生、發(fā)展中起著至關(guān)重要的作用。
目前,全基因組研究已公布了27種人類惡性腫瘤中超過(guò)15 000個(gè)可變剪切基因。在肺癌中的可變剪切基因主要包括B淋巴細(xì)胞瘤xL(Bcl-xL)、甘氨酸脫羧酶(GLDC)、RNA結(jié)合蛋白(RBM)、富絲氨酸/精氨酸的剪接因子(SRSF)、內(nèi)收蛋白3(ADD3)及酪氨酸激酶受體(MET)等,這些可變剪切基因能夠參與腫瘤細(xì)胞的增殖、分化、凋亡等一系列生物學(xué)行為[10]。本文重點(diǎn)介紹其中六種具有潛在臨床價(jià)值的可變剪切基因及其變體。
2.1.ET MET是一種原癌基因,定位于人染色體7q21-31,長(zhǎng)度約125 kb,含有21個(gè)外顯子。MET的主要突變類型包括14外顯子跳躍突變、基因擴(kuò)增、激酶域突變以及基因融合等[11]。其中,MET 14外顯子跳躍突變是近年來(lái)備受關(guān)注的突變類型。研究報(bào)道,MET 14外顯子跳躍突變可使含有E3泛素連接酶c-Cbl的近膜端結(jié)構(gòu)域缺失,MET蛋白泛素化降低,致使MET蛋白不斷積累,從而使MET信號(hào)通路持續(xù)激活,繼而導(dǎo)致腫瘤發(fā)生。MET的編碼蛋白具有酪氨酸激酶活性,是一種肝細(xì)胞生長(zhǎng)因子(HGF)酪氨酸激酶受體,被配體激活后可導(dǎo)致其下游信號(hào)通路的激活,如Ras/ERK/MAPK、PI3K/Akt、Wnt/β-catenin和STAT等信號(hào)通路,進(jìn)而導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞增殖、侵襲以及腫瘤血管生成[12]。在NSCLC患者中,MET 14外顯子跳躍突變的發(fā)生概率為1%~3%,多見(jiàn)于老年NSCLC患者,一般不與EGFR、ALK、ROS1等致病基因同時(shí)存在,但常與TP53突變、CDKN2A/B缺失以及MET、MDM2或CDK4/6擴(kuò)增共存。研究表明,MET 14外顯子跳躍突變的NSCLC可對(duì)MET酪氨酸激酶抑制劑(TKIs)產(chǎn)生應(yīng)答,建議晚期NSCLC患者在二代基因測(cè)序中納入MET 14外顯子跳躍突變這一生物標(biāo)志物[13]。目前,靶向MET或HGF的藥物主要分為小分子TKIs和單克隆抗體。小分子TKIs又進(jìn)一步細(xì)分為多激酶MET抑制劑和選擇性MET抑制劑。多激酶MET抑制劑包括克唑替尼、卡博替尼、格列替尼、AMG208、奧曲替尼和戈伐替尼。選擇性MET抑制劑包括ATP競(jìng)爭(zhēng)性藥物卡馬替尼、特泊替尼以及非ATP競(jìng)爭(zhēng)性藥物替萬(wàn)替尼。單克隆抗體分為抗MET抗體奧那妥組單抗、依瑪妥珠單抗與抗HGF抗體非拉妥組單抗、利妥木單抗。這些靶向藥物在NSCLC治療中具有非常廣闊的應(yīng)用前景[14]。
2.2.LDC GLDC是一種與細(xì)胞代謝有關(guān)的致癌基因,定位于人染色體9p24.1。由人類GLDC編碼的P蛋白是甘氨酸裂解系統(tǒng)的關(guān)鍵酶,能夠分解代謝甘氨酸生成5,10-亞甲基四氫葉酸,從而參與細(xì)胞甘氨酸代謝。GLDCV1是GLDC的可變剪切異構(gòu)體,其外顯子1的3'端49~448位點(diǎn)缺失400 bp。與GLDC全長(zhǎng)cDNA產(chǎn)物相比,GLDCV1在194位點(diǎn)丟失了原始ATG序列。GLDC全長(zhǎng)cDNA產(chǎn)物GLDCf1及其剪切變體GLDCV1過(guò)表達(dá)可促進(jìn)正常肺成纖維細(xì)胞p-ERK、p-p38、Cyclin D1表達(dá),從而發(fā)揮促癌作用[15]。GLDC可通過(guò)外顯子跳躍方式來(lái)空間位阻反義寡核苷酸shAON,抑制NSCLC細(xì)胞GLDC過(guò)表達(dá)。在GLDC-shAON的腫瘤組織中,丙酮酸向乳酸的轉(zhuǎn)化水平顯著降低,丙酮酸脫氫酶和乳酸脫氫酶活性降低,細(xì)胞外酸化速率明顯受到抑制,順鉑的治療效果也隨之增強(qiáng)。這表明GLDC-shAON或可與常規(guī)化療藥物聯(lián)合應(yīng)用,從而增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞對(duì)化療藥物的敏感性[16]。在預(yù)后方面,GLDC過(guò)表達(dá)NSCLC患者的死亡風(fēng)險(xiǎn)是其低表達(dá)NSCLC患者的4倍。在與甘氨酸代謝有關(guān)的腫瘤中,應(yīng)用高毒性抗葉酸藥物甲氨蝶呤可能有效。聯(lián)合應(yīng)用抗葉酸藥物與GLDC表達(dá)抑制劑或?qū)ふ腋拾彼崃呀鈴?fù)合物特異性抗葉酸藥物,類似于在靶向治療中尋找激酶特異性抑制劑,或可成為更有效的靶向治療策略[17]。
2.3.BM RBM是一類RNA結(jié)合蛋白,包含RNA識(shí)別基序、RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域和核糖核蛋白基序,可參與RNA代謝,包括剪切、轉(zhuǎn)運(yùn)、翻譯及其穩(wěn)定性。研究發(fā)現(xiàn),RBM結(jié)合蛋白家族成員RBM異常表達(dá)和功能失調(diào)與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)。目前,已知的RBM超過(guò)50種。本文著重介紹具有潛在臨床應(yīng)用價(jià)值的RBM5和RBM10。
2.3.1.BM5 RBM5定位于人染色體3p21.3,是近年新發(fā)現(xiàn)的一種抑癌基因。在超過(guò)90%小細(xì)胞肺癌(SCLC)和50%~80% NSCLC患者中可檢測(cè)到RBM5缺失。RBM5的前體mRNA發(fā)生可變剪切后產(chǎn)生至少三種蛋白質(zhì)編碼變體,至少一種反義非編碼RNA在RBM5內(nèi)發(fā)生轉(zhuǎn)錄,激活線粒體細(xì)胞相關(guān)凋亡途徑,包括胱天蛋白酶2和細(xì)胞表面死亡受體Fas,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡。RBM5蛋白可參與細(xì)胞凋亡過(guò)程,與促凋亡蛋白Bax表達(dá)上調(diào)和抗凋亡蛋白Bcl-2、Bcl-xL表達(dá)下調(diào)有關(guān)。RBM5蛋白還能抑制細(xì)胞周期蛋白A表達(dá),誘導(dǎo)細(xì)胞周期G1期阻滯。此外,在順鉑耐藥的肺腺癌細(xì)胞中,RBM5蛋白還能增強(qiáng)肺腺癌細(xì)胞對(duì)順鉑的化療敏感性。因此,涉及RBM5的靶向治療策略有可能成為NSCLC的有效治療方法[18]。
2.3.2.BM10 RBM10定位于人X染色體p11.3,其轉(zhuǎn)錄體包含24個(gè)外顯子。RBM10蛋白含930個(gè)氨基酸,是一種腫瘤抑制因子,能夠降低Bcl-x的Bcl-xS亞型與Bcl-xL亞型比例,導(dǎo)致自身基因失活,減少EGFR抑制劑介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡,而其缺乏是對(duì)EGFR抑制劑治療反應(yīng)不佳的標(biāo)志[19]。RBM10蛋白可結(jié)合353種長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA),與核富集豐度轉(zhuǎn)錄物1(Neat1)有4個(gè)結(jié)合位點(diǎn)。RBM10蛋白主要位于Neat1的剪切異構(gòu)體Neat1_2上,而Neat1具有致癌作用。在RBM10蛋白過(guò)表達(dá)的NSCLC中,Neatl_1比例增加,Neatl_2比例降低,說(shuō)明RBM10蛋白通過(guò)可變剪切調(diào)節(jié)Neat1兩種可變剪切異構(gòu)體的平衡,并通過(guò)PTEN/PI3K/Akt/mTOR信號(hào)通路降低Neat1_2表達(dá),抑制NSCLC細(xì)胞的侵襲和遷移[20]。此外,RBM10蛋白截短突變常見(jiàn)于EGFR L858R突變的NSCLC患者,這部分患者對(duì)EGFR抑制劑的敏感性降低,其臨床結(jié)局通常比EGFR exon19 del缺失的NSCLC患者差,并且腫瘤進(jìn)展率高[19]。
2.4.cl-xL 根據(jù)功能不同,Bcl-2家族蛋白可分為促凋亡蛋白和抗凋亡蛋白兩種。其中,Bax為促凋亡蛋白,而Bcl-2、Bcl-xL為抗凋亡蛋白。Bcl-xL可結(jié)合Bcl-2家族的促凋亡蛋白,如Bax、Bad,從而阻止促凋亡離子通道開放,抑制凋亡信號(hào)激活。選擇性抑制Bcl-xL可提高多西他賽在NSCLC中的臨床療效,并且不會(huì)引起明顯的骨髓毒性。但是,由于Bcl-xL選擇性抑制劑的臨床療效有限,目前還沒(méi)有藥物進(jìn)入臨床試驗(yàn)。研究表明,無(wú)法進(jìn)入線粒體導(dǎo)致脫靶是Bcl-xL選擇性抑制劑A-1331852在實(shí)體瘤中療效不佳的重要原因。線粒體無(wú)毒小分子NA-2a通過(guò)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白選擇性聚集在線粒體中,改變了線粒體膜的通透性,從而促進(jìn)A-1331852進(jìn)入線粒體并與其靶點(diǎn)結(jié)合,增加抗腫瘤活性。因此,NA-2a聯(lián)合A-1331852成為一種有前景的NSCLC治療選擇[21]。新型Bcl-2/Bcl-xL雙抑制劑APG1252-M與第三代EGFR抑制劑奧希替尼聯(lián)合使用,能夠誘導(dǎo)EGFR突變的NSCLC細(xì)胞凋亡,降低奧希替尼獲得性耐藥概率,有效抑制奧希替尼耐藥NSCLC細(xì)胞的增殖[22]。ABT263是一種可誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的小分子Bcl-2抑制劑,能夠通過(guò)靶向Bcl-2/Bcl-xL改善常氧條件下放療對(duì)腫瘤細(xì)胞的毒性作用,克服體內(nèi)外暴露于急性或循環(huán)缺氧腫瘤細(xì)胞的放療抗性[23]。在高分化和中分化肺鱗癌中Bcl-xS表達(dá)顯著升高,其高表達(dá)與較高的總生存率顯著相關(guān),是手術(shù)切除肺鱗癌患者預(yù)后良好的獨(dú)立預(yù)測(cè)因素[24]。
2.5.RSF SRSF是一類富絲氨酸/精氨酸的剪切因子,具有相似的結(jié)構(gòu)域,即N末端的RNA識(shí)別結(jié)構(gòu)域和C末端的富絲氨酸/精氨酸結(jié)構(gòu)域。本文著重介紹SRSF5、SRSF9兩種最具臨床價(jià)值的可變剪切體。
2.5.1.RSF5 SRSF5參與前體mRNA的可變剪切及翻譯過(guò)程,其編碼蛋白在多種腫瘤中異常表達(dá)。SRSF5蛋白在肺癌中表達(dá)上調(diào),尤其是在SCLC中的表達(dá)顯著高于肺腺癌或肺鱗癌。SRSF5蛋白對(duì)NSCLC胸腔積液中惡性細(xì)胞的鑒別診斷價(jià)值較高,優(yōu)于臨床常用的腫瘤標(biāo)志物癌胚抗原(CEA)。SRSF5蛋白還能檢出CEA假陰性中70%非NSCLC患者。這提示SRSF5蛋白或可作為一種檢測(cè)SCLC和胸膜轉(zhuǎn)移的新型標(biāo)志物[25]。
2.5.2.RSF9 SRSF9定位于人12號(hào)染色體,其編碼蛋白在腦、結(jié)腸、肺及皮膚等部位惡性腫瘤組織中高表達(dá)。在肺腺癌中,SRSF9蛋白高表達(dá)與腫瘤突變負(fù)荷及患者總生存期呈正相關(guān)關(guān)系,這為肺腺癌預(yù)后評(píng)估提供了新的思路;在肺鱗癌中,SRSF9蛋白表達(dá)與B細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、CD4+T細(xì)胞、CD8+T細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞、巨噬細(xì)胞等六種免疫浸潤(rùn)細(xì)胞呈負(fù)相關(guān)關(guān)系,而與腫瘤純度呈正相關(guān)關(guān)系,提示SRSF9可能通過(guò)免疫抑制作用影響肺鱗癌進(jìn)展。因此,SRSF9在NSCLC免疫治療和預(yù)后評(píng)估方面表現(xiàn)出一定優(yōu)勢(shì)[26]。
2.6.DD3 細(xì)胞骨架基因在調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)和遷移中起關(guān)鍵作用。Adducin屬于膜骨架蛋白家族,由ADD1、ADD2和ADD3編碼,分別映射至染色體三個(gè)不同位置,其中ADD3編碼蛋白對(duì)維持細(xì)胞骨架至關(guān)重要。ADD3定位于人染色體功能性腫瘤抑制區(qū)域10q25.1-25.2,其編碼蛋白除了作為細(xì)胞骨架蛋白外,還是腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)的負(fù)性調(diào)節(jié)因子,其表達(dá)變化與腫瘤惡性表型和臨床預(yù)后呈負(fù)相關(guān)關(guān)系[27]。人類ADD3共有15個(gè)外顯子,其中外顯子14易發(fā)生可變剪切。QKI-5以位置依賴性方式與內(nèi)含子13的3'端多個(gè)位點(diǎn)結(jié)合,抑制ADD3外顯子14可變剪切,從而抑制腫瘤的發(fā)生、發(fā)展。ADD3的總mRNA水平在腫瘤組織與正常組織之間相差無(wú)幾,但由于mRNA存在可變剪切這一特殊的加工方式,不同的外顯子進(jìn)行拼接產(chǎn)生不同的剪切產(chǎn)物。有研究報(bào)道,受腫瘤微環(huán)境的影響,ADD3外顯子14表達(dá)在肺癌組織中上調(diào)1.43~3.76倍,并且其表達(dá)與患者生存期和QKI mRNA表達(dá)呈負(fù)相關(guān)關(guān)系[28]。在ADD3 16個(gè)外顯子中,外顯子15傾向于在NSCLC中表達(dá),而在正常肺組織中不表達(dá),在高轉(zhuǎn)移性乳腺癌中亦有同樣趨勢(shì),這表明ADD3特異性可變剪切體可能在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中具有重要作用,或可作為一種新的腫瘤生物標(biāo)志物預(yù)測(cè)腫瘤的發(fā)生、發(fā)展[29]。
綜上所述,可變剪切是調(diào)節(jié)基因表達(dá)和產(chǎn)生蛋白質(zhì)組多樣性的重要機(jī)制,可變剪切基因異常幾乎與腫瘤細(xì)胞的所有特征表型有關(guān),能夠參與多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展以及治療耐藥。在NSCLC中的可變剪切基因主要有MET、GLDC、RBM、Bcl-xL、SRSF、ADD3等,這些可變剪切基因能夠參與NSCLC細(xì)胞的增殖、分化、凋亡等一系列生物學(xué)行為。近年在可變剪切領(lǐng)域的研究中取得了巨大進(jìn)展,很大程度上促進(jìn)了腫瘤靶向藥物的研發(fā)。但關(guān)于NSCLC預(yù)后標(biāo)志物或治療靶點(diǎn)的潛在可變剪切基因還有很多,許多基于可變剪切的靶向治療還遠(yuǎn)未進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段,仍需進(jìn)一步探索。