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四種品系中華鱉的形態(tài)差異和通徑分析

2023-07-27 07:09王芬宋光同陳祝徐彬季索菲周翔徐笑娜侯冠軍張曄李端朱成駿蘇友風(fēng)董振興蔣業(yè)林
中國農(nóng)學(xué)通報 2023年20期
關(guān)鍵詞:決定系數(shù)通徑品系

王芬,宋光同,陳祝,徐彬,季索菲,周翔,徐笑娜,侯冠軍,張曄,李端,朱成駿,蘇友風(fēng),董振興,蔣業(yè)林,7

(1安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院水產(chǎn)研究所/水產(chǎn)增養(yǎng)殖安徽省重點實驗室,合肥 230031;2安徽省鱉類養(yǎng)殖工程技術(shù)研究中心/安徽省喜佳農(nóng)業(yè)發(fā)展有限公司,安徽蚌埠 233701;3馬鞍山春盛生態(tài)農(nóng)業(yè)有限公司,安徽馬鞍山 243000;4宣城銅樂農(nóng)業(yè)開發(fā)有限公司,安徽宣城 242057;5桐城市蘇氏農(nóng)業(yè)發(fā)展有限公司,安慶桐城 231400;6合肥雅度人思養(yǎng)殖專業(yè)合作社,安徽合肥 231141;7安徽省昱濤農(nóng)業(yè)科技有限公司,安徽合肥 230031)

0 引言

中華鱉(Pelodiscus sinensis)屬爬行綱(Reptilia)、龜鱉目 (Testudinata)、鱉科(Trionychidae)、鱉屬(Pelodiscus)。廣泛分布于中國、日本、泰國等亞洲國家[1-2]。在中國,主要分布在長江中下游以及華南地區(qū)[3-4]。2019年,全國總產(chǎn)量為325497 t,約占淡水養(yǎng)殖總量的1.15%[5]。中華鱉沒有明顯的亞種分化,但是中國幅員遼闊,氣候差異大,不同地域形成了各自的地理品系,如黃河、淮河、洞庭湖品系等[4]。安徽省屬暖溫帶與亞熱帶的過渡地區(qū),地跨長江、淮河、新安江三大流域,境內(nèi)主要養(yǎng)殖的中華鱉有淮河、黃河、長江、日本、烏鱉和清溪花鱉等群體,2021年年產(chǎn)量4.2618萬t,約是10 年前產(chǎn)量的2.62 倍[5-6]。養(yǎng)殖產(chǎn)量的快速增加促使制約行業(yè)發(fā)展的問題日漸突出,尤其是良種缺乏,而育種材料不足是影響良種培育的關(guān)鍵。外部形態(tài)特征作為種質(zhì)資源鑒定的方法之一,是魚類分類的重要依據(jù),具有簡單、直觀的優(yōu)勢。體重是產(chǎn)能的直接反應(yīng),是其遺傳育種研究的重要依據(jù),也是良種選育最直接的目標(biāo)性狀[7]。

多元統(tǒng)計分析方法已被廣泛的應(yīng)用于水產(chǎn)動物育種和進(jìn)化方面的研究,如蝦類[8-10]、魚類[11-12]、蟹類[13-14]、貝類[15-16]等。對中華鱉不同群體外部形態(tài)特征的研究較多。1997 年,李思發(fā)等[17]對華東地區(qū)中華鱉地方群體形態(tài)差異進(jìn)行初步研究,發(fā)現(xiàn)對判別分析貢獻(xiàn)較大的形態(tài)參數(shù)在不同性別和大小的鱉有所不同。金晶等[18]通過聚類分析、主成分分析和判別方法比較了5個不同地理種群的中華鱉,發(fā)現(xiàn)中華鱉群體間形態(tài)差異主要表現(xiàn)在背甲周長、裙邊寬、頭部和尾部。梁宏偉等[19]對3 個品系和性別的形態(tài)差異進(jìn)行分析,并建立了相應(yīng)的判別函數(shù)。肖鳳芳等[7]運用通徑分析和多元回歸分析的方法,通過分析黃河、洞庭和綠卡群體的形態(tài)性狀與體質(zhì)量的關(guān)系并建立回歸方程,找到了影響體重的主要形態(tài)性狀。

本研究通過分析安徽省主養(yǎng)品系中華鱉的形態(tài)差異以及形態(tài)與體重的相關(guān)性,旨在為安徽省中華鱉育種材料的選育工作提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 實驗材料

選擇體質(zhì)健壯、體表完整無傷、無畸形、無疾病的長江、烏鱉、日本和黃河品系的中華鱉,各品系平均體重約為150 g。其中,中華鱉長江品系采自馬鞍山春盛生態(tài)農(nóng)業(yè)有限公司(安徽馬鞍山),烏鱉采自安徽黑神生態(tài)農(nóng)業(yè)有限公司(安徽蕪湖),中華鱉日本品系和黃河品系采自安徽省喜佳農(nóng)業(yè)發(fā)展有限公司(安徽蚌埠)。

1.2 測定項目和方法

每個品系測定30 只。采用電子游標(biāo)卡尺測定對身體的形狀參數(shù)進(jìn)行測定,包括背甲長、背甲寬、體高、腹甲長、腹甲寬、裙邊厚、頭寬、眼間距、吻突長。所有的參數(shù)測定均根據(jù)測量方法根據(jù)國標(biāo)GB 21044—2007。

1.3 數(shù)據(jù)分析

試驗結(jié)果用平均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,采用的統(tǒng)計軟件為SPSS 22.0,數(shù)據(jù)經(jīng)單因素方差分析,聚類分析和主成分分析。為消除樣品規(guī)格對形態(tài)參數(shù)值的影響,本研究先將可量性狀數(shù)據(jù)與背甲長之比作為校正,再進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。

單因素方差分析采用LSD法并進(jìn)行多重比較,以檢驗不同形態(tài)比值性狀間的差異顯著性。聚類分析采用歐氏距離的最短距離法對各群體8個比例性狀的平均值進(jìn)行系統(tǒng)聚類,繪出反映形態(tài)相似性的樹形圖;對4 個品系中華鱉形態(tài)指標(biāo)進(jìn)行主成分分析,得到各主成分特征值和貢獻(xiàn)率。判別分析采用逐步判別法進(jìn)行,選擇對4 個群體形態(tài)差異貢獻(xiàn)較大的參數(shù)建立判別函數(shù)。

根據(jù)通徑分析結(jié)果,保留通徑系數(shù)檢結(jié)果顯著的自變量,將通徑系數(shù)檢驗結(jié)果不顯著的自變量剔除,剖析表型性狀對4個品系中華鱉體重的直接作用以及間接作用,使用逐步回歸方法列出估測4 個品系中華鱉表型性狀作用于體重的最優(yōu)多元回歸方程。

計算各個性狀間的Pearson 相關(guān)系數(shù),利用t檢驗檢驗相關(guān)系數(shù)的顯著性。

通徑分析是在多元回歸的基礎(chǔ)上將相關(guān)系數(shù)分解為直接通徑系數(shù)和間接通徑系數(shù)。其相關(guān)的計算公式見(1)~(3)。

其中,Pi代表性狀對軟體質(zhì)量的通徑系數(shù),Pij為xi通過xj對y的間接通徑系數(shù),決定系數(shù)di為相關(guān)系數(shù)的平方,rij代表兩性狀間的相關(guān)系數(shù),Pjy代表xj對y的直接通徑系數(shù)。dij為不同性狀xi和xj共同對y的決定系數(shù)。

2 結(jié)果與分析

2.1 形態(tài)參數(shù)

4個品系的8個性狀比例統(tǒng)計結(jié)果見表1。除吻突長/背甲長,黃河鱉品系的7 個性狀比例均最大,且與烏鱉品系和長江品系存在顯著性差異。除背甲寬/背甲長、眼間距/背甲長和吻突長/背甲長和與日本鱉品系不存在顯著性差異外,其余性狀參數(shù)均在顯著性差異。長江品系的8個性狀比例均顯著性小于日本鱉和黃河鱉品系。且除體高/背甲長和裙邊厚/背甲長兩個性狀比例小于烏鱉品系外無顯著性差異,其余性狀比例均最小。從分析結(jié)果可以看出不同品系的中華鱉具有不同的形態(tài)特征,可滿足不同養(yǎng)殖生產(chǎn)的需要。

表1 4個品系中華鱉的形態(tài)比例參數(shù)

2.2 聚類分析

聚類分析能夠較準(zhǔn)確揭示中華鱉不同品系間的形態(tài)差異,進(jìn)而判別形態(tài)差異明顯的親本。從圖1 可以看出,4個中華鱉群體被聚為兩大類,烏鱉品系和長江品系形態(tài)相近,而日本品系和黃河品系形態(tài)相近。

圖1 4個品系中華鱉的聚類分析圖

2.3 典型區(qū)別函數(shù)

以8個形態(tài)比值為變量進(jìn)行判別分析,共獲得了3個典型判別式函數(shù):D1,D2和D3,相應(yīng)的系數(shù)見表2,相應(yīng)的方差依次為95.7、3.0 和1.2。第一和第二判別函數(shù)散布圖見圖2,日本鱉品系和黃河鱉品系不能清晰的分開,錯判現(xiàn)象比較明顯。其原始數(shù)值判別和交叉驗證結(jié)果見表3。

圖2 4個品系中華鱉第一、第二辨別函數(shù)散布圖

表2 典型區(qū)別函數(shù)系數(shù)

表3 4個品系中華鱉的辨別結(jié)果

判別結(jié)果表明4 個品系中華鱉有76.7%原始分組觀察值被正確分類。烏鱉、日本、長江和黃河品系的原始觀察值正確分類的比例依次為83.3%、83.3%、80.0%和60%。其中烏鱉和長江品系分別有16.7%和20.0%的原始觀察值被分到對方,而日本和黃河品系分別有16.7%和40%的原始值被分到對方。經(jīng)過交叉驗證得出的結(jié)果比初始判別結(jié)果低,4 個品系的中華鱉分類準(zhǔn)確率分別為73.3%、70.0%、73.3%和53.3%,綜合判別準(zhǔn)確率為67.5%。其中烏鱉品系有6.7%和20.0%被錯分至日本和長江品系,日本品系有3.3和26.7%被錯分至烏鱉和黃河品系。長江品系有26.7%被錯分至烏鱉品系,黃河品系有46.7%被錯分至日本品系。綜合以上判別結(jié)果可知,烏鱉品系和長江品系形態(tài)相似,而日本品系和黃河品系形態(tài)相似,該結(jié)果與聚類分析結(jié)果一致。

2.4 主成分分析

對所有樣本的性狀比例進(jìn)行主成分分析,特征值大于1的主成分共1個,可解釋不同群體之間的形態(tài)差異的69.417%,其中貢獻(xiàn)率較大的背甲寬/背甲長、腹甲長/背甲長、腹甲寬/背甲長、頭寬/背甲長和體高/背甲長。表明影響4 個品系的主成分主要集中在背甲、腹甲、頭寬和體高等體型特征中。

2.5 體重與形態(tài)形狀間的表型相關(guān)系數(shù)

4個品系中華鱉各形態(tài)和體重間的表型相關(guān)系數(shù)如表4 所示,烏鱉品系和黃河品系體重分別與吻突長和裙邊厚不存在顯著性相關(guān),4 個品系中華鱉與其余形態(tài)參數(shù)均呈現(xiàn)極顯著的正相關(guān)關(guān)系。另4個品系中華鱉形態(tài)性狀之間大部分呈現(xiàn)極顯著的正相關(guān)關(guān)系,很有可能存在不同程度的多重共線性問題。為了進(jìn)一步明確各性狀對提高體重的重要性,運用通徑分析研究形態(tài)性狀對體重的直接和間接作用,并運用多元逐步回歸分析法建立體重與形態(tài)性狀的回歸方程。

表4 4個品系中華鱉與形態(tài)參數(shù)的相關(guān)性

2.6 性狀對體重的直接作用和間接作用

對4 個品系中華鱉的各形態(tài)參數(shù)進(jìn)行Kolmogorov-Smirnov 單樣本正態(tài)檢驗,均符合正態(tài)分布(p>0.05)假設(shè),進(jìn)行以體重為因變量的回歸分析,獲得各形態(tài)學(xué)性狀對體重的通徑系數(shù),并排除存在共線性的形態(tài)性狀。形態(tài)學(xué)性狀對體重的直接作用和通過其他形態(tài)性狀對體重的間接作用見表5。

表5 4個品系中華鱉形態(tài)對體質(zhì)量的直接作用和間接作用

烏鱉品系的形態(tài)對體重的通徑分析中,背甲長和體高達(dá)到了顯著性水平(p<0.05),二者對體重的直接作用分別為0.222 和0.784,背甲長通過體高對體重的間接作用為0.639,體高通過背甲長對體重的間接作用為0.176。體高對體重的決定系數(shù)為0.615,比背甲長大,故體高是對烏鱉品系體重影響最大的形態(tài)性狀。2個性狀的單獨決定系數(shù)與共同決定系數(shù)之和∑d為0.948,大于0.85,可見體高和背甲長是影響烏鱉品系體重的主要因素,其他形態(tài)影響較小。

日本品系通徑系數(shù)達(dá)顯著水平的有背甲寬和頭寬,直接作用分別為0.580 和0.413,間接作用分別為0.367和0.515,表明背甲寬對體重的直接作用大,而頭寬對體重的間接影響大。背甲寬和頭寬對體重的決定系數(shù)分別為0.336 和0.171,背甲寬通過頭寬對體重的決定系數(shù)為0.425,背甲寬對體重的影響較大。2個性狀的單獨決定系數(shù)與共同決定系數(shù)之和∑d為0.932,大于0.85,可見背甲寬和頭寬是影響烏鱉品系體重的主要因素,其他影響較小。

腹甲長,頭寬和背甲寬對長江品系中華鱉體重的通徑系數(shù)達(dá)顯著水平,腹甲長對體重的直接作用最大,為0.869,頭寬對體重有負(fù)向作用。間接作用中,腹甲長和背甲寬的共同決定程度最高,為0.821。3 個性狀的單獨決定系數(shù)與共同決定系數(shù)之和∑d為0.935,大于0.85,說明這3 個形態(tài)性狀是影響長江品系中華鱉體重的主要因素。

背甲長,腹甲寬和腹甲長對黃河品系中華鱉體重的通徑系數(shù)達(dá)顯著水平,背甲長對體重的直接作用最大,腹甲長通過背甲長對體重的間接影響最高,為0.446。3個性狀的單獨決定系數(shù)與共同決定系數(shù)之和∑d為0.971,大于0.85,說明這3個形態(tài)性狀是影響黃河品系中華鱉體重的主要因素。

2.7 多元回歸方程

以體重為因變量(Y),以形態(tài)性狀為自變量,對不同品系的中華鱉體重進(jìn)行多元回歸分析,根據(jù)顯著性檢驗結(jié)果,舍去偏回歸系數(shù)不顯著的自變量,得到對體重與具有顯著性影響形態(tài)的多元回歸方程見式(4)~(7)。

對4 個品系中華鱉的多元回歸方程進(jìn)行方差分析,相關(guān)系數(shù)R2分別為0.948、0.932、0.935 和0.971,回歸常數(shù)和所有的標(biāo)準(zhǔn)偏回歸系數(shù)均達(dá)到顯著水平(p<0.05),F(xiàn)值依次為246.725、184.931、125.529 和293.33,說明回歸方程有統(tǒng)計學(xué)意義,可以應(yīng)用于實際生產(chǎn)中。

3 討論與結(jié)論

3.1 多元分析

形態(tài)學(xué)方法是通過不同的種群具有不同的形態(tài)學(xué)特征而對種群進(jìn)行鑒別的方法,是判明群體間差異的主要手段[20]。1997 年,李思發(fā)等[17]采用多元分析方法對華東地區(qū)中華鱉地方群體形態(tài)差異進(jìn)行初步研究。本研究通過聚類分析可對不同群體進(jìn)行初步歸類,主成分分析結(jié)果顯示載荷較大的性狀主要集中在背部和腹部,這與梁宏偉等[19]的報道是一致的。判別方程式中貢獻(xiàn)較大的變量也多分布于背部和腹部,說明背部和腹部的形態(tài)差異是區(qū)分烏鱉、日本、長江和黃河品系的主要依據(jù)。在判別結(jié)果中,烏鱉品系和長江鱉易誤判至對方品系,日本品系和黃河品系易錯判至對方品系,說明烏鱉品系和長江品系,日本品系和黃河品系形態(tài)差異最小,親緣關(guān)系最相近。烏鱉品系和長江品系中華鱉分別來源于蕪湖和馬鞍山,地理位置較近,這2個群體的祖先可能是同一種群,而日本品系和黃河品系中華鱉來源于蚌埠,采集的樣品可能為是這2 個品系的雜交子代。判別結(jié)果與聚類結(jié)果一致,即烏鱉品系和長江品系中華鱉聚為一類,日本品系和黃河品系中華鱉聚為一類。

3.2 通徑分析

體重作為魚類選育的重要經(jīng)濟指標(biāo),很大程度上決定了生產(chǎn)性能,而且受到多項形態(tài)性狀的影響。不同的地理群體,在形態(tài)上亦存在差異,對影響體重的主要因素亦不相同[4,21]。本研究結(jié)果表明,4 個品系中華鱉體重與大部分形態(tài)性狀的相關(guān)性達(dá)極顯著水平,但并不能說明該形態(tài)性狀能夠顯著性影響體重。另外,形態(tài)性狀兩兩之間也均為極顯著相關(guān),這可能會出現(xiàn)多重共線性現(xiàn)象,通徑分析找出實際影響體重的主要形態(tài)性狀,并將相關(guān)系數(shù)分解為性狀對體重的直接作用和間接作用,明確不同形態(tài)性狀的重要性[22-23]。經(jīng)過通徑分析,發(fā)現(xiàn)對烏鱉、日本、長江和黃河品系中華鱉體重的影響最大的形態(tài)依次為體高、背甲寬、腹甲長和背甲長。肖鳳芳等[7]報道對黃河品系體重影響較大的形態(tài)性狀為背甲長和體高,而本研究報道的影響黃河品系體重的形態(tài)性狀為背甲長,腹甲寬和腹甲長。推測造成這種差異的主要因素在于取樣大小不同造成的,肖鳳芳采集的樣品為13 月齡的,體重約為340 g,而本研究采集的樣本為150 g左右的幼鱉。

4 結(jié)論

不同品系中華鱉具有不同的形態(tài)特征,主要形態(tài)差異集中在背部和腹部,可滿足不同養(yǎng)殖生產(chǎn)的需要。對不同品系中華鱉體質(zhì)量影響的主要形態(tài)性狀亦不相同,針對性的對體質(zhì)量有顯著性影響的性狀進(jìn)行選育,可有效提高選育效率。

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