李亞萍,戴惠明,姜 武,陳家棟,段曉婧,陶正明
(1.浙江農(nóng)林大學(xué) 食品與健康學(xué)院 浙江省特色中藥資源保護(hù)與創(chuàng)新利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,浙江 杭州 311300;2.浙江省亞熱帶作物研究所,浙江 溫州 325005;3.永嘉縣自然資源和規(guī)劃局,浙江 永嘉 325199)
黃精Polygonatumspp.的干燥根莖是常用的一味中藥[1],具有補(bǔ)氣養(yǎng)陰、健脾、益腎等功效,臨床常用于脾胃氣虛、胃陰不足、精血不足、腰膝酸軟等證[2-3]?,F(xiàn)代研究發(fā)現(xiàn):黃精含有多糖、甾體皂苷、木質(zhì)素等多種化合物,其中黃精多糖被認(rèn)為是黃精主要的活性成分,可清除自由基,延緩衰老,降低血乳酸,緩解疲勞等。黃精多糖的降血糖和抗炎等多種作用相互協(xié)作,為研究治療糖尿病提供了較好的思路。黃精藥性平和,不僅具有多種藥理作用,還有一定滋補(bǔ)作用,故在復(fù)方湯劑以及中成藥的守正創(chuàng)新中具有較好的應(yīng)用前景[4-5]。另外,黃精因具有獨(dú)特風(fēng)味和較好的口感,已被開發(fā)出多種保健食品,如黃精藥膳、黃精酒、黃精飲料、黃精酸奶等[6]。隨著大健康產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,黃精保健食品的復(fù)合開發(fā)具有極大的市場(chǎng)潛力。
黃精品種多,適應(yīng)能力強(qiáng),分布廣[7]。黃精遺傳多樣性保護(hù)與優(yōu)良品種選育可以提高黃精品質(zhì)與產(chǎn)量,促進(jìn)黃精產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。葉錢等[8]對(duì)多花黃精P.cyrtonema有效成分與主要環(huán)境因子的相關(guān)性進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)不同種源的多花黃精化學(xué)成分存在差異,這為進(jìn)一步探討黃精品質(zhì)與環(huán)境因素之間關(guān)系提供了理論依據(jù)。
相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(SRAP)分子標(biāo)記技術(shù)在植物遺傳多樣性方面研究應(yīng)用較多,但在藥用植物應(yīng)用較少,如何首烏[9]。另有研究表明:SRAP 分子技術(shù)能較好地用于鐵皮石斛Dendrobiumofficinale品種親緣關(guān)系的研究[10],但此技術(shù)尚未見用于黃精遺傳多樣性分析。與之前研究使用的簡(jiǎn)單重復(fù)序列SSR 多態(tài)位點(diǎn)分析方法[11]、多態(tài)性分子標(biāo)記(SCoT)方法[12]和簡(jiǎn)單序列間重復(fù)(ISSR)分子標(biāo)記方法[13]、葉綠體基因聯(lián)合序列分析[14]等技術(shù)相比,SRAP 分子標(biāo)記技術(shù)以基因的開放閱讀框 (open reading frames,ORFs)的特定區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增,具有簡(jiǎn)單、可靠、共顯性高等特點(diǎn)[15]。本研究采用SRAP 分析技術(shù)對(duì)華東、西北、華中、西南4 個(gè)居群47 份黃精種質(zhì)資源的遺傳多樣性進(jìn)行研究,為黃精的遺傳多樣性與優(yōu)良品種選育研究提供依據(jù),以更好地保護(hù)和開發(fā)黃精種質(zhì)資源。
收集華東居群(浙江省、福建省、安徽省、江西省),西北居群(河北省、陜西省),華中居群(湖南省),西南居群(四川省、貴州省、云南省)的黃精干燥葉片,共47 份種質(zhì)資源,各種質(zhì)資源位置信息如表1所示。樣品采集后置于密封袋中干燥保存,經(jīng)浙江省亞熱帶作物研究所陶正明研究員鑒定后為多花黃精、長(zhǎng)梗黃精P.filipes、黃精P.sibiricum、滇黃精P.kingianum。
表1 黃精種質(zhì)采集信息Table 1 Collected information of Polygonatum spp.
將150~450 mg 葉片于液氮下研成粉末,采用杭州萊楓生物科技有限公司的plant DNAzol 試劑,逐一提取DNA 后用核酸蛋白分析儀測(cè)定其質(zhì)量濃度及質(zhì)量分?jǐn)?shù),均稀釋至20 mg·L-1,于-20 ℃保存待用。
PCR 反應(yīng)體系參照文獻(xiàn)[16]。具體為:12.5 μL 2×預(yù)混型Taq酶,1.0 μL 濃度為10 mmol·L-1的引物,模板DNA 40~60 ng,補(bǔ)水至25.0 μL。擴(kuò)增程序?yàn)椋侯A(yù)變性94 ℃ 5 min;變性94 ℃ 30 s,退火52℃ 30 s,延伸72 ℃ 2 min,35 個(gè)循環(huán)后結(jié)束。72 ℃延伸7 min,4 ℃保存。電泳方法:反應(yīng)產(chǎn)物5.0 μL,質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1.2%聚丙烯酰胺凝膠電泳,5×TBE 緩沖液,150 V 跑膠 40 min,結(jié)束后凝膠成像系統(tǒng)拍照留存。
由SRAP-PCR 電泳結(jié)果獲得0/1 矩陣。使用PopGene version 1.32 進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)算多態(tài)位點(diǎn)百分率(PPB)、等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei’s 基因多樣性指數(shù)(H)、Shannon’s 多態(tài)性信息指數(shù)(I)、Nei’s 基因分化系數(shù)(Gst)、居群總基因多樣性(Ht)、居群內(nèi)基因多樣性(Hs)、基因流(Nm);使用Ntsys-PC 2.1 進(jìn)行非加權(quán)組平均法(UPGMA)聚類分析。
88 對(duì)SRAP 引物中篩選出7 對(duì)擴(kuò)增條帶清晰且多態(tài)性明顯的SRAP 引物。引物序列見表2。47 份樣品共檢測(cè)到159 條擴(kuò)增條帶,其中140 條為多態(tài)性條帶,PPB 為88.05%。引物ME4/em3 擴(kuò)增條帶數(shù)最多,但其多態(tài)率最低,為68.29%。而引物ME5/em9、ME6/em4 兩者多態(tài)性條帶數(shù)與擴(kuò)增條帶數(shù)量一致,多態(tài)率為100.00%(表3,圖1)。
圖1 引物ME5/em9 和ME6/em4 對(duì)47 份黃精種質(zhì)資源總DNA 的擴(kuò)增結(jié)果Figure 1 Amplification results of total DNA based on primer ME5/em9 and ME6/em4 from 47 samples of Polygonatum spp.
表2 SRAP 引物序列Table 2 Primer sequences for SRAP
表3 SRAP 引物組合的擴(kuò)增結(jié)果Table 3 Amplification results of combinated SRAP primers
物種水平上黃精PPB 為88.05%,H為0.259 8±0.166 9,I為0.401 0±0.227 2 (表4),表明黃精有較高的遺傳多樣性和遺傳變異度。居群水平上,Na為1.421 4~1.861 6,平均值為1.600 6;Ne為1.276 1~1.421 2,平均值為1.343 6;H為0.188 1~0.259 1,平均值為0.204 1;I為0.238 2~0.399 4,平均值為0.308 0;PPB 為42.14%~86.16%(表4),從高到低依次是華東居群、西南居群、華中居群、西北居群,表明華東居群遺傳多樣性豐富,遺傳變異度較高。4 個(gè)黃精居群之間的Ht為0.253 3±0.029 4,Hs為0.204 1±0.020 1,基因分化系數(shù)Gst為0.194 1,即居群間遺傳變異占居群遺傳變異的19.41%,80.59%的遺傳變異在居群內(nèi)進(jìn)行;種群間的遺傳分化系數(shù)基因流Nm為2.075 4,表明居群間存在一定的基因流動(dòng)。
表4 黃精居群遺傳多樣性Table 4 Genetic diversity of Polygonatum spp.
對(duì)樣品個(gè)體進(jìn)行聚類分析(圖2),47 份黃精種質(zhì)資源的遺傳相似系數(shù)為0.63~0.84。當(dāng)相似系數(shù)為0.63,浙江泰順種質(zhì)資源單獨(dú)聚為一類,表明此種質(zhì)資源與其他黃精種質(zhì)資源的遺傳距離較遠(yuǎn)。當(dāng)相似系數(shù)為0.66,聚為4 類,Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ 類為浙江部分種質(zhì)資源單獨(dú)聚類,表明這些地區(qū)的黃精種質(zhì)資源在親緣關(guān)系上比較接近,可能與引種有關(guān)。當(dāng)相似系數(shù)為0.68 時(shí),Ⅱ類分聚為2 支,華東地區(qū)的安徽、江西與浙江龍泉、慶元、松陽(yáng)部分種質(zhì)資源以及少數(shù)華中居群聚為一支,另一支為華東地區(qū)的浙江景寧、慶元和松陽(yáng)部分種質(zhì)資源與多數(shù)華中、西南、西北居群聚類,西北居群與西南居群雖然地理差異大,但黃精種質(zhì)資源之間的遺傳距離相差并不大,種質(zhì)資源之間親緣關(guān)系較近,可能與黃精引種栽培有關(guān)。慶元地區(qū)是黃精種植開始較早的地方,因此種質(zhì)引進(jìn)種植比較多樣,所以采集數(shù)量最多。由圖2可以看出,慶元7 份種質(zhì)資源分別聚為4 類:ZJQY8 和ZJQY13與ZJSY15、ZJLQ18~20、AHQM41~42、JXWY43~44 以及HNAH32 聚為一類;ZJQY11與ZJYQ7 聚為一類;ZJQY14 與ZJCA2~3、ZJOH6聚為一類;ZJQY9~10 和ZJQY 12 與部分華東、華中以及西北、西南種質(zhì)資源聚為一大類,遺傳多樣性豐富。
圖2 基于SRAP 的黃精種質(zhì)資源UPGMA 分析聚類圖Figure 2 UPGMA dendrogram of Polygonatum spp.based on SRAP
對(duì)4 個(gè)居群的種質(zhì)資源進(jìn)行聚類,遺傳相似系數(shù)為0.90~0.97 (圖3)。相似系數(shù)為0.90 時(shí),可分為2 類,華東居群、西南居群與華中居群聚為一類,西北居群?jiǎn)为?dú)為一類。
圖3 基于SRAP 的黃精居群UPGMA 分析聚類圖Figure 3 UPGMA dendrogram of Polygonatum spp.populations based on SRAP
遺傳多樣性是生物多樣性的核心,是物種保持進(jìn)化潛能的基本條件,也是優(yōu)良品種選育的主要依據(jù)[17]。本研究采用SRAP 分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)47 份黃精種質(zhì)資源進(jìn)行分析,多態(tài)性比率為88.05%,表明黃精遺傳多樣性豐富,其中華東居群遺傳多樣性相對(duì)其他地區(qū)更豐富一些。推測(cè)有2 種原因:一是與地區(qū)采樣量有關(guān),二是華東地區(qū)黃精種質(zhì)資源以多花黃精為主。多花黃精遺傳多樣性高于黃精[18]。相對(duì)于SRAP 分子標(biāo)記方法,使用ISSR 方法,對(duì)福建多花黃精與長(zhǎng)梗黃精多態(tài)性比率可達(dá)100%,使用SCoT 分子標(biāo)記技術(shù),多態(tài)性比率可達(dá)為99.6%[12-13]。從多態(tài)位點(diǎn)來看,另外2 種標(biāo)記方法優(yōu)于SRAP 技術(shù)。物種或者居群的遺傳多樣性越高,對(duì)環(huán)境變化的適應(yīng)能力就越強(qiáng)。在本研究中,華東居群整體上遺傳多樣性高,與朱巧等[19]的研究結(jié)果相反。他們對(duì)60 份黃精種質(zhì)資源進(jìn)行SSR 分子標(biāo)記分析,其結(jié)果為西部地區(qū)黃精種質(zhì)資源遺傳多樣性最高,與黃精屬起源中心為西南地區(qū)染色體基數(shù)較高有關(guān),但結(jié)合居群聚類結(jié)果,華東與西南遺傳相似系數(shù)最近,且聚為一類。這可能是因?yàn)辄S精自西南引種之后,在華東地區(qū)對(duì)環(huán)境變化的適應(yīng)力較強(qiáng),保留了一定的遺傳多樣性,所以華東地區(qū)在黃精遺傳多樣性保護(hù)以及優(yōu)良品種選育方面有一定的地理優(yōu)勢(shì),可充分利用以促進(jìn)黃精產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。
遺傳分化是指遺傳多樣性在居群內(nèi)和居群間的分布[20]。本研究47 份黃精資源的Gst為0.194 1,表明80.59%的遺傳分化發(fā)生在居群內(nèi),19.41%的遺傳分化存在于居群間,居群內(nèi)有較高的遺傳分化。這一結(jié)果與籍蓉蓉[21]對(duì)安徽省多花黃精遺傳變異研究結(jié)果一致,居群內(nèi)變異要大于居群間變異?;蛄鞔笥? 時(shí),表明居群間有一定程度的基因交流。本研究中黃精基因流Nm為 2.075 4,表明不同居群間存在一定的基因交流。黃精可自花授粉,也可借助昆蟲等媒介進(jìn)行異花授粉。對(duì)各種質(zhì)資源的聚類分析發(fā)現(xiàn):華東居群有較高的遺傳多樣性,這可能與引種其他地區(qū)黃精種質(zhì)資源有關(guān),引種在同一地區(qū)增加了不同居群間的基因交流,從而提高了黃精遺傳多樣性。
遺傳距離能判斷種質(zhì)資源間遺傳關(guān)系遠(yuǎn)近。云南普洱和貴州銅仁采集的黃精種質(zhì)資源都有最小的遺傳距離,遺傳相似度高,親緣關(guān)系較近,與劉新等[22]研究結(jié)果一致,相同或相近地區(qū)種質(zhì)資源基本聚在一起,可能與黃精無性繁殖有關(guān)。浙江慶元黃精種質(zhì)資源則不同,遺傳距離遠(yuǎn)近不一,具有復(fù)雜的親緣關(guān)系,這與慶元地區(qū)為早期種植黃精的地區(qū),種質(zhì)資源引進(jìn)種植多樣有關(guān)。浙江一帶黃精種質(zhì)資源有較為復(fù)雜的親緣關(guān)系,這種復(fù)雜性增加了黃精的遺傳多樣性。浙江一帶引種栽培較多,為各種質(zhì)資源之間遺傳交流提供基礎(chǔ),有助于優(yōu)質(zhì)黃精品種選育。