王建東,王景松,,王健霖,李繼東,郭亞男*
(1.寧夏農(nóng)林科學(xué)院 動(dòng)物科學(xué)研究所,寧夏 銀川 750002;2.寧夏大學(xué) 動(dòng)物科技學(xué)院,寧夏 銀川 750021)
產(chǎn)氣莢膜梭菌(Clostridium perfringens)又稱產(chǎn)氣莢膜芽孢桿菌、魏氏芽孢桿菌和魏氏梭菌,是一種革蘭氏陽性專性厭氧桿菌,可形成芽孢,不能運(yùn)動(dòng)[1-2]。產(chǎn)氣莢膜梭菌在環(huán)境中分布廣泛,包括污染的水、食物和土壤中。產(chǎn)氣莢膜梭菌也是人和其他動(dòng)物胃腸道微生物群的組成部分,屬于條件致病菌。在臨床上,人和動(dòng)物的氣性壞疽、食物中毒、非食源性腹瀉、腸炎和腸毒血癥等疾病都與產(chǎn)氣莢膜梭菌有一定關(guān)系[3-4]。產(chǎn)氣莢膜梭菌致病性與其能產(chǎn)生20余種毒素和酶,即α、β、ε、ι、腸毒素、NetB、κ、μ、θ、PFO和β2等[1,5-6]是密不可分的,而且大多數(shù)疾病都由這些毒素中的一種或多種介導(dǎo)。由于不同菌株所產(chǎn)生的毒素有很大不同,這種差異性使得產(chǎn)氣莢膜梭菌分離株可以根據(jù)所產(chǎn)生的毒素進(jìn)行分類,這種分型方式稱為毒素分型。Rood等[7]對(duì)毒素分型方案進(jìn)行了修改和補(bǔ)充,根據(jù)α、β、ε、ι、腸毒素和NetB 6種主要毒素,將產(chǎn)氣莢膜梭菌分為7種毒素類型,即A型(產(chǎn)α毒素)、B型(產(chǎn)α、β、ε毒素)、C型(產(chǎn)α、β毒素,部分產(chǎn)cpe)、D型(產(chǎn)α、ε毒素,部分產(chǎn)cpe)、E型(產(chǎn)α、ι,部分產(chǎn)cpe)、F型(產(chǎn)α、cpe)和G型(產(chǎn)α、NetB)。不同類型的產(chǎn)氣莢膜梭菌對(duì)動(dòng)物所產(chǎn)生的影響有所不同,所以需準(zhǔn)確判斷產(chǎn)氣莢膜梭菌毒素類型。因此,本文對(duì)目前產(chǎn)氣莢膜梭菌主要毒素的檢測(cè)方法進(jìn)行總結(jié),為后續(xù)快速診斷方法的建立以及相關(guān)研究提供一定參考。
產(chǎn)氣莢膜梭菌引起動(dòng)物感染發(fā)病的主要因素取決于細(xì)菌產(chǎn)生的外毒素和酶。為控制產(chǎn)氣莢膜梭菌病的傳播,減少或避免給畜牧養(yǎng)殖業(yè)造成的嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失,必須快速且準(zhǔn)確地確定該菌的毒素基因型。臨床上一般通過了解病史、臨床癥狀和病理剖檢等對(duì)是否患有產(chǎn)氣莢膜梭菌病作出初步判斷,但確診還需要進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室診斷。實(shí)驗(yàn)室診斷方法目前主要包括微生物學(xué)檢測(cè)法、免疫學(xué)檢測(cè)法以及分子生物學(xué)檢測(cè)法。
實(shí)驗(yàn)室微生物學(xué)方法是將樣品進(jìn)行預(yù)處理,接種至專性培養(yǎng)基37 ℃厭氧培養(yǎng)18~24 h后,挑取疑似菌落進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),革蘭氏染色鏡檢,最后通過生化試驗(yàn)等進(jìn)行確認(rèn)。產(chǎn)氣莢膜梭菌的微生物學(xué)檢測(cè)方法可以參考GB 4789.13—2012《食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗(yàn) 產(chǎn)氣莢膜梭菌檢驗(yàn)》中的緩沖動(dòng)力-硝酸鹽試驗(yàn)、乳糖-明膠以及含鐵牛乳發(fā)酵試驗(yàn)進(jìn)行復(fù)檢確認(rèn),也可以利用反向CAMP試驗(yàn):用無乳鏈球菌在血平板上劃線,疑似產(chǎn)氣莢膜梭菌的樣品垂直于無乳鏈球菌劃線,厭氧培養(yǎng)24~48 h后,由于協(xié)同溶血作用,將形成一個(gè)“蝴蝶結(jié)”帶,即可驗(yàn)證。
免疫學(xué)方法是利用特異性免疫原理建立的檢測(cè)方法。與細(xì)菌學(xué)診斷方法相比,具有取樣便捷、樣品用量少、可靠性強(qiáng)、靈敏度高、便于操作等優(yōu)點(diǎn)[8]。毒素中和試驗(yàn)是最早和最經(jīng)典的檢測(cè)方法之一。酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)屬于免疫學(xué)方法中的一種重要檢測(cè)方法。王武斌等[9]以純化的產(chǎn)氣莢膜梭菌etx毒素重組蛋白作為包被抗原,構(gòu)建了etx毒素間接ELISA檢測(cè)方法,其血清靈敏度為1∶3 200,靈敏度和特異性良好。馬玲玲等[10]以產(chǎn)氣莢膜梭菌CPB1毒素作為包被抗原,建立了CPB1抗體的間接ELISA檢測(cè)方法,其特異性、靈敏度和重復(fù)性均較高。cpa毒素、β1毒素、β2毒素等均已作為包被抗原被構(gòu)建為產(chǎn)氣莢膜梭菌的間接ELISA檢測(cè)方法[11-13]。陳長(zhǎng)俊等[14]以抗α毒素單克隆抗體為捕獲抗體,抗α毒素多克隆抗體為檢測(cè)抗體,建立了檢測(cè)α毒素的雙抗夾心ELISA(DAS-ELISA)檢測(cè)方法,其特異性、靈敏度良好。
隨著近些年科研水平的不斷提高,分子生物學(xué)也得到了快速發(fā)展,將分子生物學(xué)技術(shù)應(yīng)用于病原分析鑒定也越來越廣泛。實(shí)驗(yàn)室診斷技術(shù)也從常規(guī)的微生物學(xué)檢測(cè)和免疫學(xué)檢測(cè)發(fā)展為分子生物學(xué)檢測(cè)。分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù)除了傳統(tǒng)的基礎(chǔ)PCR方法外,還出現(xiàn)了多重PCR、熒光定量PCR、環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Loopmediated isothermal amplification,LAMP)以及重組酶聚合酶擴(kuò)增(Recombinase polymerase amplification,RPA)等新型分子生物學(xué)技術(shù)手段,利用這些方法可以鑒定細(xì)菌菌型以及判定其致病性。
1.3.1 16S rRNA PCR技術(shù) 16S rRNA基因序列全長(zhǎng)約1 500 bp,是原核生物中編碼核糖體16S rRNA的DNA序列,存在于細(xì)菌、支原體等所有原核生物中,因具有特異性和穩(wěn)定性,常用于原核生物的初步鑒定。在PCR中使用全長(zhǎng)16S rRNA通用引物進(jìn)行基因擴(kuò)增并測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)鑒定,基于序列相似性>97%來指定分類學(xué),在檢測(cè)食品中的產(chǎn)氣莢膜梭菌中也有所應(yīng)用[15]。
1.3.2 普通PCR技術(shù) 普通PCR技術(shù)又稱聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是在生物體外進(jìn)行特殊的DNA復(fù)制,通常利用變性、退火、延伸三步法進(jìn)行體外擴(kuò)增。1993年,F(xiàn)ach P等[16]建立了產(chǎn)氣莢膜梭菌cpa毒素的檢測(cè)方法,可直接用于糞便樣本的檢測(cè)。Uzal等[17]針對(duì)產(chǎn)氣莢膜梭菌α、β、ε和ι 4種毒素基因設(shè)計(jì)了4對(duì)特異性引物,分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),可用于檢測(cè)不同類型的產(chǎn)氣莢膜梭菌。2004年,梁光軍等[18]建立了可擴(kuò)增α毒素全基因的PCR檢測(cè)方法。單一PCR每次只能擴(kuò)增1種靶基因,因此對(duì)產(chǎn)氣莢膜梭菌定型就需要多次反應(yīng)。于是,1次反應(yīng)即可檢測(cè)多個(gè)靶基因的多重PCR技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。
1.3.3 多重PCR技術(shù) 多重PCR技術(shù)是在單一PCR基礎(chǔ)上發(fā)展而來的PCR技術(shù),其特點(diǎn)是能夠在反應(yīng)體系中加入多種引物,從而擴(kuò)增出多條帶的PCR方法。其原理與單一PCR基本相同。2004年,Baums等[19]建立的多重PCR,利用高溫將產(chǎn)氣莢膜梭菌菌液裂解作為模板進(jìn)行產(chǎn)氣莢膜梭菌cpa、cpb、etx、ia、cpb2和cpe毒素基因的檢測(cè),減少了提取產(chǎn)氣莢膜梭菌基因組的步驟,極大地節(jié)省了檢測(cè)時(shí)間。2005年,Heikenheimo等[20]通過經(jīng)典毒素試驗(yàn)和多重PCR證實(shí)了2種方法對(duì)C.perfringens的分型結(jié)果一致,并且其特異性和敏感性均比毒素中和試驗(yàn)高。張凱川等[21]以產(chǎn)氣莢膜梭菌cpa基因、艱難梭菌Glud基因、脆弱擬桿菌Lue基因?yàn)榘谢颍⒘丝焖贆z測(cè)厭氧菌引起的細(xì)菌性腹瀉多重PCR檢測(cè)方法,其最低檢測(cè)下限分別為1.6×10-2pg/μL、0.7 pg/μL和2.8 pg/μL。唐娜等[22]以小反芻獸疫病毒N蛋白基因和產(chǎn)氣莢膜梭菌α毒素基因建立了雙重PCR檢測(cè)方法,檢測(cè)下限分別達(dá)到0.001 TCID50/mL和10 個(gè)CFU/mL,實(shí)現(xiàn)了小反芻獸疫病毒與產(chǎn)氣莢膜梭菌的鑒別診斷。2013年,董潔等[23]根據(jù)α、β、ε、ι毒素基因序列構(gòu)建了C.perfringens定型的菌落多重PCR,可以鑒定A、B、C、D、E 5個(gè)型,并對(duì)106份樣本進(jìn)行檢測(cè),鑒定出30株C.perfringensA型。2022年,繆西鵬等[24]以產(chǎn)氣莢膜梭菌α、β、ε、ι毒素的基因序列為靶基因,構(gòu)建四重PCR檢測(cè)方法,通過對(duì)樣本檢測(cè)并與GB 4789.13—2012《食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗(yàn) 產(chǎn)氣莢膜梭菌檢驗(yàn)》進(jìn)行對(duì)比,結(jié)果高度一致。張凱悅[25]建立了cpa、cpb、etx、itx、cpe和netB毒素基因的六重PCR,通過對(duì)34株已知樣品進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果與菌株的分型一致。多重PCR技術(shù)簡(jiǎn)單、經(jīng)濟(jì),通過1次反應(yīng)即可檢測(cè)出多種靶基因,不僅節(jié)省試劑和時(shí)間,而且能達(dá)到理想的對(duì)比效果,從而準(zhǔn)確鑒別產(chǎn)氣莢膜梭菌毒素類型[26]。
1.3.4 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù) LAMP是一種新型的核酸擴(kuò)增技術(shù)。該技術(shù)主要依靠一種具有鏈置換特性的DNA聚合酶,在恒溫條件下快速擴(kuò)增DNA,既有較高的特異性,又具備較高的擴(kuò)增效率,而且反應(yīng)時(shí)間只需1 h左右[27]。王朋沖等[28]建立了快速檢測(cè)產(chǎn)氣莢膜梭菌α毒素的LAMP檢測(cè)方法,靈敏度高,對(duì)產(chǎn)氣莢膜梭菌的DNA檢測(cè)下限為10 ng/L,對(duì)產(chǎn)氣莢膜梭菌菌液的檢測(cè)下限為3.7×102CFU/mL,比普通PCR靈敏10~100倍;反應(yīng)時(shí)間為62 ℃水浴40 min,80 ℃ 10 min終止反應(yīng),對(duì)牛糞便樣品、飼料和飲水進(jìn)行檢測(cè)時(shí),檢出率為19.61%,與PCR檢測(cè)和細(xì)菌分離鑒定結(jié)果一致。Radhika B等[29]利用自身構(gòu)建的產(chǎn)氣莢膜梭菌α毒素的LAMP檢測(cè)方法,對(duì)120份疑似腸毒血癥糞便樣本進(jìn)行檢測(cè),LAMP和PCR檢測(cè)cpa毒素基因,112份(93.3%)陽性,檢測(cè)結(jié)果一致,靈敏度相同。
1.3.5 重組酶聚合酶擴(kuò)增 RPA是一種恒溫核酸擴(kuò)增技術(shù),主要利用重組蛋白酶和單鏈結(jié)合蛋白等物質(zhì)參與反應(yīng),可在37 ℃左右條件下30 min內(nèi)完成對(duì)靶基因的檢測(cè),無需高溫變性、退火、延伸等步驟。該技術(shù)具有特異性強(qiáng)、靈敏度高等特征,目前已被廣泛應(yīng)用于多種食源性致病菌的快速檢測(cè)。許笑等[30]以產(chǎn)氣莢膜梭菌α毒素的編碼基因plc為靶基因進(jìn)行引物和探針設(shè)計(jì),建立了雞源產(chǎn)氣莢膜梭菌的real-time RPA快速診斷技術(shù),該方法可在38 ℃、25 min內(nèi)完成檢測(cè),檢測(cè)下限為1×10 copies/L,并且與qPCR檢測(cè)方法檢測(cè)結(jié)果一致,但比qPCR的檢測(cè)時(shí)間縮短了近一半。劉立兵等[31]以保守性強(qiáng)的產(chǎn)氣莢膜梭菌plc基因序列為靶基因,建立了實(shí)時(shí)熒光RPA檢測(cè)方法,其檢測(cè)下限為1.3 pg/μL和1.0×102CFU/mL,只需要3~13 min即可完成樣品檢測(cè),特異性強(qiáng),操作方便。
RPA在引物設(shè)計(jì)上要求高,引物序列長(zhǎng)度控制在30~35 bp,擴(kuò)增片段大小在100~500 bp,擴(kuò)增效率更高,但也有學(xué)者將擴(kuò)增片段設(shè)計(jì)到1 000 bp,也可擴(kuò)增出靶基因片段。同時(shí)RPA較高的靈敏度使其極易出現(xiàn)污染或假陽性。目前為止還未研發(fā)出專門用于設(shè)計(jì)RPA的引物軟件。
1.3.6 TaqMan熒光定量PCR TaqMan熒光定量PCR以其探針的特異性可用于多種靶基因檢測(cè),已廣泛應(yīng)用于科學(xué)研究、食品檢測(cè)、臨床醫(yī)學(xué)檢測(cè)與診斷等領(lǐng)域[32-34]。2004年,Wise等[35]建立的產(chǎn)氣莢膜梭菌16S rRNA熒光定量PCR,可檢測(cè)50 fg產(chǎn)氣莢膜梭菌菌體。2007年,Gurjar等[36]構(gòu)建了產(chǎn)氣莢膜梭菌cpa、cpb、etx、ia、cpb2和cpe多毒素二重TaqMan熒光定量PCR,其分別以cpa和cpb2、cpb和etx以及ia和cpe三個(gè)體系同時(shí)進(jìn)行,對(duì)307份牛糞便進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果顯示,cpa、cpb、ia、etx、cpb2和cpe毒素基因分別檢測(cè)到68份(28.2%)、6份(2.5%)、6份(2.5%)、4份(1.6%)、164份(68%)和11份(4.6%)。2011年,石玉玲等[37]以產(chǎn)氣莢膜梭菌16S rRNA為目的基因,構(gòu)建了產(chǎn)氣莢膜梭菌TaqMan熒光定量PCR,對(duì)純菌液的檢測(cè)下限為9×102CFU/mL,可對(duì)氣性壞疽快速診斷進(jìn)行準(zhǔn)確報(bào)告。2016年,張蓉蓉等[38]以產(chǎn)氣莢膜梭菌α和cpe毒素為目的基因,構(gòu)建雙重?zé)晒舛縋CR方法,其靈敏度、特異性、重復(fù)性均較好。2017年,鄭萍等[39]針對(duì)水中產(chǎn)氣莢膜梭菌α毒素基因構(gòu)建單重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法,其靈敏度達(dá)到10 copies/μL,對(duì)16種細(xì)菌進(jìn)行特異性驗(yàn)證均為陰性。2020年,李一鳴等[40]對(duì)產(chǎn)氣莢膜梭菌α、β、ε毒素基因序列設(shè)計(jì)特異性引物和TaqMan探針,構(gòu)建了可鑒定羊源產(chǎn)氣莢膜梭菌A、B、C和D型的三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法,其靈敏度可達(dá)到1×102copies/μL。2020年,學(xué)者根據(jù)產(chǎn)氣莢膜梭菌高度保守的plc基因設(shè)計(jì)特異性引物和探針,建立了產(chǎn)氣莢膜梭菌的實(shí)時(shí)熒光定量PCR,其檢測(cè)下限為1.3 pg/μL和1.0×102CFU/mL,僅需24~46 min(Ct值為17.45~33.65)即可完成檢測(cè),其特異性強(qiáng)、靈敏度高、操作方便[31]。2021年,劉嘉琳等[41]對(duì)豬大腸桿菌irp2基因、沙門氏菌fim基因和產(chǎn)氣莢膜梭菌plc基因進(jìn)行特異性引物和探針設(shè)計(jì),構(gòu)建了同時(shí)檢測(cè)3種病原的多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法,其產(chǎn)氣莢膜梭菌最低檢測(cè)下限為4.37×103copies/μL。
隨著新型技術(shù)的開發(fā)和應(yīng)用,有關(guān)產(chǎn)氣莢膜梭菌檢測(cè)方法的研究也日益深入,本文對(duì)目前產(chǎn)氣莢膜梭菌主要檢測(cè)方法進(jìn)行了總結(jié),每種檢測(cè)方法均有一定的優(yōu)缺點(diǎn),相信隨著科技的不斷進(jìn)步,產(chǎn)氣莢膜梭菌的檢測(cè)方法也會(huì)日益完善。