據Fonseca AF 2023 年6 月12 日(Front Immunol,2023,14.https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1142573.)報道,美國休斯頓大學的研究人員努力讓T 細胞免疫療法更加安全,他們開發(fā)了一種名為CrossDome 的工具,該工具結合遺傳信息和生化信息來預測T細胞免疫療法是否可能錯誤地攻擊健康細胞。
基于T 細胞的免疫療法在抗擊癌癥和傳染病方面有著巨大的潛力,因為它們有能力專門識別靶向病變細胞,包括癌癥轉移。然而,由于它可能識別健康細胞的未知靶標,這種潛力受到了安全問題的影響。在一種情形下,研究人員構建了特殊的T 細胞,它們被認為靶向一種在稱為黑色素瘤的皮膚癌中發(fā)現的蛋白。 然而,這些T 細胞最終也攻擊一些患者的心臟細胞,因其蛋白不同。 這對心臟造成了嚴重損害。
CrossDome 工具有助于預測基于T 細胞的免疫療法的潛在風險。 它使用不同類型的信息(稱為多組學)的組合來進行預測,并確定這種療法除了靶向預定的病變細胞之外,是否可能意外地傷害健康細胞。 通過分析多種因素,CrossDome 為基于T 細胞的免疫療法的安全性提供了新的見解,并可能幫助人們開發(fā)更安全的治療方法。
為了測試CrossDome 的有效性,研究人員用它來預測16 個廣為人所知的T 細胞交叉反應病例中的潛在錯誤,包括黑色素瘤-心臟損害病例。該工具成功地將一種心臟蛋白確定為T 細胞的潛在靶標,在數以千計的其他蛋白中把它列為高風險的候選靶標。為了加強這些研究結果,研究人員結合了來自不同功能數據集的信息,以幫助評估某些基因的表達量,以及它們與某種名為HLA 的分子結合的可能性,從而引發(fā)免疫反應。 這些信息幫助人們決定哪些潛在的非靶標基因值得在實驗中測試。