王志浩,劉浩昂,蘭 凱,廉 婷,張旭東
(1.西安醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)院中尼友好拉吉姆醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室,陜西 西安 710021;2.西安醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)院陜西省呼吸病預(yù)防與診治工程中心,陜西 西安 710021)
膠質(zhì)瘤(glioma)占成人原發(fā)惡性腦腫瘤的75%,是人類最常見(jiàn)的原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)惡性腫瘤[1]。目前認(rèn)為膠質(zhì)瘤源自神經(jīng)膠質(zhì)干細(xì)胞或祖細(xì)胞,根據(jù)惡性程度不同,國(guó)際上將其分為WHOⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ級(jí)[2]。據(jù)相關(guān)研究統(tǒng)計(jì),高級(jí)別的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM,WHOⅣ級(jí))因生長(zhǎng)迅速、侵襲性強(qiáng)、發(fā)病率、致死致殘率高,其患者中位總生存期(OS)僅14.4個(gè)月,且5年生存率不足10%[3]。目前臨床上膠質(zhì)瘤的治療主要為手術(shù)大范圍切除、放化療、基因靶向治療、免疫治療及電場(chǎng)療法等,但其治療效果不佳[4,5]。因此,研究膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展機(jī)制對(duì)膠質(zhì)瘤患者的早期干預(yù)及尋找治療新方法十分重要。10跨膜P24販運(yùn)蛋白10(transmembrane P24 trafficking protein,TMED10)又稱TMP21,是一種定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體中間體(ERGIC)上的參與蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)的膜蛋白。近年來(lái)我國(guó)學(xué)者研究發(fā)現(xiàn),TMED10在非經(jīng)典蛋白分泌(unconventional protein secretion,UPS)過(guò)程中發(fā)揮重要作用[6-8]。此外,有研究表明,其還與細(xì)胞增殖[9]、細(xì)胞自噬[10,11]有關(guān)。近年來(lái)有許多學(xué)者研究TMED10與阿爾茲海默癥[12-14]、甲狀腺癌[15]、原發(fā)性肝癌[16]、自身免疫性疾病[17]等疾病的關(guān)系及可能存在的作用機(jī)制,但TMED10在膠質(zhì)瘤中的研究還很少。因此,本研究旨在分析TMED10在膠質(zhì)瘤中的表達(dá)情況,為研究TMED10在膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展中的作用及尋找治療膠質(zhì)瘤的新靶點(diǎn)提供參考。
1.1 資料來(lái)源 研究數(shù)據(jù)來(lái)源于癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)在線數(shù)據(jù)庫(kù)(GEPIA,http://gepia.cancer-pku.cn/);中國(guó)腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)(Chinese Glioma Genome Atlas, CGGA, http:/www.cgga.org.cn);String數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.string-db.org/)。
1.2 方法 使用 CGGA、GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)分析 TMED10在膠質(zhì)瘤不同臨床病理?xiàng)l件下的差異性表達(dá)情況,檢索方法:①Analyze-mRNA data;性別(Male vs Female),年齡(>42歲 vs<42歲),不同級(jí)別狀態(tài)(WHOⅡvs WHOⅢ vs WHOⅣ),發(fā)展?fàn)顟B(tài)(原發(fā) vs 復(fù)發(fā));②Data type:mRNA;③ Dataset:mRNAseq_325;④Gene:TMED10;⑤臨界值設(shè)定P-value<0.05。利用CGGA、GEPIA 數(shù)據(jù)庫(kù)分析 TMED10 相關(guān)基因的表達(dá)與膠質(zhì)瘤患者生存預(yù)后的影響,檢索方法:①AnalyzemRNA data;②Survival;③Dataset:mRNAseq_325;④Gene:TMED10。通過(guò) String數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)TMED10表達(dá)蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析。檢索方法:①Proteinname:TMED10;②Organism:Homo sapiens,并利用Kaplan-Meier、Kruskal-Wallis 進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。
2.1 TMED10在膠質(zhì)瘤組織和正常對(duì)照組織中的表達(dá)比較 基于GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)過(guò)表達(dá)基因篩查發(fā)現(xiàn)TMED10在膠質(zhì)瘤中的表達(dá)高于正常組織(P=2.66E-98),見(jiàn)圖1、圖2。
圖1 膠質(zhì)瘤中TMED10的差異性分析
圖2 TMED10在膠質(zhì)瘤組織和正常對(duì)照組織中的表達(dá)
2.2 TMED10在不同膠質(zhì)瘤亞型中的表達(dá)比較TMED10在高級(jí)別的原發(fā)性膠質(zhì)瘤和復(fù)發(fā)性膠質(zhì)瘤組織中呈較高表達(dá)(P=1.1e-07),見(jiàn)圖3。
圖3 TMED10在不同類型膠質(zhì)瘤中的表達(dá)情況
2.3 TMED10在不同性別膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)比較不同性別膠質(zhì)瘤患者中TMED10的表達(dá)比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.083),見(jiàn)圖4。
圖4 MED10在不同性別膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)
2.4 TMED10在不同年齡膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)比較TMED10在42歲以上與42歲以下膠質(zhì)瘤患者組織中的表達(dá)比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.2),見(jiàn)圖5。
圖5 TMED10在不同年齡膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)
2.5 TMED10在不同級(jí)別膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)比較TMED10與膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展呈正相關(guān);不同級(jí)別的膠質(zhì)瘤TMED10表達(dá)比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=7e-09),見(jiàn)圖6。
圖6 TMED10在不同級(jí)別膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)
2.6 TMED10在不同進(jìn)展?fàn)顩r的膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)比較 TMED10在原發(fā)性、復(fù)發(fā)性膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.075),見(jiàn)圖7。
圖7 TMED10在不同進(jìn)展?fàn)顩r的膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)
2.7 TMED10在不同年齡、性別、發(fā)病階段的膠質(zhì)瘤中的表達(dá)比較 TMED10在WHOⅡ、Ⅲ、Ⅳ級(jí)膠質(zhì)瘤中的表達(dá)比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);在WHO Ⅳ級(jí)男性膠質(zhì)瘤患者中TMED10的表達(dá)高于女性(P=0.027),TMED10在原發(fā)型、復(fù)發(fā)性膠質(zhì)瘤患者組織中表達(dá)比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)圖8~圖10。
圖8 TMED10在不同年齡階段的膠質(zhì)瘤中的表達(dá)
圖9 TMED10在不同性別膠質(zhì)瘤中的表達(dá)
圖10 TMED10在不同發(fā)病階段膠質(zhì)瘤中的表達(dá)
2.8 TMED10的表達(dá)與患者生存率的相關(guān)性 TMED10在原發(fā)性、復(fù)發(fā)性膠質(zhì)瘤中的表達(dá)與患者生存率呈負(fù)相關(guān)(P<0.0001;P=0.0081),見(jiàn)圖11。
圖11 TMED10的表達(dá)與患者生存率及生存時(shí)間的關(guān)系
2.9 TMED10表達(dá)蛋白相關(guān)作用網(wǎng)絡(luò)分析 TMED10與TMED2、NCSTN、APH1A等多個(gè)蛋白有相互作用,見(jiàn)圖12。
圖12 TMED10表達(dá)蛋白相關(guān)作用網(wǎng)絡(luò)分析
目前,TMED10作為一種介導(dǎo)UPS的分子備受關(guān)注。越來(lái)越多的研究證明TMED10調(diào)控細(xì)胞增殖、自噬,并且與神經(jīng)退行性疾病、自身免疫性疾病及癌癥發(fā)生發(fā)展有關(guān)。研究發(fā)現(xiàn),無(wú)信號(hào)肽蛋白(leaderless cargo)在胞質(zhì)中HSP90A蛋白的幫助下去折疊后,必須與TMED10相互作用并使其發(fā)生寡聚化形成蛋白通道才能進(jìn)入ERGIC內(nèi)并通過(guò)囊泡包裹分泌到細(xì)胞外[6,7]。同時(shí),還有研究發(fā)現(xiàn)TMED10是自噬調(diào)節(jié)分子,抑制TMED10的表達(dá)會(huì)嚴(yán)重影響甲狀腺癌的生長(zhǎng),可能是通過(guò)激活A(yù)MPK/mTOR通路誘導(dǎo)自噬來(lái)調(diào)節(jié)癌細(xì)胞的生長(zhǎng)[15]。研究發(fā)現(xiàn)[16],TMED10在原發(fā)性肝細(xì)胞癌(HCC)中呈現(xiàn)高表達(dá)狀態(tài),聯(lián)合使用SiTmed10、SiTMBIM4、SiDtd2(D-tyrosyl-tRNA deacylase 2)可以顯著促進(jìn)肝癌細(xì)胞系Huh7、HepG2凋亡,而正常肝細(xì)胞系THLE-2幾乎不受影響,這一結(jié)果表明TMED10的小分子抑制劑可能是肝癌治療的新靶點(diǎn)。最新的研究發(fā)現(xiàn)[17,18],TMED10能阻礙TGF-βⅠ型(ALK5)和 Ⅱ型受體(TβRⅡ)復(fù)合物的形成,從而抑制TGF-β信號(hào)通路,進(jìn)而抑制TGF-β介導(dǎo)的生長(zhǎng)抑制現(xiàn)象。還有研究報(bào)道[19],巨細(xì)胞病毒免疫逃逸素m152/gp40可以通過(guò)TMED10錨定在宿主細(xì)胞的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上進(jìn)而產(chǎn)生免疫逃逸現(xiàn)象。這些發(fā)現(xiàn)提示TMED10在膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展中可能發(fā)揮重要的作用,然而TMED10在膠質(zhì)瘤中的作用目前仍不明確。
本研究基于GEPIA、CGGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn),TMED10在膠質(zhì)瘤組織中表達(dá)高于正常對(duì)照組織(P=2.66E-98);在不同級(jí)別的膠質(zhì)瘤中,TMED10的表達(dá)量比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=7e-09);同時(shí)TMED10在原發(fā)性、復(fù)發(fā)性膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)與患者生存期呈負(fù)相關(guān)(P<0.0001;P=0.0081)。表明TMED10在膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中具有促進(jìn)作用,可能是TMED10通過(guò)調(diào)控內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激過(guò)程,促進(jìn)膠質(zhì)瘤細(xì)胞的惡性增殖。最后通過(guò)String數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn)TMED10有TMED2、NCSTN、APH1A等多個(gè)相互作用蛋白,可為后續(xù)的進(jìn)一步研究提供相關(guān)依據(jù)。
綜上所述,TMED10在膠質(zhì)瘤組織中呈高表達(dá)狀態(tài),且與患者的生存率密切相關(guān);并且TMED10在細(xì)胞自噬、增殖、疾病的發(fā)生發(fā)展等方面的重要作用。因此,TMED10可能成為治療膠質(zhì)瘤的潛在靶點(diǎn)。