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m6A 修飾在胃癌中的研究進(jìn)展

2022-11-28 09:50謝生茂張志龍李春卉石菲
中國醫(yī)藥導(dǎo)報(bào) 2022年10期
關(guān)鍵詞:復(fù)合物甲基化抑制劑

謝生茂 張志龍 李春卉 石菲

1.解放軍聯(lián)勤保障部隊(duì)第九六九醫(yī)院消化內(nèi)科,內(nèi)蒙古呼和浩特 010051;2.解放軍聯(lián)勤保障部隊(duì)第九六九醫(yī)院普外科,內(nèi)蒙古呼和浩特 010051;3.內(nèi)蒙古自治區(qū)人民醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科,內(nèi)蒙古呼和浩特 010010;4.解放軍空軍軍醫(yī)大學(xué)航空航天醫(yī)學(xué)院,陜西西安 710032

胃癌又稱胃腺癌,是癌癥相關(guān)死亡的第二大原因[1]。許多患者在疾病的晚期才被診斷,因此胃癌的治療效果欠佳[2]。由于胃癌的復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移,胃癌患者的5 年生存率仍然很低[2]。為了發(fā)現(xiàn)胃癌的潛在生物標(biāo)志物及其意義,闡明胃癌發(fā)生和發(fā)展的基本分子機(jī)制是非常必要的。m6A 修飾是近年來發(fā)現(xiàn)的豐度最高的RNA修飾方式,其在RNA 代謝和細(xì)胞的各種生物學(xué)過程中扮演重要角色[3]。m6A 修飾還在腫瘤、心肌重塑和造血干細(xì)胞異常分化等多種病理生理過程中起著關(guān)鍵的調(diào)節(jié)作用[4]。研究證實(shí),m6A 修飾異??赡苁俏赴┌l(fā)生的潛在機(jī)制[5]。本文歸納總結(jié)了m6A 修飾在胃癌發(fā)生發(fā)展中的最新研究成果,這些研究提示m6A 修飾位點(diǎn)可能是胃癌治療的潛在靶點(diǎn)。

1 m6A 修飾簡(jiǎn)介

20 世紀(jì)70 年代m6A 修飾被首次發(fā)現(xiàn),其是位于腺苷N6位點(diǎn)的一種動(dòng)態(tài)化修飾。m6A 多位于3’非翻譯區(qū),在終止密碼子附近富集[3]。m6A 修飾幾乎調(diào)控著mRNA 代謝的全過程[3]。不僅如此,m6A 修飾對(duì)環(huán)狀RNA 等非編碼RNA 具有重要的調(diào)節(jié)功能[3]。

m6A 甲基化轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物催化底物完成m6A 修飾的添加,S 腺苷甲硫氨酸是甲基的供體,m6A 甲基化轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物是由甲基轉(zhuǎn)移酶3(methyltransferaselike 3,METTL3)、甲基轉(zhuǎn)移酶14(methyltransferaselike 14,METTL14)和Wilms 腫瘤1 相關(guān)蛋白(Wilms tumor 1-associated protein,WTAP)等多種蛋白共同組成[6]。該復(fù)合物主體是由METTL3 和METTL14 形成的一個(gè)異二聚體,METTL3 有催化m6A 甲基化轉(zhuǎn)移的活性,METTL14 雖獨(dú)立時(shí)無催化作用,但其在復(fù)合物中發(fā)揮支持作用,缺少時(shí)將大大降低復(fù)合物的催化活性[6]。m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶的組成成分尚未完全解析,目前仍有不同組成蛋白相繼報(bào)道[6]。

m6A 脫甲基酶復(fù)合物(Erasers)主要由Alkb 同系物5(demethylases alkB homologue 5,ALKBH5)和脂肪和肥胖相關(guān)蛋白(fat mass and obesity-associated protein,F(xiàn)TO)組成。最初研究發(fā)現(xiàn)FTO 是脂肪形成與肥胖中的關(guān)鍵基因[7],直到2011 年美國芝加哥大學(xué)的何川教授團(tuán)隊(duì)首先報(bào)道了FTO 的m6A 脫甲基化作用,而就是這個(gè)發(fā)現(xiàn)才揭示了m6A 動(dòng)態(tài)調(diào)控的機(jī)制,為m6A 修飾打開了新世界的大門[8]。

m6A 修飾調(diào)控功能的實(shí)現(xiàn)主要是通過“Reader”蛋白識(shí)別m6A 修飾位點(diǎn)。而“Reader”蛋白是YTH 結(jié)構(gòu)域家族蛋白,其主要包括了YTHDF1-3 和YTHDC1-2。其中,YTHDF1 能夠調(diào)控mRNA 的翻譯過程,YTHDF2則是調(diào)控mRNA 的降解,而YTHDF3 可根據(jù)具體的生物學(xué)過程發(fā)揮相應(yīng)的調(diào)控mRNA 翻譯和降解的過程的作用[9]。

2 m6A 修飾在胃癌中的作用

2.1 m6A 修飾中“Writers”在胃癌中的作用

研究發(fā)現(xiàn),在預(yù)后不良的胃癌患者中,m6A 甲基化轉(zhuǎn)移酶METTL3 表達(dá)上調(diào)[10]。Zhou 等[11]已經(jīng)證實(shí),METTL3 通過m6A 修飾YAP1 促進(jìn)胃癌細(xì)胞的增殖和遷移。在另一篇報(bào)道中,作者發(fā)現(xiàn)[6]高水平的METTL3可以促進(jìn)肝癌衍生生長(zhǎng)因子mRNA 的m6A 修飾,并促進(jìn)其穩(wěn)定性。肝癌衍生生長(zhǎng)因子上調(diào)可進(jìn)一步促進(jìn)腫瘤血管生成,增加胃癌組織的糖酵解,進(jìn)而促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)和肝轉(zhuǎn)移[6]。此外,研究還發(fā)現(xiàn),前蛋白易位因子被異常的METTL3 高度修飾,加速胃癌的進(jìn)展[10]。也有學(xué)者報(bào)道,乙型肝炎X-相互作用蛋白通過METTL3介導(dǎo)的c-MYC mRNA 的m6A 修飾促進(jìn)胃癌發(fā)生發(fā)展[12]。METTL3 還能夠通過對(duì)非編碼RNA 修飾促進(jìn)胃癌的進(jìn)展[13]。研究表明,METTL3 通過調(diào)控pri-miR-17-92 成熟抑制PTEN/TMEM127 并提高胃癌患者對(duì)依維莫司的敏感性[13]。此項(xiàng)研究揭示了非編碼RNA在胃癌進(jìn)展中的表觀遺傳學(xué)調(diào)控,并為依維莫司治療m6A/METTL3 高胃癌提供了依據(jù)。

類似地,其他高水平的m6A 甲基化轉(zhuǎn)移酶,如METTL14、METTL16、WTAP、RBM15 和KIAA1429,也預(yù)示著胃癌的預(yù)后不良[14-19]。Li 等[15]發(fā)現(xiàn)WTAP 可作為胃癌的獨(dú)立預(yù)測(cè)因子,其高表達(dá)與低T 淋巴細(xì)胞浸潤(rùn)和T 細(xì)胞相關(guān)免疫反應(yīng)密切相關(guān)。Miao 等[18]發(fā)現(xiàn),KIAA1429 在胃癌組織中表達(dá)上調(diào),并促進(jìn)了胃癌細(xì)胞的增殖。Hu 等[19]發(fā)現(xiàn),METTL14 介導(dǎo)的m6A 修飾導(dǎo)致LINC01320 上調(diào),而過度表達(dá)的LINC01320 促進(jìn)了胃癌細(xì)胞的侵襲表型轉(zhuǎn)化。

但有趣的是,有不同團(tuán)隊(duì)的研究者發(fā)現(xiàn),m6A 甲基化轉(zhuǎn)移酶METTL14 在胃癌患者中表達(dá)下調(diào)[5,20],其研究證實(shí),METTL14 的沉默可能導(dǎo)致Wnt 和PI3KAkt 信號(hào)的激活,從而促進(jìn)胃癌進(jìn)展[5,20]。導(dǎo)致上述研究結(jié)果不同的原因可能是因?yàn)椴煌芯窟x擇的胃癌樣本分期和分型有所差別,同時(shí)也暗含了METTL14或者其他不同Writers 對(duì)胃癌調(diào)控的復(fù)雜性。

2.2 m6A 修飾中“Erasers”在胃癌中的作用

據(jù)報(bào)道,F(xiàn)TO 和ALKBH5 在胃癌的高危評(píng)分亞型中經(jīng)常高表達(dá),因此是獨(dú)立的預(yù)后不良標(biāo)志物[14]。Guo 等[21]發(fā)現(xiàn),在胃癌組織中FTO 高表達(dá),且FTO 可促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲。也有研究證實(shí),在胃癌組織和細(xì)胞中組蛋白脫乙酰酶3 和FTO 表達(dá)上調(diào),而FTO 可通過降低胃癌細(xì)胞中MYC 的m6A 甲基化水平來穩(wěn)定其mRNA[22]。此項(xiàng)研究揭示了組蛋白脫乙酰酶3 通過維持FTO/m6A/MYC 信號(hào)軸在胃癌中的起始活性,突出了靶向治療m6A 表觀遺傳修飾對(duì)抗胃癌的潛力。Feng 等[23]也發(fā)現(xiàn),奧美拉唑通過沉默胃癌中高表達(dá)的FTO 激活提高胃癌細(xì)胞的化療敏感性。有學(xué)者研究發(fā)現(xiàn),ALKBH5 通過與lncRNA NEAT1 相互作用促進(jìn)胃癌的侵襲和轉(zhuǎn)移[24]。也有學(xué)者評(píng)估了外周血m6A 水平作為胃癌診斷的生物標(biāo)志,他們發(fā)現(xiàn)胃癌患者外周血中ALKBH5 和FTO 的表達(dá)降低,其外周血中m6A 修飾水平顯著升高[25-27]。

然而,ALKBH5 和FTO 在有些胃腸道腫瘤中的表達(dá)水平仍存在爭(zhēng)議[28]。從腫瘤基因組圖譜、基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫和人類蛋白質(zhì)圖譜中,ALKBH5 在胃癌和結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)弱于正常組織,而FTO 在胃癌和結(jié)直腸癌組織和正常組織中的表達(dá)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[28]。

2.3 m6A 修飾中“Readers”在胃癌中的作用

越來越多的研究發(fā)現(xiàn),導(dǎo)致胃癌中異常表達(dá)為m6A讀取器的上游調(diào)控機(jī)制[29]。近期有學(xué)者證實(shí),約7%的胃癌患者發(fā)生了YTHDF1 突變,YTHDF1 的高表達(dá)與更具侵襲性的腫瘤進(jìn)展和較差的總體生存率相關(guān)。在體外和體內(nèi),抑制YTHDF1 可減弱胃癌細(xì)胞增殖和腫瘤發(fā)生。在機(jī)制上,YTHDF1 通過控制FZD7 的翻譯促進(jìn)胃癌的發(fā)生[30]。Chen 等[31]也發(fā)現(xiàn),YTHDF1 可通過識(shí)別USP14 基因的m6A 修飾,從而增加該蛋白的翻譯,進(jìn)而促使胃癌的發(fā)生和轉(zhuǎn)移。不僅如此,有學(xué)者發(fā)現(xiàn)YTHDF1 與胃癌患者的高危亞型顯著相關(guān),提示YTHDF1 可能是胃癌早期診斷的潛在靶點(diǎn)[32]。Shen等[33]新發(fā)現(xiàn),YTHDF2 在胃癌組織和細(xì)胞中的表達(dá)較低,且能夠抑制胃癌細(xì)胞的生長(zhǎng),此外,經(jīng)臨床資料的分析發(fā)現(xiàn),YTHDF2 的表達(dá)水平與胃癌的分期和生存密切相關(guān),可作為胃癌的預(yù)后標(biāo)志物。

2.4 m6A 修飾對(duì)胃癌腫瘤微環(huán)境浸潤(rùn)特征的作用

腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)和存活所依賴的微環(huán)境在腫瘤進(jìn)展中也起著至關(guān)重要的作用。腫瘤細(xì)胞通過與其他腫瘤微環(huán)境成分的直接和間接相互作用,如誘導(dǎo)增殖和血管生成、抑制凋亡、避免缺氧及誘導(dǎo)免疫耐受,引起多種生物學(xué)行為的改變[34]。

Zhang 等[34]在一項(xiàng)研究中,整合了1938 例胃癌樣本的基因組信息,以綜合評(píng)估m(xù)6A 修飾模式,將m6A修飾模式與腫瘤微環(huán)境細(xì)胞浸潤(rùn)特征相關(guān)聯(lián);并揭示出3 種不同的m6A 修飾模式,發(fā)現(xiàn)這3 種模式下的腫瘤微環(huán)境特征分別與免疫排斥表型、免疫炎癥表型和免疫沙漠表型高度一致。這項(xiàng)研究表明,m6A 修飾在形成胃癌腫瘤微環(huán)境特征方面發(fā)揮了不可忽視的作用。

3 未來的治療策略

鑒于甲基化修飾與腫瘤的密切聯(lián)系,學(xué)者們正在探索新的腫瘤治療策略。甲氯芬那酸是一種非甾體抗炎藥,能與FTO 結(jié)合競(jìng)爭(zhēng)m6A 修飾位點(diǎn),起到FTO 抑制劑的作用[35]。突變型異檸檬酸脫氫酶1/2 酶產(chǎn)生的R-2-羥基戊二酸也能抑制FTO 活性,提高細(xì)胞內(nèi)m6A 修飾含量,進(jìn)而降低MYC/CEBPA 的穩(wěn)定性,阻斷MYC 通路活化[36]。最近,學(xué)者們發(fā)現(xiàn)了兩種合成的高效FTO 抑制劑。Huang 等[37]合成了兩種有效的FTO 抑制劑,即FB23 和FB23-2,該研究團(tuán)隊(duì)后續(xù)又驗(yàn)證了這兩種FTO 抑制劑可高選擇性的阻斷FTO 的m6A 脫甲基酶活性,而對(duì)其脂代謝相關(guān)活性無明顯作用。隨后,他們進(jìn)一步開發(fā)了另外兩種很有應(yīng)用前景的FTO抑制劑,即CS1 和CS2,其在多種癌癥中表現(xiàn)出很強(qiáng)的抗腫瘤作用[37]。對(duì)于白血病細(xì)胞,F(xiàn)TO 抑制劑不僅可以阻斷FTO/m6A/MYC/CEBPA 的信號(hào)軸,抑制腫瘤干細(xì)胞的自我更新,而且可以抑制免疫檢查點(diǎn)的表達(dá)和免疫逃避,從而增強(qiáng)白血病細(xì)胞的免疫功能T 細(xì)胞的細(xì)胞毒性[38]。然而,其他m6A 調(diào)節(jié)劑如METTL3、METTL14 或WTAP 的抑制劑尚未被系統(tǒng)地開發(fā)。

4 結(jié)語

盡管在理解m6A 甲基化修飾的生物發(fā)生方面已經(jīng)取得了重大進(jìn)展,但其確切功能和治療特點(diǎn)尚不清楚,需要更多的研究來發(fā)現(xiàn)m6A 甲基化修飾與胃癌發(fā)生和發(fā)展的潛在關(guān)系。進(jìn)一步的廣泛研究將增加對(duì)m6A 甲基化修飾在胃癌中的生物學(xué)功能的認(rèn)識(shí),以期為胃癌患者的有效治療提供新的策略。

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