鄭唐春,李璐璐,王 佳,程堂仁,張啟翔
(花卉種質(zhì)創(chuàng)新與分子育種北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,國(guó)家花卉工程技術(shù)研究中心,城鄉(xiāng)生態(tài)環(huán)境北京實(shí)驗(yàn)室,園林環(huán)境教育部工程研究中心,林木花卉遺傳育種教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京林業(yè)大學(xué) 園林學(xué)院,北京100083)
植物豐富多樣的株型是經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期進(jìn)化和自然選擇的結(jié)果,是遺傳與環(huán)境互作的復(fù)雜調(diào)控過(guò)程[1]。木本植物按照枝型可以分為直枝、垂枝、曲枝等[2]。多樣的植物株型性狀在豐富園藝作物品種與促進(jìn)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中具有重要的應(yīng)用價(jià)值。植株株型是由頂端分生組織(SAM)形成的分枝決定的。因此,枝條的數(shù)量和形態(tài)特征對(duì)園藝植物的株型至關(guān)重要。莖頂端分生組織和腋生分生組織(AM)的衍生物,產(chǎn)生植物除子葉以外的所有器官。植物新梢發(fā)育經(jīng)歷3 個(gè)階段:腋生分生組織起始、葉芽初生生長(zhǎng)和莖次生生長(zhǎng)[3]。眾所周知,芽的發(fā)育是一個(gè)由許多基因精心調(diào)控的生物過(guò)程,如腋生分生組織形成相關(guān)的Cup-shaped cotyledon(CUC)、Like Aux(LAX)、HD-Zip III 亞家族基因[4-5],側(cè)芽形成相關(guān)的Wuschel(WUS)和Clavata(CLV)等基因[6-8],以及側(cè)芽生長(zhǎng)相關(guān)的More axillary branching(MAX)基因[9]。
HD-Zip III 轉(zhuǎn)錄因子是高等植物特有的轉(zhuǎn)錄因子,廣泛參與植物生長(zhǎng)和發(fā)育進(jìn)程。在擬南芥中有5 個(gè)HD-Zip III 亞家族成員,包括Revolula(REV)、Phabulosa(PHB)、Phavolula(PHV)、ATHB8和Corona(CNA、ATHB15)[10-11]。 除 了ATHB8基因外,REV、PHB、PHV和CAN基因均在頂端分生組織中表達(dá)[12]。HD-Zip III 基因也在葉原基的近軸側(cè)表達(dá),并可調(diào)節(jié)葉片極性建立。REV基因在擬南芥中過(guò)量表達(dá)表現(xiàn)出遠(yuǎn)軸側(cè)扁平葉和維管束的產(chǎn)生[11,13]。擬南芥rev突變體顯著降低腋生分生組織活性和花莖分枝[14],而REV功能獲得突變體jba-1D 和avb1均表現(xiàn)出增大的頂端分生組織和增加的分枝表型,表明REV通過(guò)調(diào)節(jié)頂端分生組織活性來(lái)調(diào)節(jié)莖分枝[15]。在木本植物楊樹中,REV的同源基因PRE(PtrHB2)和PtrHB7在形成層細(xì)胞分裂激活和次生生長(zhǎng)過(guò)程發(fā)揮重要作用,其microRNA 靶點(diǎn)突變導(dǎo)致產(chǎn)生異常維管組織[16-17]。
梅花是中國(guó)傳統(tǒng)名花,位居十大名花之首,有“花魁”之美譽(yù),是我國(guó)著名的早春木本觀賞植物。梅花雖然品種豐富,但存在株型單一、株型育種周期長(zhǎng)等問(wèn)題,無(wú)法滿足市場(chǎng)多樣化、新穎性產(chǎn)品需求,嚴(yán)重制約了梅花產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。前期在梅花中共鑒定出32 個(gè)HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子,RNA-seq 和qRT-PCR 分析顯示HD-Zip III 亞家族基因在莖和葉芽中高表達(dá)[18],推測(cè)HD-Zip III 在調(diào)節(jié)梅花分生組織分化和莖發(fā)育中起重要作用。本研究克隆出PmHB5基因和啟動(dòng)子序列并驗(yàn)證了PmHB5基因的時(shí)空表達(dá)和激素應(yīng)答模式,以期為系統(tǒng)解析PmHB5調(diào)控梅花莖發(fā)育形成機(jī)制提供理論依據(jù)。
梅花‘飛綠萼’(P.mume‘Fei Lve’)1 年生枝條取自北京林業(yè)大學(xué)鷲峰國(guó)際梅園,采集后立即放入水中瓶插;用于RNA 提取的葉芽、莖段、葉片等材料液氮速凍后保存于-80 ℃冰箱中。擬南芥(Arabidopsis thaliana,Col-0)和本氏煙草(Nicotianabenthamiana)由本實(shí)驗(yàn)室保存。pBI121-mgfp、pBI121、pCAMBIA1300super 和pCAMBIA1301 載體均由本實(shí)驗(yàn)室保存。TB Green? Premix ExTaq?II、PrimeScript? RT reagent Kit with gDNA Eraser反轉(zhuǎn)錄試劑盒、限制性內(nèi)切酶、PrimeSTAR HS DNA Polymerase、T4DNA 連接酶、In-fusion 重組酶等均購(gòu)自TaKaRa 寶生物(北京)有限公司。其它試劑為進(jìn)口或國(guó)產(chǎn)分析純。
利用少量高濃度NaOH 溶液溶解IAA、GA3、BR、KT、ZA 粉末配制母液,隨后用大量ddH2O 稀釋至使用濃度。
1.2.1 梅花不同組織樣品收集、RNA 提取和cDNA合成 為了檢測(cè)梅花PmHB5基因在不同組織的表達(dá)水平,選取長(zhǎng)勢(shì)健壯且一致的‘飛綠萼’3 株,收集葉片和不同發(fā)育階段的莖(LBS Ⅰ,發(fā)芽階段葉芽;LBS Ⅱ,展葉階段葉芽;S1-5,第1-5 節(jié)莖尖;S6-10,第6-10 節(jié)莖;S11-15,第11-15 節(jié)莖),以及伸長(zhǎng)生長(zhǎng)枝條的韌皮部、形成層和木質(zhì)部等液氮速凍后保存于-80 ℃冰箱中。
利用天根RNA 提取試劑盒RNAprep pure Plant Kit 提取梅花不同組織總RNA 并利用NanoDrop-1000 測(cè)定樣品RNA 濃度和質(zhì)量,進(jìn)一步使用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)樣品RNA 的完整性。參照PrimeScript RT reagent Mix with gDNA Eraser試劑盒操作流程將梅花總RNA 反轉(zhuǎn)錄為cDNA。
1.2.2 不同組織中PmHB5基因表達(dá)水平分析 利用IDT 在 線 軟 件(https://sg.idtdna.com/scitools/Applications/RealTimePCR/)設(shè) 計(jì) 梅 花PmHB5基因特異性引物(表1)。使用PikoReal PCR 系統(tǒng)和TB Green Premix ExTaqII 試劑盒按照操作流程進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR 反應(yīng)(qRT-PCR),PCR 反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃ 3 min 預(yù)變性、95 ℃ 5 s 變性、60 ℃20 s 退火,設(shè)置為40 個(gè)循環(huán)。在60 ~95 ℃范圍內(nèi)記錄溶解曲線。以PmPP2A作為參考基因[19](表1),設(shè)置3 個(gè)生物學(xué)重復(fù)。數(shù)據(jù)下機(jī)后利用采用2-△△Ct法計(jì)算目的基因相對(duì)表達(dá)量[20]。
1.2.3 外源激素處理下PmHB5基因表達(dá)水平分析 為了檢測(cè)梅花PmHB5基因?qū)Σ煌に靥幚淼捻憫?yīng)情況,選取長(zhǎng)勢(shì)基本一致的‘飛綠萼’植株3株,分別取3 枝基部已木質(zhì)化的當(dāng)年生枝條插入100 μmol/L 的IAA、GA3、BR、KT、ZA 溶液中侵泡12 h,以ddH2O 處理為空白對(duì)照,取溶液面以上2 cm 的莖段用于提取總RNA 并反轉(zhuǎn)錄為cDNA,利用qRT-PCR 檢測(cè)不同激素處理后PmHB5的表達(dá)情況。
1.2.4PmHB5基因和啟動(dòng)子克隆 根據(jù)梅花基因組中PmHB5基因的側(cè)翼序列設(shè)計(jì)引物(表1)。以梅花嫩莖cDNA 為模板,通過(guò)PCR 反應(yīng)擴(kuò)增目的基因。PCR 程序?yàn)椋?8 ℃ 5 min;98 ℃ 30 s;57 ℃30 s;68 ℃ 3 min;68 ℃ 5 min;反應(yīng)35 個(gè)循環(huán)。PCR 產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠(w/v)電泳后,使用天根Universal DNA 純化回收試劑盒(DP214)回收目的片段連接至亞克隆載體pEASY?-Blunt Cloning Vector,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞,挑選陽(yáng)性克隆并送生工生物工程(上海)股份有限公司(簡(jiǎn)稱“上海生工”)測(cè)序。
使用多糖多酚植物基因組DNA 提取試劑盒提取‘飛綠萼’葉片DNA,并以此為模板,根據(jù)PmHB5基因上游2 000 bp 序列設(shè)計(jì)特異性引物(表1)擴(kuò)增啟動(dòng)子片段。PCR 產(chǎn)物經(jīng)過(guò)1%瓊脂糖凝膠電泳后,膠回收目的片段連入pEASY?-Blunt Cloning Vector 上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞后挑選陽(yáng)性克隆送上海生工公司測(cè)序。
1.2.5 植物表達(dá)載體構(gòu)建 為驗(yàn)證梅花PmHB5基因的亞細(xì)胞定位情況,根據(jù)PmHB5基因堿基序列,去掉終止密碼子,根據(jù)pCAMBIA1300super 載體序列和PmHB5基因序列設(shè)計(jì)帶有載體同源臂的引物(表1)。通過(guò)PCR 擴(kuò)增反應(yīng)出擴(kuò)增目的條帶并利用Sma I酶切pCAMBIA1300super 載體,使用In-fusion 連接酶將純化后的PCR 產(chǎn)物連入pCAMBIA1300super 載體。進(jìn)一步轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α 并挑選陽(yáng)性克隆送上海生工公司測(cè)序。
為驗(yàn)證梅花PmHB5基因啟動(dòng)子時(shí)空表達(dá)模式,將梅花PmHB5基因啟動(dòng)子克隆純化后,利用Xba I和Kpn I限制性內(nèi)切酶連入到pBI121-mgfp載體上,構(gòu)建pBI121-PmHB5pro-GUS,驅(qū)動(dòng)報(bào)告基因GUS基因表達(dá)。
1.2.6 亞細(xì)胞定位 選取測(cè)序正確的質(zhì)粒pCAMBIA1300super-35S::PmHB5-GFP轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌GV3101 感受態(tài)。將成功轉(zhuǎn)化目的質(zhì)粒的菌株在添加50 mg/L 卡那霉素和50 mg/L 利福平的LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃ 200 r/min 過(guò)夜培養(yǎng)至OD600值為0.4,5 000 r/min 離心5 min 收集菌體,使用重懸液重懸菌團(tuán)至OD600值為0.6 后加入200 μmol/L 乙酰丁香酮制作侵染液。
選取生長(zhǎng)2 個(gè)月的本氏煙草植株,利用注射器將重懸后的農(nóng)桿菌菌液注射進(jìn)煙草葉片背面,暗培養(yǎng)24 h 后光照培養(yǎng)48 h。經(jīng)50 ng/mL 4',6- 二脒基-2- 苯基吲哚二鹽酸鹽(4',6-Diamidino-2-Phenylindole, Dihydrochloride,DAPI) 溶 液 染 色15 min 后,利用Leica TCS SP8 激光共聚焦顯微鏡(Leica, Wetzlar, Germany)觀察綠色熒光在細(xì)胞中的分布情況并拍照。
1 2.7 擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化與GUS 組織染色 將構(gòu)建好的pBI121-PmHB5pro-GUS轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101 感受態(tài),選取初花期擬南芥植株,利用花序浸染法轉(zhuǎn)化擬南芥。將收獲的T0代種子播種在含有50 mg/L卡那的篩選培養(yǎng)基上,篩選陽(yáng)性植株并提取葉片DNA 作為模板,利用GUS基因特異性引物(表1)驗(yàn)證轉(zhuǎn)基因植株。
表1 本文使用的引物序列Table 1 Primer sequences used in this study
將不同生長(zhǎng)狀態(tài)的轉(zhuǎn)基因擬南芥幼苗和不同組織浸泡在GUS 染色液中,使用真空泵將氣壓維持在0.01 Pa 大約30 min 排出組織間氣體。隨后置于37 ℃培養(yǎng)箱中染色5 ~7 h,隨即利用卡諾固定液固定過(guò)夜,75%酒精浸泡2 ~3 d 完全褪色后,使用Leica ED4 體式顯微鏡拍照(Leica,德國(guó))。
利用梅花嫩莖cDNA 克隆獲得PmHB5基因序列,測(cè)序結(jié)果顯示PmHB5編碼區(qū)包含2 523 個(gè)核苷酸序列,編碼840 個(gè)氨基酸。相比于梅花參考基因組,‘飛綠萼’PmHB5基因編碼序列中存在3 個(gè)單堿基突變,蛋白序列無(wú)差異,包含18 個(gè)外顯子(圖1A)。通過(guò)ExPASY 網(wǎng)站在線分析,推測(cè)該基因含有保守的HOX 和START 結(jié)構(gòu)域,編碼蛋白的分子量為大約92.89 kD,等電點(diǎn)為5.83(圖1B)。PmHB5基因的啟動(dòng)子序列中存在大量光響應(yīng)元件,包括AE-box、Box 4、I-box、GT1-motif、G-box、GT1-motif、TCT-motif。同時(shí),存在許多與激素響應(yīng)相關(guān)的順式元件(P-box、TATC-box、TCA element、ABRE、TGA-element、AuxRR-core、TGACG-motif、CGTCA-motif、ERF)和芽和分生組織特異性表達(dá)元素(as-2-box、CAT-box 和O2-site),推測(cè)PmHB5基因參與調(diào)控分生組織和莖的發(fā)育(圖1C)。
圖1 梅花PmHB5基因和啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)及生物信息學(xué)分析Fig. 1 Structure and bioinformatics analysis ofPmHB5gene and promoter sequences
利用qRT-PCR 方法檢測(cè)PmHB5在不同器官(葉片、葉芽和不同發(fā)育階段莖)中的表達(dá)水平,結(jié)果顯示PmHB5基因在葉片、葉芽和莖中均有不同程度的表達(dá),PmHB5在LBII、S1-5、S5-10、S11-15中的表達(dá)量均顯著高于葉片中表達(dá)量(圖 2A)。進(jìn)一步研究PmHB5在莖發(fā)育中的功能,從莖中分離出韌皮部、形成層和木質(zhì)部,qRT-PCR 結(jié)果顯示,PmHB5基因在形成層和木質(zhì)部中的表達(dá)量均顯著高于韌皮部中的表達(dá)量(圖 2B),表明PmHB5可能在細(xì)胞分化和枝條木質(zhì)化過(guò)程中起到重要作用。
生物信息學(xué)分析顯示,PmHB5基因中存在miRNA 的靶位點(diǎn),推測(cè)miR165/166可能對(duì)PmHB5基因存在轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,利用qRT-PCR 對(duì)miR165和miR166在梅花嫩莖不同組織中的表達(dá)量進(jìn)行測(cè)定,結(jié)果表明miR165和miR166的表達(dá)量均在韌皮部中表達(dá)量最高,在形成層中最低,韌皮部中miR165的表達(dá)量為木質(zhì)部中的171 倍,而形成層中的miR165的表達(dá)量?jī)H為韌皮部的15.2%(圖 2C);韌皮部中miR166的表達(dá)量為木質(zhì)部中的342 倍,同樣形成層中的miR166的表達(dá)量?jī)H為韌皮部的7.6%(圖2C)。相關(guān)性分析表明,miR165和miR166在梅花莖不同組織中的表達(dá)量呈正相關(guān),相關(guān)系數(shù)達(dá)0.999 98,miR165和miR166與PmHB5的 表 達(dá) 量呈顯著負(fù)相關(guān),相關(guān)系數(shù)絕對(duì)值均大于0.96(圖2D)。綜上,梅花miR165和miR166在木質(zhì)部、形成層和韌皮部中的表達(dá)量和PmHB5基因呈相反趨勢(shì)。
圖2 梅花PmHB5和miR165/166在不同組織中的表達(dá)模式分析Fig. 2 Expression analysis ofPmHB5andmiR165/166in different tissues
為了驗(yàn)證PmHB5基因能否響應(yīng)激素處理,使用100 μmol/L 的生長(zhǎng)素(IAA)、赤霉素(GA3)、表油菜素內(nèi)酯(BR)、激動(dòng)素(KT)、玉米素(ZA)對(duì)離體枝條進(jìn)行處理12 h 后,檢測(cè)PmHB5基因表達(dá)情況。定量結(jié)果表明梅花PmHB5基因均能夠響應(yīng)GA3、IAA、ZA、KT 和BR 激素處理。BR 處理后,PmHB5表達(dá)量變化最大,顯著上調(diào)了2 039 倍;KT 處理后,PmHB5的表達(dá)量上調(diào)了15.4 倍;IAA處理后,PmHB5的表達(dá)量上調(diào)了36.4 倍;而使用兩種細(xì)胞分裂素(ZA 和KT)處理后,PmHB5基因的表達(dá)量也顯著升高(圖3)。
圖3PmHB5基因?qū)Σ煌に靥幚淼捻憫?yīng)Fig. 3 The response ofPmHB5to different hormone treatments
為研究PmHB5啟動(dòng)子的功能,通過(guò)擬南芥花序侵染法,利用農(nóng)桿菌將pBI121-PmHB5promoter 轉(zhuǎn)移到擬南芥基因組中并對(duì)轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行GUS 組織染色。結(jié)果表明PmHB5主要在花芽分生組織、側(cè)芽分生組織、花朵、幼嫩葉片以及莖的維管組織中等細(xì)胞分裂和分化活躍部位表達(dá)(圖4A-F)。莖解剖結(jié)構(gòu)顯示,PmHB5主要在形成層和發(fā)育中的木質(zhì)部中表達(dá)(圖4G-H)。此外,PmHB5基因在花瓣的維管組織中表達(dá)量較高(圖4C)。根據(jù)PmHB5基因的表達(dá)部位推測(cè)其參與調(diào)控頂端分生組織和維管分生組織的發(fā)育、分化和維持。
圖4PmHB5基因啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)GUS 在擬南芥中染色Fig.4 GUS staining driven byPmHB5promoters in stem ofArabidopsis thaliana
為研究PmHB5基因的亞細(xì)胞定位情況,將去掉密碼子的PmHB5序列連入帶有GFP 蛋白的pCAMBIA1300super 載體中, 將重組后的pCAMBIA1300super-35S::PmHB5-GFP亞細(xì)胞定位載體通過(guò)瞬時(shí)轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化本氏煙草葉片。激光共聚焦顯微觀察結(jié)果表明,轉(zhuǎn)化pCAMBIA1300super 空載體的煙草葉片下表皮細(xì)胞中,綠色熒光信號(hào)在全細(xì)胞內(nèi)均能被檢測(cè)到,而轉(zhuǎn)化pCAMBIA1300super-35S::PmHB5-GFP載體的煙草葉片中,僅在細(xì)胞核中檢測(cè)到綠色熒光信號(hào)(圖5),表明PmHB5是定位在細(xì)胞核上的轉(zhuǎn)錄因子。
圖5 PmHB5 蛋白亞細(xì)胞定位Fig. 5 Subcellular localization of PmHB5 proteins
HD-Zips 蛋白屬于同源異型盒基因家族,是植物高度保守的一類轉(zhuǎn)錄因子,常以二聚體形式識(shí)別DNA 上的一對(duì)對(duì)稱序列,并作為轉(zhuǎn)錄激活子或者抑制子調(diào)控靶基因表達(dá),其調(diào)控活性受microRNA 調(diào)控[21]。HD-Zip 蛋白廣泛參與植物發(fā)育過(guò)程,如維管發(fā)育、器官形成、分生組織維持、逆境響應(yīng)等[22]。HD-Zips 依據(jù)DNA 結(jié)合域同源性被分為HD-Zip(I-IV)4 個(gè)亞家族。HD-Zip III 是維持莖尖分生組織模式所必需的轉(zhuǎn)錄因子,其功能缺失或功能獲得突變會(huì)改變維管束模式,從而影響莖的形態(tài)建成。
梅花PmHB5在未展葉的葉芽(LBSII)和莖頂端(S1-5)中有較高的表達(dá)水平,在梅花莖次生生長(zhǎng)過(guò)程中,PmHB5在形成層中表達(dá)量最高,在分化木質(zhì)部中次之。轉(zhuǎn)基因擬南芥GUS 組織染色結(jié)果表明梅花PmHB5基因主要在分生組織、維管組織等細(xì)胞生長(zhǎng)和分化活躍的部位中表達(dá)。Ko 等通過(guò)半定量RT-PCR、Northern blot 和原位雜交等方法證明銀白楊(Populus alba)HD-Zip III 亞家族基因PtaHB1主要在木質(zhì)部中表達(dá),且在枝條木質(zhì)部形成過(guò)程中表達(dá)量逐漸升高[23]。杉木ClHDZ2和ClHDZ3主要在莖中表達(dá)且表達(dá)量均隨著木質(zhì)化程度的提高而增強(qiáng),推測(cè)其參與杉木木質(zhì)部的發(fā)育[24]。取百日草(Zinnia elegans)嫩莖進(jìn)行原位雜交試驗(yàn),結(jié)果表明ZeHB-10、ZeHB-11和ZeHB-12基因主要在原形成層和分化木質(zhì)部中表達(dá)[25],與PmHB5在梅花中的表達(dá)模式基本類似?;赑mHB5基因在莖中的表達(dá)模式推測(cè)其在梅花莖中參與調(diào)控細(xì)胞分化和枝條木質(zhì)化過(guò)程。
HD-Zip III 基因在多種植物中被報(bào)道能夠響應(yīng)多種激素誘導(dǎo)。外施IAA 可以促進(jìn)擬南芥ATHB-8基因表達(dá)[26-27],在百日草中,油菜素類激素能夠誘導(dǎo)ZeHB-10、ZeHB-11和ZeHB-12表 達(dá)[25],使 用BR處理后,巨桉(Eucalyptus grandis)中PHB、PHV和ATHB15的表達(dá)量顯著升高[28]。水稻OsHox10基 因 能 夠 響 應(yīng)JA 和ABA 處 理[29],在 光 皮 樺(Betula luminifera)中,HD-Zip III 基因BlHDZ2、BlHDZ3、BlHDZ4、BlHDZ5均 能 響 應(yīng)IAA 處 理,BlHDZ1和BlHDZ2能夠響應(yīng)油菜素內(nèi)酯處理,GA、IAA、BR 和乙烯利(Ethephon)處理后的第2 天,BlHDZ4表達(dá)量升高[29]。在本研究中,通過(guò)對(duì)梅花PmHB5基因啟動(dòng)子中順式作用元件預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),PmHB5基因啟動(dòng)子中存在大量光響應(yīng)元件和多種激素響應(yīng)順式作用元件,包括IAA、SA、ET、MeJA、GA 和ABA 等。使用不同激素處理梅花枝條,qRTPCR 檢測(cè)結(jié)果表明,PmHB5基因能夠響應(yīng)GA3、IAA、ZA、KT 和BR 等激素誘導(dǎo),這與長(zhǎng)白落葉松HD-Zip 基因?qū)ν庠醇に氐捻憫?yīng)模式類似[31]。Chip-Seq 試驗(yàn)證明擬南芥HD-Zip III 亞家族轉(zhuǎn)錄因子REV能夠直接作用于多個(gè)HD-Zip II γ 和δ 組基因啟動(dòng)子,包括HAT22、HAT14、HAT1、ATHB2、ATHB4等基因,這些基因被報(bào)道能夠響應(yīng)光敏色素參與紅光/遠(yuǎn)紅光(R: FR)誘導(dǎo)的蔭蔽反應(yīng),在蔭蔽環(huán)境下促進(jìn)擬南芥下胚軸伸長(zhǎng)[32-35]。生長(zhǎng)素在調(diào)控植物在蔭蔽環(huán)境中的下胚軸伸長(zhǎng)方面起著至關(guān)重要的作用,REV轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)直接激活調(diào)控色氨酸依賴途徑的生長(zhǎng)素合成[36]以及生長(zhǎng)素運(yùn)輸相關(guān)基 因(LAX2)和LAX3的 表 達(dá)[37]。HD-Zip III 和KANAD1 轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)相互拮抗共同調(diào)控器官或組織的極性發(fā)育,如莖頂端分生組織、葉片原基、莖和根的維管組織等[38-40]。另外,HD-Zip II 和HD-Zip III 和miR165/166之間存在一個(gè)反饋調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。在葉片原基中,miR165/166在遠(yuǎn)軸面抑制HD-Zip III 亞家族基因REV的表達(dá),而在葉原基遠(yuǎn)軸面,HD-Zip II 亞家族HAT3和ATHB4轉(zhuǎn)錄因子能夠與REV結(jié)合形成異源二聚體抑制miR65/166的表達(dá)從而促進(jìn)HDZip III 亞家族基因的表達(dá)。3 類基因的相互作用共同維持了組織特異性發(fā)育的平衡,導(dǎo)致了扁平葉片的形成[41-42]。