近日，我國科研團(tuán)隊依托原創(chuàng)的臨床單細(xì)胞拉曼藥敏快檢系統(tǒng)（CAST-R）建立的單個細(xì)菌細(xì)胞精度、“鑒定-藥敏-溯源”全流程一體化的H.pylori 診療技術(shù)CAST-R-HP，具有快速病原鑒定、精確藥敏表型檢測、基于單細(xì)胞全基因組支撐耐藥機(jī)制研究與精準(zhǔn)溯源等優(yōu)勢，其特性可用來診療幽門螺桿菌感染。

幽門螺桿菌耐藥菌鑒定的臨床金標(biāo)準(zhǔn)是內(nèi)鏡檢查與細(xì)菌培養(yǎng)相結(jié)合的藥敏檢驗。由于其生長條件苛刻，分離和培養(yǎng)胃活檢標(biāo)本中的幽門螺桿菌通常需7～10天，且難以考察臨床樣品中“原位”的病原多樣性。目前臨床醫(yī)生主要依賴經(jīng)驗用藥而非藥敏結(jié)果指導(dǎo)下的精準(zhǔn)治療，隨著幽門螺桿菌耐藥性的不斷增加，經(jīng)驗治療的根除失敗率日益提高。

針對以上瓶頸問題，科研團(tuán)隊構(gòu)建了15種臨床常見胃部共生菌的單細(xì)胞拉曼光譜（SCRS）參考數(shù)據(jù)庫，進(jìn)而利用端到端的深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（DCNN），將拉曼光譜特征提取與分類模型訓(xùn)練過程相融合，有效提升了基于SCRS 的病原鑒定準(zhǔn)確率。直接從臨床胃黏膜樣品出發(fā)，對幽門螺桿菌細(xì)胞進(jìn)行識別和鑒定，準(zhǔn)確率達(dá)98.5±0.27%。

下一步，研究人員將基于“微生物藥敏單細(xì)胞技術(shù)臨床示范網(wǎng)絡(luò)”，進(jìn)一步開發(fā)CAST-R-HP 系統(tǒng)，拓展其應(yīng)用，從而為建立單細(xì)胞精度的幽門螺桿菌診療與疾控體系奠定技術(shù)和裝備基礎(chǔ)。