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非洲豬瘟病毒引物解旋酶C962R轉(zhuǎn)錄水平的動(dòng)態(tài)分析及其互作病毒蛋白的鑒定

2022-11-05 03:05:58皇甫皓月黃煉榆王可欣沈冬冬張紀(jì)文張振江趙東明
關(guān)鍵詞:基因組質(zhì)粒引物

席 飛,皇甫皓月,黃煉榆,王可欣,沈冬冬,張紀(jì)文,張振江,李 芳,趙東明

(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,黑龍江 哈爾濱 150069)

非洲豬瘟(African swine fever,ASF)是一種由ASF 病毒(ASFV)引起豬的傳染性病毒病,死亡率可達(dá)100%[1]。該疾病于1921 年在肯尼亞首次被發(fā)現(xiàn)[2],并于2018 年在我國遼寧省沈陽市被發(fā)現(xiàn)[3],隨后在全國快速流行,目前尚無針對(duì)該疾病有效的抗病毒藥物及疫苗,嚴(yán)重威脅著我國養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展[4],針對(duì)ASFV的抗病毒藥物及有效的疫苗研發(fā)顯得尤為重要。

ASFV 是一種單分子線狀DNA 病毒,屬于雙鏈DNA 病毒目非洲豬瘟病毒科(Asfarviridae)非洲豬瘟病毒屬(Asfivirus),也是Asfarviridae家族(Asfivirus屬)的唯一成員[5]。ASFV 基因組非常龐大,約170 kb~190 kb,含150 多個(gè)開放閱讀框[6](ORFs),病毒結(jié)構(gòu)極其復(fù)雜[7]?;谠擙嫶蟮幕蚪M,ASFV能夠編碼許多功能蛋白供其完成某些生命周期活動(dòng)。例如,ASFV 可以編碼與病毒基因組復(fù)制相關(guān)的蛋白[8]。已有研究表明,ASFV 基因組中G1211R、E301R、F1055L、P1192R、C962R等基因編碼的蛋白為ASFV 基因組復(fù)制相關(guān)蛋白[9]。其中,C962R 蛋白類似于彩虹病毒中的引物酶家族成員,能夠融合至D5 樣解旋酶結(jié)構(gòu)域[10],具有解開DNA 雙螺旋及形成DNA 復(fù)制階段所需RNA 引物的作用[11],C962R基因在不同ASFV 分離株中均高度保守[12]。引物解旋酶是ASFV 基因組復(fù)制過程中和DNA 合成過程中重要的功能蛋白,并能與DNA 聚合酶亞基相互作用及形成蛋白復(fù)合物,探究與C962R蛋白互作的病毒蛋白將有助于揭示C962R 蛋白的生物學(xué)功能和了解與ASFV 基因組復(fù)制相關(guān)的功能性復(fù)合體的組成和分子機(jī)理。

為分析ASFV引物解旋酶C962R基因的動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)錄水平及探尋與其互作的病毒蛋白,本研究利用熒光定量PCR(RT-qPCR)檢測ASFV Pig/HLJ/2018株感染豬肺泡巨噬細(xì)胞(PAM)后不同時(shí)間C962R基因的轉(zhuǎn)錄水平,并構(gòu)建融合表達(dá)C962R 和Strep 標(biāo)簽的重組ASFV 及表達(dá)C962R蛋白的細(xì)胞,通過質(zhì)譜分析及免疫共沉淀試驗(yàn)確定與C962R蛋白互作的病毒蛋白,為以C962R蛋白為靶蛋白的新型抗ASFV藥物及疫苗的研發(fā)提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 主要實(shí)驗(yàn)材料ASFV Pig/HLJ/2018 株、ASFV 基因組、HEK293T細(xì)胞、PAM、PK-15細(xì)胞、pCAGGS載體、表達(dá)C962R 蛋白和Strep 標(biāo)簽的慢病毒包裝質(zhì)粒LentiGuide-puro-962-Strep、慢病毒包裝輔助質(zhì)粒pVSVG、pPSPA、攜帶有mCherry基因的質(zhì)粒pmCherry、pCAGGS-C962R-Strep 質(zhì)粒、同源重組轉(zhuǎn)染試劑K2M、K2 由本實(shí)驗(yàn)室保存;p3X-MCS 載體由pMD18-T 質(zhì)粒改造構(gòu)建,并保存在本實(shí)驗(yàn)室;E. coliDH5α 感受態(tài)細(xì)胞購自南京諾唯贊生物科技股份有限公司;轉(zhuǎn)染試劑TransIT-Lenti 購自Mirus 公司;鼠源Strep 抗體、鼠源Flag 抗體、山羊抗小鼠IgG-HRP 及脫硫生物素(D-Desthiobiotin)均購自Sigma公司;Strep-Tactin?Sepherose 購自IBA 公司;OPTI-MEM 購自Gibco 公司;蛋白上樣緩沖液、poly brene 購自Solarbio 公司;預(yù)染蛋白Maker、T4連接酶購自Thermofisher scientific公司。

本研究所涉及到的ASFV 操作均在中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所國家動(dòng)物疫病防控高級(jí)別生物安全實(shí)驗(yàn)室完成。

1.2 引物的設(shè)計(jì)與合成根據(jù)GenBank 中ASFV Pig/HLJ/2018 株基因組序列(MK333180.1),利用Primer Premier 5.0 軟件設(shè)計(jì)引物,并在上下游引物5′端分別引入相應(yīng)酶切位點(diǎn),引物均由吉林庫美生物科技有限公司合成(表1)。

表1 本研究所需引物Table 1 Primers of the study

1.3 ASFVC962R基因轉(zhuǎn)錄水平的動(dòng)態(tài)分析將ASFV Pig/HLJ/2018 株以MOI 10 感染PAM,感染后的0~20 h 內(nèi)每間隔2 h 收獲細(xì)胞,提取RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA。利用C962R基因引物C962R-F/C962R-R,內(nèi)參引物DNAJC14-F/DNAJC14-R 經(jīng)RT-qPCR 擴(kuò)增C962R基因和內(nèi)參基因DNAJC14,每組設(shè)置3 個(gè)重復(fù),DEPC 水作為陰性對(duì)照。將RT-qPCR 的結(jié)果用2-ΔΔCt(Ct 目的基因-Ct 內(nèi)參基因=ΔCt;ΔCt 處理樣品-ΔCt 對(duì)照樣品=ΔΔCt)法處理,分析C962R基因轉(zhuǎn)錄水平的動(dòng)態(tài)變化。

1.4 重組質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定以ASFV 基因組為模板,利用引物Upstream-F/R 經(jīng)PCR 擴(kuò)增距C962R基因起始密碼子41 bp(內(nèi)含子部分)處上游約1 000 bp的基因序列,得到Upstream片段,克隆至質(zhì)粒p3X-MCS中, 構(gòu)建重組質(zhì)粒p3X-MCS-Upstream;以質(zhì)粒pm-Cherry 為模板,利用引物mCherry-F/R 擴(kuò)增mCherry片段并克隆至p3X-MCS-Upstream 質(zhì)粒中構(gòu)建重組質(zhì)粒p3X-MCS-Upstream-mCherry;以ASFV 基因組為模板,利用引物Downstream-Strep-F/R、Downstream-41-F/R經(jīng)PCR 擴(kuò)增C962RN 端約1 000 bp 的基因序列(該N端融合Strep 標(biāo)簽)及C962R基因起始密碼子上游的41 bp(內(nèi)含子部分)基因序列,分別克隆至p3X-MCSUpstream-mCherry 質(zhì)粒,構(gòu)建重組質(zhì)粒p3X-MCSC962R-mCherry,經(jīng)雙酶切(NdeI/Hind III)和測序鑒定。

1.5 表達(dá)C962R 蛋白融合Strep 標(biāo)簽的重組ASFV的構(gòu)建與鑒定將PAM 以3×106個(gè)/孔鋪于六孔細(xì)胞板中,24 h 后,每孔加入40 μL K2M 試劑;1.5 h后,分別配置A 液:130 μL 1640 培養(yǎng)基+10 μL K2試劑;B 液:130 μL 1640 培養(yǎng)基+3 μg p3X-MCSC962R-mCherry 質(zhì)粒,將A 液和B 液混合,室溫下放置10 min 后轉(zhuǎn)染PAM。24 h 后,將ASFV Pig/HLJ/2018 株以MOI 1 感染PAM,48 h 后分別收獲細(xì)胞與上清液。將收獲的含重組ASFV 的上清液以MOI 1 感染PAM,24 h 后,分別收獲上清液和PAM。提取細(xì)胞上清中的病毒基因組,利用引物962-F/962-R 擴(kuò)增含mCherry融合Strep 標(biāo)簽的基因片段,并由庫美公司測序;利用細(xì)胞裂解液(1 mmol/L Tris-HCl pH7.3,2.5 mmol/L NaCl,10% NP-40,20 mmol/L EDTA)裂解PAM,離心后取上清,以鼠源Strep 抗體(1∶1 000)為一抗、山羊抗小鼠IgG-HRP(1∶10 000)為二抗,經(jīng)western blot 檢測重組ASFV(rC962R-mCherry),以感染ASFV Pig/HLJ/2018 株的PAM 作為陰性對(duì)照。

1.6 表達(dá)C962R 蛋白的PK 15 細(xì)胞(PK-15-962-Strep)的構(gòu)建與鑒定將HEK293T細(xì)胞以4×106個(gè)/孔鋪于六孔板中,24 h 后將慢病毒包裝質(zhì)粒LentiGuidepuro-962-Strep、輔助質(zhì)粒pVSVG、pPSPA 共同溶于OPTI-MEM 中;另將轉(zhuǎn)染試劑TransIT-Lenti 與OPTIMEM 混合,孵育5 min 后將上述兩種混合液混合,室溫孵育30 min后轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞,48 h后收獲含慢病毒的細(xì)胞上清。將PK-15 細(xì)胞以3×106個(gè)/孔鋪于六孔板中,將慢病毒按照1/2 細(xì)胞培養(yǎng)液體積轉(zhuǎn)導(dǎo)至細(xì)胞中,每孔加入1.1 μL poly brene 試劑,以正常PK-15 細(xì)胞作為空白對(duì)照。轉(zhuǎn)導(dǎo)48 h 后,利用嘌呤霉素(1 μg/mL)篩選,直至空白對(duì)照組的細(xì)胞全部死亡,收獲存活的細(xì)胞。利用1.5 中的western blot 方法,檢測獲得的細(xì)胞中C962R 蛋白的表達(dá),以正常PK-15細(xì)胞作為空白對(duì)照。

1.7 與ASFV C962R 蛋白互作病毒蛋白的Strep pull-down 試驗(yàn)分別利用構(gòu)建的重組ASFV rC962RmCherry 和PK-15-962-Strep 細(xì)胞檢測與ASFV C962R蛋白互作的病毒蛋白。前者:將重組ASFV rC962RmCherry 以MOI 1 感染PAM 作為實(shí)驗(yàn)組,以Pig/HLJ/2018 株感染PAM 作為陽性對(duì)照,正常PAM 作為空白對(duì)照。后者:將Pig/HLJ/2018 株以MOI 1 感染細(xì)胞PK-15-962-Strep 作為實(shí)驗(yàn)組,以PK-15-962-Strep細(xì)胞作為陽性對(duì)照,正常的PK-15 細(xì)胞作為空白對(duì)照。每組感染24 h 后,分別裂解細(xì)胞,離心取上清,并與Strep-Tactin?Sepherose 于4 ℃低速共孵育2 h 后,進(jìn)行Strep pull-down 試驗(yàn),以鼠源Strep 抗體(1∶1 000)為一抗、山羊抗小鼠IgG-HRP(1∶10 000)為二抗,經(jīng)western blot 檢測洗脫液中的C962R 蛋白及與其互作的病毒蛋白。將獲得的洗脫液由中科院生物物理所質(zhì)譜中心經(jīng)質(zhì)譜鑒定C962R 蛋白及與其互作的病毒蛋白。

1.8 與ASFV C962R 蛋白互作的病毒蛋白的Co-IP驗(yàn)證以ASFV 基因組為模板,利用表1 中的引物A137R-F/A137R-R、K145R-F/K145R-R、K205R-F/K205R-R 經(jīng)PCR 擴(kuò)增由1.7 質(zhì)譜鑒定到的病毒蛋白編碼基因,并分別通過PCR 融合Strep 標(biāo)簽于各基因的C 端,將擴(kuò)增得到的基因片段分別克隆至pCAGGS 載體中,經(jīng)雙酶切(SacI/NheI)鑒定為陽性的質(zhì)粒由庫美生物科技有限公司測序,正確的質(zhì)粒分別命名為:pCAGGS-A137R-Flag、pCAGGS-K145R-Flag、pCAGGSK205R-Flag。將HEK293T 細(xì)胞鋪于六孔細(xì)胞板中,當(dāng)細(xì)胞融合度達(dá)到80%~90%時(shí),將質(zhì)粒pCAGGSA137R-Flag+pCAGGS-C962R-Strep、pCAGGS-K145RFlag+pCAGGS-C962R-Strep、pCAGGS-K205R-Flag+pCAGGS-C962R-Strep 利 用 轉(zhuǎn) 染 試 劑TransIT-Lenti 分別轉(zhuǎn)染至HEK293T 細(xì)胞中,單獨(dú)分別轉(zhuǎn)染pCAGGSA137R-Flag、pCAGGS-K145R-Flag、pCAGGS-K205RFlag 的HEK293T 細(xì)胞作為對(duì)照。36 h 后裂解細(xì)胞離心后取上清,取部分上清作為Input 對(duì)照。將剩余的上清與Strep-Tactin?Sepherose 在4 ℃搖床中共孵育5 h 后,利用細(xì)胞裂解液清洗Strep-Tactin?Sepherose 5 次,最后加入2×蛋白上樣緩沖液于沸水中煮樣得到IP 樣品,分別以1∶1 000 稀釋的鼠源Strep 抗體與鼠源Flag 抗體為一抗,以1∶10 000稀釋的山羊抗小鼠IgG-HRP 為二抗,對(duì)Input 樣品及IP 樣品經(jīng)western blot 驗(yàn)證1.7 獲得的與ASFV C962R 蛋白互作的病毒蛋白。

2 結(jié) 果

2.1 ASFV C962R 轉(zhuǎn)錄水平動(dòng)態(tài)變化的檢測結(jié)果將ASFV Pig/HLJ/2018 株感染PAM,感染后0~20 h 內(nèi)每間隔2 h 取細(xì)胞,利用染料法RT-qPCR 檢測細(xì)胞中C962R基因轉(zhuǎn)錄水平的動(dòng)態(tài)變化。結(jié)果顯示,感染病毒后6 h 能夠檢測到C962R基因的轉(zhuǎn)錄,隨著感染時(shí)間的延長,C962R基因的轉(zhuǎn)錄水平升高,并在感染后18 h 達(dá)到峰值(圖1)。陰性對(duì)照未檢測該基因的轉(zhuǎn)錄,所以未展示該數(shù)據(jù)。結(jié)果表明C962R基因?yàn)锳SFV 晚期轉(zhuǎn)錄基因,且其轉(zhuǎn)錄水平在一定的時(shí)間內(nèi)與感染時(shí)間成正相關(guān)。

圖1 ASFV C962R基因轉(zhuǎn)錄水平動(dòng)態(tài)變化的RT-qPCR檢測結(jié)果Fig.1 Detection of dynamic changes of transcript level of ASFV C962R gene by RT-qPCR

2.2 重組質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定結(jié)果分別以ASFV 基因組及pmCherry 質(zhì)粒為模板,利用PCR 分別擴(kuò)增相應(yīng)基因片段,并依次克隆至p3X-MCS 載體,構(gòu)建重組質(zhì)粒p3X-MCS-C962R-mCherry。該重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定結(jié)果顯示,獲得大小分別為2 741 bp 和2 494 bp(載體)的片段(圖2),與預(yù)期結(jié)果相符。測序結(jié)果顯示,插入基因序列正確。表明正確構(gòu)建了重組質(zhì)粒p3X-MCS-C962R-mCherry。

圖2 重組質(zhì)粒p3X-MCS-C962R-mCherry的酶切鑒定結(jié)果Fig.2 Identification of recombinant plasmid p3X-MCSC962R-mCherry by enzyme digestion

2.3 表達(dá)C962R 蛋白融合Strep 標(biāo)簽的重組ASFV的構(gòu)建與鑒定結(jié)果將重組質(zhì)粒p3X-MCS-C962RmCherry 轉(zhuǎn)染PAM,24 h 后將ASFV Pig/HLJ/2018 株感染該P(yáng)AM,48 h 后收獲融合表達(dá)C962R 和Strep 標(biāo)簽的重組ASFV,并以MOI 1感染PAM,24 h后,分別收獲上清和細(xì)胞,利用PCR 擴(kuò)增上清中含mCherry及Strep 標(biāo)簽的融合基因序列并測序鑒定;收獲的PAM裂解后經(jīng)western blot 檢測C962R 蛋白的表達(dá)。PCR 結(jié)果顯示,擴(kuò)增出一條約1 000 bp 的目的條帶,測序結(jié)果與預(yù)期基因序列相符(圖略);Western blot 結(jié)果顯示,PAM裂解液離心后的上清中出現(xiàn)100 ku的特異性條帶,而對(duì)照組無該特異性條帶(圖3)。上述結(jié)果表明,獲得了融合表達(dá)C962R 蛋白和Strep 標(biāo)簽的重組ASFV(rC962R-mCherry)。

圖3 重組病毒C962R-mCherry的western blot鑒定結(jié)果Fig.3 Detection of rC962R-mCherry by western blot

2.4 表達(dá)C962R 蛋白的PK-15 細(xì)胞的構(gòu)建與鑒定結(jié)果分別將慢病毒包裝質(zhì)粒LentiGuide-puro-962-Strep、輔助質(zhì)粒pVSVG、pPSPA 轉(zhuǎn)染HEK293T 細(xì)胞48 h 后收獲含慢病毒的上清液,并轉(zhuǎn)導(dǎo)至PK-15 細(xì)胞中48 h 后,利用嘌呤霉素篩選融合表達(dá)C962R 蛋白和Strep 標(biāo)簽蛋白的細(xì)胞并經(jīng)western blot 鑒定。結(jié)果顯示,裂解細(xì)胞并離心后的上清液中出現(xiàn)100 ku的特異性條帶,而未轉(zhuǎn)導(dǎo)慢病毒的PK-15 細(xì)胞無該特異性條帶(圖4)。表明獲得了表達(dá)ASFV C962R 蛋白的細(xì)胞PK-15-962-Strep。

圖4 表達(dá)C962R蛋白的細(xì)胞的western blot鑒定結(jié)果Fig.4 Detection of cells that expressing C962R protein by western blot

2.5 與ASFV C962R 蛋白互作病毒蛋白的Strep pull-down 試驗(yàn)結(jié)果將rC962R-mCherry 感染PAM,同時(shí)將ASFV Pig/HLJ/2018 株感染PK-15-962-Strep,分別通過這兩種方式經(jīng)Strep pull-down 試驗(yàn)檢測C962R 蛋白及篩選與其互作的病毒蛋白。結(jié)果顯示,rC962R-mCherry 感染的PAM、Pig/HLJ/2018 株感染的細(xì)胞PK-15-962-Strep 以及無病毒感染的空白細(xì)胞PK-15-962-Strep 的洗脫液中均出現(xiàn)100 ku 的特異性條帶(圖5)。將每組的洗脫液經(jīng)質(zhì)譜鑒定,結(jié)果顯示分別利用rC962R-mCherry 及表達(dá)C962R 蛋白的細(xì)胞PK-15-962-Strep 共篩選出3 種相同的病毒蛋白:A137R 蛋白、K145R 蛋白及K205R 蛋白。結(jié)果表明,C962R 蛋白在rC962R-mCherry 感染的PAM、Pig/HLJ/2018 株感染的細(xì)胞PK-15-962-Strep 以及無病毒感染的空白細(xì)胞PK-15-962-Strep中均獲得了表達(dá),且初步鑒定了與C962R蛋白互作的ASFV蛋白:A137R蛋白(~16.1 ku)、K145R 蛋白(~17.2 ku)、K205R 蛋白(~23.7 ku)。

圖5 分別利用rC962R-mCherry(A)及PK-15-962-Strep(B)鑒定與ASFV C962R蛋白互作病毒蛋白的Strep pull-down試驗(yàn)結(jié)果Fig.5 Strep pull-down results of viral proteins interacting with ASFV C962R protein by using rC962R-mCherry and PK-15-962-Strep

2.6 與ASFV C962R 蛋白互作病毒蛋白的Co-IP 試驗(yàn)結(jié)果經(jīng)PCR 分別融合Strep 標(biāo)簽于篩選出的3 種病毒蛋白編碼基因A137R、K145R及K205R的C 端,并分別克隆至pCAGGS 載體中,獲得表達(dá)A137R、K145R 和K205R 的重組質(zhì)粒。并將這3 種質(zhì)粒分別與pCAGGS-C962R-Strep 共轉(zhuǎn)染HEK293T 細(xì)胞,36 h 后裂解細(xì)胞離心后取上清采用Co-IP 試驗(yàn)驗(yàn)證與ASFV C962R 蛋白互作的病毒蛋白。結(jié)果顯示,利用鼠源Strep 抗體與鼠源Flag 抗體分別作為一抗時(shí),Input 樣品中均可以檢測到各轉(zhuǎn)染組分蛋白的表達(dá);IP 樣品中,利用Strep 抗體可以在實(shí)驗(yàn)組中檢測到100 ku 的特異性條帶,對(duì)照組中則無該特異性條帶,利用Flag 抗體可以檢測到約16 ku 及17 ku 的特異性條帶(圖6),根據(jù)條帶大小,上述特異性條帶分別對(duì)應(yīng)A137R、K145R 蛋白。上述結(jié)果表明在實(shí)驗(yàn)組中可以檢測到C962R 蛋白的表達(dá),且A137R、K145R 蛋白與C962R 蛋白均存在相互作用。

圖6 與ASFV C962R蛋白互作病毒蛋白的Co-IP試驗(yàn)結(jié)果Fig.6 Co-IP results y of viral proteins interacting with ASFV C962R protein

3 討 論

在病毒的生命周期中,其基因組的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄至關(guān)重要,ASFV 編碼與病毒基因組復(fù)制相關(guān)的蛋白。Linda總結(jié)歸納了與ASFV 基因組復(fù)制相關(guān)的蛋白,分別為:G1211R、E301R、C962R、F1055L、P1192R、NP419L 蛋白[9]。其中,C962R 蛋白作為引物解旋酶,具有解開ASFV DNA 雙鏈及形成RNA 引物的作用[11],該蛋白是DNA 聚合酶功能性復(fù)合體的重要組成部分,并與其亞基存在相互作用,找到與C962R 蛋白互作的病毒蛋白有利于揭示C962R 蛋白的功能及了解與ASFV 基因組復(fù)制相關(guān)的功能性復(fù)合體的組成。

本研究首先利用ASFV Pig/HLJ/2018 株感染PAM,通過染料法RT-qPCR 檢測了C962R基因的動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)錄水平,結(jié)果顯示,在感染后6 h 能夠明顯地檢測到C962R基因的轉(zhuǎn)錄,在感染后18 h 其轉(zhuǎn)錄水平達(dá)到峰值。表明C962R為ASFV 晚期轉(zhuǎn)錄基因,其轉(zhuǎn)錄水平在一定的時(shí)間內(nèi)與感染時(shí)間成正比。已有研究顯示,DNA 復(fù)制所需的酶在ASFV 從未被包膜的核心粒子進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)后立即表達(dá),即在其基因組復(fù)制前的轉(zhuǎn)錄翻譯過程中表達(dá),也即約在感染宿主后6 h ASFV 基因組開始復(fù)制,說明與ASFV DNA復(fù)制所需的酶需要在0~6 h之前轉(zhuǎn)錄,本研究結(jié)果均與之相符[12]。

本研究利用Strep pull-down 試驗(yàn)篩選到3 種與ASFV C962R 蛋白互作的病毒蛋白:A137R 蛋白、K145R 蛋白、K205R 蛋白。進(jìn)一步利用Co-IP 試驗(yàn)驗(yàn)證C962R 蛋白與這3 種蛋白是否具有相互作用,結(jié)果顯示,只有A137R、K145R 蛋白與C962R 蛋白有相互作用,由此推測A137R、K145R 蛋白可能通過與C962R 蛋白的相互作用影響ASFV 基因組的復(fù)制。已有研究表明,敲除A137R基因后可以抑制ASFV 的復(fù)制及降低病毒毒力[13],說明在ASFV 基因組復(fù)制過程中,A137R可能具有不可替代的作用。而敲除K145R基因后卻對(duì)ASFV的復(fù)制及毒力無太大影響[14]。但有相關(guān)研究表明,共敲除ASFV Georgia 2007/1 株的MGF360-12L和K145R基因后,明顯降低了ASFV 在巨噬細(xì)胞中的復(fù)制水平,說明K145R 蛋白可能為ASFV 基因組復(fù)制過程中的輔助因子。此外,敲除ASFV Georgia 2007/1 株中的K145R和DP148R能夠延遲感染豬出現(xiàn)臨床癥狀的時(shí)間,說明K145R對(duì)病毒的毒力也有一定的影響。A137R 蛋白、K145R 蛋白在ASFV 中的具體作用及其作用機(jī)制還有待進(jìn)一步的研究。

綜上所述,ASFV 引物解旋酶C962R 為晚期轉(zhuǎn)錄蛋白,病毒蛋白A173R、K145R 與其存在相互作用,該類復(fù)合體可能參與病毒基因組的復(fù)制階段。本研究結(jié)果有助于了解與ASFV 基因組復(fù)制相關(guān)病毒蛋白分子的組成及ASFV 基因組復(fù)制的相關(guān)機(jī)制,為以C962R 蛋白為靶蛋白的新型抗病毒藥物及疫苗的研發(fā)提供參考依據(jù)。

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