高寧寧,李曉慧,康利允,梁 慎,常高正,李海倫,王慧穎,王 琰,徐小利,趙衛(wèi)星
(河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所, 鄭州 450002)
【研究意義】西瓜(Citrulluslanatus)屬葫蘆科,我國(guó)是世界上最大的西瓜產(chǎn)地。近年來(lái),小果型西瓜以皮薄、含糖量高、口感細(xì)膩等特點(diǎn),受到消費(fèi)者的廣泛歡迎[1]。西瓜是異花授粉植物,西瓜雜交種的生產(chǎn)以人工去雄為主,套袋處理、人工授粉,工作量大且雜交種子易不純,利用西瓜雄性不育系能夠解決這一難題[2]。我國(guó)小果型西瓜發(fā)展較晚,種質(zhì)資源相對(duì)匱乏,對(duì)小果型西瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性進(jìn)行分析,拓寬小果型西瓜的遺傳基礎(chǔ),更好地創(chuàng)新和利用小果型西瓜種質(zhì)資源?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】目前的分子標(biāo)記方法有RFLP、SCAR、RAPD、CAPS、SSR和SRAP等,SRAP分子標(biāo)記是一種基于PCR技術(shù)的新型標(biāo)記系統(tǒng),具有簡(jiǎn)便高效、重復(fù)性好、高共顯性等特點(diǎn)[3]。SRAP標(biāo)記在小麥[4-5]、黃瓜[6]、油菜[7]、甜瓜[8-10]等作物上已經(jīng)被廣泛應(yīng)用,SRAP標(biāo)記在西瓜上的應(yīng)用主要在遺傳圖譜構(gòu)建[11]、基因關(guān)聯(lián)分析[12]、品種純度鑒定[13-14]等方面。此外,利用SRAP分子標(biāo)記分析西瓜種質(zhì)遺傳多樣性也有相關(guān)報(bào)道,張愛(ài)萍等[15]采用SRAP技術(shù)對(duì)64份西瓜種質(zhì)資源進(jìn)行了遺傳多樣性研究,結(jié)果表明多數(shù)西瓜育種材料間同源性較高。李嚴(yán)等[16]利用20對(duì)SRAP引物組合標(biāo)記分析了20個(gè)西瓜雜交種的遺傳多態(tài)性,研究發(fā)現(xiàn)西瓜的SRAP多態(tài)性水平相對(duì)低。Yaciolu等[17]利用27對(duì)引物對(duì)256個(gè)土耳其西瓜進(jìn)行了SRAP標(biāo)記,產(chǎn)生了210個(gè)標(biāo)記用于遺傳分析。李朋飛等[18]運(yùn)用SRAP分子標(biāo)記技術(shù)分析了80份西瓜種質(zhì)資源的遺傳多樣性,多態(tài)性最高達(dá)45.5%,研究表明供試西瓜材料遺傳背景狹窄?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】目前,SRAP分子標(biāo)記對(duì)小果型西瓜雄性不育和可育種質(zhì)資源遺傳多樣性分析的研究未見(jiàn)報(bào)道。【擬解決的關(guān)鍵問(wèn)題】利用SRAP標(biāo)記對(duì)雄性不育和可育小果型西瓜進(jìn)行親緣關(guān)系分析,為其特異種質(zhì)資源的合理利用提供理論基礎(chǔ),加快小果型西瓜新品種的選育進(jìn)程。
供試的45份小果型西瓜種質(zhì)為河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所從世界各地收集及經(jīng)過(guò)多年創(chuàng)新的品種(系)。其中,1~9號(hào)為雄性不育材料,10~45號(hào)為正常雄性可育材料(表1)。
表1 供試45 份小果型西瓜品種
續(xù)表1 Continued table 1
1.2.1 DNA提取 待供試45份西瓜材料長(zhǎng)至兩葉一心,取幼嫩葉片100 mg,放入破碎儀中破碎,利用改良的CTAB法[19]提取西瓜DNA,用分光光度計(jì)測(cè)量提取樣品的DNA濃度,并稀釋至30 ng/μL,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 SRAP擴(kuò)增及電泳檢測(cè) SRAP反應(yīng)采用15 μL體系:2×Master Mix 7.5 μL (試劑購(gòu)自BioTeke公司),30 ng/μL DNA 1 μL,0.4 μmol/L正、反向引物各0.4 μL,雙蒸水5.7 μL,擴(kuò)增程序參考黃春瓊等[20]的方法。選取雄性不育PV-2和雄性可育的西瓜材料MW002對(duì)441對(duì)SRAP引物組合進(jìn)行篩選(表2),利用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),具體操作參考梁寶萍等[21]的方法,篩選擴(kuò)增條帶清晰、穩(wěn)定且多態(tài)性高的引物。
人工讀帶將圖譜上出現(xiàn)條帶的記為“1”,無(wú)條帶的記為“0”,用Excel軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。使用NTSYS-pc 2.1e軟件中的UPGMA方法計(jì)算遺傳相似系數(shù),利用模塊Treeplot對(duì)統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析;用PopGen Version 3.2軟件計(jì)算不同類型小果型西瓜材料的遺傳變異指數(shù),包括觀測(cè)等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei’s基因多樣性指數(shù)(H)、Shannon’s信息指數(shù)(I)、遺傳距離和遺傳一致度,利用Cophenetic相關(guān)性方法對(duì)相似系數(shù)矩陣和聚類分析結(jié)果的吻合度進(jìn)行檢驗(yàn)。
表2 引物核苷酸序列
利用篩選出的20對(duì)清晰穩(wěn)定且多態(tài)性較高的引物,對(duì)45份小果型西瓜進(jìn)行SRAP標(biāo)記,共獲得265條多態(tài)性條帶,平均每對(duì)引物組合可擴(kuò)增到17.4條,其中多態(tài)性條帶13.25條,多態(tài)性比率為76.1%(表3)。me20-em5組合多態(tài)性條帶最多,為28條(圖1),me12-em13、me12-em14和me21-em13引物組合擴(kuò)增多態(tài)率可達(dá)85%以上,me20-em20多態(tài)率最低,為52.2%。
雄性不育和雄性可育小果型西瓜的Na參數(shù)分別為1.5460、1.7241,總體值為1.7557;Ne參數(shù)分別為1.2464、1.2887,總體值為1.3053;H參數(shù)分別為0.1562、0.1836,總體值為0.1954;I參數(shù)分別為0.2451、0.2918,總體值為0.3106(表4)。以上結(jié)果表明,供試45份小果型西瓜的遺傳多樣性較為豐富,雄性可育小果型西瓜遺傳多樣性指數(shù)均高于雄性不育型,說(shuō)明雄性可育小果型西瓜的遺傳變異較雄性不育型豐富。雄性不育和雄性可育小果型西瓜種質(zhì)的遺傳一致度為0.9348,遺傳距離為0.0674
表3 SRAP擴(kuò)增引物及擴(kuò)增多態(tài)率
表4 不同類型西瓜品種(系)遺傳多樣性指數(shù)
(表5),表明兩種類型小果型西瓜種質(zhì)的親緣關(guān)系較近。雄性不育類型中,來(lái)自美國(guó)和河南的遺傳差異最大,遺傳一致度為0.7635,遺傳距離為0.2699,來(lái)自新疆和海南的遺傳差異最小,遺傳一致度為0.9608,遺傳距離為0.0400;雄性可育類型中,來(lái)自日本和河南的遺傳差異最大,遺傳一致度為0.7267,遺傳距離為0.3192,來(lái)自山東和河南的遺傳差異最小,遺傳一致度為0.9575,遺傳距離為0.0435(表6)。
利用NTSYS軟件分析45份小果型西瓜種質(zhì)的親緣關(guān)系,得出供試小果型西瓜的遺傳相似系數(shù)值為0.57~0.94(表7)。來(lái)自新疆的雄性不育小果型西瓜‘GMS3’和雄性可育小果型西瓜‘M6’的遺傳相似系數(shù)最小,為0.57,表明這兩份種質(zhì)間的親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。來(lái)自河南的雄性可育小果型西瓜中的‘斯維特2號(hào)’和‘禮品5’的遺傳相似系數(shù)最大,為0.94,表明這兩份種質(zhì)間的親緣關(guān)系最近。雄性不育類型中來(lái)自新疆的‘GMS3’和美國(guó)的‘PV-1’之間的遺傳相似系數(shù)最小(0.68);雄性可育類型中來(lái)自陜西的‘MW008’和海南的‘X3’、山東的‘A20-3’之間的以及來(lái)自新疆的‘M6’和‘MW006’、河南的‘禮品5’之間的遺傳相似系數(shù)最小(0.64),說(shuō)明這5組的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
表5 不同類型西瓜品種(系)遺傳一致度和遺傳距離
表6 不同地區(qū)西瓜品種(系) 遺傳一致度和遺傳距離
續(xù)表6 Continued table 6
表7 45個(gè)西瓜種質(zhì)相似系數(shù)
利用NTSYS軟件對(duì)20對(duì)SRAP引物檢測(cè)到的348個(gè)多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行分析,通過(guò)UPGMA方法進(jìn)行聚類,以遺傳系數(shù)0.73為界,可將45份小果型西瓜種質(zhì)分為4個(gè)類群(圖2),雄性不育小果型西瓜均集中在第Ⅰ類群,雄性可育小果型西瓜分布在第Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ類群。第Ⅰ類群包含9個(gè)品種,均為雄性不育類型;第Ⅱ類群包含7個(gè)品種,第Ⅲ類群包含26個(gè)品種,第Ⅳ大類包含3個(gè)品種,均為雄性可育類型。
Cophentic關(guān)聯(lián)性能夠衡量遺傳相似系數(shù)和UPGMA聚類結(jié)果之間的相關(guān)程度。通過(guò)Cophentic相關(guān)性檢驗(yàn)得出兩個(gè)矩陣間的相關(guān)系數(shù)為0.75,表明遺傳相似系數(shù)矩陣與UPGMA聚類結(jié)果矩陣之間有密切的相關(guān)性。
SRAP分子標(biāo)記多態(tài)性高、操作簡(jiǎn)單、能夠反映品種間的遺傳差異,是分析植物親緣關(guān)系和遺傳多樣性最常用的標(biāo)記之一[22]。本研究利用篩選出的20對(duì)穩(wěn)定且多態(tài)性較高的SRAP引物,對(duì)45份小果型西瓜進(jìn)行標(biāo)記,獲得348個(gè)條帶,其中多態(tài)性條帶265條,多態(tài)性比率為76.1%,多態(tài)率較高。本研究結(jié)果高于徐曉婷等[23]對(duì)95個(gè)F6重組自交系小果型西瓜的SRAP標(biāo)記(21.8%) 和Wang等[24]對(duì)61份中國(guó)西瓜種質(zhì)資源的SRAP分析(52.24%),這可能與選擇群體有關(guān);但是低于Solmaz等[25]對(duì)93份土耳其西瓜的標(biāo)記結(jié)果(97.3%),可能是由研究對(duì)象的數(shù)量和種類不同導(dǎo)致。綜上表明,SRAP能夠有效地分析基因型狹窄的種質(zhì)資源。
雄性不育型供試小果型西瓜的多樣性參數(shù)Na、Ne、H、I值(1.5460、1.2464、0.1562、0.2451)均比雄性可育型的參數(shù)值(1.7241、1.2887、0.1836、0.2918)低,表明雄性可育型小果型西瓜的遺傳多樣性比雄性不育型的豐富。群體的樣本量不同,對(duì)遺傳多樣性的分析結(jié)果也有一定影響。群體內(nèi)的SRAP遺傳多樣性指數(shù)總值(1.7557、1.3053、0.1954、0.3106)高于高寧寧等[26]對(duì)51份不同抗性西瓜的標(biāo)記總值(1.6766、1.3033、0.1878、0.2931),但低于尚曉星等[27]對(duì)玫瑰香系葡萄種質(zhì)資源的SRAP分析多樣性指數(shù)(1.7914、1.3791、0.2269、0.3488)和郭祿芹等[28]對(duì)167份西瓜的SSR遺傳多樣性標(biāo)記指數(shù)(4.86、2.20、0.27、0.94),可能由研究者利用的分子標(biāo)記種類以及作物種類不同等因素所致。雄性不育和可育兩個(gè)群體間的遺傳距離為0.0674,表明兩群體間的遺傳差異較小。但筆者仍然能夠明顯發(fā)現(xiàn)不同地區(qū)群體間有一定的差異,雄性不育類型中,來(lái)自美國(guó)和河南的遺傳差異最大,遺傳距離為0.2699;雄性可育類型中,來(lái)自日本和河南的遺傳差異最大,遺傳距離為0.3192,說(shuō)明國(guó)外引進(jìn)的品種與國(guó)內(nèi)品種差異較大。另外,來(lái)自新疆的雄性不育小果型西瓜‘GMS3’和雄性可育型‘M6’兩者的遺傳相似系數(shù)較小(0.57),遺傳差異最大。可見(jiàn),SRAP分子標(biāo)記能夠展現(xiàn)供試材料的遺傳多樣性和親緣關(guān)系。
本研究使用UPGMA聚類方法將 45份小果型西瓜種質(zhì)劃分為4大類,9份雄性不育小果型西瓜均集中在第Ⅰ大類,36份雄性可育小果型西瓜分布在第Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ大類,分類結(jié)果與遺傳多樣性遺傳參數(shù)結(jié)果一致,表明雄性可育小果型西瓜遺傳多樣性更豐富一些。通過(guò)Cophentic相關(guān)性檢驗(yàn)得出遺傳相似系數(shù)矩陣與UPGMA聚類結(jié)果矩陣間的相關(guān)系數(shù)為0.75,表明兩個(gè)矩陣之間的關(guān)聯(lián)性強(qiáng),SRAP標(biāo)記分析得出的結(jié)果可信度較高。
豐富的種質(zhì)材料是新品種選育的基礎(chǔ),明確了種質(zhì)的遺傳背景和群體結(jié)構(gòu),才能有效而充分地利用[29]。該研究表明,利用SRAP分子標(biāo)記技術(shù)研究小果型西瓜種間的親緣關(guān)系和遺傳差異是準(zhǔn)確可靠的,對(duì)小果型西瓜特殊種質(zhì)的利用、雜交親本的合理選擇具有很好的參考價(jià)值。今后還需要進(jìn)一步增加新種質(zhì)以豐富雜交后代的變異程度。
利用篩選出的20對(duì)SRAP引物能夠準(zhǔn)確地展現(xiàn)45份供試小果型西瓜種質(zhì)間的親緣關(guān)系和遺傳多樣性,為小果型西瓜種質(zhì)的合理利用和雜交親本的有效選擇提供了理論基礎(chǔ)。供試小果型西瓜種質(zhì)之間總體遺傳差異較小,雄性可育比雄性不育小果型西瓜的遺傳多樣性豐富,引進(jìn)的國(guó)外品種與國(guó)內(nèi)品種差異較大。因此,需要轉(zhuǎn)育融入更多新基因,從而提高小果型西瓜的遺傳多樣性,拓寬遺傳背景。