呂文,張正陽(yáng),李萍,杜欣軍*,王碩
(1.食品營(yíng)養(yǎng)與安全國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津科技大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,天津 300457;2.天津市食品科學(xué)與健康重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南開大學(xué)醫(yī)學(xué)院,天津 300071)
阪崎克羅諾桿菌是一種兼性厭氧革蘭氏陰性細(xì)菌,不產(chǎn)生孢子,但具有形成生物膜的能力,可以在人類和動(dòng)物的腸道中存活[1]。該菌是一種食源性病原體,通常檢出于嬰兒配方奶粉中。該致病菌可以引起嬰幼兒菌血癥、腦膜炎和壞死性小腸結(jié)腸炎等,死亡率較高[2]。此外,該細(xì)菌還會(huì)感染免疫功能減弱的老年人和成年人,并導(dǎo)致肺炎、結(jié)膜炎、傷口感染和尿路感染等[3-4]。這種細(xì)菌對(duì)各類極端外部環(huán)境表現(xiàn)出不同的抵抗力,例如耐酸性[5]、耐藥性[6]和耐壓力性[7]。與其他細(xì)菌相比,耐干燥性是阪崎克羅諾桿菌最突出的環(huán)境抵抗能力,這也是導(dǎo)致食品污染、引起嬰幼兒感染的重要原因[8-10]。因此,研究阪崎克羅諾桿菌的耐干燥機(jī)制具有重要意義,能夠?yàn)榉乐卧摬≡峁┲匾膮⒖肌?/p>
目前的研究表明,生物膜、海藻糖和細(xì)胞中的相容物質(zhì)有利于阪崎克羅諾桿菌對(duì)抗周圍環(huán)境中的不利因素。生物膜不僅有助于細(xì)菌附著在一些物體的表面,還能增強(qiáng)微生物在各種環(huán)境中的抵抗力[11]。生物膜的產(chǎn)生可以增強(qiáng)細(xì)菌在低水活度環(huán)境中的生存能力,同時(shí)增強(qiáng)細(xì)胞對(duì)外界環(huán)境壓力的抵抗能力[12]。在低水分條件下,阪崎克羅諾桿菌可以產(chǎn)生大量的海藻糖。海藻糖可穩(wěn)定磷脂膜和蛋白質(zhì)之間的結(jié)構(gòu),以抵抗有害的外部干燥環(huán)境[13]。此外,細(xì)胞中相容物質(zhì)的攝取和合成,如脯氨酸、甜菜堿、甘氨酸、膽堿也可以在滲透調(diào)節(jié)過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用,從而保護(hù)菌株細(xì)胞免受干燥環(huán)境造成的損害[14]。雖然目前對(duì)于阪崎克羅諾桿菌耐干燥機(jī)制已經(jīng)開展了一些研究,但并未發(fā)現(xiàn)屬于該菌的獨(dú)特機(jī)制,因此,很難解釋阪崎克羅諾桿菌突出的干燥抵抗能力。需要進(jìn)一步研究該致病菌突出耐干燥能力的潛在機(jī)制。
前期對(duì)一株耐干燥能力較強(qiáng)的阪崎克羅諾桿菌進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,從蛋白表達(dá)水平分析了菌株在干燥刺激前后蛋白表達(dá)的差異[15]。其中,ESA-00281基因編碼的假設(shè)蛋白表現(xiàn)出明顯的表達(dá)差異。對(duì)比分析顯示,它與鼠傷寒沙門氏菌中對(duì)應(yīng)的同系物STM3155相似度為51.88%,STM3155由于在半固體培養(yǎng)基中表達(dá)情況類似于其他的運(yùn)動(dòng)相關(guān)基因,因此,被描述為運(yùn)動(dòng)基因[16]。Hartmann等[11]通過(guò)轉(zhuǎn)座子突變構(gòu)建阪崎克羅諾桿菌ESA-00281突變體發(fā)現(xiàn),該基因?qū)ι锬そY(jié)構(gòu)有強(qiáng)烈影響,且有助于與Caco-2腸上皮細(xì)胞的黏附。但該基因?qū)嫫榭肆_諾桿菌脫水耐受性的影響及其作用機(jī)制尚需進(jìn)一步研究。
本研究構(gòu)建阪崎克羅諾桿菌ATCC BAA-894的ESA-00281基因敲除菌株和回補(bǔ)菌株,基于對(duì)野生株、突變株及回補(bǔ)株的耐干燥能力、表面疏水性、膜透過(guò)性以及運(yùn)動(dòng)性、生物膜形成能力進(jìn)行比較分析,探究ESA-00281基因在阪崎克羅諾桿菌耐干燥過(guò)程中的可能作用機(jī)制,可為阪崎克羅諾桿菌的防控提供參考。
阪崎克羅諾桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC BAA-894:美國(guó)菌種保藏中心。S17lambda pir菌株、DH5α菌株、pCVD442質(zhì)粒等為食品營(yíng)養(yǎng)與安全國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存。
限制性內(nèi)切酶BamHI、SalI:美國(guó)NEB公司;DNA提取試劑盒:天根生化科技有限公司;肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(lauria broth,LB):美國(guó)BD公司;平板計(jì)數(shù)瓊脂培養(yǎng)基:國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;RPMI-1640培養(yǎng)液:賽默飛世爾科技(中國(guó))有限公司;質(zhì)粒小提試劑盒:美國(guó)OMEGA公司;無(wú)縫克隆和組裝試劑盒:中國(guó)諾唯贊生物科技有限公司;甲醛(分析純):上海生工生物有限公司;結(jié)晶紫、1-N-苯基萘胺(分析純)、二甲苯(分析純):天津泰進(jìn)科技有限公司。
DYY-6C型電泳儀、WD-9405B型水平搖床:北京市六一儀器廠;德國(guó)Eppendorf公司;UV-Vis紫外可見分光光度計(jì):上海光譜儀器有限公司;HCJ-4C型磁力攪拌水浴鍋:蘇州東鵬儀器制造有限公司;5424C-150339型臺(tái)式離心機(jī):艾本德中國(guó)有限公司;LBI-250型生化培養(yǎng)箱:上海龍躍儀器設(shè)備有限公司;OHG-914385型電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱:上海新苗醫(yī)療器械制造有限公司;Sunrise Basic酶標(biāo)儀:奧地利Tecan公司。
1.3.1 引物設(shè)計(jì)
參考美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)阪崎克羅諾桿菌ATCC BAA-894基因序列設(shè)計(jì)引物(Genbank序列號(hào):NC_009778.1),引物序列見表1,引物位置見圖1。
圖1 引物位置示意圖Fig.1 Locations of primers
表1 試驗(yàn)引物Table 1 Primers for test
1.3.2 ESA-00281基因缺失突變體的構(gòu)建
在阪崎克羅諾桿菌ATCC BAA-894中,使用pCVD442自殺載體介導(dǎo)的同源重組實(shí)現(xiàn)ESA-00281基因的敲除[17]。使用引物pCVD442F和pCVD442R(表1)對(duì)pCVD442進(jìn)行線性化。使用兩對(duì)引物ESA-00281UF/ESA-00281UR和ESA-00281DF/ESA-00281 DR(表1)從阪崎克羅諾桿菌ATCC BAA-894的DNA中擴(kuò)增ESA-00281的上下同源臂。使用商用無(wú)縫克隆和組裝試劑盒將上游和下游片段克隆到pCVD442自殺載體中,生成目標(biāo)載體pCVD442-Q-H。將目標(biāo)載體轉(zhuǎn)化到大腸桿菌S17 lambda pir,然后通過(guò)電轉(zhuǎn)化構(gòu)建缺失突變體ΔESA-00281。
1.3.3 回補(bǔ)菌株的構(gòu)建
使用含有限制性內(nèi)切酶位點(diǎn)的cpESA-00281F/cpESA-00281R引物(表1)從阪崎克羅諾桿菌ATCC BAA-894的基因組DNA中擴(kuò)增ESA-00281基因。將產(chǎn)物克隆到pACYC184,轉(zhuǎn)移到突變體中獲得回補(bǔ)菌株cpESA-00281。對(duì)重組質(zhì)粒和回補(bǔ)菌株中ESA-00281編碼區(qū)的核苷酸序列進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證。
1.3.4 生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
取活化后的菌液按照1∶100(體積比)接種于LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)14 h。從轉(zhuǎn)接開始,每隔1 h取樣,測(cè)定OD600。用LB液體培養(yǎng)基作為空白對(duì)照。測(cè)定菌液OD600直至平臺(tái)期,最后繪制出生長(zhǎng)曲線。比較阪崎克羅諾桿菌ATCC BAA-894野生型菌株、ΔESA-00281突變株和回補(bǔ)株生長(zhǎng)曲線的差異。每個(gè)樣本作3個(gè)平行。
1.3.5 耐干燥性評(píng)估
將菌株活化,以1∶100(體積比)將10μL培養(yǎng)12h~14 h的菌液接種于1 mL LB液體培養(yǎng)基培養(yǎng)到對(duì)數(shù)期(OD600值為0.6~0.8),平板計(jì)數(shù)瓊脂培養(yǎng)基培養(yǎng)12 h~14 h后進(jìn)行平板計(jì)數(shù),得到干燥前的菌落總數(shù)。將對(duì)數(shù)期的菌液加入96孔板并置于滅菌的干燥器中(內(nèi)有500 g脫水硅膠),封口膜密封,每個(gè)干燥器內(nèi)放置1個(gè)96孔細(xì)胞培養(yǎng)板,置于溫度為37℃、濕度為45%的恒溫培養(yǎng)箱恒溫恒濕培養(yǎng)6 d后取出96孔板,在每個(gè)孔中加入200 μL/孔的磷酸鹽緩沖溶液,梯度稀釋后平板計(jì)數(shù)瓊脂培養(yǎng)基培養(yǎng)12 h~14 h后進(jìn)行平板計(jì)數(shù),得到干燥后的菌落總數(shù)。以上步驟重復(fù)3次,計(jì)算死亡率。死亡率越高,耐干燥能力越弱。
1.3.6 表面疏水性評(píng)估
將菌株接種于LB液體培養(yǎng)基中,置于搖床中振蕩培養(yǎng)(37℃、200 r/min)12 h~14 h。5 000 r/min離心5 min后收集菌體,用磷酸鹽緩沖溶液沖洗3次后,將OD600調(diào)至0.5,將2 mL細(xì)菌懸浮液與400 μL二甲苯混合液在室溫(25±1)℃下培養(yǎng)2 h,取出水相物質(zhì)測(cè)定OD600值,記為H。細(xì)菌表面疏水性指數(shù)(H/%)計(jì)算公式為H/%=(0.5-H)/0.5 ×100[18]。
1.3.7 生物膜形成能力評(píng)估
將菌株接種于10 mL LB液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)至細(xì)胞密度達(dá)到107CFU/mL,各取100 μL菌液加入96孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,以無(wú)菌的LB培養(yǎng)基為空白對(duì)照,置于37℃恒溫培養(yǎng)箱靜置培養(yǎng)48 h。48 h后取出96孔板,將懸浮的菌液吸出,待平板完全干透后于孔中加入200 μL 99%甲醇將生物膜固定15 min,吸出上清液,將平板晾干。隨后,向孔中加入200 μL 0.1%結(jié)晶紫(crystal violet,CV)溶液。30 min后取出多余的 CV,用生理鹽水清洗3次,將結(jié)晶紫溶液洗凈。最后,加入200 μL 95%乙醇釋放結(jié)合的CV。使用Sunrise Basic酶標(biāo)儀在570 nm處測(cè)量吸光度。
1.3.8 運(yùn)動(dòng)能力評(píng)估
運(yùn)動(dòng)性分析參考文獻(xiàn)[19]稍加修改。將菌株接種于LB液體培養(yǎng)基中,置于搖床中振蕩培養(yǎng)(37℃、200 r/min)12 h~14 h。吸取 5 μL 菌液滴于軟瓊脂平板(含0.3%瓊脂的LB瓊脂培養(yǎng)基)中央,待無(wú)菌風(fēng)吹干后封口膜密封于30℃恒溫培養(yǎng)箱倒置培養(yǎng)12 h~14 h,觀察菌落大小。
1.3.9 膜透過(guò)性評(píng)估
將菌株接種于LB液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)(37℃、200 r/min)12 h~14 h。12 000 r/min離心 1 min獲得菌體沉淀,用磷酸緩沖鹽溶液洗滌3次后,利用磷酸緩沖鹽溶液將菌體復(fù)溶至OD600值為0.5。取1.92 mL細(xì)胞懸液和80 μL熒光探針1-N-苯基萘胺混合,設(shè)置熒光分光光度計(jì)的寬度、激發(fā)波長(zhǎng)和發(fā)射波長(zhǎng)分別設(shè)置為5、350 nm和420 nm,在此條件下監(jiān)測(cè)混合物的熒光強(qiáng)度[20]。
使用Origin8.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。每個(gè)試驗(yàn)獨(dú)立重復(fù)3次,以確保重復(fù)性。所有結(jié)果均采用鄧肯多區(qū)間檢驗(yàn)和方差分析(ANOVA)進(jìn)行分析,以分析組間的差異。
構(gòu)建ESA-00281基因敲除突變體ΔESA-00281及相應(yīng)的回補(bǔ)菌株cpESA-00281。突變株和回補(bǔ)株的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)驗(yàn)證結(jié)果見圖2。
圖2 突變株和回補(bǔ)株的PCR驗(yàn)證Fig.2 PCR validation of the mutant and complementary strains
利用ESA-00281F/R和YZESA-00281F/R引物對(duì)突變株進(jìn)行驗(yàn)證,利用ESA-00281F/R對(duì)回補(bǔ)株進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果顯示,ESA-00281F/R引物對(duì)在野生株、突變株和回補(bǔ)株中擴(kuò)增片段大小為367 bp、無(wú)擴(kuò)增、367 bp,YZESA-00281F/R引物對(duì)在野生株和突變株中擴(kuò)增片段大小分別為979、577 bp,證明敲除株和回補(bǔ)株均構(gòu)建成功。
2.2.1 阪崎克羅諾桿菌野生株、突變株及回補(bǔ)株生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
Research on coupled heating system of air source heat pump and gas boiler
用紫外可見分光光度計(jì)測(cè)定生長(zhǎng)曲線,結(jié)果見圖3。
圖3 阪崎克羅諾桿菌野生株、突變株及回補(bǔ)株的生長(zhǎng)曲線Fig.3 Growth curves of wild,mutant and complementary strains of C.sakazakii
由圖3可知,與野生株相比,ΔESA-00281突變體及cpESA-00281回補(bǔ)株表現(xiàn)出類似的生長(zhǎng)速度,回補(bǔ)株相對(duì)于其他兩株菌先進(jìn)入對(duì)數(shù)期,但三者均符合細(xì)菌正常生長(zhǎng)的規(guī)律,OD600均于10 h左右開始保持穩(wěn)定。結(jié)果表明,生長(zhǎng)性能并不受基因缺失的影響,排除了不同生長(zhǎng)規(guī)律對(duì)后續(xù)試驗(yàn)結(jié)果的影響。
2.2.2 阪崎克羅諾桿菌野生株、ΔESA-00281突變株及回補(bǔ)株耐干燥性評(píng)估
對(duì)阪崎克羅諾桿菌野生株、突變株及回補(bǔ)株6 d干燥脅迫下的死亡率進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果見圖4。
圖4 阪崎克羅諾桿菌野生株、突變株及回補(bǔ)株的干燥死亡率Fig.4 Desiccation-induced mortality rates of wild,mutant and complementary strains of C.sakazakii
由圖4可知,野生株、突變株、回補(bǔ)株的干燥死亡率分別為56.02%、64.78%、57.84%。干燥刺激后,相對(duì)于野生株 WT,ΔESA-00281突變株的死亡率有所升高,回補(bǔ)株的死亡率則與野生株大致相同,表明ESA-00281基因的缺失降低了阪崎克羅諾桿菌的干燥耐受能力,ESA-00281在阪崎克羅諾桿菌抵御干燥環(huán)境過(guò)程中起到正向作用。
2.2.3 表面疏水性分析
對(duì)野生株、ΔESA-00281突變株及其回補(bǔ)株的表面疏水性進(jìn)行了比較分析,結(jié)果見圖5。
圖5 阪崎克羅諾桿菌野生株、突變株及回補(bǔ)株細(xì)胞表面疏水性Fig.5 Cell surface hydrophobicity of wild,mutant and complementary strains of C.sakazakii
2.2.4 生物膜形成能力分析
采用結(jié)晶紫染色研究ESA-00281基因?qū)嫫榭肆_諾桿菌ATCC BAA-894生物膜形成的影響,結(jié)果見圖6。
圖6 阪崎克羅諾桿菌野生株、突變株及回補(bǔ)株的生物膜形成能力比較Fig.6 Biofilm formation capacity of wild,mutant and complementary strains of C.sakazakii
由圖6可知,與野生型相比,ΔESA-00281突變株的生物膜量明顯減少,回補(bǔ)株的生物膜形成能力與野生株相似。結(jié)果表明,ESA-00281基因在生物膜形成方面發(fā)揮正向作用。
2.2.5 運(yùn)動(dòng)能力分析
阪崎克羅諾桿菌在半固體培養(yǎng)基培養(yǎng)可以形成明顯的運(yùn)動(dòng)環(huán)。野生株(WT)、ΔESA-00281突變株和cpESA-00281回補(bǔ)株的菌株運(yùn)動(dòng)性結(jié)果見圖7。
圖7 阪崎克羅諾桿菌野生株、突變株及回補(bǔ)株的運(yùn)動(dòng)性鑒定Fig.7 Mobility identification of wild,mutant and complementary strains of C.sakazakii
由圖7可知,與野生株相比,ΔESA-00281突變株的運(yùn)動(dòng)環(huán)直徑無(wú)明顯變化,表明ESA-00281對(duì)阪崎克羅諾桿菌的運(yùn)動(dòng)性無(wú)關(guān)。
2.2.6 膜透過(guò)性測(cè)定結(jié)果
對(duì)阪崎克羅諾桿菌野生株、ΔESA-00281突變株及回補(bǔ)株細(xì)胞的外膜通透性進(jìn)行測(cè)定,結(jié)果見圖8。
圖8 阪崎克羅諾桿菌野生株、突變株及回補(bǔ)株細(xì)胞膜通透性測(cè)定Fig.8 Membrane permeability of wild,mutant and complementary strains of C.sakazakii
由圖8可知,與野生株相比,ΔESA-00281突變株的膜通透性無(wú)明顯變化,說(shuō)明ESA-00281基因的缺失并不會(huì)影響其外膜通透性。
以上試驗(yàn)說(shuō)明,ESA-00281基因?qū)w生長(zhǎng)、運(yùn)動(dòng)性以及細(xì)胞膜通透性無(wú)明顯影響,可通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞表面疏水性及生物膜的形成能力等機(jī)制以抵抗外界環(huán)境的壓力并確保生命活動(dòng)的正常進(jìn)行,從而應(yīng)對(duì)干燥脅迫,調(diào)節(jié)菌株的耐干燥性能。在面對(duì)外界復(fù)雜的生存環(huán)境時(shí),最先感知到外界變化并作出響應(yīng)的往往是細(xì)菌細(xì)胞的表面,細(xì)菌細(xì)胞的表面具有許多生物活性物質(zhì),它們體現(xiàn)了細(xì)菌生命活動(dòng)的情況,其變化會(huì)影響細(xì)胞的表面疏水性。在液體環(huán)境中,細(xì)胞表面的疏水作用使細(xì)胞表面具有一定的黏附能力[21],從而增強(qiáng)其生存能力。文獻(xiàn)[11]表明,該基因?qū)aco-2細(xì)胞的黏附有一定的影響。因此,ESA-00281基因缺失導(dǎo)致的表面疏水性降低可能是該突變株耐干燥能力下降的原因之一。細(xì)菌細(xì)胞形成菌膜能有效提高對(duì)外界環(huán)境的耐受性[22]。一般認(rèn)為,細(xì)菌可以通過(guò)形成生物膜以增加對(duì)干燥環(huán)境的抵抗力[23]。很多報(bào)道已經(jīng)顯示,菌膜形成對(duì)沙門氏菌[24]、單核細(xì)胞增生李斯特菌[25]和大腸桿菌抵抗干燥環(huán)境具有重要作用[26]。本結(jié)果表明,ESA-00281可能通過(guò)促進(jìn)生物膜的形成進(jìn)而增強(qiáng)耐干燥能力。
本文利用基因敲除技術(shù)構(gòu)建了ΔESA-00281突變株,并以此研究阪崎克羅諾桿菌ATCC BAA-894中該基因的功能。對(duì)阪崎克羅諾桿菌ATCC BAA-894野生株及ΔESA-00281突變株的耐干燥性比較結(jié)果顯示,ESA-00281基因缺失后菌株在干燥脅迫下的死亡率有所升高,表明該基因在阪崎克羅諾桿菌耐干燥中發(fā)揮正向作用。此外,對(duì)阪崎克羅諾桿菌ATCC BAA-894野生株及ΔESA-00281突變株的生理活性進(jìn)行比較分析,結(jié)果顯示,ESA-00281對(duì)于阪崎克羅諾桿菌的生物膜形成及表面疏水性發(fā)揮正向調(diào)節(jié)作用,表明該基因可能通過(guò)改變表面疏水性來(lái)調(diào)節(jié)生物膜的形成和對(duì)介質(zhì)的黏附,從而正向調(diào)節(jié)菌株的耐干燥能力。