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菜籽多肽結(jié)構(gòu)鑒定及其包封β-胡蘿卜素的機(jī)制

2022-09-07 10:38羅發(fā)莉藍(lán)妙傳付余馬良戴宏杰馮鑫張宇昊
食品與發(fā)酵工業(yè) 2022年16期
關(guān)鍵詞:負(fù)載量菜籽多肽

羅發(fā)莉,藍(lán)妙傳,付余,馬良,2,戴宏杰,馮鑫,張宇昊,2*

1(西南大學(xué) 食品科學(xué)學(xué)院,重慶,400715)2(西南大學(xué) 前沿交叉學(xué)科研究院,生物學(xué)研究中心,重慶,400715)

β-胡蘿卜素是最重要的類胡蘿卜素之一,具有抗氧化、抗腫瘤和增強(qiáng)免疫力等生物活性。然而,由于β-胡蘿卜素水溶性差、生物利用率較低以及對(duì)氧氣、光和溫度極其敏感而發(fā)生降解等缺點(diǎn),在食品、醫(yī)藥和化妝品等領(lǐng)域的應(yīng)用受到了限制[1]。近年研究表明,食品蛋白質(zhì)來(lái)源的多肽具有兩親性、生物相容性、生物降解性、生物活性和環(huán)境友好性等優(yōu)勢(shì),現(xiàn)已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于對(duì)生物活性物質(zhì)的包封[2]。JIAO等[3]以玉米醇溶蛋白肽作載體對(duì)水溶性差、不穩(wěn)定和生物利用度低的葉黃素進(jìn)行包封,結(jié)果表明多肽可有效提高葉黃素的溶解度、穩(wěn)定性和生物利用度。DU等[4]通過(guò)酶促水解α-乳清蛋白制備了α-乳清蛋白膠束,將其用于β-胡蘿卜素的自組裝包封,結(jié)果表明與游離的β-胡蘿卜素相比,經(jīng)α-乳清蛋白膠束包封的β-胡蘿卜素在60 ℃加熱或紫外光照射下的水溶性和穩(wěn)定性顯著提高。JIAO等[5]研究發(fā)現(xiàn),聚-L-賴氨酸修飾的納米脂質(zhì)體可用于葉黃素的新型遞送系統(tǒng),與未被聚-L-賴氨酸修飾的納米脂質(zhì)體遞送葉黃素相比,聚-L-賴氨酸可以保護(hù)納米脂質(zhì)體中的葉黃素不被降解,并促進(jìn)胃腸液條件下納米脂質(zhì)體中葉黃素的釋放進(jìn)而提高其生物利用度。綜上,多肽可作為疏水性生物活性物質(zhì)的載體,具有提高其穩(wěn)定性、水溶性和生物利用度的潛力。然而,當(dāng)前研究側(cè)重于多肽包封生物活性物質(zhì)的理化性質(zhì)[粒徑、多分散指數(shù)、zeta電位、包封率(encapsulation efficiency,EE)、負(fù)載量(loading amount,LA)和體外穩(wěn)定等],并沒(méi)有從分子水平上闡明兩者的相互作用機(jī)制。因此,研究多肽包封生物活性物質(zhì)的相互作用機(jī)制具有十分重要的意義。

本課題組先前發(fā)現(xiàn)以菜籽粕為原料,經(jīng)酶解得到的菜籽多肽(rapeseed peptides,RPs)可自組裝包封疏水性生物活性物質(zhì)β-胡蘿卜素,以不同水解時(shí)間、包封時(shí)間以及β-胡蘿卜素與菜籽多肽質(zhì)量比為自組裝包封β-胡蘿卜素的影響因素進(jìn)行條件優(yōu)化后,測(cè)得包封率為80.03%,負(fù)載量為0.48 mg/mg[6]。此外,菜籽多肽經(jīng)超濾(1~3 kDa)和乙腈先后處理,將其用于β-胡蘿卜素的包封,包封率顯著提高到95.79%,負(fù)載量提高到0.57 mg/mg。由此說(shuō)明,菜籽多肽的分子質(zhì)量和極性差異會(huì)影響與β-胡蘿卜素相互作用的位點(diǎn)進(jìn)而導(dǎo)致包封出現(xiàn)差異[7]。因此,為進(jìn)一步探究菜籽多肽與β-胡蘿卜素的相互作用機(jī)制,本研究以經(jīng)超濾(1~3 kDa)和乙腈先后處理的菜籽多肽為研究對(duì)象,首先利用液質(zhì)聯(lián)用對(duì)菜籽多肽的氨基酸序列進(jìn)行鑒定,然后,以多肽的分子質(zhì)量、親疏水性和氨基酸組成等影響包封效果的因素為依據(jù),篩選多肽進(jìn)行分子對(duì)接研究。最后,基于分子對(duì)接結(jié)果和親疏水氨基酸組成,從中篩選多肽固相合成后驗(yàn)證包封實(shí)驗(yàn)。本研究為闡明菜籽多肽包封β-胡蘿卜素相互作用機(jī)制提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

菜籽粕(蛋白質(zhì)含量41.20%),西南大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物科技學(xué)院;β-胡蘿卜素(純度98%),北京索萊寶生物科技有限公司;堿性蛋白酶Alcalase 2.4 L,諾維信公司;多肽,生工生物工程(上海)股份有限公司;乙腈、甲酸(均為色譜純),成都科隆化學(xué)品有限公司;氫氧化鈉、正己烷,成都科隆化學(xué)品有限公司試劑廠;其余試劑均為分析純。

1.2 儀器與設(shè)備

Easy-nLC 1200液相色譜儀、Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀和Heraeus Multifuge X3R,美國(guó)賽默飛世爾科技公司;BNGM2097有機(jī)膜分離實(shí)驗(yàn)機(jī),濟(jì)南博納生物技術(shù)有限公司;JA3003B電子天平,上海精天電子儀器有限公司;CJ-78-1磁力攪拌器,上海將任實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司;HH-4數(shù)顯恒溫?cái)嚢杷″仯虾P轮Z儀器設(shè)備有限公司;PE20實(shí)驗(yàn)室pH計(jì),上海梅特勒-托利多儀器有限公司。

1.3 實(shí)驗(yàn)方法

1.3.1 菜籽多肽的制備

將菜籽粕粉均勻分散在純水中,料液比為1∶25(g∶mL),酶底物比為1∶100(mL∶g),并在堿性蛋白酶Alcalase 2.4 L的最適條件(溫度55 ℃、pH 8.5)下水解60 min以制備菜籽多肽,使用0.5 mol/L的NaOH溶液維持pH 8.5恒定。水解結(jié)束后,立即置于沸水中15 min滅酶。待冷卻至室溫后離心(5 000 r/min,10 min),取上清液分別通過(guò)1 kDa和3 kDa分子質(zhì)量超濾膜制備分子質(zhì)量為1~3 kDa的多肽溶液,再通過(guò)180 Da納濾膜除鹽以避免多肽液中可能存有的少量鹽類對(duì)色譜柱造成損害。然后在磁力攪拌下加入乙腈溶液(肽溶液與乙腈溶液體積比為1∶3),并在 4 ℃的冰箱中放置使其充分混合后離心(10 000 r/min,10 min),取上清液旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)去除乙腈,收集多肽溶液冷凍干燥后備用。

1.3.2 菜籽多肽的質(zhì)譜測(cè)序與多肽的篩選

菜籽多肽的氨基酸序列通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用鑒定。

液相色譜條件參考FENG等[8]的方法并作適當(dāng)?shù)男薷?。色譜儀:Easy-nLC 1200系統(tǒng);色譜柱:C18(3 μm,100 ?,75 μm×15 cm),流動(dòng)相A為0.1%甲酸溶液,流動(dòng)相B為含甲酸0.1%(體積分?jǐn)?shù))的乙腈水溶液(體積分?jǐn)?shù)80%)。所應(yīng)用的色譜梯度為:0~4 min(95%A,5%B);4~40 min(90%A,10%B);40~47 min(72%A,28%B);47~48 min(62%A,38%B);48~60 min(0%A,100%B)。進(jìn)樣量:5 μL,流速:0.3 mL/min,柱溫:30 ℃。

質(zhì)譜條件參考ZHANG等[9]的方法并作適當(dāng)?shù)男薷?。具體參數(shù)如下:噴霧電壓2.0 kV,毛細(xì)管溫度320 ℃,分辨率設(shè)置為1級(jí)120 000(m/z200),2級(jí)30 000(m/z200),離子掃描范圍m/z350~1 550,MS1自動(dòng)增益控制(AGC)4e5,離子注入時(shí)間50 ms,MS2自動(dòng)增益控制(AGC)1e5,離子注入時(shí)間50 ms,離子篩選窗口1.6m/z,動(dòng)態(tài)排除時(shí)間為60 s(質(zhì)量范圍±1 Da)。

對(duì)于所獲得的液質(zhì)聯(lián)用數(shù)據(jù)使用PEAKS Studio X plus進(jìn)行處理分析,利用菜籽蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)Brassicanapus(Rape)匹配結(jié)果以鑒定肽序列[10]。進(jìn)一步根據(jù)液質(zhì)聯(lián)用所獲得的菜籽多肽鑒定結(jié)果,結(jié)合不同多肽序列的分子質(zhì)量大小、親疏水氨基酸組成、含量來(lái)源等影響多肽自組裝包封的因素。同時(shí)參考ProtParam數(shù)據(jù)庫(kù)(https://web.expasy.org/protparam/)計(jì)算多肽的親水性總平均值(grand average of hydropathicity,GRAVY),負(fù)值越大表示親水性越好,正值越大表示疏水性越強(qiáng),接近0的時(shí)候表明其兩親性較好[11],從中篩選具有良好包封潛力的多肽進(jìn)行分子對(duì)接。

1.3.3 分子對(duì)接

小分子物質(zhì)的準(zhǔn)備:從Pubchem數(shù)據(jù)庫(kù)(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)獲取能量最低、最穩(wěn)定的β-胡蘿卜素結(jié)構(gòu),下載文件格式為.Mol2,以保證后續(xù)分子對(duì)接實(shí)驗(yàn)順利進(jìn)行。

靶標(biāo)多肽結(jié)構(gòu)的準(zhǔn)備:首先利用在線網(wǎng)站(https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/)對(duì)多肽結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),并遵循能量最低最穩(wěn)定的原則選擇多肽結(jié)構(gòu)。再利用SYBYL-X 2.1.1軟件中Surflex-Dock(SFIC)標(biāo)準(zhǔn)模式對(duì)多肽進(jìn)行結(jié)構(gòu)處理,把原配體分子從受體的口袋中分離,除去水分子和其他小分子,并對(duì)其末端進(jìn)行修復(fù),對(duì)多肽加氫原子、加電荷,以配體為中心5?的距離內(nèi)設(shè)定對(duì)接口袋,由此生成靶標(biāo)多肽的對(duì)接文件[12]。

分子對(duì)接:根據(jù)分子對(duì)接的步驟設(shè)定相關(guān)參數(shù),采用一致性打分函數(shù)Concensus Score(C-Score)和總得分函數(shù)Total-Score(T-Score)相結(jié)合的方式來(lái)對(duì)分子對(duì)接結(jié)果進(jìn)行評(píng)價(jià)[13]。C-Score通過(guò)構(gòu)象預(yù)測(cè)函數(shù)、結(jié)合自由能函數(shù)、共同評(píng)價(jià)函數(shù)等多個(gè)方面一起綜合得到的評(píng)價(jià)對(duì)接結(jié)果可靠性進(jìn)行打分的函數(shù),主要根據(jù)D-SCORE、PMF-SCORE、G-SCORE、CHEM-SCORE這4個(gè)值的計(jì)算得到。總得分函數(shù)T-Score是SYBYL-X 2.1.1 軟件自帶的打分函數(shù),主要由Crash(碰撞打分,越趨近于0越好)和Polar(極性打分,分值越小越好)組成?;谝陨显u(píng)判標(biāo)準(zhǔn)篩選出最佳結(jié)合構(gòu)象,對(duì)獲得的最佳結(jié)合構(gòu)象初步探討肽段與β-胡蘿卜素相互作用情況;進(jìn)一步利用LigPlus軟件對(duì)最佳結(jié)合構(gòu)象的相互作用力可視化,研究分析菜籽多肽與β-胡蘿卜素相互作用機(jī)制。根據(jù)分子對(duì)接結(jié)果和親疏水氨基酸組成選取多肽固相合成用于包封實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

1.3.4 包封率及負(fù)載量的測(cè)定

參考LIU等[14]的方法稍作修改,對(duì)包封率和負(fù)載量進(jìn)行測(cè)定。將合成多肽配制成5 mg/mL的溶液,調(diào)節(jié)pH為7,以多肽與β-胡蘿卜素質(zhì)量比為3∶5加入β-胡蘿卜素粉末并在25 ℃下連續(xù)攪拌3 h后即得到包封溶液。將包封后的多肽溶液每次加入10 mL的正己烷,渦旋振蕩3 min,重復(fù)數(shù)次直至正己烷層變?yōu)闊o(wú)色使游離的未被包封的β-胡蘿卜素分離出來(lái),進(jìn)一步測(cè)定正己烷中未被包封的β-胡蘿卜素的含量(β-胡蘿卜素的標(biāo)準(zhǔn)曲線為y=0.843 5x-0.000 2,R2=0.998 7)。包封率和負(fù)載量計(jì)算如公式(1)和公式(2)所示:

(1)

(2)

式中:β-c(free)為游離β-胡蘿卜素的含量,mg;β-c(total)為添加的β-胡蘿卜素的總含量,mg;m(RPs)為添加的菜籽多肽的質(zhì)量,mg。

1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

每個(gè)實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次,結(jié)果用平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示,使用SPSS Statistics 21.0對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,并使用Origin 8.0軟件作圖。

2 結(jié)果與分析

2.1 質(zhì)譜測(cè)序及篩選結(jié)果的分析

2.1.1 質(zhì)譜測(cè)序

菜籽多肽液的質(zhì)譜測(cè)序總離子色譜圖如圖1所示。從菜籽多肽液中共鑒定出2 086條多肽序列。將得到的多肽測(cè)序結(jié)果與Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.uniprot.org/)中菜籽蛋白的序列進(jìn)行BLAST同源性比對(duì),發(fā)現(xiàn)水解液中多肽大多來(lái)源于P33525、P33522、P24565等幾種油菜籽中主要的儲(chǔ)藏蛋白Cruciferin和Napin,也有部分多肽來(lái)源于菜籽蛋白中的P29111、C3S7F1等油料蛋白Oleosins[15]。

圖1 菜籽蛋白肽的總離子色譜圖Fig.1 Total ionic chromatogram on rapeseed peptides

2.1.2 多肽的篩選

多肽的分子質(zhì)量大小、親疏水性氨基酸分布和含量豐度等因素會(huì)影響包封效果[16-17]。本課題組先前研究證明,與小于1 kDa以及3~5 kDa的多肽組分相比,1~3 kDa的多肽具有最優(yōu)的包封效果。此外,HAN等[18]研究表明,親疏水氨基酸規(guī)律性交替分布或者各分布在多肽鏈的1端的多肽可能更有利于多肽的自組裝,進(jìn)而可提高其包封效果。此外,參考GRAVY值選擇接近于0的兩親性多肽[19]。再者,從多肽含量和原料來(lái)源的獨(dú)特性考慮,選擇酶解液中含量豐富且來(lái)源為菜籽蛋白中最主要蛋白的多肽。因此,篩選得到了5條多肽(GFRDMHQKVE、NSYDLPILRVL、GTCPFIAIPF、KGQQGQSQGQQ、NTGDQPLVII,表1)用于后續(xù)分子對(duì)接。由表1可知,這5條多肽均來(lái)源于最主要的菜籽蛋白且含量豐富,分子質(zhì)量均為1 000~1 300 Da,并且這5條多肽按照親疏水性氨基酸規(guī)律性交替(RPs-1)和親疏水性氨基酸各在多肽鏈的一端(RPs-2~RPs-5)的特征分布。同時(shí),這5條多肽的GRAVY值均接近于0,可能具有良好的兩親性有利于多肽自組裝包封,值得進(jìn)一步通過(guò)分子對(duì)接實(shí)驗(yàn)進(jìn)行研究。

表1 所篩選菜籽多肽的基本信息Table 1 Basic information on the rapeseed peptides

2.2 分子對(duì)接結(jié)果分析

5條菜籽多肽的3D結(jié)構(gòu)圖如圖2所示。不同多肽展現(xiàn)出不同構(gòu)象,彎曲折疊形成了一定的空間結(jié)構(gòu)。5條菜籽多肽分別與β-胡蘿卜素的分子對(duì)接模型如圖3所示。藍(lán)色的整片區(qū)域是多肽的“對(duì)接口袋”,線形形狀的小分子物質(zhì)即為β-胡蘿卜素。由圖3可知,沒(méi)有出現(xiàn)β-胡蘿卜素分子遠(yuǎn)離多肽的現(xiàn)象,說(shuō)明多肽能夠與β-胡蘿卜素形成穩(wěn)定的包封復(fù)合物。β-胡蘿卜素端鏈上的2,6,6-三甲基環(huán)己烯基與多肽的“對(duì)接口袋”可能產(chǎn)生了相互作用,但具體相互作用力后續(xù)將利用LigPlus軟件進(jìn)一步分析。分子對(duì)接結(jié)果的打分評(píng)價(jià)結(jié)果如表2所示。從T-Score數(shù)據(jù)來(lái)看,上述幾種多肽的T-Score值都較低,說(shuō)明菜籽多肽與β-胡蘿卜素的相互作用效果不太理想,但還需結(jié)合一致性打分函數(shù)C-Score的結(jié)果來(lái)進(jìn)一步判斷。C-Score是應(yīng)用最為廣泛的評(píng)價(jià)指標(biāo),所篩選的5種多肽的C-Score≥4,表示對(duì)接成功,說(shuō)明對(duì)接結(jié)果與實(shí)驗(yàn)的相似度較高,具有可靠性[20]。

表2 分子對(duì)接結(jié)果的打分結(jié)果Table 2 Scoring results of molecular docking

A-RPs-1;B-RPs-2;C-RPs-3;D-RPs-4;E-RPs-5圖2 所篩選菜籽多肽的3D結(jié)構(gòu)圖Fig.2 Three dimensional structure diagram on the selected rapeseed peptides

A-RPs-1;B-RPs-2;C-RPs-3;D-RPs-4;E-RPs-5圖3 所篩選菜籽多肽與β-胡蘿卜素的分子對(duì)接模型Fig.3 The molecular docking model on the selected rapeseed peptides and β-carotene

5條多肽與β-胡蘿卜素2D相互作用力可視化結(jié)果如圖4所示。圖中“睫毛狀”標(biāo)識(shí)表示所發(fā)生疏水相互作用的氨基酸,標(biāo)識(shí)的數(shù)目也反映了疏水相互作用力的強(qiáng)弱。由圖4可知菜籽多肽與β-胡蘿卜素的非共價(jià)相互作用力主要為疏水相互作用,且參與疏水相互作用的氨基酸大多在多肽“C端”。這與ALLAHDAD等[21-22]利用分子對(duì)接揭示β-胡蘿卜素分別與酪蛋白和乳清蛋白主要通過(guò)疏水相互作用結(jié)合的結(jié)論類似。本課題組前期借助傅里葉變換紅外光譜的研究表明菜籽多肽與β-胡蘿卜素在包封過(guò)程中沒(méi)有氫鍵的形成,因此更可能是疏水相互作用的結(jié)果[6]。根據(jù)疏水相互作用標(biāo)識(shí)的數(shù)目可知,RPs-1的2個(gè)氨基酸(谷氨酰胺和纈氨酸)分別與β-胡蘿卜素的2,6,6-三甲基環(huán)己烯基發(fā)生疏水相互作用,而RPs-2~RPs-5均只有1個(gè)氨基酸與β-胡蘿卜素產(chǎn)生疏水相互作用。與RPs-2~RPs-5相比,RPs-1與β-胡蘿卜素產(chǎn)生的疏水相互作用更強(qiáng),可能具有更優(yōu)的包封效果。此外,通過(guò)進(jìn)一步歸納多肽與β-胡蘿卜素相互作用的氨基酸種類可知,纈氨酸和谷氨酰胺與β-胡蘿卜素的2,6,6-三甲基環(huán)己烯基產(chǎn)生的疏水相互作用可能在包封中發(fā)揮了重要的作用。因此,基于分子對(duì)接結(jié)果和親疏水氨基酸的組成,通過(guò)化學(xué)合成RPs-1和RPs-5,用于驗(yàn)證包封實(shí)驗(yàn)。

A-RPs-1;B-RPs-2;C-RPs-3;D-RPs-4;E-RPs-5圖4 2D相互作用可視化結(jié)果圖Fig.4 The image of 2D interaction visualization results

2.3 相互作用包封的結(jié)果分析

合成多肽RPs-1和RPs-5的包封率和負(fù)載量如圖5所示。RPs-1和RPs-5的包封率和負(fù)載量分別達(dá)到93.17%和0.56 mg/mg,95.70%和0.57 mg/mg。與利用食源性蛋白對(duì)類胡蘿卜素包封的類似研究對(duì)比,乳清分離蛋白對(duì)番茄紅素進(jìn)行包封制備納米顆粒的包封率僅為64.7%[23]。以玉米醇溶蛋白作載體,對(duì)葉黃素進(jìn)行包封制備納米顆粒,測(cè)得包封率為85.18%[24]。綜上,合成的2條菜籽多肽對(duì)β-胡蘿卜素的包封均表現(xiàn)出良好的效果,并且RPs-5較RPs-1具有更優(yōu)的包封效果。這與分子對(duì)接結(jié)果略有差異,可能的原因是分子對(duì)接時(shí)所使用的是多肽與小分子物質(zhì)(β-胡蘿卜素)是一對(duì)一的相互作用,但在實(shí)際體系中往往是多個(gè)菜籽多肽分子與多個(gè)β-胡蘿卜素分子之間的相互作用[25]。

圖5 RPs-1和RPs-5的包封率和負(fù)載量Fig.5 The encapsulation efficiency and loading amount on RPs-1 and RPs-5

3 結(jié)論

菜籽蛋白水解液中的多肽大部分來(lái)源于菜籽蛋白的儲(chǔ)藏蛋白Cruciferin和Napin,少部分來(lái)源于油料蛋白Oleosins。菜籽多肽與β-胡蘿卜素的相互作用力主要是疏水相互作用。此外,菜籽多肽中參與疏水相互作用的氨基酸主要為谷氨酰胺、纈氨酸、脯氨酸和異亮氨酸,并且大多在多肽鏈的“C端”。進(jìn)一步篩選合成的2條多肽鏈(GFRDMHQKVE、NTGDQPLVII)均具有良好的包封效果。因此,本研究可為菜籽多肽包封β-胡蘿卜素等疏水性生物活性物質(zhì)提供一定的理論參考。

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