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驢源枯草芽孢桿菌分離鑒定及生物學特性

2022-08-04 05:09齊鵬飛吳艷秋岳壽松強邊于金慧王永軍蘇曉軼
中國飼料 2022年15期
關(guān)鍵詞:枯草芽孢生化

齊鵬飛 , 吳艷秋,3, 岳壽松, 張 偉, 李 強邊 斐, 于金慧, 王永軍, 蘇曉軼, 張 燕

(1.山東省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所,山東濟南 250100;2.山東省農(nóng)業(yè)科學院農(nóng)作物種質(zhì)資源研究所,山東濟南 250100;3.吉林農(nóng)業(yè)大學動物科學技術(shù)學院,吉林長春 130124;4.山東省畜牧總站,山東濟南 250100;5.濟南市動物疫病預防與控制中心,山東濟南 250022;6. 淄博市農(nóng)業(yè)綜合行政執(zhí)法支隊,山東淄博 255020)

驢隸屬于馬屬動物, 是耐粗飼單胃草食動物(劉宇等,2019), 也是我國獨具特色和優(yōu)勢的畜牧品種(李杰等,2019)。隨著人們對阿膠、驢肉等驢制品需求量增加,養(yǎng)驢業(yè)逐漸向規(guī)模化、集約化發(fā)展。 規(guī)?;H場多選用玉米青貯(包括全株玉米青貯)、花生秧、豆秸、干玉米秸、麥秸、麥糠、谷秸、花生殼、豆莢皮等粗纖維含量高的飼草料,搭配一定比例的精料飼喂驢,粗纖維的消化吸收率偏低(姜慧新等,2019)。 芽孢桿菌屬細菌是動物飼料添加劑中的重要菌屬,除蠟樣芽孢桿菌和炭疽芽孢桿菌外, 大多數(shù)對哺乳動物無害(Amin等,2019)。 芽孢桿菌屬細菌能分泌各種酶類、抑菌物質(zhì)和維生素等代謝產(chǎn)物,促進營養(yǎng)物質(zhì)消化和吸收,抑制病原菌生長,維持腸道菌群平衡,增強動物機體免疫(Amin 等,2019;Elshaghabee 等,2017;李春鳳等,2013)。 芽孢桿菌的芽孢能抵抗各種逆境(胃酸、高溫、高鹽、紫外線等)(Olmossoto 等,2020;Elshaghabee 等,2017; 李春鳳等,2013),已成為廣泛應用于魚蝦(Olmos-soto 等,2020)、肉 雞(Xi 等,2019;謝 文 惠,2018;Li 等,2016)、豬(孟祥宇,2018)等漁業(yè)與畜牧養(yǎng)殖業(yè)生產(chǎn)的飼料添加劑。

益生菌具有宿主特異性, 理想益生菌菌株應來源于本源動物(Cui 等,2017)。 驢源益生菌研究很少, 到目前為止, 有驢源的1 株短小芽孢桿菌(Bacillus pumilus)(劉宇等,2019)、2 株乳酸菌[分別為干酪乳桿菌(Lactobacillus casei)和羅伊氏乳桿菌(L.reuteri)](王卓等,2021;劉宇等,2017)和1株屎腸球菌 (Enterococcus faecium)(左立康等,2021)的相關(guān)報道。本試驗旨在分離篩選具有良好益生性能的驢源芽孢桿菌, 為研發(fā)綠色安全的驢用微生態(tài)制劑提供理論和應用參考依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

1.1.1 主要試劑 酵母粉、 蛋白胨購自Oxoid 公司;瓊脂粉、牛肉浸粉購自北京索萊寶科技有限公司;氯化鈉、剛果紅、羧甲基纖維素鈉等購自生工生物(上海)股份有限公司;細菌基因組DNA 提取試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司;細菌微量生化反應管、 藥敏紙片均購自杭州濱和微生物試劑有限公司;T5 Super PCR Mix 購自青島擎科梓熙生物技術(shù)有限公司;DNA 凝膠回收試劑盒購自OMEGA 公司。

1.1.2 主要培養(yǎng)基配方 LB、 牛肉膏營養(yǎng)培養(yǎng)基、蛋白酶選擇培養(yǎng)基、淀粉酶選擇培養(yǎng)基和纖維素酶選擇培養(yǎng)基配制參照李龍等(2017)的方法。

1.1.3 指示菌株 大腸桿菌(Escherichia coli)、沙門氏菌(Salmonella typhimurium)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)均由聊城大學黑毛驢研究院惠贈。

1.2 菌株分離

1.2.1 樣品來源 在無棣縣、 禹城市和東阿縣3個規(guī)模化驢場分別用無菌袋采集3 頭2 歲左右健康驢新鮮糞便,置于干冰中帶回實驗室,并于-80 ℃保存,直至菌株篩選。

1.2.2 菌株篩選 分別稱取10 g 驢糞樣品,置于含90 mL 無菌生理鹽水的錐形瓶內(nèi)(瓶內(nèi)預置適量無菌玻璃珠),置于搖床180 r/min 充分振蕩30 min,85 ℃水浴處理20 min,依次10 倍梯度稀釋,吸取100 μL 合適梯度樣品涂布LB 平板,置于37 ℃培養(yǎng)24 ~48 h, 根據(jù)菌落形態(tài)挑取芽孢桿菌單菌落,并繼續(xù)劃線培養(yǎng)2 ~3 次,直至菌落純化。

1.3 抑菌活性檢測 挑取分離純化菌株,接種于營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基,37 ℃振蕩過夜培養(yǎng),1%接種于新鮮的肉湯培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h, 發(fā)酵液用0.22 μm針孔濾膜過濾備用。將適量活化金黃色葡萄球菌、大腸桿菌和沙門氏菌分別注入適溫LB 固體培養(yǎng)基,混勻后倒平板。將發(fā)酵液進行牛津杯(直徑D0為8 mm) 抑菌試驗, 觀察、 記錄抑菌圈直徑D(mm),通過抑菌帶(D-D0)大小判定菌株抑菌活性。 篩選到2 株芽孢菌對金黃色葡萄球菌有強抑制作用,分別命名為LV1 和LV2。

1.4 革蘭氏染色和生化鑒定 革蘭氏染色觀察LV1 和LV2 菌體形態(tài)。 生化試驗參照《伯杰氏細菌鑒定手冊》和《常用細菌系統(tǒng)鑒定手冊》生化鑒定指標進行。

1.5 16S rDNA 序列分析 參照TIANGEN 細菌基因組DNA 提取試劑盒方法提取LV1 和LV2 總DNA, 采用通用引物7F: 5′-CAGAGTTTGATCCTGGCT -3′ 和 1540R: 5′ -AGGAGGTGATCCAGCCGCA-3′ PCR 擴增16S rDNA 片段,產(chǎn)物測序由北京擎科生物科技有限公司完成。 所得序列與GenBank 數(shù)據(jù)庫序列進行BLAST 比對分析,并采用Neighbor-Joining 法與相似度較高序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

1.6 產(chǎn)酶能力 將LV1 和LV2 菌株點接于蛋白酶選擇培養(yǎng)基、 淀粉酶選擇培養(yǎng)基和纖維素酶選擇培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)24 h。 在蛋白酶選擇培養(yǎng)基上直接觀察菌落周圍水解圈情況; 在纖維素酶選擇培養(yǎng)基上先滴加1 g/L 剛果紅溶液染色30 min,再滴加1 mol/L NaCl 溶液,觀察菌落周圍水解圈情況;在淀粉酶選擇培養(yǎng)基上滴加碘液,觀察菌落周圍水解圈情況。

1.7 酸和膽鹽耐受性 用鹽酸將LB 液體培養(yǎng)基pH 調(diào)至2.0、3.0 和4.0, 用牛膽鹽配制質(zhì)量分數(shù)分別為0.1%、0.2%和0.3% 的LB 培養(yǎng)基。 將100 μL培養(yǎng)24 h 的菌液分別接種于9.9 mL 不同pH 液體培養(yǎng)基和不同膽鹽濃度的培養(yǎng)基中, 置于37 ℃培養(yǎng)4 h。 兩處理分別于0 h 和4 h 時進行菌落計數(shù),記錄為N0和NT,并根據(jù)以下公式計算存活率。

1.8 耐藥性檢測 采用K-B 紙片瓊脂擴散法測定, 根據(jù)抑菌圈大小判定目標菌株對市售常見抗生素藥品敏感性。

2 結(jié)果

2.1 體外抑菌試驗 抑菌試驗結(jié)果獲得兩株對金黃色葡萄球菌具有強抑制作用的芽孢菌,分別命名為LV1 和LV2,抑菌圈直徑分別達26 mm 和28 mm,但對大腸桿菌和沙門氏菌無抑菌活性(圖1)。

圖1 菌株LV1 和LV2 對3 種指示菌體外抑菌試驗

2.2 菌落形態(tài) LV1 和LV2 菌落和芽孢形態(tài)見圖2,兩菌株菌落近圓形或邊緣不規(guī)則,表面粗糙有褶皺,呈灰白色或淡黃色。 LV1 和LV2 革蘭氏染色后可見兩端鈍圓的陽性桿狀,芽孢橢圓形,位于細胞末端或中央,具有芽孢桿菌屬特征。

圖2 LV1 和LV2 菌落及菌體形態(tài)

2.3 生化試驗結(jié)果 LV1 和LV2 菌株生理生化鑒定結(jié)果見表1,參照《伯杰氏細菌鑒定手冊》和《常用細菌系統(tǒng)鑒定手冊》生化鑒定指標,初步判斷LV1 和LV2 可能為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)。

表1 菌株LV1 和LV2 生化試驗結(jié)果

2.4 16S rDNA 測序和進化分析 由圖3 可知,LV1 和LV2 菌株16S rDNA PCR 擴增產(chǎn)物大小約1500 bp,與預期結(jié)果一致。 由圖4 遺傳進化比對結(jié)果顯示,LV1 和LV2 16S rDNA 序列完全一致,與參考菌株B.subtilis(登錄號:NR112629) 和B.subtilis(登錄號:CP020102)遺傳距離最小,親緣關(guān)系最近,初步判定菌株為枯草芽孢桿菌。結(jié)合菌落形態(tài)、生理生化試驗結(jié)果與16S rDNA 分析結(jié)果,可確定LV1 和LV2 為枯草芽孢桿菌。

圖3 16S rDNA PCR 擴增結(jié)果

圖4 基于16S rDNA 基因序列采用鄰接法構(gòu)建菌株LV1 和LV2 的系統(tǒng)進化樹

2.5 胞外酶活性 由圖5 可知,在淀粉酶選擇型培養(yǎng)基、 纖維素酶選擇性培養(yǎng)基和蛋白質(zhì)選擇性培養(yǎng)基上,LV1 和LV2 菌株菌落周圍都產(chǎn)生清晰的水解圈,說明LV1 和LV2 都能水解淀粉、羧甲基纖維素鈉和蛋白質(zhì)。 其中,LV1 和LV2 降解淀粉透明圈直徑分別為11 mm 和14 mm,菌落直徑分別為6 mm 和4 mm, 透明圈直徑/菌落直徑分別為1.83 和3.5; 降解羧甲基纖維素鈉透明圈直徑分別為20 mm 和19 mm, 菌落直徑分別為7 mm 和8 mm, 透明圈直徑/菌落直徑分別為2.86和2.34;降解蛋白透明圈直徑分別為18 mm 和19 mm,菌落直徑分別為8 mm 和6 mm,透明圈直徑/菌落直徑分別為2.25 和3.17。 LV2 對淀粉和蛋白的降解能力大于LV1,而LV1 對纖維素的降解水平略大于LV2。

圖5 菌株LV1 和LV2 在3 種水解酶選擇性培養(yǎng)基的水解特性

2.6 耐酸和耐膽鹽試驗 由圖6 可知,LV1 和LV2 都具有很好的耐酸和耐膽鹽活性,隨著pH 升高和膽鹽濃度降低存活率逐漸升高。 LV1 和LV2對酸性環(huán)境耐受性強,在pH 為2.0 時,存活率分別為89.9%和112.6%。 LV1 和LV2 對膽鹽環(huán)境也具有很強的耐受性,在膽鹽含量為0.3% 時,存活率分別達到70.2%和94.2%。LV1 和LV2 兩株芽孢桿菌對酸性環(huán)境和膽鹽環(huán)境都具有很好的耐受性,尤其LV2 菌株對酸性和膽鹽的耐受性更強。

圖6 菌株LV1 和LV2 對酸性和膽鹽環(huán)境的耐受性

2.7 藥敏試驗 藥敏試驗按抑菌圈直徑大小作為判定敏感度高低的標準。 由表2 可知,LV1 和LV2 菌株對本試驗所用9 種抗生素卡那霉素、新霉素、四環(huán)素、慶大霉素、氨芐西林、頭孢拉定、頭孢氨芐、氟羅沙星、環(huán)丙沙星都敏感。

表2 藥敏試驗結(jié)果

3 討論

益生菌能夠提高動物免疫力和生產(chǎn)性能,具有無毒、無污染、無殘留、綠色環(huán)保等優(yōu)點,成為一種良好的抗生素替代品。 與雙歧桿菌、乳酸菌、腸球菌、酵母菌等益生菌相比,芽孢桿菌具有很大優(yōu)勢(Mingmongkolchai 等,2018)。 一方面,芽孢桿菌可形成堅硬、耐逆性強的內(nèi)生孢子,能抵御各種極端環(huán)境(低pH、高溫、高濃度膽鹽等),另一方面,內(nèi)生孢子存活期長 (Mingmongkolchai 等,2017;Cutting,2011)。 枯草芽孢桿菌是目前研究較為透徹的一類菌,也是一種理想的多功能益生菌,其孢子能耐受動物消化道逆境, 養(yǎng)殖中能提高飼料轉(zhuǎn)化率, 抑制病原菌的生長 (Olmos-soto 等,2020;Mingmongkolchai 等,2018;Li 等,2016)。本研究通過對篩選目標菌株生物學特性測定, 獲得產(chǎn)酶性能良好、對酸性和膽鹽有較強耐受性、對金黃色葡萄球菌有強抑制作用的LV1 和LV2 菌株,綜合生化試驗結(jié)果與16S rDNA 測序分析, 確定兩株菌都為枯草芽孢桿菌,為后續(xù)應用提供了便利條件。

驢養(yǎng)殖業(yè)一直以來都屬小眾產(chǎn)業(yè), 驢源益生菌的研究較少。 劉宇等(2019)報道的短小芽孢桿菌LV2 隸屬芽孢桿菌屬,能產(chǎn)纖維素酶(透明圈直徑13 mm,菌落直徑6 mm),有較好抑制金黃色葡萄球菌活性(抑菌圈直徑20 mm,牛津杯直徑8 mm)。 與短小芽孢桿菌LV2 菌株相比,本研究篩選的兩株枯草芽孢桿菌LV1 和LV2,具有更好的抑菌性和產(chǎn)酶性能, 對金黃色葡萄球菌抑菌圈直徑分別達為26 mm 和28 mm (牛津杯直徑8 mm), 產(chǎn)纖維素酶活性更好 (透明圈直徑分別為20 mm 和19 mm, 菌落直徑分別為7 mm 和8 mm),并能同時產(chǎn)淀粉酶(透明圈直徑分別為11 mm 和14 mm,菌落直徑分別為6 mm 和4 mm)和蛋白酶(透明圈直徑分別為18 mm 和19 mm,菌落直徑分別為8 mm 和6 mm),此外,LV1 和LV2對試驗用9 種抗生素都敏感, 傳播耐藥基因的潛在風險小??莶菅挎邨U菌LV1 和LV2 同時具備了抑菌、產(chǎn)多種底物降解酶、耐酸和膽鹽能力強、安全性較高的特性,具有很大的應用潛力。

抗生素曾在動物疫病防控、生長發(fā)育、飼料轉(zhuǎn)化等方面發(fā)揮著重要作用,但抗生素的濫用,導致細菌耐藥性(特別是超級細菌)、獸藥藥殘等問題出現(xiàn), 對畜禽產(chǎn)品質(zhì)量安全和環(huán)境安全造成嚴重威脅(Mingmongkolchai 等,2018)。 隨著科學技術(shù)發(fā)展和生活水平提高, 人們對抗生素濫用的負面影響也越來越重視,歐盟、美國、日本等國家相繼禁止在飼料中添加抗生素,我國也于2020 年1 月1 日起, 退出除中藥外的所有促生長類藥物飼料添加劑品種,自2020 年7 月1 日起,飼料生產(chǎn)企業(yè)停止生產(chǎn)含有促生長類藥物飼料添加劑(中藥類除外)的商品飼料(農(nóng)業(yè)農(nóng)村部第194 號公告)。因此, 尋找用于畜禽養(yǎng)殖業(yè)疾病防控和促生長的抗生素替代品成為近年來研究熱點。 本研究篩選的兩株枯草芽孢桿菌不僅具有降解纖維素、 淀粉和蛋白質(zhì)性能, 還具有很強的抑制金黃色葡萄球菌的性能,且無耐藥性,避免菌株在動物腸道內(nèi)抗性基因水平轉(zhuǎn)移,是潛在的微生態(tài)制劑候選菌株??莶菅挎邨U菌為我國飼料添加劑名錄(2013)(中華人民共和國農(nóng)業(yè)部公告第2045 號) 可添加菌種,相對安全,但由于菌株的特異性,其動物安全性及動物體內(nèi)益生作用還需進一步研究。

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