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實(shí)時熒光定量PCR 對社區(qū)暴露腹瀉樣本CA-CDI 的診斷價值

2022-08-01 04:43鄭瑞兵張卉卉應(yīng)建飛汪一萍
關(guān)鍵詞:梭菌定量試劑盒

鄭瑞兵,張卉卉,應(yīng)建飛,汪一萍

艱難梭菌(CD)屬于厭氧芽孢桿菌,能以芽孢形式長期存活于土壤或水環(huán)境中,經(jīng)糞-口途徑傳播,是抗生素相關(guān)性腹瀉和醫(yī)療機(jī)構(gòu)相關(guān)性腹瀉重要病原體之一[1]。艱難梭菌感染(CDI)患者常表現(xiàn)為腹瀉、伴或不伴腹痛及發(fā)熱等癥狀,輕中度癥狀具有自限性,重度及暴發(fā)型感染患者則易引發(fā)全身癥狀,威脅患者生命健康[2]。我國CDI 發(fā)病呈現(xiàn)逐年上升趨勢,作為我國丙類法定傳染病的重要病原體之一,CD的診斷與檢測技術(shù)評估,對疾病的二級預(yù)防具有重大意義[3-4]。社區(qū)獲得性艱難梭菌感染(CA-CDI)是指在醫(yī)院外罹患的CDI[5]。相關(guān)研究顯示,社區(qū)獲得性腹瀉中CDI 率為14%,培養(yǎng)陽性率為5%~6%[6]。CD 的毒性主要來源于兩大毒素,毒素A(tcd-A)為外毒素,結(jié)合腸黏膜刷狀緣以破壞其正常生理結(jié)構(gòu);毒素B(tcd-B)發(fā)揮細(xì)胞毒作用,破壞腸上皮細(xì)胞的細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu)從而形成偽膜[7]。本研究選取社區(qū)來源非重復(fù)腹瀉糞便標(biāo)本,運(yùn)用實(shí)時熒光定量PCR 法對tcd-B 基因進(jìn)行擴(kuò)增檢測,評估實(shí)時熒光定量PCR 法直接檢測糞便標(biāo)本與“金標(biāo)準(zhǔn)”[產(chǎn)毒培養(yǎng)法(TC)+細(xì)胞毒性酶免疫分析(EIA)][8]診斷結(jié)果的差異,為進(jìn)一步的CA-CDI 社區(qū)干預(yù)提供更多依據(jù)?,F(xiàn)報道如下。

1 資料與方法

1.1 樣本 選取2016年4-10月寧波市社區(qū)醫(yī)療機(jī)構(gòu)就診的具有社區(qū)暴露史的腹瀉患者,符合:(1)腹瀉發(fā)病前6 周無住院經(jīng)歷;(2)非重復(fù)有效腹瀉標(biāo)本;(3)具有CDI 臨床診斷特征(危險因素+臨床表現(xiàn))[9];(4)社區(qū)暴露腹瀉樣本行CA-CDI檢測,以TC+EIA為“金標(biāo)準(zhǔn)”[10]。排除:(1)具有醫(yī)院暴露史;(2)重復(fù)腹瀉標(biāo)本。最終獲得有效腹瀉標(biāo)本329例,并及時進(jìn)行厭氧培養(yǎng)。其中男191例,女138例;年齡3 ~81歲,平均(42.1±25.6)歲。

1.2 方法

1.2.1 樣本采集與運(yùn)輸 囑被檢測者于干燥清潔便盆內(nèi)自然排便,以無菌采便管/盒挑取糞便中存在黏液、膿液或血液的部分4 ~6 g(液體糞便≥5 ml),4℃保存,24 h 內(nèi)完成免疫學(xué)檢測。

1.2.2 檢測方法

1.2.2.1 實(shí)時熒光定量PCR 法(1)儀器與試劑:儀器選取實(shí)時熒光定量PCR儀(Cepheid,美國),試劑采用艱難梭菌熒光PCR 檢測試劑盒[(tcd-B)XY-DT-D-1330,xuanya]。(2)方法:拭子蘸取少量待測樣本插入含樣品處理液的小瓶后震蕩混勻,加樣后按照試劑盒說明書操作,將反應(yīng)體系放入熒光PCR 儀進(jìn)行擴(kuò)增,并于退火/延長過程中記錄熒光信號。采用通用循環(huán)法,即以95℃10min 進(jìn)行酶活化;95℃15s 進(jìn)行變性,循環(huán)35 ~40 輪;60℃60s進(jìn)行退火/延伸。(3)反應(yīng)結(jié)束后,根據(jù)熒光信號與Ct 值判斷擴(kuò)增結(jié)果。

1.2.2.2 TC+EIA 鑒定(1)CD 培養(yǎng):取約0.2 ml 糞便標(biāo)本與Eugon 肉湯(美國BBL公司)1∶1 混勻,并于80 ℃加熱10 min;接種環(huán)絲氨酸-頭孢西丁-果糖瓊脂平板(CCFA)和增菌肉湯,行35 ℃厭氧菌培養(yǎng)。如直接培養(yǎng)陰性可取變成紅色的肉湯轉(zhuǎn)移CCFA 繼續(xù)培養(yǎng)并鑒定;CD在CCFA上呈白色或淡黃色不透明的扁平狀“攤雞蛋樣”菌落,分離CD 菌株入-40 ℃低溫冰箱保存。(2)EIA 鑒定:采用毒素A+B 抗原ELISA 試劑盒(C.difficile toxins A+B ELISA,ELA4448 DRG,96T),檢測tcd-A、tcd-B。

1.3 統(tǒng)計方法 采用SPSS 22.0 統(tǒng)計軟件進(jìn)行分析。計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,計數(shù)資料以n(%)表示,待評估檢測手段與“金標(biāo)準(zhǔn)”診斷結(jié)果差異性檢驗采用McNemar 檢驗,一致性檢驗采用Kappa 分析。

2 結(jié)果

2.1 329例社區(qū)暴露腹瀉標(biāo)本CA-CDI檢測情況 艱難梭菌熒光PCR 檢測共檢測tcd-B陽性14例,陽性率為4.26%;其中包括1例熒光PCR 檢測CA-CDI(+)但培養(yǎng)(-)標(biāo)本。排除1例培養(yǎng)(+)但EIA 鑒定陰性標(biāo)本,TC 法共獲得產(chǎn)毒CD 17 株(5.17%),陽性菌株ELISA法定性測定毒素基因tcd-A 和tcd-B,15株標(biāo)本為tcd-A(+)、tcd-B(+)樣本;1 株為tcd-A(-)、tcd-B(+),1 株為tcd-A(+)、tcd-B(-)。

2.2 兩種檢測法對CA-CDI 檢測效能比較 艱難梭菌熒光PCR 檢測試劑盒(tcd-B)對CA-CDI 檢測結(jié)果與“TC+EIA 鑒定”結(jié)果差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.375,雙側(cè)檢驗),一致性檢驗Kappa 值為0.831。艱難梭菌熒光PCR 檢測試劑盒(tcd-B)對CA-CDI 檢測靈敏度為76.47%,特異度為99.68%,見表1~2。

表1 實(shí)時熒光定量PCR與產(chǎn)毒培養(yǎng)對CACDI 檢測結(jié)果比較 例

2.3 兩種檢測法對tcd-B檢測效能比較艱難梭菌熒光PCR 檢測試劑盒(tcd-B)對tcd-B 檢測結(jié)果與“TC+EIA 鑒定”結(jié)果差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.625,雙側(cè)檢驗),一致性檢驗Kappa 值為0.860。艱難梭菌熒光PCR 檢測試劑盒(tcd-B)對tcd-B 檢測靈敏度為81.25%,特異度為99.68%,見表2~3。

表2 實(shí)時熒光定量PCR 對不同診斷目標(biāo)的檢測效能參數(shù) %

表3 實(shí)時熒光定量PCR 與產(chǎn)毒培養(yǎng)對產(chǎn)毒基因tcd-B 檢測結(jié)果比較例

3 討論

CDI 是腸道菌群失調(diào),進(jìn)而產(chǎn)毒性CD大量繁殖并產(chǎn)生毒素導(dǎo)致的[11]。以往研究多著眼于醫(yī)院CDI 的檢測與治療,關(guān)于的CA-CDI 研究相對較少[12-13]。本研究就是著眼于CA-CDI,分析在社區(qū)暴露腹瀉患者群體中,病原分子生物學(xué)檢測手段的檢測效能。

現(xiàn)有的CDI 檢測技術(shù)包括糞便厭氧培養(yǎng)、EIA、谷氨酸脫氫酶(GDH)檢測及熒光定量PCR 檢測等[14]。本研究選取實(shí)時熒光定量PCR 為主要待評估檢測手段,以TC+EIA 為“金標(biāo)準(zhǔn)”進(jìn)行比較,結(jié)果顯示,艱難梭菌熒光PCR 檢測試劑盒(tcd-B)檢測CA-CDI 陽性率為4.26%;“金標(biāo)準(zhǔn)”檢測CA-CDI 陽性率為5.17%(17/329),與以往研究中1%~7%的人群攜帶率相符[15]。出現(xiàn)1例實(shí)時熒光定量PCR 檢測樣本tcd-B(+)但培養(yǎng)(-)標(biāo)本,考慮為運(yùn)輸及保存過程中空氣暴露時間過長引起的假陰性結(jié)果。另有1例TC 法對樣本CA-CDI 檢測中培養(yǎng)(+),但進(jìn)一步EIA 檢測顯示均為陰性,考慮源于TC 無法區(qū)分產(chǎn)毒與非產(chǎn)毒CD 的檢測缺陷導(dǎo)致[16]。艱難梭菌熒光PCR 檢測試劑盒(tcd-B)對社區(qū)暴露腹瀉樣本CA-CDI診斷靈敏度與特異度分別為76.47%和99.68%;對tcd-B 檢測靈敏度與特異度分別為 81.25%和99.68%;與“金標(biāo)準(zhǔn)”檢測一致性分別達(dá)到0.831 和0.860。這說明社區(qū)暴露腹瀉樣本CA-CDI 產(chǎn)毒基因tcd-B 的實(shí)時熒光定量PCR 檢測效能較高,可代替TC 進(jìn)行快速的獨(dú)立檢測。

總之,實(shí)時熒光定量PCR 技術(shù)檢測糞便樣本,具有簡單快捷且準(zhǔn)確率高等優(yōu)點(diǎn),對CA-CDI診斷效能良好,方便在基層醫(yī)療單位廣泛應(yīng)用。

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