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基于蛋白互作和關(guān)鍵作用靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究白花敗醬草治療潰瘍性結(jié)腸炎的作用機(jī)制及實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證

2022-07-04 05:59李曉晨王帥李天嬌趙琳包永睿孟憲生遼寧中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院遼寧大連6600遼寧省中藥多維分析專業(yè)創(chuàng)新技術(shù)中心遼寧省現(xiàn)代中藥研究工程實(shí)驗(yàn)室遼寧大連6600遼寧省現(xiàn)代中藥研究工程實(shí)驗(yàn)室遼寧大連6600
中南藥學(xué) 2022年4期
關(guān)鍵詞:白花靶點(diǎn)結(jié)腸

李曉晨,王帥,2,3,李天嬌,2,3,趙琳*,包永睿,2,3*,孟憲生,2,3(.遼寧中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,遼寧 大連 6600;2.遼寧省中藥多維分析專業(yè)創(chuàng)新技術(shù)中心,遼寧省現(xiàn)代中藥研究工程實(shí)驗(yàn)室,遼寧 大連 6600;3.遼寧省現(xiàn)代中藥研究工程實(shí)驗(yàn)室,遼寧 大連 6600)

潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis,UC)是一種常見的反復(fù)發(fā)作的慢性疾病,常表現(xiàn)為腹痛、腹瀉、便秘、便血以及炎癥等。目前廣泛認(rèn)為腸黏膜損傷是引發(fā)UC的主要原因之一。近年來,UC發(fā)病率逐年攀升,其治療藥物主要包括美沙拉秦、鹽酸小檗堿、柳氮磺胺吡啶、氨基水楊酸、糖皮質(zhì)類激素等。臨床治療中發(fā)現(xiàn)長時間使用上述藥物常會伴隨著多種不良反應(yīng)的發(fā)生,且停藥后復(fù)發(fā)率較高,給患者帶來極大的困擾[1-6]。

近年來,大量研究顯示中醫(yī)藥在臨床治療中療效好、毒性低[7]。因此,從中醫(yī)藥角度出發(fā)尋找治療UC新藥是一種可行的方法。UC的中醫(yī)病名為“休息痢”,目前認(rèn)為脾氣虛弱為其基本病機(jī),濕熱之邪是其主要致病因素,瘀血阻滯是久病不愈的重要原因。白花敗醬草[Patrinia villosa(Thunb.)Juss.]系敗醬科植物,藥用其全草,味辛,性寒,始載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,被《本草綱目》中記載為治腸癰之要藥,主要含有黃酮類、酚酸類以及皂苷類化合物,具有清熱解毒,利濕排膿,活血化瘀,鎮(zhèn)心安神的功效,臨床上常用于治療闌尾炎,癰腫瘡毒,腸炎,UC,慢性胃炎,腫瘤等[8-9]。已有文獻(xiàn)表明,敗醬草在臨床使用、體外實(shí)驗(yàn)等都具有顯著的療效,毒副作用及復(fù)發(fā)率均相對較低[5-6,10-11]。本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究方法,構(gòu)建“潛在活性成分-作用靶點(diǎn)-疾病”網(wǎng)絡(luò)對白花敗醬草治療UC靶點(diǎn)進(jìn)行全面預(yù)測并探討其作用機(jī)制;并在此基礎(chǔ)上,利用自由飲用葡聚糖硫酸鈉(DSS)建立的UC小鼠模型對其中篩選出的重要途徑進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,深入探討白花敗醬草治療UC的作用機(jī)制,為其進(jìn)一步臨床應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

1 材料

1.1 相關(guān)數(shù)據(jù)庫

中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP)[12],有機(jī)小分子生物活性數(shù)據(jù)庫(PubChem),蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(UniProt)[13],GeneCard數(shù)據(jù)庫,OMIM數(shù)據(jù)庫,Drugbank數(shù)據(jù)庫,String數(shù)據(jù)庫[14],DAVID數(shù)據(jù)庫。

1.2 試藥

白花敗醬飲片[經(jīng)遼寧中醫(yī)藥大學(xué)許亮教授鑒定為白花敗醬Patrinia villosa(Thunb.)Juss.的干燥全草];質(zhì)譜級甲醇、乙腈(德國Merck KGaA公司);質(zhì)譜級甲酸(美國Thermo公司,批號:141831A);純凈水(杭州娃哈哈集團(tuán)有限公司);美沙拉秦緩釋顆粒(上海愛的發(fā)制藥有限公司);葡聚糖硫酸鈉鹽(Meilunbio公司,批號:S0925A);TNF-α酶聯(lián)免疫吸附測定試劑盒(上??婆d有限公司,批號:21071230N);IL-6酶聯(lián)免疫吸附測定試劑盒(上??婆d有限公司,批號:21071233N);Kodak X膠片(美國柯達(dá)公司);RIPA裂解液(ambion生物科技有限公司);PMSF蛋白酶抑制劑、6×protein loading buffer(北京全式金生物技術(shù)有限公司);三羥甲基氨基甲烷(Tris)、甘氨酸(Glycine)、十二烷基磺酸鈉(SDS)、BCA蛋白濃度測定試劑盒(上海索萊寶生物科技有限公司);SDS-PAGE凝膠快速配置試劑盒、飛克特超敏ECL發(fā)光液(大連美侖生物科技有限公司);雙色預(yù)染蛋白Marker(Proteintech,Cat:PL00001);兔 抗AKT多 克隆抗體(Proteintech,Cat:10176-2-Ap);兔抗PI3 Kinase p85(Signaling,Cat:#4292);兔 抗Beat Actin多克隆抗體(Proteintech,Cat:20536-1-Ap);HRP-conjugated Affinipuer Goat anti-Rabbit IgG(H+L)(Proteintech,Cat:SA00001-2)。

1.3 動物

SPF級C57BL/6雌性小鼠,體質(zhì)量(20±2)g [遼寧長生生物技術(shù)有限公司,許可證編號:SCXK(遼)2020-0001]。

1.4 儀器

旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(美國SENCO公司);Sartorius CP225D電子分析天平(北京賽多利斯天平有限公司);CV200吉艾姆真空離心濃縮儀(北京吉艾姆科技有限公司);組織脫水機(jī)(日本櫻花:VIP6 AI);BM450A包埋機(jī)、凍臺(派斯杰);PH60病理切片機(jī)(Lecia);PH60組織漂烘儀(派斯杰);GHP-9160烤箱(上海恒一);YA0170載玻片(Solarbio);3DHISTECH P250 FLASH全景掃描儀(3DHISTECH);CM1900冰凍切片機(jī)(Lecia);酶標(biāo)儀(美國Molecular Drvices公司);通用電泳儀(美國BD公司)。

2 方法與結(jié)果

2.1 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)

2.1.1 藥物與疾病交集靶點(diǎn)預(yù)測 應(yīng)用TCMSP數(shù)據(jù)庫平臺與白花敗醬草相關(guān)文獻(xiàn)[15],以口服生物利用度(OB)≥30%、藥物相似性(DL)≥0.18為條件,篩選出活性較高的成分共12種,檢索并分析其對應(yīng)靶點(diǎn)信息;利用UniProt數(shù)據(jù)庫,規(guī)范相應(yīng)蛋白靶點(diǎn),得到169個藥物作用靶點(diǎn),建立藥效成分潛在作用靶點(diǎn)庫,并構(gòu)建可視化網(wǎng)絡(luò)圖,見圖1。應(yīng)用GeneCards、OMIM、DrugBank數(shù)據(jù)庫搜索UC的作用靶點(diǎn),獲取相關(guān)基因1234個,構(gòu)建疾病靶標(biāo)庫;將所得靶點(diǎn)信息取交集,獲得藥物與疾病的交集靶點(diǎn)98個。

圖1 白花敗醬草治療UC的“活性成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖Fig 1 ”Active component-target” network diagram of Patrinia villosa Juss.in treating ulcerative colitis

2.1.2 交互網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建和富集分析 將藥材、疾病交集靶點(diǎn)輸入蛋白交互作用網(wǎng)站String,生物種類選擇“Homo sapiens”,最小相互作用閾值設(shè)置“medium confidence”(>0.4),其他參數(shù)選擇默認(rèn)值,即可得到PPI網(wǎng)絡(luò),將結(jié)果進(jìn)一步美化,得到交集蛋白PPI網(wǎng)絡(luò)圖[16],其中蘇氨酸蛋白激酶(AKT1)的degree值為82,在所有靶點(diǎn)中排列第一,表明其在整個PPI網(wǎng)絡(luò)中占據(jù)重要地位。網(wǎng)絡(luò)圖包含98個節(jié)點(diǎn),2028條相互作用,見圖2;以節(jié)點(diǎn)大小和顏色用于反映degree值的大小,選取degree值排列前20的靶點(diǎn)繪制棒棒糖圖,探究潛在靶基因功能,見圖3;利用String和DAVID數(shù)據(jù)庫對潛在基因進(jìn)行功能、通路富集分析,見圖4~6,結(jié)果中除人類癌癥相關(guān)通路外,磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/絲氨酸激酶(AKT)信號通路排列第一,可能是白花敗醬草治療UC的關(guān)鍵靶點(diǎn)及關(guān)鍵通路。已證實(shí)AKT是PI3K下游的直接靶蛋白,主要負(fù)責(zé)由PI3K始動的生物信息轉(zhuǎn)導(dǎo),位點(diǎn)被磷酸化后,結(jié)合在細(xì)胞膜上的AKT被完全激活,其首要的功能就是激活NF-κB,并誘導(dǎo)其釋放大量的炎性因子如IL-6和TNF-α等[17]。

圖2 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)圖Fig 2 Protein-protein interaction network

圖3 度值排名前20的相關(guān)靶點(diǎn)Fig 3 Top 20 related targets in degree value

圖4 BP、CC、MF三方面功能富集分析圖Fig 4 Functional enrichment analysis of BP,CC,and MF

2.1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用GraphPad Prism 7.0軟件進(jìn)行分析,數(shù)據(jù)以(±s)表示,組間比較采用單因素方差分析統(tǒng)計(jì),P<0.05認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2.2 動物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證

2.2.1 白花敗醬草藥液制備 精密稱取白花敗醬藥材粗粉約100.0 g,精密加入10倍量的70%乙醇,加熱回流提取3次,每次2 h,合并提取液,減壓濃縮至0.1 g·mL-1生藥濃度的浸膏溶液[18],過濾除菌分裝,4℃保存?zhèn)溆?。根?jù)人體每日推薦劑量15.0 g/70.0 kg計(jì)算,設(shè)置白花敗醬草給藥組進(jìn)行小鼠灌胃實(shí)驗(yàn),每日0.039 g/20.0 g。

圖5 通路富集分析圖Fig 5 Enrichment analysis diagram of pathway

圖6 活性成分-靶點(diǎn)-KEGG通路網(wǎng)絡(luò)圖Fig 6 Network of active ingredient-target-KEGG pathway

2.2.2 實(shí)驗(yàn)分組及干預(yù)方式 32只C57BL/6雌性小鼠喂養(yǎng)一周后,隨機(jī)分為空白組、模型組、陽性藥組、白花敗醬草給藥組,每組8只??瞻捉M每日自由飲用自來水,其余組小鼠自由飲用3.5% DSS溶液7 d,建立UC小鼠模型,一周后飲用自來水。造模成功后,白花敗醬草給藥組灌胃白花敗醬草提取液,陽性對照組小鼠按美沙拉秦緩釋顆粒臨床用量給予灌胃,空白組、模型組小鼠灌胃等體積蒸餾水,連續(xù)灌胃10 d。

2.2.3 疾病活動指數(shù)(disease activity index,DAI)評價(jià)及各組小鼠一般情況 實(shí)驗(yàn)期間觀察小鼠體質(zhì)量、大便性狀和便血情況,按照三項(xiàng)得分進(jìn)行DAI評分,DAI=(體質(zhì)量得分+大便性狀得分+便血得分)/3,詳細(xì)評分標(biāo)準(zhǔn)見表1[19]。采用DSS溶液誘導(dǎo)的UC小鼠模型與人類UC最為相似[20]。根據(jù)觀察小鼠的體質(zhì)量、大便性狀,隱血、便血情況及組織學(xué)形態(tài),符合炎癥的組織病理改變,提示造模成功。與空白組小鼠相比,模型組能夠引起UC小鼠的體質(zhì)量減輕及總DAI指數(shù)顯著升高(P<0.01),經(jīng)給藥組干預(yù)后,給藥組小鼠體質(zhì)量呈現(xiàn)上升趨勢、總DAI 指數(shù)呈現(xiàn)顯著的下降趨勢(P<0.01)。表明白花敗醬草與陽性藥物有相同作用,能有效改善UC小鼠體質(zhì)量減輕、緩解UC小鼠的癥狀(P<0.01,見圖7)。

表1 DAI評分標(biāo)準(zhǔn) Tab 1 DAI scoring criteria

圖7 各組小鼠DAI評分結(jié)果Fig 7 DAI score of mice in each group

2.2.4 樣本采集及病理學(xué)結(jié)果 最后一次灌胃24 h后,禁食,小鼠摘眼球取血,室溫下靜置30 min后,3000 r·min-1離心10 min,取上清液分裝,-80℃保存待測。取小鼠結(jié)腸組織,用生理鹽水清洗后濾紙吸干,各組小鼠取部分結(jié)腸組織,4%多聚甲醛固定后,進(jìn)行石蠟包埋,切片脫蠟,用蘇木精和伊紅染色,脫水封片,觀察結(jié)腸組織形態(tài)。其余各組小鼠結(jié)腸組織液氮速凍,-80℃保存,備用。與空白組相比,模型組小鼠出現(xiàn)結(jié)腸黏膜炎癥,個別部位黏膜上皮明顯變薄,大量炎癥細(xì)胞浸潤。與模型組相比,白花敗醬草給藥組小鼠及陽性藥物組小鼠結(jié)腸隱窩結(jié)構(gòu)基本完整,炎性浸潤較模型組小鼠明顯減輕,上皮細(xì)胞排列較為緊密,提示白花敗醬草與陽性藥物具有相同治療作用,結(jié)果見圖8。

圖8 不同組組織病理學(xué)結(jié)果圖(×200)Fig 8 Histopathdogy of different groups(×200)

2.2.5 Western blot檢測小鼠結(jié)腸組織中PI3K、AKT蛋白表達(dá)水平 每組小鼠隨機(jī)抽取3只樣本,取部分結(jié)腸組織,加入含有PMSF的RIPA裂解液,冰上研磨至無明顯顆粒狀,離心后吸取蛋白溶液,充分變性,置-20℃保存,備用。嚴(yán)格按照抗體說明書操作,檢測小鼠結(jié)腸組織中PI3K、AKT蛋白表達(dá)水平,并用Image J軟件進(jìn)行定量分析。結(jié)果表明,與空白組比較,模型組小鼠結(jié)腸組織PI3K、AKT蛋白表達(dá)顯著升高(P<0.01)。與模型組比較,白花敗醬草給藥組與陽性藥給藥組小鼠結(jié)腸組織PI3K、AKT蛋白水平均下調(diào)(P<0.01)。結(jié)果見圖9。

圖9 各組小鼠結(jié)腸組織中PI3K、AKT蛋白表達(dá)Fig 9 PI3K and AKT protein expression in colon tissues of mice in each group

2.2.6 ELISA法檢測各組小鼠血清TNF-α、IL-6含量 將稀釋后的標(biāo)準(zhǔn)品和每組隨機(jī)抽取的3只待測小鼠血清樣品依次加入ELISA酶標(biāo)板中,每孔100 μL,每組設(shè)置3個復(fù)孔,嚴(yán)格按照試劑盒說明書操作,使用酶標(biāo)儀在450 nm波長處檢測各孔的光密度(OD值)。根據(jù)所測標(biāo)準(zhǔn)品OD值與濃度繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,計(jì)算各組細(xì)胞上清液中TNF-α、IL-6的水平。結(jié)果表明與空白組比較,模型組大鼠血清IL-6、TNF-α含量升高(P<0.01);與模型組比較,白花敗醬草給藥組與陽性藥物組TNF-α和IL-6水平明顯降低(P<0.05,P<0.01)。IL-6是一種多功能細(xì)胞因子,在機(jī)體免疫應(yīng)答、炎癥等過程中具有調(diào)節(jié)作用,在UC的發(fā)生和發(fā)展過程中,其表達(dá)水平與UC嚴(yán)重程度成正相關(guān)[21-22];TNF-α,可促進(jìn)活化血小板因子釋放,產(chǎn)生氧自由基等,對腸黏膜造成傷害[23]。相關(guān)文獻(xiàn)表明,IL-6、TNF-α的水平與UC病情具有較大的相關(guān)性[24]?;谝陨辖Y(jié)果,推測白花敗醬草可能通過調(diào)控PI3K/AKT信號通路,抑制促炎因子IL-6、TNF-α的釋放,達(dá)到治療UC的目的。結(jié)果見表2。

表2 不同組ELISA實(shí)驗(yàn)結(jié)果 Tab 2 ELISA for different groups

3 討論與結(jié)論

本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析方法研究白花敗醬草治療UC的活性成分、作用靶點(diǎn)及相關(guān)通路,并在此基礎(chǔ)上利用UC小鼠模型,對其中篩選出的關(guān)鍵通路PI3K/AKT信號通路進(jìn)行驗(yàn)證,初步解析白花敗醬草治療UC的作用機(jī)制。

通過對白花敗醬草中潛在活性成分-作用靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析,關(guān)鍵化學(xué)成分主要為槲皮素、山柰酚、木犀草素、異牡荊素、青風(fēng)藤堿、谷甾醇等。相關(guān)文獻(xiàn)表明,槲皮素能提高組織PI3K、AKT表達(dá),阻滯細(xì)胞周期,抑制細(xì)胞增殖能力,從而起到抗炎的作用[25-26];山柰酚通過下調(diào)PI3K、AKT的表達(dá)促進(jìn)細(xì)胞凋亡[27];木犀草素、異牡荊素主要通過降低炎癥轉(zhuǎn)錄因子活性,抑制促炎因子TNF-α、IL-6的釋放,從而發(fā)揮抗炎作用[28-30];青風(fēng)藤堿則可以減少促炎因子TNF-α、IL-6的釋放[31];谷甾醇可抑制巨噬細(xì)胞IL-6活性,減少TNF-α等炎性因子的分泌[32-34]。提示白花敗醬草通過多成分、多靶點(diǎn)激活PI3K/AKT信號通路,發(fā)揮治療UC的作用。

綜上,通過對白花敗醬草網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的分析及其干預(yù)UC模型小鼠的動物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,明確白花敗醬草治療UC的藥理藥效及作用機(jī)制,為其進(jìn)一步臨床應(yīng)用及開發(fā)奠定基礎(chǔ)。

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