劉一超, 陸超, 戰(zhàn)崳華, 柯秀彬, 陸偉, 燕永亮
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所,北京100081
鐵元素是幾乎所有微生物生長、繁殖和代謝所必需的營養(yǎng)元素。目前已知鐵元素的功能大都基于其作為關(guān)鍵酶輔因子展開,例如,它可以作為輔因子參與構(gòu)成血紅素蛋白和鐵-硫蛋白的核心,或參與構(gòu)成二鐵單核酶的活性中心并穩(wěn)定其構(gòu)象,也可與鐵載體結(jié)合而發(fā)揮作用[1]。研究表明,不同物種內(nèi)鐵元素的存在和作用模式不同,對微生物來說,并不是鐵的吸收越多越好,胞內(nèi)過高濃度的鐵會對細(xì)胞產(chǎn)生毒性,破壞微生物內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定性[2],微生物必須在鐵的攝取不足與鐵過多導(dǎo)致毒性之間保持平衡。革蘭氏陰性菌中,胞內(nèi)鐵轉(zhuǎn)運、儲存和利用主要由鐵吸收調(diào)節(jié)蛋白Fur(ferric uptake regulator)調(diào)控[3]。大量研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ur 在鐵的轉(zhuǎn)運和利用、光合作用、呼吸作用、DNA 的生物合成、微生物-宿主互作、環(huán)境競爭等過程中發(fā)揮重要作用[4-6]。
Fur 蛋白在原核生物中廣泛存在,Hantke 等[7]最早在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)了該蛋白,而Bagg 等[8]進(jìn)一步通過實驗證明了該蛋白可以與亞鐵離子結(jié)合,并對鐵轉(zhuǎn)運系統(tǒng)起調(diào)控作用。Fur 通過其蛋白結(jié)構(gòu)上一個富含組氨酸區(qū)域與靶標(biāo)基因啟動子上富含A/T 區(qū)域的Fur box 結(jié)合[3]。這種序列的特異性在不同細(xì)菌間存在較大差異[9]。近年來的研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ur 蛋白對靶標(biāo)的表達(dá)存在正調(diào)控和負(fù)調(diào)控兩種模式,如Fur 作為轉(zhuǎn)錄因子的負(fù)調(diào)控機制[10]、apo-Fur 的正調(diào)控機制[11]和Fe2+-Fur 復(fù)合體的正調(diào)控機制[12-13]。此外,也有研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ur蛋白可通過非編碼RNA 介導(dǎo)的RNA-RNA 互作調(diào)控模式,對鐵代謝相關(guān)的基因進(jìn)行精準(zhǔn)調(diào)控,如大腸桿菌中參與氧化脅迫調(diào)控的非編碼RNA RyhB[14-16]。
施氏假單胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501是一株分離于水稻根際的聯(lián)合固氮菌[17],也是目前聯(lián)合固氮研究的模式菌株之一,其高效固氮和根表定殖需要大量含鐵蛋白(如固氮酶)的參與,因此了解其如何適應(yīng)不同生境鐵有助于完善A1501 的生境適應(yīng)機制及固氮調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。近年來,科研人員通過對A1501在抗氧化脅迫、碳源利用、固氮調(diào)控與氮循環(huán)、生物膜形成以及根表定殖等方面的深入研究,對其基本調(diào)控模式和適應(yīng)環(huán)境的能力有了更為清晰的理解[18-24],但是關(guān)于A1501如何響應(yīng)外界鐵信號并調(diào)控其根際適應(yīng)和高效固氮等的相關(guān)研究仍較匱乏。本研究以A1501 的Fur 蛋白為研究對象,通過比較Fur 蛋白及其編碼基因fur的表達(dá)特性,并開展功能鑒定,初步明確A1501 中fur影響鐵離子轉(zhuǎn)運和氧化脅迫適應(yīng)的作用機制,以期為進(jìn)一步解析A1501 根際環(huán)境適應(yīng)和高效固氮機制奠定理論基礎(chǔ)。
1.1.1 菌株與培養(yǎng)條件 施氏假單胞菌A1501為本實驗室長期保存菌株。Luria-Bertani(LB)培養(yǎng)基:10.0 g·L?1胰蛋白胨,5.0 g·L?1酵母抽提物,10.0 g·L?1氯化鈉。鐵限制培養(yǎng)基通過在LB 培養(yǎng)基中加入終濃度為200 μmol·L?1的二聯(lián)吡啶獲得。鐵過量培養(yǎng)基通過在LB 培養(yǎng)基中加入終濃度為100 μmol·L?1氯化鐵獲得。A1501 及其衍生菌株培養(yǎng)條件為LB培養(yǎng)基,30 ℃,220 r·min?1。
1.1.2 試劑與耗材 細(xì)菌RNA 提取試劑盒(innu-PREP RNA mini kit)購自Analytik Jena AG 公司;逆轉(zhuǎn)錄制備cDNA 試劑盒(HiScript 1st strand cDNA synthesis kit)及染料法熒光定量預(yù)混液(2×SYBR Mix TaqII)購自諾維贊公司;Fur 單抗由北京華大蛋白質(zhì)研發(fā)中心有限公司制備;羊抗鼠二抗購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;二聯(lián)吡啶購自Sigma公司;其余試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.1.3 主要儀器 渦旋振蕩儀(型號Vortex Genie2)購自美國Scientific Industries 公司;紫外可見分光光度計(型號U3010 Hitachi)購自日立高新技術(shù)公司;微量紫外可見分光光度計(型號Nano Drop 2000)購自Thermo Fisher 公司;恒溫培養(yǎng)箱(型號DH4000AB)購自HEB 西安禾普生物公司;臺式冷凍離心機(型號3K-15)購自Sigma-aldrich公司;PCR儀(型號9700)購自Bio-Rad 公司;小型離心機(型號5424)購自Eppendorf 公司;實時熒光定量PCR儀(型號7500)購自美國Applied Biosystems公司。
1.2.1 突變株構(gòu)建 通過同源雙交換的方法構(gòu)建fur缺失突變株,采用pLFRA3 載體構(gòu)建功能回補株,具體方法參照Zhan 等[24]的方法。突變株及回補株構(gòu)建涉及的引物見表1。
表1 本研究所用引物Table 1 Primers used in this study
1.2.2 實時熒光定量反轉(zhuǎn)錄PCR(qRT-PCR)引物鐵轉(zhuǎn)運系統(tǒng)及氧化脅迫調(diào)控相關(guān)基因表達(dá)差異涉及的qRT-PCR引物見表1。
1.2.3 生長曲線的測定 從固體平板上挑取A1501及其衍生菌單菌落接種至20 mL的LB液體培養(yǎng)基中,30 ℃、220 r·min?1過夜培養(yǎng);次日,將菌液于4 ℃、6 000g離心8 min 收集菌體,棄上清后用20 mL 0.85%的氯化鈉溶液在相同離心條件下清洗菌體2次;初始濃度OD600=0.1轉(zhuǎn)接菌液,每組設(shè)置3 個平行,于30 ℃、220 r·min?1條件下震蕩培養(yǎng),每隔1 h 取樣,測定菌液在600 nm 下的吸光值。根據(jù)所測得的數(shù)據(jù),以時間(h)為橫坐標(biāo),吸光值(OD600)為縱坐標(biāo)繪制生長曲線。
1.2.4Biolog碳源代謝差異分析 野生型A1501與fur突變株于LB 液體培養(yǎng)基中生長至對數(shù)中期,用接種環(huán)蘸取菌液并轉(zhuǎn)接至LB 固體平板,30 ℃過夜靜止培養(yǎng);次日,將平板上的新鮮菌體重懸于LB 液體培養(yǎng)基中并調(diào)節(jié)OD600至0.1;將菌懸液接種至預(yù)裝95 種已知碳源的GN2 Biolog 碳源鑒定板中;在30 ℃培養(yǎng)箱中靜置培養(yǎng)至4 h 和24 h時用Biolog酶標(biāo)儀讀取吸光值。
1.2.5 胞內(nèi)鐵含量測定 將調(diào)至OD600=1的A1501與fur突變株接種到500 mL LB 培養(yǎng)基中,調(diào)整終濃度為OD600=0.1,30 ℃、220 r·min?1培養(yǎng)6 h 后收集菌體。菌體用含有5 mmol·L?1乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA)的磷酸緩沖液清洗2遍,再用不含EDTA 的PBS緩沖液清洗兩遍,于50 mL 離心管中50 ℃過夜烘干。稱取干重后用濃硝酸和雙氧水將菌體溶解,經(jīng)蒸發(fā)和定容后用電感耦合等離子體質(zhì)譜測定鐵元素含量。
1.2.6 Western blotting 將過夜富集培養(yǎng)的野生型A1501液轉(zhuǎn)接(1%)至LB液體培養(yǎng)基中,并于菌體的指數(shù)生長期(約6 h)收集細(xì)胞沉淀并制備全細(xì)胞提取液。鐵過量和鐵限制條件下分別通過額外添加終濃度為100 μmol·L?1的FeCl3和200 μmol·L?1的二聯(lián)吡啶實現(xiàn)。利用12%(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù))的SDS 聚丙烯酰胺凝膠(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gels,SDS-PAGE)對等量的不同蛋白樣品(以定量分析目標(biāo)蛋白的表達(dá)量變化)進(jìn)行分離,然后通過半干電轉(zhuǎn)印的方法,將蛋白樣品從SDS-PAGE 轉(zhuǎn)移到聚偏二氟乙烯膜(polyvinylidene fluoride,PVDF)膜上。帶有蛋白樣品的PVDF 膜分別依次與阻斷緩沖液室溫孵育2 h、抗P. sttzeriA1501 Fur 蛋白的血清(anti-Fur antisera)在4 ℃孵育過夜后,再與抗鼠二抗室溫孵育2 h,最后采用HRP-DAB 化學(xué)顯色試劑盒對膜上可能存在的蛋白樣品進(jìn)行化學(xué)顯色。PVDF 膜在不同抗體或顯色緩沖液中切換時使用含0.1% Tween-20的Tris緩沖液洗滌膜3次,每次10 min。
1.2.7 過氧化氫沖擊 將A1501野生型、fur突變株以及回補株接入LB液體培養(yǎng)基,30 ℃、220 r·min?1搖床培養(yǎng),過夜;按1%接菌量,轉(zhuǎn)接到LB 液體培養(yǎng)基,培養(yǎng)至OD600=0.5左右;分別取1 mL菌體,用0.85%的氯化鈉溶液分別稀釋到10?1、10?2、10?3、10?4、10?5作為對照組,然后再取1 mL 菌體加入終濃度為20 mmol·L?1的H2O2沖擊10 min并且依次稀釋至10?5,用移液器分別取出8 μL點在LB平板上,30 ℃過夜培養(yǎng);培養(yǎng)16~20 h,用菌落計數(shù)儀拍照。1.2.8 qRT-PCR 反應(yīng) 根據(jù)細(xì)菌RNA 提取試劑盒說明書對目的菌株提取總RNA。根據(jù)逆轉(zhuǎn)錄制備cDNA 試劑盒說明書去除樣品中的基因組DNA并逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。以16S為內(nèi)參基因,測定菌株中目的基因的表達(dá)情況。每個反應(yīng)設(shè)置3個重復(fù)。
施氏假單胞菌A1501 基因組中存在一個Fur編碼基因fur,由PST3330 編碼,該基因在假單胞菌屬中的基因位置非常保守,均位于DNA 修復(fù)蛋白基因recN和外膜蛋白基因omlA之間,而大腸桿菌中fur的側(cè)翼基因與假單胞屬中fur側(cè)翼基因沒有同緣關(guān)系(圖1A)。A1501 中Fur 蛋白由134 個氨基酸殘基組成。分別選取了同屬的施氏假單胞菌ATCC 17588、銅綠假單胞菌PAO1、模式菌株大腸桿菌K12、棕色固氮菌CA6的Fur蛋白進(jìn)行了同源性比對,結(jié)果表明,A1501 與ATCC17588 的Fur蛋白一致性為100%,與銅綠假單胞菌、棕色固氮菌、大腸桿菌的Fur 蛋白一致性分別為90%、89%和60%,表明該蛋白在進(jìn)化上相對保守。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測表明,以上菌株中Fur 蛋白均含有5個α螺旋和5個β折疊結(jié)構(gòu)域(圖1B),其中β3折疊前具有典型的HHDH 離子結(jié)合區(qū)域,該區(qū)域的功能可能與Fur蛋白形成二聚體結(jié)構(gòu)有關(guān)。
圖1 不同細(xì)菌中fur基因的染色體位置以及Fur蛋白的二級結(jié)構(gòu)比較Fig.1 Comparative analysis of the chromosomal location offurgene and primary structure of Fur protein in different bacteria
為了探究A1501 中fur基因的表達(dá)對環(huán)境中鐵濃度的響應(yīng),分別通過在LB 培養(yǎng)基中添加100 μmol·L?1的FeCl3以及200 μmol·L?1鐵離子螯合劑——二聯(lián)吡啶來創(chuàng)造鐵過量和鐵限制條件,通過qRT-PCR 方法測定fur基因在不同條件下的表達(dá)水平。結(jié)果表明,相比正常的培養(yǎng)條件,在鐵限制條件下,fur基因的表達(dá)量提高了2.5 倍以上;而在鐵過量條件下,fur的表達(dá)量均下降了50%左右(圖2A)。此外,本研究制備了Fur 蛋白的單克隆抗體,通過Western blotting 實驗檢測了A1501在含有不同鐵離子濃度的LB 培養(yǎng)條件下Fur 蛋白的表達(dá)差異,結(jié)果表明,在鐵限制條件下Fur 蛋白的表達(dá)量明顯高于正常培養(yǎng)條件和鐵過量條件(圖2B)。以上結(jié)果表明,在施氏假單胞菌中,fur的表達(dá)受到環(huán)境中鐵含量的影響,在環(huán)境中鐵缺乏時,F(xiàn)ur 蛋白的表達(dá)量會升高;在環(huán)境中鐵過量時,F(xiàn)ur蛋白的表達(dá)量會降低。
圖2 A1501fur基因及Fur蛋白在不同鐵離子濃度培養(yǎng)條件下的表達(dá)水平Fig.2 Expression offurgene and Fur protein in wild type A1501 under different iron conditions
通過同源雙交換的方法構(gòu)建了fur基因的缺失突變株和功能回補菌株。采用GN2 Biolog 碳源鑒定板測定了fur基因突變對碳源代謝利用的影響,結(jié)果表明,在測定的95種碳源中,fur基因的突變改變了A1501 種類的碳源利用種類:與野生型A1501 相比,fur突變使菌株幾乎完全喪失了對碳源L-天冬氨酸的利用能力,但是對α-丁酮酸的利用能力增強。除此之外,fur的突變降低了糊精、α-D葡萄糖、丙酮酸甲酯、D,L-乳酸、D-丙氨酸、L-焦谷氨酸的利用能力(圖3)。這說明Fur 可能通過參與某些關(guān)鍵的細(xì)胞代謝過程影響了A1501 的碳代謝。
圖3 野生型A1501和fur突變株的碳源代謝譜比較Fig.3 Changes in the carbon metabolite profiling between wild type A1501 andfurmutant
本研究進(jìn)一步測定了野生型、突變株和回補株在鐵豐富培養(yǎng)基LB中的生長曲線。結(jié)果表明,在正常鐵濃度條件下,與野生型相比,fur突變株的生長情況沒有受到明顯的影響(圖4A),而在鐵限制條件下,fur突變株的生長受到影響(圖4B)。推測其可能的原因在于,F(xiàn)ur 在鐵限制條件下高表達(dá)以適應(yīng)鐵限制環(huán)境,而fur的基因缺失突變導(dǎo)致菌體無法合成足夠的Fur 蛋白,胞內(nèi)的鐵代謝紊亂從而影響菌株生長,具體機制值得進(jìn)一步研究。
圖4 野生型A1501、fur突變株和回補株在鐵過量和鐵限制條件下的生長情況Fig.4 Growth curves of wild type A1501,furmutant and C-furunder iron-excessive and iron-limited conditions
大量研究表明,F(xiàn)ur 對鐵元素的吸收發(fā)揮調(diào)控作用,以適應(yīng)鐵缺乏的環(huán)境。為了驗證fur突變是否對A1501 的鐵離子運輸產(chǎn)生影響,本研究采用電感耦合等離子體質(zhì)譜技術(shù)測定了A1501 和fur突變株胞內(nèi)的鐵離子濃度。結(jié)果如圖5 所示,在LB 條件下,與野生型相比,fur突變株的胞內(nèi)鐵含量上升了30%左右(圖5A),推測可能的原因是fur突變導(dǎo)致鐵離子的胞內(nèi)主動運輸能力增強,并且Fur 對鐵離子的轉(zhuǎn)運系統(tǒng)存在負(fù)調(diào)控作用。為了驗證上述推測,進(jìn)一步挑選了與鐵轉(zhuǎn)運相關(guān)的基因進(jìn)行了qRT-PCR 分析,其中PST_0819、PST_0820、PST_0821 和PST_0822 分別與編碼鐵轉(zhuǎn)運蛋白的TonB 系統(tǒng)關(guān)鍵組分高度同源,PST_4066是ABC 轉(zhuǎn)運系統(tǒng),PST_2271是一個細(xì)胞外膜特異性受體。qRT-PCR 發(fā)現(xiàn)其TonB 系統(tǒng)相關(guān)基因、ABC 轉(zhuǎn)運蛋白和TonB 依賴的受體表達(dá)量都顯著上升至少8倍以上(圖5B)。該結(jié)果表明,A1501中fur突變導(dǎo)致了鐵轉(zhuǎn)運的表達(dá)量上升從而導(dǎo)致了細(xì)胞內(nèi)鐵含量升高。
圖5 野生型A1501和fur突變株胞內(nèi)鐵元素水平Fig.5 Intracellular iron level between wild type A1501 andfurmutant
細(xì)胞內(nèi)過量的鐵會對細(xì)胞產(chǎn)生毒性:胞內(nèi)鐵離子含量的增加會引發(fā)芬頓反應(yīng),產(chǎn)生大量的自由基對細(xì)胞產(chǎn)生氧化損傷[25]。過氧化氫是可以引起細(xì)胞氧化損傷的成分,本研究檢測了野生型A1501、fur突變株及回補株在過氧化氫沖擊下的存活率并對fur基因突變前后菌株的氧化應(yīng)激耐受能力進(jìn)行了比較。結(jié)果如圖6 所示,fur基因突變后,菌株的抗氧化脅迫能力明顯減弱,經(jīng)H2O2沖擊后的fur突變株存活率較野生型明顯降低約3 個數(shù)量級,而回補株C-fur與野生型A1501 差異不顯著。
圖6 H2O2沖擊條件后野生型A1501、fur突變株及回補株存活率的比較Fig.6 Comparision of survival rates among wild type A1501,furmutant and complementary strain after treatment with H2O2
通過分析H2O2沖擊前后fur突變株的存活情況,我們推測fur可能參與了A1501 的抗氧化脅迫調(diào)控。本研究進(jìn)一步選取了A1501中可能與氧化脅迫相關(guān)的5 個基因——超氧化物歧化酶sodB(鐵超氧化物歧化酶)、sodC(銅超氧化物歧化酶)、katE(過氧化氫酶)基因和2 個谷胱甘肽過氧化物酶編碼基因(分別由PST_1360 和PST_2535編碼)進(jìn)行了qRT-PCR 分析。結(jié)果表明,在過氧化氫沖擊條件下,fur突變株中sodB基因表達(dá)顯著下調(diào)(圖7),其他基因的變化并不顯著。SodB 蛋白是以鐵離子為核心的超氧化物歧化酶,由此推測,fur可能通過某種機制調(diào)控sodB基因的表達(dá),并進(jìn)而影響了菌體的抗氧化脅迫能力。
圖7 qRT-PCR檢測H2O2沖擊條件下野生型A1501、fur突變株氧化脅迫相關(guān)基因表達(dá)Fig.7 Expression of oxidative-response genes in wild type A1501,furmutant after treated with H2O2by qRT-PCR
自然環(huán)境中,大多數(shù)微生物并不能完全“積極”地生長。正如對植物抗性研究一樣,關(guān)于微生物的研究也越來越多地考慮到脅迫耐受以及競爭關(guān)系和生理或生物干擾等諸多因素[26]。微量元素是所有植物生長的必需營養(yǎng)素,但與C、H、O 等大量元素不同,植物對微量元素的需求量少,即營養(yǎng)缺乏與過量毒害之間的含量范圍很?。?7]。對于植物根際微生物來說,如何高效適應(yīng)根際環(huán)境中不斷變化的微量元素顯得尤為重要。目前微生物學(xué)領(lǐng)域?qū)τ贔e 和Mg 等關(guān)鍵酶輔因子吸收、利用及相關(guān)穩(wěn)態(tài)的相關(guān)研究大多集中在致病細(xì)菌,如銅綠假單胞菌等[28]以及根瘤菌等物種[4]。
施氏假單胞菌A1501生物固氮的核心組分是固氮酶,其一般由鐵蛋白和鉬鐵蛋白兩個組分組成,其結(jié)構(gòu)中共需34 個鐵原子[29]。因此,A1501的高效固氮和根際定殖同樣需要很多含鐵蛋白的參與。在關(guān)于A1501 的早期研究中,Yan 等[18]發(fā)現(xiàn)該菌基因組上存在1個由11個轉(zhuǎn)錄單元構(gòu)成的49 kb的固氮島,該固氮島內(nèi)許多基因直接編碼了含鐵酶或鐵硫簇。關(guān)于這些蛋白表達(dá)模式的相關(guān)研究中,除了已知受到NifA-RpoN 的調(diào)控外[20,30],其他轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子是否對這些固氮相關(guān)基因表達(dá)存在直接或間接的調(diào)控作用等相關(guān)研究尚未開展。由于這些固氮相關(guān)基因(如nifHDK、nifU和hesB等)所編碼的產(chǎn)物蛋白的生物學(xué)活性的形成及生物學(xué)功能的發(fā)揮均需要大量的鐵作為輔基,因此我們推測這些基因的表達(dá)可能受到Fur 蛋白的影響。
Fur 蛋白經(jīng)證實是一個重要的全局調(diào)控因子。在不同的細(xì)菌中,其調(diào)控的靶標(biāo)存在差異。在革蘭氏陰性菌中,F(xiàn)ur 的一個基本功能是調(diào)控鐵吸收和轉(zhuǎn)運體系。通過控制鐵轉(zhuǎn)運系統(tǒng)的表達(dá)來維持菌體內(nèi)的鐵穩(wěn)態(tài)。本研究發(fā)現(xiàn),A1501中,fur的突變導(dǎo)致了細(xì)菌鐵吸收系統(tǒng)解除抑制,進(jìn)而導(dǎo)致了胞內(nèi)鐵含量的升高,說明在A1501 中fur的基本功能也與其他假單胞菌屬中Fur 蛋白功能相似,是鐵吸收的一個調(diào)控基因[31]。該基因可以抑制A1501中參與鐵吸收與運輸?shù)囊蕾囉谑辱F素的鐵吸收系統(tǒng),該系統(tǒng)一般由嗜鐵素、特異性的受體、ABC轉(zhuǎn)運系統(tǒng)和TonB 系統(tǒng)組成[32]。通過熒光定量數(shù)據(jù)分析,本研究發(fā)現(xiàn)A1501 中該系統(tǒng)與其他細(xì)菌中一樣,也受到了Fur 的負(fù)調(diào)控。由于細(xì)胞內(nèi)鐵含量的升高,可能導(dǎo)致了芬頓反應(yīng)產(chǎn)生過多的自由基對細(xì)胞產(chǎn)生了損害,降低了對氧化脅迫的抗性[33]。在幽門螺旋桿菌中,apo-Fur 可以激活sodB基因的表達(dá)[11],從而調(diào)控細(xì)胞對氧化脅迫的抗性,而A1501 中是否存在這一直接調(diào)控途徑還有待進(jìn)一步研究。
通過正常條件下和鐵缺乏條件下生長曲線的測定,本研究發(fā)現(xiàn),突變株對鐵缺乏的脅迫更敏感,這與前面的fur突變導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)鐵含量升高的結(jié)果并不矛盾,分析原因為Fur 的缺失引起了包括鐵吸收和利用在內(nèi)的鐵穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的紊亂,由于鐵吸收是受到Fur 負(fù)調(diào)控的,所以導(dǎo)致了細(xì)胞內(nèi)鐵含量的升高;而其他Fur 調(diào)控涉及TCA 循環(huán)、呼吸作用等的基因有一大部分是受到了Fur 的正調(diào)控。由于fur的缺失,A1501 的維持鐵吸收和鐵代謝的穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)已經(jīng)被破壞,一方面導(dǎo)致了突變株細(xì)胞內(nèi)鐵含量的升高,另一方面導(dǎo)致了細(xì)胞對缺鐵環(huán)境的抗性降低。
綜上所述,本研究初步解析了A1501 中Fur蛋白在鐵離子運輸和氧化脅迫適應(yīng)中的功能,即Fur 蛋白在高濃度鐵環(huán)境下表達(dá)下調(diào),對鐵轉(zhuǎn)運基因表達(dá)存在負(fù)調(diào)控作用,維持了菌株鐵穩(wěn)態(tài)平衡,此外Fur 通過正調(diào)節(jié)sodB基因表達(dá)參與菌株的氧化脅迫適應(yīng),從而降低鐵過量導(dǎo)致的芬頓反應(yīng)對細(xì)胞的損害。未來的研究將在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步聚焦Fur 蛋白調(diào)控相關(guān)基因的分子機制,同時探索Fur 蛋白對固氮酶表達(dá)的影響,為進(jìn)一步探究A1501適應(yīng)生境鐵并調(diào)節(jié)固氮過程的分子機制奠定理論基礎(chǔ)。