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白云鄂博稀土礦來源放線菌Actinorectispora metalli 的次生代謝產(chǎn)物研究

2022-05-25 11:29何江波石洋銖康大偉牛燕芬王紀(jì)愛畢曉旭曹艷茹
關(guān)鍵詞:稀土礦產(chǎn)物梯度

何江波,石洋銖,康大偉,牛燕芬,王紀(jì)愛,陳 秀,秦 靜,畢曉旭,欒 杰,曹艷茹**

(1.昆明學(xué)院,云南 昆明 650214;2.云南省疾病預(yù)防與控制中心,云南 昆明 650022)

白云鄂博稀土礦是一座世界罕見的多金屬共生礦床,礦產(chǎn)資源十分豐富,被譽(yù)為“世界稀土之鄉(xiāng)”[1],其鈮?鐵礦床的稀土資源居世界第一[2].除此以外,該礦還含有豐富的銅礦、金礦等資源.白云鄂博稀土礦微生物是特殊的環(huán)境微生物,對這一特殊礦區(qū)的微生物資源進(jìn)行多樣性的研究,有利于我們研究其次生代謝產(chǎn)物的多樣性.特殊環(huán)境微生物具有獨(dú)特的新陳代謝途徑、適應(yīng)機(jī)制,因此會產(chǎn)生具有新穎結(jié)構(gòu)的次生代謝產(chǎn)物,可以為藥物的研發(fā)提供參考.放線菌Actinorectispora metalli是我們從白云鄂博礦區(qū)分離得到的一個(gè)放線菌新種[3],前期研究表明該菌的典型菌株KC 198T在酵母膏?蛋白胨培養(yǎng)基中發(fā)酵產(chǎn)蛋白酶活性較好,分別在第7 d 和第8 d 時(shí)酶活性較高,其蛋白酶酶活性在28 ℃時(shí)達(dá)到最高.研究結(jié)果表明A.metalliKC 198T可作為工業(yè)酶制劑的菌株來源[4].因此,我們課題組繼續(xù)對A.metalliKC 198T進(jìn)行深入研究,挖掘高活性的次生代謝產(chǎn)物,為該菌的深入開發(fā)奠定基礎(chǔ).

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 菌株 自白云鄂博稀土礦中分離,16S rRNA 基因序列分析結(jié)果表明KC 198 與印度放線菌(Actinorectispora indicaYIM 75 728)相似性最高,為98.4%.經(jīng)多相分類實(shí)驗(yàn),命名為Actinorectispora metallisp.nov[3],菌種目前保存于昆明學(xué)院農(nóng)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院菌種庫(編號為KC 198).

1.1.2 培養(yǎng)基 ISP2 培養(yǎng)基(1 L):酵母膏4 g,酵母浸粉5 g,葡萄糖4 g,動(dòng)物蛋白胨2 g,植物蛋白胨1 g,微量鹽1 mL,復(fù)合維生素少許,自來水1 000 mL,pH 7.2.

PDB 培養(yǎng)基(1 L):土豆200 g,葡萄糖20 g,自來水1 000 mL,微量鹽1 mL.

1.1.3 主要試劑和儀器 1.1-二苯基-2-苦肼基自由基(梯希愛化成工業(yè)發(fā)展有限公司);柱層析用硅膠(0.054~0.077 mm)、薄層層析用硅膠GF254 均為青島海洋化工廠生產(chǎn),Sephadex LH-20 (25~100 μm)為Pharmacia 公司產(chǎn)品;RP-18 (40~60 μm)為日本Daiso 產(chǎn)品.色譜試劑:甲醇、乙腈(上海星可高純?nèi)軇┯邢薰?.顯色劑為H2SO4(10%)的乙醇溶液.分析純甲醇超高壓液相色譜三重四級桿串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用儀器(英國Waters 公司,Xevo TQ-S);Avance 600 MHz 核磁共振儀(TMS 作為內(nèi)標(biāo));島津UV-2401 紫外分光光度計(jì);Hanbon-NP7000C 制備液相(漢邦儀器公司),制備柱(Zorbax XDB-C-18,φ21.2×150 mm,5 μm);旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(東京理化,N-1100);搖床(上海智城分析儀器制造有限公司,ZWY-2102);萬分之一電子天平(上海越平電子天平,F(xiàn)A1004B).

1.2 方法

1.2.1 菌株活化與種子液的培養(yǎng) 將保存于?20 ℃的菌株接種于PDA 平板,28 ℃,7 d,以進(jìn)行活化.然后將單菌落接種至改良ISP2 培養(yǎng)基,恒溫?fù)u床28 ℃,180 r/min,3 d,作為種子液.

1.2.2 菌株發(fā)酵 將種子液接種至PDB 培養(yǎng)基(121 ℃,滅 菌30 min,pH 7.2),培 養(yǎng)8 d,28 ℃,180 r/min,發(fā)酵液采用紗布過濾,收集濾液,得發(fā)酵液25 L,然后將發(fā)酵液濃縮至2 L.

1.2.3 提取與分離 浸膏采用等體積的乙酸乙酯萃取3 次,濃縮萃取液,得乙酸乙酯浸膏3.5 g.水層再次采用等體積正丁醇萃取3 次,濃縮萃取液,得正丁醇浸膏12.5 g.乙酸乙酯浸膏采用甲醇溶解后,過濾,除去不溶物,經(jīng)Sephadex LH-20 凝膠柱色譜初步分離,根據(jù)薄層色譜(TLC),10%濃硫酸乙醇溶液顯色合并相似成分,得3 個(gè)組分Fr A~C.Fr A 組 分(238.3 mg)采用硅膠柱色譜(0.054~0.077 mm,φ2 cm×50 cm)再次純化,以石油醚?丙酮系統(tǒng)梯度洗脫(體積比10∶1~0∶1),根據(jù)TLC合并相似組分,再經(jīng)Sephadex LH-20 柱(MeOH)分離后得到化合物1(4.3 mg).Fr C 經(jīng)RP-18 反相柱色譜(甲醇?水10%~100%,梯度洗脫,每梯度200 mL)分離,經(jīng)TLC (GF254硅膠板)檢測后為樣品Fr C1(162.2 mg),采用制備液相進(jìn)一步分離,40%色譜甲醇等度洗脫(流速10 mL/min,tR12′33′′),得化合物2(7.8 mg).Fr C2 質(zhì)量18.9 mg,采用制備液相分離純化,以10%色譜甲醇等梯度洗脫(流速10 mL/min,tR10′57′′)得化合物3(9.5 mg).正丁醇浸膏采用甲醇溶解,過濾,棄去不溶物,采用Sephadex LH-20 凝膠柱色譜脫糖,得到Fr A-F 部分.Fr A 部分采用硅膠柱色譜分離,洗脫劑為石油醚?丙酮體系(體積比10∶1~0∶1,梯度洗脫),得到FrA1-3,F(xiàn)rA-1 再次采用Sephadex LH-20 凝膠柱色譜純化得到化合物4(11 mg).FrA-2 采用Sephadex LH-20凝膠柱色譜純化得到化合物5(8.2 mg).Fr C 1.2 g,采用RP-18 (10%~100%,梯度洗脫,每個(gè)梯度200 mL),根據(jù)TLC 顯色合并相似部分,然后采用硅膠柱色譜法石油醚?丙酮梯度洗脫(體積比5∶1~0∶1),得化合物6(25.8 mg).Fr D 部分采用Sephadex LH-20 凝膠柱色譜脫色,根據(jù)TLC 合并相似組分,然后采用制備液相70%甲醇水等度洗脫純化(流速10 mL/min,tR14′00′′),得化合物7(9.0 mg).以上化合物結(jié)構(gòu)見圖1.

圖1 化合物1~7 的結(jié)構(gòu)式Fig.1 Chemical structure of compounds 1?7

1.2.4 抗氧化活性實(shí)驗(yàn) 稱取一定量的DPPH粉末,用甲醇溶解,配成1 mmol/L 的母液.測定時(shí)用甲醇稀釋10 倍,配成0.1 mmol/L 的DPPH 反應(yīng)液.取用甲醇稀釋的不同濃度樣品0.5 mL 于5 mL離心管中,加入2 mL 的DPPH 工作液,混勻,振蕩30 min,在517 nm 處測定吸光值.然后按照公式計(jì)算DPPH 自由基清除率,并計(jì)算IC50值.

其中:A0—對照組吸光值,0.5 mL 甲醇+2 mL DPPH;Ax0—0.5 mL 樣品+2 mL 甲醇;Ax—0.5 mL 樣品+2 mL DPPH.

2 結(jié)果與分析

2.1 新化合物的結(jié)構(gòu)鑒定

化合物1,無色油狀物,易溶于甲醇;ESI-MS:m/z365 [M-H]?;HR-ESI-MS:m/z401.100 7,[M+Cl]?,calcd.for根據(jù)1H NMR 和13C NMR 推測該化合物為含有萘環(huán)的結(jié)構(gòu),同時(shí)還含有一個(gè)β型(δ=5.04,J=6.0 Hz)葡萄糖的單元.根據(jù)質(zhì)譜推斷該化合物含有18 個(gè)碳,其中包含一個(gè)萘環(huán)單元,一個(gè)葡萄糖單元,以及兩個(gè)甲氧基.再次結(jié)合1H NMR 分析,萘環(huán)上有5 個(gè)未取代的H 信號,兩個(gè)甲氧基信號在δ=3.96 (3H,s,1-OCH3)和3.99 (3H,s,4-OCH3).根據(jù)1H-1H COSY譜可知,δH=8.11 與δH=7.35 相 關(guān),δH=7.35 與δ=7.49 相關(guān),δH=7.49 與δH=8.00 相關(guān).因此推斷δC=123.1 與δC=125.0 連接,δC=125.0 與δC=127.9 連接,δC=127.9 與δC=122.1 連接(圖2).根據(jù)HMBC 圖譜,確定δH=3.96 與δC=138.2 連接,δH=3.99 與δC=153.8連接.δH=5.04 與δC=147.5 存在相關(guān),確定糖單元的連接位置(圖2).

圖2 化合物1 的重要1H?1H COSY(─)和HMBC(→)相關(guān)Fig.2 The key 1H?1H COSY(─) and HMBC(→) correlations of compound 1

因此化合物1的結(jié)構(gòu)被確定,并命名為1,4-dimethoxy-2-hydroxy naphthalene-2-O-β-D-glucopyra noside,該化合物為新化合物,與文獻(xiàn)化合物1,2,4-trihydroxynaphthalene-2-O-β-D-glucopyranoside [5]相似.核磁數(shù)據(jù)為1H NMR (600 MHz,CD3OD)δ:8.11(1H,dt,J=6.0,0.8 Hz,H-5),8.00 (1H,dt,J=6.0,0.6 Hz,H-8),7.49 (1H,ddd,J=6.0,5.0,0.8 Hz,H-7),7.35 (1H,ddd,J=6.0,5.0,0.8 Hz,H-6),6.99 (1H,s,H-3),5.04 (1H,d,J=6.0 Hz,H-1′),3.99 (3H,s,4-OCH3),3.96 (3H,s,1-OCH3),3.91 (1H,dd,J=9.0,1.8 Hz,H-6′b),3.68 (1H,dd,J=9.0,4.8 Hz,H-6′a),3.56 (1H,dd,J=7.2,6.0 Hz,H-2′),3.50 (1H,t,J=6.6 Hz,H-3′),3.46 (1H,ddd,J=7.2,4.8,1.8 Hz,H-5′),3.38 (1H,dd,J=7.2,6.6 Hz,H-4′);13C NMR(150 MHz,CD3OD)δ:138.2 (C-1),147.5 (C-2),99.2(C-3),153.8 (C-4),123.1 (C-5),125.0 (C-6),127.9 (C-7),122.1 (C-8),130.3 (C-9),123.8 (C-10),103.7 (C-1′),75.2 (C-2′),78.2 (C-3′),71.6 (C-4′),78.5 (C-5′),62.7 (C-6′),62.2 (1-OCH3),56.3 (4-OCH3).

2.2 已知化合物的核磁數(shù)據(jù)

化合物2:無色油狀物,易溶于甲醇.1H NMR(600 MHz,CD3OD)δ:7.93 (1H,d,J=7.2 Hz,H-8),7.65~7.62 (2H,m,H-5,H-6),7.42 (1H,m,H-7),4.92 (1H,dd,J=6.0,3.0 Hz,H-4),2.86 (1H,ddd,J=13.2,5.4,3.6 Hz,H-2a),2.62 (1H,ddd,J=13.2,7.8,3.6 Hz,H-2b),2.36 (1H,m,H-3a),2.11 (1H,m,H-3b).13C NMR (150 MHz,CD3OD)δ:200.2 (C-1),36.4 (C-2),33.1 (C-3),68.4 (C-4),127.8 (C-5),135.4(C-6),128.7 (C-7),128.8 (C-8),129.2 (C-9),148.1 (C-10).以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)化合物[6]一致,故鑒定為4-hydroxy-tetralone.

化合物3:白色粉末,易溶于甲醇.1H NMR(600 MHz,CD3OD)δ:7.49 (1H,d,J=6.0 Hz,H-8′),7.35 (1H,d,J=6.0 Hz,H-5′),7.09 (1H,t,J=6.0 Hz,H-6′),7.04 (1H,s,H-2′),7.01 (1H,t,J=6.0 Hz,H-7′),4.19 (1H,t,J=3.6 Hz,H-9),3.46 (1H,dd,J=10.8,2.4 Hz,H-6),3.40 (1H,dt,J=12.0,6.0 Hz,H-3),3.10 (1H,dd,J=11.4,3.6 Hz,H-10),2.99 (1H,ddd,J=9.0,7.2,1.8 Hz,H-3),2.20 (1H,dd,J=8.4,4.8 Hz,H-10),1.85 (1H,m,H-5),1.75 (1H,m,H-4),1.52 (1H,m,H-5),1.20 (1H,m,H-4);13C NMR (150 MHz,CD3OD)δ:166.8 (C-1),44.6 (C-3),20.9 (C-4),29.8 (C-5),58.1 (C-6),170.2 (C-7),57.8 (C-9),28.3(C-10),107.9 (C-1′),124.8 (C-2′),136.6 (C-4′),111.0 (C-5′),121.3 (C-6′),118.1 (C-7′),118.6 (C-8′),127.2 (C-9′).以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)化合物[7]一致,故鑒定為環(huán)(L-色氨酸-L-脯氨酸).

化合物4:白色粉末,易溶于DMSO.1H NMR(600 MHz,DMSO-d6)δ:10.94 (1H,s,NH),7.39 (1H,d,J=7.5 Hz,H-6),5.45 (1H,d,J=7.5 Hz,H-5);13C NMR (150 MHz,DMSO-d6)δ:151.6 (C-2),164.4 (C-4),142.3 (C-5),100.3 (C-6).以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)化合物[8]一致,故鑒定為尿嘧啶.

化合物5:13C NMR (150 MHz,DMSO-d6)δ:151.5 (C-2),165.0 (C-4),107.7 (C-5),137.8 (C-6),11.8 (CH3-5).以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)化合物[9]一致,故鑒定為胸腺嘧啶.

化合物6:白色粉末,易溶于DMSO.1H NMR(600 MHz,DMSO-d6)δ:8.34 (1H,s,H-8),8.13 (1H,s,H-2),7.34 (2H,s,NH2),5.87 (1H,d,J=6.0 Hz,H-1′),5.48 (1H,d,J=6.0 Hz,OH-2′),5.42 (1H,dd,J=7.2,4.8 Hz,OH-5′),5.22 (1H,d,J=4.8 Hz,OH-3′),4.60 (1H,d,J=6.0 Hz,H-2′),4.14 (1H,dd,J=7.8,3.6 Hz,H-3′),3.96 (1H,q,J=3.0 Hz,H-4′),3.66 (1H,dt,J=12.0,3.6 Hz,H-5′),3.55 (1H,ddd,J=11.4,6.6,3.6 Hz,H-5′);13C NMR (150 MHz,DMSO-d6)δ:152.4 (C-2),149.1 (C-4),119.4 (C-5),156.2 (C-6),139.9 (C-8),87.9 (C-1′),73.5 (C-2′),70.7 (C-3′)85.9 (C-4′),61.7 (C-5′).以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)化合物[10]一致,故鑒定為β-adenosine.

化合物7:無色油狀物,易溶于甲醇.1H NMR(600 MHz,CD3OD)δ:7.56 (1H,d,J=7.8 Hz,H-4),7.32 (1H,d,J=7.8 Hz,H-7),7.09 (1H,s,H-2),7.07(1H,t,J=7.8 Hz,H-7),6.99 (1H,t,J=7.8 Hz,H-5),3.94 (1H,m,H-11),3.55 (1H,dd,J=10.8,3.6 Hz,H-12a),3.48 (1H,dd,J=10.8,6.0 Hz,H-12b),2.96 (1H,dd,J=10.8,6.0 Hz,H-10a),2.85 (1H,1H,dd,J=10.8,6.0 Hz,H-10b);13C NMR (150 MHz,CD3OD)δ:124.3 (C-2),112.6 (C-3),119.7 (C-4),119.6 (C-5),122.4 (C-6),112.3 (C-7),138.3 (C-8),129.2 (C-9),30.7 (C-10) 74.0 (C-11),67.0 (C-12).以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)化合物[11]一致,故鑒定為3-(2,3-dihydroxypropyl)indole.

2.3 抗DPPH 自由基結(jié)果實(shí)驗(yàn)采用DPPH 自由基清除實(shí)驗(yàn)評價(jià)化合物1~7的抗氧化能力.單體化合物分別配成50、40、30、20 μmol/L 的溶液.分別添加50 μL 到96 孔板,再加入200 μL DPPH 液體.在暗處放置30 min,再用酶標(biāo)儀于517 nm 處測定吸光度,并計(jì)算清除率.實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,化合物1~7均未顯示出DPPH 自由基清除活性.

3 討論與結(jié)論

微生物次生代謝產(chǎn)物是藥物的重要先導(dǎo)化合物來源,鏈霉菌的次生代謝產(chǎn)物被廣泛用作臨床藥物.從常規(guī)微生物資源中尋找藥物先導(dǎo)化合物面臨巨大的調(diào)整,因此我們選擇白云鄂博稀土礦中的微生物資源 進(jìn)行挖 掘.通過對A.metalliKC 198T進(jìn)行PDB 液體發(fā)酵產(chǎn)物研究,發(fā)現(xiàn)7 個(gè)化合物,其中化合物1為新化合物,且化合物1的類似物1,2,4-trihydroxynaphthalene-2-O-β-D-glucopyranosides 具有抗氧化活性和拮抗Aβ42 疏水肽聚集活性,被認(rèn)為可以作為治療阿爾治海默癥的先導(dǎo)物[5].但是本次研究中未發(fā)現(xiàn)化合物1具有顯著的抗氧化活性,初步推斷其原因是酚羥基被甲基化后活性消失.另外,β-adenosine 也在本項(xiàng)研究中分離得到,該化合物在Domondon DL[10]的報(bào)道中,具有促進(jìn)蘑菇生長的作用.從A.metalliKC 198T良好的產(chǎn)酶活性,到次生代謝產(chǎn)物研究,均表明該菌具有較高的研究價(jià)值.

本研究對白云鄂博稀土礦放線菌A.metalliKC 198T的次生代謝產(chǎn)物進(jìn)行了初步的研究,運(yùn)用現(xiàn)代分離分析方法共分離并鑒定了7 個(gè)化合物成分,其中化合物1為新化合物,其余化合物為已知化合物.通過抗氧化活性測試表明,所分離得到的化合物均無顯著的抗氧化活性.以上研究結(jié)果為進(jìn)一步挖掘白云鄂博稀土礦微生物資源奠定了物質(zhì)研究基礎(chǔ),同時(shí)也豐富了鏈霉菌的次生代謝產(chǎn)物.

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