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458份小麥品種(系)抗病性狀功能基因的KASP標(biāo)記檢測

2022-05-12 13:06張宏芝王立紅李劍峰樊哲儒張躍強(qiáng)
新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年4期
關(guān)鍵詞:白粉病抗性種質(zhì)

王 重,張宏芝,高 新,時 佳,王立紅,李劍峰,樊哲儒,趙 奇,張躍強(qiáng)

(1.新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院核技術(shù)生物技術(shù)研究所,烏魯木齊 830091;2.農(nóng)業(yè)部荒漠綠洲作物生理生態(tài)與耕作重點實驗室,烏魯木齊 830091;3.新疆農(nóng)作物生物技術(shù)重點實驗室,烏魯木齊 830091)

0 引 言

【研究意義】新疆地處亞洲大陸中心,降雨量少,蒸騰量大,氣候干燥,小麥病害發(fā)生較少[1],近年來由于氣候變化、栽培方式改變、致病菌種變異以及抗病性喪失等因素,小麥種植區(qū)白粉病和銹病發(fā)生頻率和病害有所加重[2]。目前防治小麥白粉病和銹病病害的主要措施是農(nóng)藥,將常規(guī)育種手段與分子輔助選擇育種技術(shù)相結(jié)合,選育抗病分子標(biāo)記聚合的育種材料或品種,對于新疆的小麥生產(chǎn)有實際意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】競爭性等位基因特異性PCR(kompetitive allele specific PCR,KASP)是一種對特定位點處SNP以及插入和缺失(insertion-deletion,InDels)進(jìn)行雙等位基因分型技術(shù),可針對絕大多數(shù)基因組DNA的SNPs和特定位點InDels,準(zhǔn)確分析雙等位基因,具有穩(wěn)定性好、準(zhǔn)確性高、無需合成特異熒光探針、檢測成本較低和高通量等優(yōu)點[3]。李瑋等[4]對KASP對94份小麥育種親本的功能基因進(jìn)行分子檢測表明,與抗性相關(guān)的Lr68優(yōu)異等位變異占比為15%,未檢測到Lr34和Pm21陽性材料。利用KASP標(biāo)記技術(shù)對120份小麥品種(系)的重要性狀功能基因進(jìn)行檢測,69份材料含有Lr14a,3份材料含Lr68基因,未發(fā)現(xiàn)含有Yr15基因材料[5]。高潔等[6]對小麥4個多效抗病基因分子標(biāo)記進(jìn)行了轉(zhuǎn)化和再開發(fā),并對其進(jìn)行了驗證?!颈狙芯壳腥朦c】目前通過KASP檢測的材料多以當(dāng)?shù)刂髟云贩N、育種骨干親本及衍生品系為主,針對新疆小麥品種(系)及育種親本的抗白粉病、銹病基因分子檢測少見報道。需采用KASP標(biāo)記技術(shù)檢測抗白粉病基因Pm21、抗條銹病基因Yr15和抗葉銹病基因Lr14a、Lr68?!緮M解決的關(guān)鍵問題】以56份新疆小麥品種、304份小麥品系和98份引進(jìn)種質(zhì)資源為試驗材料,研究不同小麥品種(系)抗病性狀功能基因的分布狀態(tài),分析小麥品種(系)的抗病功能基因,為小麥抗病育種提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材 料

1.1.1 小麥品種(系)

參試小麥品種(系)總計458份材料,其中新疆審定小麥品種56份,高代穩(wěn)定品系304份,引進(jìn)種質(zhì)資源98份。

1.1.2 KASP標(biāo)記

抗白粉病標(biāo)記1個,Pm21;條銹病抗性標(biāo)記1個,Yr15;葉銹病抗性標(biāo)記2個,Lr14a和Lr68。引物參照中國農(nóng)科院作物科學(xué)研究所夏先春老師提供序列由上海生工合成。

1.2 方 法

1.2.1 小麥DNA提取

參試小麥品種(系)播種于育苗盤中,待其生長至3葉1心取葉片置于1.5 mL離心管中,鋼珠震蕩破碎,采用PVP40(聚乙烯吡咯烷酮40)法[7]提取小麥基因組DNA。DNA提取完成后使用Nanodrop one對DNA濃度測定,并定容至100 ng/μL。

1.2.2 抗性標(biāo)記檢測

以參試小麥品種(系)DNA為模板,選擇中國春等5個已知分子標(biāo)記品種作為陽性對照,采用擴(kuò)增子拯救多重PCR(amplicon rescued multiplex PCR,arm-PCR)技術(shù)對小麥基因組DNA的抗性標(biāo)記檢測[8]。

1.2.2.1 PCR體系

PCR反應(yīng)體系10 μL,包括DNA模板2 μL,2×KASP Mix 5 μL,引物混合液0.1 μL,ddH2O 2.9 μL。引物混合液由合成的FAM引物(100 μM)、HEX引物(100 μM)、通用引物(100 μM)和ddH2O按照12∶12∶30∶46的比例進(jìn)行混合制成。

1.2.2.2 PCR程序

預(yù)變性94℃ 5 min;變性94℃ 20 sec,退火65~56℃1 min,每個循環(huán)降低1℃,10個循環(huán);變性94℃ 20 sec,退火56℃ 1 min,30個循環(huán)。

2 結(jié)果與分析

2.1 抗白粉病基因Pm21檢測

研究表明,僅有2份材料檢測到Pm21標(biāo)記,約占群體的0.44%,且這2份材料均為審定品種??拱追鄄》肿訕?biāo)記Pm21在審定品種中有極少量分布,但是在目前的高代穩(wěn)定品系中,以及引進(jìn)種質(zhì)資源中,均未發(fā)現(xiàn)白粉病抗性標(biāo)記Pm21。圖1

注:紅色:無Pm21;藍(lán)色:攜帶Pm21

2.2 抗條銹病基因Yr15檢測

研究表明,14份材料檢測到Y(jié)r15標(biāo)記,約占群體的3.06%,其中,審定品種7份,高代穩(wěn)定材料6份,引進(jìn)種質(zhì)資源1份。雖然條銹病抗性標(biāo)記Yr15在參試品種(系)中的分布頻率較低,但是無論在審定品種或者高代品系中均存在較為穩(wěn)定的分布。圖2

2.3 葉銹病抗性基因檢測

2.3.1 抗性標(biāo)記Lr14a檢測

研究表明,22份材料檢測到Lr14a標(biāo)記,約占參試材料的4.80%。其中,審定品種21份,引進(jìn)種質(zhì)資源1份。Lr14a較為集中的分布于冬小麥審定品種中,共有20份材料,其余2份材料分布于春小麥品種和引進(jìn)種質(zhì)資源中。圖3

注:紅色:攜帶Yr15;藍(lán)色:無Yr15

注:紅色:攜帶Lr14a;藍(lán)色:無Lr14a

2.3.2 抗性標(biāo)記Lr68檢測

研究表明,有48份材料檢測到Lr68標(biāo)記,約占供試材料的10.48%。其中,審定品種4份,高代品系15份,引進(jìn)種質(zhì)資源29份。雖然新疆小麥審定品種中Lr68分布較為少見,但是在目前的高代品系和引進(jìn)種質(zhì)資源中Lr68的分布頻率顯著增加。圖4

注:紅色:攜帶Lr68;藍(lán)色:無Lr68

2.4 小麥抗病功能基因分布

研究表明,抗葉銹病功能基因Lr68的分布頻率最高,達(dá)到了10.48%,其次是葉銹病抗性基因Lr14a,分布頻率為4.80%,抗條銹病基因Yr15分布頻率為3.06%,抗白粉病功能基因Pm21分布頻率最低,僅為0.44%。在不同小麥類型中,冬小麥抗葉銹病功能基因Lr14a的分布頻率較高,抗白粉病功能基因Pm21僅有的2份材料均為冬小麥,而春小麥中,抗條銹病功能基因Yr15和抗葉銹病基因Lr68的分布頻率較高且多于冬小麥。根據(jù)參試小麥品種(系)不同來源分析,在審定品種中4個抗病基因均有分布,引進(jìn)種質(zhì)資源中未見白粉病抗性基因Pm21,條銹病抗性基因Yr15及葉銹病抗性基因Lr14a僅發(fā)現(xiàn)1份材料,而高代品系中Pm21和Lr14a均未檢測到。表1

表1 小麥抗病功能基因分布狀態(tài)Table 1 Distribution of disease-resistance genes in wheat

3 討 論

小麥抗白粉病基因Pm21位于小麥6A染色體上,來源于簇毛麥[9-10]。由于小麥白粉病菌變異性較強(qiáng),部分小麥抗白粉病基因抗性逐漸減弱甚至喪失,而Pm21在近幾年的鑒定中仍然保持了很好的抗性,且具有較廣的抗譜,可以作為小麥抗白粉病育種的重要抗性來源[11]。但Pm21在國內(nèi)小麥品種中分布較少,李瑋等[4]對94份小麥品種或高代品系進(jìn)行檢測,未發(fā)現(xiàn)Pm21陽性材料,王鑫等[12]對305份國內(nèi)外小麥種質(zhì)進(jìn)行鑒定,僅發(fā)現(xiàn)1份材料含有Pm21。研究中在458份小麥品種(系)中僅檢測到2份材料攜帶Pm21,在新疆小麥品種(系)中,Pm21的分布極少,與前人研究結(jié)果基本一致。

小麥抗條銹病功能基因Yr15位于小麥1B染色體上,來源于野生二粒小麥[13]。目前Yr15是少數(shù)幾個對于中國條銹菌流行小種仍然保持較好抗性的基因[14],對于抗條銹病小麥育種而言,Yr15是極其重要的抗性來源。鄒景偉等[5]對120份小麥品種(系)進(jìn)行了檢測,未發(fā)現(xiàn)含有Yr15材料,王鑫等[12]在305份國內(nèi)外小麥種質(zhì)中發(fā)現(xiàn)10份攜帶Yr15材料。研究在458份小麥品種(系)中檢測到含有Yr15材料14份,這與王鑫等[12]的結(jié)果基本一致,Yr15分布頻率均為3%左右。在高代品系中有6份材料含有Yr15,Yr15通過雜交等手段成功導(dǎo)入后代材料中,進(jìn)一步工作中可以加強(qiáng)分子標(biāo)記輔助選擇,篩選攜帶Yr15后代材料,提升新品種條銹病抗性。

小麥抗葉銹病功能基因Lr14a位于小麥7B染色體上,來源于野生二粒小麥[15-16];Lr68也位于小麥7B染色體上,來源于野生二粒小麥,屬于慢銹病基因,即反應(yīng)型表現(xiàn)出感病,但嚴(yán)重度較低[17]。Lr14a和Lr68在小麥中的分布較為廣泛,李瑋等[4]對94份小麥品種或高代品系進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)Lr14a陽性率約為50%,Lr68為15%,鄒景偉等[5]在120份小麥種質(zhì)中發(fā)現(xiàn)69份材料含有Lr14a,3份材料含有Lr68。研究在458份小麥材料中檢測到含有Lr14a材料22份,Lr68材料48份,這與前人結(jié)果并不一致??赡苁怯捎诖盒←湶牧现蠰r14a的分布頻率太少,導(dǎo)致整體分布頻率偏低,而Lr68在引進(jìn)種質(zhì)資源中分布頻率較高,并成功導(dǎo)入高代品系中,在高代品系中分布頻率也提高。

4 結(jié) 論

小麥抗病基因Pm21、Yr15和Lr14a的分布頻率仍然較低,均低于5%,而Lr68的分布頻率雖然超過10%,但是在審定品種中分布頻率也并不高。

新疆小麥品種(系)中抗病基因的分布頻率較低,約為5%。從458份小麥品種(系)中檢測到含有Pm21材料2份,含有Yr15材料14份,含有Lr14a材料22份,含有Lr68材料48份。

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