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新型冠狀病毒肺炎的代謝組學(xué)研究進(jìn)展*

2022-04-15 13:39:06王藝霏王藝婷徐攀洋涂哲禹許建成
國際檢驗醫(yī)學(xué)雜志 2022年7期
關(guān)鍵詞:精氨酸代謝物組學(xué)

王藝霏,夏 薇,王藝婷,徐攀洋,涂哲禹,許建成△

1.吉林大學(xué)第一醫(yī)院檢驗科,吉林長春 130021;2.北華大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院,吉林吉林 132013

新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)是由新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)感染所致的疾病,截至2022年2月18日,全球已報告418 650 474例確診,其中5 856 224例死亡[1],其大流行導(dǎo)致全球發(fā)生健康危機(jī)。目前,實時熒光定量PCR檢測SARS-CoV-2核酸陽性作為診斷COVID-19的金標(biāo)準(zhǔn),在篩查高危人群及追蹤疑似病例等方面發(fā)揮重要作用。組學(xué)在傳染病診斷方面是一個不斷發(fā)展的科學(xué)領(lǐng)域。研究顯示,對丙型肝炎病毒感染患者進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的分析,可為其發(fā)病機(jī)制和治療靶點的研究提供新的思路[2]。大量基于SARS-CoV-2 RNA或蛋白抗原的替代檢測方法逐漸被開發(fā)處理,組學(xué)方法如蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)已用于尋找COVID-19的潛在治療靶點[3-6]。

1 COVID-19臨床分型

當(dāng)前由SARS-CoV-2傳播導(dǎo)致的COVID-19大流行對全球公共衛(wèi)生構(gòu)成威脅,感染的患者臨床上多表現(xiàn)為發(fā)熱、咳嗽、咳痰、乏力、胸痛及食欲減退等癥狀,肺部多層螺旋CT主要表現(xiàn)為單發(fā)或多發(fā)毛玻璃影[7]。在國家衛(wèi)健委和國家中醫(yī)藥管理局發(fā)布的《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第七版)》[8]中,其臨床分型如下。(1)輕型:臨床癥狀輕微,影像學(xué)未見肺炎表現(xiàn)。(2)普通型:有發(fā)熱、呼吸道等癥狀,影像學(xué)可見肺炎表現(xiàn)。(3)重型:①出現(xiàn)氣促,呼吸頻率≥30次/分,②靜息狀態(tài)下,氧飽和度≤93%,③動脈氧分壓/氧濃度≤300 mm Hg(1 mm Hg=0.133 kPa),符合上述3條中任何一條者,肺部影像學(xué)顯示24~48 h內(nèi)病灶明顯進(jìn)展>50%者按重型管理。(4)危重型:符合下列條件之一者,①呼吸衰竭,需要機(jī)械通氣,②出現(xiàn)休克,③合并其他器官功能衰竭,需要進(jìn)入重癥監(jiān)護(hù)室監(jiān)護(hù)治療。

臨床大多數(shù)COVID-19患者表現(xiàn)為無癥狀或癥狀較輕,約14%的患者表現(xiàn)為普通型或重型,伴有明顯浸潤或呼吸損害跡象;約5%的患者臨床表現(xiàn)為危重型[9]。隨著病情加重,危重型COVID-19患者可發(fā)展為嚴(yán)重肺炎、肺水腫、急性呼吸窘迫綜合征或多器官衰竭并死亡。值得注意的是,任何年齡的健康人群都可能因感染COVID-19而出現(xiàn)危重病情。因此,篩選特異的生物標(biāo)志物來鑒別該病的臨床分型和預(yù)后,可更好地針對不同分型患者實施相應(yīng)治療和護(hù)理,有效降低患者病情的嚴(yán)重程度,抑制SARS-CoV-2在全球范圍內(nèi)的快速傳播。

2 COVID-19的代謝組學(xué)分析

代謝組學(xué)通過各種高通量分析化學(xué)方法對內(nèi)源性小分子代謝產(chǎn)物的組成和變化進(jìn)行定量、定性分析,并根據(jù)代謝物的變化,發(fā)現(xiàn)其特異代謝產(chǎn)物。研究表明,小分子代謝物既可參與機(jī)體代謝途徑,也可調(diào)節(jié)病毒感染的先天和適應(yīng)性免疫過程[10-11],代謝組學(xué)提供了一種功能性的“后基因組學(xué)”檢測診斷方法,可節(jié)省傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測診斷的成本和時間,是探索病毒與人體間相互關(guān)系的有效工具。因此,研究人員開展了COVID-19代謝組學(xué)方面的研究,揭示了一些內(nèi)源性小分子代謝物在該病發(fā)病機(jī)制中的作用,本文總結(jié)了COVID-19不同臨床分型中代謝物的變化,見表1[12-18]。

表1 COVID-19的代謝組學(xué)研究

2.1脂質(zhì)代謝 SARS-COV-2是一種被脂質(zhì)雙層包圍的包膜病毒。脂質(zhì)在病毒感染中具有促進(jìn)病毒膜與宿主細(xì)胞融合、病毒復(fù)制及病毒的胞吞和胞吐等作用[19]。因此,脂質(zhì)代謝在病毒生命周期中起著至關(guān)重要的作用。鞘脂作為調(diào)節(jié)膜特性如黏度和張力的重要脂質(zhì),其生物合成途徑始于絲氨酸和棕櫚酰輔酶A的縮合,形成3-酮鞘氨醇,隨后被3-酮鞘氨醇還原酶還原為鞘氨醇[20]。鞘氨醇具有抗菌活性[21],同時可干擾SARS-CoV-2與其受體血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2結(jié)合[22]。因此,鞘氨醇有望成為COVID-19治療的新靶點。通過對差異代謝物和脂質(zhì)進(jìn)一步分析,發(fā)現(xiàn)COVID-19患者的代謝物和脂質(zhì)的變化與疾病進(jìn)程有顯著相關(guān)性,并篩選到一些有助于疾病診斷的生物標(biāo)志物[23],這一發(fā)現(xiàn)對治療不同臨床分型的COVID-19患者具有指導(dǎo)意義。研究表明,低密度脂蛋白水平與COVID-19呈負(fù)相關(guān)[24],這可能是COVID-19進(jìn)展和不良預(yù)后的預(yù)測因素,有助于醫(yī)生對患者進(jìn)行快速診斷及治療。有研究人員分析不同分型COVID-19患者的血漿脂質(zhì)組學(xué)差異,結(jié)果顯示:與輕型、普通型患者相比,重型患者的磷脂酰膽堿及其衍生的縮醛磷脂、膽固醇、鞘磷脂和N-酰基乙醇胺相對減少;富含單唾液酸二己糖基神經(jīng)節(jié)苷脂的外泌體與該病嚴(yán)重程度有關(guān)[16]。此研究有助于鑒別COVID-19臨床分型,并進(jìn)行有針對性的治療。

2.2氨基酸代謝 氨基酸是人體必需的營養(yǎng)物質(zhì),具有提高免疫力、維持人體正常代謝等作用,一些研究發(fā)現(xiàn)氨基酸代謝異常與COVID-19患者有關(guān)[23,25-27]。研究發(fā)現(xiàn)促炎癥細(xì)胞因子和趨化因子,如白細(xì)胞介素(IL)-6、巨噬細(xì)胞集落刺激因子(M-CSF)、IL-1α和IL-1β與COVID-19患者的氨基酸代謝有密切聯(lián)系[25]。色氨酸參與的犬尿喹啉代謝途徑(KP)對COVID-19有影響,吲哚2,3-雙加氧酶參與該途徑中的限速步驟,其作為一種多效性酶,具有免疫調(diào)節(jié)的作用,通常作為炎癥和免疫的負(fù)向調(diào)節(jié)劑[26],被認(rèn)為在抗炎方面存在一定作用[27],有望在治療COVID-19中發(fā)揮重要作用。未來還需要調(diào)整年齡、性別、體重、病史等因素造成的偏倚,利用大數(shù)據(jù)驗證KP代謝物作為COVID-19預(yù)后標(biāo)志物的可能性。另有研究顯示[23],非重型COVID-19患者體內(nèi)氨基酸水平下降,包括精氨酸、不對稱二甲基精氨酸、對稱二甲基精氨酸、均精氨酸和N-乙?;彼岬染彼嵫苌?。這些氨基酸處于正常水平時可保護(hù)肝臟并防止脂肪在肝臟內(nèi)堆積,水平下降則提示非重型COVID-19患者肝功能障礙。這些代謝物的變化揭示了COVID-19患者的治療情況,同時可對該病進(jìn)行臨床分型評估。

2.3有機(jī)酸代謝 有機(jī)酸有助于維持人體內(nèi)環(huán)境酸堿平衡及穩(wěn)定。研究表明,SARS-CoV-2感染可導(dǎo)致腎近端腎小管功能障礙及尿酸丟失,COVID-19患者血清尿酸水平降低,且與患者的呼吸衰竭有關(guān)[28]。因此,血清尿酸作為生物標(biāo)志物,可識別COVID-19危重患者。另一研究表明,犬尿酸與性別、年齡、COVID-19臨床分型、細(xì)胞因子和趨化因子豐度增強(qiáng)顯著相關(guān)[29]。由于與COVID-19免疫反應(yīng)有關(guān),犬尿酸有望成為治療干預(yù)的潛在靶點。

2.4其他 隨COVID-19患者病情加重,患者體內(nèi)的差異代謝物逐漸增多。有研究發(fā)現(xiàn),住院期間COVID-19非幸存者較康復(fù)出院者的血糖、天門冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶、肌酸激酶、乳酸脫氫酶、肌酐、D-二聚體、C反應(yīng)蛋白水平顯著升高,而清蛋白、血紅蛋白和淋巴細(xì)胞水平顯著下降[30]。另有研究比對了有無接受有創(chuàng)通氣治療的COVID-19患者的血清代謝組學(xué)差異,發(fā)現(xiàn)多種代謝物聯(lián)合可準(zhǔn)確鑒別二者,其中的甲酸鹽和檸檬酸鹽較為重要[13]。

研究發(fā)現(xiàn),治愈后的COVID-19患者與健康者比較,血漿中的多種代謝物存在顯著變化[31]。說明康復(fù)的COVID-19患者仍需充足的營養(yǎng)攝入和護(hù)理,才能更快恢復(fù)。這一發(fā)現(xiàn)為該病的病情監(jiān)控、預(yù)后判斷和治療提供了重要依據(jù)。盡管這些差異代謝物有一定研究進(jìn)展,但仍無法幫助臨床準(zhǔn)確預(yù)測患者對特定治療方案的反應(yīng)情況。

3 小 結(jié)

從公共衛(wèi)生角度看,早期發(fā)現(xiàn)COVID-19對抑制SARS-COV-2傳播至關(guān)重要;從檢測角度看,實時熒光定量PCR是最敏感和特異的檢測方法。然而,由于成本、時間、設(shè)備要求和技術(shù)限制,許多資源有限的國家無法將該法作為大規(guī)模篩查的檢測項目,而且標(biāo)準(zhǔn)的實時熒光定量PCR檢測需收集鼻咽部標(biāo)本,需統(tǒng)一培訓(xùn)標(biāo)本采集人員。盡管實時熒光定量PCR檢測較許多微生物學(xué)方法獲得結(jié)果所需的時間短,但在實際應(yīng)用中仍有不足之處。為此,代謝組學(xué)在鑒別診斷COVID-19方面展現(xiàn)了良好的應(yīng)用前景。值得注意的是,代謝組學(xué)較傳統(tǒng)方法而言仍存在局限性,即該法過于依賴于宿主對病毒的反應(yīng),而非病毒本身。由于宿主反應(yīng)具有高度可變性,代謝組學(xué)在COVID-19診斷的應(yīng)用中可能會出現(xiàn)假陽性結(jié)果。臨床上用于傳染病的代謝組學(xué)相關(guān)生物標(biāo)志物的實際案例較少,盡管目前在COVID-19代謝組學(xué)的生物標(biāo)志物研究中投入了大量精力,并確定了一些潛在的生物標(biāo)志物,但未來仍需大規(guī)模數(shù)據(jù)驗證其臨床效用。

COVID-19臨床分型與各種代謝途徑及體內(nèi)差異代謝物有關(guān),且一些代謝物有望在治療COVID-19中起關(guān)鍵作用,大規(guī)模臨床試驗對尋找COVID-19的治療靶點十分必要。

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