王 胥,陳 丹,陰魯鑫
(1 徐州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院神經(jīng)外科 江蘇 徐州 221000)
(2 徐州醫(yī)科大學(xué) 江蘇 徐州 221000)
(3 徐州市第一人民醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科 江蘇 徐州 221000)
人腦膠質(zhì)瘤源自神經(jīng)上皮,約占顱內(nèi)腫瘤的40%~60%,是中樞神經(jīng)系統(tǒng)中最常見的惡性腫瘤之一[1]。盡管采用了手術(shù)切除、放射治療、化療及免疫治療等各種治療手段,但膠質(zhì)瘤患者的臨床治療效果并不十分理想[2]。近年來隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展和分子病理診斷的興起,人們發(fā)現(xiàn)人腦膠質(zhì)瘤的分子基因譜存在顯著的個體差異,這也導(dǎo)致了明顯的預(yù)后差別,因此,人們將諸如IDH1 突變,1p19q 共缺失,MGMT 甲基化,ATRX 突變等分子病理譜也納入了膠質(zhì)瘤的分類診斷標(biāo)準(zhǔn),這為膠質(zhì)瘤的預(yù)后預(yù)測及個體化治療提供了新的方向[3]。
端粒酶常常被認為是細胞不斷分裂增殖的關(guān)鍵因素,也是腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要標(biāo)志。端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶基因啟動子(TERT)在許多癌癥中對端粒的延長與腫瘤的發(fā)生起到關(guān)鍵作用。TERT 啟動子區(qū)域的兩種特殊突變(C228T和C250T)扮演著十分非常重要的角色,它們促進了轉(zhuǎn)錄增強子新結(jié)合位點的形成,驅(qū)動了端粒酶表達和活性的增加,進而促進了腫瘤的發(fā)生發(fā)展[4]。人第10 號染色體缺失的磷酸酶及張力蛋白同源基因(PTEN)是包括顱內(nèi)腫瘤、乳腺癌和前列腺癌中最常見的缺失或下調(diào)的基因之一,其功能的部分喪失可能會影響腫瘤的發(fā)生及進展[5]。TERT 啟動子和PTEN 在顱內(nèi)腫瘤中起到重要作用,它們作為膠質(zhì)瘤分子病理診斷的新興分子,逐步顯示其對人腦膠質(zhì)瘤患者進展及預(yù)后預(yù)測的重要性[6]。本文利用數(shù)據(jù)庫預(yù)測等生物信息學(xué)分析,及對TERT 啟動子及PTEN 突變情況對膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的影響進行回顧性研究,探索TERT 啟動子及PTEN 突變情況與膠質(zhì)瘤預(yù)后的關(guān)系,以期指導(dǎo)膠質(zhì)瘤患者的臨床診療。
選取2019 年1 月—2021 年1 月徐州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院確診的人腦膠質(zhì)瘤患者22 例,所有入組膠質(zhì)瘤患者均經(jīng)歷過手術(shù)切除,并完成分子病理檢測。根據(jù)病例系統(tǒng)采集患者信息并進行跟蹤隨訪,生存時間為手術(shù)日期至死亡或隨訪結(jié)束日期。本研究通過查閱GDC 數(shù)據(jù)網(wǎng)站(https://portal.gdc.cancer.gov/exploration),運用TCGA 數(shù)據(jù)庫分析TERT 啟動子及PTEN 突變對膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的影響,并進行生物信息學(xué)分析。利用GraphPad軟件采用Kaplan-Meier 法對入組患者進行生存分析并繪制生存曲線,其中P<0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
在22 例行分子病理檢測的人腦膠質(zhì)瘤患者中,組織病理WHO Ⅳ級有15 例,占中總病例的68.2%;男女比例為1.2:1;年齡大于60 歲的占77.3%;腫瘤部位主要集中在額頂葉;主要分子病理結(jié)果見表1。
表1 腦膠質(zhì)瘤分子病理信息
根據(jù)GDC 數(shù)據(jù)網(wǎng)站,查閱TCGA 數(shù)據(jù)庫中TERT 啟動子及PTEN 突變與非突變膠質(zhì)瘤患者,其中TERT 啟動子突變患者63 例,非突變528 例;PTEN 突變患者276 例,非突變患者466 例,利用log-rank 算法比較兩組生存差異,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),提示TERT 啟動子及PTEN 突變較非突變患者的生存期明顯縮短,預(yù)后較差。見圖1。
圖1 TCGA 數(shù)據(jù)庫中TERT 啟動子及PTEN 突變與膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的關(guān)系
本研究對臨床確診膠質(zhì)瘤并完成分子病理檢測的患者進行分組,分為TERT 啟動子突變型與野生型患者及PTEN 突變型與野生型患者(各11 例),采用GraphPad軟件利用Kaplan-Meier 法對入組患者進行生存分析并繪制生存曲線,可以發(fā)現(xiàn)TERT 啟動子及PTEN 突變型患者生存期較野生型明顯縮短,預(yù)后較差(圖2)。
圖2 TERT 啟動子及PTEN 突變與入組人腦膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的關(guān)系
人腦膠質(zhì)瘤,尤其是膠質(zhì)瘤母細胞瘤,表現(xiàn)出進展快且預(yù)后差的特點。準(zhǔn)確評估膠質(zhì)瘤患者病情及預(yù)后,有利于及時采取針對性措施延長生存期,然而現(xiàn)階段臨床尚缺乏有效的預(yù)后評估指標(biāo)。膠質(zhì)瘤分子病理作為新的膠質(zhì)瘤診斷方法,在臨床膠質(zhì)瘤患者診療中起到越來越重要的作用,尋找可靠的分子標(biāo)記物已經(jīng)成為熱點[1]。目前新的分子標(biāo)記物如TERT 啟動子和PTEN 基因等的出現(xiàn)為膠質(zhì)瘤的診斷、預(yù)后及改善生存率提供了新的可能性。
癌癥進展的關(guān)鍵在于它具有無限增殖的能力。在細胞周期中,人體正常細胞由于端粒長度的減少進而導(dǎo)致細胞分裂受限,而癌細胞通過激活保護端粒長度的端粒酶突破這一限制[7]。TERT 作為端粒酶的催化亞基,與端粒酶RNA 組分(TERC)共同構(gòu)成端粒酶復(fù)合體的最重要的單位[8]。端粒酶是引起癌細胞中端粒異常的主要因素,其關(guān)鍵元素TERT 可以在染色體末端添加5'-TTAGGG-3'串聯(lián)重復(fù)序列,從而避免端粒長度減少。TERT 的表達可以調(diào)節(jié)端粒酶活性,C-myc 蛋白作為轉(zhuǎn)錄因子激活TERT的轉(zhuǎn)錄,進而觸發(fā)端粒酶活性[7]。TERT 通過在染色3'端添加六聚體重復(fù)序列來維持端粒的長度,已經(jīng)在包括膠質(zhì)瘤、黑色素瘤等多種實體腫瘤中發(fā)現(xiàn)TERT 核心啟動子區(qū)域發(fā)生突變,并且相關(guān)研究確定了幾種腫瘤中TERT 啟動子的突變類型,包括C228T、C250T、C216T、C229G、G267C、C295T 及G233C[9]。TERT 啟動子在端粒酶激活導(dǎo)致惡性細胞永生中起重要作用,TERT 的C228T和C250T 位點突變是最常見的突變類型[4]。然而,在大多數(shù)原發(fā)性膠質(zhì)母細胞瘤患者中TERT 啟動子可以發(fā)生突變,但在星形細胞瘤或大多數(shù)少突星型細胞瘤患者中,這些突變發(fā)生頻率往往較低,這提示我們TERT 啟動子突變在不同膠質(zhì)瘤類型中存在差異[10]。在TERT 突變的頻率相對較低的膠質(zhì)瘤中,這些腫瘤中端粒延長可能存在另一種機制,而且很有可能是由于ATRX 基因的突變導(dǎo)致的。另外,TERT 啟動子突變在各類膠質(zhì)瘤中均有發(fā)生,表明端粒伸長的調(diào)控在膠質(zhì)瘤的發(fā)病機制中起著至關(guān)重要的作用[10]。先前的一項研究表明,TERT 突變型膠質(zhì)母細胞瘤患者的TERT mRNA 水平升高,并報道TERT rs2853676 是中國人群膠質(zhì)瘤的危險基因型[7]。
2015 年,Yang Yuan 等[11]發(fā)現(xiàn)TERT 基因多態(tài)性與膠質(zhì)瘤風(fēng)險的增加顯著相關(guān),TERT 啟動子突變可能導(dǎo)致膠質(zhì)瘤患者預(yù)后不良,推測TERT 基因是一種有價值的膠質(zhì)瘤預(yù)后和預(yù)測生物標(biāo)志物。TERT 啟動子突變作為一種遺傳事件經(jīng)常在60 張力蛋白同源基因~75%的膠質(zhì)母細胞瘤中檢測到,并且與不良預(yù)后相關(guān)。然而,關(guān)于TERT突變與膠質(zhì)瘤預(yù)后關(guān)系的觀點目前尚不一致。有學(xué)者認為TERT 啟動子突變不能作為膠質(zhì)瘤的單一預(yù)測因子,應(yīng)該結(jié)合MGMT 甲基化狀態(tài)對其進行解釋[12],因此TERT 啟動子突變與膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的關(guān)系有待進一步研究。
PTEN 基因位于人10 號染色體,由9 個外顯子組成,是第一個被發(fā)現(xiàn)的具有磷酸酯酶活性的抑癌基因,在調(diào)節(jié)細胞增殖和DNA 損傷修復(fù)等諸多方面發(fā)揮重要作用[13]。眾多研究發(fā)現(xiàn),PTEN 基因在多種人類惡性腫瘤中均有不同程度的突變,而它的主要突變類型是基因缺失[13]。PTEN 功能部分缺失可能對癌癥發(fā)生和進展產(chǎn)生巨大影響,研究顯示,即使PTEN 表達水平輕微下降,也會顯著增加癌癥易感性[14]。人體內(nèi)的PTEN 基因通常通過其磷酸酶蛋白產(chǎn)物發(fā)揮抑制癌癥的功能。PTEN 在細胞凋亡、細胞周期阻滯、血管生成、細胞遷移、細胞擴散和侵襲以及干細胞調(diào)控中發(fā)揮著重要作用[5]。此外,PTEN 頻繁的等位基因缺失在惡性星形細胞瘤、間變性少突膠質(zhì)細胞瘤和室管膜瘤病例中也有報道。這可以解釋為PTEN 基因的遺傳變異,可能改變PTEN 的結(jié)構(gòu)和功能,導(dǎo)致細胞凋亡減少和絲裂素信號通路增加,從而影響個體對膠質(zhì)瘤的易感性[13]。
PTEN 表達缺失在5%~40%的膠質(zhì)瘤病例中發(fā)生,已被證明是膠質(zhì)瘤的早期事件。有研究表明PTEN 的突變與膠質(zhì)瘤的惡性進展有關(guān),它們與膠質(zhì)瘤中較短的生存期相關(guān)[5],因此PTEN 突變可能被認為是預(yù)測神經(jīng)膠質(zhì)瘤風(fēng)險和臨床結(jié)果的潛在和重要的候選基因。然而,P T E N 對膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的意義仍存在爭議。一些文獻表明膠質(zhì)瘤中PTEN 基因突變與生存期較差相關(guān),然而有研究報道P T E N 基因突變與生存期無明顯相關(guān)性[15]。因此,有必要從大數(shù)據(jù)及回顧性研究分析PTEN與膠質(zhì)瘤預(yù)后的相關(guān)性,探索可能的膠質(zhì)瘤預(yù)后預(yù)測分子。
綜上,發(fā)現(xiàn)在數(shù)據(jù)庫及回顧性分析中TERT 啟動子和PTEN 基因突變型較野生型膠質(zhì)瘤患者生存期縮短,它們可能成為預(yù)測人腦膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的標(biāo)志物,這對制定膠質(zhì)瘤患者的個性化診療提供了理論依據(jù)。由于分子病理診斷價格昂貴,很多膠質(zhì)瘤患者無法進行分子病理診斷,所以回顧性分析中病例數(shù)略顯不足,我們擬延長搜索年限,擴大病例數(shù),同時隨著入組病例的增多,后續(xù)擬對IDH1 突變,1p19q 共缺失,MGMT 甲基化等因素與TERT 啟動子和PTEN 基因突變進行相關(guān)性分析,試圖找出膠質(zhì)瘤患者分子病理譜中潛在的聯(lián)系,為臨床診療提供新的思路。