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(天津醫(yī)科大學(xué)口腔醫(yī)院口腔頜面外科,天津 300070)
口腔鱗狀細(xì)胞癌(OSCC)是口腔最常見(jiàn)的惡性腫瘤,約占口腔癌總數(shù)的90%,其發(fā)病率呈上升趨勢(shì)[1-2]。OSCC 可發(fā)生在舌、頰、牙齦、硬腭、口底等黏膜部位。OSCC 的病因尚不清楚,多數(shù)研究表明吸煙、飲酒、咀嚼檳榔、人乳頭瘤病毒(HPV,主要是16 型)、硬皮病、某些遺傳病(如Zinsser- Engman -Cole 綜合征等)可能是口腔癌發(fā)生的危險(xiǎn)因素。OSCC 浸潤(rùn)性強(qiáng),易出現(xiàn)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,通常在晚期后才被診斷出來(lái),5年生存率不到50%[3]。目前已有一些研究探討了影響OSCC 發(fā)展和預(yù)后的一些相關(guān)因子,以尋找新的治療靶點(diǎn),為OSCC 基因靶向治療提供了新方向[4]。
次黃嘌呤磷酸核糖基轉(zhuǎn)移酶1(hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1,HPRT1)又稱為HPRT、HGPRT。它是一種補(bǔ)救途徑酶,負(fù)責(zé)將核糖單磷酸從磷酸核糖焦磷酸(phosphoribosyl pyrophosphate,PRPP)轉(zhuǎn)移到次黃嘌呤和鳥(niǎo)嘌呤,分別形成肌苷單磷酸(inosine monophosphate,IMP)和鳥(niǎo)苷單磷酸(guanosine monophosphate,GMP)[5]。HPRT1含有217個(gè)氨基酸,在所有組織中均以低水平表達(dá)[6],唯一的例外是在中樞神經(jīng)組織中表達(dá)水平異常升高[7]。最近一些研究發(fā)現(xiàn),HPRT1 在惡性腫瘤組織中的表達(dá)普遍升高。有學(xué)者發(fā)現(xiàn)HPRT1 的mRNA 水平與受試小鼠的腫瘤負(fù)荷直接相關(guān),說(shuō)明小鼠體內(nèi)HPRT1 的水平與腫瘤的大小有關(guān)[8]。研究表明,HPRT1 的表達(dá)在前列腺癌患者樣本中增加,在乳腺癌患者的基礎(chǔ)亞型中最高,并與乳腺癌的進(jìn)展相關(guān),可作為一個(gè)潛在的預(yù)后標(biāo)志物[9]。對(duì)結(jié)腸、直腸癌的研究表明,與正常組織相比,腫瘤樣本中HPRT1 的水平升高[10]。最新研究發(fā)現(xiàn),HPRT 通過(guò)與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與轉(zhuǎn)錄激活因子3(STAT3)的直接相互作用,促進(jìn)頭頸部鱗狀細(xì)胞癌(HNSCC)的增殖和轉(zhuǎn)移[11]。也有學(xué)者證實(shí)HPRT1在HNSCC 組織中的高表達(dá)與患者的不良預(yù)后有關(guān)[12]。目前國(guó)內(nèi)對(duì)于HPRT1 在OSCC 中的作用鮮有報(bào)道,因此本研究擬利用TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站分析HPRT1在OSCC 中的表達(dá)及意義。有文獻(xiàn)報(bào)道嘌呤水平顯著降低了癌癥中的免疫細(xì)胞活化,惡性腫瘤組織中HPRT1的上調(diào)是免疫抑制微環(huán)境的一個(gè)促成因素[13]。因此本研究對(duì)HPRT1 在OSCC 免疫環(huán)境中的作用也做了相應(yīng)研究。
1.1 TCGA 數(shù)據(jù)收集 從TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)(https://can cergenome.nih.gov/)中下載OSCC 轉(zhuǎn)錄樣本394 例(其中362 例癌癥樣本,32 例癌旁樣本)和臨床數(shù)據(jù)(381 例)。
1.2 研究方法
1.2.1 GESA 富集分析 GESA4.1.0 軟件富集分析HPRT1 表達(dá)水平與京都基因和基因組百科全書(KEGG)通路基因集的相關(guān)性。從MsigDB 數(shù)據(jù)庫(kù)中下載通路富集常用的c2.cp.kegg.v7.2.symbols 基因集作為參照基因集。軟件參數(shù)設(shè)置為隨機(jī)組合次數(shù)為1 000 次,計(jì)算富集系數(shù)和標(biāo)準(zhǔn)化后的富集系數(shù)。按照錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(false discovery rates,F(xiàn)DR)進(jìn)行排序,利用HPRT1 基因表達(dá)的中位數(shù)值將TCGA 數(shù)據(jù)集中的381 例OSCC 患者分為高表達(dá)組和低表達(dá)組,分別篩選出前十條通路。
1.2.2 免疫差異性與相關(guān)性分析 使用R4.1.1 軟件的“l(fā)imma”包和“vioplot”包對(duì)免疫細(xì)胞在HPRT1高低表達(dá)組中的差異性進(jìn)行分析和繪圖;使用“l(fā)imma”包、“ggplot2”包、“ggpubr”包和“ggExtra”包對(duì)HPRT1 的表達(dá)量與免疫細(xì)胞的相關(guān)性進(jìn)行分析和繪圖。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 利用R4.1.1 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。利用Wilcoxon 法和Kruskal-Wallis 法進(jìn)行臨床相關(guān)性分析。利用Log-Rank 法進(jìn)行生存評(píng)估分析。生存資料中不同變量的風(fēng)險(xiǎn)比采用Cox 回歸分析。因TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)中OSCC 患者臨床數(shù)據(jù)中M 分期未知的數(shù)據(jù)過(guò)多,導(dǎo)致刪除臨床信息不完整的數(shù)據(jù)后樣本量過(guò)小,因此在進(jìn)行臨床相關(guān)性分析和Cox 分析時(shí)未將M 分期納入其中。P<0.05 表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 OSCC 和正常組織中HPRT1 的表達(dá)差異 TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中OSCC 組織與正常組織樣本相比,OSCC組織中HPRT1 表達(dá)水平明顯高于正常組織(t=1.856,P<0.001,圖1、2)。
圖1 總樣本中HPRT1 的表達(dá)差異Fig 1 Expression difference of HPRT1 in total samples
圖2 配對(duì)樣本中HPRT1 的表達(dá)差異Fig 2 Expression difference of HPRT1 in paired samples
2.2 HPRT1 基因與OSCC 患者臨床特征的相關(guān)性 HPRT1 表達(dá)水平在腫瘤分級(jí)中的G1 和G2 級(jí)(χ2=0.010,P=0.011)、G1 和G3 級(jí)(χ2=0.806,P< 0.001)以及G2 和G3 級(jí)(χ2=0.001,P=0.047)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖3);在腫瘤臨床分期中的Ⅰ期和Ⅲ期(χ2=0.078,P=0.006)、Ⅲ期和Ⅳ期(χ2=0.091,P=0.038)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖4);在T 分期中的T1 期和T3期(χ2=0.342,P=0.037)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖5)。HPRT1 表達(dá)水平與年齡、性別、N 分期差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖6~8)。
圖3 HPRT1 與腫瘤分級(jí)的關(guān)系Fig 3 Relationship between HPRT1 and tumor grade
圖4 HPRT1 與臨床分期的關(guān)系Fig 4 Relationship between HPRT1 and clinical stage
圖5 HPRT1 與腫瘤T 分期的關(guān)系Fig 5 Relationship between HPRT1 and tumor T stage
圖6 HPRT1 與年齡的關(guān)系Fig 6 Relationship between HPRT1 and age
圖7 HPRT1 與性別的關(guān)系Fig 7 Relationship between HPRT1 and gender
圖8 HPRT1 與腫瘤N 分期的關(guān)系Fig 8 Relationship between HPRT1 and tumor N stage
2.3 HPRT1 基因表達(dá)與患者生存率的關(guān)系 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)中381 例患者的隨訪時(shí)間為0.07 個(gè)月至15 年,HPRT1 基因高表達(dá)組總生存率明顯低于低表達(dá)組(圖9,P<0.05)。高表達(dá)組5 年生存率為35.2%,低表達(dá)組5 年生存率為50.3%。
圖9 HPRT1 與患者生存率的關(guān)系Fig 9 Relationship between HPRT1 and patients'survival rate
2.4 HPRT1 基因與OSCC 患者預(yù)后的關(guān)系 Cox 單因素分析顯示OSCC 中年齡(HR=1.03,P= 0.001)、腫瘤分級(jí)(HR=1.38,P=0.031)、腫瘤分期(HR=1.74,P<0.001)、T 分期(HR=1.54,P<0.001)、N 分期(HR=1.50,P<0.001)、HPRT1 表達(dá)量(HR=1.03,P<0.001)與患者的生存預(yù)后相關(guān)(表1)。Cox 多因素分析顯示OSCC 中年齡(HR=1.03,P<0.001)和HPRT1 表達(dá)量(HR=1.02,P=0.002)與患者生存預(yù)后相關(guān)。因此年齡和HPRT1 的高表達(dá)是影響OSCC 患者預(yù)后的獨(dú)立因素(表1、圖10)。
表1 Cox 單因素及多因素分析Tab 1 Cox single factor and multi factor analysis
圖10 HPRT1 的Cox 多因素分析結(jié)果Fig 10 Cox multivariate analysis results of HPRT1
2.5 HPRT1 可能參與的信號(hào)通路 GSEA 結(jié)果顯示,HPRT1 基因高表達(dá)樣本主要富集在基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子通路、細(xì)胞周期通路、DNA 復(fù)制等通路(FDR<0.05,P<0.05);HPRT1 基因低表達(dá)樣本主要富集在氨酰-tRNA 生物合成通路、堿基切除修復(fù)通路(P<0.05)(圖11、12)。
圖11 HPRT1 基因高表達(dá)組的GSEA 富集結(jié)果Fig 11 GSEA enrichment results of HPRT1 gene high expression group
2.6 HPRT1 與免疫細(xì)胞的相關(guān)性
2.6.1 免疫細(xì)胞差異分析 幼稚B 細(xì)胞(P=0.048)、調(diào)節(jié)性T 細(xì)胞(P=0.001)、休眠NK 細(xì)胞(P=0.029)、休眠肥大細(xì)胞(P<0.001)、活躍肥大細(xì)胞(P=0.047)、嗜酸性粒細(xì)胞(P=0.035)、中性粒細(xì)胞(P=0.016)的表達(dá)在HPRT1 高表達(dá)組與低表達(dá)組中的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖13)。
圖13 免疫細(xì)胞在兩組患者中的表達(dá)Fig 13 Expression of immune cells in two groups of patients
2.6.2 免疫細(xì)胞相關(guān)性檢驗(yàn) 調(diào)節(jié)性T 細(xì)胞(R<0,P<0.001)、休眠肥大細(xì)胞(R<0,P=0.003)和中性粒細(xì)胞含量(R<0,P=0.001)與HPRT1 表達(dá)量呈負(fù)相關(guān);嗜酸性粒細(xì)胞含量(R>0,P=0.016)與HPRT1 表達(dá)量呈正相關(guān)(圖14)。
圖12 HPRT1 基因低表達(dá)組的GSEA 富集結(jié)果Fig 12 GSEA enrichment results of HPRT1 gene in low expression group
圖14 HPRT1 與免疫細(xì)胞的相關(guān)性Fig 14 Correlation between HPRT1 and immune cells
OSCC 是嚴(yán)重威脅人類健康的一類惡性腫瘤,它的典型特征是高度的局部侵襲性和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,由于OSCC 易轉(zhuǎn)移、易復(fù)發(fā),因此OSCC 患者的總體5年生存率仍不到50%[14]。目前OSCC 的發(fā)病機(jī)制尚不清楚,可能是由多基因、多通路聯(lián)合調(diào)控的復(fù)雜過(guò)程。尋找與OSCC 發(fā)展及預(yù)后的密切相關(guān)因子,對(duì)腫瘤的早期診斷與預(yù)后極其重要。本研究通過(guò)挖掘TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)公開(kāi)發(fā)表的基因表達(dá)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)HPRT1 在OSCC 組織中高度表達(dá),對(duì)腫瘤內(nèi)的免疫環(huán)境產(chǎn)生了影響,并且高表達(dá)患者的生存預(yù)后更差,提示HPRT1 可能是OSCC 的一個(gè)潛在的預(yù)后因子。
HPRT1 是一種蛋白質(zhì),已顯示在多種腫瘤類型中顯著升高[8-10],HPRT1 在神經(jīng)發(fā)育和嘌呤合成中具有次要調(diào)節(jié)作用,嘌呤過(guò)剩分解與HPRT1 功能的喪失直接相關(guān)[15]。HPRT1 在腫瘤中的表達(dá)普遍升高,說(shuō)明HPRT1 在腫瘤中的調(diào)節(jié)作用可能是獨(dú)特的,HPRT1 的異常調(diào)節(jié)可能會(huì)增強(qiáng)細(xì)胞增殖并促進(jìn)腫瘤發(fā)展。腫瘤微環(huán)境不僅由惡性細(xì)胞組成,實(shí)質(zhì)細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、間充質(zhì)細(xì)胞、血管、淋巴管和免疫細(xì)胞之間存在復(fù)雜的相互作用,它們結(jié)合起來(lái)形成復(fù)雜的腫瘤微環(huán)境[16]。本研究顯示HPRT1 升高會(huì)影響調(diào)節(jié)性T 細(xì)胞(Tregs)、休眠肥大細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和嗜酸性粒細(xì)胞的含量,因此HPRT1 可能對(duì)腫瘤微環(huán)境中的細(xì)胞因子表達(dá)有影響。有學(xué)者研究HPRT1在幾種腫瘤中的免疫浸潤(rùn)發(fā)現(xiàn),HPRT1 表達(dá)與B 細(xì)胞、CD8+T 細(xì)胞、CD4+T 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和樹(shù)突細(xì)胞的免疫浸潤(rùn)之間存在顯著的負(fù)相關(guān);在前列腺腺癌(PRAD)、肺鱗狀細(xì)胞癌(LUSC)和甲狀腺癌(THCA)中,HPRT1 升高后所有類型的免疫細(xì)胞的腫瘤浸潤(rùn)減少,但THCA 中的CD8+T 細(xì)胞除外;而HPRT1 升高后免疫浸潤(rùn)幾乎沒(méi)有變化的是食道癌(ESCA)、腎嫌色細(xì)胞癌(KICH)和子宮癌肉瘤(UCS)[13]。Tregs 在維持自身耐受和免疫穩(wěn)態(tài)方面發(fā)揮重要作用,但它們參與促進(jìn)了腫瘤周圍的免疫抑制環(huán)境[17],而腫瘤微環(huán)境也促進(jìn)了Tregs 的積累[18]。Tregs 可以高度浸潤(rùn)各種腫瘤類型(如皮膚癌、胰腺癌、乳腺癌等),在晚期腫瘤(Ⅲ期和Ⅳ期)經(jīng)常表現(xiàn)出更高的積累[18]。有報(bào)道指出腫瘤內(nèi)Tregs 的浸潤(rùn)與生存率呈負(fù)相關(guān)[19]。而本研究發(fā)現(xiàn)HPRT1 的高表達(dá)與Tregs 的含量呈負(fù)相關(guān),并且在3 種與HPRT1 表達(dá)呈負(fù)相關(guān)的免疫細(xì)胞中差異最大,推測(cè)HPRT1 的表達(dá)對(duì)Tregs 在腫瘤微環(huán)境中的產(chǎn)生與積累密切相關(guān),關(guān)于HPRT1 與Tregs 在腫瘤微環(huán)境中表達(dá)的機(jī)制還有待進(jìn)一步探究。休眠肥大細(xì)胞是與軟組織肉瘤的復(fù)發(fā)和生存率相關(guān)的免疫細(xì)胞[20],并與透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌(ccRCC)的良好預(yù)后有關(guān),盡管其在ccRCC 中的含量較低[21]。本研究發(fā)現(xiàn)休眠肥大細(xì)胞在HPRT1 高低表達(dá)組中含量差異最大,表明HPRT1高表達(dá)可能抑制休眠肥大細(xì)胞產(chǎn)生。腫瘤相關(guān)的中性粒細(xì)胞增多是黑色素瘤、胃癌、肺癌、頭頸癌等的不良預(yù)后特征[22]。有學(xué)者發(fā)現(xiàn)CD16(high)CD62L(dim)中性粒細(xì)胞的增加與頭頸癌的良好預(yù)后相關(guān)[23]。本研究發(fā)現(xiàn)中性粒細(xì)胞隨HPRT1表達(dá)增高而減少,關(guān)于中性粒細(xì)胞在OSCC 中的作用還有待證實(shí)。嗜酸性粒細(xì)胞可分泌多種可溶性介質(zhì)和效應(yīng)分子,它們對(duì)腫瘤微環(huán)境中其他免疫細(xì)胞亞群具有調(diào)節(jié)功能,或?qū)δ[瘤細(xì)胞具有直接的細(xì)胞毒性功能,而產(chǎn)生抗腫瘤或促腫瘤作用[24]。在以腫瘤相關(guān)組織嗜酸性粒細(xì)胞增多(TATE)為特征的致癌物誘導(dǎo)的倉(cāng)鼠OSCC模型,用抗白細(xì)胞介素-5 單克隆抗體治療,可抑制腫瘤生長(zhǎng),嗜酸性粒細(xì)胞可能具有促腫瘤作用[25]。而本研究發(fā)現(xiàn)HPRT1 的高表達(dá)與嗜酸性粒細(xì)胞含量正相關(guān),嗜酸性粒細(xì)胞在OSCC 中可能具有促腫瘤作用。HPRT1 參與嘌呤調(diào)節(jié)和產(chǎn)生,HPRT1 升高會(huì)產(chǎn)生更多的嘌呤。實(shí)質(zhì)性腫瘤微環(huán)境可表現(xiàn)為缺氧,而嘌呤對(duì)缺氧條件下免疫細(xì)胞活化有顯著影響,因此這也可能是HPRT1 對(duì)腫瘤微環(huán)境的作用之一。HPRT1 在調(diào)節(jié)細(xì)胞周期中起重要作用,其參與的基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子通路、細(xì)胞周期通路、DNA 復(fù)制等通路可能對(duì)OSCC 預(yù)后也有影響。盡管本研究確定了OSCC 中HPRT1 基因的表達(dá)水平增加,但這種現(xiàn)象的潛在機(jī)制仍不清楚,還需更深入的探討。
綜上所述,本研究結(jié)果表明HPRT1 過(guò)表達(dá)與OSCC 的進(jìn)展顯著相關(guān)。腫瘤組織中HPRT1 表達(dá)的上調(diào)可能是OSCC 診斷、預(yù)后和靶向治療的生物標(biāo)志物。然而,必須進(jìn)行進(jìn)一步的調(diào)查和臨床試驗(yàn)來(lái)闡明HPRT1 在OSCC 中的作用機(jī)制。
天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2022年2期