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上海市寵物貓杯狀病毒、皰疹病毒及流感病毒的分離與鑒定

2022-03-15 12:20白藝蘭桂亞萍夏爐明龔國華朱曉英常曉靜陳偉鋒鞠厚斌趙洪進
中國動物檢疫 2022年3期
關鍵詞:核苷酸毒株引物

白藝蘭,劉 健,桂亞萍,夏爐明,龔國華,朱曉英,常曉靜,陳偉鋒,鞠厚斌,王 建,趙洪進

(上海市動物疫病預防控制中心,上海 201103)

上呼吸道感染(upper respiratory tract disease,URTD)是貓常見的臨床疾病,是引起幼貓死亡的重要原因之一,通常由一種或多種病原感染引起,從而出現(xiàn)以呼吸道或眼部疾病為特征的貓呼吸道疾病癥候群[1]。引起URTD 的病原很多,但主要為貓杯狀病毒(feline calicivirus,F(xiàn)CV)、貓皰疹病毒1 型(feline herpesvirus type 1,F(xiàn)HV-1)和貓流感病毒(feline influenza virus,F(xiàn)IV)[2]。

FCV 在貓群中的感染率很高,常引起貓口腔潰瘍和上呼吸道癥狀,也可引起其他疾病,如跛行、流產、慢性胃腸炎、尿道感染等。該病毒既可單獨感染,也可與其他病原混合感染,嚴重危害貓及貓科動物的健康[3]。FHV-1 是一種高度接觸性傳染病原,也可垂直傳播,引起的發(fā)病率很高,可達100%,但成年貓感染后病死率很低,幼貓感染后癥狀嚴重,病死率可達50%,未死亡的貓可終生帶毒排毒,危害很大[4]。貓及貓科動物都對FIV十分易感,通過食入感染的動物性食品或接觸感染的人和動物都很容易被感染。目前在貓及貓科動物身上已分離到多種亞型FIV,包括H1N1、H5N1、H5N6 及H7N2 等[5]。秋冬為貓呼吸道疾病高發(fā)季節(jié),為此本研究對患有上呼吸道癥狀疾病的臨床貓病例進行FCV、FHV-1 和FIV 的分離與鑒定,了解在該季節(jié)上海市貓上呼吸道疾病病例中FCV、FHV-1 和FIV 的感染比例,為貓上呼吸道疾病的防控和治療提供依據。

1 材料和方法

1.1 樣品及來源

2020 年11 月至2021 年3 月,以上海市中心城區(qū)寵物醫(yī)院接診的以及來自貓舍的具有上呼吸道感染癥狀的貓為研究對象,采集每只患病貓的眼結膜、口咽和鼻黏膜拭子53 份,其中寵物醫(yī)院30 份、貓舍23 份,每個病例樣品一式兩份。樣品采集好后立即送至上海獸醫(yī)疾病診斷中心實驗室進行病毒分離與鑒定。

1.2 主要試劑

F81 細胞(貓腎傳代細胞),由上海獸醫(yī)疾病診斷中心實驗室保存;SPF 雞胚(批號11401000020754),購自北京勃林格殷格翰維通生物技術有限公司;DMEM 細胞培養(yǎng)液(批號2126865)、0.25% 的胰酶消化液(批號2042303),均購自GIBCO 公司;胎牛血清(批號2418),購自SIGMA 公司;核酸提取試劑盒(批號MDII14-01),購自Magen 公司;PrimeScriptTMRT-PCR Kit(批 號AJ62323A)、LA PCR? Kit Ver.2.1(批 號AK5301)、Prime Script? One Step RT-PCR Kit Ver.2(Dye Plus)(批號AKE0559A),均購自寶生物工程(大連)公司。

1.3 病原分離、鑒定及同源性分析

1.3.1 FCV F81 細胞常規(guī)消化傳代,待長成單層且貼壁率達到90%時,將細胞按照1:3 的比例消化傳代,同時將待測樣品經過0.22 μm 濾膜過濾后同步接種到細胞中,放入37 ℃,5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每12 h 觀察細胞病變(CPE)1 次;待70%細胞出現(xiàn)CPE 時,將培養(yǎng)液凍融3 次,2 000 r/min離心5 min,收獲細胞上清;96 h 后將未出現(xiàn)CPE的細胞上清收獲,盲傳3 代,收獲第3 代細胞上清提取病毒RNA。根據文獻[6]合成FCVVP1基因檢測引物(上游:ATGTGCTCAACCTGCGC;下游:TCATAATTTAGTCATTGAGCTCCT),擴增片段大小為2 007~2 010 bp。引物由上海桑尼生物科技有限公司合成。按照PrimeScriptTMRT-PCR Kit 說明書進行PCR 擴增后取5 μL RT-PCR 擴增產物經1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,陽性RT-PCR 產物送上海桑尼生物科技有限公司進行測序。應用MEGA 6.0 軟件和DNAstar v7.1 軟件,對FCVVP1基因序列進行遺傳進化分析,比較其與GenBank 中參考序列核苷酸同源性差異,繪制基因進化樹。

1.3.2 FHV-1 按照1.3.1 中的病毒分離步驟進行病毒分離,將收獲的第3 代細胞上清提取病毒DNA。根據FHV-1gB基因保守序列(S49775.1)合成基因檢測引物(上游:GGGGTGGGTGGACGGTGAGTAA;下游:TAGGTCTCCAGGGTTCCAGTCT)。擴增片段大小為1 798 bp。引物由上海桑尼生物科技有限公司合成。按照PrimeScriptTMRT-PCR Kit 說明書進行PCR 擴增后取5 μL PCR 擴增產物經1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,陽性PCR 產物送上海桑尼生物科技有限公司進行測序。應用MEGA 6.0 軟件和DNAstar v7.1 軟件,對FHV-1gB基因序列進行遺傳進化分析,比較其與GenBank 中參考序列核苷酸同源性差異。

1.3.3 FIV 將另外一份待檢樣品經0.22 μm 濾膜過濾后尿囊腔接種到10 日齡SPF 雞胚中,37 ℃孵化箱中培養(yǎng),每24 h 照胚1 次,并將死亡雞胚及時保存至4 ℃冰箱,96 h 后將所有雞胚放至4 ℃冰箱過夜,收獲雞胚尿囊液,測定其血凝性;如有血凝性則作進一步鑒定,沒有血凝性則進行盲傳,收獲第3 代雞胚尿囊液作進一步鑒定;對雞胚尿囊液進行HA 試驗,根據文獻[7]合成引物對HA 和NA 編碼序列進行測定(HA 上游:GGGGAATTTCACAACCACTCAAG;HA 下游:TTGAGTAGAAACAAGGGTGTTTC。NA 上游:AGCAAAAGCAGGAGTRAAAATGA;NA 下游:GGCAAGTAGAAACAAGGAGTT)。擴增片段HA 為1 742 bp,NA 為1 457 bp。引物由上海桑尼生物科技有限公司合成。PCR 擴增后經1%瓊脂凝膠電泳檢測。

2 結果

2.1 細胞接種

將處理好的53 份貓眼、口、鼻拭子樣品接種F81 細胞,共有33 份樣品出現(xiàn)了CPE,細胞表現(xiàn)出聚集、圓縮、脫落、崩解等現(xiàn)象(圖1)。

2.2 FCV 分離及鑒定及VP1 基因同源性和遺傳進化分析

2.2.1 分離及鑒定 將53 份樣品的細胞上清液進行FCVVP1基因PCR 鑒定,發(fā)現(xiàn)共有31 份細胞上清出現(xiàn)2 010 bp 左右目的條帶(圖2),與預期片段大小相符。53 份樣品的FCV 分離率為58.49%(31/53),其中寵物醫(yī)院樣品分離率為46.67%(14/30),貓舍樣品分離率為73.91%(17/23)。

2.2.2VP1基因同源性和遺傳進化分析 FCVVP1序列比對分析結果(表1)顯示:31 株分離株間的核苷酸同源性為75.3%~99.8%,與國內FCV 疫苗株255 的同源性為74.8%~78.3%,與國外FCV 疫苗株F4 的同源性為73.7%~78.6%,與跛行綜合征株2280 的同源性為74.3%~79.0%,與2016 年發(fā)現(xiàn)的美國超強毒株VS-FCV-Ari 的同源性為73.9%~77.1%。同國際分離株相比,31 株分離株與美國3786 株的同源性較高,與美國超強毒株VS-FCV-Ari 的同源性最低。與國內分離株相比,與國內吉林株CH-JL4 的同源性最高,與湖北HB-S4 株的同源性最低,與2014 年上海SH2014 株的同源性為75.9%~80.3%。相應的氨基酸序列分析表明,31 株分離株與255 疫苗株的同源性為85.5%~89.1%,與F4 疫苗株的同源性為83.1%~90.1%,與超強毒株VS-FCV-Ari 的同源性為82.3%~86.8%,與上海SH2014 株的同源性為83.7%~89.5%。FCVVP1基因遺傳進化分析結果(圖3)顯示:31 個分離株總體上可以劃分為3 個分支。第一分支只包括FCV20-11 和FCV20-29,其與疫苗株、超強毒株和國內外的一些分離株親緣關系較近,形成一個獨立分支,進化關系最為復雜,來源也最為廣泛;第二分支只包含14 株分離株,遺傳進化關系最為簡單,已經形成獨立的遺傳進化譜系;第三分支包括15 株分離株及其他3 株國內毒株。結果表明,F(xiàn)CV 進化關系較為復雜,且本地分離株具有多樣性。

表1 31 株FCV 分離株與各參考毒株VP1 基因同源性比較結果 %

2.3 FHV-1 分離、鑒定及gB 基因同源性分析

2.3.1 分離與鑒定 將上述細胞上清液作為模板,進行FHV-1gB基因PCR 檢測,結果有2 份細胞上清出現(xiàn)1 798 bp 左右目的條帶(圖4),與預期片段大小相符,F(xiàn)HV-1 的分離率為3.77%(2/53),2 份樣品均來自于寵物醫(yī)院。

2.3.2gB基因同源性分析 FHV-1gB基因序列比對分析結果(圖5)顯示,2 株分離株間的核苷酸同源性為100%,與國內株(GD2018、CHB)、美國經典株(C-27)、澳大利亞株(Feligen)及其他參考株的同源性均為100%。

2.4 FIV 鑒定

將53 份尿囊液進行HA 檢測,結果均為陰性,未分離到病原。將其第3 代尿囊液進行HA 通用RT-PCR 檢測,結果也均為陰性。

3 討論

近年來隨著人民生活水平的提高,貓作為伴侶動物已逐漸成為城市生活的一部分。經過初步統(tǒng)計,上海市家養(yǎng)寵物貓數量已達21 萬只,流浪貓數量更是達到了27 萬只。貓上呼吸道疾病在大量貓同居的環(huán)境中尤其嚴重,包括動物收容所、貓舍和半野生動物群落[7]。FCV 和FHV-1 被認為是引起貓上呼吸道疾病的主要病原,常引起鼻氣管炎、結膜炎和鼻/面部潰瘍等[8],雖然原發(fā)感染相對輕微,但繼發(fā)感染對幼貓或免疫功能低下的貓構成較大威脅,并可能導致致命后果,而FIV 可能會對家養(yǎng)伴侶動物及人類健康帶來重大影響[9]。

本研究通過細胞培養(yǎng)和雞胚接種方法,對上海市秋冬季部分具有上呼吸道癥狀貓的眼、口、鼻拭子進行FCV、FHV-1、FIV 分離鑒定,發(fā)現(xiàn)FCV分離率為58.49%(31/53),其中貓舍樣品的分離率高達73.91%(17/23),推測主要原因是貓舍為群居場所,貓間接觸頻繁,容易造成相互傳染,因此貓的頻繁接觸和混居是FCV 傳播和流行的重要因素。FHV-1 分離率不高,僅為3.77%(2/53)。FHV-1 是間歇排毒,并且大多數情況下潛伏在三叉神經,所以病毒分離相對較為困難[10]。2 株分離株間的核苷酸同源性為100%,與其他參考株的同源性同樣均為100%。目前對FHV-1 分離株的研究相對較少。國內王吉[11]等分離的5 株FCV 分離株的核苷酸與參考株同源性大于99%。同時有研究[12]表明,F(xiàn)HV-1 與其他水痘病毒的gB基因具有高度相似性。gB 蛋白作為免疫原性蛋白,在哺乳動物細胞中究竟如何影響FHV-1 感染宿主及其在宿主體內的增殖仍需進一步研究證明。31 份FCV 陽性樣本中未同時分離得到FHV-1。雖然兩種病毒都能感染F81 細胞,但是兩者的CPE 和生長曲線并不一致,可能導致兩者不能同時被分離到。采用雞胚接種方法未分離到FIV,可能是臨床貓FIV 感染率較低,也可能與FIV 的一過性感染特性有關,或者是該病毒培養(yǎng)方法并不適用FIV 分離,具體原因有待進一步研究。本研究采集臨床中具有呼吸道疾病癥狀貓的口鼻拭子樣本進行檢測,所得結果為病毒核酸檢出率,不能代表貓的實際感染情況。

FCV 雖然只有1 個血清型,但抗原很容易變異。目前針對FCV 感染無特效藥,疫苗是控制該病的重要手段。在分離到FCV 的31 份臨床病例中,70.97%(22/31)的病例都免疫了進口“妙三多”(FPV、FCV 和FHV-1)疫苗,但仍然感染FCV 并導致發(fā)病,說明目前的貓三聯(lián)疫苗并不能保護機體抵御所有FCV 毒株的感染,因此疫苗保護率差是造成FCV 感染的因素之一。國內同樣有研究[13]顯示,該疫苗對FCV 保護力不佳。有研究[14]表明,使用滅活的FCV 顆粒進行鼻內免疫可對貓的同源和異源病毒提供強有力的保護。通過反向遺傳技術也使FCV 疫苗研究取得了一定進展[15]。本研究中,F(xiàn)CV 分離株間的核苷酸同源性為75.3%~99.8%,與FCV 疫苗株255 和F4 的同源性都不高,與美國超強毒株VS-FCV-Ari 的同源性只有73.9%~77.1%。國內相關研究[16-17]同樣表明,F(xiàn)CV 感染比較普遍,且毒株相互間的同源性不高,來源復雜。因而,今后有必要繼續(xù)進行FCV 等病毒的流行情況調查。

綜上所述,本研究通過細胞培養(yǎng)分離獲得了31 株FCV 分離株和2 株FHV-1 分離株,并進行了基因序列分析,初步了解了上海市貓上呼吸道疾病病例中FCV、FHV-1 和FIV 的感染比例以及病原的遺傳變化特點,為貓呼吸道病毒性疾病診斷試劑及疫苗研究奠定了基礎。

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