梁慧慧 張世亮
摘要 目的:借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究人參-三七藥對治療無癥狀性心肌缺血的作用機制。方法:借助中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP),以“人參”“三七”為檢索詞獲取藥物成分及作用靶點,運用UniProt對基因靶點標準化處理,利用Cytoscape 3.7.2軟件構(gòu)建成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖;以GeneCards平臺挖掘SMI作用靶點;使用韋恩圖得到藥物-疾病交集靶點。基于STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò),進行可視化分析,篩選核心靶點。利用Metascape數(shù)據(jù)庫及微生信在線繪圖平臺對藥物-疾病核心靶點進行基因本體(GO)富集分析和京都基因和基因組百科全書(KEGG)富集分析。結(jié)果:共得到22個活性成分,4個共有成分,125個作用靶點,1 242個SMI相關(guān)靶點,94個交集靶點,39個核心靶點。主要的活性成分包括山柰酚、槲皮素、β-谷固醇等,后二者為藥對共有成分;核心靶點包括IL6、VEGFA、TNF、TP53等。GO富集分析發(fā)現(xiàn)積極調(diào)控細胞遷移、細胞對脂質(zhì)的反應(yīng)、肌肉細胞增殖、活性氧代謝過程、細胞對氧化應(yīng)激的反應(yīng)等生物過程;KGEE通路分析得到糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號通路、癌癥的途徑、IL-17信號通路、HIF-1信號通路、松弛素信號通路等通路。結(jié)論:本研究表明人參-三七藥對可通過參與上述生物過程調(diào)控信號通路發(fā)揮抗炎、抗細胞凋亡、改善血管通透性等作用,進一步說明了人參-三七治療SMI的通路較多,機制較復(fù)雜。
關(guān)鍵詞 人參;三七;無癥狀性心肌缺血;網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué);活性成分;信號通路
To Explore the Mechanism of Radix Ginseng-Radix Notoginseng on Improving Asymptomatic Myocardial Ischemia Based on Network Pharmacology
LIANG Huihui1,ZHANG Shiliang2
(1 Shandong University of Traditional Chinese Medicine,Ji′nan 250014,China; 2 Shandong University of Traditional Chinese Medicine Affiliated Hospital Heart Disease 4,Ji′nan 250014,China)
Abstract Objective:To study the mechanism of Radix Ginseng-Radix Notoginseng in the treatment of asymptomatic myocardial ischemia(SMI) by network pharmacology.Methods:With the help of TCMSP database,we used “Radix Ginseng” and “Radix Notoginseng” as search terms to obtain drug components and targets,and UniProt to standardize gene targets.We used Cytoscape 3.7.2 software to construct component-target network diagrams; used GeneCards platform to mine SMI targets; used Venn diagrams to obtain drug-disease intersection targets.A protein interaction network(PPI) was constructed based on the STRING database for visual analysis and screening of core targets.GO enrichment analysis and KEGG pathway analysis of core drug-disease targets were performed using Metascape database and WeChat online mapping platform.Results:A total of 22 active ingredients were obtained by analysis,4 common ingredients,125 targets,1242 SMI related targets,94 intersection targets,39 core targets.Among the main active ingredients are kaempferol,quercetin,β-guillotine,The latter two are the common components of the drug; core targets include IL6,VEGFA,TNF,TP53 and etc.GO enrichment analysis found that active regulation of cell migration,cell response to lipid,muscle cell appreciation,active oxygen metabolism process,cell response to oxidative stress and other biological processes; KGEE pathway analysis obtained AGE-RAGE signaling pathway,cancer pathway,IL-17 signaling pathway,HIF-1 signaling pathway,relaxin signaling pathway and so on in diabetic complications.Conclusion:In this study,Radix Ginseng-Radix Notoginseng drugs can play anti-inflammatory,anti-apoptosis and improve vascular permeability through regulating signaling pathway,further explained that Radix Ginseng-Radix Notoginseng treatment SMI more pathways,the mechanism is more complex.
Keywords Radix Ginseng; Radix Notoginseng; Asymptomatic myocardial ischemia; Network pharmacology; Active components; Signal path
中圖分類號:R256.2;R541文獻標識碼:Adoi:10.3969/j.issn.1673-7202.2022.02.004
無癥狀性心肌缺血(Silent Myocardial Ischemia,SMI)又稱隱匿性冠心病、無痛性冠心病,是慢性冠脈綜合征中常見的類型之一[1]。臨床研究證據(jù)表明患者有心肌缺血,但無胸悶、胸痛等典型的臨床癥狀[2-3]。多數(shù)常因發(fā)現(xiàn)困難、就醫(yī)不及時,出現(xiàn)嚴重的并發(fā)癥如急性心肌梗死、心律失常,甚至猝死。目前無癥狀心肌缺血的治療與有心絞痛癥狀的冠心病患者相同如硝酸酯類制劑、抗血小板制劑、降脂藥及β受體阻滯劑等,但有一定的局限性,且預(yù)后較差[4]。而在心血管疾病防治中,中醫(yī)的優(yōu)勢日漸突出[5-7]。
人參為五加科植物的根,在現(xiàn)存最早的《神農(nóng)本草經(jīng)》中記載了“人參可補五臟、安精神”,具有大補元氣、復(fù)脈固脫的功效[8-9]。三七為五加科人參屬植物三七的塊根,被譽為“參中之王”,具有化瘀止血、活血止痛功效[10]。且人參、三七同屬五加科植物,同宗不同效,《本草綱目拾遺》有云:“人參補氣第一,三七補血第一,味同而功亦等?!倍吖沧嘌a氣生血、補氣活血之功,故兩藥合用較單藥療效顯著?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究表明,人參的主要成分為人參皂苷,具有抗氧化、抗腫瘤、抗心肌缺血、抗衰老、改善記憶力等的藥理活性[11]。盧淑立等[12]研究發(fā)現(xiàn)三七在治療冠心病、高血壓等心血管疾病方面療效好。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)搭建了中醫(yī)藥與現(xiàn)代藥理學(xué)的橋梁,為中醫(yī)藥的研究提供了平臺[13]。本研究以人參-三七藥對為例,借助于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),闡明中醫(yī)藥治療SMI的作用機制,為進一步研究奠定基礎(chǔ)。
1 資料與方法
1.1 人參、三七藥對活性成分的獲取與篩選 在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/tcm-spsearch.php)中以“人參”“三七”為檢索詞,按口服生物利用度(OB)≥30%,類藥性(DL)≥0.18條件篩選出有效成分,通過該數(shù)據(jù)庫導(dǎo)出所選活性成分對應(yīng)的靶點。然后將導(dǎo)出的靶點導(dǎo)入UnitProt數(shù)據(jù)庫(https://www.unitprot.org/)進行基因的標準化處理。
1.2 SMI疾病靶點的獲取與預(yù)測 在GeneCards數(shù)據(jù)庫中以“Silent Myocardial Ischemia”為關(guān)鍵詞進行檢索,得到疾病相關(guān)的靶點信息。
1.3 活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析 將人參、三七的活性成分及作用靶點導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2軟件,構(gòu)建其活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖。
1.4 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析 將交集靶點輸入STRING數(shù)據(jù)庫,限定物種為人,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)圖。根據(jù)節(jié)點度(Degree)值進行篩選,得到核心作用靶點。
1.5 富集分析及生物通路 將核心靶點導(dǎo)入Metascape進行富集通路分析,利用微生信在線繪圖得到生物過程分析圖,通過通路富集結(jié)果對人參-三七治療SMI的作用機制進行預(yù)測。
2 結(jié)果
2.1 活性成分的靶點篩選及預(yù)測 利用TCMSP數(shù)據(jù)庫藥物成分搜索,將得到的成分按照口服生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18為條件進行篩選。得到人參有效成分19個,三七有效成分7個,二者共有成分4個。去除重復(fù)值得到22個活性成分。見表1。
2.2 成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建 利用TCMSP網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫,將人參-三七藥對的22個有效成分在數(shù)據(jù)庫內(nèi)進行檢索,獲取其有效成分相對應(yīng)的靶點共125個。并將其導(dǎo)入UnitProt數(shù)據(jù)庫進行基因名標準化處理,再通過Cytoscape 3.7.2軟件構(gòu)建“人參-三七有效成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)。見圖1。圖中節(jié)點越大,成為藥物治療疾病關(guān)鍵成分的可能越大。
2.3 SMI相關(guān)靶點蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 通過GeneCards數(shù)據(jù)庫篩選的與SMI相關(guān)的靶點有1 242個。將藥物靶點與疾病靶點映射取交集,再將交集靶點基因?qū)隒ytoscape 3.7.2軟件,構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖。見圖2。
2.4 核心靶點的篩選 通過Cytoscape 3.7.2軟件對該網(wǎng)絡(luò)進行可視化分析,以Degree值大于等于21為篩選標準,得到39個核心靶點。見圖3。其中位居前5位的是IL6、VEGFA、TNF、TP53、NOS3。
2.5 生物通路及富集分析 將篩選出的39個核心靶點進行富集分析,獲得所參與的生物過程及通路。利用微生信平臺繪制生物過程圖,可以看出富集在積極調(diào)控細胞遷移和細胞對脂質(zhì)的反應(yīng)這2個生物過程的基因數(shù)最多。見圖4。利用Metescape數(shù)據(jù)庫進行KEGG通路分析。見表2、圖5。不同顏色節(jié)點表示不同通路,節(jié)點顏色越深基因表達的顯著性越強??梢钥闯鋈藚?三七治療SMI的通路較多,機制較復(fù)雜。
3 討論
SMI是冠心病的一種類型,雖無胸悶、胸痛的癥狀,但基本的病機與冠心病相同,故可歸屬于中醫(yī)“胸痹心痛”的范疇。其基本病機為氣虛血瘀,氣虛無力推動血液運行,氣血運行不暢,加重血瘀,故不通則痛[14]。人參為大補元氣之要藥,三七為活血的常用藥物,且氣與血存在“氣為血之帥,血為氣之母,氣可行血、也可活血”的關(guān)系,故二者合用可增強其功效。獨方“人參四物湯”中以人參為君藥,配以活血藥物,其中三七為粉劑隨藥沖服,在治療心血管疾病中取得了滿意的效果[15]。
本研究借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)較為系統(tǒng)地探討了人參-三七治療SMI的作用機制。分析結(jié)果顯示,共獲取到22種有效成分,如山柰酚、槲皮素、β-谷甾醇等。山柰酚為黃酮醇類化合物,現(xiàn)代藥理學(xué)表明山柰酚具有抗氧化、抗炎、抗癌和預(yù)防心血管疾病等多種藥理活性[16]。槲皮素在心血管疾病治療中廣泛應(yīng)用,可用來降血脂、抗動脈粥樣硬化、抗心肌缺血等[17]。β-谷甾醇是植物甾醇,是細胞膜重要的組成成分,最常用來降低膽固醇,除此之外,還具有抗炎、抗細胞凋亡、抗氧化、抗腫瘤等藥理作用[18-19]。以上各個成分之間存在相互關(guān)系,協(xié)同作用。
由核心基因PPI網(wǎng)絡(luò)圖可知,涉及的核心靶標有IL6、VEGFA、TNF、TP53、NOS3等。IL-6、TNF-α作為重要的炎癥介質(zhì),其含量可反映組織損傷的程度,與疾病的進展密切相關(guān),炎癥介質(zhì)的測定為防治冠心病提供新思路[20-22]。VEGF通常被稱為VEGF-A,能夠特異性作用于血管內(nèi)皮細胞,具有促進血管內(nèi)皮細胞增殖和遷移、抑制內(nèi)皮細胞凋亡、促進血管新生,研究證明可促進缺血性心臟病患者血管新生[23]。TP53又稱P53是一種抑癌基因,是細胞生長周期中的調(diào)節(jié)因子,與細胞周期調(diào)控、細胞分化、細胞凋亡等途徑有關(guān)[24]。NOS3(內(nèi)皮型一氧化氮合成酶)主要分布在冠狀動脈和心肌細胞的內(nèi)膜上,可參與氨基酸的代謝,同時生成一氧化氮(NO),NO具有舒張血管、改善內(nèi)皮血管通透性、抑制血小板和白細胞黏附等重要功能,參與多種疾病的病理生理過程[25]。
GO生物過程富集分析和KEGG信號通路結(jié)果顯示,人參-三七藥對治療SMI可能參與積極調(diào)控細胞遷移、細胞對脂質(zhì)的反應(yīng)、肌肉細胞增殖、活性氧代謝過程、細胞對氧化應(yīng)激的反應(yīng)等生物過程以及KEGG通路中糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號通路、IL-17信號通路、HIF-1信號通路、松弛素信號通路、VEGF信號通路、核因子κB信號通路等通路,其中最主要的通路是糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號通路,方穎等[26-28]以神經(jīng)病變的大鼠為模型發(fā)現(xiàn)AGE-RAGE信號通路可激活核因子κB,上調(diào)炎癥信號轉(zhuǎn)導(dǎo),促進IL、TNF等炎癥介質(zhì)的釋放,引發(fā)異常的炎癥和免疫反應(yīng),導(dǎo)致組織處于持續(xù)損傷的狀態(tài)。此外,AGE-RAGE信號通路激活內(nèi)皮細胞產(chǎn)生過多VEGF(血管內(nèi)皮生長因子)誘發(fā)血管新生,增加血管的通透性,造成內(nèi)皮的損傷[29]。張雷[30]實驗研究中發(fā)現(xiàn)AGE-RAGE信號通路在促進人平滑肌細胞凋亡和血管鈣化中起關(guān)鍵的作用,而且血管鈣化是冠心病危險因素之一。
本研究初步闡明了人參-三七藥對中山柰酚、槲皮素、β-谷甾醇等成分治療SMI的潛在作用機制。其活性成分作用于相關(guān)的靶點基因,靶點基因參與生物過程,調(diào)控信號通路,最終發(fā)揮抗炎、抗細胞凋亡、改善血管通透性等藥理學(xué)作用,為后續(xù)新藥的開發(fā)提供科學(xué)的證據(jù)。
參考文獻
[1]萬進東,冉飛,夏思維,等.高密度脂蛋白顆粒大小與青年冠心病無癥狀性心肌缺血的關(guān)系[J].中國動脈硬化雜志,2020,28(12):1054-1059.
[2]喬婧,江守剛.心電圖運動平板試驗在無癥狀心肌缺血診斷中的應(yīng)用[J].醫(yī)藥論壇雜志,2020,41(10):159-162.
[3]任雯慶,薛振宇,范吉林,等.參蛭通心膠囊治療Cohn Ⅲ型無癥狀性心肌缺血臨床療效及對患者血清缺血修飾白蛋白、血漿脂蛋白相關(guān)磷脂酶A2、血清超敏C反應(yīng)蛋白的影響[J].河北中醫(yī),2020,42(5):672-676.
[4]應(yīng)海峰,徐驊,狄永才,等.參麥注射液治療無癥狀性心肌缺血型冠心病患者療效分析及對其心電圖的影響[J].遼寧中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報,2019,21(11):141-144.
[5]韋靜.中醫(yī)“治未病”在心血管疾病的思考[J].中西醫(yī)結(jié)合心血管?。ㄟB續(xù)型電子期刊),2017,5(34):164.
[6]張霞霞.中醫(yī)治療心血管疾病的臨床療效分析[J].現(xiàn)代醫(yī)學(xué)與健康研究(連續(xù)型電子期刊),2019,3(2):64-65.
[7]孫文奇.淺析中醫(yī)治療心血管疾病的優(yōu)勢[J].中西醫(yī)結(jié)合心血管病(連續(xù)型電子期刊),2019,7(7):25-26.
[8]袁文,湯丹丹,夏清.基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測人參配伍石菖蒲治療阿爾茨海默病的作用機制[J].中國藥師,2020,23(12):2306-2312.
[9]郭經(jīng)奇,李瑩,范吉林,等.基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討人參-甘松藥對治療陣發(fā)性房顫的作用機制[J/OL].海南醫(yī)學(xué)院學(xué)報:1-11[2020-12-21].https://doi.org/10.13210/j.cnki.jhmu.20200825.001.
[10]田會東,王靜,郭麗娜,等.基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的“黃連-三七”藥對抗2型糖尿病作用機制[J].醫(yī)藥導(dǎo)報,2020,39(12):1608-1614.
[11]李貴明,李燕.人參皂苷藥理作用研究現(xiàn)狀[J].中國臨床藥理學(xué)雜志,2020,36(8):1024-1027.
[12]盧淑立,馮妍,高杰,等.三七提取物在心血管疾病臨床應(yīng)用中的研究進展[J].中國全科醫(yī)學(xué),2021,24(5):539-545.
[13]苑婕,胡靜,賀虹,等.網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中醫(yī)藥現(xiàn)代化研究中的進展[J].海南醫(yī)學(xué),2020,31(20):2688-2691.
[14]王驍.中醫(yī)論痛[J].中醫(yī)健康養(yǎng)生,2020,6(8):9-11.
[15]薛思楊,張世亮.人參四物湯加減治療心臟微血管性心絞痛驗案1則[J].世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘(連續(xù)型電子期刊),2019,19(66):296.
[16]雷曉青,陳鰲,劉毅,等.山萘酚藥理作用的研究進展[J].微量元素與健康研究,2017,34(2):61-62.
[17]陳振華,胡曉艷,趙滕,等.槲皮素對心血管系統(tǒng)疾病的影響及其新劑型研究進展[J].時珍國醫(yī)國藥,2019,30(2):440-443.
[18]陳李霞,丁越,沈征武,等.膽固醇在脂質(zhì)體中作用及甾醇、皂苷對其替換的研究進展[J].中草藥,2020,51(24):6396-6404.
[19]張俊卿,李建寬,王妍,等.潞黨參甾體類成分及其抗炎活性[J].中成藥,2021,43(1):92-97.
[21]夏哲林,章欣,金禮通,等.麝香保心丸聯(lián)合常規(guī)治療對冠心病穩(wěn)定型心絞痛患者的臨床療效[J].中成藥,2021,43(7):1772-1774.
[21]趙雅靜,劉明輝,王彥麗,等.辛伐他汀聯(lián)合曲美他嗪對冠心病心絞痛血液流變學(xué)、血管內(nèi)皮功能和炎癥因子的影響[J].湖南師范大學(xué)學(xué)報:醫(yī)學(xué)版,2020,17(5):166-169.
[22]侯文廣,李嬌,魏麗萍.血常規(guī)檢測在冠心病患者中的應(yīng)用進展[J].醫(yī)學(xué)綜述,2020,26(22):4533-4537.
[23]Oduk Y,Zhu W,Kannappan R,et al.VEGF nanoparticles repair the heart after myocardial infarction[J].Am J Physiol Heart Circ Physiol.2018.314(2):H278-H284.
[24]王繼超,楊采彬,卓伊琳,等.MDM2-p53抑制劑的研究進展[J/OL].藥學(xué)學(xué)報:1-28[2020-12-21].http://kns.cnki.net/kcms/detail/11.2163.R.20201203.1127.002.html.
[25]張永健,王永成,楊金龍,等.基于KEGG通路和蛋白互作對慢性心力衰竭靶點基因的篩選[J].臨床心血管病雜志,2020,36(4):355-362.
[26]方穎,王亞東,周雯,等.黃芪桂枝五物湯對糖尿病周圍神經(jīng)病變大鼠模型AGEs/RAGE/NF-κB信號通路的影響[J].中國實驗方劑學(xué)雜志,2020,26(13):52-58.
[27]宋濤,吳樹金,劉玉暉,等.Cariporide對糖基化終末產(chǎn)物所致血管內(nèi)皮損傷的保護作用[J].中南藥學(xué),2007,5(5):429-432.
[28]陳美麗,劉靜,何文智.黃連解毒湯對腦缺血大鼠模型腦組織中NF-κB p65動態(tài)變化的影響[J].中醫(yī)藥導(dǎo)報,2018,24(1):13-17.
[29]楊超茅,楊志新,馬曉玲.AGEs-RAGE信號通路在糖尿病腎病中的作用機制及中醫(yī)藥研究進展[J].中醫(yī)學(xué)報,2019,34(9):1864-1868.
[30]張雷.AGEs/RAGE軸通過P38MAPK/JNK信號通路促進人主動脈平滑肌細胞凋亡[D].瀘州:西南醫(yī)科大學(xué),2015.
(2021-01-08收稿 本文編輯:魏慶雙)