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西紅花FT同源基因的表達(dá)及功能分析

2022-03-02 06:51楊柳燕裴衛(wèi)忠張永春
植物研究 2022年2期
關(guān)鍵詞:球莖擬南芥同源

王 楨 楊柳燕 裴衛(wèi)忠 李 心 楊 貞 張永春*

(1. 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院林木果樹研究所,上海 201499;2. 上海市藥材有限公司,上海 200003)

對(duì)高等植物來(lái)說(shuō),開(kāi)花是從營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段向生殖生長(zhǎng)階段轉(zhuǎn)換的重要生活階段,與不同信號(hào)網(wǎng)絡(luò)的排列組合緊密相關(guān)。研究表明在擬南芥()中至少存在5 條不同的開(kāi)花調(diào)控途徑:光周期途徑、春化/溫度途徑、自主途徑、赤霉素途徑以及年齡途徑等。()是三大開(kāi)花途徑整合子之一,可以整合來(lái)自光周期、春化/溫度等不同開(kāi)花途徑的信號(hào),促進(jìn)植物開(kāi)花,在植物開(kāi)花過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。2007 年,在擬南芥和水稻()中同時(shí)被證實(shí),F(xiàn)T-like 蛋白作為“成花素”,主要在葉片中表達(dá),通過(guò)篩管運(yùn)輸?shù)角o尖分生組織(SAM),與鋅指蛋白FD(FLOWERING LOCUS D)互作,促進(jìn)下游、、等花分生組織特征基因和花器官?zèng)Q定基因的表達(dá),促進(jìn)成花轉(zhuǎn)換,啟動(dòng)花發(fā)育過(guò)程?;蛟诔苫ㄞD(zhuǎn)變過(guò)程中起重要作用,且同源基因的序列相似性很高,使得對(duì)基因的分離和功能研究發(fā)展很快,先后從葡萄()、玉米()、黃瓜()、蘋果()、土豆()、楊樹()、郁金香()等多種植物中分離出同源基因,并進(jìn)行了一系列的生物學(xué)分析,逐漸揭示了不同物種同源基因在調(diào)控開(kāi)花時(shí)間及其它多方面的功能。

西紅花(L.)為鳶尾科(Iridaceae)番紅花屬()多年生球根植物,又名藏紅花、番紅花。其紅色的干燥柱頭和花柱可入藥,是我國(guó)緊缺的名貴藥材之一。還廣泛應(yīng)用于食品香料、天然染料等行業(yè),集多種用途于一身,被譽(yù)為“紅色金子”。上海崇明島作為我國(guó)最早開(kāi)始西紅花人工種植的地區(qū)之一,從上世紀(jì)70 年代末進(jìn)行引種栽培,形成了獨(dú)有的“兩段法”栽培模式,目前西紅花已經(jīng)成為上海市的道地中藥材之一。

筆者前期對(duì)西紅花田間栽培階段的營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)過(guò)程和室內(nèi)儲(chǔ)藏階段的花芽分化、開(kāi)花過(guò)程進(jìn)行了觀測(cè)。自然條件下,西紅花的花期主要集中在10 月底至11 月上旬,單朵花期短,給花絲的采收帶來(lái)很大的人工壓力。研究發(fā)現(xiàn)溫度處理能顯著影響西紅花花芽分化的有無(wú)和花發(fā)育、開(kāi)花進(jìn)程,但是迄今為止,鮮見(jiàn)對(duì)西紅花成花誘導(dǎo)過(guò)程的分子機(jī)理進(jìn)行深入探索的文獻(xiàn)報(bào)道,分離到的開(kāi)花相關(guān)的基因也不多,主要集中在MADS-box基因家族等。Tsaftaris 等從西紅花中分離得到3 個(gè)同源基因,、和,但沒(méi)有進(jìn)一步進(jìn)行功能鑒定等。因此,為深入理解西紅花基因在西紅花開(kāi)花、休眠和球莖膨大等重要發(fā)育過(guò)程中的功能,本研究對(duì)Tsaftaris等克隆出的3 個(gè)西紅花基因通過(guò)qRT-PCR 分析其在不同組織中的表達(dá)情況,通過(guò)轉(zhuǎn)化煙草()和擬南芥及其突變體進(jìn)行功能驗(yàn)證,期望為探索西紅花基因的功能和基因資源的開(kāi)發(fā)利用等研究提供參考。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

1.1.1 植物材料

2018 年11 月至2019 年11 月將西紅花種球種植于崇明華宇西紅花種植專業(yè)合作社基地。期間,11 月至5 月為大田繁育球莖階段,5 月至11 月為室內(nèi)儲(chǔ)藏球莖階段。

煙草栽培種‘NC89’種植于上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)箱,生長(zhǎng)條件為24 ℃,16 h/22 ℃,8 h,用于遺傳轉(zhuǎn)化和對(duì)照。

擬南芥Col 和突變體-(Ler 生態(tài)型)用于遺傳轉(zhuǎn)化和對(duì)照,Ler 生態(tài)型用于對(duì)照,均種植于實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)箱,生長(zhǎng)條件為24 ℃,16 h/22 ℃,8 h,用于遺傳轉(zhuǎn)化或?qū)φ铡F渲?,突變體-(Ler 生態(tài)型)購(gòu)買自擬南芥生物資源中心(Bio‐logical Resource Center,USA),編號(hào)CS56。

1.1.2 各種酶及生化試劑

各種限制性內(nèi)切酶、T4-ligase 連接酶等購(gòu)自Thermo 公司。DNA 瓊脂糖凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒購(gòu)自Axygen 公司。植物RNA 提取試劑盒RNeasy PowerPlant Kit 購(gòu)自Qiagen 公司。反轉(zhuǎn)錄試劑盒Evo M-MLV、SYBR Green Pro Tag HS預(yù)混型qPCR試劑盒等購(gòu)自艾科瑞生物公司。

1.1.3 菌株及載體

pMD18-T 載體購(gòu)于TaKaRa 公司。大腸桿菌菌株DH5α 感受態(tài),農(nóng)桿菌感受態(tài)EHA105、GV3101 均購(gòu)買自上海唯地生物科技有限公司。超量表達(dá)載體pMOG22為實(shí)驗(yàn)室保存。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 西紅花基因組DNA提取

稱取0.1 g鮮葉片,于液氮中研磨成粉末,根據(jù)CTAB法提取西紅花基因組DNA。

1.2.2 西紅花總RNA提取及逆轉(zhuǎn)錄

稱取0.1 g 鮮葉片和花芽,于液氮中研磨成粉末,根據(jù)RNeasy PowerPlant Kit 植物總RNA提取試劑盒的操作步驟,提取總RNA。采用Evo M-MLV反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈。

1.2.3 西紅花基因組DNA 和cDNA 全長(zhǎng)擴(kuò)增

根據(jù)Tsaftaris文中提供的西紅花3 個(gè)基因的引物序列,以基因組DNA(gDNA)和cDNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。通過(guò)測(cè)序得到基因序列后,自行設(shè)計(jì)特異性正向和反向引物,用于超量表達(dá)載體構(gòu)建。引物序列如表1,下劃線表示酶切位點(diǎn),用于構(gòu)建超量表達(dá)載體的3對(duì)引物兩端分別加有酶切位點(diǎn)RⅠ/HⅠ,Ⅰ/RⅠ,RⅠ/Ⅰ;用于構(gòu)建亞定位載體的3 對(duì)引物兩段均加有酶切位點(diǎn)Ⅰ/Ⅰ。試驗(yàn)所用引物及測(cè)序均由上海生工生物技術(shù)有限公司提供服務(wù)。

表1 擴(kuò)增西紅花FT基因全長(zhǎng)的特異引物Table 1 Gene specific primers used to isolate complete FT coding sequences of saffron

1.2.4 西紅花表達(dá)分析

采集不同生長(zhǎng)階段的球莖、葉片、花等為材料,根據(jù)RNeasy PowerPlant Kit 總RNA提取試劑盒的操作步驟,提取總RNA,進(jìn)行基因的定量表達(dá)分析。詳細(xì)取樣部位為,大田繁育階段:1 月份子球莖、葉片、主根、側(cè)根,4 月份子球莖、頂芽;室內(nèi)儲(chǔ)藏階段:9 月份葉片、花瓣、花藥、柱頭。以西紅花作為內(nèi)參基因,檢測(cè)-在上述樣品中的表達(dá)水平(引物見(jiàn)表2)。使用Roche LightCy‐cle480 System 熒光定量PCR 儀。每個(gè)樣品設(shè)置3次重復(fù)。數(shù)據(jù)采用2法方法進(jìn)行處理。

表2 qRT-PCR分析特異引物Table 2 Gene specific primers used for qRT-PCR analysis

1.2.5 西紅花序列分析、系統(tǒng)進(jìn)化分析

序列分析和多序列比對(duì)使用ClustalW 軟件,基因序列作圖使用GeneDoc 軟件。系統(tǒng)進(jìn)化分析使用MEGA 5.0軟件,采用鄰接法(Neighbor Join‐ing,NJ),使用1 000個(gè)重復(fù)進(jìn)行Bootstrap檢驗(yàn)。為了分析西紅花基因與其他被子植物同源基因的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,我們從GenBank(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)數(shù)據(jù)庫(kù)中選取了已報(bào)道的功能確定(花期控制方面)的同源基因共同構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。

1.2.6 西紅花超量表達(dá)載體構(gòu)建和遺傳轉(zhuǎn)化

擴(kuò)增出的cDNA 特異片段通過(guò)DNA 瓊脂糖凝膠回收試劑盒進(jìn)行回收,連接pMD18-T 載體,熱激轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞。挑選陽(yáng)性克隆搖菌,提質(zhì)粒,再通過(guò)相應(yīng)的酶切位點(diǎn),酶切,回收,連接超量表達(dá)載體pMOG22。構(gòu)建的超量表達(dá)載體分別命名為35S::,35S::,35S::.

將35S::,35S::,35S::超量表達(dá)載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌菌株EHA105 感受態(tài)細(xì)胞,采用葉盤轉(zhuǎn)化法異源轉(zhuǎn)化煙草‘NC89’。

將35S::,35S::,35S::超量表達(dá)載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌菌株GV3101 感受態(tài)細(xì)胞,采用花序浸染法轉(zhuǎn)化擬南芥()Col生態(tài)型和突變體-(Ler生態(tài)型)。

1.2.7 轉(zhuǎn)基因植株的檢測(cè)及表型觀測(cè)

采集待檢測(cè)的煙草和擬南芥植株的葉片,采用Trizol 法提取RNA 進(jìn)行PCR 分子鑒定。分別以煙 草和 擬 南 芥作 為 內(nèi) 參 基 因(見(jiàn)表3)。

表3 RT-PCR分析特異引物Table 3 Gene specific primers used for RT-PCR analysis

選取至少20株T0代轉(zhuǎn)基因煙草植株進(jìn)行表型觀測(cè)的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),包括3個(gè)指標(biāo)—開(kāi)花時(shí)主莖的葉片數(shù)量,初花時(shí)植株高度和從移栽到開(kāi)花的時(shí)間。

選取至少20 株T1 代轉(zhuǎn)基因擬南芥植株進(jìn)行表型觀測(cè)的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),包括3個(gè)指標(biāo)—抽薹時(shí)蓮座葉葉片數(shù)量,抽薹時(shí)莖生葉葉片數(shù)量和從播種到開(kāi)花的時(shí)間。

運(yùn)用SAS 進(jìn)行方差分析(one-way ANOVA)和顯著性分析(Duncan’s multiple range test)。

2 結(jié)果與分析

2.1 西紅花CsatFT 全長(zhǎng)gDNA 和cDNA 的克隆及系統(tǒng)進(jìn)化分析

以西紅花葉片gDNA 和葉片、花芽cDNA 為模板,采用特異引物(見(jiàn)表1)進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,分別得到了3 個(gè)西紅花基因gDNA 和cDNA 的全長(zhǎng)序列。如圖1 所示,擴(kuò)增出的3 個(gè)西紅花基因gDNA 包含長(zhǎng)度分別為835、1 642 和1 132 bp 的完整開(kāi)放閱讀框(ORF),和其它絕大部分物種中同源基因的結(jié)構(gòu)一致,包含4 個(gè)外顯子(exon)和3個(gè)內(nèi)含子(intron),并且它們第二個(gè)和第三個(gè)外顯子的長(zhǎng)度一致,分別是62 和41 bp(見(jiàn)圖1:A)。擴(kuò)增出的3 個(gè)西紅花基因cDNA 包含長(zhǎng)度分別為528、525 和540 bp 的ORF,分別編碼175、174 和179個(gè)氨基酸。

用Clustal W 軟件進(jìn)行多序列比對(duì)分析,發(fā)現(xiàn)分離出的3 個(gè)CsatFT 的序列相似性達(dá)到79.44%,與模式植物擬南芥AtFT 氨基酸序列的相似性也達(dá)到69.66%、72.57%和71.51%。并且它們都含有保守的氨基酸位點(diǎn),即FT 中的Tyr85 和Gln140 氨基酸殘基(見(jiàn)圖1:B)。

同時(shí),為了分析克隆出的西紅花基因與其他被子植物同源基因的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,我們從GenBank(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)數(shù)據(jù)庫(kù)中選取了已報(bào)道的功能確定(花期控制方面)的同源基因,利用MEGA 5.0 軟件進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析。如圖1C 所示,CsatFT1、CsatFT2、CsatFT3 分別和同為單子葉植物的水仙()、麝香百合()LlFT 和洋蔥()AcFT1表現(xiàn)出較近的遺傳距離。同時(shí),這3個(gè)同源基因都具有促進(jìn)開(kāi)花的早花功能。

圖1 西紅花CsatFT基因的結(jié)構(gòu)、氨基酸序列比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化分析A.FT同源基因結(jié)構(gòu);方框和橫線分別表示外顯子和內(nèi)含子,數(shù)字表示各自的長(zhǎng)度(bp);B.FT同源基因預(yù)測(cè)氨基酸序列比對(duì);星號(hào)表示保守的氨基酸位點(diǎn),三角表示擬南芥FT基因外顯子和內(nèi)含子的邊界,第四個(gè)外顯子被分為ABCD四部分[25];C.不同物種FT同源基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析,灰色方框表示3個(gè)西紅花FT基因,CsatFT1,CsatFT2和CsatFT3Fig.1 Gene structures and alignment of amino acid sequences and phylogenetic analysis of CsatFT homologs of saffronA.Gene structures of FT;Boxes indicate exons and lines indicate introns,the numbers represent their corresponding lengths(bp);B.Alignment of amino acid sequences of FT homologs;Boxes and asterisks represent the conserved residues;Triangles show the exon boundaries of FT of Arabidop‐sis.The four segments of the fourth exon are shown as A,B,C and D[25];C.Phylogenetic analysis of the FT homologs from different plant species.Grey boxes represent three FT genes of saffron,CsatFT1,CsatFT2 and CsatFT3

2.2 CsatFT的表達(dá)模式分析

如圖2 所示,1 月份,子球莖膨大至直徑約1 cm,、、在葉片中表達(dá)水平最高,側(cè)根中次之,子球莖、主根中極低幾乎檢測(cè)不到;4月份,子球莖膨大至直徑約3 cm,葉片上部開(kāi)始枯萎,此時(shí)剝開(kāi)外層的膜質(zhì)結(jié)構(gòu)可見(jiàn)明顯的頂芽,頂芽處于營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)狀態(tài),、、都在子球莖中表達(dá)水平高,頂芽中極低幾乎檢測(cè)不到;在室內(nèi)儲(chǔ)藏開(kāi)花階段(5~11月),9 月份,頂芽已經(jīng)萌發(fā),剝開(kāi)低出葉可見(jiàn)明顯的葉片和花器官,、、在柱頭中表達(dá)水平最高,葉中次之,花瓣和花藥中較低,其中和在花藥中幾乎檢測(cè)不到。

圖2 西紅花CsatFT的qRT-PCR表達(dá)分析A.西紅花不同生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期和采樣部位;B.CsatFT1、CsatFT2、CsatFT3在不同組織部位的相對(duì)表達(dá)量Fig.2 qRT-PCR analysis of FT expression in saffronA.The different development phases and the tissues used of saffron;B.Relative expression levels of CsatFT1,CsatFT2 and CsatFT3 in different tissues

2.3 異源轉(zhuǎn)化CsatFT基因煙草的表型分析

如表4 所示,、和轉(zhuǎn)基因煙草植株開(kāi)花時(shí)間都顯著提前。T0代植株移栽60 d 后,幾乎所有轉(zhuǎn)基因植株均已開(kāi)花,而野生型煙草還未顯蕾(見(jiàn)圖3:A)。35S::、35S::和35S::轉(zhuǎn)基因植株的開(kāi)花時(shí)間分別為(59.90±3.21)、(61.80±3.79)和(59.50±2.37)d,都顯著低于野生型所需要的開(kāi)花時(shí)間(68.10±1.86)d。但是,35S::、35S::和35S::轉(zhuǎn)基因植株開(kāi)花時(shí)主莖上的葉片數(shù)量與野生型相比沒(méi)有顯著性差異;35S::轉(zhuǎn)基因植株開(kāi)花時(shí)植株高度為(28.90±2.85)cm,與野生型(29.10±1.86)cm 相比沒(méi)有顯著性差異,35S::、35S::轉(zhuǎn)基因植株高度顯著高于野生型。

圖3 西紅花3個(gè)FT基因的轉(zhuǎn)基因煙草植株表型A.從左到右分別是35S::CsatFT1-3,野生型,生長(zhǎng)60 d后;B.轉(zhuǎn)基因煙草植株的RT-PCR檢測(cè)Fig.3 Phenotypic analysis of transgenic tobacco plants harboring three FT homologs of saffronA.FT homologs of saffron from left to right,35S::CsatFT1-3,wild-type,respectively,after growth for 60 d;B.RT-PCR analysis to confirm the trans‐genic lines

表4 西紅花FT基因的T0代轉(zhuǎn)基因煙草植株表型統(tǒng)計(jì)Table 4 Flowering phenotypes of representative T0 transgenic tobacco lines harboring FT homologs of saffron

2.4 異源轉(zhuǎn)化CsatFT基因擬南芥的表型分析

為了進(jìn)一步驗(yàn)證CsatFT1-3 的功能,我們又進(jìn)行了擬南芥轉(zhuǎn)化和功能互補(bǔ)試驗(yàn)。如圖4A 所示,異源轉(zhuǎn)化擬南芥Col的表型觀測(cè)表明,在相同條件生長(zhǎng)30 d 后,、和轉(zhuǎn)基因擬南芥均已抽薹開(kāi)花,如圖4C~D 所示,轉(zhuǎn)基因擬南芥株系#2 抽薹時(shí)葉片數(shù)量為(11.10±0.74)個(gè),從播種到開(kāi)花所需的時(shí)間為(30.70±1.16)d,均顯著少于野生型Col 植株(14.30±0.82)和(34.20±1.14)d。如圖4E 所示,異源轉(zhuǎn)化擬南芥-(Ler 生態(tài)型)的表型觀測(cè)表明,、和轉(zhuǎn)化-突變體植株的開(kāi)花期均早于-突變體,轉(zhuǎn)基因株系的葉片數(shù)量和從播種到開(kāi)花時(shí)間都顯著低于-突變體,但顯著高于Ler 生態(tài)型擬南芥(見(jiàn)圖4:G~H)。綜上,轉(zhuǎn)基因擬南芥和功能互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)的結(jié)果,與超量表達(dá)煙草的表型一致,即均表現(xiàn)出早花的表型,進(jìn)一步說(shuō)明西紅花的3個(gè)基因都具有促進(jìn)開(kāi)花的功能。

圖4 西紅花CsatFT異源轉(zhuǎn)化擬南芥Col和ft-1突變體表型A.從左到右分別是30 d大的35S::CsatFT1,35S::CsatFT2,35S::CsatFT3,Col擬南芥植株;B.轉(zhuǎn)基因擬南芥植株的RT-PCR檢測(cè);C.長(zhǎng)日照條件下,擬南芥抽苔時(shí)的葉片數(shù);D.長(zhǎng)日照條件下,擬南芥從播種到抽苔的天數(shù);E.西紅花FT 異源轉(zhuǎn)化擬南芥ft-1 突變體植株表型;F.轉(zhuǎn)基因擬南芥植株的RT-PCR 檢測(cè);G.長(zhǎng)日照條件下,擬南芥抽苔時(shí)的葉片數(shù);H.長(zhǎng)日照條件下,擬南芥從播種到抽苔的天數(shù);CL.莖生葉;RL.蓮座葉;相同的小寫字母表示在P=0.05沒(méi)有顯著差異Fig.4 Phenotypic analysis of ectopically expressing CsatFT homologs of saffron in the Col and ft-1 mutantsA. 30-day-old 35S::CsatFT1,35S::CsatFT2,35S::CsatFT3,Col Arabidopsis;B. RT-PCR analysis to conform the transgenic lines;C. Leaf num‐ber of wild-type Col and transgenic Arabidopsis plants under LD(16 h-light/8 h-dark)conditions;D.Time from seed to bolting of wild-type Col and transgenic Arabidopsis plants under LD(16 h-light/8 h-dark)conditions;E. Phenotype of ectopically expressing FT homologs of saffron in ft-1 mu‐tant;F. RT-PCR analysis to conform the transgenic lines;G. Leaf number of wild-type Ler,ft-1 and transgenic Arabidopsis plants under LD(16 hlight/8 h-dark)conditions;H.Time from seed to bolting of wild-type Ler,ft-1 and transgenic Arabidopsis plants under LD(16 h-light/8 h-dark)con‐ditions;CL.Cauline leaves;RL.Rosette leaves;The common letters within the same figures are not significantly different at P=0.05

3 討論

對(duì)高等植物來(lái)說(shuō),開(kāi)花對(duì)生殖成功和繁衍至關(guān)重要,及其同源基因位于多條開(kāi)花途徑的交匯點(diǎn)上,在植物開(kāi)花過(guò)程中發(fā)揮著重要作用而受到研究者的關(guān)注,已經(jīng)從大量物種中克隆獲得了同源基因,并且通過(guò)異源或本物種轉(zhuǎn)基因等分子遺傳手段對(duì)其調(diào)控開(kāi)花時(shí)間的功能進(jìn)行了驗(yàn)證,大量結(jié)果表明過(guò)量表達(dá)可以縮短童期或營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)時(shí)間,促進(jìn)并加速成花。同時(shí),隨著研究的深入,發(fā)現(xiàn)也存在其它的潛在功能,例如,在長(zhǎng)光周期條件下,控制側(cè)枝的發(fā)育;響應(yīng)藍(lán)光的情況下,可以通過(guò)激活保衛(wèi)細(xì)胞中的H-ATP 合酶,調(diào)控氣孔張開(kāi);土豆同源基因作為移動(dòng)的“塊莖形成素”,誘導(dǎo)對(duì)光周期敏感的塊莖形成過(guò)程;洋蔥同源基因和在鱗莖形成中發(fā)揮功能。同時(shí),也逐漸進(jìn)化出抑制開(kāi)花的功能,甜菜()中的2個(gè)基因參與了對(duì)冬天長(zhǎng)時(shí)間低溫和春化相關(guān)的開(kāi)花響應(yīng),BvFT2 促進(jìn)開(kāi)花,而BvFT1 抑制開(kāi)花,并且BvFT1 的下調(diào)表達(dá)對(duì)甜菜對(duì)春化作用的響應(yīng)至關(guān)重要。在煙草中也發(fā)現(xiàn)了4個(gè)旁系同源基因,NtFT1-3 抑制開(kāi)花,NtFT4 促進(jìn)開(kāi)花。同樣地,在龍眼()、楊樹()等物種中都報(bào)道了旁系同源基因自然分化出拮抗功能的例子,同時(shí)功能的改變是由于關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)的變異導(dǎo)致的,并且這些位點(diǎn)在不同物種之間是保守的。

本研究中涉及的西紅花3 個(gè)同源基因,、和,均具有4個(gè)外顯子和3 個(gè)內(nèi)含子,將其編碼的氨基酸序列與擬南芥At‐FT 進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)彼此之間都有較高的序列相似性,說(shuō)明不同物種間基因序列是非常保守的。與同家族基因,兩者高度同源卻功能相反,F(xiàn)T 促進(jìn)開(kāi)花,TFL1 抑制開(kāi)花。研究表明,擬南芥AtFT 和AtTFL1 單個(gè)氨基酸的改變,或者一段氨基酸的改變,能使兩者的功能互換。序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)CsatFT1、CsatFT2、CsatFT3 均具有行使FT 早花功能關(guān)鍵的氨基酸位點(diǎn)Y85、Q140 和第四個(gè)外顯子中關(guān)鍵的B 段和C 段,同時(shí),系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示CsatFT1、CsatFT2、CsatFT3分別和同為單子葉植物的水仙NtFT、麝香百合LlFT和洋蔥AcFT1表現(xiàn)出較近的遺傳距離,這3 個(gè)同源基因都被報(bào)道具有促進(jìn)開(kāi)花的功能,說(shuō)明本研究克隆的為同源基因且具有促進(jìn)開(kāi)花的功能。

普遍認(rèn)為,基因的表達(dá)模式與其功能密切相關(guān)。擬南芥主要在葉片篩管中表達(dá),經(jīng)韌皮部運(yùn)輸至SAM,其在韌皮部和莖中過(guò)量表達(dá),可促進(jìn)提早開(kāi)花;蘋果主要在成年期的花果枝的頂芽中表達(dá),在幼年期的組織中幾乎無(wú)表達(dá),而主要在花芽、花器官、花梗、幼果等生殖器官中表達(dá),和異源轉(zhuǎn)化擬南芥均能促進(jìn)提早開(kāi)花,過(guò)表達(dá)能使轉(zhuǎn)基因蘋果植株縮短營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)期,提早開(kāi)花。qRT-PCR 的結(jié)果表明,小球莖膨大階段前期,、、在葉片中表達(dá)水平最高,側(cè)根中次之,子球莖、主根中極低(幾乎檢測(cè)不到);小球莖膨大階段后期,、、都在子球莖中表達(dá)水平高,在營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)狀態(tài)的頂芽中幾乎檢測(cè)不到。室內(nèi)儲(chǔ)藏開(kāi)花階段,、、在柱頭中表達(dá)水平最高,葉中次之,花瓣和花藥中較低(幾乎檢測(cè)不到)。這與Tsaftar‐is 等通過(guò)RT-PCR 半定量檢測(cè)方法,得到的西紅花3 個(gè)基因表達(dá)水平的結(jié)果部分一致,文中結(jié)果表明,和在10 月份和3 月份的葉片和球莖中有表達(dá),但是沒(méi)有檢測(cè)到的表達(dá),只在地下的未成熟的花中有表達(dá),葉片和球莖中均沒(méi)有。而我們的試驗(yàn)結(jié)果在1 月份的葉片和球莖中也檢測(cè)到了的表達(dá),雖然其相對(duì)表達(dá)量較和的低??赡苁怯捎诓蓸訒r(shí)間和國(guó)內(nèi)外栽培模式存在差異,且檢測(cè)方法不同,后續(xù)需要進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。

超量表達(dá)、、的轉(zhuǎn)基因煙草植株,均表現(xiàn)出提早開(kāi)花的表型,和野生型煙草相比,營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段縮短。同時(shí),擬南芥轉(zhuǎn)基因和突變體互補(bǔ)試驗(yàn),進(jìn)一步證明了、、在促進(jìn)成花轉(zhuǎn)變中的早花功能。因此,說(shuō)明3 個(gè)西紅花同源基因在花期控制方面的功能和擬南芥等模式植物中報(bào)道的功能是保守的,均具有促進(jìn)開(kāi)花的功能。

西紅花為同源三倍體,其栽培歷史超過(guò)3 000年,一直進(jìn)行無(wú)性繁殖。從進(jìn)化角度來(lái)看,基因是在自然進(jìn)化過(guò)程中進(jìn)化出抑制開(kāi)花的功能,同時(shí)在很多物種中,F(xiàn)T抑制子和FT誘導(dǎo)子在功能上具有拮抗作用。本研究中涉及的3個(gè)西紅花同源基因的基因結(jié)構(gòu)一樣,序列相似性很高,行使關(guān)鍵功能的氨基酸位點(diǎn)和片段亦沒(méi)有出現(xiàn)氨基酸的差異,異源轉(zhuǎn)化的功能驗(yàn)證也呈現(xiàn)出相同的促進(jìn)開(kāi)花的功能,間接說(shuō)明其功能和進(jìn)化較保守。西紅花3個(gè)同源基因在西紅花球莖膨大過(guò)程中的子球莖中都有表達(dá),而在儲(chǔ)藏期間的球莖中幾乎沒(méi)有表達(dá),因此,西紅花3個(gè)同源基因是否和土豆、洋蔥中同源基因一樣,可能在球莖膨大過(guò)程中具有功能,也值得進(jìn)一步的研究。

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