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lncRNA PITPNA-AS1靶向miR-92a-3p/TCF21對卵巢癌OVCAR-3細胞增殖和侵襲的影響

2022-02-22 08:47:46曾友玲馬元學(xué)
關(guān)鍵詞:報告基因熒光素酶細胞系

曾 潔,曾友玲,張 清,陳 說,楊 玉,馬元學(xué)

卵巢癌是一種常見的婦科惡性腫瘤,病死率居婦科腫瘤首位,其發(fā)病率近年來呈現(xiàn)上升趨勢[1]。卵巢癌的治療方式主要包括外科手術(shù)治療和化療,醫(yī)療技術(shù)的進步盡管改善了卵巢癌患者的預(yù)后,但其五年生存率依然很低,嚴重威脅女性生命健康[2]。因此,尋找新的卵巢癌早期診斷標志物和分子治療靶標對改善患者的預(yù)后具有重要意義。長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一種轉(zhuǎn)錄本長度大于200個核苷酸的非編碼RNA[3]。lncRNA可在轉(zhuǎn)錄水平或者轉(zhuǎn)錄后水平影響基因的表達,調(diào)控細胞分化、凋亡、衰老等各種生物學(xué)行為[4]。越來越多的研究[5]表明,lncRNA在多種腫瘤如卵巢癌、鼻咽癌、甲狀腺癌、肝癌等中表達異常,在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程中扮演重要角色。研究[6- 7]顯示,lncRNA PITPNA-AS1定位于細胞質(zhì),可影響肝癌、肺癌、宮頸癌細胞的增殖、細胞周期、轉(zhuǎn)移、凋亡等。卵巢癌中關(guān)于PITPNA-AS1的報道很少。該研究通過檢測卵巢癌組織和細胞系中PITPNA-AS1的表達水平,觀察過表達PITPNA-AS1后卵巢癌細胞增殖活力和侵襲能力,并進一步預(yù)測和驗證PITPNA-AS1作用的分子機制。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1組織標本 收集2018年6月—2020年8月在華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院附屬武漢兒童醫(yī)院(武漢市婦幼保健院)婦科接受手術(shù)治療的42例卵巢癌患者的癌組織和癌旁組織?;颊吣挲g38~74(56.42±9.13)歲。組織于液氮罐中保存,所有組織均由該院病理科醫(yī)師確認,癌組織類型均為漿液性囊腺癌,高分化19例,中低分化23例。國際婦產(chǎn)科聯(lián)盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,F(xiàn)IGO)分期為Ⅰ期+Ⅱ期28例、Ⅲ期+Ⅳ期14例。該研究經(jīng)華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院附屬武漢兒童醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會審核通過,患者均簽署知情同意書。

1.1.2 細胞與試劑人卵巢癌細胞系(HO-8910、A2780、SKOV-3、OVCAR-3、OC3)和正常卵巢上皮細胞系IOSE80均購自中國科學(xué)院上海細胞庫。miR-92a-3p mimics、miR-NC、PITPNA-AS1過表達質(zhì)粒、陰性對照質(zhì)粒、PITPNA-AS1-WildType-Reporter(WT)載體、PITPNA-AS1-Mut-Reporter(Mut)載體、TCF21-WildType-Reporter(WT)載體、TCF21-Mut-Reporter(Mut)載體購自上海吉瑪公司。DMEM/F12培養(yǎng)基、胎牛血清(FBS)、RPMI 1640培養(yǎng)基購自美國Hyclone公司。Transwell小室購自美國康寧公司。TRIzol試劑盒、Lipofectamine 3000轉(zhuǎn)染試劑盒、Matrigel基質(zhì)膠購自美國Invitrogen公司。細胞計數(shù)實驗(cell count kit-8,CCK-8)試劑盒購自大連美侖生物技術(shù)有限公司。qPCR試劑盒、RNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購自美國Roche公司。雙熒光素酶報告基因試劑盒和一抗(TCF21、CDK6、β-Tubulin、Cyclin D2、Zeb2、Snail)均購自美國Abcam公司。

1.2 方法

1.2.1細胞培養(yǎng)和轉(zhuǎn)染 常規(guī)復(fù)蘇OVCAR-3、OC3細胞后培養(yǎng)于含10% FBS的RPMI 1640培養(yǎng)基,常規(guī)復(fù)蘇HO-8910、A2780、SKOV-3、IOSE80細胞后培養(yǎng)于含10% FBS的DMEM/F12培養(yǎng)基,在37 ℃、5%體積分數(shù)CO2的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。將對數(shù)生長期的OVCAR-3細胞接種于6孔板,細胞匯合度為50%時,采用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染技術(shù)將PITPNA-AS1或陰性對照質(zhì)粒轉(zhuǎn)染進OVCAR-3細胞,記為實驗組和對照組,轉(zhuǎn)染方法依據(jù)Lipofectamine 3000說明書嚴格操作。收集轉(zhuǎn)染48 h后的細胞用于后續(xù)實驗。

1.2.2熒光實時定量聚合酶鏈反應(yīng)(qPCR) 采用TRIzol法提取組織或細胞中總RNA,超微量分光光度計檢測RNA的純度及濃度,采用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒逆轉(zhuǎn)錄RNA為cDNA。建立qPCR擴增體系,qPCR引物序列:PITPNA-AS1上游引物為 5′-GCAGGGTGGATAAAGAGGA-3′,下游引物為5′-CCTACTGACAGGATGTCCT-3′;GAPDH上游引物為 5′-AGAAGGCTGGGGCTCATTTG-3′,下游引物為5′-AGGGGCCATCCACAGTCTTC-3′;TCF21上游引物為 5′-TCCTGGCTAACGACAAATACGA-3′,下游引物為5′-TTTCCCGGCCACCATAAAGG-3′;U6上游引物為5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′,下游引物為5′-ACGCTTCACGAATTTGCGT-3′;miR-92a-3p上游引物為 5′-UAUUGCACUGUCCCGGCCUGU-3′,下游引物為5′-CAGTGCGTGTCGTGGAGT-3′。采用2-ΔΔCt法處理數(shù)據(jù),以GAPDH為內(nèi)參分析PITPNA-AS1和TCF21 mRNA的表達水平,以U6為內(nèi)參分析miR-92a-3p的表達水平。

1.2.3CCK-8檢測OVCAR-3細胞的增殖活性 將轉(zhuǎn)染后的各組OVCAR-3細胞接種于96孔板(3 000個/孔),200 μl/孔培養(yǎng)基,分別培養(yǎng)1、2、3、4、5 d,在每個時間點分別進行CCK-8法檢測時,每孔中加入20 μl CCK-8試劑,在暗箱中繼續(xù)培養(yǎng)2 h,在酶標儀上測定450 nm波長處每孔的吸光度(A)值,以A值代表細胞的增殖活性。

1.2.4Transwell實驗檢測OVCAR-3細胞的侵襲能力 預(yù)鋪Matrigel基質(zhì)膠至Transwell小室上層,在培養(yǎng)箱中凝固。胰酶消化收集轉(zhuǎn)染后的OVCAR-3細胞,無血清培養(yǎng)基制備單細胞懸液,接種于Transwell小室上層(2×104個/孔),每孔200 μl培養(yǎng)基。在Transwell小室下層加600 μl含血清培養(yǎng)基。在培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h,取出Transwell小室,4%多聚甲醛固定20 min,0.1%結(jié)晶紫溶液染色20 min。流水沖洗后,采用棉簽擦去未穿膜的OVCAR-3細胞。室溫下風(fēng)干后,在光學(xué)顯微鏡下對侵襲細胞數(shù)計數(shù)。

1.2.5生物信息學(xué)方法預(yù)測PITPNA-AS1作用的分子機制 使用starBase v2.0網(wǎng)站預(yù)測PITPNA-AS1可相互作用的微小RNA(miRNA)。使用DIANA-microT網(wǎng)站預(yù)測miRNA的靶基因。

1.2.6雙熒光素酶報告基因?qū)嶒?將PITPNA-AS1-WT、PITPNA-AS1-Mut質(zhì)粒分別與miR-NC、miR-92a-3p共轉(zhuǎn)染至OVCAR-3細胞中,根據(jù)雙熒光素酶報告基因試劑盒說明書操作,48 h后用化學(xué)發(fā)光技術(shù)測定每組細胞的相對熒光素酶活性,驗證miR-92a-3p靶向結(jié)合并受PITPNA-AS1調(diào)控。將TCF21-WT、TCF21-Mut質(zhì)粒分別與miR-92a-3p、miR-NC共轉(zhuǎn)染至OVCAR-3細胞中,根據(jù)雙熒光素酶報告基因試劑盒說明書操作,48 h后用化學(xué)發(fā)光技術(shù)測定每組細胞的螢火蟲熒光素酶活性和海腎熒光素酶活性,相對熒光素酶活性=螢火蟲熒光素酶活性/海腎熒光素酶活性,驗證miR-92a-3p靶向結(jié)合并可調(diào)控TCF21。

1.2.7Western blot檢測 在各組細胞中加入1 ml RIPA 裂解液,冰上裂解 30 min,收集上清液并采用BCA蛋白定量試劑盒檢測蛋白濃度。每孔道加等量蛋白,進行十二烷基聚丙烯酰胺凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜后用5%脫脂牛奶封閉3 h,加入均以1 ∶1 000比例稀釋的一抗,在冰箱內(nèi)孵育過夜。加入以1 ∶10 000比例稀釋的二抗孵育3 h,滴加ECL溶液,在化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)內(nèi)顯影、拍照,以β-tubulin為內(nèi)參蛋白。采用Image-Pro Plus 4.0軟件比較蛋白的相對表達水平。

2 結(jié)果

2.1 PITPNA-AS1在卵巢癌組織和細胞系中低表達該研究結(jié)果顯示,PITPNA-AS1在卵巢癌組織相對表達低于癌旁組織相對表達,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=14.81,P<0.01),見圖1。與正常卵巢上皮IOSE80細胞相比,PITPNA-AS1在人卵巢癌細胞系(HO-8910、A2780、SKOV-3、OVCAR-3、OC3)中低表達(P<0.05),見圖2,以O(shè)VCAR-3細胞中PITPNA-AS1的表達最低(P<0.01),所以后續(xù)實驗選該細胞系。

圖1 PITPNA-AS1在卵巢癌組織和癌旁組織中的表達與癌旁組織比較:**P<0.01

圖2 PITPNA-AS1在正常卵巢上皮細胞和卵巢癌細胞系中的表達與IOSE80細胞比較:*P<0.05,**P<0.01

2.2 轉(zhuǎn)染PITPNA-AS1過表達質(zhì)粒對OVCAR-3細胞中PITPNA-AS1的表達的影響該研究顯示,PITPNA-AS1在對照組和實驗組OVCAR-3細胞中相對表達分別為(1.01±0.07)和(12.12±2.54),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),提示PITPNA-AS1質(zhì)??捎行岣逴VCAR-3細胞中PITPNA-AS1的表達,表明轉(zhuǎn)染成功。

2.3 過表達PITPNA-AS1對OVCAR-3細胞增殖活性的影響CCK-8法檢測顯示(圖3),接種2 d后,對照組OVCAR-3細胞吸光度高于實驗組OVCAR-3細胞(P<0.05),表明過表達PITPNA-AS1能抑制OVCAR-3細胞增殖活性。

圖3 過表達PITPNA-AS1對OVCAR-3細胞增殖活性的影響與對照組比較:*P<0.05,**P<0.01

2.4 過表達PITPNA-AS1對OVCAR-3細胞的侵襲能力影響Transwell實驗顯示(圖4),對照組穿膜細胞數(shù)個/視野多于實驗組穿膜細胞數(shù),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),表明過表達PITPNA-AS1能抑制OVCAR-3細胞的侵襲能力。

圖4 過表達PITPNA-AS1表達對OVCAR-3細胞侵襲能力的影響 結(jié)晶紫染色 ×100與對照組比較:**P<0.01

2.5 生物信息學(xué)方法預(yù)測PITPNA-AS1作用的分子機制如圖5,使用starBase v2.0網(wǎng)站預(yù)測顯示,miR-92a-3p可以與PITPNA-AS1的互補序列結(jié)合。使用DIANA-microT網(wǎng)站預(yù)測顯示,TCF21 mRNA可以與miR-92a-3p中互補序列結(jié)合。

圖5 PITPNA-AS1互補結(jié)合miR-92a-3p的序列區(qū)域及miR-92a-3p互補結(jié)合TCF21 mRNA的序列區(qū)域

2.6 雙熒光素酶報告基因?qū)嶒炄鐖D6,共轉(zhuǎn)染PITPNA-AS1-WT與miR-92a-3p后相對熒光素酶強度較PITPNA-AS1-WT與miR-NC降低(P<0.01),定點突變后,共轉(zhuǎn)染PITPNA-AS1-Mut與miR-92a-3p較PITPNA-AS1-Mut與miR-NC相對熒光素酶活性差異無統(tǒng)計學(xué)意義,表明PITPNA-AS1能夠靶向結(jié)合miR-92a-3p。如圖6,共轉(zhuǎn)染TCF21-WT與miR-92a-3p后相對熒光素酶強度較TCF21-WT與miR-NC降低(P<0.01),定點突變后,共轉(zhuǎn)染TCF21-Mut與miR-92a-3p較TCF21-Mut與miR-NC相對熒光素酶活性差異無統(tǒng)計學(xué)意義,表明TCF21能夠靶向結(jié)合miR-92a-3p。

圖6 雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烌炞CPITPNA-AS1作用的分子機制A:PITPNA-AS1與miR-92a-3p的靶向關(guān)系驗證;B:miR-92a-3p與TCF21的靶向關(guān)系驗證;與miR-NC比較:**P<0.01

2.7 過表達PITPNA-AS1的OVCAR-3細胞中miR-92a-3p和TCF21 mRNA的表達情況本研究顯示,對照組OVCAR-3細胞中miR-92a-3p相對表達(1.02±0.10)高于實驗組相對表達(0.35±0.09),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01);對照組OVCAR-3細胞中TCF21 mRNA相對表達(1.09±0.24)低于實驗組相對表達(6.79±1.31),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),表明過表達PITPNA-AS1能下調(diào)miR-92a-3p的表達,增加TCF21 mRNA的表達。

2.8 過表達PITPNA-AS1的OVCAR-3細胞中TCF21蛋白的表達該研究采用Western blot檢測結(jié)果顯示(圖7),過表達PITPNA-AS1后,TCF21蛋白表達增加,細胞增殖相關(guān)蛋白CDK6、Cyclin D2表達降低,細胞侵襲相關(guān)Zeb2、Snail表達降低,間接表明卵巢癌細胞的增殖和侵襲被抑制。

圖7 過表達PITPNA-AS1對OVCAR-3細胞TCF21蛋白表達的影響與對照組比較:**P<0.01

3 討論

lncRNA在細胞中廣泛存在,參與調(diào)控各種信號通路,lncRNA的異常表達與心血管疾病、自身免疫病、腫瘤等多種疾病的發(fā)生有關(guān)[8]。TPT1-AS1[3]、FAM83H-AS1[5]、KCNQ1OT1[8]等lncRNA已被研究證實可影響卵巢癌細胞的增殖、遷移、凋亡、侵襲等生物學(xué)行為,在卵巢癌的發(fā)生、發(fā)展中起到重要作用。Ren et al[7]研究發(fā)現(xiàn),PITPNA-AS1在非小細胞肺癌組織和細胞系中高表達,沉默PITPNA-AS1可抑制非小細胞肺癌細胞的增殖和轉(zhuǎn)移能力,并促進細胞凋亡。同一個lncRNA在不同的腫瘤中可發(fā)揮不同的作用,既可表現(xiàn)為癌基因作用,也可表現(xiàn)為抑癌基因作用[9]。PITPNA-AS1在卵巢癌中的表達和功能尚不明確。該研究結(jié)果表明,與癌旁組織和正常卵巢上皮細胞系比較,PITPNA-AS1在卵巢癌組織和細胞系中的表達降低,提示PITPNA-AS1可能參與卵巢癌的發(fā)生和發(fā)展。該研究通過CCK-8、Transwell實驗證實,PITPNA-AS1對卵巢癌OVCAR-3細胞增殖和侵襲具有抑制作用,提示PITPNA-AS1在卵巢癌中表現(xiàn)為抑癌基因作用。

微小RNA(miRNA)是一類長度約為18~24個核苷酸的小分子單鏈RNA,可在轉(zhuǎn)錄后水平特異性結(jié)合靶基因信使RNA(mRNA)的3′非翻譯區(qū),誘導(dǎo)靶基因mRNA降解或者直接抑制其翻譯[10]。lncRNA可通過競爭性結(jié)合miRNA促進靶基因mRNA的表達,lncRNA-miRNA-靶基因mRNA是lncRNA發(fā)揮功能的重要機制[9]。該研究采用starBase v2.0網(wǎng)站預(yù)測顯示,PITPNA-AS1可能互補結(jié)合miR-92a-3p。miR-92a-3p是miRNA家族一員。Li et al[11]研究發(fā)現(xiàn),miR-92a-3p在食管鱗狀細胞癌組織和細胞系中高表達,miR-92a-3p可促進食管鱗狀細胞癌細胞的增殖、遷移和侵襲,抑制其凋亡,miR-92a-3p表現(xiàn)為癌基因作用。與正常組織相比,miR-92a-3p在卵巢癌組織中的表達較高[12]。雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烇@示PITPNA-AS1可互補結(jié)合miR-92a-3p。過表達PITPNA-AS1后,miR-92a-3p表達降低,提示PITPNA-AS1可能在卵巢癌細胞中競爭性結(jié)合miR-92a-3p。

該研究采用DIANA-microT網(wǎng)站預(yù)測顯示,miR-92a-3p可能互補結(jié)合TCF21 mRNA。TCF21基因定位于染色體6q23-q24,是一種新近發(fā)現(xiàn)的抑癌基因[13]。TCF21蛋白屬于基本螺旋環(huán)螺旋轉(zhuǎn)錄因子家族,研究表明TCF21在卵巢癌、胃癌、肺癌、乳腺癌等腫瘤中低表達,過表達TCF21可抑制腫瘤細胞的增殖和轉(zhuǎn)移[14-15]。該研究雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烇@示miR-92a-3p可互補結(jié)合TCF21 mRNA。miR-92a-3p表達下調(diào)后,TCF21基因的表達增加,提示miR-92a-3p在卵巢癌細胞中的靶基因是TCF21。TCF21蛋白表達增加后,細胞增殖相關(guān)蛋白CDK6、Cyclin D2表達降低,細胞侵襲相關(guān)Zeb2、Snail表達降低,間接提示卵巢癌細胞的增殖和侵襲被抑制。

綜上所述,PITPNA-AS1在卵巢癌組織及細胞系中低表達,上調(diào)PITPNA-AS1通過競爭性結(jié)合miR-92a-3p,增加TCF21基因的表達,從而抑制卵巢癌OVCAR-3細胞的增殖活性和侵襲能力,PITPNA-AS1可能是卵巢癌潛在的診療靶標。

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