邢曉旭,張宗山,趙瑩瑩,張馨慧,曾丹丹,趙玉珠,張 旭
(黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,黑龍江 大慶 163319)
腹瀉是臨床常見疾病,嚴(yán)重危害公共衛(wèi)生安全并造成嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失,也是制約畜牧業(yè)發(fā)展因素[1],引起腹瀉原因包括細(xì)菌性腹瀉、病毒性腹瀉、寄生蟲性腹瀉及非傳染性腹瀉,預(yù)防和治療難度大[2]。因此尋找一種非特異性止瀉藥物成為目前亟待解決的問(wèn)題之一。
中草藥在腹瀉病防控方面具有一定潛力,多種傳統(tǒng)單味中藥及方劑已被證明具有澀腸止瀉作用[3]。同時(shí),中藥在治療豬腹瀉病上具有副作用小、耐藥性低、藥物無(wú)殘留等優(yōu)點(diǎn)[4]。甘草為豆科植物甘草(Glycyrrhiza uralensisFisch.)、脹果甘草(Glycyrrhiza inflataBat.)或光果甘草(Glycyrrhiza glabraL.)干燥根和根莖,味甘性平,具有補(bǔ)脾益氣,清熱解毒,祛痰止咳等功效,可與其他藥物連用止瀉[5]。異甘草素作為甘草提取物,已證明具有抗菌、抗病毒和增強(qiáng)免疫、減輕炎癥作用[6-7]。因此,異甘草素作為一種非特異性抗腹瀉藥物應(yīng)用前景良好。
中藥治療疾病是“多成分、多途徑、多靶標(biāo)”協(xié)同作用,無(wú)法從單一方面闡明其治療疾病的具體機(jī)制[8]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是一門新興學(xué)科,通過(guò)整合多種組學(xué)、高通量篩選、分子交互驗(yàn)證、網(wǎng)絡(luò)可視化分析等相關(guān)技術(shù)揭示“藥物-基因-靶標(biāo)-疾病”之間復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,闡明藥物作用機(jī)理,已成為研究創(chuàng)新藥物重要途徑。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)可通過(guò)整理歸納現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)中信息,分析中藥與疾病之間相互關(guān)系[9]。
本研究利用蓖麻油誘導(dǎo)小鼠腹瀉模型評(píng)價(jià)異甘草素抗腹瀉活性,再利用網(wǎng)絡(luò)藥理研究方法探討異甘草素治療腹瀉關(guān)鍵靶標(biāo),基于分子對(duì)接技術(shù)驗(yàn)證異甘草素與靶標(biāo)結(jié)合作用,揭示異甘草素治療腹瀉潛在分子機(jī)制,為臨床應(yīng)用奠定理論基礎(chǔ)。
本試驗(yàn)所用昆明白鼠購(gòu)自哈爾濱醫(yī)科大學(xué),雌雄各半。
異甘草素標(biāo)準(zhǔn)品(PHLC≥98%)購(gòu)自上海源葉生物科技有限公司;蓖麻油(貨號(hào):C6770)購(gòu)自北京索萊寶科技有限公司;二甲基亞砜(DMSO)購(gòu)自北京索萊寶科技有限公司。
1.3.1 蓖麻油誘導(dǎo)小鼠腹瀉
取昆明白鼠50只,體重為18~22 g,雌雄各半,隨機(jī)分成5組,每組10只,灌胃給藥,試驗(yàn)分為空白對(duì)照組、腹瀉對(duì)照組、異甘草素(50mg.kg-1)低劑量組、異甘草素(100 mg.kg-1)中劑量組和異甘草素(200 mg.kg-1)高劑量組。試驗(yàn)前24 h禁食,異甘草素低、中、高劑量組分別口服灌胃異甘草素0.2 mL,空白對(duì)照組和腹瀉對(duì)照組口服灌胃含0.1%DMSO生理鹽水0.2 mL。0.5 h后,分別灌胃0.2 mL蓖麻油,空白對(duì)照組灌胃0.2 mL生理鹽水,試驗(yàn)觀察6 h,記錄各組小鼠精神和生理狀態(tài)及各組小鼠初次腹瀉時(shí)間和次數(shù)。
另取50只昆明白鼠,體重為18~22 g,雌雄各半,隨機(jī)分成5組,試驗(yàn)分組與處理方式同上,用適量碳粉代替蓖麻油灌胃,1.5 h后處死小鼠,記錄并計(jì)算各組小鼠腸道內(nèi)碳粉推進(jìn)比。
腸道碳粉推進(jìn)比計(jì)算公式為:推進(jìn)比=碳粉推進(jìn)長(zhǎng)度/腸管總長(zhǎng)度×100%。
1.3.2 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析
1.3.2.1 異甘草素及腹瀉疾病靶標(biāo)的檢索
在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和分析平臺(tái)(TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù),https://www.tcmspw.com/tcmsp.php)中檢索與異甘草素相關(guān)靶標(biāo)。將“Diarrhea”作為檢索詞,在GeneCards在線數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.genecards.org/)中檢索腹瀉已知相關(guān)疾病靶點(diǎn),得到腹瀉疾病靶點(diǎn)。將異甘草素相關(guān)蛋白與腹瀉相關(guān)靶標(biāo)作對(duì)比,尋找兩者交集靶標(biāo),確定異甘草素治療腹瀉潛在靶點(diǎn)。
1.3.2.2 PPI靶蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
利用STRING平臺(tái)(https://string-db.org/)構(gòu)建交集靶點(diǎn)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)(PPI),分析異甘草素治療腹瀉靶標(biāo)相互關(guān)系。將所有交集蛋白導(dǎo)入至STRING平臺(tái),選擇“多重蛋白”分析,物種選擇為“mus”,根據(jù)結(jié)果選擇編碼相應(yīng)蛋白基因名稱,生成蛋白互作網(wǎng)絡(luò),分析網(wǎng)絡(luò)關(guān)聯(lián)度及蛋白富集系數(shù),確定異甘草素治療腹瀉中調(diào)控關(guān)鍵蛋白。
1.3.2.3 基因本體論(Geneontology,GO)分析
將篩選出的交集靶點(diǎn)基因?qū)隬ebGestalt在線工具,對(duì)交集靶點(diǎn)作GO富集分析,將物種與背景設(shè)定為“mus”,根據(jù)P<0.05描述蛋白質(zhì)顯著程度,分析交集靶標(biāo)所集中的生物學(xué)過(guò)程,探討異甘草素治療腹瀉所影響的分子通路。
1.3.2.4 KEGG通路富集分析
與GO分析原理相同,將篩選出的靶點(diǎn)導(dǎo)入WebGestalt在線工具,對(duì)交集靶點(diǎn)作KEGG富集分析,將物種與背景設(shè)定為“mus”,根據(jù)P<0.05描述顯著程度,得到異甘草素治療腹瀉疾病主要作用通路,分析顯著通路。
1.3.3 分子對(duì)接
在PDB數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www1.rcsb.org/)檢索關(guān)鍵蛋白晶體結(jié)構(gòu),利用NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)檢索異甘草素3D結(jié)構(gòu)。利用Discovery situido 2016作分子對(duì)接,采用C-CDOCK半柔性對(duì)接,計(jì)算異甘草素與關(guān)鍵靶標(biāo)相互作用潛在結(jié)合構(gòu)想和結(jié)合能,確定潛在異甘草素與關(guān)鍵靶標(biāo)相互作用模式。
1.3.4 熒光定量PCR
取昆明白鼠10只,體重為18~22 g,雌雄各半,隨機(jī)分成兩組,每組5只,分別為健康對(duì)照組、異甘草素組。異甘草素組口服灌胃0.2 mL 200 mg.kg-1異甘草素溶液,對(duì)照組灌胃等量生理鹽水。6 h后,處死小鼠,取各小鼠腸段組織研磨,利用RNA提取試劑盒提取組織中RNA,再利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,通過(guò)NovoStart?SYBRqPCR SuperMix Plus法實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)系統(tǒng)作qPCR。所用引物見表1。將上述體系加于0.1 mL八聯(lián)管內(nèi),混勻后瞬離上機(jī)。反應(yīng)體系為:水(RNase-Free ddH2O)5μL,上、下游引物(10μmol.L-1)各0.5μL,預(yù)混染料(NovoStart?SYBR qPCR SuperMix Plus)10μL,模板(cDNA)4μL,共計(jì)20μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃30 s;95℃30 s,60℃30 s,72℃30 s,40個(gè)循環(huán);92℃5 s,60℃1 min,95℃continues;50℃30 s。反應(yīng)結(jié)束后,讀取Ct值,運(yùn)用ΔΔCt法分析數(shù)據(jù)。確定異甘草素對(duì)MAPK14、NCOA2、PPARG和ESR1基因表達(dá)的影響。
表1 熒光定量PCR引物Table1 Primersfor quantitative PCR reactions
1.3.5 統(tǒng)計(jì)分析
所有試驗(yàn)均開展3次獨(dú)立重復(fù)試驗(yàn),使用Excel 2016和SPSS 19.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)作統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,P>0.05表示無(wú)顯著性差異,不標(biāo)記;0.01<P<0.05表示顯著性差異,以*標(biāo)記;P<0.01表示極顯著性差異,以**標(biāo)記。
本研究通過(guò)蓖麻油誘導(dǎo)小鼠腹瀉模型評(píng)價(jià)異甘草素抗腹瀉作用,腹瀉對(duì)照組小鼠試驗(yàn)開始后6 h精神沉郁,不喜運(yùn)動(dòng),四肢蜷縮,小鼠被毛粗亂;用藥組小鼠精神狀態(tài)良好,生理狀態(tài)正常,與空白對(duì)照組相比無(wú)明顯差異。如圖1所示,與腹瀉對(duì)照組相比,異甘草素顯著降低小鼠腹瀉次數(shù)(P<0.05),延緩小鼠初次腹瀉時(shí)間(P<0.05),且呈一定劑量依賴。同時(shí),與腹瀉對(duì)照組相比,異甘草素還可顯著抑制腸道蠕動(dòng)(P<0.05),延緩碳粉推進(jìn)距離,減少腹瀉發(fā)生。試驗(yàn)結(jié)果表明異甘草素對(duì)蓖麻油誘導(dǎo)小鼠腹瀉具有良好治療作用。
圖1 異甘草素對(duì)蓖麻油誘導(dǎo)的小鼠腹瀉治療作用Fig.1 Effect of isoliquiritigenin on castor oil induced diarrhea in mice
基于數(shù)據(jù)檢索,在TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中共找到與異甘草素相關(guān)蛋白靶標(biāo)34個(gè),在GeneCards在線數(shù)據(jù)庫(kù)共找到與腹瀉相關(guān)靶標(biāo)蛋白5 686個(gè),其中交集靶標(biāo)共計(jì)14個(gè),蛋白名稱如表2所示。這些交集靶標(biāo)與腹瀉的發(fā)生和異甘草素均具有一定相關(guān)性,可能是異甘草素治療腹瀉的靶標(biāo)。
表2 交集靶標(biāo)信息Table 2 Intersection target information
將上述交集蛋白名稱導(dǎo)入至STRING平臺(tái),通過(guò)STRING平臺(tái)構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò),種屬選擇為“mus”。試驗(yàn)結(jié)果見圖2,共有4個(gè)蛋白與其他蛋白無(wú)關(guān)聯(lián),其余蛋白與網(wǎng)絡(luò)中其他蛋白均產(chǎn)生緊密相關(guān)性,網(wǎng)絡(luò)中蛋白節(jié)點(diǎn)數(shù)為13,網(wǎng)絡(luò)預(yù)期邊數(shù)為5,共產(chǎn)生17條邊,平均節(jié)點(diǎn)度為2.62,PPI富集P值為1.11×10-5,表明網(wǎng)絡(luò)中蛋白與蛋白高度關(guān)聯(lián),其中有絲分裂活化蛋白激酶14(MAPK14)、核受體輔活化因子2(NCOA2)、過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體(PPARG)及雌激素受體1(ESR1)在PPI中節(jié)點(diǎn)數(shù)最高,為關(guān)鍵蛋白。異甘草素可能通過(guò)影響上述4個(gè)關(guān)鍵蛋白活性或調(diào)節(jié)關(guān)鍵蛋白表達(dá),進(jìn)而影響整個(gè)網(wǎng)絡(luò),達(dá)到治療腹瀉目的。
圖2 交集靶標(biāo)蛋白互作圖Fig.2 PPI of intersection target
對(duì)上述靶標(biāo)基因作富集分析,KEGG分析結(jié)果見圖3,這些蛋白主要參與成纖維細(xì)胞增值通路調(diào)節(jié)、平滑肌細(xì)胞凋亡過(guò)程調(diào)節(jié)及應(yīng)激反應(yīng)等相關(guān)生物學(xué)過(guò)程,表明異甘草素可能通過(guò)上述基因通路和生物學(xué)過(guò)程,達(dá)到治療腹瀉目的。
圖3 KEGG分析Fig.3 KEGG analysis
對(duì)異甘草素治療腹瀉的相關(guān)靶標(biāo)作GO基因富集分析,試驗(yàn)結(jié)果如圖4所示,不同顏色分別代表不同富集類別,紅色代表生物學(xué)過(guò)程、藍(lán)色代表細(xì)胞成分、綠色代表分子功能。
圖4 GO分析Fig.4 GO analysis
結(jié)果表明這些靶標(biāo)基因與應(yīng)激反應(yīng)、生物學(xué)運(yùn)動(dòng)及細(xì)胞信息傳遞等生物學(xué)過(guò)程緊密聯(lián)系。同時(shí),這些靶標(biāo)基因參與細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核物質(zhì)調(diào)控,與蛋白互作及細(xì)胞信息傳遞高度相關(guān)。
基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析,找到異甘草素治療腹瀉的4個(gè)關(guān)鍵靶標(biāo),分別為MAPK14、NCOA2、PPARG以及ESR1。通過(guò)分子對(duì)接分析異甘草素與4個(gè)關(guān)鍵靶標(biāo)結(jié)合作用。如圖5所示,異甘草素分別有效占據(jù)4個(gè)蛋白活性腔內(nèi),異甘草素在該結(jié)構(gòu)域內(nèi)與底物存在競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系,抑制蛋白功能。異甘草素與4個(gè)蛋白結(jié)合能分別為-30.25、-42.65、-37.64和-46.56 KJ.mol-1。表明異甘草素可自發(fā)與4種蛋白產(chǎn)生結(jié)合,是靶標(biāo)潛在競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑。
為進(jìn)一步驗(yàn)證異甘草素與關(guān)鍵靶標(biāo)關(guān)系,利用熒光定量PCR檢測(cè)異甘草素對(duì)關(guān)鍵靶標(biāo)基因表達(dá)的影響。異甘草素顯著下調(diào)MAPK14、NCOA2、PPARG及ESR1基因表達(dá),結(jié)果見圖6。表明異甘草素通過(guò)影響關(guān)鍵靶標(biāo)基因表達(dá)調(diào)控腹瀉相關(guān)通路,達(dá)到治療腹瀉的作用。
圖6 異甘草素對(duì)關(guān)鍵靶標(biāo)基因表達(dá)的影響Fig.6 Effect of isoglycyrrhizin on the expression of key target genes
異甘草素具有良好抗腹瀉效果,可顯著降低腹瀉次數(shù),延緩初次腹瀉時(shí)間,作為一種非特異性抗腹瀉藥物具有一定開發(fā)前景[10-11]。為更好探究異甘草素抗腹瀉作用機(jī)制,本文通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接方法尋找異甘草素治療腹瀉關(guān)鍵蛋白。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是借助網(wǎng)絡(luò)研究藥物-靶標(biāo)-疾病之間關(guān)系,基于現(xiàn)有數(shù)據(jù)信息再次整合,挖掘藥物治療疾病藥理作用的研究方法[12]。本研究探討異甘草素治療腹瀉的關(guān)鍵靶標(biāo)和關(guān)鍵通路,結(jié)果表明MAPK14、NCOA2、PPARG和ESR1可能是異甘草素治療腹瀉關(guān)鍵蛋白。同時(shí),本研究利用熒光定量技術(shù)確定異甘草素對(duì)上述關(guān)鍵靶標(biāo)基因的影響。白東東等利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析白頭翁治療腹瀉分子機(jī)制,確定雌激素受體1(Estrogen receptor,ESR1)、CREB結(jié)合蛋白(CREB binding protein,CREBBP)等gned45個(gè)關(guān)鍵靶標(biāo)[13],與本研究結(jié)果相似。在異甘草素治療腹瀉關(guān)鍵靶標(biāo)中,MAPK14在結(jié)腸炎中具有重要調(diào)節(jié)作用,研究表明蓖麻油可對(duì)腸黏膜產(chǎn)生強(qiáng)烈刺激,引起腸道炎癥導(dǎo)致動(dòng)物腹瀉[14]。此外,研究表明NCOA2參與腸道膽汁酸相關(guān)通路調(diào)節(jié),與結(jié)腸炎發(fā)生和發(fā)展相關(guān)[15]。PPARG主要存在3個(gè)亞型,多在脂肪組織內(nèi)表達(dá),參與膽固醇和脂質(zhì)代謝等生物學(xué)過(guò)程,對(duì)腸道內(nèi)微環(huán)境有一定調(diào)節(jié)作用,與腹瀉發(fā)生相關(guān)[16]。分子對(duì)接技術(shù)是目前篩選和設(shè)計(jì)靶向性藥物的有效手段,為藥物研發(fā)提供重要數(shù)據(jù)支撐和試驗(yàn)依據(jù)。通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬技術(shù)進(jìn)行分子對(duì)接已成為藥物研發(fā)主要途徑[17]。在本研究中利用Discovery Stiudio 2016進(jìn)行半柔性對(duì)接,小分子可根據(jù)鍵轉(zhuǎn)角合理改變構(gòu)象,使結(jié)果更加準(zhǔn)確。分子對(duì)接結(jié)果顯示異甘草素能夠有效與MAPK14、NCOA2、PPARG以及ESR1產(chǎn)生結(jié)合,結(jié)合能均為負(fù)值,說(shuō)明異甘草素可通過(guò)抑制上述關(guān)鍵靶標(biāo)活性影響腹瀉相關(guān)生物學(xué)通路,治療腹瀉。
KEGG和GO基因富集分析是分析“藥物-靶標(biāo)-通路”有效手段,KEGG分析結(jié)果表明交集蛋白與成纖維細(xì)胞增值的信號(hào)通路調(diào)節(jié)高度相關(guān),成纖維細(xì)胞是疏松結(jié)締組織的重要細(xì)胞成分,對(duì)維持黏膜固有層和黏膜下層結(jié)構(gòu)具有重要生理作用[18]。表明異甘草素可通過(guò)調(diào)控成纖維細(xì)胞增殖維持腸道管壁結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定,防止腹瀉發(fā)生。GO分析結(jié)果顯示交集靶標(biāo)與應(yīng)激反應(yīng)相關(guān),而造成腹瀉原因之一是機(jī)體對(duì)環(huán)境改變而產(chǎn)生應(yīng)激反應(yīng)[19],表明異甘草素可通過(guò)控制應(yīng)激反應(yīng)發(fā)生降低機(jī)體發(fā)生腹瀉情況。GO分析結(jié)果顯示異甘草素與離子之間相互作用有關(guān),造成腹瀉發(fā)生最直接原因是腸道內(nèi)無(wú)機(jī)鹽離子失衡,異甘草素可通過(guò)抑制關(guān)鍵蛋白,引起相關(guān)基因表達(dá),輻射至整個(gè)信號(hào)通路,影響胃腸道內(nèi)環(huán)境,延緩腹瀉發(fā)生?;诰W(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接研究,表明異甘草素可能通過(guò)維持腸道內(nèi)環(huán)境,降低炎癥反應(yīng),起抗腹瀉作用。
綜上所述,異甘草素作為抗腹瀉藥物具有良好開發(fā)前景。本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接,分析異甘草素治療腹瀉的潛在靶標(biāo)及可能影響的生物學(xué)過(guò)程,初步探討其抗腹瀉分子機(jī)制,為后續(xù)異甘草素抗腹瀉研究奠定理論基礎(chǔ)。