王新濤,李保葉,楊 青,代資舉,郝俊杰
(1. 河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 植物保護研究所,河南 鄭州 450002;2. 河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 芝麻研究中心,河南 鄭州450002;3. 河南省作物分子育種研究院,河南 鄭州 450002)
玉米是重要的糧食作物和飼料作物,在國民經(jīng)濟中占有非常重要的地位,而玉米產(chǎn)量的提高是玉米育種者和生產(chǎn)者追求的永恒目標(biāo)[1]。研究表明,玉米籽粒相關(guān)性狀如粒質(zhì)量、粒長和粒寬等是構(gòu)成產(chǎn)量的主要因素,這些籽粒相關(guān)性狀與產(chǎn)量具有高度的相關(guān)性[2]。因此,從分子水平上解析籽粒粒質(zhì)量、粒長和粒寬的遺傳基礎(chǔ),對于有效開展籽粒相關(guān)性狀的分子育種進而提高玉米產(chǎn)量具有重要意義。
籽粒粒質(zhì)量、粒長和粒寬等性狀均為多基因控制的數(shù)量性狀,國內(nèi)外研究者對籽粒相關(guān)性狀進行了大量的QTL(Quantitative trait loci)定位分析,對其內(nèi)在遺傳機制研究也在逐漸深入[3?4]。MESSMER等[5]通過構(gòu)建的重組自交系(Recombinant inbred line,RIL)群體定位到8個百粒質(zhì)量QTL;張向歌等[6]利用74 個單片段代換系,在2 個環(huán)境條件下同時檢測到2 個粒質(zhì)量QTL 和2 個粒長QTL;LI 等[7]利用11個RIL 群體進行籽粒相關(guān)性狀的QTL 定位,檢測到146 個與產(chǎn)量和籽粒性狀相關(guān)的QTL,其中粒質(zhì)量Lqkwei4和粒長Lqklen4-1在多個環(huán)境下被定位在bin 4.05 的臨近區(qū)間,其最大貢獻率分別達到27%和24%;王安貴等[8]利用T32 與齊319 構(gòu)建的F2:3家系,分別檢測到2 個控制粒質(zhì)量、2 個控制粒長和7個控制粒寬的QTL,單個QTL 可解釋4.03%~11.34% 的表型變異。這些籽粒相關(guān)性狀研究中QTL 定位的數(shù)目和位置存在差異,不同的定位結(jié)果也反映了玉米籽粒相關(guān)性狀遺傳調(diào)控的復(fù)雜性。因此,在不同的遺傳背景下,發(fā)掘更多新的或穩(wěn)定的控制玉米籽粒性狀相關(guān)的QTL,有利于進一步解析籽粒性狀的遺傳機制。為此,以玉米籽粒相關(guān)性狀存在顯著差異的玉米自交系鄭58 和D863F 為親本,構(gòu)建包含241 個家系的RIL 群體,利用SSR 分子標(biāo)記對2 a 不同環(huán)境下玉米籽粒百粒質(zhì)量、粒長和粒寬進行QTL 定位,檢測穩(wěn)定表達的QTL,為玉米籽粒相關(guān)主效QTL 的精細定位與候選基因分離及產(chǎn)量分子育種提供理論依據(jù)。
供試材料為玉米籽粒性狀存在顯著差異的自交系鄭58(來自河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院糧食作物研究所,是我國推廣面積最大的玉米雜交種鄭單958 的母本)和D863F(來自中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所種質(zhì)資源庫)及含有241 個家系的RIL 群體。其中,RIL 群體是以鄭58 和D863F 為親本,從F2后采用單粒傳法連續(xù)自交至F7所得。
田間試驗于2018 年夏季在河南省西平縣試驗基地(113°36'E、33°10'N)、2019 年夏季在河南省原陽縣河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技試驗示范基地(113°96'E、35°05'N)進行。供試材料種植行長2 m,行距0.6 m,株距0.25 m,正常田間管理。
河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院郝俊杰課題組前期已經(jīng)對親本鄭58 和D863F 進行多態(tài)性SSR 標(biāo)記篩選,共鑒定出有差異性的標(biāo)記215個(數(shù)據(jù)未發(fā)表)。本研究用這215 對引物進行PCR 擴增。PCR 反應(yīng)體系為10 μL,其中,DNA 模板2.0 μL,上、下游引物各0.4 μL,Mix 5.0 μL,ddH2O 2.8 μL。擴增程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性60 s,60 ℃退火50 s,72 ℃延伸50 s,35 個循環(huán);72 ℃延伸5 min。PCR 產(chǎn)物在ABI 3500XL 基因分析儀中進行電泳和分析。
河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院郝俊杰課題組前期利用JoinMap 4.0 軟件構(gòu)建了該RIL 群體的遺傳連鎖圖譜,圖譜全長為1 832.35 cM,平均遺傳距離為8.52 cM,并進行了抗病等性狀(粗縮病和葉寬)的定位分析[9?10]。本研究采用QTL IciMapping 4.0 軟件的完備區(qū)間作圖法對2 a 不同環(huán)境下的百粒質(zhì)量、粒長、粒寬進行QTL 分析,設(shè)定LOD(Likelihood of odd)閾值為2.5,PIN(Pvalues for entering variables)設(shè)為0.01,通過1 000 次模擬運算檢測確定[11]。QTL 命名方式為q+性狀名稱縮寫+染色體,如果同一染色體存在多個QTL位點,則在染色體后加上相應(yīng)的編號。
對玉米親本及RIL群體的籽粒相關(guān)性狀進行分析(表1、圖1—2),結(jié)果表明,2 a不同環(huán)境下,親本鄭58 的百粒質(zhì)量、粒長和粒寬平均值均高于D863F,均存在顯著(P<0.05)或極顯著(P<0.01)差異。RIL群體中不同株系的百粒質(zhì)量、粒長和粒寬均表現(xiàn)出較大的變異。其中,2 a 百粒質(zhì)量的變異系數(shù)最大,分別為16.18%和15.50%,粒長的變異系數(shù)分別為7.49%和7.16%,粒寬的變異系數(shù)分別為7.00%和6.39%。除2018 年粒長的峰度絕對值大于1 外,其他性狀的峰度、偏度絕對值均小于1,基本符合連續(xù)的正態(tài)分布,表明籽粒相關(guān)性狀屬于典型的受多基因控制的數(shù)量性狀,適合進行QTL定位研究。
表1 不同環(huán)境下玉米親本及RIL群體籽粒相關(guān)性狀分析Tab.1 Traits related with kernel in parents and RIL population under different environments
對2 a不同環(huán)境下玉米RIL群體的百粒質(zhì)量、粒長和粒寬進行相關(guān)性分析(表2),結(jié)果表明,玉米RIL 群體百粒質(zhì)量、粒長和粒寬兩兩之間呈極顯著正相關(guān)。其中,百粒質(zhì)量與粒寬相關(guān)系數(shù)最大,2 a分別為0.91 和0.87;粒長與粒寬的相關(guān)系數(shù)最小,分別為0.63 和0.64。方差分析結(jié)果表明,百粒質(zhì)量、粒長和粒寬均具有較高的廣義遺傳力,分別為0.86、0.89和0.88(表3)。
表2 玉米RIL群體籽粒性狀的相關(guān)性分析Tab.2 Correlation analysis among traits related with kernel in maize RIL population
表3 不同環(huán)境下玉米RIL群體籽粒相關(guān)性狀的方差分析Tab.3 Variance analysis on traits related with kernel in maize RIL population under different environments
本研究在2 a不同環(huán)境下共檢測到14個與玉米百粒質(zhì)量、粒長和粒寬有關(guān)的QTL,分別位于玉米的第2、3、4、7 染色體上。其中,第4 染色體上檢測到的QTL 增效等位基因來源于D863F,其余QTL 的增效等位基因均來自于鄭58,單個QTL 表型貢獻率(Phenotypic variance explained,PVE)介于6.42%~13.41%(表4、圖3)。
2.3.1 百粒質(zhì)量QTL 定位 2 a 不同環(huán)境下共檢測到6 個控制玉米籽粒百粒質(zhì)量的QTL(表4、圖3),且所有QTL 在2 a 不同環(huán)境下定位區(qū)間相同,表型貢獻率為6.47%~13.41%。其中,位于第2 染色體的q100KW2兩年的表型貢獻率均大于10%,為主效QTL。
2.3.2 粒長QTL 定位 2 a 不同環(huán)境下共檢測到3個控制玉米籽粒粒長的QTL(表4、圖3),表型貢獻率為6.80%~7.92%。其中,QTLqKL7在2 a 不同環(huán)境下定位區(qū)間相同;2019 年檢測到的qKL4增效等位基因來源于D863F,表型貢獻率為7.92%。
2.3.3 粒寬QTL 定位 2 a 不同環(huán)境下共檢測到5個控制玉米籽粒粒寬的QTL(表4、圖3),其中,QTLqKW3-1和qKW4在2 a 不同環(huán)境下定位區(qū)間相同。qKW3-1兩年的表型貢獻率分別為6.42%、7.06%,增效等位基因來源于鄭58;qKW4兩年的表型貢獻率分別為10.66%、8.90%,增效等位基因來源于D863F;2019 年檢測到的qKW3-2表型貢獻率為12.57%。
2.3.4 百粒質(zhì)量、粒長、粒寬QTL 共定位 2 a 不同環(huán)境條件下,在第4 染色體umc1891—mmc0371 區(qū)間內(nèi)同時檢測到控制百粒質(zhì)量、粒長和粒寬的QTLq100KW4、qKL4和qKW4,表型貢獻率最高達10.66%;在第7 染色體umc2333—umc1841 區(qū)間內(nèi)同時檢測到控制百粒質(zhì)量和粒長的QTLq100KW7和qKL7(表4、圖3)。
表4 玉米RIL 群體籽粒性狀相關(guān)QTLTab.4 QTLs related with kernel traits in maize RIL population
百粒質(zhì)量、粒長和粒寬是玉米產(chǎn)量主要構(gòu)成因素[12?13]。本研究結(jié)果表明,玉米籽粒的百粒質(zhì)量、粒長和粒寬性狀存在較大變異,2 a不同環(huán)境下百粒質(zhì)量與粒長、粒寬均呈極顯著正相關(guān),表明粒寬和粒長是決定百粒質(zhì)量的重要因素。張偉強等[14]研究發(fā)現(xiàn),百粒質(zhì)量與籽粒深度呈極顯著正相關(guān);張向歌等[6]研究發(fā)現(xiàn),百粒質(zhì)量與粒長呈顯著正相關(guān),與粒寬呈正相關(guān),這與本研究結(jié)果相似。因此,在玉米籽粒性狀改良過程中,應(yīng)充分認識三者的緊密相關(guān)性,重視對百粒質(zhì)量和粒寬/粒長的協(xié)同改良。
玉米籽粒相關(guān)性狀屬于多基因控制的數(shù)量性狀,解析其遺傳組成對玉米產(chǎn)量的提高具有重要意義[15]。本研究利用RIL 群體進行玉米籽粒相關(guān)性狀的QTL 定位,共定位到14 個相關(guān)的QTL,包括6 個百粒質(zhì)量相關(guān)的QTL、3個粒長相關(guān)的QTL和5個粒寬相關(guān)的QTL。其中,在第4 染色體umc1891—mmc0371 區(qū)間定位到的控制百粒質(zhì)量的QTLq100KW4與PENG 等[16]定 位 的 百 粒 質(zhì) 量QTLQqkwei4一致,在第7 染色體umc2333—umc1841 區(qū)間定位到的控制百粒質(zhì)量QTLq100KW7與趙璞等[17]定位的百粒質(zhì)量QTLqkwb5一致。馬娟等[18]研究發(fā)現(xiàn),玉米第4 染色體(bin4.03—bin4.05)包含控制百粒質(zhì)量、粒長和粒寬的熱點區(qū)域,江培順等[19]在第4(bin4.05)和第7(bin7.02)染色體也發(fā)現(xiàn)了影響粒質(zhì)量的一致性QTL,與本研究的定位結(jié)果一致,由此推測以上2 個百粒質(zhì)量QTL 可靠性較高,具有潛在的育種利用價值。位于第2染色體的控制百粒質(zhì)量的主效QTLq100KW2至今未見報道,是新發(fā)現(xiàn)的QTL,這為分子標(biāo)記輔助選擇育種及粒質(zhì)量改良提供了重要參考。
研究表明,相同或鄰近QTL 具有同時控制多個目標(biāo)性狀的效應(yīng),這些定位區(qū)域內(nèi)可能存在不同性狀緊密連鎖的QTL 或者存在一因多效QTL[20?21]。本研究發(fā)現(xiàn),在第4 染色體umc1891—mmc0371 區(qū)間同時檢測到控制百粒質(zhì)量、粒長和粒寬的QTL,在第7 染色體umc2333—umc1841 區(qū)間也同時檢測到控制百粒質(zhì)量和粒長的QTL,推測定位區(qū)間可能存在同時影響百粒質(zhì)量、粒長、粒寬或者百粒質(zhì)量、粒長從而影響玉米產(chǎn)量的主效基因。進一步明確這些一因多效QTL 將為后續(xù)精細定位和挖掘高產(chǎn)基因奠定基礎(chǔ)。