陳志輝, 周銳, 唐瑩, 周岱翰
1.廣州中醫(yī)藥大學第一臨床醫(yī)學院,廣東 廣州 510405;2.廣州中醫(yī)藥大學第二臨床醫(yī)學院,廣東 廣州 510405;3.廣州中醫(yī)藥大學腫瘤研究所,廣東 廣州 510405
在全世界范圍內(nèi),惡性腫瘤是威脅人類健康的重大疾病之一,因其具有高發(fā)病率、高復發(fā)率、高死亡率等特點而備受關(guān)注。據(jù)統(tǒng)計,2018年全球新增癌癥患者1 810萬,我國占380.4萬例,其中肺癌的發(fā)病率為11.8%,病死率為18.4%[1]。而非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)約占了所有類型肺癌的80%,且五年生存率低于10%[2]。目前NSCLC的治療主要有手術(shù)、放療、化療、分子靶向治療、免疫治療和中醫(yī)藥治療等。其中,中醫(yī)藥在治療NSCLC方面具有獨特優(yōu)勢,除了可延長患者生存期,還可減少放化療和分子靶向治療的毒副反應[3-4]。
鶴蟾片是國醫(yī)大師周岱翰教授的經(jīng)驗方,有多年的臨床應用基礎(chǔ)。鶴蟾片主要由仙鶴草、干蟾皮、半夏、天冬、浙貝母、貓爪草、葶藶子、魚腥草、人參組成,方中干蟾皮清熱解毒,利水消脹;仙鶴草補虛止血;半夏、貓爪草、浙貝母化痰散結(jié);魚腥草清熱解毒,消癰排膿;葶藶子瀉肺平喘,利水消腫;天冬養(yǎng)陰潤燥,清肺生津;人參大補元氣,補脾益肺,全方配伍,具有解毒除痰、凉血養(yǎng)陰、消癥散結(jié)等功效,用于治療原發(fā)性支氣管肺癌及肺部轉(zhuǎn)移[5]。目前已有多項研究表明,鶴蟾片具有抑瘤作用。周岱翰等[5]用鶴蟾片治療102例晚期肺癌患者(單服鶴蟾片組62例,手術(shù)治療配合鶴蟾片組31例,化療配合鶴蟾片組9例)。其中單服鶴蟾片組,顯效6例,有效33例,總體有效率為62.9%,平均生存時間7.66個月;手術(shù)治療配合鶴蟾片組有效26例,平均生存時間9.1個月;化療配合鶴蟾片組顯效1例,有效4例,平均生存時間6.1個月。鶴蟾片對于肺癌的治療具有較好的臨床療效,而此次的研究也獲得了全國中醫(yī)藥重大科技成果乙等獎。熊紹權(quán)等[6]研究發(fā)現(xiàn),鶴蟾片含藥血清對人肺腺癌A549細胞具有生長抑制作用,并證實為通過誘導細胞凋亡途徑,其分子機制可能與抑制EGFR基因的轉(zhuǎn)錄表達有關(guān)。本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學方法,構(gòu)建“鶴蟾片-活性成分-靶點-非小細胞肺癌”網(wǎng)絡(luò),結(jié)合生物學信息分析,探索更多有關(guān)鶴蟾片治療NSCLC的潛在靶點及作用機制。
通過中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)尋找鶴蟾片(仙鶴草、干蟾皮、半夏、天冬、浙貝母、貓爪草、葶藶子、魚腥草、人參)9味中藥化學組成成分,根據(jù)口服利用度(oral bioavailability,OB)≥30%且類藥性(drug likeness,DL)≥ 0.18的2個體外藥代幼力學屬性值進行活性成分的初步篩選,并根據(jù)已發(fā)表的文獻報道補充未預測到的活性成分。
通過PubChem數(shù)據(jù)庫(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)獲取中藥活性成分的結(jié)構(gòu),將其2D結(jié)構(gòu)保存為SDF格式。將活性成分結(jié)構(gòu)導入Swiss Target Prediction數(shù)據(jù)庫(http://www.swisstargetprediction.ch)中進行靶點預測,以獲取活性成分的靶點。其中把Probability<0.1的靶點及未能預測到的活性成分進行剔除。
通過GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org)檢索“非小細胞肺癌”靶點,以Score值為條件獲取疾病靶點。將中藥活性成分預測靶點與非小細胞肺癌疾病靶點取交集,獲得成分-疾病共同靶點。之后使用Cytoscape 3.8.2構(gòu)建“鶴蟾片-活性成分-靶點-非小細胞肺癌”網(wǎng)絡(luò),篩選出主要活性成分。
將交集靶點提交至STRING11.0數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org)構(gòu)建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)模型,將生物種類設(shè)定為“Homo sapiens”,最小互相作用閾值設(shè)定為“highest confidence”(>0.9),其余設(shè)置均為默認設(shè)置,得到PPI網(wǎng)絡(luò)。將PPI網(wǎng)絡(luò)導入Cytoscape 3.8.2進行可視化,并使用Network Analyzer功能計算Degree值,根據(jù)Degree值篩選核心靶點。
使用R軟件3.6.2中的“clusterProfiler”包對核心靶點進行富集分析,包括基因本體論(gene ontology,GO)和生物學通路(biological pathway)富集分析,使用Bonferroni檢驗法校正P值,并設(shè)定P<0.05,篩選出具統(tǒng)計學意義的生物學過程和信號通路。
通過TCMSP數(shù)據(jù)庫以及已發(fā)表的相關(guān)文獻報道檢索鶴蟾片的活性成分,其中仙鶴草41個,干蟾皮30個,半夏116個,天冬32個,浙貝母17個,貓爪草79個,葶藶子68個,魚腥草50個,人參190個。根據(jù)ADME篩選后獲得活性成分共99個,其中仙鶴草5個,干蟾皮12個,半夏13個,天冬9個,浙貝母7個,貓爪草12個,葶藶子12個,魚腥草7個,人參22個。將99個中藥活性成分導入PubChem數(shù)據(jù)庫,剔除無法獲得結(jié)構(gòu)或結(jié)構(gòu)種類不明確的活性成分,最終得到活性成分72個,其中仙鶴草4個,干蟾皮8個,半夏12個,天冬6個,浙貝母6個,貓爪草8個,葶藶子9個,魚腥草5個,人參14個(見表1)。將72個活性成分導入SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫進行靶點預測,共得到預測靶點3 233個,去除重復靶點后,得到活性成分靶點772個。
表1 鶴蟾片的活性成分Table 1 Active components of He Chan Tablets
在GeneCards數(shù)據(jù)庫中檢索到非小細胞肺癌相關(guān)靶點共計19 240個,根據(jù)經(jīng)驗,若靶點過多則設(shè)定Score大于中位數(shù)的目標靶點為非小細胞肺癌的潛在靶點。因此選取Score≥37.16的1 204個靶點作為非小細胞肺癌的潛在靶點。
將篩選的772個鶴蟾片活性成分靶點與非小細胞肺癌的1 204個靶點取交集,得到交集靶點228個(見圖1)。將72個鶴蟾片活性成分與228個潛在靶點,通過Cytoscape 3.8.2軟件構(gòu)建“鶴蟾片-活性成分-靶點-非小細胞肺癌”網(wǎng)絡(luò)(見圖2),經(jīng)過NetworkAnalyzer網(wǎng)絡(luò)拓撲分析后,得出度值(Degree)最高的5個活性成分(見表2),這5個成分可能是鶴蟾片治療NSCLC的主要活性成分。
圖1 鶴蟾片活性成分靶點與非小細胞肺癌靶點韋恩圖Figure 1 Venn Diagram of relationship between active components targets of HeChan Tablets and NSCLC potential targets
圖2 鶴蟾片活性成分-非小細胞肺癌靶點網(wǎng)絡(luò)Figure 2 The “compound-target-disease” network of HeChan tablets and NSCLC.(The blue nodes represent the active components of HeChan tablets;The green nodes represent potential targets;The red nodes represent HeChan tablets;The size of the nodes represent the degree)
表2 鶴蟾片度值排名前5的主要活性成分Table 2 The main five active components of He Chan Tablets
將228個共同靶點導入String 11.0數(shù)據(jù)庫檢索其相互作用的蛋白,得到216個節(jié)點(其中SCN9A、 PLA2G2A、 P2RX7、 HNF4A、 GBA、TYR、HPGD、ANPEP、ROS1、MIF、CHRNA3、NQO2無相互作用,故剔除),1574條邊,置信度≥0.90的PPI網(wǎng)絡(luò)。采用Cytoscape 3.8.2進行篩選核心靶點及可視化,使用Network Analyzer進行拓撲分析后,以degree≥9為篩選條件,最終獲得116個核心靶點和1 513條邊(見圖3)。度值排名前10的核心靶點見表3。
表3 度值排名前10的核心靶點Table 3 The main potential targets of HeChan Tablets
圖3 鶴蟾片-非小細胞肺癌核心靶點的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)Figure 3 The PPI network of the main potential targets between HeChan tablets and NSCLC.(The size of the nodes represent the degree;The colour represent the betweenness centrality)
使用R軟件中的clusterProfiler包對核心靶點進行富集分析。GO分析包括分子功能(Molecular Function, MF)、 生 物 過 程(Biological Process,BP)、和細胞組成(Cellular Component,CC)三個部分,結(jié)果見圖5。MF富集結(jié)果顯示:核心靶點主要涉及蛋白絲氨酸/蘇氨酸激酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性、磷酸酶結(jié)合、蛋白磷酸酶結(jié)合、激素受體結(jié)合等功能;BP富集結(jié)果顯示:核心靶點主要涉及肽基酪氨酸磷酸化、肽基絲氨酸磷酸化、蛋白激酶B信號、磷脂酰肌醇介導的信號傳導、磷脂酰肌醇3-激酶信號傳導等生物過程;CC富集結(jié)果顯示:核心靶點主要涉及細胞膜、神經(jīng)元胞體、黏著斑、蛋白激酶復合物、細胞周期蛋白依賴性蛋白激酶全酶復合物等細胞成分。根據(jù)核心靶點通路的富集分析結(jié)果,主要涉及的通路有:PI3K-AKT信號通路、癌癥中的蛋白多糖、非小細胞肺癌、EGFR酪氨酸激酶抑制劑耐藥、前列腺癌、胰腺癌等通路(見圖4)。
圖4 核心靶點的富集分析結(jié)果(注:A:GO-MF分析;B:GO-BP分析;C:GO-CC分析;D:KEGG分析)Figure 4 Result of the GO enrichment analysis(A:GO-Molecular Function;B:GO-Biological Process;C:GO-Cellular Component;D:KEGG pathway)
古代并無肺癌病名,文獻中關(guān)于“咳嗽”“肺痿”“痰飲”“肺積”“息賁”等病證的描述與肺癌具有高度相似性。周岱翰教授在多年的臨床實踐過程中,認為肺癌的辨證不離“痰”“瘀”“虛”“毒”四個方面。病機特點總屬“本虛標實”,本虛以肺脾兩虛多見,久病入絡(luò),病久及腎,標實則痰瘀互結(jié)常見。根據(jù)肺癌的發(fā)病特點將肺癌分為肺郁痰瘀、脾虛痰濕、陰虛痰熱、氣陰兩虛4種證型。鶴蟾片全方配伍,具有解毒除痰、凉血養(yǎng)陰、消癥散結(jié)的功效,切中肺癌“痰”“瘀”“虛”“毒”的辨證特點。
網(wǎng)絡(luò)藥理學是基于網(wǎng)絡(luò)觀點從系統(tǒng)水平識別“疾病-表型-基因-藥物”的多層次關(guān)系,體現(xiàn)了中藥多成分-多靶點-多途徑作用的特征,符合中醫(yī)藥整體觀及組方配伍原則,是中藥研究和新藥發(fā)掘的一種新方法[7]。本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學方法,構(gòu)建“鶴蟾片-活性成分-靶點-非小細胞肺癌”網(wǎng)絡(luò),得出鶴蟾片的5個主要活性成分為:黃芩素(baicalein)、槲皮素(quercetin)、異鼠李素(isorhamnetin)、山柰酚(kaempferol)、五味子酯乙(Gomisin B)。黃芩素屬于黃酮類化合物,研究表明黃芩素具有多種藥理作用,如抗菌、抗病毒、抗炎、抗變態(tài)反應、抗氧化、清除氧自由基、抗凝、抗血栓形成、抗腫瘤和保護肝臟、心腦血管、神經(jīng)元等作用[8-13]。而黃芩素在非小細胞肺癌方面,主要是通過細胞周期進程、凋亡相關(guān)蛋白及通路、血管生成、上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化、腫瘤微環(huán)境、抗氧化等多方面調(diào)控NSCLC細胞的增殖、凋亡、侵襲、化療敏感性等生物學行為,具有廣泛的抗腫瘤作用[14]。鶴蟾片中的仙鶴草、魚腥草、葶藶子、天冬都含有槲皮素,研究表明槲皮素具有明顯的抑制A549細胞增殖、遷移和侵襲能力,其機制可能與STAT3信號通路的抑制有關(guān)[15]。羅進勇等[16]發(fā)現(xiàn)槲皮素能抑制肺腺癌A549細胞的生長,其機制可能與上調(diào)促凋亡蛋白p53表達和下調(diào)凋亡抑制蛋白Bcl-2的表達有關(guān)。朱玲等[17]進行體內(nèi)外研究結(jié)果表明異鼠李素可下調(diào)bcl-2基因、PCNA蛋白表達,上調(diào)抑癌基因P53,bax及caspase-3基因,抑制人體肺腺癌A549細胞生長。張敬等[18]發(fā)現(xiàn)山柰酚可通過抑制雌激素受體相關(guān)受體發(fā)揮降低非小細胞肺癌A549細胞侵襲和遷移能力。劉小東等[19]發(fā)現(xiàn)五味子酯乙能高效逆轉(zhuǎn)肺癌耐紫杉醇A549/Tax細胞對多種化療藥物的耐藥性,其機制可能與抑制P糖蛋白的藥物外排功能和下調(diào)其蛋白表達有關(guān)。
根據(jù)PPI網(wǎng)絡(luò)結(jié)果顯示,本研究的核心靶點為PIK3CA、PIK3R1、MAPK1、AKT1、SRC 等。而根據(jù)KEGG富集分析結(jié)果顯示,PI3K-AKT信號通路為主要通路,其次為癌癥中的蛋白多糖、前列腺癌、EGFR酪氨酸激酶抑制劑耐藥、胰腺癌、非小細胞肺癌等通路。磷脂酰肌醇-3激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)是一種可催化磷脂酰肌醇D3位磷酸化的脂類激酶,在PI3K家族中,研究最廣泛的是能被細胞表面受體所激活的Ⅰ型PI3K。IA型PI3K是由催化亞基p110和調(diào)節(jié)亞基p85所組成的二聚體蛋白,具有類脂激酶和蛋白激酶的雙重活性[20]。PIK3R1基因編碼表達PI3K的調(diào)節(jié)亞單位p85,而PIK3CA基因編碼表達PI3K的催化亞單位p110。研究表明[21]PI3K在非小細胞肺癌發(fā)展中起重要作用,當PIK3CA基因突變可導致p110α酶活性增強、激活AKT信號、減少細胞對生長因子的依賴、抑制細胞的凋亡和促進腫瘤的侵襲。Akt基因是一個絲/蘇氨酸蛋白激酶,又被稱為蛋白激酶B,是PI3K下游的作用靶點[20]。研究表明[22]AKT是PI3K/AKT信號通路的核心,激活狀態(tài)的AKT表達升高被證實存在于43%~90%的NSCLC病例中,而且激活狀態(tài)的AKT表達于早期的原發(fā)性腫瘤中的患者往往預后差,且AKT的過度激活與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及侵襲、轉(zhuǎn)移等有關(guān)。PI3K/AKT通路是NSCLC最常見的調(diào)控途徑之一,其對癌細胞的生存以及疾病的發(fā)生發(fā)展都至關(guān)重要,包括腫瘤的發(fā)生、增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移,抑制腫瘤細胞凋亡促進血管生成和化療耐藥等都與PI3K/AKT通路相關(guān)[23]。因此阻斷PI3K/AKT信號通路有可能抑制NSCLC的生存途徑并誘導其凋亡。此外,研究表明絲裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)的過度激活與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及侵襲和轉(zhuǎn)移過程密切相關(guān)[24]。張潔等[25]發(fā)現(xiàn)Src作為胞漿內(nèi)蛋白,能與細胞膜上的許多生長因子受體相互作用,進而激活Src蛋白。激活的Src蛋白使其下游信號發(fā)生瀑布效應,通過組織MAPK以及STAT3信號通路促進腫瘤細胞增殖和轉(zhuǎn)移[26]。
綜上所述,本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學方法初步探討了鶴蟾片治療非小細胞肺癌的主要活性成分、核心靶點、信號通路,揭示鶴蟾片是通過多成分、多靶點、多通路共同發(fā)揮藥理作用。但限于網(wǎng)絡(luò)藥理學方法的局限性,本研究結(jié)果可能出現(xiàn)藥物活性成分及潛在靶點收集不全、或數(shù)據(jù)庫信息未能及時更新所致研究結(jié)果不準確等問題,后續(xù)仍需通過動物和細胞實驗加以佐證。