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貴腐菌的篩選鑒定及培養(yǎng)條件優(yōu)化

2021-10-11 11:18王超萍劉凡啟嚴(yán)戰(zhàn)偉尹向田丁燕
中外葡萄與葡萄酒 2021年5期
關(guān)鍵詞:氮源碳源菌落

王超萍,劉凡啟,嚴(yán)戰(zhàn)偉,尹向田*,丁燕*

(1.山東省葡萄研究院/山東省葡萄栽培與精深加工工程技術(shù)研究中心,山東濟(jì)南 250100;2.山東新豐農(nóng)業(yè)開發(fā)股份有限公司,山東威海 264500;3.北京張?jiān)垤潮H酒莊有限公司,北京 101500)

灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea),屬半知菌綱,叢梗孢目,叢梗孢科,葡萄孢屬,是產(chǎn)生貴腐作用的病原菌[1]。該菌的寄生范圍比較廣[2],可以侵染200多種植物的不同組織,對(duì)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)有較大危害[3-4]。在葡萄貯存中,灰葡萄孢菌繁殖速率快,變異率高,適應(yīng)性強(qiáng)[5],造成的損失最為嚴(yán)重[6]。2013年10月,美國加州大學(xué)金海翎教授發(fā)現(xiàn)灰霉菌是世界上首個(gè)可以利用小分子RNA達(dá)到有效侵染的病原菌,由此開啟了一個(gè)新的研究方向[7]。

葡萄果實(shí)成熟期間,在夜間迷霧濕度大而白天晴朗干燥的干濕交替條件下,貴腐菌才能對(duì)葡萄果實(shí)發(fā)生適度侵染,導(dǎo)致果實(shí)在樹體上天然濃縮。貴腐菌在侵染過程中改變了葡萄的新陳代謝,刺激果實(shí)產(chǎn)生一些次生代謝產(chǎn)物,進(jìn)一步豐富了葡萄的風(fēng)味物質(zhì),使釀成的貴腐酒有別于其他甜葡萄酒,具有獨(dú)特的風(fēng)味。

乳山位于山東半島東南部,地處北緯36°41′~37°08′,東經(jīng)121°11′~121°51′,屬暖溫帶東亞季風(fēng)型大陸性氣候,四季變化和季風(fēng)進(jìn)退較明顯。但與同緯度的內(nèi)陸相比,具有氣候溫和、雨水豐沛、光照充足、無霜期長(zhǎng)的特點(diǎn)。該地以砂質(zhì)壤土為主,透氣性好,排水容易,極有利于葡萄生長(zhǎng)。獨(dú)特的小氣候造就了乳山葡萄酒特有的產(chǎn)區(qū)風(fēng)格,也為貴腐菌的侵染提供了可能。

由于氣候條件對(duì)天然貴腐作用的發(fā)生起著關(guān)鍵影響,除了歐洲傳統(tǒng)的優(yōu)質(zhì)貴腐酒產(chǎn)區(qū)外,世界上其他釀酒葡萄產(chǎn)區(qū)很難在自然條件下使葡萄發(fā)生貴腐作用,因此貴腐酒非常珍貴,目前國內(nèi)沒有批量生產(chǎn)。

Caseys等[8]為了揭示灰葡萄孢的寄主特異性和致病性的遺傳結(jié)構(gòu),對(duì)灰葡萄孢在整個(gè)植物界的侵染結(jié)果進(jìn)行分析,從8種寄主植物的90種基因型上,生成98株灰霉病菌的傳染性矩陣,結(jié)果表明主要是由寄主抗性或病原體毒力的變化所解釋。蘭圓圓等[1]利用從感染灰霉菌的番茄果實(shí)、青菜豆果實(shí)和葉子上分離得到了灰葡萄孢菌,并成功進(jìn)行了人工侵染得到貴腐葡萄;安榮艷等[9]報(bào)道‘霞多麗’貴腐酒研究采用的菌種選自感染了灰霉病的果蔬染病組織,通過不同條件下灰葡萄孢菌種的β-葡萄糖苷酶酶活的測(cè)定與比較,最終選定編號(hào)為Botrytis-T的菌株作為人工貴腐葡萄的侵染使用菌株;汪蕾等[10]在賀蘭山東麓貴腐葡萄特征研究中,從‘威代爾’葡萄上分離得到菌株,經(jīng)過光學(xué)顯微鏡觀察灰葡萄孢為表層侵染,確定其是造成感染的微生物;黃露莉等[11]研究的人工貴腐‘玫瑰蜜’葡萄酒采用的菌種是從‘夏黑’葡萄果實(shí)上分離得到,經(jīng)形態(tài)學(xué)和分子鑒定為灰葡萄孢。此外,也有研究人員對(duì)灰葡萄孢在不同條件下的生長(zhǎng)情況進(jìn)行對(duì)比分析,楊玉紅等[12]調(diào)查了不同碳源、pH、光照、溫度條件對(duì)菌種的影響,得出灰霉菌在以下條件生長(zhǎng)發(fā)育較快:馬鈴薯+葡萄糖培養(yǎng)基,pH5~6、18~26 ℃,每天給予8 h的光照。李寧等[13]探索了在搖瓶液體培養(yǎng)條件下,不同碳源、氮源和無機(jī)鹽對(duì)灰葡萄孢液體深層培養(yǎng)的影響,確定了最佳培養(yǎng)基組成為葡萄糖3%、土豆汁4%、硝酸鉀0.1%、磷酸二氫鉀0.1%、硫酸鎂0.05%;最佳培養(yǎng)條件為溫度26 ℃、pH 5.5、轉(zhuǎn)速120 r/min。在乳山田間試驗(yàn)觀察到晚收的釀酒葡萄‘貴人香’果實(shí)表面前期為黑褐色,呈皺縮甚至干癟狀態(tài),但果肉完好未腐爛,表現(xiàn)出典型的“貴腐”特征,因此采樣作為研究對(duì)象進(jìn)行篩菌鑒定,并研究菌株的最佳培養(yǎng)條件。該研究將為中國貴腐酒的研制及其菌種分子生物學(xué)研究提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

乳山臺(tái)依湖酒莊10月底11月初的晚摘感染貴腐病害的釀酒葡萄‘貴人香’。

培養(yǎng)基有PDA培養(yǎng)基、PSA培養(yǎng)基、葡萄汁瓊脂培養(yǎng)基(自制)、葡萄枝條瓊脂培養(yǎng)基(自制)、MEA麥芽汁瓊脂培養(yǎng)基、PDA改良培養(yǎng)基(1/2PDA+1/2MEA);主要試劑為葡萄糖、蔗糖、淀粉、甘露醇、麥芽糖、牛肉膏、酵母粉、酵母膏、麥芽浸膏、尿素、胰蛋白胨、硫酸銨、硝酸鉀、蛋白胨、硝酸鈉。以上培養(yǎng)基、試劑均購自濟(jì)南賽傲生物技術(shù)有限公司。真菌基因組DNA提取試劑盒:Omega,D3390;DNA純化回收試劑盒:購自天根生化科技(北京)有限公司,DP214;引物:由生工生物工程股份有限公司合成,按照合成單加入ddH2O,制成10 μmol溶液。

1.2 主要儀器與設(shè)備

無菌打孔器:購自濟(jì)南賽傲生物技術(shù)有限公司;光學(xué)顯微鏡:意大利Optika;菌種分離超凈臺(tái):蘇凈安泰。

1.2 方法

1.2.1 貴腐菌的篩選

采用常規(guī)組織分離方法[11]。選取感染貴腐菌病的釀酒葡萄‘貴人香’,用無菌挑針選取葡萄表皮感染貴腐菌的病健交接組織,大小約為3 mm×3 mm,用75%的酒精消毒30 s,再用無菌水沖洗3次,用無菌鑷子將挑取的組織置于PDA培養(yǎng)基上,鋪平,27 ℃下培養(yǎng)3~5 d。從分離的菌落中挑選具有典型性狀的無雜菌菌落重新接種到PDA平板上。相同溫度條件下,繼續(xù)培養(yǎng)3~5 d。如此反復(fù),直至菌落形態(tài)一致時(shí)保留分離出的菌株,并將其保存在PDA培養(yǎng)基中。

1.2.2 貴腐菌的鑒定

菌落形態(tài)學(xué)觀察:將純化好的菌種選取3株,取單菌落接種至改良PDA[14]培養(yǎng)基上,于27 ℃下培養(yǎng)3 d,觀察單菌落、菌絲形態(tài)、生長(zhǎng)速度、顏色等特征變化,使用十字交叉法測(cè)定并記錄菌落直徑大小。

菌絲及孢子形態(tài)學(xué)觀察:在400倍顯微鏡下觀察菌株分生孢子形態(tài)。

貴腐菌的分子生物學(xué)鑒定[15]:使用真菌DNA小量提取試劑盒D3390提取DNA,用引物ITS1:5'-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3';ITS4:5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3'進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物使用普通瓊脂糖凝膠DNA試劑盒回收。產(chǎn)物委托青島派森諾基因科技有限公司進(jìn)行測(cè)序,將得到的ITS rDNA序列用NCBI Blast程序與NCBI ribosomal RNA sequence數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì),利用MEGA 4.0軟件繪制系統(tǒng)發(fā)育樹[16]。

1.2.3 貴腐菌培養(yǎng)基的選擇

培養(yǎng)基的選擇:選用PDA培養(yǎng)基、PSA培養(yǎng)基、葡萄汁瓊脂培養(yǎng)基、葡萄枝條瓊脂培養(yǎng)基、MEA麥芽汁瓊脂培養(yǎng)基、PDA改良培養(yǎng)基(1/2PDA+1/2MEA)進(jìn)行對(duì)比試驗(yàn)。使用打孔器在供試菌落邊緣打取菌餅[17],然后將菌餅用挑針轉(zhuǎn)接到6種不同的培養(yǎng)基上,在27 ℃條件下培養(yǎng)3 d,使用十字交叉法測(cè)定并記錄菌落大小,3次重復(fù)。

碳源的選擇:以改良的PDA為基礎(chǔ)培養(yǎng)基,分別選用1%的葡萄糖、蔗糖、淀粉、甘露醇、麥芽糖、果糖代替PDA培養(yǎng)基中的碳源,其他操作同培養(yǎng)基篩選,3次重復(fù)。

氮源的選擇:以改良的PDA為基礎(chǔ)培養(yǎng)基,分別選用1%的牛肉膏、酵母粉、酵母膏、麥芽浸膏、尿素、胰蛋白胨、硫酸銨、硝酸鉀、蛋白胨、硝酸鈉代替PDA培養(yǎng)基中的氮源,其他操作同培養(yǎng)基篩選,3次重復(fù)。

pH選擇:以改良PDA為基礎(chǔ)培養(yǎng)基,用0.1 mol/L的HCl和0.1 mol/L的NaOH調(diào)整pH,梯度分別為3、4、5、6、7、8、9、10、11。制成不同的pH梯度的平板分別接菌,其他操作同培養(yǎng)基篩選,3次重復(fù)。

溫度的選擇:以改良PDA為基礎(chǔ)培養(yǎng)基,分別在4、10、15、20、25、30、35 ℃下進(jìn)行培養(yǎng),其他操作同培養(yǎng)基,3次重復(fù)。

光照的選擇:在25 ℃條件,改良的PDA為基礎(chǔ)培養(yǎng)基,3個(gè)菌株在無光照、光照、光照及無光照時(shí)間各半的情況下培養(yǎng),其他操作同培養(yǎng)基篩選,3次重復(fù)。

2 結(jié)果與分析

2.1 菌種的形態(tài)分析

2.1.1 灰葡萄孢的形態(tài)學(xué)鑒定

試驗(yàn)共分離到68株菌,選取3株疑似貴腐菌株的菌落進(jìn)行培養(yǎng)。初期菌落灰白色,周圍光滑、規(guī)則,后期菌絲變成鼠灰色,第7天孢子開始發(fā)芽,菌絲密集,氣生菌絲發(fā)達(dá),基內(nèi)菌絲結(jié)成團(tuán),3~4 d后開始產(chǎn)生孢子。孢子頭密布,邊緣處密度較大,培養(yǎng)10 d開始形成菌核。菌核緊密貼生在培養(yǎng)基表面,圓盤形,灰黑色,大小為7 mm。在光學(xué)顯微鏡下觀察到的菌株孢子形態(tài)如圖1、圖2、圖3,孢子梗叢生,有隔膜,孢子呈球形或者橢圓形,單胞,通過對(duì)比《真菌鑒定手冊(cè)》[18],初步鑒定為灰葡萄孢。

圖1 菌株1菌落及孢子形態(tài)Figure 1 Colony and spore morphology of strain 1

圖2 菌株2菌落及孢子形態(tài)Figure 2 Colony and spore morphology of strain 2

圖3 菌株3菌落及孢子形態(tài)Figure 3 Colony and spore morphology of strain 3

2.2 貴腐菌的分子生物學(xué)鑒定

利用通用引物ITS1/ITS4對(duì)菌株1、菌株2、菌株3的ITS rDNA片段進(jìn)行擴(kuò)增,經(jīng)測(cè)序獲得目的基因片段分別為526 bp、503 bp、510 bp,經(jīng)Blast搜索并與GenBank數(shù)據(jù)庫中的核酸序列進(jìn)行同源性比較,建立系統(tǒng)發(fā)育樹。發(fā)現(xiàn)3株菌株均與灰葡萄孢的基因序列同源性相近,同源率在99.23%以上。挑選親緣性較高的同屬不同種的菌株作為參比菌株,并采用最大似然法(maximum likelihood analysis)用MEGA 4.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明,菌株1、菌株2、菌株3分別與參比菌株B.cinereaZ17 KC172064.1、B.cinereaLW6 MN077161.1、B.cinereaQ1 MT704983.1同源性相近。結(jié)合形態(tài)特征鑒定結(jié)果,可將3株菌鑒定為B.cinerea,分別命名為GRX06、GRX08、GRX62(圖4)。

圖4 基于ITS rDNA序列構(gòu)建的貴腐菌和相關(guān)真菌的系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 4 Phylogenetic tree of B.cinerea and related fungi based on ITS rDNA sequence

2.3 菌種培養(yǎng)基的選擇及培養(yǎng)條件的優(yōu)化

2.3.1 培養(yǎng)基及其成分的選擇

(1)基本培養(yǎng)基的選擇。通過對(duì)3個(gè)菌株在6種不同培養(yǎng)基上的生長(zhǎng)表現(xiàn),根據(jù)3 d后菌落直徑測(cè)量結(jié)果及柱狀圖(圖5)可以發(fā)現(xiàn),3株菌株在所選培養(yǎng)基上均可生長(zhǎng),但在PDA改良培養(yǎng)基上的生長(zhǎng)情況最佳,菌落直徑分別為6.78 cm、6.95 cm、7.06 cm。

圖5 不同培養(yǎng)基對(duì)3株菌株生長(zhǎng)情況的影響Figure 5 Effect of different culture media on three strains growth

(2)碳源的選擇。通過對(duì)3株菌株在6種不同碳源的改良PDA培養(yǎng)基上進(jìn)行培養(yǎng),根據(jù)菌落直徑的測(cè)量可以發(fā)現(xiàn),3株菌株均能很好的利用這6種碳源,但對(duì)碳源優(yōu)劣次序不同。GRX62的最佳碳源為甘露醇,菌落直徑5.13 cm;GRX06的最佳碳源為葡萄糖,菌落直徑4.47 cm;GRX08的最佳碳源為甘露醇,菌落直徑4.22 cm(圖6)。

圖6 碳源對(duì)3株菌株生長(zhǎng)情況的影響Figure 6 Effect of carbon sources on strains growth

(3)氮源的選擇。通過對(duì)3個(gè)菌株在9種不同氮源的PDA改良培養(yǎng)基上進(jìn)行培養(yǎng),根據(jù)菌落直徑可以發(fā)現(xiàn),3株菌株在以尿素為氮源的培養(yǎng)基上幾乎不生長(zhǎng),在其他氮源培養(yǎng)基上菌體生長(zhǎng)正常,而且3株菌株的氮源優(yōu)劣次序不同。GRX62最佳氮源為酵母粉,菌落直徑為6.48 cm;GRX06的最佳氮源為牛肉膏,菌落直徑為6.47 cm;GRX08的最佳氮源為硝酸鉀,菌落直徑6.35 cm(圖7)。

圖7 不同氮源對(duì)3株菌株生長(zhǎng)情況的影響Figure 7 Effect of nitrogen sources on growth of three strains

(4)pH值優(yōu)化。通過對(duì)3個(gè)菌株在9種不同pH培養(yǎng)基的培養(yǎng),根據(jù)菌落直徑的測(cè)量數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)(圖8),3株菌株在偏中性的培養(yǎng)基上均生長(zhǎng)良好。GRX62和GRX08在不同的pH下均能生長(zhǎng),GRX06在pH為3、4的情況下基本不生長(zhǎng)。GRX62的最佳pH為8,菌落直徑為6.70 cm;GRX06的最佳pH為6,菌落直徑為7.15 cm;GRX08的最佳pH為6,菌落直徑為6.55 cm。

圖8 不同pH對(duì)3株菌株生長(zhǎng)情況的影響Figure 8 Effect of different pH on growth of three strains

2.3.2 培養(yǎng)條件的選擇

(1)溫度條件優(yōu)化。對(duì)3菌株在7個(gè)溫度處理下進(jìn)行培養(yǎng),根據(jù)培養(yǎng)基菌落直徑的測(cè)量數(shù)據(jù)可以發(fā)現(xiàn),溫度低于4 ℃及高于35 ℃時(shí),菌落幾乎不生長(zhǎng)。GRX62在溫度為20 ℃時(shí),菌落直徑最大為6.47 cm;GRX62在25 ℃時(shí),菌落直徑最大為7.15 cm;GRX08在溫度為25 ℃時(shí),菌落直徑最大為6.55 cm(圖9)。

圖9 不同溫度對(duì)3株菌株生長(zhǎng)情況的影響Figure 9 Effect of temperatures on growth of three strains

(2)光照條件優(yōu)化。對(duì)3菌株在3種不同光照條件下進(jìn)行培養(yǎng),根據(jù)培養(yǎng)基菌落直徑的測(cè)量數(shù)據(jù)可以發(fā)現(xiàn),菌落大小變化不大,GRX62和GRX06的最佳光照時(shí)間均為全光照,菌落直徑分別為6.47、6.15 cm;GRX08菌株在黑暗的條件下長(zhǎng)得最好,菌落直徑是5.91 cm(圖10)。

圖10 不同光照處理對(duì)3株菌株生長(zhǎng)情況的影響Figure 10 Effect of illumination treatment on growth of three strains

3 討論與結(jié)論

從乳山臺(tái)依湖酒莊的疑似發(fā)生貴腐作用的晚收釀酒葡萄‘貴人香’上分離篩選出3株貴腐菌GRX62、GRX06、GRX08。通過形態(tài)學(xué)、生理生化及ITS rDNA鑒定,確定3株菌株均為貴腐菌(Botrytis cinerea)。試驗(yàn)結(jié)果表明,GRX62的最佳培養(yǎng)條件為:改良PDA培養(yǎng)基、碳源為甘露醇、氮源為酵母粉、pH為8、溫度為20 ℃,光照時(shí)間72 h;GRX06的最佳培養(yǎng)條件為:改良PDA培養(yǎng)基、碳源為葡萄糖、氮源為牛肉膏、pH為6、溫度為25 ℃,全光照;GRX08的最佳培養(yǎng)條件為:改良PDA培養(yǎng)基、碳源為甘露醇、氮源為硝酸鉀、pH為6、溫度為25 ℃,暗培養(yǎng)。試驗(yàn)中選出的培養(yǎng)基基本與金其榮[19]等研究得出的結(jié)論一樣,均為改良PDA培養(yǎng)基。

試驗(yàn)中貴腐菌的生長(zhǎng)溫度及光照條件,與雷百戰(zhàn)、張鵬等[20-21]的研究結(jié)果一致;最適pH值也與李廷剛等[22]的結(jié)果相同。對(duì)貴腐菌的生長(zhǎng)條件進(jìn)行探索,不僅有利于認(rèn)識(shí)貴腐菌的生物學(xué)特性和發(fā)生特點(diǎn),在與土壤碳、氮等利用關(guān)系方面也有重要意義[23]。

山東是中國葡萄酒產(chǎn)業(yè)基礎(chǔ)最好的地區(qū),擁有張?jiān)?、威龍、煙臺(tái)長(zhǎng)城等一線品牌和蓬萊、乳山酒莊集群等,也是中國葡萄酒產(chǎn)業(yè)發(fā)展的風(fēng)向標(biāo)。試驗(yàn)首次從臺(tái)依湖酒莊的晚收‘貴人香’葡萄中篩選出可以釀造貴腐酒的菌種,將為葡萄貴腐菌的分子生物學(xué)研究提供基礎(chǔ)材料,為推動(dòng)膠東地區(qū)葡萄酒產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展,豐富葡萄酒產(chǎn)品類型有重要意義。

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