巫婷玉,徐芳玲 ,葉蔚歆,虞春華,馬 嫚,陳 曄
(1.江西醫(yī)學(xué)高等??茖W(xué)校基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部,江西上饒 334000;2.九江學(xué)院藥學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院,江西九江 332000;3.廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院,廣東廣州 510000)
豆腐乳是中國流傳數(shù)千年的漢族傳統(tǒng)民間美食,豆腐乳以它的口味鮮美、風(fēng)味獨特、質(zhì)地細(xì)膩、營養(yǎng)豐富而著稱,被稱之為“東方奶酪”,是我國著名的傳統(tǒng)發(fā)酵豆制調(diào)味品之一。發(fā)酵豆制品的整個生產(chǎn)過程被認(rèn)為是一個開放的、傳統(tǒng)的過程,整個發(fā)酵過程中有多種微生物共同參與,不同微生物所起的作用可能各不相同。
豆腐乳作為發(fā)酵食品,目前研究發(fā)現(xiàn)豆腐乳中真菌有毛霉屬(Mucor)[1?2]、曲霉屬(Aspergillus)、青霉屬(Penicillium)、根霉屬(Rhizopus)[3]、地霉屬(Geotrichum)、鐮刀孢屬(Fusarium)、毛孢子菌屬(Trichosporon)、畢赤酵母屬(Pichia)、假絲酵母屬(Candida)、酵母屬(Saccharomyces)、耶羅維亞酵母屬(Yarrowia)等微生物[4?6];微生物在豆腐乳的生產(chǎn)、揮發(fā)性風(fēng)味、品質(zhì)等方面具有影響,國內(nèi)外不同地方[7?9]以及不同風(fēng)味的豆腐乳中微生物多樣性研究[10?12]表明,豆腐乳中具有豐富的真菌資源,如低鹽[13?14]、紅豆腐乳[15]、傳統(tǒng)發(fā)酵的豆腐乳[16?17]中的真菌資源均很豐富。
上饒位于江西省東北部,氣候溫濕,適合真菌的生存。由于當(dāng)?shù)氐娘L(fēng)俗習(xí)慣,每年春節(jié)將近家家戶戶都會制作豆腐乳。相對于工廠里具有嚴(yán)格的安全管理,家庭自制發(fā)酵豆腐乳具有更高的危害性,由于自制豆腐乳開放式的制作環(huán)境,豆腐乳中其它雜霉菌和細(xì)菌存在的幾率很高。這些霉菌的存在對于豆腐乳風(fēng)味的形成可能具有一定的有益作用,同時也可能是有害菌株,在發(fā)酵過程中產(chǎn)毒,造成多種微量毒素共存的現(xiàn)象[18?22]。因此,為了讓百姓了解自制發(fā)酵豆腐乳的危害性,更好地改善自制豆腐乳的品質(zhì),本文以自然發(fā)酵豆腐乳為材料,采用稀釋平板培養(yǎng)方法,結(jié)合形態(tài)特征和LSU序列測序進行菌株鑒定探究上饒不同地區(qū)豆腐乳真菌的多樣性。研究結(jié)果將有助于進一步了解家庭自制自然發(fā)酵豆腐乳真菌毒素的檢測,為家庭自制豆腐乳安全性提供科學(xué)的理論基礎(chǔ)。
自然發(fā)酵豆腐乳 來自江西上饒市的八個鄉(xiāng)村;分離培養(yǎng)基 虎紅培養(yǎng)基(蛋白胨5 g、葡萄糖10 g、磷酸二氫鉀1 g、硫酸鎂0.5 g、瓊脂19 g、孟加拉紅0.033 g、氯霉素0.1 g、蒸餾水1000 mL);純化、保種培養(yǎng)基 PDA培養(yǎng)基。
LT302電子天平、DYY-2C型電泳儀 北京市六一儀器廠;紫外分析儀、HH-4數(shù)顯恒溫水浴鍋、基因擴增儀 上海啟前電子科技有限公司。
1.2.1 材料采集和處理 于2018年4月分別在江西上饒市八個鄉(xiāng)村進行了自然發(fā)酵豆腐乳樣本采集(具體采樣地點為:A:婺源縣溪頭鄉(xiāng)呈川村;B:廣豐區(qū)洋口鎮(zhèn);C:鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村;D:玉山縣樟村鎮(zhèn);E:德興市紅山生活區(qū);F:上饒縣田墩鎮(zhèn);G鉛山縣石塘周邊;H:廣豐區(qū)小康城安利小區(qū)。在文中圖表用不同英文字母來表示不同采樣點)。在每個采樣點分別采集3家自然發(fā)酵豆腐乳放入無菌瓶中(每瓶150 g),并用無菌自封袋密封帶回實驗室于4 ℃保存,對樣品進行處理培養(yǎng)。
1.2.2 真菌分離純化 采用稀釋涂布平板法。樣品稀釋液的制備:準(zhǔn)確稱取待測樣品l0 g,放入研缽中,加入90 mL蒸餾水,進行研磨,使微生物細(xì)胞分散,再在虎紅培養(yǎng)基上進行涂布,將平板倒置,進行標(biāo)號,放入25 ℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)5~7 d,每天觀察。做三個平行實驗,每一個平行實驗中每個稀釋濃度涂布五個平板。
當(dāng)培養(yǎng)基上長出菌絲后,通過不同菌落的形態(tài)特征進行區(qū)分,用無菌接種針分別挑取不同菌落的菌絲接到PDA培養(yǎng)基上,繼續(xù)25 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3~5 d,進行純化培養(yǎng),直到獲得單一的菌種[23]。純化得到的菌株進行分離鑒定,并采用甘油管保藏法置于?20 ℃于保存。
1.2.3 真菌的鑒定
1.2.3.1 形態(tài)學(xué)鑒定 根據(jù)菌落的形態(tài)、顏色、菌絲和產(chǎn)孢器結(jié)構(gòu)的形態(tài)查閱《真菌鑒定手冊》[24]、Barnett & hunter(1998)和Seifert et al.(2011)的分類系統(tǒng)鑒定到屬。
1.2.3.2 分子生物學(xué)鑒定 根據(jù)菌落的培養(yǎng)特征及微觀特征進行形態(tài)型的劃分合并,通過選取具有代表性的形態(tài)型菌株,分別刮取在PDA上培養(yǎng)成熟的菌絲,利用氯化芐法提取DNA[25]。采用真菌引物L(fēng)R0R(5’-GTACCCGCTGAACTTAAGC-3’)和LR5(5’-TTAAAAAGCTCGTAGTTGAAC-3’)對菌株進行PCR擴增LSU片段[26],獲得的擴增產(chǎn)物送北京擎科生物科技有限公司進行序列測定。測得序列經(jīng)峰圖檢查并在NCBI中進行同源性比對[27]。確保序列準(zhǔn)確性后,將本研究獲得序列和從GenBank數(shù)據(jù)庫中下載的相關(guān)序列利用MEGA 10.1軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.2.4 實驗數(shù)據(jù)公式
1.2.4.1 菌落總數(shù)(colonies number)的計算
式中:C表示某一稀釋度下平板上生長的平均菌落數(shù);m表示涂布平板時所用豆腐乳的質(zhì)量,g;M表示稀釋倍數(shù)。
1.2.4.2 分離頻率(isolation frequency,IF)的計算
1.2.4.3 Shannon-Wiener指數(shù)(H)的計算
式中:pi表示為種i真菌菌株數(shù)目與全部真菌菌株數(shù)目的比值。
1.2.4.4 Jaccard相似性指數(shù)(Cj)的計算[28]
式中:a表示一個地區(qū)豆腐乳分離的真菌的屬數(shù);b表示另一個地區(qū)豆腐乳分離的真菌的屬數(shù);c表示兩個地區(qū)豆腐乳具有的相同真菌屬數(shù);Cj表示兩個地區(qū)豆腐乳之間真菌的屬組成的相似程度。
運用Origin75漢化版軟件進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析。
豆腐乳中每樣品中的菌落數(shù)(表1),豆腐乳中的真菌數(shù)量較多。在同一稀釋濃度下,不同的地區(qū)的豆腐乳中真菌數(shù)有較大的差異,在稀釋濃度為10?3時,鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村、廣豐區(qū)洋口鎮(zhèn)、婺源縣溪頭鄉(xiāng)呈川村每克樣品中的菌落數(shù)明顯高于其他五個地區(qū);在稀釋濃度為10?4時,鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村、上饒縣田墩鎮(zhèn)、廣豐區(qū)小康城安利小區(qū)、婺源縣溪頭鄉(xiāng)呈川村的每克樣品中的菌落數(shù)明顯高于其他四個地區(qū);在稀釋濃度為10?5時,鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村、廣豐區(qū)洋口鎮(zhèn)、鉛山縣石塘周邊的每克樣品中的菌落數(shù)明顯高于其他五個地區(qū);說明鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村、廣豐區(qū)洋口鎮(zhèn)、鉛山縣石塘周邊三個地區(qū)的菌株豐富度較高。
表 1 每克樣品中的菌落數(shù)Table 1 Number of colonies per gram of sample
從上饒市八個地區(qū)自制豆腐乳樣品中共分離227個菌株,根據(jù)形態(tài)特征,形態(tài)型菌株LSU序列的相似性比較和分子發(fā)育分析將227株菌株劃分Aspergillus、Penicillium、Talaromyces等26個分類單元(表2)。從屬級水平的分離頻率來看,以Penicillium(29.04%)、Aspergillus(24.65%)、Talaromyces(22.88%)、Fusarium(10.57%)為優(yōu)勢菌群;同時可知Penicillium為婺源縣溪頭鄉(xiāng)呈川村、鉛山縣石塘周邊、廣豐區(qū)洋口鎮(zhèn)的共同優(yōu)勢菌群,Talaromyces為廣豐區(qū)小康城安利小區(qū)和上饒縣田墩鎮(zhèn)的共同優(yōu)勢菌群,而德興市紅山生活區(qū)的優(yōu)勢菌群為Penicillium和Aspergillum,鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村的優(yōu)勢菌群為Aspergillus,玉山縣樟樹鎮(zhèn)的優(yōu)勢菌群為Fusarium。
表 2 上饒地區(qū)自制豆腐乳真菌菌群組成Table 2 Composition of fermented soybean curd fungus in Shangrao area
從種級水平的分離頻率來看:在八個地區(qū)中,以Aspergillus niger(12.77%)、Penicillium pulvillorum(11.00%)、Talaromyces albobiverticillius(10.12%)為優(yōu)勢菌群;在各個地區(qū)的優(yōu)勢類群也有一定的差異,在婺源縣溪頭鄉(xiāng)呈川村以Penicillium pulvillorum(3.08%)、Penicillium citrimum(2.64%)、Fusarium oxysporum(1.76%)為優(yōu)勢菌群,在廣豐區(qū)洋口鎮(zhèn)以Penicillium citrimum(3.96%)、Talaromyces albobiverticillius(2.20%)、Aspergillus niger(2.20%)為優(yōu)勢菌群,在鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村以Aspergillus niger(4.41%)、Penicillium pulvillorum(3.52%)、Talaromyces amestolkiae(2.20%)為優(yōu)勢菌群,在玉山縣樟村鎮(zhèn) 以Fusarium flocciferum(4.41%)、Aspergillus restrictus(2.64%)、Fusarium oxysporum(1.76%)、Bionectriasp.(1.76%)為優(yōu)勢菌群,在德興市紅山生活區(qū)以Penicillium brasilianum(1.32%)、Aspergillus flavus(0.88%)、Fusarium tricinctum(0.88%)優(yōu)勢菌群,在上饒縣田墩鎮(zhèn)以Penicillium brasilianum(2.64%)、Talaromyces verruculosus(2.64%)、Aspergillus restrictu(2.20%)為優(yōu)勢菌群,在鉛山縣石塘周邊以Aspergillus niger(2.20%)、Penicillium pulvillorum(2.20%)、Penicillium brasilianum(1.76%)、Fusarium flocciferum(1.76%)為優(yōu)勢菌群,在廣豐區(qū)小康城安利小區(qū)以Talaromyces albobiverticillius(2.20%)、Bionectriasp.(1.76%)、Talaromyces allahabadensis(1.32%)為優(yōu)勢菌群;其中Aspergillus novoparasiticus、Trematosphaeria biappendiculate為 婺 源縣溪頭鄉(xiāng)呈川村特有菌株,F(xiàn)ungalsp.為鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村特有菌株,Penicillium oxalicum、Penicillium mariae-crucis、Penicilliumsp.、Talaomyces aculeatus為玉山縣樟村鎮(zhèn)特有菌株,Aspergillus flavusvar、Fusarium tricinctum、Meyerozyma guilliermondii為德興市紅山生活區(qū)特有菌株,Talaromyces purpureogenus為上饒縣田墩鎮(zhèn)特有菌株,Penicil-lium simplicissimum、Penicillium mariae-crucis、Talaromyces allahabadensis為廣豐區(qū)小康城安利小區(qū)特有菌株,說明每個地區(qū)的環(huán)境不同導(dǎo)致了菌落的差異性。
從圖1中可以看出明顯分為三個進化分支,其自展值各為99%;其中菌株D011與Meyerozyma guilliermondiiKY108543單獨劃為一支,兩者的自展值為99%,具有較高的相似性。菌株D001、Y007、Y036聚集在一支歸屬于Fusarium,另外菌株Y042與Bionectriasp. DQ327624.1具有99%的自展值;Aspergillus、Penicillium、Talaromyces、Trematosphaeria劃為一支,均屬于散囊菌目的絲孢發(fā)菌科mitosporicTrichocomaceae;其中菌株R007、R001、Y009、Y019、1K004以及W009聚集為一支歸屬于Talaromyces,菌株1K004與Talaromyces albobiverticilliusMH869906具有99%的自展值,較高的相似性;菌株D004、Q026、D005、W041聚集為一支歸屬于Aspergillus,該四株菌種為Aspergillus的可信度較高,菌株G038與Aspergillus restrictusJF922028的自展值達到99%;菌株2Y019、K009、K006、Y014、T018等聚集為一支,歸屬于Penicillium,其中菌株G033與Penicillium citrinumMH665234的自展值為99%。
2.4.1 上饒地區(qū)豆腐乳中真菌菌群組成的多樣性從Shannon-Wiener指數(shù)(H)來看(圖2),鉛山縣石塘周邊(H=1.92)>廣豐區(qū)小康城安利小區(qū)(H=1.57)>婺源縣溪頭鄉(xiāng)呈川村(H=1.56)>玉山縣樟村鎮(zhèn)(H=1.50)>廣豐區(qū)洋口鎮(zhèn)(H=1.42)>鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村(H=1.28)>上饒縣田墩鎮(zhèn)(H=1.26)>德興市紅山生活區(qū)(H=0.74),可以看出鉛山縣石塘周邊的豆腐乳中的真菌多樣性較高,而德興市紅山生活區(qū)的豆腐乳中的真菌多樣性是八個地區(qū)中最低的,該地區(qū)的豆腐乳中的真菌種類相當(dāng)于其他七個地區(qū)更單調(diào)。
圖 1 基于LSU基因序列構(gòu)建的豆腐乳菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.1 Phylogenetic tree of soybean curd strain based on LSU gene sequence
圖 2 不同地區(qū)豆腐乳真菌的多樣性指數(shù)Fig.2 Diversity index of fermented soybean curd fungi in different regions
2.4.2 上饒地區(qū)豆腐乳中真菌菌群組成的相似性從相似性系數(shù)來看(表3),鉛山縣石塘周邊和廣豐區(qū)小康城安利小區(qū)豆腐乳的真菌的相似性系數(shù)(Cj)為1.00,而鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村和玉山縣樟村鎮(zhèn)中豆腐乳的真菌的相似性系數(shù)(Cj)為0.29,并且Fungal只出現(xiàn)在鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村、Trematosphaeria只出現(xiàn)在婺源縣溪頭鄉(xiāng)呈川村、Meyerozyma只出現(xiàn)在德興市紅山生活區(qū),說明鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村與玉山縣樟樹村鎮(zhèn)的豆腐乳中的真菌相似性不高,具有一定的差異性,鉛山縣石塘周邊和廣豐小康城安利小區(qū)的豆腐乳中的真菌的屬相似度很高,并且以上一些菌株只在個別地區(qū)存在,因此八個地區(qū)豆腐乳中的真菌類群存在一定的差異性和專一性。
本研究從上饒市中八個地區(qū)豆腐乳中共分離了227個菌株,鑒定出26個分類單元:Penicillium、Aspergillus、Talaromyces、Fusarium等9個 屬26種。研究發(fā)現(xiàn)不同地區(qū)豆腐乳中的真菌種群數(shù)量和群落結(jié)構(gòu)存在較大差異性與專一性,個別地區(qū)具有特殊的菌株,如婺源縣溪頭鄉(xiāng)呈川村豆腐乳中的真菌(Aspergillus novoparasiticus、Trematosphaeria biappendiculate)為該地區(qū)的特有菌株,F(xiàn)ungalsp.為鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村豆腐乳中的特有菌株,Penicillium oxalicum、Penicillium mariae-crucis、Penicilliumsp.、Talaromyces aculeatus為玉山縣樟村鎮(zhèn)豆腐乳中的特有菌株。八個地區(qū)豆腐乳中分離得到的菌株多樣性系數(shù)和相似性系數(shù)結(jié)果表明,鉛山縣石塘周邊的豆腐乳真菌多樣性系數(shù)(H=1.92)最高,該地環(huán)境中能侵入豆腐乳的真菌相當(dāng)于其他地區(qū)種類更多;而德興市紅山生活區(qū)的豆腐乳真菌為多樣性系數(shù)(H=0.74),是八個地區(qū)中最低,該地豆腐乳中的真菌比其他七個地區(qū)種類更少;由相似性系數(shù)分析可知,鉛山縣石塘周邊和廣豐區(qū)小康城安利小區(qū)豆腐乳的真菌的相似性系數(shù)(Cj)為1.00,而鉛山縣紫溪鄉(xiāng)文山村和玉山縣樟村鎮(zhèn)中豆腐乳的真菌的相似性系數(shù)(Cj)為0.29,不同兩個地區(qū)的菌株相似性系數(shù)不相同,說明不同地區(qū)自然發(fā)酵豆腐乳的真菌具有一定的差異性。影響八個地區(qū)豆腐乳中真菌多樣性的因素很多,如溫度、濕度、季節(jié)、覆蓋的稻草環(huán)境因素等[29?30],而有關(guān)影響豆腐乳中真菌多樣性的具體機制有待進一步探究。
表 3 不同地區(qū)豆腐乳真菌的相似性指數(shù)Table 3 Similarity index of soybean curd fungi in different regions