張文倩 華媛媛 范 靈 凌 麗 熊正愛(ài) 曾倩茹
(重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院婦產(chǎn)科 重慶 400010)
卵巢癌是死亡率最高的婦科惡性腫瘤[1],易復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移,由于卵巢位于盆腔深處,多數(shù)患者確診時(shí)已為晚期,5年生存率僅30-40%,患者預(yù)后差。結(jié)合靶向治療的綜合治療卵巢癌是目前研究熱點(diǎn)之一,血管生成在腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要作用及抗血管生成治療得到極大關(guān)注。卵巢腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)、轉(zhuǎn)移和復(fù)發(fā)都依賴于新生血管生成提供養(yǎng)料和氧氣。缺氧、血管損傷、促血管生成因子等多種因素誘發(fā)血管生成,其中缺氧是血管生成的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)力[2]。缺氧環(huán)境下缺氧誘導(dǎo)因子1-α(hypoxia inducible factor 1α, HIF-1α)轉(zhuǎn)錄活性增強(qiáng),誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞和腫瘤相關(guān)基質(zhì)細(xì)胞生成多種促血管生成因子,如血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(vascular endothelial growth factor, VEGF)家族尤其是VEGF-A、VEGFR2、血管生成素2(angiopoietin 2, ANGPT2)[2]等,VEGF-A除在腫瘤血管生成發(fā)揮關(guān)鍵作用[2]外,還促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增值[3]。
核因子90(nuclear factor 90,NF90,也稱為DRBP76和NFAR1)和NF110(也稱為IL3、NFAR2和TCP110)是白細(xì)胞介素增強(qiáng)結(jié)合因子3(interleukin enhancer binding factor 3,ILF3)差異性剪接生成的主要產(chǎn)物[4][5][6],分子量分別為90kDa和110kDa。NF90在肝細(xì)胞癌[7]、鼻咽癌[5]、宮頸癌[8]、卵巢癌[9]、胃癌[10]等惡性腫瘤中過(guò)表達(dá),其作用被廣泛研究,但與卵巢癌血管生成的關(guān)系少有報(bào)道。本研究探尋NF90在卵巢癌組織中的表達(dá)情況,體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證敲減NF90對(duì)卵巢癌細(xì)胞VEGF-A表達(dá)的影響,為后期深入研究提供實(shí)驗(yàn)思路。
Oncomine(www.oncomine.org)是目前世界上最大的癌基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù)和整合數(shù)據(jù)挖掘平臺(tái),擁有最全的癌癥突變譜、基因表達(dá)數(shù)據(jù)以及相關(guān)的臨床信息,可利于發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物或新的治療靶點(diǎn)。本研究通過(guò)檢索“ILF3”分析ILF3 mRNA在包含卵巢癌在內(nèi)的常見(jiàn)惡性腫瘤組織中的表達(dá)情況,從Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選基因,在本研究中設(shè)置檢索條件為:1.Gene: ILF3,2.Analysis Type: Ovarian Cancer vs. Normal Analysis,3.Data Type: mRNA, 4.Over-expression.
Human Protein Atlas(www.proteinatlas.org)是利用基于抗體的成像、基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)技術(shù)整合各種人類蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)庫(kù)。Human Protein Atlas包括組織圖譜、細(xì)胞圖集和病理學(xué)圖譜,其中,組織圖譜顯示蛋白質(zhì)跨越人體所有主要組織和器官的分布,細(xì)胞圖集顯示蛋白質(zhì)在單細(xì)胞中的亞細(xì)胞定位,病理學(xué)圖譜顯示蛋白質(zhì)水平對(duì)患者癌癥的患者存活的影響。本研究利用Human Protein Atlas中的組織圖譜檢索ILF3轉(zhuǎn)錄蛋白(NF90和NF110)在卵巢子宮內(nèi)膜樣腺癌、漿液性腺癌和正常卵巢組織中的表達(dá)情況。
攜帶NF90干擾序列基因的重組慢病毒購(gòu)于漢恒生物有限公司(上海,中國(guó))。其中陰性對(duì)照插入的片段scramble為一段亂序不針對(duì)任何人或鼠的shRNA,干擾載體為pHBLV-U6-ZsGreen-PGK-Puro。
人卵巢癌細(xì)胞系SKOV-3購(gòu)于中國(guó)科學(xué)院細(xì)胞庫(kù),細(xì)胞采用含10%胎牛血清(Ausbian,澳大利亞)的DMEM高糖培養(yǎng)基(Gibco,美國(guó))培養(yǎng),培養(yǎng)箱設(shè)定為5%CO2、37℃。
取對(duì)數(shù)期細(xì)胞,棄舊培養(yǎng)基,PBS洗滌后加入無(wú)血清培養(yǎng)基孵育過(guò)夜。次日,棄舊培養(yǎng)基,PBS洗滌后加入CoCl2工作液避光孵育構(gòu)建化學(xué)缺氧模型。
對(duì)數(shù)期SKOV-3經(jīng)細(xì)胞胰酶常規(guī)消化后按1×105個(gè)/孔接種于6孔板,常規(guī)孵育過(guò)夜。次日采用4小時(shí)小體積感染法進(jìn)行慢病毒轉(zhuǎn)染,即棄原培養(yǎng)基,加入1/2(即500μl)體積無(wú)血清培養(yǎng)基稀釋的慢病毒液,同時(shí)設(shè)立空白對(duì)照組,37℃孵育4h后補(bǔ)齊無(wú)血清培養(yǎng)基至正常體積(即1ml)。轉(zhuǎn)染24h后,棄病毒培養(yǎng)基,改為完全培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)。轉(zhuǎn)染72小時(shí)候,熒光顯微鏡觀察慢病毒轉(zhuǎn)染效率。用puromycin篩選穩(wěn)轉(zhuǎn)株,避光孵育,連續(xù)篩選2周后得到穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞株,更換為完全培養(yǎng)基繼續(xù)擴(kuò)大培養(yǎng)。同時(shí),收集細(xì)胞進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。
RIPA裂解液、PMSF和磷酸酶抑制劑按體積比100:1:1充分混勻后裂解細(xì)胞并提取細(xì)胞總蛋白。采用BCA法測(cè)定蛋白濃度。SDS-PAGE凝膠電泳后,采用濕轉(zhuǎn)法200V恒壓轉(zhuǎn)膜2小時(shí);將含5%脫脂奶粉的TBST封閉液中室溫封閉2小時(shí);用相應(yīng)的一抗4℃孵育過(guò)夜;TBST洗膜3次后二抗室溫孵育1小時(shí);再次用TBST洗膜3次后進(jìn)行ECL成像。使用Image lab軟件進(jìn)行各條帶灰度值的半定量分析,以β-tubulin為參照,計(jì)算目的蛋白相對(duì)表達(dá)量。
利用ELISA測(cè)定卵巢癌細(xì)胞上清液中VEGF-A的濃度。步驟為:1.經(jīng)NF90/shRNA-control(Control)或NF90-shRNA(shNF90)轉(zhuǎn)染后的SKOV-3細(xì)胞用CoCl2缺氧誘導(dǎo),收集細(xì)胞培養(yǎng)基后3000rpm離心20min后收集上清液。根據(jù)說(shuō)明書按上樣—孵育—洗板—加檢測(cè)抗體—洗板—加酶標(biāo)試劑—洗板—顯色—終止—測(cè)定OD值。根據(jù)OD值計(jì)算各組細(xì)胞上清液中VEGF-A的濃度,設(shè)置濃度調(diào)平基準(zhǔn)為pg/ml/2×106cell。
服從正態(tài)分布的連續(xù)性變量以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±standa rd)表示。兩組間均數(shù)比較行獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)(Unpaired Student’s t-tests),多組間均數(shù)行單因素方差分析(One-way ANOVA),以α=0.05為檢驗(yàn)水準(zhǔn),符合方差齊性檢驗(yàn)組,使用Bonferonni方法分析,不符合方差齊性檢驗(yàn)者,使用Dunnett’s T3分析,SNK法行事后兩兩比較。p<0.05為有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。采用SPSS 23.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,GraphPad Prism軟件作圖。
NF90在Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)中分析NF90在卵巢癌中的表達(dá)情況,共納入7個(gè)數(shù)據(jù)集,包含1043個(gè)臨床樣本,包括卵巢漿液性腺癌、卵巢透明細(xì)胞腺癌、卵巢子宮內(nèi)膜樣腺癌、卵巢粘液性腺癌和正常卵巢組織的比較。分析發(fā)現(xiàn),NF90在多種卵巢組織中高表達(dá)(median rank=2541, P=0.005),分析發(fā)現(xiàn)卵巢漿液性腺癌中NF90表達(dá)最高(圖1)。在TCGA數(shù)據(jù)中分析發(fā)現(xiàn)在卵巢漿液性現(xiàn)在中ILF3基因表達(dá)較正常卵巢組織顯著升高(P=4.39E-9,fold change=1.870,圖2A)?;诖?,進(jìn)一步檢索Human protein atlas(www.proteinatlas.org)數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)現(xiàn)ILF3蛋白在卵巢漿液性腺癌和內(nèi)膜樣腺癌中強(qiáng)陽(yáng)性表達(dá),在正常卵巢組織中陰性表達(dá)(圖2B),與Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)的分析結(jié)果一致。
圖1 Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)中NF90在卵巢癌組織中的表達(dá)的meta分析Fig.1 The meta-analysis of the expression of NF90 in ovarian cancer in the Oncomine database
圖2 NF90和NF110在卵巢癌組織中過(guò)表達(dá)Fig.2 NF90 and NF110 are upregulated in human ovarian cancer specimens
VEGF-A是血管生成的金標(biāo)準(zhǔn)之一,本研究采取VEGF-A蛋白表達(dá)作為血管生成的指標(biāo)。SKOV-3細(xì)胞經(jīng)饑餓處理后用CoCl2化學(xué)缺氧,發(fā)現(xiàn)SKOV-3細(xì)胞經(jīng)CoCl2處理后HIF-1α、VEGF-A和NF90表達(dá)均升高,而NF110無(wú)明顯變化(圖3)。
圖3 缺氧條件下NF90、HIF-1α和VEGF-A表達(dá)情況Fig.3 The protein expression of NF90, HIF-1α, and VEGF-A after cultured with CoCl2.
將SKOV-3細(xì)胞經(jīng)NF90/shRNA-control(Control)、NF90/shRNA(shNF90)轉(zhuǎn)染后,經(jīng)CoCl2缺氧刺激模擬細(xì)胞缺氧環(huán)境,提取蛋白,WB驗(yàn)證HIF-1α、VEGF-A、NF110、NF90蛋白表達(dá)情況,以β-tubulin蛋白作為內(nèi)參。
CoCl2刺激后,SKOV-3細(xì)胞中HIF-1α、VEGF-A和NF90蛋白表達(dá)升高;Control組中HIF-1α、VEGF-A和NF90蛋白與未轉(zhuǎn)染經(jīng)CoCl2刺激組無(wú)明顯差異;與Control組相比,shNF90組HIF-1α、VEGF-A和NF90蛋白表達(dá)明顯降低。各組中NF110蛋白表達(dá)無(wú)明顯變化(圖4)。
圖4 干擾/過(guò)表達(dá)NF90后HIF-1α和VEGF-A表達(dá)情況Fig.4 The protein expression of HIF-1α and VEGF-A after knockdown/overexpression of NF90.
VEGF-A為分泌性蛋白,收集慢病毒轉(zhuǎn)染、缺氧誘導(dǎo)下SKOV-3細(xì)胞的上清液,使用VEGF-A ELISA試劑盒測(cè)定各組上清液中VEGF-A的濃度,進(jìn)一步驗(yàn)證NF90與VEGF-A表達(dá)的相關(guān)性。
CoCl2誘導(dǎo)缺氧環(huán)境下,SKOV-3細(xì)胞上清液中VEGF-A濃度是無(wú)缺氧下SKOV-3細(xì)胞上清液的2.334倍(1104.193±18.537pg/ml vs 471.331±37.697pg/ml,p<0.05)。與Control組細(xì)胞上清液相比,shNF90組細(xì)胞上清液中VEGF-A濃度降低了約57.6%(510.978±25.191pg/ml vs 1204.095±89.267pg/ml,p<0.05)。
圖5 干擾NF90引起SKOV-3細(xì)胞上清液中VEGF-A濃度下降Fig.5 Knockdown of NF90 decreases of the secretion of VEGF-A in CoCl2, *p <0.05, compared with SKOV-3 without CoCl2, #p<0.05, compared with Control group.
NF90和NF110具有不同的C-端和細(xì)胞內(nèi)定位,NF110全部位于細(xì)胞核內(nèi),作用受到極大限制[11];而NF90一部分可與RNA相互作用定位于細(xì)胞核,另一部分通過(guò)與核糖核胞質(zhì)接觸位于細(xì)胞質(zhì),參與調(diào)控DNA代謝[12]、轉(zhuǎn)錄[13][14]、翻譯[15][16]、mRNA穩(wěn)定[7][17]以及多種病毒復(fù)制和基因表達(dá)[18][19][20]。NF90在多種惡性腫瘤的作用被廣泛研究:在宮頸癌中通過(guò)p53/p21信號(hào)通路抑制宮頸癌細(xì)胞凋亡,促進(jìn)腫瘤增殖[21],通過(guò)PI3K/Akt/HIF-1α/VEGF-A信號(hào)通路促進(jìn)血管生成[8];在肝細(xì)胞癌中通過(guò)與cyclin E1 mRNA結(jié)合加速細(xì)胞周期促進(jìn)細(xì)胞增殖[7];在乳腺癌中通過(guò)維持尿激酶型纖溶酶原激活劑(urokinase-type plasminogen activator,uPA)表達(dá)促進(jìn)侵襲和轉(zhuǎn)移[22],通過(guò)增強(qiáng)VEGF mRNA穩(wěn)定性,促進(jìn)血管生成[23]。然而,另有研究發(fā)現(xiàn)在NF90過(guò)表達(dá)抑制裸鼠卵巢癌模型細(xì)胞增殖,NF90/NF110通過(guò)控制嵌入在DICER前體mRNA中的miR-3173的加工促進(jìn)DICER表達(dá),而miR-3173的過(guò)表達(dá)以NF90和DICER依賴性方式顯著增加轉(zhuǎn)移,提出通過(guò)促進(jìn)DICER表達(dá),NF90可以作為卵巢癌的抑制因子[24]。
本研究應(yīng)用Oncomine和Human Protein Atlas數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)現(xiàn)NF90在卵巢癌,尤其是卵巢漿液性癌和內(nèi)膜樣腺癌中表達(dá)顯著升高。體檢實(shí)驗(yàn)構(gòu)建卵巢癌細(xì)胞SKOV-3缺氧模型,進(jìn)一步探討NF90對(duì)卵巢癌血管生成的影響,結(jié)果顯示,缺氧誘導(dǎo)NF90、HIF-1α和VEGF-A表達(dá)顯著升高;干擾NF90后,SKOV-3細(xì)胞HIF-1α和VEGF-A蛋白表達(dá)顯著降低,細(xì)胞上清液中VEGF-A濃度下降。
綜上,NF90在卵巢癌組織中高表達(dá),并通過(guò)誘導(dǎo)VEGF-A表達(dá)促進(jìn)卵巢癌血管生成,但其作用機(jī)制仍需進(jìn)一步研究,為以后多靶點(diǎn)抗血管生成治療卵巢癌提供實(shí)驗(yàn)思路。