潘 鋮, 鈕羽群, 夏露霞, 伍春芳, 景凱婷,程墻義, 王夢馨, 韓寶瑜,*
(1. 中國計量大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院, 浙江省生物計量及檢驗檢疫技術(shù)重點實驗室, 杭州 310018;2. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護學(xué)院, 合肥 230000)
在昆蟲進化的生命歷程中,其體內(nèi)的共生菌扮演著不可替代的作用,能幫助宿主昆蟲更好地進行營養(yǎng)攝取、生長發(fā)育、解毒、天敵防御和免疫應(yīng)答等生命活動(譚周進等, 2005; Engel and Moran, 2013)。刺吸式口器昆蟲,因僅能取食木質(zhì)部、韌皮部的汁液,極易造成取食營養(yǎng)結(jié)構(gòu)不平衡,其生命活動部分營養(yǎng)功能需依靠共生菌分泌纖維素等碳水化合物酶來維持(Anandetal., 2010; Xueetal., 2014; Douglas, 2015)。唾液作為昆蟲和植物之間互作的基礎(chǔ)性物質(zhì),在互作中起著復(fù)雜且重要的作用,有研究指出唾液中含有的共生菌來源于與口針相連的唾液管道(唾液腺)和食物管道(腸道)(殷海娣等, 2006; 王雪麗等, 2016; 尚哲明等, 2019; Xuetal., 2019)。煙粉虱Bemisiatabaci唾液腺中被發(fā)現(xiàn)存在共生細菌(立克次氏體Rickettsia)(Bruminetal., 2012);張瑛等(2015)以斑透翅蟬Hyalessamaculaticollis唾液腺為對象,利用16S rRNA序列分離鑒定了變形菌門(Proteobacteria)和厚壁菌門(Firmicutes)的7種細菌。直接以唾液為研究對象,唐明等(2014)分離鑒定發(fā)現(xiàn)褐飛虱Nilaparvatalugens唾液分泌物中存在4種γ變形菌綱和2種β變形菌綱細菌;苗雨桐等(2017)從褐飛虱成蟲水狀唾液鑒定出屬于變形菌門、放線菌門和厚壁菌門的22種細菌??梢娡僖褐写嬖诓糠掷ハx共生菌,并可能參與宿主昆蟲與植物的互作機制。
茶小綠葉蟬Empoascaflavescens是我國茶區(qū)嚴重發(fā)生的害蟲,該害蟲種群密度較大,繁殖能力強,極難防治;為害后茶樹嫩梢變紅、卷曲,嚴重影響名優(yōu)茶的色、香、味和形等品質(zhì)特征,制約茶葉的產(chǎn)量。幾十年以來依賴化學(xué)防治,已致使茶小綠葉蟬對啶蟲脒和聯(lián)苯菊酯的抗藥性達高抗水平,對吡蟲啉達中抗水平;同時業(yè)內(nèi)估計每年茶園中40%的施藥量被用于防治茶小綠葉蟬(莊家祥等, 2009)。隨著高通量測序技術(shù)、宏基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等技術(shù)的發(fā)展,借助新技術(shù)分析成為趨勢。劉小改等(2016)和王天召等(2019)分別利用高通量測序分析稻縱卷葉螟Cnaphalocrocismedinalis和褐飛虱腸道細菌,分別得到604和235個分類單元;毛迎新等(2018)利用高通量測序分析了5個地理種群的茶小綠葉蟬成蟲體內(nèi)共生細菌種類,共鑒定41門116綱105種細菌。目前還沒有葉蟬唾液細菌蛋白的研究報道。本研究以茶小綠葉蟬成蟲唾液的細菌蛋白為切入點,采用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(liquid chromatography-tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)蛋白分析法鑒定唾液中細菌蛋白,為葉蟬細菌蛋白研究和其在昆蟲取食、致害和解毒等生命過程的作用提供理論基礎(chǔ)。
實驗所用的茶小綠葉蟬來自浙江省湖州市安吉縣的露天茶園(安吉白茶品種),飼養(yǎng)于人工氣候室(溫度26±1℃,相對濕度65%±5%,光周期14L∶10D)內(nèi),仍用采集的安吉白茶茶枝飼養(yǎng)。
茶小綠葉蟬水狀唾液的收集方法使用的是Parafilm膜夾營養(yǎng)液法(圖1)。首先使用Parafilm膜在玻璃管(玻璃管兩頭開口,管口內(nèi)徑5.5 cm,高為10.0 cm,管壁均勻分布小孔用于透氣)的一端制作葉蟬取食裝置,將第1層Parafilm膜均勻拉開到適宜薄度覆蓋于玻璃管一端,使用移液槍吸取3 mL 5%無菌蔗糖溶液添加于膜中間,再將薄度一致的第2層膜覆蓋其上,排出氣泡將液體鎖定于兩膜之間,最后在最外部添加第3層相對較厚的保護膜。從玻璃管另一端將20頭經(jīng)過1 h饑餓處理的葉蟬成蟲放入,以濕潤的紗布封口。根據(jù)上述方法依次制作相同的唾液收集裝置,排列于透氣網(wǎng)盒中,確保取食裝置位于上端,略微傾斜,轉(zhuǎn)移至人工氣候室(溫度26±0.5℃,相對濕度65%±5%,光周期14L∶10D)內(nèi)。待葉蟬取食24 h后,使用無菌注射器穿刺收集被取食過的蔗糖溶液,儲存于-80℃的超低溫冰箱。共收集6 000頭葉蟬取食過的蔗糖溶液。
圖1 葉蟬唾液收集裝置示意圖Fig. 1 Schematic diagram of cicada saliva collection device
使用超濾方式進行濃縮。首先加入等體積SDS-Tris(2% SDS, 10 mmol/L Tris-HCl, pH 8.0)裂解液,混勻后沸水浴10 min;用3 kD的超濾離心管濃縮收集的樣品,濃縮至終體積200 μL;然后在濃縮樣品中加入適量SDT溶液(4% SDS, 100 nmol/L DTT, 150 mmol/L Tris-HCl, pH 8.0),沸水浴15 min后18 000 g室溫離心15 min,收集上清液;取20 μL樣品上樣,聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),染色;最后采用BCA法進行蛋白質(zhì)定量,分裝樣品,儲存于-80℃的超低溫冰箱。
使用膜輔助樣品制備技術(shù)法(filter-aided sample preparation, FASP)對蛋白進行酶解(Winiewskietal., 2009)。取100 μg蛋白質(zhì)溶液,加入二硫蘇糖醇(DTT)至終濃度為100 mmol/L。沸水浴5 min后冷卻至室溫。加入200 μL的UA Buffer(0.1 mol/L Tri-HCl含8 mol/L尿素, pH 8.5)混勻,轉(zhuǎn)移至超濾離心管中,14 000 g 離心15 min,棄廢液,重復(fù)一次。加入100 μL的IAA Buffer(100 mmol/L IAA溶解于UA Buffer),600 r/min振蕩1 min,室溫避光反應(yīng)30 min,14 000 g離心15 min。加入100 μL UA Buffer, 14 000 g離心15 min,重復(fù)2次。加入100 μL NH4HCO3(25 mmol/L)溶液,14 000 g離心15 min,重復(fù)兩次。加入40 μL Trypsin Buffer(2 μg Trypsin溶于40 μL 100 mmol/L NH4HCO3溶液中),600 r/min振蕩1 min,37℃放置16~18 h。換新收集管,14 000 g離心15 min;再加入40 μL NH4HCO3(25 mmol/L),14 000 g離心15 min,收集濾液。采用C18 Cartridge對肽段進行脫鹽,肽段凍干后加入40 μL濃度為0.1%甲酸溶液復(fù)溶,最后對肽段定量(測定OD280值)。
參照定量結(jié)果取適量酶解產(chǎn)物進行LC-MS/MS分析,蛋白檢測分析由上海中科新生命生物科技有限公司進行。
液相部分:采用納升級流速HPLC液相系統(tǒng)Easy nLC進行分離。分別配制0.1%甲酸水溶液和0.1%甲酸乙腈水溶液(乙腈為84%)作為緩沖液A液和B液。色譜柱平衡時使用95%的A液進行。C18上樣色譜柱規(guī)格:Thermo Scientific EASY Column(2 cm×100 μm, 5 μm C18)。C18分析柱規(guī)格:Thermo Scientific EASY Column(75 μm×100 mm, 3 μm C18)。樣品進上樣色譜柱后,再經(jīng)過分析柱,流速300 nL/min。洗脫程序見表1。
表1 120 min梯度洗脫程序Table 1 120 min gradient elution procedure
原始文件(raw file) 采用軟件Mascot 2.2(Matrix Science)進行查庫分析。質(zhì)譜鑒定結(jié)果比對UniProt的細菌蛋白數(shù)據(jù)庫,參數(shù)設(shè)置參考苗雨桐等(2017),母離子質(zhì)量差設(shè)置為20 mmu,碎片離子誤差為15 μg/g,半胱氨酸上的脲甲基修飾以及蛋氨酸上氧化修飾分別被選定為固定修飾和可變修飾。允許失誤的剪切位點為1。檢索結(jié)果以P<0.05為顯著。利用KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)數(shù)據(jù)庫的KEGG Pathway 數(shù)據(jù)庫進行信號通路注釋分析。
本研究對濃縮后的茶小綠葉蟬唾液細菌蛋白進行一維電泳(圖2),蛋白分子量大多數(shù)集中分布在35~110 kD之間。
表2 質(zhì)譜儀參數(shù)設(shè)置Table 2 Parameter setting of MS
圖2 茶小綠葉蟬成蟲唾液細菌蛋白的分離電泳Fig. 2 Electrophoresis of bacterial proteins in the salivaof Empoasca flavescens adultsMarker: 蛋白質(zhì)分子量標準Protein molecular weight marker; 1: 目的蛋白Target protein.
本次實驗利用LC-MS/MS蛋白分析法對葉蟬成蟲唾液中的細菌蛋白進行鑒定,利用UniProt公共數(shù)據(jù)庫進行比對,共鑒定142種細菌蛋白(表3)。分類結(jié)果顯示為27個目49種細菌的142種蛋白,隸屬于5個門和11個綱分類階元。以變形菌門(Proteobacteria)細菌蛋白為主,共107個蛋白,占總蛋白數(shù)的75%以上,其中又以α-變形菌綱(α-Proteobacteria)51個蛋白和γ-變形菌綱(γ-Proteobacteria)40個蛋白為占比最多的兩類。其次為厚壁菌門(Firmicutes)共28個蛋白,分別屬于桿菌綱(Bacilli)和梭菌綱(Clostrida)。蛋白種類大于10個的目,包括根瘤菌目(Rhizobiales)、鞘脂單包菌目(Sphingomonadales)、腸桿菌目(Enterobacteriales)、假單胞菌目(Pseudomonadale)、芽孢桿菌目(Bacillales)。
在鑒定的142種細菌蛋白中,發(fā)現(xiàn)新陳代謝(metabolism)和遺傳信息加工(genetic information processing)是數(shù)量最多的兩個類群(圖3)。在新陳代謝類別中,12個蛋白參與氨基酸代謝(amino acid metabolism)通路,涉及天冬氨酸、精氨酸、絲氨酸、賴氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、纈氨酸和亮氨酸等生物合成或代謝途徑;11個蛋白參與核苷酸代謝(nucleotide metabolism)通路,包括雙功能嘌呤生物合成蛋白、核苷二磷酸激酶、核苷酸轉(zhuǎn)移酶、核苷二磷酸激酶等參與嘌呤或嘧啶代謝的蛋白;10個蛋白參與能量代謝(energy metabolism)通路,包括ATP合酶、NADH醌氧化還原酶、甲基四氫甲烷蝶呤環(huán)水解酶、絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶。在遺傳信息加工中, 主要涉及翻譯(translation)通路, 主要以核糖體、氨基酰tRNA生物合成為主。另外,參與膜的形成和運輸、信號傳導(dǎo)(signal transduction)、細胞過程(cellular processes)、蛋白折疊等的蛋白也被鑒定發(fā)現(xiàn)。
圖3 茶小綠葉蟬成蟲唾液細菌蛋白的KEGG信號途徑分析Fig. 3 KEGG pathway classification of bacterial proteins in the saliva of Empoasca flavescens adults
昆蟲共生細菌多樣性分析最常用的鑒定方法有:體外培養(yǎng)鑒定和16S rRNA序列分子標記鑒定。但體外培養(yǎng)需要如特殊營養(yǎng)物質(zhì)、pH、氧化還原電位等復(fù)雜特殊的生存環(huán)境,使絕大多數(shù)共生菌難以人工培養(yǎng)(Engel and Moran, 2013; 梅承等, 2018),同時利用培養(yǎng)基分離的細菌分類單元相對偏少,效率較低;利用16S rRNA結(jié)合限制性片段長度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)等技術(shù)的分子標記,雖然使鑒定難度降低,鑒定的分類單元增加,但文庫構(gòu)建和電泳分析均費時費力(Anandetal., 2010; 李香香, 2011; 黃衛(wèi)強和張和平, 2014)。本研究為解析茶小綠葉蟬在取食過程中唾液內(nèi)含有的共生菌,首次利用LC-MS/MS法對水狀唾液中的細菌蛋白進行鑒定,并使用細菌UniProt蛋白數(shù)據(jù)庫進行比對注釋,共發(fā)現(xiàn)5門11綱27目49種細菌的142種蛋白。細菌單元分類數(shù)量小于利用高通量測序分析結(jié)果(毛迎新等, 2018),但結(jié)果與利用蛋白質(zhì)組技術(shù)鑒定褐飛虱成蟲唾液發(fā)現(xiàn)22種細菌的35種蛋白(苗雨桐等, 2017)類似,唾液細菌數(shù)量小于高通量測序分析褐飛虱腸道細菌的結(jié)果(王天召等, 2019)。
以韌皮部汁液為食的半翅目昆蟲均有共生微生物,共生菌可為宿主提供氨基酸、維生素和脂肪等必需物質(zhì)彌補其飲食結(jié)構(gòu)中營養(yǎng)不平衡的缺陷(Feldhaar and Gross, 2009; 李香香等, 2011; Douglas, 2015),同時還對免疫反應(yīng)、抗病性和抵御天敵等都存在作用(Scarboroughetal., 2005; Vorburger, 2014)。本次共鑒定到精氨琥珀酸裂解酶、精氨酸脫氨酶、天冬氨酸解氨酶、絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶、色氨酸合成酶、2,3,4,5-四氫吡啶-2,6-二羧酸N-琥珀酰轉(zhuǎn)移酶、烯醇丙酮酸莽草酸合酶、苯甲酸合成酶、過氧化物酶、吲哚-3-丙酮酸脫羧酶、酮酸還原異構(gòu)酶涉及8種以上氨基酸的生物合成或代謝途徑,可能為葉蟬的生長發(fā)育提供氨基酸(Douglas, 2015)。Wu等(2006)發(fā)現(xiàn)Baumanniacicadellinicola被發(fā)現(xiàn)可為琉璃葉蟬Homalodiscacoagulata提供維生素,本研究中注釋為參與輔助因子和維生素代謝的9個蛋白涉及根瘤菌目、海洋螺菌目、伯克霍爾德氏菌目、亞硝化單胞菌目、粘球菌目、芽孢桿菌目和硫發(fā)菌目等。參與能量代謝的鑒定到甲基四氫甲烷蝶呤環(huán)水解酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶、ATP合酶和NADH醌氧化還原酶等多種酶類,參與糖酵解、三羧酸循環(huán)和電子傳遞鏈等代謝過程可能為宿主提供合成原料和能量。
本次研究所鑒定蛋白均來源于49種細菌,其中假單胞菌目、海洋螺菌目、梭菌目、立克次氏體目、根瘤菌目、伯克霍爾德氏菌和腸桿菌目等均被多次報道在茶小綠葉蟬或頭喙亞目昆蟲體內(nèi)存在(苗雨桐等, 2017; 毛迎新等, 2018; 王天召等, 2019)。褐飛虱唾液分泌物的16S rDNA檢測發(fā)現(xiàn)存在不動桿菌Acinetobactersp.(唐明等, 2014);而唾液細菌蛋白的鑒定發(fā)現(xiàn)的22種細菌(苗雨桐等, 2017),其中有17種細菌均在本次的研究中被檢測到。本研究還檢測到頭喙亞目昆蟲的多種常見共生菌,例如:蚜蟲中報道較多的初級共生菌Buchneraaphidicola和次級共生菌Hamiltonelladefensasubsp.Acyrthosiphonpisum(Charles and Ishikawa, 1999; Moran, 2005);在采采蠅中報道的共生菌Sodalisglossinidius和Wigglesworthiaglossinidiabrevipalpis(Chenetal., 1999; Akman, 2001);當然,也包括蟬科昆蟲共生菌CandidatusSulcia muelleri(黃桿菌)、次生共生菌Rickettsia(Nodaetal., 2001; Bruminetal., 2012)。這些結(jié)果與毛迎新等(2018)報道的結(jié)果一致。有研究指出,H.defensa不但參與2種必需氨基酸和7種非必需氨基酸的合成,還參與大多數(shù)必需維生素的合成。也有研究指出,昆蟲體內(nèi)的初級共生菌會相互配合為寄主提供所需營養(yǎng)元素,葉蟬體內(nèi)的10種氨基酸,其中Sulcia負責8個氨基酸的合成,另一種共生菌合成其余2種,其中某一氨基酸還有由兩種共生菌共同參與的(McCutcheon and Moran, 2007, 2010; Bennett and Moran, 2013, 2015)。但是本次檢測未發(fā)現(xiàn)葉蟬中分布最多的次級共生菌沃爾巴克氏菌Wolbachia(杜慧民等, 2020),與毛迎新等(2018)基于16S rDNA在其所有地理種群均檢測到該菌且為優(yōu)勢種群的結(jié)果存在差異,猜測可能是由于沃爾巴克氏菌與生殖和發(fā)育相關(guān)且只能進行垂直傳播,在唾液中可能不分布該菌,與苗雨桐等(2017)在褐飛虱唾液中未發(fā)現(xiàn)內(nèi)共生菌Wolbachia和殺雄菌屬Arsenophonus的細菌蛋白的結(jié)果一致。本次檢測還發(fā)現(xiàn)許多次級共生菌的分布,但是不同種類的葉蟬其體內(nèi)的次級共生菌需進一步研究。
本研究首次獲得了茶小綠葉蟬唾液共生菌的詳細信息,鑒定多種已報道的葉蟬共生細菌及其他昆蟲的共生菌蛋白,這些蛋白雖然不一定均源于葉蟬唾液細菌群落或腸道細菌代謝,但在葉蟬的生活史中必然發(fā)揮著重要的作用,為進一步研究共生菌、茶小綠葉蟬和茶樹之間的關(guān)系提供基礎(chǔ)信息。