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基于表面等離子體共振技術(shù)篩選與轉(zhuǎn)錄因子AP-2γ具有高親和力的小分子化合物

2021-09-03 09:54:50賴丹寧張逸菲王培鑫林少玲胡嘉淼
食品與藥品 2021年4期
關(guān)鍵詞:樣點響應(yīng)值親和力

賴丹寧,張逸菲,王培鑫,林少玲,胡嘉淼*

(1. 閩臺特色海洋食品加工及營養(yǎng)健康教育部工程研究中心,福建 福州 350002;2. 福建農(nóng)林大學(xué) 食品科學(xué)學(xué)院,福建 福州 350002)

表面等離子體共振(surface plasmon resonance,SPR)是一種無標(biāo)記的生物分析技術(shù),常用于檢測金屬/介電界面上的生物分子相互作用[1-2]。它可用于鑒定并量化分子相互作用,如蛋白質(zhì)-核酸、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-小分子化合物等相互作用的結(jié)合親和力[3-6]。AP-2γ轉(zhuǎn)錄因子屬激活蛋白2轉(zhuǎn)錄因子家族。該家族由4個不同的成員組成,分別為AP-2α,AP-2β,AP-2γ及后來發(fā)現(xiàn)的AP-2δ[7]。目前研究表明,該家族所有成員都有一個獨特的介導(dǎo)蛋白質(zhì)二聚化的螺旋-環(huán)-螺旋(helix-span-helix)結(jié)構(gòu);而N端富含脯氨酸和谷氨酰胺的區(qū)域介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄激活[8]。許多研究表明,惡性腫瘤與AP-2γ蛋白的過量表達及活性異常有關(guān)[9-12]。因此,尋找可有效抑制AP-2γ活性的小分子化合物被認(rèn)為是潛在的腫瘤藥物開發(fā)策略。

本文采用SPR技術(shù)篩選美國食品藥品監(jiān)督管理局(Food and Drug Administration,F(xiàn)DA)批準(zhǔn)的藥物分子庫中,同AP-2γ蛋白存在高親和力的小分子化合物,并測定樣品間相互作用的動力學(xué)常數(shù),以期為新型抗腫瘤藥物的開發(fā)提供依據(jù)。

1 儀器與材料

1.1 儀器

PlexArray?HT生物分子相互作用分析儀(美國Plexera公司)。

1.2 材料

AP-2γ蛋白(DetaiBio公司,純度>90 %);DA1018藥物芯片(美國Plexera公司),芯片上打印有FDA批準(zhǔn)的1018種小分子化合物及陰性對照二甲亞砜(DMSO)、陽性對照雷帕霉素(rapamycin);DMSO(北京索萊寶);丙三醇(國藥集團);甘氨酸(北京索萊寶);1×PBS(pH 7.4,北京索萊寶)。

2 方法

2.1 流通相及固定相的制備

選擇FDA 分子庫的 1018 種小分子作為固定相,由廠家預(yù)先通過3D光交聯(lián)方式打印于SPR芯片表面;流通相選擇AP-2γ蛋白溶液,使用前將AP-2γ蛋白原液用1×PBS(pH 7.4)及10 %丙三醇緩沖液稀釋成3 個濃度梯度(5 0 0,2 5 0,1 2 5 nmol/L)。

2.2 SPR實時動力學(xué)分析

用生物分子相互作用分析儀加載打印有目標(biāo)分子的芯片,隨后加載不同濃度梯度(500,250,125 nmol/L)的AP-2γ蛋白樣品各 650 μl,流速為2 μl/s,結(jié)合時間為300 s,解離時間為300 s。用鹽酸甘氨酸(pH 2.0)溶液作為重生液。所得的3次數(shù)據(jù)通過Plexera SPRi 系統(tǒng)計算并獲得平均值。

3 結(jié)果

3.1 系統(tǒng)基線建立及芯片質(zhì)量驗證

首先以100 nmol/L 的FK506結(jié)合蛋白12(FK506-binding protein of 12 kD)作為流通相檢驗芯片質(zhì)量,結(jié)果見圖1。由圖1可知,F(xiàn)K506結(jié)合蛋白12與陰性對照DMSO基本無相互作用,信號基本同系統(tǒng)背景的基線信號相仿;而FK506結(jié)合蛋白12與已知的配體雷帕霉素(陽性對照)迅速結(jié)合產(chǎn)生信號,響應(yīng)值迅速升高,并在約300 s后達到飽和,響應(yīng)值趨于穩(wěn)定。提示該芯片質(zhì)量檢測合格、SPR系統(tǒng)工作正常。

圖1 陰陽性樣點信號對照

3.2 FDA批準(zhǔn)的1018種藥物與AP-2γ蛋白的相互作用

通過高通量SPR技術(shù)成功地從FDA批準(zhǔn)的1018種藥物中篩選出了80種能與目標(biāo)AP-2γ蛋白特異性結(jié)合的藥物分子(見表2)。流通相AP-2γ蛋白溶液流過芯片過程中,與芯片上80個結(jié)合樣點發(fā)生結(jié)合所生成的響應(yīng)值見圖2。

根據(jù)圖2,截取600~700 s時間段內(nèi)的響應(yīng)值,分別求平均值,可得AP-2γ蛋白(500 nmol/L)與芯片上結(jié)合樣點的解離穩(wěn)定階段的最大響應(yīng)值(RUmax)。如圖3所示,AP-2γ蛋白與S4190(辛可芬,cinchophen)相互作用的解離穩(wěn)定階段的RUmax最大,其次是S3105(那氟沙星,nadifloxacin)、S1761(舒洛芬,suprofen)和S4166 (氯磺丙脲,chlorpropamide)。

圖2 500 nmol/L AP-2γ與芯片上結(jié)合樣點的結(jié)合情況

圖3 AP-2γ 蛋白(500 nmol/L)與芯片上的結(jié)合樣點的平均最大信號

3.3 樣品與AP-2γ蛋白結(jié)合情況的驗證

將不同濃度的AP-2γ蛋白(500,250,125 nmol/L)流過芯片,分別測定其響應(yīng)值變化曲線,見圖4。由圖4可見,相互作用所呈現(xiàn)的響應(yīng)值曲線均符合結(jié)合-解離循環(huán)的特征,即SPR測定結(jié)果表明測定信號響應(yīng)值均呈穩(wěn)定、上升、穩(wěn)定、小幅下降、穩(wěn)定趨勢。這是由于前100 s時,儀器管道中只有緩沖液,故信號保持穩(wěn)定、平坦;100 s后儀器開始進樣蛋白流通相,溶液中蛋白濃度突然上升,樣點上開始逐漸結(jié)合蛋白,此時實時檢測信號開始上升;流通相流通一定時間后,AP-2γ蛋白與芯片上結(jié)合樣點結(jié)合至飽和狀態(tài),故實時檢測信號到達峰值,曲線大致維持平穩(wěn);約300 s開始,緩沖液流通進芯片,將未結(jié)合的蛋白洗脫下來,實時檢測信號變?nèi)酰瑱z測信號開始不斷下降,此為解離階段;解離完成后,信號曲線趨于平穩(wěn)[13]。此外,隨著流通相濃度的增加,特異性結(jié)合信號逐漸增強。

圖4 AP-2γ與樣品S4190(a),S3105(b), S1761(c)和S4166(d)的濃度梯度結(jié)合曲線

3.4 動力學(xué)數(shù)據(jù)分析

FDA批準(zhǔn)的藥物分子庫中,能與AP-2γ蛋白特異性結(jié)合的小分子共有80種。通過對這80種小分子與AP-2γ蛋白的親和力常數(shù)(KD)進行計算,可發(fā)現(xiàn)KD集中在10-9~10-7mol/L左右,證實測得特異性結(jié)合能力強,見表1。

表1 目標(biāo)藥物與AP-2γ蛋白結(jié)合的動力學(xué)、親和力

表1(續(xù))

進一步以10為底,對FDA批準(zhǔn)的藥物分子庫樣品與AP-2γ蛋白的結(jié)合常數(shù)平均結(jié)合速率常數(shù)(Avg Kon),平均解離速率常數(shù)(Avg Koff)取對數(shù)進行分析,可得結(jié)合能力動力學(xué)分布圖(見圖5),可見這80種小分子與AP-2γ蛋白的特異性結(jié)合絕大部分都在類型一、三區(qū)域內(nèi),結(jié)合都是穩(wěn)定的。

圖5 80種小分子化合物與AP-2γ蛋白的結(jié)合能力動力學(xué)分布圖

4 討論

SPR技術(shù)靈敏度高,特異性強,能實現(xiàn)高通量檢測,并可實時監(jiān)測化學(xué)生物反應(yīng)過程,為抗腫瘤藥物開發(fā)提供了有力的研究工具。本研究中,我們采用了SPR技術(shù)對抗腫瘤的潛在藥物進行篩選。在FDA批準(zhǔn)的1018種藥物中,我們確定了80種與AP-2γ蛋白具有較高的親和力、有可能應(yīng)用于腫瘤治療的潛在藥物。其中,氯磺丙脲(chlorpropamide)對AP-2γ蛋白的親和力最強,其次是甲溴辛托品(anisotropine methylbromide)、維生素D3 (Vitamin D3)、扎托布洛芬(zaltoprofen)、羥萘酸芐酚寧(bephenium hydroxynaphthoate)、吡硫翁鋅(pyrithione zinc,PYZ)、阿西美辛(acemetacin、雷米普利(ramipril)、阿昔洛韋(acyclovir)、那氟沙星(nadifloxacin)等。

其中值得關(guān)注的如維生素D3在癌癥的發(fā)病機制和過程中的重要性已通過體外研究、動物研究及流行病學(xué)研究得到證實。Amir等[14]報道乳腺癌骨轉(zhuǎn)移患者每天服用10 000 IU維生素D3和1000 mg鈣補劑能顯著減少疼痛部位的數(shù)量。Fife等[15]發(fā)現(xiàn)維生素D3能顯著抑制雌激素受體陰性、孕激素受體陰性的人乳腺癌細(xì)胞系MDA-MB-435、人前列腺癌細(xì)胞系LNCaP和人骨肉瘤細(xì)胞系U2OS的體外增殖。Swami等[16]研究發(fā)現(xiàn),與對照組(飼料含1000 IU/kg維生素D3)相比,在4周維生素D3補充飲食(飼料含5000 IU/kg維生素D3)后,攜帶MCF-7乳腺癌異種移植瘤的免疫功能受損小鼠的腫瘤顯著縮?。?50 %)。Marshall等[17]研究發(fā)現(xiàn)每天補充4000 IU維生素D3可降低低風(fēng)險前列腺癌患者重復(fù)活檢陽性率。此外,在一些研究中,維生素D代謝物(25-羥基維生素D)水平較低被證實與乳腺癌預(yù)后不良有關(guān)[14]。

吡硫翁鋅(pyrithione zinc,PYZ)是一種鋅的配位復(fù)合物,被FDA批準(zhǔn)為非處方局部抗菌藥物,用于治療銀屑病和B波段紫外線(ultraviolet radiation B,UVB)誘導(dǎo)的表皮增生[18]。近年多項研究表明,PYZ在癌癥干預(yù)方面具有應(yīng)用潛力。Srivastava等[18]研究發(fā)現(xiàn)PYZ可有效降低口腔鱗狀細(xì)胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)細(xì)胞的集落形成、遷移和侵襲的能力;其機制主要涉及PYZ引起OSCC細(xì)胞中PI3K/AKT/mTOR和WNT/b-catenin等信號通路的改變,降低了14-3-3z、14-3-3s、cyclin D1、c-Myc、丙酮酸激酶M2(pyruvate kinase M2)等蛋白的表達。此外,PYZ治療還被證實可顯著減少免疫受損NOD/SCID/Crl小鼠的移植成瘤體積,而不會對正常組織造成明顯的毒性。項航[19]研究發(fā)現(xiàn)PYZ可在胃癌細(xì)胞中通過改變?nèi)苊阁w膜通透性抑制自我保護性自噬,還可抑制異種皮下移植瘤的生長。Tailler等[20]在FDA批準(zhǔn)的1040種藥物中發(fā)現(xiàn)PYZ和哇巴因(ouabain,OUA)是潛在的抗白血病藥物,PYZ和OUA均能有效誘導(dǎo)急性髓系白血?。╝cute myeloid leukemia,AML)細(xì)胞凋亡,誘導(dǎo)凋亡染色質(zhì)凝聚和抑制核因子-κB存活信號(nuclear factor-κB survival signaling),導(dǎo)致抗凋亡蛋白表達減少。

氯磺丙脲、甲溴辛托品、扎托布洛芬等藥物目前雖然還沒有應(yīng)用于癌癥治療的相關(guān)報導(dǎo),但相比其他藥物,它們具有與AP-2γ蛋白親和力高、結(jié)合穩(wěn)定等優(yōu)勢,仍具有很大的發(fā)展成為抗癌藥物的潛力。本文從現(xiàn)有的已被FDA批準(zhǔn)的1018種藥物中尋找能AP-2γ蛋白特異性結(jié)合,并具有較高親和力的藥物,可有效減少研究周期,便于藥物更快地服務(wù)于臨床。

5 結(jié)論

綜上,本文利用高通量SPR技術(shù),從FDA批準(zhǔn)的藥物庫篩選出能與AP-2γ蛋白產(chǎn)生特異性結(jié)合的80種小分子藥物,并得到了相應(yīng)的動力學(xué)常數(shù)。在后續(xù)的研究中,需對AP-2γ蛋白與目標(biāo)樣品的結(jié)合情況進行挑選驗證,可結(jié)合解離穩(wěn)定階段的平均最大信號值RUmax及各結(jié)合樣點的親和力來挑選結(jié)合信號強、親和力大的藥物進行相關(guān)驗證試驗。

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