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唾液細胞外囊泡miRNA輔助口腔鱗癌診斷與術(shù)后評估

2021-08-10 08:06葉偉龍趙鵬程馬國武
關(guān)鍵詞:唾液標(biāo)志物蛋白

葉偉龍 趙鵬程 馬國武 孫 波

口腔鱗狀細胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)是口腔頜面部最常見的惡性腫瘤[1],目前臨床上診斷OSCC時將組織病理作為金標(biāo)準(zhǔn),但是技術(shù)上存在滯后性、創(chuàng)傷性、靜態(tài)性、偏倚性等局限。本實驗對文獻中提到的幾種差異表達的miRNA,以實時定量聚合酶鏈反應(yīng)(RT-qPCR)檢測目標(biāo)miRNA在OSCC患者組和健康組之間,以及OSCC患者手術(shù)前后的表達差異,旨在探討miRNA作為OSCC患者術(shù)前的輔助診斷和術(shù)后療效評估的參考生物標(biāo)志物的應(yīng)用前景。

資料和方法

一、材料患者納入及主要試劑準(zhǔn)備

受試者:依照倫理委員會的標(biāo)準(zhǔn),從2017年5月到2018年11月,征得患方同意并收集共計17例口腔鱗癌患者術(shù)前的唾液,年齡分布為38~79歲,其中男性12例,女性5例。按發(fā)病部位分為5例舌部,4例唇部,4例口底,2例頰部,2例牙齦(表1)。所納入病例的TNM分類均為T2N0M0。作為對照組,收集11位40~80歲的健康志愿者的唾液。此外還提取了6例患者血液,以及7例患者術(shù)后1~3月的唾液,以檢測其細胞外囊泡miRNA表達變化。

表1 OSCC患者臨床特點

主要試劑:苯甲基磺酰氟、DNase/RNase-Free Water購自北京索萊寶公司。廣譜蛋白酶抑制劑購自瑞士Roche公司。RIPA裂解液、pH=6.8和pH=8.8的1mM Tris-HCL緩沖液、30%丙烯酰胺、SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液購自中國碧云天公司。SDS L5750、過硫酸銨7727-54-0、TEMED17-1312-01購自美國Sigma-Aldrich公司。Total Exosome Isolation Kit購自美國invitrogen公司。PrimeScriptTMRT Master Mix、SYBR? Premix Ex TaqTMII、RNAiso Plus9108購自Takara公司。miRNA檢測外參購自中國天根公司。Cel-miR-39-3p的引物購自廣州銳博公司。Hsa-miR-10b-5p、Hsa-miR-486-5p、Hsa-miR-512-3p、Hsa-miR-412-3p的引物購自上海吉瑪公司。

表2 蛋白免疫印跡使用抗體及濃度

提取唾液細胞外囊泡:每日上午,受試者空腹平靜狀態(tài)下,無菌管吸取口內(nèi)唾液1~2mL于離心管,冰上放置。按照試劑盒說明書,向離心管內(nèi)加入等體積PBS溶液,移液器吹打均勻分裝,4℃離心取上清液,以樣本體積:試劑體積=2∶1的比例加入提取試劑,4℃過夜后再4℃離心,棄上清液。加入PBS溶液溶解沉淀,-80℃儲存?zhèn)溆谩?/p>

透射電子顯微鏡(TEM):取適量收集的細胞外囊泡樣品置于封口膜上,夾取銅網(wǎng)置其上,樣品沉降15min后用濾紙從銅網(wǎng)側(cè)邊輕輕吸干液體。取一定量3%磷鎢酸于封口膜上,將吸干液體的銅網(wǎng)再置于其上負染5min,濾紙輕輕吸干染液,晾干后行透射電子顯微鏡檢測。

總蛋白濃度測定:按照BCA試劑盒說明配制50:1工作液,將標(biāo)準(zhǔn)蛋白用PBS溶液稀釋至0.5mg/ml。依次將0、1、2、4、8、12、16、20μL的梯度體積的標(biāo)準(zhǔn)蛋白分別加到96孔酶標(biāo)板中,統(tǒng)一用PBS溶液補足到20μL。另在一孔中加入5μL待測樣品與15μL PBS溶液。向每個酶標(biāo)孔中加入200μL BCA工作液,37℃孵化30min。冷卻后測量波長在563nm處的吸光度,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,算得總蛋白濃度。

蛋白質(zhì)免疫印跡(WB):用RIPA裂解細胞外囊泡,4℃離心取上清液,BCS法測得蛋白濃度,調(diào)整至2μg/μL,加入5倍的上樣緩沖液,100℃水浴10min。配制15%分離膠,5%濃縮膠,向每個梳孔中加2μL樣品或者彩虹Marker;設(shè)置電壓80V電泳至樣品到達濃縮膠與分離膠界限,調(diào)電壓至120V,電泳至溴酚藍遷移到達分離膠底部;設(shè)置電流250mA,時間1h,轉(zhuǎn)至PVDF膜。后將PVDF膜取出,用5%脫脂奶粉封閉1h;加入配制好的一抗,倒置孵育,4℃過夜;于搖床上TBST洗三次,每次10min;加入對應(yīng)二抗,室溫下倒置孵育1h;TBST,搖床洗三次,每次15min。A液與B液按1∶1配制發(fā)光液,避光孵育2min,凝膠成像儀成像。

實時定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-qPCR):取一定量細胞外囊泡,Trizol法提取總RNA,測得濃度。以100ng總RNA,10μL的反應(yīng)體系行逆轉(zhuǎn)錄。用SYBR作為熒光指示行熒光定量檢測,反應(yīng)體系為:SYBR PREMIX EX TAQⅡ10μL,上下游引物各8μL,cDNA 2μL,RNAase Free ddH2O 6.4μL。每個實驗樣品設(shè)置3個重復(fù)樣,每組實驗重復(fù)1次。PCR循環(huán)設(shè)置為:95℃30s循環(huán)1次;95℃5s,60℃30s循環(huán)40次;95℃15s,60℃30s,95℃15s循環(huán)1次。分析熔解曲線與CT值,以2-ΔΔCt法計算特定基因相對表達量。

數(shù)據(jù)分析:使用GraphPad.Prism.v5.0軟件制圖與統(tǒng)計分析數(shù)據(jù),非參數(shù)t檢驗比較差異,P<0.05視為具有統(tǒng)計學(xué)意義。

結(jié) 果

1.唾液細胞外囊泡的提取與鑒定:通過超高速離心和外泌體分離提取,得到OSCC患者組和健康志愿者組的唾液細胞外囊泡。TEM檢測結(jié)果示兩組均表現(xiàn)為典型的囊泡形態(tài),呈圓形,茶托樣,直徑大小在40~100nm(圖1A)。蛋白免疫印跡實驗顯示常見的細胞外囊泡標(biāo)志物CD63、CD81、CD9、Hsp 70在兩組中均正常表達(圖1B)。

圖1 唾液細胞外囊泡的提取和鑒定

對提取的細胞外囊泡,用BCA蛋白定量法計算得出總蛋白濃度,可見患者組的蛋白濃度顯著高于健康組(圖2A);而經(jīng)trizol法提取的總RNA濃度,患者組和健康組并無明顯差異(圖2B)。

圖2 唾液細胞外囊泡中總蛋白濃度和總RNA濃度

2.miRNA在唾液與血液源囊泡中的表達:從既往文獻中查找到,miR-21可作為OSCC診斷標(biāo)志物。本次實驗中選擇miR-21作為目標(biāo)序列,對6例患者術(shù)前的唾液和血液提取總RNA后行RT-qPCR,進而得到miR-21的相對表達量(圖3)。從柱狀圖中可見血液中miR-21的表達比唾液更高,而趨勢則基本一致。為了確定血液與唾液中表達的相關(guān)性,將miR-21的相對表達量繪制成散點圖,加入趨勢線后計算得R2=0.6951,相關(guān)系數(shù)ρ=0.886,P<0.05,趨向于正相關(guān)。

圖3 唾液與血液細胞外囊泡miR-21-5p的相關(guān)性

3.miRNA輔助診斷OSCC:從既往文獻中發(fā)現(xiàn),miR-21、miR-10b-5p、miR-486-5p、miR-412-3p、miR-512-3p,可以作為OSCC的診斷標(biāo)志。對患者組和健康組細胞外囊泡中5種miRNA的表達行RT-qPCR檢測和分析,非參數(shù)t檢驗法比較差異。結(jié)果顯示,miR-21-5p和miR-10b-5p在患者組表達高于對照組,而miR-512-3p、miR-412-3p、miR-486-5p的表現(xiàn)則無明顯差異(圖4)。

圖4 患者組與健康組唾液細胞外囊泡中miR-21-5p、miR-10b-5p、miR-512-3p、miR-412-3p、miR-486-5p的相對表達量

為了評估m(xù)iR-21-5p和miR-10b-5p在診斷中的準(zhǔn)確性,根據(jù)各自RT-qPCR結(jié)果,在OSCC診斷中設(shè)置閾值,算得此時的靈敏度和1-特異度。進而得到受試者工作特征曲線(ROC)、曲線下面積(AUC)及置信區(qū)間(CI)(圖5)。結(jié)果顯示AUC(miR-21-5p)=0.936,95% CI=(0.849-1.023),P=0.0001。AUC(miR-10b-5p)=0.807,95%CI=(0.646-0.967),P=0.0069。兩者AUC都大于0.5且接近1.0視為均具有較好的診斷意義。

圖5 miR-21-5p和miR-10b-5p在診斷中的準(zhǔn)確性

4.miRNA輔助OSCC患者術(shù)后判斷:對7例患者收集術(shù)前及術(shù)后1月的唾液樣本,提取細胞外囊泡,經(jīng)RT-qPCR測 試miR-21-5p、miR-10b-5p、miR-486-5p、miR-412-3p、miR-512-3p的 表 達 變化,并以此繪制柱狀圖。結(jié)果顯示后四種miRNA在術(shù)后3個月時未表現(xiàn)出規(guī)律的差異性(圖6B~E)。而對于miR-21-5p,7例患者中的6例在1月后表現(xiàn)出表達的下降,1例變化不明顯(圖6A)。對第7例術(shù)后3月再次提取唾液,測得miR-21-5p的表達相對術(shù)前有顯著的下降。因此,認為唾液細胞外囊泡中的miR-21-5p的表達,在OSCC術(shù)后療效判斷中具有一定的參考價值。

圖6 患者手術(shù)前后唾液細胞外囊泡中miR-21-5p、miR-512-3p、miR-486-5p、miR-412-3p和miR-10b-5p的相對表達量

討 論

miRNA是一類有內(nèi)源性基因編碼的、核苷酸鏈長大概20~24個的非編碼類RNA,被證實與多種腫瘤的惡性發(fā)展、轉(zhuǎn)移、抗藥有關(guān)[2]。目前OSCC的病理輔助診斷方法有甲苯胺藍染色法、組織活檢法、熒光成像法、分子學(xué)檢測法等[3~7]。在分子學(xué)檢測中,Ki-67、p53、IV型膠原是報道較多的OSCC的生物標(biāo)志物[8]。唾液中的主要成分有水,無機物,以及多種有機物,其中多種小分子具有輔助臨床診斷的潛能,并且唾液相比血液或者組織取材更容易、安全。但是唾液中的分子具有多源性(口腔內(nèi)為有菌環(huán)境),復(fù)雜性(唾液的分泌受多種調(diào)控),不穩(wěn)定性(唾液中的酶使得蛋白質(zhì)易降解)等問題。

既往研究表明,腫瘤組織會釋放細胞外囊泡、循環(huán)腫瘤細胞及游離核酸進入體液循環(huán)[9]。其中細胞外囊泡的數(shù)量比循環(huán)腫瘤細胞更多且更易富集,膜的存在也使得相比游離核酸更穩(wěn)定,因而近年來成為相關(guān)研究領(lǐng)域的一大熱點[10]。因此提出一個設(shè)想,以細胞外囊泡為液體活檢對象,檢測細胞外囊泡來源的miRNA,可以顯著降低實驗復(fù)雜性和受干擾性,提高待測因子穩(wěn)定性及檢測結(jié)果可靠性。

本次實驗對OSCC患者來源的唾液提取細胞外囊泡,進行TEM和WB檢驗,從形貌和表面標(biāo)志物兩個方向?qū)毎饽遗葑鞫ㄐ?。在細胞外囊泡的總蛋白質(zhì)與總RNA定量中,發(fā)現(xiàn)OSCC患者組總蛋白濃度相比健康對照組顯著升高,而總RNA濃度則無明顯差異,表明蛋白質(zhì)表達過程中存在差異。為探究蛋白質(zhì)表達水平發(fā)生變化的原因,對患者組和健康組唾液細胞外囊泡中的miR-21-5p、miR-10b-5p、miR-512-3p、miR-412-3p和miR-486-5p這 五 種miRNA進行RT-qPCR檢驗,結(jié)果顯示在患者組miR-21-5p和miR-10b-5p的表達顯著增高,這表明miR-21-5p和miR-10b-5p可以作為輔助診斷OSCC的標(biāo)志物。相關(guān)研究表明,miR-21-5p通過拮抗PDCD4,PTEN等的活性,增強腫瘤的惡性行為,進而促進腫瘤發(fā)展;如果競爭抑制miR-21-5p的作用,則可相對抑制OSCC的發(fā)展[11~13]。對于miR-10b,多種腫瘤的報道認為其促進了上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化、誘導(dǎo)血管生成、抑制凋亡,促進腫瘤細胞增殖、遷移、抵抗免疫監(jiān)視等,而當(dāng)miR-10b表達被抑制時,腫瘤的轉(zhuǎn)移也得以控制,預(yù)后更佳[14~16]。此處分別對比miRNA在患者組或健康組中的ROC,AUC后,認為miR-21-5p和miR-10b-5p在輔助診斷中具有很好的準(zhǔn)確性。此外,也檢測了唾液和血液中的細胞外囊泡,獲得miR-21的相對表達趨勢,結(jié)果顯示兩種來源的細胞外囊泡中,miR-21的表達近似正相關(guān),這證實了唾液源細胞外囊泡作為診斷指標(biāo)具有很好的可靠性。還采集了OSCC患者術(shù)前術(shù)后唾液行RT-qPCR檢測,結(jié)果術(shù)后患者唾液中的miR-21的表達都表現(xiàn)出明顯的下降。

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