近日,中國科學(xué)院昆明植物研究所科研人員參與的豆科系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)和根瘤菌固氮共生演化研究取得新進(jìn)展。相關(guān)研究破解了豆科植物在“恐龍大滅絕”時(shí)期得以幸存并繁衍成為被子植物最成功的類群之一的“密碼”。
研究顯示,豆科的祖先起源于大約距今6700萬年前,即“恐龍大滅絕”時(shí)期。這一時(shí)期,包括裸子和蕨類植物等在內(nèi)的大約五分之三的物種發(fā)生滅絕,豆科卻得以幸存。豆科植物與根瘤菌共生固氮體系,是自然界固氮效率最高、固氮量最大的生物固氮系統(tǒng),每年可以固定17.2×107噸氮元素。
通過國際合作廣泛取樣、大規(guī)模RNA測(cè)序或淺層DNA測(cè)序,科研團(tuán)隊(duì)新獲得391個(gè)豆科物種的700多萬核基因轉(zhuǎn)錄本的序列數(shù)據(jù),結(jié)合其他已發(fā)表的基因序列數(shù)據(jù)集,覆蓋豆科所有的6個(gè)亞科59個(gè)族或族級(jí)分支的共計(jì)463種。
基于這些數(shù)據(jù),科研人員得到高解析和高支持的豆科系統(tǒng)樹,解決一些長(zhǎng)期存在爭(zhēng)議的系統(tǒng)關(guān)系。同時(shí),在豆科中鑒定到28次全基因組二倍化或者三倍化加倍事件;并針對(duì)豆科亞科之間多個(gè)異源多倍化的假說進(jìn)行65個(gè)豆科物種數(shù)據(jù)的比較分析,支持豆科祖先經(jīng)歷多倍化。
研究表明,豆科早期全基因組復(fù)制事件可能為穩(wěn)定有效的固氮根瘤提供豐富的遺傳物質(zhì)基礎(chǔ),為一系列生理、生態(tài)性狀的演化提供內(nèi)在條件。同時(shí),“恐龍大滅絕”時(shí)期物種大滅絕為豆科物種提供了更多的生態(tài)位,以及豆科穩(wěn)定高效的固氮能力協(xié)同促進(jìn)自身物種的多樣化進(jìn)程,使之最終演化成為一個(gè)成功的被子植物類群。這一研究為了解新生代物種多樣性提供了重要的視角。