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青稞普通根腐病的調(diào)查與病原鑒定

2021-07-19 07:09:04李雪萍劉梅金許世洋郭建煒漆永紅李敏權(quán)
草業(yè)學(xué)報 2021年7期
關(guān)鍵詞:根腐病大麥青稞

李雪萍 ,劉梅金 ,許世洋 ,郭建煒 ,漆永紅 ,李敏權(quán) *

(1. 甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護研究所,甘肅蘭州730070;2. 甘肅省甘南州農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,甘肅合作747000;3. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院,甘肅蘭州730070)

青稞(Hordeum vulgarevar.nudum)是多棱裸粒大麥統(tǒng)稱,在我國主要種植于西藏、青海、云南、甘肅、四川等省區(qū)海拔較高的地區(qū),其成熟期短、耐寒性強,在海拔超過4200 m 的高寒地區(qū),青稞是唯一能夠正常成熟的谷物,因此,在古埃及和我國的藏區(qū)也常被當(dāng)?shù)鼐用褡鳛橹魇常?]。同時,青稞在澳大利亞、歐洲馬其頓、美國北部大平原、加拿大西部等多個國家地區(qū)及我國多個地區(qū)常被作為飼用作物,其富含多種氨基酸、膳食纖維、維生素、β?葡聚糖以及鈣、鎂、磷、鋅、錳、硒等礦質(zhì)元素,亦常被用來釀酒及現(xiàn)代健康食品的加工等[2]。由此可見,青稞的生產(chǎn)不僅保障了高原地區(qū)畜牧業(yè)的發(fā)展及當(dāng)?shù)鼐用竦幕旧睿鼮楝F(xiàn)代人民健康生活水平的提升做出了貢獻。

然而,植物病害嚴(yán)重影響了包括青稞在內(nèi)的大麥類作物的生產(chǎn)。據(jù)Murray 等[3]報道,澳大利亞在1998?2007 年這10 年間,由植物病害造成大麥(Hordeum vulgare)損失每年達2.52 億美元,是總產(chǎn)值的19.6%。在美國北達科他地區(qū)及加拿大,根腐病造成大麥減產(chǎn)近10%[4]。青稞感染根腐病后根和芽的鮮重、干重、谷粒數(shù)均大幅下降,從而導(dǎo)致總產(chǎn)量降低;分析其營養(yǎng)成分發(fā)現(xiàn),其總碳水化合物下降23.28%~82.77%,蛋白質(zhì)下降0.55%~76.62%,脂肪下降28.45%~79.25%[5]。目前,對大麥類作物病害的研究主要集中在大麥條紋?。??7]、銹病等[8?9]方面,對于根腐病的研究較少,對青稞根腐病的研究僅有本課題組報道[10?11],而根腐病病害類型復(fù)雜,病原多樣,因寄主、環(huán)境、氣候、土壤等各種因素而異。鑒于此,本研究對西北青藏高原地區(qū)的青稞根腐病進行了調(diào)查,明確其危害程度及發(fā)病癥狀,并采集樣品進行病原分離鑒定、致病性測定,以期為青稞根腐病的防控及致病機理的研究提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 調(diào)查研究區(qū)概況

調(diào)查研究區(qū)選擇甘肅省甘南藏族自治州合作市、卓尼縣、臨潭縣以及青海省海北藏族自治州剛察縣、海東市互助土族自治縣等我國重要的青稞生產(chǎn)區(qū)。其位于青藏高原東部及北部邊緣,平均海拔2800 m 以上,無霜期短,日照時間時長,是典型的大陸性氣候,青稞是該地區(qū)適生作物,也是該地區(qū)最主要的糧飼作物。

1.2 調(diào)查采樣

參考《植病研究法》[12]對該區(qū)域青稞發(fā)病率進行調(diào)查統(tǒng)計,避開地邊5 m,挑選植株枯黃或長勢明顯很弱,且發(fā)病植物地下部普遍有根腐癥狀的地塊,統(tǒng)計其占總地塊的面積比例,即其發(fā)病率,據(jù)此計算同一地區(qū)所有地塊的平均發(fā)病率,即該地區(qū)青稞普通根腐的發(fā)生率;采用多點采樣法采集發(fā)病特征典型的疑似青稞普通根腐病植株,低溫運輸至實驗室進行研究。

1.3 病原的分離與純化

刷掉青稞病株根部土壤,清洗干凈并自然風(fēng)干。從根部的病健交界處剪下根段,70%的酒精消毒2~3 s 并用無菌水沖洗干凈,放入0.1%的升汞溶液中消毒10 s,再用無菌水洗4 次,用無菌濾紙吸干表面水分;然后用無菌解剖刀切去根段兩端,將中間的根段接于馬鈴薯葡萄糖瓊脂(potato dextrose agar,PDA;培養(yǎng)基成分:馬鈴薯200 g,葡萄糖20 g,瓊脂20 g,水1000 mL)平板之上;約3~4 d 后,將根段的兩端長出的菌絲轉(zhuǎn)移到另一PDA 平板之上,并采用單孢分離法[13]對其進行純化。

1.4 菌株鑒定

1.4.1 形態(tài)鑒定 觀察并記錄菌株在PDA 培養(yǎng)基上的菌落形態(tài)特征,在顯微鏡下觀察其菌絲及孢子形態(tài),參照《真菌鑒定手冊》[14]、《中國真菌志》第十六卷(鏈格孢屬)[15]、第三十卷《蠕形分生孢子真菌》[16],確定其分類地位。

1.4.2 分子生物學(xué)鑒定 將待鑒定菌株活化后接于馬鈴薯葡萄糖培養(yǎng)液中,120 r·min?1、25 ℃搖床培養(yǎng)5 d,收集菌絲體,F(xiàn)ungal DNA Kit 試劑盒(OMEGA)提取DNA(操作步驟依據(jù)試劑盒說明書)。選用ITS1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)和 ITS2(5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′)引物進行 PCR 擴增。反應(yīng)體系為:總體積 25 μL、基因組 DNA 1.0 μL、10×Buffer(含 2.5 mmol·L?1Mg2+)2.5 μL、Taq 聚合酶(5 U·μL?1)0.5 μL、dNTP(10 mmol·L?1)1.0 μL、Primer(±10 μmmol·L?1)1 μL、ddH2O 補至 25 μL。PCR 參數(shù)為:94 ℃預(yù)變性 5 min,94 ℃變性 30 s,58 ℃退火 45 s,72 ℃延伸 80 s,重復(fù)擴增35 個循環(huán),72 ℃延伸 7 min,4 ℃保存。反應(yīng)完成后,取2 μL PCR 產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,檢測合格后委托北京天一輝遠(yuǎn)生物科技有限公司進行測序。得到測序結(jié)果后在NCBI 中進行Blast 比對并選取參考序列,利用MEGA 7.0 中的最大似然法(1000次重復(fù))構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,確定其分類地位,并將結(jié)果提交至GenBank,獲得登錄號。

1.5 致病性測定

根據(jù)前期研究結(jié)果,燒杯水瓊脂法可以較好、較便捷的反應(yīng)菌株的致病性[13],具體為:1)將待測菌株活化后接種于1.2%的水瓊脂(water agar,WA)培養(yǎng)基上,置于25 ℃培養(yǎng)3 d。2)將供試種子(品種為藏青2000,由甘南州農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所提供)消毒后25 ℃催芽48 h。3)挑取發(fā)芽一致的種子均勻擺放在帶菌的WA 培養(yǎng)基上,并在不接菌的WA 培養(yǎng)基上接入種子作為對照,每杯放入10 粒,錫紙封口后放入人工氣候箱(兩個階段:第一階段為時間8 h,光80%,濕度60%,溫度25 ℃;第二階段為時間16 h,光照為0,濕度80%,溫度20 ℃)。待種苗長至燒杯口處時揭去錫紙,打開紙盒蓋,繼續(xù)在人工氣候箱中培養(yǎng),8 d 后觀察發(fā)病情況,參考田間發(fā)病情況及發(fā)病癥狀,確定分級標(biāo)準(zhǔn),統(tǒng)計病級,計算其發(fā)病率及病情指數(shù)。

分級標(biāo)準(zhǔn):0 級?健康無病,葉綠,根與根莖白;1 級?根系有褐色斑點出現(xiàn),但不超過30%;2 級?根系成段變褐,但不斷裂,不超過30%;3 級?根系成段變褐甚至變黑,容易斷裂,不超過50%;4 級?根系成段變褐甚至變黑,斷裂腐爛,大于50% 或整個植株死亡。

將致病性測定后病株每菌隨機挑出3 株,剪下其種子或病根,接種于PDA 培養(yǎng)基上,于25 ℃下培養(yǎng)7 d 后鏡檢觀察其孢子形態(tài),在此期間不斷觀察其菌落形態(tài),確認(rèn)是否與接入時的菌株一致。

1.6 數(shù)據(jù)分析

相關(guān)數(shù)據(jù)整理及分析采用Excel 2007 和DPS 15.10 完成,采用Duncan 新復(fù)極差法進行差異顯著性分析(P<0.05)。

2 結(jié)果與分析

2.1 發(fā)生分布

青稞普通根腐病主要分布在甘肅省甘南藏族自治州臨潭縣古戰(zhàn)鄉(xiāng),卓尼縣柳林鎮(zhèn)、阿子灘鄉(xiāng)、完冒鄉(xiāng),合作市卡加曼鄉(xiāng)以及青海省海北藏族自治州剛察縣,海東市互助土族自治縣林川鄉(xiāng)。發(fā)生較為普遍,田間發(fā)病率為5%~15%(表1)。

表1 青稞根腐病的調(diào)查Table 1 Investigation on root rot of qinke barley

2.2 發(fā)病癥狀

青稞苗期普通根腐病不易識別,其癥狀為地上葉片多表現(xiàn)為葉色淡,呈黃綠色,幼苗瘦弱或死亡,有明顯的發(fā)病中心,挖出洗凈后可發(fā)現(xiàn)其根部發(fā)黑,容易斷裂或腐爛;青稞成株期普通根腐病多表現(xiàn)為穗白粒癟,莖稈甚至葉片呈黑褐色,挖出洗凈后亦可發(fā)現(xiàn)根部黑褐?jǐn)嗔鸦蚋癄€(圖1)。

圖1 青稞普通根腐病癥狀Fig.1 Qingke barley common root rot symptoms

2.3 病原鑒定

2.3.1 形態(tài)特征 共分離得到13 株青稞普通根腐病病原,其中8 株在PDA 培養(yǎng)基上均呈現(xiàn)青灰褐色,氣生菌絲發(fā)達,厚絨狀,易產(chǎn)生大量分生孢子,孢子呈淡黃褐色至灰褐色,易從兩端萌發(fā),擬紡錘形,多數(shù)較直,少數(shù)彎曲,平均大小為(63.62~79.36)μm×(18.99~22.46)μm(圖2),初步鑒定為麥根腐平臍蠕孢(Bipolaris sorokiniana)。

圖2 麥根腐平臍蠕孢的形態(tài)特征Fig.2 Morphological characteristics of B. sorokiniana

其中5 株菌落呈青灰褐色,菌絲發(fā)達,在PDA 培養(yǎng)基上容易產(chǎn)生大量的分生孢子,分生孢子黃褐色至青灰褐色,形狀大小不一,有橫隔膜,斜隔膜和縱隔膜,平均大小為(24.86~41.66)μm×(8.32~13.92)μm(圖3)。初步鑒定為鏈格孢(Alternaria alternata)。

圖3 鏈格孢的形態(tài)特征Fig.3 Morphological characteristics of A. alternate

2.3.2 分子鑒定 如圖4 所示,以木賊鐮孢及鏈格孢等作為外群,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹發(fā)現(xiàn),D26-2、D23-1、D22-1、D13-1、D32-6、D28-3、NQ4-3、Q7-6 這 8 株菌與麥根腐平臍蠕孢聚為一類,遺傳距離為 0,自展支持值為 100(1000 次重復(fù))。結(jié)合形態(tài)特征鑒定的結(jié)果,確定本研究分離到的此8 株菌均為麥根腐平臍蠕孢。提交序列至GenBank,獲得的登錄號分別為 KY365567(D26-2)、KY365566(D23-1)、KY365565(D22-1)、KY365575(D13-1)、KY365569(D32-6)、KY365568(D28-3)、KY365583(NQ4-3)、KY365590(Q7-6)。

圖4 基于rDNA ITS 區(qū)序列構(gòu)建的麥根腐平臍蠕孢系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.4 B. sorokiniana phylogenetic tree based on rDNA ITS sequence

同時,以麥根腐平臍蠕孢作為外群,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹發(fā)現(xiàn),D28-1、D34-1、D3-4、NQ3-4、D33-2 這5 菌株與鏈格孢的遺傳距離為0,自展支持值大于99(1000 次重復(fù))。結(jié)合形態(tài)特征,確定該5 株菌為鏈格孢。提交序列至GenBank,獲得的登錄號分別為 KY365561(D28-1)、KY365563(D34-1)、KY365573(D3-4)、KY365582(NQ3-4)、KY365562(D33-2)(圖 5)。

圖5 基于rDNA ITS 區(qū)序列構(gòu)建的鏈格孢系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.5 A. alternate phylogenetic tree based on rDNA ITS sequence

2.4 致病性分析

如表2 所示,8 株麥根腐平臍蠕孢均可導(dǎo)致青稞普通根腐病的發(fā)生,發(fā)病癥狀與青稞田間苗期普通根腐病癥狀一致,除D13-1 及NQ4-3 外,其他6 株菌可100%引起青稞普通根腐病的發(fā)生,其中D32-6、Q7-6、D26-2 和D28-3 這4 株菌的致病性最強,病情指數(shù)均在80%以上,且各菌株的致病性差異顯著。經(jīng)再次分離病原觀察其形態(tài)特征發(fā)現(xiàn),與接入時一致,確認(rèn)為該種病害的病原。

表2 青稞普通根腐病病原-麥根腐平臍蠕孢的致病性Table 2 The common root rot pathogen of qinke barley-B.sorokiniana pathogenicity

如表3 所示,5 株均有致病性,致病差異顯著;鏈格孢的致病性較低,致病性最強的D28-1 發(fā)病率為89.17%,病情指數(shù)為36.42;發(fā)病癥狀與田間苗期普通根腐病輕癥一致,經(jīng)再分離發(fā)現(xiàn),其菌株形態(tài)與接入時一致,確認(rèn)為普通根腐病病原。

表3 鏈格孢的致病性Table 3 The A.alternate pathogenicity

3 討論

目前,關(guān)于青稞根腐病的研究較少,病原研究鮮見,可查閱到的資料多為大麥根腐病的相關(guān)研究,并非其變種青稞,因此,本研究首次明確了青稞普通根腐病的病原。本研究發(fā)現(xiàn),青稞普通根腐病的優(yōu)勢病原是麥根腐平臍蠕孢,與 Ilija 等[17]、Mohammad 等[18]和Zhong 等[4]對大麥根腐病病原的研究結(jié)果一致。也有眾多研究表明大麥根腐病的優(yōu)勢病原為鐮孢菌,主要包括燕麥鐮孢、黃色鐮孢、禾谷鐮孢、梨孢鐮孢、擬枝鐮孢等[19?22]。然而,有研究發(fā)現(xiàn),大麥根腐病是由多種病原復(fù)合侵染引起的,如 Makela 等[23]、Pua 等[24]和 Fedel 等[25]研究表明,大麥根腐病是由麥根腐平臍蠕孢和鐮孢菌屬共同引起的。Amira[26]和 Ravjit 等[27]則研究表明,絲核菌和鐮孢菌是引起大麥根腐病的優(yōu)勢病原。前人對大麥根腐病病原的研究做出了巨大貢獻,但未見將根腐病害類型作以區(qū)分。究其原因,根腐類病害發(fā)生的環(huán)境復(fù)雜,受氣候、種植、土壤等多個因素的影響,不同類型的根腐類病害往往混合發(fā)生,癥狀類似,從而對根腐類病害類型的確定造成了困難。本研究通過大量調(diào)查采樣及試驗研究發(fā)現(xiàn)以麥根腐平臍蠕孢為優(yōu)勢病原的青稞根腐類病害,其癥狀典型,與鐮孢菌根腐病等其他根腐類病害差異較大,確定為青稞普通根腐病。麥根腐平臍蠕孢是小麥(Triticum aestivum)、玉米(Zea mays)、柳枝稷(Panicum virgatum)等植物葉斑?。?8?30]、根腐病[31]以及燕麥(Avena sativa)褐斑?。?2]等多種作物病害的病原,其侵染規(guī)律、致病機理及各種病害之間的關(guān)系有待進一步研究。另外,近年來,越來越多的研究證明,鏈格孢能引起葉斑病、果腐病、根腐病、黑斑病等多種植物病害,其寄主廣泛,致病性強,產(chǎn)生毒素,危害嚴(yán)重[33?34]。本研究發(fā)現(xiàn),5株鏈格孢可致病導(dǎo)致青稞根腐病的發(fā)生,但未見只分離到鏈隔孢的病株,其可能與麥根腐平臍蠕孢復(fù)合侵染或在麥根腐平臍蠕孢侵染后加重發(fā)病程度,其互作機理還有待進一步研究。

4 結(jié)論

我國西北青藏高原地區(qū)甘肅省甘南藏族自治州、青海省海東市、海北藏族自治州青稞普通根腐病發(fā)生普遍,發(fā)病率為5%~15%。青稞感染普通根腐病后葉呈黃綠色,穗白粒癟,幼苗瘦弱或死亡,根部發(fā)黑、腐爛或斷裂。青稞普通根腐病的病原為麥根腐平臍蠕孢和鏈格孢,麥根腐平臍蠕孢為優(yōu)勢病原。

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