黃年英,朱珍珍,劉昌燕,廖芳麗,李 莉,陳宏偉,劉良軍,韓雪松,萬正煌 ,沙愛華
(1. 長江大學農(nóng)學院/主要糧食作物產(chǎn)業(yè)化湖北省協(xié)同創(chuàng)新中心,湖北 荊州 434025;2. 湖北省農(nóng)業(yè)科學院糧食作物研究所/糧食作物種質(zhì)創(chuàng)新與遺傳改良湖北省重點實驗室,武漢 430064;3. 荊州市種子管理局,湖北 荊州 434020)
【研究意義】綠豆[Vigna radiata(L.)Wilczek],屬菜豆族(Phaseoleae)豇豆屬(Vigna),是我國傳統(tǒng)的豆類食物,廣泛種植于華北、西北和東北等主產(chǎn)區(qū)及其他省份[1],綠豆播種季節(jié)常因降雨量少而影響綠豆種子萌發(fā),嚴重限制了綠豆生產(chǎn)的發(fā)展[2,3]。除了引水灌溉,篩選耐旱綠豆種質(zhì)資源、培育耐旱品種是解決這一問題的根本途徑。萌發(fā)期是植株正常生長發(fā)育的關(guān)鍵時期,而土壤水分含量會直接影響種子萌發(fā),因此萌發(fā)期是研究植物耐旱性的關(guān)鍵時期。對綠豆種質(zhì)資源萌發(fā)期耐旱性進行評價及篩選耐旱種質(zhì),可為綠豆耐旱品種選育及品種改良提供參考[4]。【前人研究進展】近年來,綠豆種質(zhì)篩選方面的研究已有較多報道,劉晨旦等[5]采用15% 的PEG-6000 高滲溶液對 58 份綠豆品種進行干旱模擬脅迫,測定其發(fā)芽率、發(fā)芽勢、發(fā)芽指數(shù)、活力指數(shù)和相對根長等指標,對不同基因型綠豆品種的耐旱性進行了鑒定,篩選出1份高耐和4份耐性品種。王蘭芬等[6]利用抗旱性系數(shù)、隸屬函數(shù)和抗旱性指數(shù)對綠豆的抗旱性進行評價,指出3種方法相關(guān)性極高,適宜于綠豆抗旱鑒定評價。Ali等[7]根據(jù)綠豆種子萌發(fā)特性與幼苗抗氧化潛能及養(yǎng)分吸收的關(guān)系,研究了不同綠豆品種的耐旱性。高運青等[8]運用灰色關(guān)聯(lián)度分析方法,對29份不同來源綠豆種質(zhì)資源進行綜合評價,篩選出6份綜合性能較好的綠豆品種,并依據(jù)聚類分析將其資源聚為4 類?;诜肿泳垲惖姆椒軌驕蚀_揭示不同種質(zhì)之間的遺傳關(guān)系,為應(yīng)用不同種質(zhì)開展相關(guān)育種提供參考,綠豆中也有較多研究報道。Sunayana等[9]對60份不同基因型綠豆在夏季限濕條件下的遺傳差異進行了評價,基于19個表型標記,層次聚類分析確定了9個大類,包含1~15個基因型。葉衛(wèi)軍等[10]開發(fā)了274 2個SSR標記,通過聚類分析將90份材料分為2個類群,具有相同地理來源的材料多數(shù)可以聚在一起或成簇狀分布。趙雅楠等[11]利用 15 對SSR引物對東北三省地區(qū) 156 份綠豆種質(zhì)資源進行遺傳多樣性分析,在遺傳相似系數(shù)為 0. 478 的閾值處將參試個體分為 5 個組群,相同地理來源品種大多成簇分布?!颈狙芯壳腥朦c】前人研究雖然鑒定出了一些耐旱綠豆種質(zhì),但仍無法滿足生產(chǎn)需求。本研究擬通過評價收集的56份綠豆種質(zhì)萌發(fā)期耐旱性,期望鑒定出新的耐旱綠豆種質(zhì),并明確其遺傳基礎(chǔ),以滿足綠豆耐旱育種的需要?!緮M解決的關(guān)鍵問題】以相對發(fā)芽率、相對發(fā)芽勢和相對根長等10個指標作為耐旱性評價指標,通過主成分分析、隸屬函數(shù)分析和多元分析方法鑒定綠豆種質(zhì)耐旱性。基于SSR擴增對56份種質(zhì)資源進行分子聚類,明確其遺傳基礎(chǔ)。
供試的56份綠豆種質(zhì)材料及來源地如表1所示,均 由湖北省農(nóng)業(yè)科學院糧食作物科學研究所提供。
1.2.1 試驗準備 選取優(yōu)質(zhì)、飽滿的種子在10%Naclo溶液中浸泡5 min,然后用無菌水洗滌3~4次。均勻擺入鋪有雙層濾紙的培養(yǎng)皿中,甘露醇處理和蒸餾水對照處理(CK)均3次重復,每個重復放25粒種子,用15 mL甘露醇溶液或蒸餾水浸潤,培養(yǎng)皿放置在人工培養(yǎng)箱黑暗發(fā)芽,溫度為25 ℃,每天定時補 充少量溶液或水。
1.2.2 耐旱性相關(guān)指標測定 從種子放置培養(yǎng)皿第2天開始每日定時統(tǒng)計發(fā)芽種子數(shù)。第8天從每個培養(yǎng)皿中隨機選取10株正常生長的幼苗測定其根長、芽長及其鮮重等指標,并計算平均值。發(fā)芽相關(guān)指標按農(nóng)作物發(fā)芽技術(shù)規(guī)定(GB/T 35434 1995)測量計算,各指標公式如下:
相對發(fā)芽率(RGR,relative germination rate)=第8 d發(fā)芽種子數(shù)/供試種子數(shù)×100%
發(fā)芽率(GR,germination rate)=第8 d發(fā)芽種子數(shù)/供試種子數(shù)×100%
相對發(fā)芽勢(RGE,relative germination energy)=(處理發(fā)芽勢/對照發(fā)芽勢)×100%
發(fā)芽勢(GE,germination energy)=(第5 d的發(fā)芽種子數(shù)/供試種子數(shù))×100%
表 1 56份綠豆材料編號及基本信息Table 1 Codes and basic information of 56 mung bean germplasms
相對根長(RRL,relative Root length)=(處理根長/對照根長)×100%
相對胚軸長(RPL,relative plumular axis length)=(處理胚軸長/對照胚軸長)×100%
相對芽長(RBL,relative bud length)=(處理芽長/對照芽長)×100%
相對芽干重(RSDW,relative shoot dry weight)=(處理芽干重/對照芽干重)×100%
相對芽鮮重(RSFW,relative shoot fresh weight)=(處理芽鮮重/對照芽鮮重)×100%
活力指數(shù)(VI,vigor index)=(相對苗高×相對發(fā)芽率)×100%
相對苗高(RBL,relative bud length)=(處理苗高/對照苗高)×100%
萌發(fā)耐旱指數(shù)(GDRI,germination drought tolerant index)=滲透脅迫下的萌發(fā)指數(shù)/對照萌發(fā)指數(shù),萌發(fā)指數(shù)(GI,germination index)=(1.00)nd2+(0.75)nd4+(0.5)nd6+(0.25)nd8(其中,nd2、nd4、nd6、nd8分別為第2、4、6、8 d的種子發(fā)芽率,1.00、0.75、0.50、0.25分別為相應(yīng)萌發(fā)時間所賦予的耐旱系數(shù))
萌發(fā)脅迫指數(shù)(GSI,germination stress index)=處理種子發(fā)芽指數(shù)/對照種子發(fā)芽指數(shù)
發(fā)芽指數(shù)(GI,germination index)=?(DG/DT)(DG為逐日發(fā)芽數(shù),DT為相應(yīng)DG的發(fā)芽天數(shù))
萌發(fā)耐旱性指數(shù)和萌發(fā)脅迫指數(shù)的計算方法參照 李玲等[12]的方法。
1.2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析 采用Microsoft Excel 2010 進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計、計算及隸屬函數(shù)分析,DPS 7.01 統(tǒng)計軟件進行數(shù)據(jù)相關(guān)性分析及主成分分析。相關(guān)公式如下:
式中,U(Xj)表示j指標的隸屬函數(shù)值,Xj為某個指標的實際測量值,Xjmax、Xjmin分別為該指標的最大值和最小值。
權(quán)重計算公式:
式中,Pj表示第j個綜合指標的貢獻率。綜合評價D值計算公式:
參考王利彬等[13]的大豆耐旱性鑒定方法,把耐旱級別劃分為5個等級:1級:D≥0.8,高耐;2級:0.6≤D<0.8,耐;3級:0.4≤D<0.6,中耐;4級:0.2≤D<0.4,較敏感;5級:D<0.2,敏感。
1.3.1 DNA提取和PCR擴增 取室溫下種植的綠豆新鮮幼葉葉片,用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)提取基因組DNA,并用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA質(zhì)量。并將DNA稀釋至50 ng·μL?1,選用34對SSR引物[14]對綠豆進行SSR標記分析(表2)。反應(yīng)體系總體積為15 μL,包含 Taq聚合酶0. 2 μL,10×Buffer 1.5 μL,dNTP 0.4 μL,引物各0.6 μL,模板DNA 1.5 μL,ddH2O 10. 2 μL。PCR擴增在TGreat Gradient
表 2 用于遺傳多樣性分析的34對引物信息Table 2 Thirty-four pairs of primers used for genetic diversity analysis
Thermal Cycler OSE-GP-01型PCR儀上進行。反應(yīng)程序為94 ℃預變性5 min;94 ℃ 變性30 s,53~60 ℃復性30 s,72 ℃延伸30 s,35個循環(huán);最后72 ℃終延伸10min。PCR產(chǎn)物用6.0% PAGE電泳分析,銀染后讀帶。每個基因座的等位基因數(shù)(Na)和多態(tài)性 信息含量(PIC值)均作為多樣性參數(shù)[15]。
1.3.2 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析 同一對SSR引物擴增帶(等位基因變異)在電泳板相同位置有帶記為 1,無帶記為0。使用PowerMarker 3.4計算遺傳多樣性參數(shù)。利用NTSYS-PC 2.1軟件生成遺傳相似系數(shù),并進行聚 類分析。
在10%甘露醇溶液和蒸餾水對照下測量56種綠豆種質(zhì)的發(fā)芽指標(表3)。發(fā)芽勢為4.00%~88.00%,平均值為44.32%,較對照變化率為?54.12%;發(fā)芽率為28.00%~100%,平均為64.74%,變化率為?33.67%;其他發(fā)芽相關(guān)指標也表現(xiàn)出受到明顯抑制作用,芽鮮重變化率最大為?99.00%,其次為活力指數(shù)變化率為?96.81%,根長、胚軸長、芽長、芽干重、發(fā)芽指數(shù)、萌發(fā)指數(shù)變化率分別為?93.1%、?92.14%、?95.4%、?96.00%、?73.04%、?70.51%。因此,干旱脅迫對種子萌發(fā)的抑制作用體現(xiàn)在多個性狀,抑制程度也存在差異。比較處理組與對照組,處理組芽長與芽干重的變異系數(shù)分別降低14.29%和2.33%,其發(fā)芽勢變異系數(shù)增加9.52倍,胚軸長、萌發(fā)指數(shù)、發(fā)芽指數(shù)、發(fā)芽率、簡易活力指數(shù)、芽鮮重和根長分別增加9.00倍、7.20倍、5.67倍、0.84倍、0.78倍、0.53倍、0.36倍(表3)。
表 3 56份綠豆材料萌發(fā)期蒸餾水和10%甘露醇干旱脅迫下各指標的變化與比較Table 3 Evaluation indicators (mean+SD) on seeds of 56 mung bean germplasms germinated under water or 10% mannitol treatment
主成分分析獲得的前三個綜合指標的貢獻率分別為57.87%,16.42%和11.42%,累積貢獻率達85.71 %(表4),表明前3個相互獨立的主成分能夠代表10個指標的變異信息。將其命名為3個全新的相互獨立的綜合指標,順序定義為第 1、第2、第 3主成分(Comprehensive index,CI1、CI2和 CI3)。
在干旱脅迫處理,CI 1中種質(zhì)No.3的 隸屬函數(shù)值U(Xj)最小,而No.13的 U(Xj)最大(表5), 表明以 CI 1作為評價指標時,No.3和 No.13分別對干旱表現(xiàn)為敏感和高耐。根據(jù)主成分分析得到的各綜合指標貢獻率大?。ū?),計算U(X)1、U(X)2和U(X)3的權(quán)重值Wj,分別為 0.675、0.192和0.133。進一步根據(jù)U(Xj)和相應(yīng)Wj進行加權(quán)計算得到的綜合評價值D對56份種質(zhì)耐旱性進行評價,發(fā)現(xiàn)No.13 的D值最大,而No.3的 D 值最小(表5),表明它們分別為最耐旱和最敏感種質(zhì)。
根據(jù)各種質(zhì)資源的綜合評價D值,按耐旱性分級標準將56個綠豆品種分為高耐、耐、中耐、敏感和高敏 5個等級。其中中綠14號(No.13)和中綠17號(No.16)表現(xiàn)為高耐;10 份種質(zhì)(No.01,08,18,20,21,22,37,40,48,52)表現(xiàn)為耐旱,占供試材料的17.86%;中耐種質(zhì)30 份,分別為No.02,04,06,07,09,10,11,14,15,17,19,23,26,28,34,35,36,39,41,42,43,44,45,46,49,50,51,54,55和56,占供試材料的53.58%;敏感材料13份,分別為No.05,12,24,25,27,29,30,31,32,33,38,47和53,占供試材料的23.21%;高敏材料1份,為中綠3號(No.03)。
表 4 主成分分析Table 4 Results of principal component analysis
利用SSR標記研究遺傳多樣性,等位基因數(shù)為2~12個,平均等位基因數(shù)為5.5個,PIC值的變幅為0.03~0.67,平均值為0.27。34對引物共擴增出191條DNA條帶,得到187條多態(tài)性條帶(等位基因)(表6)?;赟SR聚類將56個種質(zhì)在D-0.64分為3個主要類群(圖1)。第一類群(Ⅰ)共有25個種質(zhì)資源(No.01、22、02、11、09、15、17、42、16、34、41、14、18、23、39、05、07、13、36、21、44、24、25、47、48),其中84%為中耐、耐旱和高耐。值得注意的是2個高耐品種(No.13和No.16)聚在相近亞群,而3個敏感種質(zhì)No. 24,No.25和No.47聚在另外相近亞群。第二類群(Ⅱ)由26個種質(zhì)組成,其中70%為中耐和耐旱。此外,大部分敏感或高敏種質(zhì)都聚于相近亞群,例如No.03和No.38在一個小亞群中,No.32、29、33、30、53聚在相近亞群。第三類群(Ⅲ)僅包括2份敏感3份中耐種質(zhì)。以上結(jié)果表明,第一組種質(zhì)可能較耐旱,具有相似的遺傳基礎(chǔ)。第二組種質(zhì)遺傳基礎(chǔ)復雜,表現(xiàn)出不同程度的耐旱性,第三組種質(zhì)可能偏敏感。
表 5 56個綠豆品種的綜合指標、指標權(quán)重、隸屬函數(shù)和綜合評價(D值)Table 5 Comprehensive indices, index weights, subordinate function, and comprehensive evaluation D value on 56 mung bean germplasms
表 6 34對SSR引物在綠豆中的多態(tài)性Table 6 Polymorphisms of 34 pairs of SSR primers in mung beans
甘露醇模擬干旱的試驗方法被廣泛應(yīng)用于馬鈴薯[16]、狗尾草[17]、玉米[18]、高粱[19]、油菜[20]等作物中。種子發(fā)芽率是衡量種子活力的重要指標之一,但是如果將其作為衡量種子耐旱性的唯一標準,很難全面反映種子萌發(fā)期的耐旱性,因此必須建立一套更加綜合全面的種子萌發(fā)耐旱評價體系。
本文參考其他作物[12,13,18,21,22]耐旱性鑒定方法,在綠豆中建立了一種基于多項綜合指標評價種子萌發(fā)期耐旱性的方法。通過采用這一方法評估56份綠豆種質(zhì)的萌發(fā)耐旱性,鑒定出2份高耐(中綠14和中綠17)和1份高敏種質(zhì)(中綠3號),其他種質(zhì)分別鑒定為耐(17.86%)、中耐(53.38%)和敏感(23.21%)。這56份種質(zhì)中,劉晨旦等[5]對中綠1號(No.01)、中綠2號(No.02)、中綠10號(No.09)、濰綠5號(No.23)、中綠5號(No.05)、中綠8號(No.07)、晉7(No.44)、中綠3號(No.03)、冀綠2號(No.40)、中綠11號(No.10)、晉8(No.45)、保綠942(No.46)、白綠9號(No.50)和白綠10號(No.51)已做過芽期抗旱性鑒定[5]。與之相比,大部分品種的抗性鑒定一致,表現(xiàn)為中耐和耐。但是其中3個品種的抗性鑒定結(jié)果存在差異:中綠3號、中綠5號和中綠10號本文分別鑒定為高敏、敏感和中耐,而劉晨旦等[5]分別鑒定為中抗、中抗和高抗。出現(xiàn)這種偏差的原因可能在于本文用到的干旱模擬劑為甘露醇,而劉晨旦等[5]用的是PEG-6000。另外本文以10個耐旱評價相關(guān)指標進行綜合評價,而劉晨旦等[5]只選用了其中的4個指標采用隸屬函數(shù)值進行評價。盡管如此,大部分品種2種方法鑒定結(jié)果一致,表明2種方法都能比較準確的用于鑒定綠豆芽期耐旱性。
在耐旱性鑒定的基礎(chǔ)上,進一步明確其遺傳基礎(chǔ),將有利于在育種中有針對性的利用這些種質(zhì)資源。SSR 標記可以產(chǎn)生足夠多的多態(tài)性條帶以區(qū)分綠豆種質(zhì)的遺傳多樣性。本研究34對引物中,PIC平均為0.27,最高為0.67(表6),稍低于前人研究結(jié)果[11,15],可能是由于引物數(shù)量較少導致?;赟SR的聚類圖將56個種質(zhì)分為三大類,分別表現(xiàn)出不同的耐旱性(第II類群,圖1)。同時,同一類群中可能在某些位點具有相近的遺傳基礎(chǔ),但由于其他位點遺傳基礎(chǔ)不同,因而同一類群中的不同種質(zhì)也有可能表現(xiàn)出不同的耐旱性(第II類群,圖1)。也有可能由于本文用于聚類的SSR引物數(shù)量偏少,導致未能將第II類群中種質(zhì)的遺傳基礎(chǔ)完全分開,因而出現(xiàn)了不同耐旱性的種質(zhì)聚在同一類群。
圖 1 56份綠豆基于SSR遺傳相似性的聚類圖Fig. 1 Dendrogram of 56 mung bean germplasms clustered by SSR genetic similarity
總之,本文采用綜合指標評價了56份綠豆種質(zhì)的萌發(fā)期耐旱性,鑒定出2份高耐種質(zhì),可以為綠豆耐旱育種提供資源。同時,也可為從分子水平解析綠豆萌發(fā)耐旱機制奠定基礎(chǔ)。