何家樂,吳幻,劉夢綺,李勁,姜博文,吳昊,楊洪巖
(東北林業(yè)大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,哈爾濱 150040)
酸菜是我國東北地區(qū)的傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜,傳統(tǒng)腌制方法是將新鮮白菜洗凈后,浸入裝有鹽水的陶缸中,碼至頂端后用腌菜石壓實,經(jīng)過30 d左右的自然發(fā)酵即可食用。隨著生活節(jié)奏的加快,酸菜傳統(tǒng)的小家小戶制作已經(jīng)逐漸向規(guī)?;?、商業(yè)化過渡。目前的商業(yè)化酸菜生產(chǎn)仍然主要依靠自然發(fā)酵,普遍存在發(fā)酵周期長和質(zhì)量不穩(wěn)定等問題[1]。
微生物是引起蔬菜發(fā)酵體系一系列物理化學(xué)變化的主要因素[2],控制發(fā)酵體系的微生物才能從根本上控制發(fā)酵周期和發(fā)酵產(chǎn)品質(zhì)量。在我們之前的研究中,已經(jīng)對酸菜發(fā)酵體系中的微生物進行了系統(tǒng)解析,結(jié)果顯示:在酸菜發(fā)酵體系中包含Acinetobactersp.,Pseudomonasfragi,Klebsiellasp.,Citrobactersp.,Betaproteobacteriasp.和乳酸菌等微生物種屬,Leuconostocmesenteroides,Lactobacilluscurvatus,L.plantarum和L.oligofermentans是發(fā)酵中的主體微生物[3]。通過研究發(fā)現(xiàn)接種Lactobacillus在發(fā)酵體系內(nèi)占據(jù)主導(dǎo),顯著加速發(fā)酵進程和提高發(fā)酵質(zhì)量[4-5]。
碳水化合物是所有活生物體中細(xì)胞碳和能量的主要來源。乳酸菌是酸菜發(fā)酵中的主要微生物[6],可以利用各種可溶性碳水化合物作為底物生產(chǎn)有機酸。因此,添加碳水化合物有利于乳酸菌的生長。在制作酸菜時,當(dāng)乳酸菌接種劑不易獲得時,經(jīng)驗上會向發(fā)酵體系內(nèi)添加糖,以營造利于酸菜本源乳酸菌生長的環(huán)境,從而加速發(fā)酵進程,然而加糖對發(fā)酵體系理化及微生物產(chǎn)生的影響尚不明確。在本研究中,為了明確在酸菜發(fā)酵過程中添加糖對發(fā)酵體系的影響,設(shè)置不添加對照、添加蔗糖處理和添加乳酸菌3個處理,通過對發(fā)酵體系理化及微生物學(xué)特征的研究明確加糖對發(fā)酵體系的影響,為酸菜的規(guī)?;a(chǎn)提供了技術(shù)指導(dǎo)。
白菜發(fā)酵參照參考文獻[5]所描述的方法。簡要描述如下:收獲白菜,風(fēng)干萎蔫2 d,修剪、清洗后層層碼入250 L陶缸中,然后用腌菜石壓實,鹽與糖或菌劑隨水加入陶缸中,鹽的添加比例為總白菜重的1%(W/W),糖的添加比例為總白菜重的0.5%(W/W)。對于乳酸菌接種處理,根據(jù)課題組前期的研究成果,選用Lactobacilluscurvatus與Lactobacillusoligofermentans混合接種劑處理。兩菌株在優(yōu)勢培養(yǎng)基上培養(yǎng)24 h(OD600=1.5)后,以5800×g離心3 min,除去上清液后,將細(xì)胞重懸于無菌蒸餾水中,并以3∶1的比例混合。接種率為1×106菌落形成單位(CFU)/g新鮮白菜。所有處理設(shè)3次重復(fù),于18 ℃下發(fā)酵30 d,分別在發(fā)酵的第0,6,12,18,24,30天進行采樣。
在每個取樣時間點,從陶缸表面下第3層取出白菜,用榨汁機勻漿后取汁液約0.5 mL用于微生物菌落計數(shù);取30 mL于4 ℃下5800×g離心10 min后,將所得沉淀重懸于2 mL提取緩沖液(10 mmol/L Tris-HCl和40 mmol/L EDTA,pH 9.0)中。將每處理3個重復(fù)樣品合于一管,凍存于-20 ℃用于DNA提取及后續(xù)高通量測序分析。離心所得上清液(0.7 mL)加入0.3 mL乙腈(高效液相色譜(HPLC)級,Dikma,加利福尼亞州萊克福里斯特,美國),渦旋后,靜置10 min,隨后10800×g離心10 min,用0.22 μm過濾器過濾,上清液保存在-20 ℃,用于HPLC分析。取白菜由外向內(nèi)數(shù)第二層葉片,于105 ℃烘干粉碎過2 mm目篩,用于可溶性糖(WSC)的測定。
乳酸菌和一般細(xì)菌菌落計數(shù)采用平板稀釋法。乳酸菌在MRS[7]瓊脂上30 ℃培養(yǎng)2 d,其他一般細(xì)菌在營養(yǎng)瓊脂上在37 ℃培養(yǎng)2 d。使用pH計(B-212,Horiba,Kyoto,日本)進行pH測量??扇苄蕴遣捎幂焱壬╗8]。有機酸采用高效液相色譜(HPLC)法(Waters,Milford,MA,美國)。使用高親和力陽離子交換柱(Aminex HPX-87H,300 mm×7.8 mm,Bio-Rad,Hercules,CA,美國)進行色譜分離。柱溫為40 ℃,流速為0.6 mL/min,流動相中的H2SO4濃度為5 mmol/L,所有樣品均運行30 min。使用R軟件進行統(tǒng)計分析。顯著性水平為p<0.05。
總DNA的提取采用試劑盒法(Omega,USA)。建庫引物選擇515F(5'-GTGCCAGCMGCCGCGG-3')和907R(5'-CCGTCAATTCMTTTRAGTTT-3')[9]。利用雙末端測序(Paired-End)法構(gòu)建小片段測序文庫,質(zhì)檢合格后用MiSeq Illumina測序平臺測序(美吉生物有限公司,上海,中國)。
使用QIIME處理和分析高通量測序數(shù)據(jù)?;赒IIME中的Uchime算法[10],使用Usearch刪除嵌合序列。按97%的序列相似性進行操作分類單元(OTU)劃分。使用QIIME軟件對樣本的Alpha多樣性指數(shù)(Ace,Chao 1,Shannon,Simpson和Coverage)進行分析。此外,使用R軟件的Vegan包進行了主成分分析。原始序列數(shù)據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫登錄號為SRX1078336。
本研究設(shè)置3個處理,無添加對照、添加蔗糖處理和添加乳酸菌處理。3個處理的pH動態(tài)見圖1。在發(fā)酵開始時,加糖和乳酸菌處理的pH值下降速度均快于對照(p<0.05)。從發(fā)酵的第6天起,加糖處理的pH低于對照的pH(p<0.05),并且在整個發(fā)酵期間均顯著低于其他處理(p<0.05)。
圖1 酸菜發(fā)酵pH動態(tài)Fig.1 The pH values' dynamic changes of sauerkraut during fermentation注:Control表示無添加對照;Sucrose表示加糖處理;Community表示加乳酸菌處理;字母不同代表顯著性不同(p<0.05)。
利用HPLC檢測到的乳酸、乙酸和丙酸動態(tài)見圖2。
圖2 酸菜發(fā)酵過程中的有機酸動態(tài)Fig.2 The organic acids' dynamic changes of sauerkraut during fermentation注:Control表示無添加對照;Sucrose表示加糖處理;Community表示加乳酸菌處理;字母不同代表顯著性不同(p<0.05)。A表示乳酸,B表示乙酸,C表示丙酸。
添加LAB處理乳酸水平最高。蔗糖添加處理中的乳酸水平高于對照,但低于乳酸菌接種處理(p<0.05)。在發(fā)酵的前12 d,對照中的乙酸水平最高,隨后是加糖處理(p<0.05)。乳酸菌接種處理中的乙酸水平在整個發(fā)酵期間最低。在本研究中還檢測到丙酸,隨著發(fā)酵的進行,丙酸的濃度增加。在第30天時,所有處理丙酸的濃度大于1.0 g/L。
使用平板稀釋法進行微生物菌落計數(shù),見圖3。在發(fā)酵的前12 d,乳酸菌增加明顯(p<0.05),此后各處理之間的乳酸菌變化不再顯著。在發(fā)酵的第6天,對照中的乳酸菌明顯少于其他處理(p<0.05)。在所有處理中,經(jīng)過18 d的發(fā)酵,一般細(xì)菌的數(shù)量均顯著減少(p<0.05)。直至第24天,所有處理的一般細(xì)菌數(shù)量沒有顯著差異。
圖3 酸菜發(fā)酵過程中的微生物菌落動態(tài)Fig.3 The microbial colonies' dynamic changes of sauerkraut during fermentation注:Control表示無添加對照;Sucrose表示加糖處理;Community表示加乳酸菌處理;字母不同代表顯著性不同(p<0.05)。A表示乳酸菌,B表示一般細(xì)菌。
發(fā)酵體系對可溶性糖(WSC)的消耗見圖4。在發(fā)酵的第6~30 d,可溶性糖的水平顯著下降,最明顯的變化發(fā)生在前18 d。添加乳酸菌處理的WSC下降最快(p<0.05)。在第30天時,WSC的濃度約為3.0 g/100 g干物質(zhì)。
圖4 酸菜發(fā)酵過程中的可溶性糖動態(tài)Fig.4 The soluble sugar's dynamic changes of sauerkraut during fermentation注:Control表示無添加對照;Sucrose表示加糖處理;Community表示加乳酸菌處理;字母不同代表顯著性不同(p<0.05)。WSC表示可溶性糖,DM表示干物質(zhì)。
通過高通量測序分析,總共獲得了247850個有效序列,每個樣品的平均值為16523(標(biāo)準(zhǔn)差=4616)。物種豐富度Alpha多樣性指數(shù)見表1。每種處理的生物分類組成見圖5(A為門水平,B為屬水平)。
表1 酸菜樣品OTU豐富度、樣品覆蓋度和多樣性指數(shù)Table 1 The OTU richness, sample coverage rates and diversity indexes of sauerkraut samples
圖5 細(xì)菌門水平、屬水平的群落組成多樣性Fig.5 The community composition diversity at phylum level and genus level注:未鑒定出的序列統(tǒng)一標(biāo)記為No_Rank;Control表示無添加對照;Sucrose表示加糖處理;Community表示加乳酸菌處理。
由圖5可知,在這3種處理中,檢測到的門包括Firmicutes,Proteobacteria,Bacteroidetes,Actinobacteria,Cyanobacteria,F(xiàn)usobacteria和Verrucomicrobia等。在所有處理中,F(xiàn)irmicutes和Proteobacteria占據(jù)優(yōu)勢。在乳酸菌接種處理中,厚壁菌門優(yōu)勢最為明顯。
在屬水平上,主要檢測到Lactobacillus,Lactococcus,Enterobacter,Pseudomonas,Leuconostoc,Enterobacteriaceae_unclassified,Acinetobacter和Arcobacter。在對照中,Lactobacillus,Lactococcus,Pseudomonas,Leuconostoc和Enterobacteriaceae是主要菌屬;在乳酸菌接種處理中,Lactobacillus占據(jù)絕對優(yōu)勢。在對照處理中,在發(fā)酵的第30天,Lactococcus的最高比例達到29.7%,在發(fā)酵的第18天,Lactobacillus的最高比例達到45.9%。在發(fā)酵的第12天,Leuconostoc的最高相對含量達4.6%。在乳酸菌接種處理中,在發(fā)酵的第12天,Lactobacillus的相對豐度達到66.4%,之后Lactobacillus的比例達到≥80%以上。
在糖添加處理中,Lactobacillus的相對豐度在發(fā)酵過程中不斷增加。在發(fā)酵的第30天,Lactobacillus的相對豐度從第6天的13.8%增加到54.7%。在發(fā)酵的前18 d,Lactococcus的比例持續(xù)增加,最大值達到22.9%,在發(fā)酵第30天比例下降到9.9%。在加糖處理中,Enterobacter比例比其他處理高,在發(fā)酵第6天的相對豐度為39.3%,在發(fā)酵第30天其相對豐度為14.1%。加糖處理中Leuconostoc的比例也是所有處理中最高的,其最大值為12.7%。
通過PCA分析,比較了3個處理中15個樣品的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu),見圖6。
圖6 酸菜樣品發(fā)酵過程中的細(xì)菌群落主成分分析Fig.6 The principal component analysis of bacterial colonies of sauerkraut samples during fermentation注:Control表示無添加對照;Sucrose表示加糖處理;Community表示加乳酸菌處理。
由圖6可知,無添加處理和乳酸菌接種處理在PC1軸分開,說明接種微生物可以解釋兩處理菌落組成不同的54.08%;加糖處理與對照處理在PC2軸分開,說明加糖處理可以解釋兩處理微生物群落結(jié)構(gòu)差異的21.39%;除第6天樣品外,接種處理與加糖處理在PC2軸分開,表明接種和加糖處理對于發(fā)酵后期微生物結(jié)構(gòu)的影響更為顯著。
由于地域和季節(jié)不同,世界各地生產(chǎn)的發(fā)酵蔬菜的種類也存在很大差異,但發(fā)酵作為蔬菜的保藏方式由來已久[11]。與其他類型的發(fā)酵食品一樣,發(fā)酵蔬菜內(nèi)含有各種微生物,乳酸菌在整個發(fā)酵過程中起著主導(dǎo)作用。它們代謝原材料的化學(xué)成分,以改善風(fēng)味和材料質(zhì)地并幫助提高消化率。此外,乳酸菌還可以產(chǎn)生抑菌化合物從而顯示益生特性[12]。我們以前的研究顯示,在傳統(tǒng)自然發(fā)酵過程中,pH值和可溶性糖含量的下降主要發(fā)生在發(fā)酵的前12 d,乳酸積累主要發(fā)生在前18 d,在第12天觀察到乙酸濃度的增加。在本研究中,對照的發(fā)酵是自發(fā)的,其發(fā)酵的理化變化與先前的研究一致。然而,與對照相比,其他兩種處理的理化變化更為劇烈。蔬菜發(fā)酵過程中發(fā)生的物理化學(xué)變化是由微生物變化引起的[13],所以不同處理理化變化不同的結(jié)果表明添加乳酸菌或蔗糖會顯著影響微生物的代謝能力及水平。
基于傳統(tǒng)分離培養(yǎng)技術(shù)鑒定微生物多樣性存在很多局限,從樣品中直接提取核酸后進行高通量測序已經(jīng)成為分析自然生態(tài)系統(tǒng)中微生物多樣性的重要工具[14]。在本研究中,通過高通量測序分析了酸菜中細(xì)菌群落的多樣性。在門的水平上,主要包括Firmicutes,Proteobacteria,Bacteroidetes,Actinobacteria,Cyanobacteria,F(xiàn)usobacteria和Verrucomicrobia等(見圖5)。通常在水果、蔬菜和發(fā)酵乳中檢測到Firmicutes,Proteobacteria,Bacteroidetes和Actinobacteria等[15-16],而Cyanobacteria和Fusobacteria在海草、植物的根系中多有發(fā)現(xiàn)[17],Verrucomicrobia在瘤胃中更為常見[18-19],這些結(jié)果說明酸菜發(fā)酵體系中微生物群落多樣性豐富。在屬水平上,檢測到了Lactobacillus,Lactococcus,Enterobacter,Pseudomonas,Leuconostoc,Enterobacteriaceae_unclassified,Acinetobacter和Arcobacter等,該結(jié)果與我們先前對自發(fā)酸菜發(fā)酵過程中細(xì)菌屬的研究一致。在較低水平檢測到的其他屬包括Weissella,Aeromonas,Comamonas,Saccharibacillus,Shewanella,Kluyvera,F(xiàn)lavobacterium,Chryseobacterium,Janthinbacterium,Aquabacterium和Rhodococcus。
在蔬菜和水果的發(fā)酵過程中,控制乳酸發(fā)酵的方法主要有兩種:使用本源或異源發(fā)酵劑。從水果和蔬菜附著的本源微生物中選擇發(fā)酵菌種更值得推薦,因為本源菌在延長保質(zhì)期、改善制品營養(yǎng)和感官特性方面更具有優(yōu)勢[20]。本研究中所用的乳酸菌接種劑來源于酸菜本身。接種后,可以迅速在發(fā)酵體系內(nèi)定殖,使Lactobacillus成為最主要屬。
每個植物物種都有特定優(yōu)勢和恒定的微生物群[21]。乳酸菌是蔬菜原材料上的本源菌群的一小部分(2.0~4.0 log CFU/g)[22]。已從不同類型的蔬菜中鑒定到Leuconostoc,Lactobacillus,Weissella,Enterococcus和Pediococcus等異型發(fā)酵和同型發(fā)酵種。當(dāng)條件合適時,新鮮蔬菜可能會自發(fā)進行乳酸發(fā)酵。對于酸菜發(fā)酵,主要的微生物是乳酸菌。乳酸發(fā)酵的底物是WSC,葡萄糖、果糖和蔗糖是其中的典型代表[23]。在本研究中,我們將蔗糖添加到發(fā)酵系統(tǒng)中以觀察其對微生物群落的影響。在添加蔗糖處理中,各種細(xì)菌屬的相對豐度與對照相比顯著不同。Lactobacillus的相對豐度在整個發(fā)酵過程中持續(xù)增加,在第30天約占細(xì)菌總數(shù)的54.7%。Lactococcus,Enterobacter,Leuconostoc特別是Enterobacter顯著增加,腸桿菌屬兼性厭氧菌,在發(fā)酵開始時即已啟動。腸細(xì)菌種類的相對豐度在第6天最高(39.3%,見圖5),但到第30天已開始下降(相對豐度為14.1%)。已有研究表明,未加工的蔬菜中可能存在凝固酶陽性葡萄球菌和其他腸細(xì)菌,其細(xì)胞密度低,由于面臨微生物競爭而使生長受到抑制,在某些特殊情況下可能致病[24]。因此綜合本研究結(jié)果,加糖與添加乳酸菌兩種處理比較,接種乳酸菌可以更好地控制酸菜發(fā)酵,獲得相對更安全的酸菜產(chǎn)品。
在本研究中,為了明確加糖對酸菜發(fā)酵效果的影響,將乳酸菌或蔗糖添加到發(fā)酵體系中,分析發(fā)酵體系的理化及微生物動態(tài)。從理化指標(biāo)來看,添加乳酸菌或蔗糖可以更快地降低發(fā)酵系統(tǒng)的pH。接種乳酸菌處理乳酸的濃度更高。微生物分析表明,乳酸菌接種劑可以在發(fā)酵系統(tǒng)中棲息并占主導(dǎo)地位。蔗糖的添加一定程度上支持腸桿菌的生長,加糖與加乳酸菌比較,接種乳酸菌更有利。本研究結(jié)果為東北酸菜生產(chǎn)的規(guī)模化、規(guī)范化提供了技術(shù)參考。