張 靜,熊 鳴,李小娟,馬 偉,張達(dá)矜,喬媛媛
食管癌是常見的消化道腫瘤,全世界每年有30萬人死于食管癌。我國食管癌的發(fā)病率和死亡率也較高。由于早期食管癌缺乏臨床癥狀并且特異性診斷標(biāo)志也不明確,多數(shù)患者確診時(shí)已為中晚期,導(dǎo)致治療效果較差,5年生存率低于10%[1]。大量研究表明,循環(huán)腫瘤細(xì)胞(circulating tumor cells,CTCs)可作為監(jiān)測腫瘤生物學(xué)改變及復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的指標(biāo),實(shí)時(shí)監(jiān)測指導(dǎo)腫瘤的進(jìn)展、治療及其預(yù)后評(píng)估[2,3]。噬菌體抗體庫的篩選是獲得人源單鏈抗體的重要策略[4]。利用噬菌體技術(shù)篩選純蛋白、完整細(xì)胞的特異性抗體都有相關(guān)報(bào)道[5]。本課題前期應(yīng)用噬菌體展示技術(shù),針對(duì)完整腫瘤細(xì)胞高通量篩選富集,獲得與腫瘤細(xì)胞表面抗原結(jié)合的單鏈?zhǔn)删w抗體,這些抗原可能成為腫瘤的靶點(diǎn),以期為食管癌的診斷和預(yù)后提供更多的生物標(biāo)志[6]。斑馬魚是基因和發(fā)育等方面研究的熱門模式動(dòng)物,可用來進(jìn)行腫瘤監(jiān)測和藥物代謝等方面的研究。具有實(shí)驗(yàn)費(fèi)用相對(duì)低、周期短、通量高等優(yōu)勢(shì),因此本研究應(yīng)用斑馬魚模型進(jìn)行體內(nèi)抗體與移植瘤聚集的示蹤觀察鑒定[7],根據(jù)小分子抗體在動(dòng)物體內(nèi)與食管癌移植瘤的結(jié)合情況,從而確定篩選的腫瘤細(xì)胞抗體能否用于食管癌患者外周血CTCs的檢測。同時(shí)課題組采用高通量蛋白質(zhì)組芯片HuProtTM對(duì)小分子抗體可能結(jié)合的抗原蛋白表達(dá)譜進(jìn)行篩選和探討,以期得到更準(zhǔn)確的抗原種類,篩選出更多的標(biāo)志物用于腫瘤的早期診斷。
1.1 儀器與試劑 基于HuProtTM人類蛋白質(zhì)組芯片(廣州博翀生物科技有限公司提供);磁場磁性細(xì)胞分離架/器MACS MultiStand(Miltenyi Biotec產(chǎn)品,Bergisch Gladbach,Germany);抗CD45抗原磁珠,F(xiàn)ITC-抗CK8/18/19、PE-抗CD45購自Miltenyi Biotec公司(Bergisch Gladbach, Germany),細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶2抗體(4A Biotech),16%多聚甲醛,甲基纖維素,Triton-100購自Amersco Inc(Solon,OH,USA); Tris,6孔板(Fisher Scientific,China);1640培養(yǎng)液,胎牛血清,玻片購自Thermo Fisher Scientific公司(Troy,MI, USA); DAPI、BSA(St Louis,MI, USA);枸櫞酸抗凝血采血管(ACD)購自BD公司(NJ, USA)。
1.2 斑馬魚移植瘤模型建立 野生型AB品系斑馬魚,以自然成對(duì)交配繁殖方式進(jìn)行。受精后2 d齡,飼養(yǎng)于28 ℃的養(yǎng)魚用水中,實(shí)驗(yàn)動(dòng)物使用許可證號(hào):SYXK(浙)2012-0171。飼養(yǎng)管理符合國際AAALAC認(rèn)證。紅色熒光染料(CM-DiI)標(biāo)記人食管癌細(xì)胞KYSE-170或KYSE-180,以顯微注射的方式移植到斑馬魚卵黃囊內(nèi),建立斑馬魚人食管癌移植瘤模型。
1.3 熒光標(biāo)記的小分子抗體與斑馬魚移植瘤聚集示蹤 實(shí)驗(yàn)組30尾斑馬魚,設(shè)置空白對(duì)照組,陰性對(duì)照組,分別靜脈注射不同濃度抗體、陰性對(duì)照抗體等。標(biāo)記綠色熒光Alexa 488的抗體“488-NFC-20b”和“488-NFC-70a”稀釋不同濃度0.11C、0.33C和1.00C,分別注射到斑馬魚靜脈中,陰性對(duì)照組同時(shí)注射不同濃度的“iF488-OA”,每尾注射量為10 nl;注射后利用熒光顯微鏡觀察小分子抗體在斑馬魚體內(nèi)的示蹤。通過熒光強(qiáng)度、融合情況等評(píng)價(jià)抗體與斑馬魚體內(nèi)食管癌細(xì)胞的聚集效應(yīng)。
1.4 外周血采集 采集5例食管癌患者的外周血,每例7.5 ml,備用。
1.5 基于HuProtTM人類蛋白芯片的蛋白-蛋白互作鑒定抗體 采用HuProtTM蛋白質(zhì)芯片對(duì)NFC20b和NFC70a兩個(gè)抗體所結(jié)合的抗原種類進(jìn)行鑒定。將標(biāo)記熒光小分子抗體滴加在蛋白芯片上,使其與固定于芯片上的蛋白充分結(jié)合,清洗去除未結(jié)合的抗體。加入熒光標(biāo)記的二抗(Cy3-anti-mouse IgG)37 ℃孵育,對(duì)熒光信號(hào)的掃描,根據(jù)熒光信號(hào)的親和力強(qiáng)弱、數(shù)量判讀陽性結(jié)果。
1.6 采用ELISA方法對(duì)抗原進(jìn)行驗(yàn)證 分析蛋白芯片的結(jié)果,匹配NFC20b和NFC70a相關(guān)的抗原蛋白表達(dá)譜,用細(xì)胞ELISA法進(jìn)行驗(yàn)證。培養(yǎng)KYSE-170、KYSE-180細(xì)胞,傳代后接種培養(yǎng)板, 1h后離心棄上清,室溫放置至細(xì)胞干燥;加入4%多聚甲醛固定40 min后, Triton-100細(xì)胞打孔備用。將抗細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶2(CDK2)抗體1∶200稀釋,加入細(xì)胞板中,孵育洗滌后,加入HRP標(biāo)記的二抗(1∶1000稀釋),再次孵育洗滌,加入OPD底物液顯色,1mol/L H2SO4終止,讀取A490值。陰性對(duì)照為抗OA抗體,空白對(duì)照為PBS。
2.1 對(duì)斑馬魚體內(nèi)食管癌KYSE-170細(xì)胞移植瘤聚集效應(yīng)評(píng)價(jià) 標(biāo)記了紅色熒光的食管癌KYSE170細(xì)胞注射到斑馬魚卵黃囊中,形成移植瘤見圖1A, “488-NFC-20b”和“488-NFC-70a”在1 g/L濃度時(shí),從4 h起至24 h,背主動(dòng)脈、尾動(dòng)脈和尾靜脈中均能觀察到抗體的分布;同時(shí),“488-NFC-20b”和“488-NFC-70a”在0.11 g/L、0.33 g/L和1.00 g/L濃度,從注射后4 h起,均能觀察到卵黃囊中抗體與腫瘤細(xì)胞結(jié)合,其中488-NFC-70a抗體在9 h結(jié)合活性最高。表明兩個(gè)小分子抗體可以通過血液循環(huán)分布到卵黃囊,對(duì)卵黃囊中的食管癌細(xì)胞有明顯的結(jié)合聚集效應(yīng)。而陰性對(duì)照品“iF488-OA”在各時(shí)間點(diǎn)與腫瘤細(xì)胞結(jié)合均不明顯。圖1顯示的是兩個(gè)小分子抗體在1g/L濃度下與食管癌KYSE-170移植瘤的不同時(shí)間點(diǎn)的聚集效應(yīng)。
圖1 488標(biāo)記抗體對(duì)KYSE-170腫瘤細(xì)胞聚集效應(yīng)
2.2 對(duì)斑馬魚體內(nèi)食管癌KYSE-180細(xì)胞移植瘤聚集效應(yīng)評(píng)價(jià) 標(biāo)記了紅色熒光的食管癌KYSE-180細(xì)胞注射到斑馬魚卵黃囊中,形成移植瘤。同2.1結(jié)果,圖2顯示 “488-NFC-20b”和“488-NFC-70a”小分子抗體在1 g/L濃度下與食管癌KYSE-180移植瘤的不同時(shí)間點(diǎn)的結(jié)合聚集效應(yīng)。
圖2 488標(biāo)記抗體對(duì)KYSE-180腫瘤細(xì)胞聚集效應(yīng)
2.3 抗體檢測食管癌患者外周血CTCs 采用Miltenyi免疫磁珠對(duì)5例食管癌患者的外周血進(jìn)行負(fù)性富集分離,用Alexa 488標(biāo)記的NFC20b抗體鑒定CTCs。檢測出3例患者外周血有CTCs,檢測率為60%。本研究所用抗體能夠與食管癌患者CTCs結(jié)合,呈現(xiàn)綠色熒光,而白細(xì)胞表面抗原CD45染色陰性,核染色DAPI陽性(圖3)。
圖3 食管癌患者外周血CTCs的檢測(×400)
2.4 基于HuProtTM蛋白芯片利用蛋白-蛋白相互作用鑒定單鏈抗體 利用高通量蛋白芯片實(shí)驗(yàn)篩選小分子抗體的抗原表達(dá)譜,根據(jù)實(shí)驗(yàn)具體情況,通過設(shè)置cutoff閾值來確定陽性蛋白,定義cutoff=2,即SNR>2為陽性蛋白。本次共篩選出與NFC20b抗體所結(jié)合陽性蛋白23個(gè)、NFC70a所結(jié)合的陽性蛋白28個(gè)。
2.5 初步驗(yàn)證蛋白芯片結(jié)果 采用ELISA法結(jié)果發(fā)現(xiàn),KYSE-170、KYSE-180細(xì)胞能夠與CDK2(0.89±0.06;0.68±0.04)抗體有效結(jié)合,而與卵清蛋白結(jié)合很低(0.06±0.00;0.04±0.01),兩者與食管癌細(xì)胞結(jié)合活性對(duì)比,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。
斑馬魚與人類基因同源性較高,具有繁殖能力強(qiáng)、體外受精發(fā)育、胚胎透明、成熟周期較短、個(gè)體小、能在顯微鏡下實(shí)時(shí)觀察等諸多優(yōu)勢(shì),廣泛用于人類疾病模型的建立、新藥研發(fā)和藥物的篩選等方面。近年來,斑馬魚腫瘤移植模型已應(yīng)用于腫瘤細(xì)胞遷移相關(guān)基因功能的研究與抗腫瘤藥物的篩選,可在短時(shí)間為患者提供精準(zhǔn)的個(gè)體化治療信息。有學(xué)者在胃癌等細(xì)胞株構(gòu)建模型用于腫瘤藥物開發(fā)及臨床前藥物篩選的研究中發(fā)現(xiàn),通過斑馬魚可直接觀察抗癌藥物對(duì)腫瘤細(xì)胞的影響,作為臨床實(shí)驗(yàn)的初始篩選藥物并制定個(gè)體化治療方案的依據(jù),為精準(zhǔn)腫瘤學(xué)的發(fā)展提供有效平臺(tái)[8,9]。
本研究基于人源噬菌體抗體庫篩選得到食管癌細(xì)胞相關(guān)抗原的噬菌體抗體技術(shù),改造其中2株抗體NFC20b和NFC70a,進(jìn)行載體構(gòu)建,進(jìn)行原核細(xì)胞內(nèi)抗體重組蛋白的表達(dá)。綜合包涵體變性、復(fù)性、純化等步驟,得到有生物活性的小分子抗體。小分子抗體標(biāo)記熒光后,在斑馬魚體內(nèi)進(jìn)行抗體與移植瘤聚集的示蹤[7,10],觀察此前篩選的小分子抗體在斑馬魚體內(nèi)與食管癌移植瘤結(jié)合情況,確定本研究篩選的腫瘤細(xì)胞抗體在食管癌患者外周血CTCs的應(yīng)用基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)組芯片具有高通量、并行、快速分析的優(yōu)勢(shì),在系統(tǒng)生物學(xué)研究中發(fā)揮著越來越重要的作用,適用于以蛋白質(zhì)相互作用為基礎(chǔ)的各種研究領(lǐng)域,在小分子藥物靶向鑒定、單克隆抗體特異性篩選及自身抗體類標(biāo)志物的篩選等方面應(yīng)用廣泛[11]。本研究為了更好地開發(fā)抗體應(yīng)用,采用HuProtTM人類蛋白質(zhì)組芯片對(duì)小分子抗體所作用的靶蛋白進(jìn)行系統(tǒng)性篩選[12]。HuProtTM人類蛋白質(zhì)組芯片包含20,000個(gè)人源重組蛋白質(zhì)[13],是目前世界上通量最高的蛋白質(zhì)芯片,適用于全局性地進(jìn)行蛋白-蛋白互作、蛋白-核酸互作、蛋白-小分子互作及蛋白翻譯后修飾研究,借助此蛋白質(zhì)組芯片技術(shù),深入探討這兩個(gè)分子的作用。
經(jīng)過對(duì)蛋白功能作用的分析,初步錨定細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶2(CDK2)為其中一個(gè)抗體NFC20b所結(jié)合的抗原,為其應(yīng)用到食管癌檢出和治療中提供依據(jù)。CDK2是細(xì)胞周期相關(guān)蛋白,細(xì)胞周期網(wǎng)絡(luò)的異常與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),CDKs的異常表達(dá)使細(xì)胞周期紊亂、細(xì)胞增殖失控,最終發(fā)生癌變。很多腫瘤細(xì)胞系及胃癌、乳腺癌等腫瘤組織中都有CDK基因的擴(kuò)增、突變和高表達(dá)[14,15]。以CDK為中心的細(xì)胞周期調(diào)控這一領(lǐng)域已成為細(xì)胞生物學(xué)和腫瘤生物學(xué)研究的熱點(diǎn)。通過比較分析確定篩選得到的蛋白的可信性。
綜上所述,本研究探索了一套尋找腫瘤標(biāo)志物的方法,從大容量抗體庫中篩選抗體,應(yīng)用斑馬魚移植瘤模型對(duì)小分子抗體進(jìn)行動(dòng)物體內(nèi)結(jié)合活性的驗(yàn)證,并用蛋白質(zhì)芯片技術(shù)對(duì)其抗原篩選鑒定,得到與抗體直接相互作用的關(guān)鍵蛋白質(zhì),旨在從高通量篩選的新技術(shù)中尋找食管癌的標(biāo)志物和藥物作用靶點(diǎn),為食管癌的臨床診斷、預(yù)后監(jiān)測及相關(guān)靶向藥物開發(fā)提供了一定的思路[16,17]。下一步,將為其他小分子靶蛋白的發(fā)現(xiàn)提供更多的研究路線,為食管癌及其他實(shí)體瘤的檢測及治療方面的應(yīng)用研究奠定基礎(chǔ)。