丁喜艷,王成虎,曹?chē)?guó)凡,蔣 沁,姚 進(jìn)
南京醫(yī)科大學(xué)附屬眼科醫(yī)院青光眼科,江蘇 南京 210029
青光眼是世界范圍內(nèi)導(dǎo)致失明的主要原因,原發(fā)性開(kāi)角型青光眼(primary open angle glaucoma,POAG)是最常見(jiàn)的開(kāi)角型青光眼[1-2],占全部病例的一半以上。遺傳因素在POAG的發(fā)病中起主要作用[3],目前已明確小梁網(wǎng)誘導(dǎo)性糖皮質(zhì)激素反應(yīng)蛋白(myocilin,MYOC)基因主要與青少年開(kāi)角型青光眼(juvenile-onset open-angle glaucoma,JOAG)相關(guān),在JOAG家系中占36%,而在散發(fā)性POAG患者中只有2%~4%[4]。近十年來(lái)國(guó)內(nèi)外共報(bào)道MYOC基因突變30余種,在西班牙、南非、日本和高加索地區(qū)均有報(bào)道[5-8]。為探索江蘇南京地區(qū)MYOC突變,我們對(duì)江蘇南京地區(qū)1個(gè)6代POAG家系進(jìn)行測(cè)序和生物信息學(xué)及系譜分析,探討此家系中MYOC基因突變與POAG發(fā)病的關(guān)系,確定該家系的致病基因,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。
來(lái)自南京醫(yī)科大學(xué)附屬眼科醫(yī)院確診的南京市1個(gè)6代原發(fā)性開(kāi)角型青光眼家系,共55人,參加本研究的共3代27人(圖1)。POAG診斷標(biāo)準(zhǔn)(參照中華醫(yī)學(xué)會(huì)眼科學(xué)分會(huì)青光眼學(xué)組推薦標(biāo)準(zhǔn)):①青光眼的特征性損害,視網(wǎng)膜神經(jīng)纖維層缺損或視盤(pán)形態(tài)改變和/或視野出現(xiàn)青光眼性損害;②病理性高眼壓,眼壓>21 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa);③前房角開(kāi)放;④排除引起眼壓升高的其他因素,如眼外傷、葡萄膜炎、激素性青光眼、虹膜新生血管性青光眼等繼發(fā)性青光眼。如果雙眼眼壓>22 mmHg,但無(wú)特征性視盤(pán)損害或視野損害的受試者被診斷為高眼壓癥(ocular hypertension,OHT)。正常對(duì)照組為100例健康人,均排除青光眼及其他相關(guān)性遺傳性疾病。對(duì)所有參與研究的家系成員均行全面的眼科檢查,包括視力、眼壓、裂隙燈顯微鏡、房角、眼底、視野、視神經(jīng)纖維層厚度分析。該研究方案經(jīng)南京醫(yī)科大學(xué)附屬眼科醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(2019006號(hào)),根據(jù)“赫爾辛基宣言”的原則,在解釋了研究的性質(zhì)和可能的后果后,從研究對(duì)象那里獲得了知情同意,所有滿(mǎn)18周歲參與研究人員及未成年人監(jiān)護(hù)人均簽署知情同意書(shū)。
1.2.1 家系病歷采集
采用橫斷面研究方法,收集江蘇南京地區(qū)一POAG家系,從先證者出發(fā),追溯親緣關(guān)系,繪制家系圖譜,對(duì)發(fā)病者和未發(fā)病者進(jìn)行詳細(xì)的病史采集,包括既往史、治療史,對(duì)參與研究的家系成員進(jìn)行全面的眼科檢查,包括視力、眼壓、裂隙燈、裂隙燈下眼底檢查、視野、視神經(jīng)光學(xué)相干斷層掃描(optical coherence tomography,OCT)等檢查。
1.2.2 基因組提取
對(duì)參與研究的家系成員及正常對(duì)照組100例健康人采集外周靜脈血2~5 mL(EDTA抗凝)。使用血液基因組DNA提取試劑盒(北京康為世紀(jì)生物科技有限公司)提取樣本DNA,使用Nanodrop 2000對(duì)DNA進(jìn)行質(zhì)檢,質(zhì)檢合格后進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。
1.2.3 高通量測(cè)序
使用標(biāo)準(zhǔn)文庫(kù)構(gòu)建試劑盒(北京邁基諾自主研發(fā))進(jìn)行基因組文庫(kù)構(gòu)建。用Covaris-S220超聲波打斷儀將基因組DNA隨機(jī)打斷成100~700 bp的片段,末端修復(fù)加堿基A,與Illumina PE接頭寡核苷酸混合物連接,用磁珠法對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行純化。對(duì)純化產(chǎn)物進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),擴(kuò)增純化后得到DNA文庫(kù),使用Nanodrop 2000和瓊脂糖凝膠電泳對(duì)文庫(kù)進(jìn)行質(zhì)量檢測(cè)。
本研究采用目標(biāo)序列捕獲探針GenCap(北京邁基諾)對(duì)先證者已知的遺傳性青光眼疾病相關(guān)候選基因外顯子區(qū)域進(jìn)行捕獲。將構(gòu)建好的基因組文庫(kù)與經(jīng)過(guò)生物素標(biāo)記的目標(biāo)區(qū)域捕獲探針進(jìn)行雜交,用鏈霉親和素修飾的磁珠共價(jià)結(jié)合生物素標(biāo)記的探針,從而抓取目的基因,最后用磁力架吸附攜帶目的基因的磁珠,洗脫純化,富集目標(biāo)區(qū)域DNA片段。借助Illumina HiSeq X Ten測(cè)序儀對(duì)捕獲的外顯子區(qū)域進(jìn)行高通量測(cè)序。
1.2.4 生物信息學(xué)分析
將原始測(cè)序數(shù)據(jù)去除污染和接頭序列,然后利用BWA軟件將過(guò)濾后的序列與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)人類(lèi)基因組參考序列比對(duì)。利用GATK軟件分析得出單核苷酸變異(SNP)和插入缺失突變(INDEL)的相關(guān)信息。通過(guò)ANNOVAR軟件對(duì)所有的SNP和INDEL進(jìn)行注釋。篩選正常人數(shù)據(jù)庫(kù)中頻率小于0.05的突變位點(diǎn),正常人數(shù)據(jù)庫(kù)包括千人基因組計(jì)劃和EXAC等。錯(cuò)義突變使用REVEL、SIFT、PolyPhen-2、Mutation Taster和GERP++等軟件進(jìn)行致病性預(yù)測(cè)和保守性預(yù)測(cè),剪切位點(diǎn)的改變用SPIDEX等軟件分析其致病性。結(jié)合疾病遺傳模式和患者臨床表征進(jìn)行綜合分析,篩選出可疑候選變異。
1.2.5 Sanger測(cè)序驗(yàn)證候選致病基因
在除先證者以外參與研究的家系成員及對(duì)照組100例健康人中,利用PCR和Sanger測(cè)序驗(yàn)證經(jīng)分析篩選后,得到候選變異位點(diǎn)。利用Primer 3.0在線軟件設(shè)計(jì)PCR引物。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物使用3130XL測(cè)序儀進(jìn)行毛細(xì)管電泳測(cè)序并在ABI 3130 Genetic Analyzer上進(jìn)行分析。再將測(cè)序結(jié)果在家系成員中進(jìn)行共分離驗(yàn)證,觀察是否有與突變位點(diǎn)相一致的基因與表型共分離現(xiàn)象。
該P(yáng)OAG家系共6代55例成員(圖1),其中男27例,女28例。參加本研究的家系成員共3代27例,其中男15例,女12例(表1)。參與研究的家系成員中12例為POAG患者,3例為無(wú)癥狀攜帶者,12例為無(wú)明顯體征者,不存在性別差異,且疾病以垂直方式逐代遺傳,遺傳方式符合常染色體顯性遺傳。
2.2.1 Ⅱ2分支家系調(diào)查
Ⅱ2分支家系中,因Ⅲ1、Ⅲ2分支現(xiàn)定居于蘇州地區(qū),未能對(duì)其進(jìn)行臨床和實(shí)驗(yàn)室相關(guān)檢查,但電話聯(lián)系并結(jié)合其他近親屬提供的病史,此分支中Ⅲ1分支無(wú)青光眼患者,Ⅲ2、Ⅳ2系青光眼患者,Ⅴ2具體病史不詳。Ⅲ3分支中,已行手術(shù)治療3例(Ⅲ3、Ⅳ4、Ⅳ5),已行選擇性激光小梁成形術(shù)(selective laser trabeculoplasty,SLT)治療2例(Ⅳ6、Ⅴ4),所有手術(shù)及SLT治療患者術(shù)后眼壓均平穩(wěn),未行藥物控制眼壓。Ⅴ5未檢測(cè)到基因變異,Ⅴ6檢測(cè)出p.C245Y變異基因,由于其年齡較小,我們推測(cè)其將來(lái)有發(fā)展為開(kāi)角型青光眼的可能,需定期隨訪視力、眼壓、視野、視神經(jīng)纖維層厚度。Ⅲ4未行抗青光眼及任何激光治療,32歲確診為POAG時(shí)已雙眼失明,視力僅存眼前數(shù)指,后未采取手術(shù)治療,現(xiàn)長(zhǎng)期局部藥物控制眼壓,我們推測(cè)該患者發(fā)病年齡更早。Ⅳ831歲時(shí)已先后行雙眼抗青光眼手術(shù),現(xiàn)術(shù)后未用藥物,監(jiān)測(cè)眼壓穩(wěn)定。此分支家系中所有青光眼患者均檢測(cè)出p.C245Y變異基因,Ⅴ8檢測(cè)到變異,但因年幼,暫無(wú)明顯體征,仍需密切觀察。
2.2.2 Ⅱ3分支家系調(diào)查
此分支家系中POAG患者共8例(Ⅱ3、Ⅲ5、7、8、9、Ⅳ10、16、17)。先證者Ⅳ1721歲發(fā)病,手術(shù)時(shí)右眼視力喪失明顯,視野檢測(cè)不出,雙眼視神經(jīng)萎縮,杯盤(pán)比接近1.0,左眼視野缺損,雙眼視盤(pán)血管OCT,提示雙眼視盤(pán)神經(jīng)纖維層厚度較正常變薄,雙眼視盤(pán)周邊血流密度較正常降低(圖2)。其母Ⅲ8雙眼手術(shù)后16年,確診年齡為38歲。Ⅲ5雙眼手術(shù)后25年,具體發(fā)病年齡無(wú)法提供。Ⅳ10雙眼術(shù)后23年,可見(jiàn)結(jié)膜下功能性濾過(guò)泡(圖3)。Ⅲ6家系分支中無(wú)1例患者。Ⅲ7現(xiàn)年58歲,雙眼術(shù)后20年,其子Ⅳ16現(xiàn)年35歲,31歲時(shí)確診雙眼POAG,現(xiàn)藥物控制眼壓平穩(wěn)。Ⅲ930歲確診雙眼POAG,多藥聯(lián)合藥物控制眼壓不佳,2年前行雙眼抗青光眼手術(shù)治療,現(xiàn)術(shù)后單藥控制眼壓,隨訪眼壓穩(wěn)定。
圖1 POAG家系圖譜
表1 家系成員的基因型和臨床資料
2.3.1 MYOC基因突變C245Y
圖2 先證者視神經(jīng)血管OCT檢查
在先證者的DNA樣本中發(fā)現(xiàn)1個(gè)位于MYOC基因的第3外顯子雜合突變:734號(hào)核苷酸由鳥(niǎo)嘌呤G變?yōu)橄汆堰蔄(c.734G>A)的雜合突變,導(dǎo)致第245號(hào)氨基酸由半胱氨酸變?yōu)槔野彼幔╬.C245Y),見(jiàn)圖4。Sanger法對(duì)27例家系成員的DNA樣本測(cè)序,結(jié)果顯示該家系除先證者以外的11個(gè)家系成員患者中(Ⅲ3、4、5、8、9、Ⅳ4、5、6、8、10、Ⅴ4、6、8),MYOC基因第3外顯子均存在雜合突變c.734G>A(p.C245Y),而家系中表型正常者無(wú)此突變,符合家系共分離,故MYOC基因c.734G>A(p.C245Y)突變是該家系致病突變位點(diǎn),家系成員中所有突變攜帶者均為雜合子。
2.3.2 MYOC基因突變C245Y與臨床表型的關(guān)系
在15位攜帶該突變的家系成員中(表1),12例為POAG患者,男性6例,女性6例,年齡22~73歲(平均47.8歲)。確診年齡22~36歲,平均29.1歲,目前9例已行濾過(guò)手術(shù),2例已行SLT治療,1例藥物控制眼壓。無(wú)MYOC基因C245Y突變的家系成員臨床檢查均正常。
2.3.3 對(duì)照組人群MYOC基因突變C245Y篩選結(jié)果
在100例對(duì)照人群及家系成員中,未發(fā)現(xiàn)該突變攜帶者。
圖3 球結(jié)膜濾過(guò)泡
MYOC是位于染色體1q23~24上的一個(gè)編碼myoclin的第3外顯子基因,它在眼球的部分結(jié)構(gòu)中高度表達(dá),特別是小梁網(wǎng)結(jié)構(gòu),myoclin包含幾個(gè)功能結(jié)構(gòu)域,其中已有研究證實(shí)myoclin嗅素結(jié)構(gòu)域的突變會(huì)導(dǎo)致小梁網(wǎng)細(xì)胞損傷和功能障礙,從而導(dǎo)致房水流出受損和眼壓升高[5,7,9-10]。迄今發(fā)現(xiàn)至少有70多個(gè)MYOC基因突變位點(diǎn)與POAG發(fā)病有關(guān),且第3外顯子為突變熱點(diǎn)區(qū)域,約有80%以上突變位于第3外顯子[11-12]。
本研究采用目標(biāo)序列捕獲測(cè)序及一代測(cè)序家系驗(yàn)證的方法,對(duì)1個(gè)POAG家系進(jìn)行了分子遺傳學(xué)的研究,從圖1可以看出Ⅱ2、Ⅱ3分支中POAG的遺傳方式符合常染色體顯性遺傳,這與既往報(bào)道的MYOC基因突變所致青光眼的遺傳規(guī)律相同。除此之外此家系還有以下特點(diǎn):①此家系中MYOC基因C245Y突變與臨床表型有極強(qiáng)的相關(guān)性,參與本研究的受檢成員中,所有的青光眼患者都帶有此突變,而在無(wú)突變的家系成員中未發(fā)現(xiàn)青光眼患者及可疑者,說(shuō)明此突變與此家系中POAG的發(fā)生有非常緊密的聯(lián)系。②MYOC基因C245Y突變有很高的外顯率,在攜帶該突變的家系成員中年齡>22歲者全部患有青光眼,外顯率為100%,該家系中年幼的基因突變攜帶者極有可能隨著年齡的增長(zhǎng)在今后發(fā)病,應(yīng)當(dāng)定期隨訪。③正常對(duì)照組中未發(fā)現(xiàn)MYOC基因C245Y突變。
本研究中C245Y基因突變的臨床表型表現(xiàn)為混合年齡發(fā)病型POAG。myoclin基因突變可能導(dǎo)致JOAG或POAG[13],兩者除發(fā)病年齡不同外其余臨床表現(xiàn)相似。已有研究認(rèn)為發(fā)病年齡<35歲者為JOAG,發(fā)病年齡>35歲者為成年人型POAG[14],本研究參與研究的家系成員中POAG患者的發(fā)病年齡22~39歲不等,35歲以上3例,此3例(Ⅲ3、Ⅲ5、Ⅲ8)均為雙眼抗青光眼術(shù)后,均無(wú)法提供具體發(fā)病年齡,由于手術(shù)時(shí)視力均已損傷嚴(yán)重并已出現(xiàn)明顯的視神經(jīng)萎縮和視野缺損,我們推斷,此3例家系成員的發(fā)病年齡更早,其余9例發(fā)病年齡均在35歲以下,提示此家系MYOC基因突變所致的POAG大部分為青少年型,且已有研究證明第3外顯子的MYOC基因突變與青少年起病的POAG有相關(guān)性[4,15],本文研究結(jié)果與既往研究結(jié)果表現(xiàn)一致。
截至目前,被人類(lèi)基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)(HGMD)收錄的MYOC基因的致病突變位點(diǎn)已達(dá)146個(gè)(http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/gene.php?gene=PAX6),此前Fan等[4]曾報(bào)道此突變?yōu)镻OAG的致病突變,但由于報(bào)道中的家系小,患者相對(duì)較少,本研究中的家系分支廣,參與研究的患者較多,基因突變與POAG的致病關(guān)聯(lián)性明確,且為中國(guó)江蘇地區(qū)首次報(bào)道,本研究結(jié)果擴(kuò)大了中國(guó)江蘇地區(qū)MYOC基因的突變譜,為更好地診斷和治療POAG提供了理論依據(jù)。
基因突變導(dǎo)致的POAG需用分子生物學(xué)方法進(jìn)行確診,且POAG發(fā)病隱匿,早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療、降低致盲率仍然是個(gè)難題,且已有文獻(xiàn)證明,基因型和表型信息可能是預(yù)測(cè)疾病風(fēng)險(xiǎn)的有效價(jià)值來(lái)源[16],MYOC突變的基因篩查應(yīng)該集中在家族性而不是散發(fā)的POAG患者[17]。因此,通過(guò)家族史的詢(xún)問(wèn)可幫助我們確立高危人群以便進(jìn)行高效的突變篩查,對(duì)于突變陽(yáng)性的無(wú)癥狀人群應(yīng)持續(xù)追蹤觀察,以便早發(fā)現(xiàn)、早治療,降低致青光眼的致盲率,并為將來(lái)的基因分子治療等提供重要依據(jù)。
南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)2021年4期