鄧 威,孟 穎,王晨星,金齊堯,毛廣艷,李懷奇,葉金海
南京醫(yī)科大學(xué)口腔疾病研究江蘇省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南京醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院口腔頜面外科,江蘇 南京 210029
口腔鱗狀細(xì)胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)是人體最常見的6大惡性腫瘤之一,時(shí)至今日其發(fā)病率仍在上升[1-2]。OSCC具有侵襲性生長、局部浸潤及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、術(shù)后復(fù)發(fā)率高、預(yù)后差的特點(diǎn),并且通常在中晚期才被診斷[3-4]。OSCC預(yù)后較差主要是腫瘤耐藥、術(shù)后復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移所引起的,OSCC的診治對臨床醫(yī)生提出了巨大挑戰(zhàn)[5]。
微小RNA(miRNA)是一種18~25個(gè)核苷酸長度的非編碼RNA,miRNA可以通過互補(bǔ)相互作用結(jié)合其靶mRNA的3′非翻譯區(qū)(UTR),從而調(diào)節(jié)基因表達(dá)[6]。在人類癌癥研究中發(fā)現(xiàn)miRNA的失調(diào)[7],且miRNA的表達(dá)水平與癌癥的發(fā)展和進(jìn)程密切相關(guān),因此被認(rèn)為是診斷癌癥的預(yù)測性生物標(biāo)志物之一[8]。外泌體是直徑40~150 nm的細(xì)胞外囊泡,具有雙層脂質(zhì)的膜結(jié)構(gòu)[9],外泌體可以由多種體細(xì)胞分泌并廣泛存在于各種體液中,如尿液、血清、唾液等[10],外泌體可以介導(dǎo)細(xì)胞間mRNA和miRNA的傳遞,并且在受體細(xì)胞中產(chǎn)生相應(yīng)的作用[11]。研究表明,外泌體中的miRNA與其起源細(xì)胞中的miRNA類似,且外泌體可以保護(hù)其包含的miRNA免受RNase降解,使其穩(wěn)定存在于循環(huán)中,表明它們可能具有作為疾病診斷標(biāo)志物及預(yù)后評價(jià)的潛在價(jià)值[12-13]。因此,本實(shí)驗(yàn)通過檢測OSCC患者血清外泌體中miRNA的表達(dá)水平,期望找到與OSCC疾病進(jìn)展有關(guān)的外泌體miRNA,為抑制OSCC轉(zhuǎn)移和復(fù)發(fā)提供新途徑,以改善OSCC患者的生存率。
新鮮的OSCC患者血清樣本來源于南京醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院口腔頜面外科,常規(guī)病理結(jié)果均為OSCC,且手術(shù)前均未接受任何特殊的抗腫瘤治療。對照組血清樣本均從沒有腫瘤疾病的個(gè)體獲得。本研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn),所有參與研究者均知情同意。
HN6、CAL27、HEK293及HOEC細(xì)胞株均購自ATCC細(xì)胞庫,DMEM/F-12培養(yǎng)基、DMEM高糖培養(yǎng)基、青/鏈霉素雙抗、0.25%胰蛋白酶、1×PBS緩沖液(Gibco公司,美國),胎牛血清(Sciencell公司,美國),miDETECT A TrackTMmiRNA qRT-PCR Starter Kit、cel-miR-39-3p標(biāo)準(zhǔn)品及引物、hsa-miR-182-5p引物、U6引物(廣州市銳博生物科技有限公司),TRIzol(Invitrogen公司,美國),無水乙醇、三氯甲烷、異丙醇(上?;瘜W(xué)試劑有限公司),Dr.GenTLE?Precipitation Carrier(北京寶日醫(yī)生物技術(shù)有限公司),ExoQuick Exosome Precipitation Kit(SBI公司,美國),PKH67綠色熒光染料(Sigma公司,美國),超敏ECL發(fā)光液(江蘇新賽美生物科技有限公司),鼠抗人CD9單克隆抗體、兔抗人鈣聯(lián)蛋白(Calnexin)多克隆抗體(Abcam公司,美國),兔抗人腫瘤易感基因101蛋白(TSG101)單克隆抗體(GeneTex公司,美國),CCK-8檢測試劑盒(上海東仁化學(xué)科技有限公司),Cy3標(biāo)記的miR-182 antagomir(上海吉瑪基因公司)。
1.2.1 差異miRNA篩選
登陸TCGA網(wǎng)站https://cancergenome.nih.gov/,下載頭頸鱗癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)的569份miRNA-seq三級數(shù)據(jù),其中包括44例癌旁組織及525例癌組織。打開R軟件,edgeR包進(jìn)行差異分析,得到包括差異基因異常表達(dá)倍數(shù)(fold change,F(xiàn)C)及錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(false discovery rate,F(xiàn)DR)值的列表文件“diffmiSig.xls”,差異篩選的標(biāo)準(zhǔn)為|log2FC|>1、FDR=0.05。
1.2.2 血清樣本收集
采集空腹靜脈血液5 mL于血清分離膠試管中,然后在室溫下以3 000 r/min離心10 min。吸取上層血清,轉(zhuǎn)移分裝至滅菌EP管中,于-80 ℃冰箱中保存。其中OSCC患者組17例,男9例,女8例,年齡(59.5±10.4)歲;對照組18例,男8例,女10例,年齡(58.3±13.1)歲。兩組在年齡、性別組成上差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
1.2.3 細(xì)胞培養(yǎng)
OSCC細(xì)胞株HN6與CAL27使用含10%胎牛血清及1%青鏈霉素雙抗的DMEM/F-12培養(yǎng)基培養(yǎng),HEK293與正常人口腔上皮細(xì)胞HOEC使用含10%胎牛血清及1%雙抗的DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng),均培養(yǎng)于含5%CO2的37 ℃恒溫培養(yǎng)箱中。
1.2.4 外泌體提取
血清外泌體的提取采用美國SBI公司生產(chǎn)的ExoQuick試劑盒進(jìn)行提取,根據(jù)說明書,4 ℃解凍300 μL血清樣本,然后將血清樣本于4 ℃條件下3 000g離心15 min,棄去沉淀,吸取250 μL血清,加入63 μL ExoQuick試劑,上下顛倒EP管混勻,于4 ℃冰箱中靜置40 min后4 ℃條件下1 500g離心30 min,棄上清然后同等條件下離心5 min,移除殘留試劑,最后加入100 μL PBS緩沖液溶解沉淀。
HEK293細(xì)胞外泌體提取:將HEK293細(xì)胞培養(yǎng)至對數(shù)生長期,更換培養(yǎng)基(包含不含外泌體的10%胎牛血清,將胎牛血清以200 000g離心18 h以耗盡外泌體),繼續(xù)培養(yǎng)48 h收集上清液,參考Thery等[14]的方法進(jìn)行外泌體的提取,將上清液在4 ℃下以1 000g離心30 min,然后以10 000g離心60 min,去除死細(xì)胞和碎屑,然后使用L-80XP超速離心機(jī)(貝克曼)在4 ℃下以140 000g離心90 min。將沉淀重懸于PBS后,再以140 000g離心90 min。最后將外泌體沉淀物重懸于PBS中,使用BCA蛋白定量試劑盒進(jìn)行定量。
1.2.5 透射電鏡及納米粒子追蹤分析(nanoparticle tracking analyzer,NTA)
外泌體樣品用1%戊二醛固定,并用1%磷鎢酸染色,于透射電子顯微鏡下觀察外泌體并拍攝圖片。使用ZetaView系統(tǒng)(Particle Metrix)進(jìn)行NTA,追蹤懸浮在PBS中外泌體的布朗運(yùn)動,并且通過Stokes-Einstein方程生成尺寸分布數(shù)據(jù)。
1.2.6 Western blot實(shí)驗(yàn)
用RIPA裂解液提取細(xì)胞及外泌體總蛋白,將等量的蛋白質(zhì)樣品加樣并在十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行電泳(血清外泌體上樣量為70 μg,HEK293外泌體上樣量為20 μg),然后轉(zhuǎn)移到PVDF膜上。用5%的脫脂奶粉溶液封閉1 h,將膜與CD9抗體、TSG101抗體、Calnexin抗體一起在4 ℃下過夜,次日用TBST溶液洗滌3次,將膜在室溫下與二抗孵育1 h,再用TBST溶液洗滌3次。最后使用ECL發(fā)光試劑盒將蛋白條帶可視化。
1.2.7 RNA提取和RT-qPCR
采用TRIzol法提取細(xì)胞及外泌體總RNA,在提取血清外泌體總RNA時(shí)加入線蟲cel-miR-39-3p標(biāo)準(zhǔn)品作為外參,加入Dr.GenTLETMPrecipitation Carrier提高RNA的回收效率。使用Nanodrop2000檢測RNA純度和濃度。線蟲cel-miR-39-3p引物、hsamiR-182-5p引物、U6引物均購自廣州市銳博生物科技有限公司。采用加尾法試劑盒miDETECT A TrackTMmiRNA qRT-PCR Starter Kit進(jìn)行RT-qPCR檢測。檢測細(xì)胞中miR-182表達(dá)水平時(shí)以U6作為內(nèi)參,檢測血清外泌體miR-182表達(dá)水平時(shí)以cel-miR-39-3p作為參照基因,采用2-ΔΔCT法計(jì)算miR-182的相對表達(dá)量。ΔCT(細(xì)胞)=CTmiRNA-CTU6,ΔCT(外泌體)=CTmiRNA-CTcel-miR-39。
1.2.8 HEK293細(xì)胞外泌體加載miR-182 antagomir
miR-182 antagomir是miR-182的拮抗劑,在3′末端膽固醇基修飾,5′端使用紅色熒光Cy3標(biāo)記,并用2′Ome修飾。miR-182 antagomir上的膽固醇基可以與外泌體膜相結(jié)合從而加載到外泌體中。參考Zhang等[15]的研究,將100 nmol/L膽固醇綴合的miR-182 antagomir與200 μL PBS中的100 μg外泌體在37 ℃下孵育1 h,用PBS重懸外泌體在140 000g的條件下離心90 min后,將外泌體重懸并在使用前保存在-80 ℃。
1.2.9 熒光顯微鏡下觀察外泌體加載miR-182 antagomir
用250 μL的DiluentC液稀釋100 μL外泌體,加入1 μL的綠色熒光染料PKH67,室溫孵育4 min;然后加入500 μL含有1%牛血清白蛋白的PBS溶液防止過度染色,加入PBS稀釋外泌體,再通過140 000g離心90 min,收集外泌體并用PBS重懸,避光保存。在倒置熒光顯微鏡下觀察miR-182 antagomir是否加載到外泌體中。
1.2.10 CCK-8實(shí)驗(yàn)
將CAL27細(xì)胞接種于6孔板中(每孔2×105個(gè)細(xì)胞),待細(xì)胞貼壁后更換為含有加載miR-182 antagomir外泌體的培養(yǎng)基,對照組的外泌體加載NC(negative control,NC),培養(yǎng)48 h。將細(xì)胞消化離心計(jì)數(shù),接種于96孔板中,每孔2 000個(gè)細(xì)胞,每組設(shè)置3個(gè)復(fù)孔,37 ℃、5%CO2條件下培養(yǎng),分別在24、48、72 h時(shí),向每孔加入10 μL CCK-8溶液孵育2 h,用酶標(biāo)儀測定波長450 nm處的吸光度。
所有數(shù)據(jù)均用SPSS23.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,兩組間比較用t檢驗(yàn),P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
對TCGA數(shù)據(jù)庫中HNSCC樣本的miRNA測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),有155個(gè)miRNA在HNSCC癌組織中高表達(dá),107個(gè)在癌組織中低表達(dá)(圖1A)。Langevin等[16]培養(yǎng)了4種HNSCC細(xì)胞系和原代人牙齦上皮細(xì)胞,通過超速離心法分離出所培養(yǎng)的細(xì)胞上清液中的外泌體,并應(yīng)用miRNA測序來全面表征其miRNA含量,發(fā)現(xiàn)與正常的口腔上皮細(xì)胞外泌體相比,HNSCC細(xì)胞的外泌體miRNA含量存在巨大差異。我們將篩選出的差異miRNA與Langevin等的研究結(jié)果進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)miR-182與miR-93在HNSCC組織及4種HNSCC細(xì)胞系外泌體中均呈現(xiàn)出高表達(dá)狀態(tài)(表1)。本課題組先前研究發(fā)現(xiàn)miR-182在OSCC癌組織中顯著高表達(dá)(P<0.05),而miR-93在OSCC癌組織與癌旁組織中的表達(dá)水平無顯著性差異。因此我們選擇miR-182進(jìn)一步研究。
圖1 差異表達(dá)miRNA的篩選Figure 1 Screening of differentially expressed miRNAs
通過培養(yǎng)OSCC細(xì)胞株HN6、CAL27及人正??谇簧掀ぜ?xì)胞株HOEC,運(yùn)用qPCR檢測發(fā)現(xiàn)miR-182在OSCC細(xì)胞株HN6、CAL27中表達(dá)顯著上調(diào)(圖2)。
表1 miR-182與miR-93在頭頸鱗癌癌組織相對于癌旁組織的表達(dá)量Table 1 The expression levels of miR-182 and miR-93 in head and neck squamous cell carcinoma tissues relative to paracancer
圖2 miR-182在CAL27、HN6以及HOEC中的表達(dá)情況Figure 2 Expression of miR-182 in CAL27,HN6,and HOEC
運(yùn)用ExoQuick試劑盒從OSCC患者及正常人血清中提取外泌體,使用Western blot實(shí)驗(yàn)、透射電子顯微鏡和NTA表征外泌體。Western blot實(shí)驗(yàn)顯示血清外泌體組檢測到外泌體標(biāo)志性蛋白TSG101和CD9的表達(dá),而血清上清液中沒有檢測到兩者的表達(dá)(圖3A)。透射電子顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)有40~150 nm大小的囊泡樣結(jié)構(gòu)(圖3B)。NTA顯示外泌體樣本中顆粒物大小分布的峰值是105 nm,符合外泌體的粒徑分布特點(diǎn)(圖3C)。
圖3 血清外泌體鑒定Figure 3 Characterization of exosomes
使用ExoQuick試劑盒提取17例OSCC患者及18例正常人的血清外泌體。通過qPCR檢測發(fā)現(xiàn),OSCC患者血清外泌體內(nèi)miR-182的表達(dá)水平有升高趨勢,但與對照組無顯著性差異(P>0.05,圖4A),這可能與樣本量較少有關(guān),在病理上腫瘤浸潤深度>5 mm的患者血清外泌體內(nèi)miR-182含量相對于對照組有明顯升高(P<0.05,圖4B)。
運(yùn)用超速離心法從HEK293細(xì)胞上清液中提取外泌體。Western blot實(shí)驗(yàn)顯示外泌體組檢測到外泌體標(biāo)志性蛋白CD9和TSG101的表達(dá),而沒有檢測到胞漿蛋白Calnexin的表達(dá)(圖5A)。透射電子顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)有40~150 nm大小的囊泡樣結(jié)構(gòu)(圖5B)。NTA顯示外泌體樣本中顆粒物大小分布的峰值是98 nm,符合外泌體的粒徑分布特點(diǎn)(圖5C)。
圖4 miR-182在血清外泌體中的表達(dá)情況Figure 4 Expression of miR-182 in serum exosomes
使用共孵育的方法將Cy3標(biāo)記的miR-182 antagomir加載到外泌體中,倒置熒光顯微鏡下觀察發(fā)現(xiàn),紅色熒光Cy3標(biāo)記的miR-182 antagomir(圖6A)與綠色熒光PKH67標(biāo)記的外泌體(圖6B)兩者存在共標(biāo)記,呈黃色(圖6C),表明miR-182 antagomir加載到了外泌體中。
圖5 HEK293細(xì)胞外泌體鑒定Figure 5 Characterization of exosomes in HEK293
圖6 miR-182 antagomir有效加載到外泌體中(×400)Figure 6 Efficient loading of exosomes with miR-182 antagomir(×400)
將加載miR-182 antagomir的外泌體與CAL27細(xì)胞共培養(yǎng),通過CCK-8檢測發(fā)現(xiàn),48、72 h時(shí)CAL27細(xì)胞的增殖能力受到了明顯抑制(P<0.05,圖7)。
外泌體是由細(xì)胞分泌的小囊泡,目前其主要的分離方法有差速超速離心法、超濾法、聚合物沉淀法、微流控芯片分離法和免疫親和法等[17],ExoQuick試劑盒是由美國SBI公司生產(chǎn)的基于聚合物沉淀法的外泌體提取試劑盒,具有操作簡單、回收效率高和設(shè)備要求低等優(yōu)點(diǎn),適合小體積樣本的外泌體提取。超速離心法是外泌體分離使用最廣泛的方法,但是外泌體的回收效率相對較低[18-19],適用于體積較大外泌體含量較為豐富樣本的外泌體分離,我們采用這兩種方法分別對血清和HEK293細(xì)胞培養(yǎng)上清液中的外泌體進(jìn)行提取,并通過蛋白免疫印跡實(shí)驗(yàn)、TEM和NTA證明成功提取到了外泌體。
圖7 exo-miR-182 antagomir對CAL27細(xì)胞增殖的影響Figure 7 Effects of exo-miR-182 antagomir on the proliferation of CAL27 cells
有研究表明miR-182與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展有關(guān),如miR-182-5p上調(diào)作為前列腺癌、膀胱癌、胃癌和乳腺癌相關(guān)的致癌基因[20-24]。Guo等[25]研究發(fā)現(xiàn)miR-182-5p通過靶向MTSS1基因調(diào)節(jié)OSCC遷移和侵襲,當(dāng)OSCC分化程度較低,T和N分期較高時(shí)miR-182-5p表達(dá)的增加更為顯著。本研究發(fā)現(xiàn)當(dāng)OSCC患者腫瘤浸潤深度>5 mm時(shí),患者血清外泌體內(nèi)miR-182含量相對于正常人有明顯升高(P<0.05),表明OSCC患者血清外泌體miR-182含量與OSCC的疾病進(jìn)展密切相關(guān)。OSCC的浸潤深度與生存率密切相關(guān),當(dāng)腫瘤厚度超過2 mm時(shí),常觀察到頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移[26],OSCC細(xì)胞的血管和神經(jīng)周圍浸潤是導(dǎo)致局部復(fù)發(fā)以及區(qū)域和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的預(yù)后因素[27],因此血清外泌體miR-182可能成為OSCC的預(yù)后標(biāo)志物之一,但是其作用機(jī)制仍需進(jìn)一步研究。
研究表明miR-182可以促進(jìn)OSCC細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,通過轉(zhuǎn)染抗miR-182寡核苷酸可以顯著抑制OSCC的增殖、遷移和侵襲[25,28],但缺乏安全有效的遞送系統(tǒng)阻礙了其臨床應(yīng)用。外泌體作為天然的納米材料,具有免疫原性小,細(xì)胞毒性低,可以穿過血-腦屏障,能夠在血液中穩(wěn)定存在等特點(diǎn)[29-30],是一種理想的藥物遞送載體,因此我們采用外泌體遞送miR-182的拮抗劑用于觀察OSCC細(xì)胞的增殖實(shí)驗(yàn)。通過共孵育的方法將親脂性修飾的miR-182 antagomir加載到HEK293細(xì)胞外泌體中,在熒光顯微鏡下觀察到藥物加載到外泌體中,加載miR-182 antagomir的外泌體可以顯著抑制CAL27細(xì)胞的增殖,這與Wang等[28]研究一致,為口腔癌治療提供了一種新的途徑。Zhang等[15]的研究發(fā)現(xiàn)通過共孵育的方法可以將膽固醇基修飾的miR-210加載到外泌體中,并且加載miR-210的外泌體可以穿過血腦屏障從而改善小鼠腦缺血損傷,Didiot等[31]研究發(fā)現(xiàn)外泌體介導(dǎo)的寡核苷酸遞送可以降低沉默Huntingtin(Htt)mRNA所需的寡核苷酸有效濃度,在最近的一項(xiàng)研究中,需要注入700 μg反義寡核苷酸才能有效沉默Htt mRNA,而Didiot等[31]研究表明,在1周內(nèi)(1 μg/d)僅注入3.5~7.0 μg hsiRNAHTT就足以降低Htt mRNA的水平約35%。上述研究表明,共孵育法是一種簡單高效的外泌體加載核酸類藥物的方法,也表現(xiàn)出外泌體在疾病治療領(lǐng)域的巨大潛力。
綜上所述,miR-182在OSCC中以及腫瘤浸潤深度大于5 mm的患者的血清外泌體中表達(dá)水平均升高,這為OSCC的診斷及預(yù)后評估提供了新的標(biāo)志物。外泌體加載miR-182的抑制劑也為口腔癌提供了潛在的治療方法。