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解脂耶氏酵母中羽扇豆醇合成途徑的構(gòu)建與調(diào)控

2021-04-27 09:56:54萬曉宇毛相朝
工業(yè)微生物 2021年2期
關(guān)鍵詞:羽扇豆工程菌鯊烯

萬曉宇,劉 振*,毛相朝,2

1.中國海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,青島 266000;2.青島海洋科學(xué)與技術(shù)國家實驗室海洋藥物與生物制品功能實驗室,青島 266000

羽扇豆醇(lup-20(29)-ene-3β-ol)是一類來源于藥用植物的五環(huán)三萜類化合物,是羽扇豆烷型三萜的基本前體,羽扇豆醇及其衍生物如樺木酸等具有抗炎、抗癌、抗腫瘤、降血糖等生理活性,在醫(yī)藥領(lǐng)域受到廣泛關(guān)注[1-3]。已有報道表明,羽扇豆醇有顯著抑制腫瘤的生長并致使前列腺癌細胞死亡的能力,是一種潛在的治療前列腺癌的藥物成分[4]。另外,羽扇豆醇在害蟲防治領(lǐng)域發(fā)揮著重要作用,該化合物可以改變乙酰膽堿酯酶(AChE)、Na+-ATP酶、過氧化氫酶的平衡,破壞螨蟲的角質(zhì)層、肌絲、核膜、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng),最終使螨蟲死亡。因此,羽扇豆醇具有一定的殺螨能力,可以作為一種植物性害蟲防治劑[5]。

目前羽扇豆醇的獲得主要通過植物萃取法、化學(xué)法和生物合成法三種途徑[6]。羽扇豆醇主要存在于水果蔬菜中,但含量極低,例如,在橄欖果中含量約為3 μg/g,芒果皮含量約為0.67 μg/g,日本梨含量約為175 μg/g,芒果含量約為180 μg/g,蘆薈干葉含量約為280 μg/g,榆樹皮含量約為880 μg/g[7]。較低的天然含量和復(fù)雜的萃取條件使得植物萃取法得到的羽扇豆醇產(chǎn)量較低,例如以海葡萄為原料可提取得到5.6067 mg/g的羽扇豆醇,難以滿足羽扇豆醇工業(yè)應(yīng)用的需求[8]。而化學(xué)合成法普遍使用樺木醇為前體,經(jīng)過復(fù)雜的化學(xué)反應(yīng)得到羽扇豆醇,目前已知的最高轉(zhuǎn)化率為50%[9]?;瘜W(xué)法也因大量的有機溶劑和底物消耗、不可避免的污染和副產(chǎn)物的生成而限制了羽扇豆醇產(chǎn)量的提高[6]。合成生物學(xué)作為一門新興學(xué)科,為萜類的合成提供了新的思路,目前已有許多三萜通過生物合成法達到1 g/L以上的產(chǎn)量[10]。同樣,也有研究表明利用釀酒酵母作宿主可合成200.1 mg/L的羽扇豆醇[11]。

羽扇豆醇的生物合成主要存在兩種合成途徑,甲羥戊酸(MVA)途徑和甲基赤蘚糖-4-磷酸(MEP)途徑[12]。其中,MVA途徑主要存在于真核生物、古細菌和高等植物的細胞液中,MEP途徑主要存在于植物、細菌和藻類等[13,14]。在真核生物中,乙酰輔酶A分子在HMG-CoA合成酶催化下偶聯(lián)生成3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A (HMG-CoA)[15]。MVA經(jīng)由HMG-CoA還原酶(HMGR)催化生成,之后轉(zhuǎn)化為異戊烯基焦磷酸鹽(IPP)和二甲基烯丙基焦磷酸鹽(DMAPP),這個過程被稱為MVA通路[16]。IPP和DMAPP這兩個重要的中間體通過頭尾縮合轉(zhuǎn)化為法尼酰基焦磷酸(FPP)[15]。FPP經(jīng)角鯊烯合成酶(SQS)生成角鯊烯,再經(jīng)角鯊烯環(huán)氧化酶(SQE)氧化生成2,3-氧化角鯊烯。最后,氧化角鯊烯環(huán)化生成2,3-氧化角鯊烯作為陽離子中間體,陽離子中間體經(jīng)羽扇豆醇合酶(LUS)環(huán)化形成羽扇豆醇[17]。圖1所示為酵母中羽扇豆醇的合成途徑。

圖1 酵母中羽扇豆醇的合成途徑

本研究通過分別利用木欖和蓖麻來源的LUS在解脂耶氏酵母中構(gòu)建羽扇豆醇的合成途徑,對比這兩種不同來源的LUS的表達效果。另外,進一步過表達了解脂耶氏酵母來源的tHMGR和IDI兩個關(guān)鍵限速酶調(diào)控MVA途徑,實現(xiàn)了羽扇豆醇在該宿主中的合成。最后,為了強化2,3-環(huán)氧角鯊烯的合成以促進羽扇豆醇的合成,過表達了解脂耶氏酵母中的SQS和SQE,使得羽扇豆醇達到本研究中的最高產(chǎn)量。

1 材料與方法

1.1 試劑材料

1.1.1菌株及質(zhì)粒

本研究所用質(zhì)粒、菌株及引物信息見表1和表2。

表1 本研究所用質(zhì)粒及菌株

1.1.2生化試劑及藥品

P505-d1聚合酶PhantaTMMax Super-Fidelity DNA polymerase和Taq聚合酶混合體系2×Taq Master Mix購于諾唯贊生物公司(Vazyme)??焖儋|(zhì)粒小提試劑盒TIANprep Rapid Mini Plasmid Kit購于TIANGEN公司。PCR回收試劑盒Gel Extraction Kit(200)購于OMEGA公司。其他試劑及藥品未作特殊說明均為國產(chǎn)分析純。PCR引物合成及測序由青島擎科公司提供。

表2 本研究所用引物

1.1.3試劑及培養(yǎng)基配方

LB培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨10, NaCl 10,酵母提取物5,121 ℃滅菌20 min后備用。

YPD培養(yǎng)基(%):蛋白胨2,酵母提取物2,葡萄糖2,115 ℃滅菌30 min后備用。

SM[Ura]篩選培養(yǎng)基: 0.8% 酵母選擇培養(yǎng)基(一缺,Ura),2%葡萄糖,115 ℃滅菌30 min后備用。

SM[Leu]篩選培養(yǎng)基: 0.8% 酵母選擇培養(yǎng)基(一缺,Leu),2%葡萄糖,115 ℃滅菌30 min后備用。

SM[Ura-Leu]篩選培養(yǎng)基:0.8%酵母選擇培養(yǎng)基(二缺,Ura-Leu),2%葡萄糖,115 ℃滅菌30 min后備用。

上述液體培養(yǎng)基加2%的瓊脂可配成相應(yīng)的固體培養(yǎng)基。

1.2 方法

1.2.1解脂耶氏酵母中羽扇豆醇合成途徑的構(gòu)建

首先構(gòu)建含目的片段BgLUS、RcLUS的質(zhì)粒PMT1、PMT2,利用P505-d1高保真聚合酶擴增和PCR回收得到用于酵母轉(zhuǎn)化的線性片段。用YPD培養(yǎng)基活化基礎(chǔ)菌株po1g后分別將目的片段用醋酸鋰法轉(zhuǎn)入感受態(tài)中,并用SM-Ura固體培養(yǎng)基篩選轉(zhuǎn)化子。轉(zhuǎn)化子用引物進行PCR驗證和測序驗證后,得到GLU-1、GLU-2工程菌。

1.2.2MVA調(diào)控菌株的構(gòu)建

構(gòu)建MVA調(diào)控工程菌株所用的方法與1.2.1相同,首先從解脂耶氏酵母po1g全基因組中擴增IDI和tHMGR片段,將目的片段利用P505-d1高保真聚合酶擴增和PCR回收,之后轉(zhuǎn)入用SM-Ura培養(yǎng)基活化后的GLU-1、GLU-2菌株的感受態(tài)中,用含HYG抗性的SM-Ura固體培養(yǎng)基篩選轉(zhuǎn)化子。轉(zhuǎn)化子用引物進行PCR驗證和測序驗證后,得到GLU-1M、GLU-2M工程菌。

1.2.3強化2,3-環(huán)氧角鯊烯合成菌株的構(gòu)建

方法與1.2.1相同。將來源于解脂耶氏酵母po1g全基因組的SQS和SQE片段利用P505-d1高保真聚合酶擴增和PCR回收后,轉(zhuǎn)入用含HYG抗性的SM-Ura培養(yǎng)基活化后的GLU-1、GLU-2菌株的感受態(tài)中,用含HYG抗性的SM-Ura-Leu固體培養(yǎng)基篩選轉(zhuǎn)化子。轉(zhuǎn)化子用引物進行PCR驗證和測序驗證后,得到GLU-1MS、GLU-2MS、GLU-1MSS工程菌。

1.2.4搖瓶培養(yǎng)

挑取固體培養(yǎng)基上的單克隆于相應(yīng)的液體培養(yǎng)基中,30 ℃,220 r/min培養(yǎng)2 d作為種子液。將種子液以2%的接種量接種于含15 mL YPD培養(yǎng)基的100 mL三角瓶中培養(yǎng),30 ℃,220 r/min培養(yǎng)5 d。

1.2.5產(chǎn)物提取及檢測

1.2.5.1 產(chǎn)物提取

取1 mL發(fā)酵液于EP管中,1.0×103r/min離心5 min,去除培養(yǎng)基,1 mL無菌水清洗后,加入1 mL HCl(3 mol/L)于95 ℃水浴15 min,之后轉(zhuǎn)移至冰浴10 min,1.0×103r/min離心5 min,去除上清,之后加入雙蒸水洗滌,1.0×103r/min離心5 min去除上清。加入0.5 mL丙酮于55 ℃水浴15 min。1.0×103r/min離心5 min,取上清并過0.22 μm有機尼龍濾膜后備用。

1.2.5.2 產(chǎn)物檢測

羽扇豆醇和角鯊烯的定性及定量分析使用液相色譜法檢測。色譜條件:色譜柱:毛細管柱C18;柱溫:35 ℃;流動相:甲醇;總流速:1 mL/min;檢測波長:201 nm;等度洗脫;進樣體積:20 μL。角鯊烯和羽扇豆醇標準品用于定性和定量分析。

2 結(jié)果與討論

2.1 利用兩種不同來源LUS在解脂耶氏酵母中構(gòu)建羽扇豆醇合成途徑

解脂耶氏酵母是一種產(chǎn)油酵母,其自身可以合成大量乙酰輔酶A供萜類合成,另外該宿主體內(nèi)的油脂也有利于萜類的儲存,因此解脂耶氏酵母可視為一種利于萜類合成的優(yōu)秀宿主。解脂耶氏酵母具有內(nèi)源的2,3-環(huán)氧角鯊烯的合成通路,引入羽扇豆醇合酶即可催化2,3-環(huán)氧角鯊烯環(huán)化形成羽扇豆醇。本研究選取木欖和蓖麻來源的兩種LUS(BgLUS和RcLUS)分別整合到解脂耶氏酵母po1g菌株中。首先將華大基因合成和密碼子優(yōu)化后的BgLUS和RcLUS進行PCR克隆,分別與強啟動子TEF和終止子連接后,利用同源重組整合到po1g基因組上(URA為篩選標記)。轉(zhuǎn)化子經(jīng)過缺陷培養(yǎng)基篩選后,利用引物驗證和測序驗證,獲得正確的工程菌。

a:GLU-1和GLU-2工程菌株示意圖;b:泳道 1-5為GLU-1陽性克隆驗證,6-10為GLU-2陽性克隆驗證。圖2 GLU-1和GLU-2工程菌株示意圖及瓊脂糖電泳圖

陽性克隆鑒定結(jié)果顯示(圖2b),工程菌株插入大小與BgLUS(2 298 bp)和RcLUS(2 310 bp)基因大小一致的片段。測序結(jié)果顯示序列并未發(fā)生突變,菌株構(gòu)建成功。但這兩個工程菌株均檢測不到羽扇豆醇,可能的原因有解脂耶氏酵母自身的MVA途徑較弱,無法合成足夠的FPP和角鯊烯供羽扇豆醇的合成。因此,優(yōu)化MVA途徑成為促進解脂耶氏酵母中羽扇豆醇的合成的重要手段。

2.2 調(diào)控MVA途徑對羽扇豆醇和角鯊烯合成的影響

MVA途徑是萜類合成的第一道關(guān)鍵步驟,許多研究表明經(jīng)過MVA優(yōu)化后的萜類合成菌株產(chǎn)量可上調(diào)。其中HMGR是合成MVA的關(guān)鍵酶,此步驟不可逆轉(zhuǎn),有研究表明,去掉N端氨基酸的HMGR(tHMGR)具有更高的合成MVA能力。而IDI作為MVA途徑中的一步可逆反應(yīng)的酶,催化IPP與DMAPP的相互轉(zhuǎn)化,也同樣對FPP的積累產(chǎn)生重要的影響[18]。這兩種酶同時調(diào)控著IPP和DMAPP在整個途徑中平衡配比,也是代謝工程改造的主要靶點[19]。通過將來源于解脂耶氏酵母的tHMGR和IDI整合到GLU-1和GLU-2中,轉(zhuǎn)化子經(jīng)過缺陷培養(yǎng)基篩選后,利用引物驗證和測序驗證,獲得MVA途徑優(yōu)化后的工程菌GLU-1M和GLU-2M。

陽性克隆鑒定結(jié)果顯示(圖3b,3c),工程菌株插入大小與tHMGR(1 500 bp)和IDI(813 bp)基因大小一致的片段。測序結(jié)果顯示序列并未發(fā)生突變,菌株構(gòu)建成功。如圖3d所示,在調(diào)控了MVA途徑后羽扇豆醇合成途徑構(gòu)建成功,羽扇豆醇產(chǎn)量為11.74 mg/L,角鯊烯產(chǎn)量為8.33 mg/L。確定了過表達IDI和HMGR兩種關(guān)鍵酶對羽扇豆醇和角鯊烯的生成起到了強化作用,實現(xiàn)了羽扇豆醇在解脂耶氏酵母中從無到有的合成。然而,BgLUS和RcLUS對羽扇豆醇的合成無顯著差異。

2.3 過表達SQS和SQE對羽扇豆醇和角鯊烯合成的影響

在酵母中,固醇合成途徑是萜類合成的有力競爭途徑,為了使更多的2,3-環(huán)氧角鯊烯投入到萜類合成當(dāng)中,對其含量調(diào)控就尤為重要。在釀酒酵母中,SQE是三萜合成的一個關(guān)鍵限速酶。研究表明,角鯊烯作為重要中間體,其含量極大程度上影響了羽扇豆醇的合成。本研究通過過表達解脂耶氏酵母自身的SQE,構(gòu)建了GLU-1MS,GLU-2MS。另外,經(jīng)過MVA優(yōu)化的GLU-1M和GLU-2M對角鯊烯的積累水平仍然不足。因此在GLU-1MS基礎(chǔ)上,整合來源于解脂耶氏酵母的SQS成功構(gòu)建了GLU-1MSS工程菌。

a:GLU-1M和GLU-2M工程菌株圖解;b:工程菌株tHMGR片段陽性克隆驗證;c:工程菌株IDI片段陽性克隆驗證;d:過表達tHMGR和IDI對羽扇豆醇和角鯊烯產(chǎn)量的影響。圖3 GLU-1M和GLU-2M工程菌株示意圖、瓊脂糖電泳圖及角鯊烯和羽扇豆醇產(chǎn)量圖

陽性克隆鑒定結(jié)果顯示(圖4b,4c),工程菌株插入片段大小與SQE(1 467 bp)和SQS(1 338 bp)基因大小一致的片段。測序結(jié)果顯示序列并未發(fā)生突變,菌株構(gòu)建成功。如圖4d所示,在強化2,3-環(huán)氧角鯊烯的合成后羽扇豆醇的產(chǎn)量有所上升,兩種不同來源的LUS在羽扇豆醇的合成效果上出現(xiàn)差異,整合了木欖來源的BgLUS的GLU-1MS可合成19.8 mg/L的羽扇豆醇,而蓖麻來源的RcLUS合成的羽扇豆醇不到15 mg/L。為了進一步增強中間產(chǎn)物角鯊烯的產(chǎn)量,在GLU-1MS的基礎(chǔ)上整合了SQS。最終,工程菌GLU-1MSS合成的羽扇豆醇可達24.62 mg/L,角鯊烯產(chǎn)量為14.17 mg/L。相較于上一步優(yōu)化提升了1倍。

a:GLU-1MS、GLU-2MS和GLU-1MSS工程菌株圖解;b:泳道3為GLU-1MS陽性克隆驗證,6為GLU-2MS陽性克隆驗證;c:GLU-1MSS菌株SQS片段陽性克隆驗證;d:過表達SQS和SQE對羽扇豆醇和角鯊烯產(chǎn)量的影響。圖4 GLU-1MS、GLU-2MS和GLU-1MSS工程菌株示意圖、瓊脂糖電泳圖及角鯊烯和羽扇豆醇產(chǎn)量圖

3 結(jié)論

本文以解脂耶氏酵母作為表達菌株,進行了羽扇豆醇合成途徑的構(gòu)建與調(diào)控。向解脂耶氏酵母po1g中分別引入了BgLUS和RcLUS基因及MVA途徑的關(guān)鍵酶HMGR和IDI,構(gòu)建了GLU-1M和GLU-2M工程菌,成功在解脂耶氏酵母中建立了羽扇豆醇合成途徑。為了提升解脂耶氏酵母中羽扇豆醇的產(chǎn)量,進一步過表達了三萜合成的關(guān)鍵限速酶SQE和SQS,構(gòu)建了GLU-1MSS工程菌,使產(chǎn)量羽扇豆醇提升為GLU-1M的2倍。然而目前工程菌中羽扇豆醇的產(chǎn)量仍然很低,這一現(xiàn)象可能是由較低水平的角鯊烯積累和2,3-環(huán)氧角鯊烯的利用不足所導(dǎo)致的。因此,未來對羽扇豆醇在解脂耶氏酵母中的優(yōu)化可以從以下幾個方面展開:(1)過表達整條MVA途徑;(2)抑制固醇合成途徑;(3)使用強啟動子表達關(guān)鍵限速酶;(4)優(yōu)化培養(yǎng)條件;(5)選擇目的基因最佳插入位點。本研究完成了羽扇豆醇解脂耶氏酵母工程菌株的構(gòu)建,為大規(guī)模合成羽扇豆醇提供思路,為進一步合成羽扇豆烷型三萜奠定了基礎(chǔ)。

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