張麗娟 吳唯維 李素一 陳 華 柯翎 林晨韜
(1.福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所 福州 350003;2.福建師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 福州 350007;3.福建師范大學(xué)南方海洋研究院福建省微藻種質(zhì)改良工程技術(shù)研究中心 福州 350117;4.福建師范大學(xué)福建省特色海洋生物資源可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 福州 350117)
抗菌肽(Antimicrobial peptide)是一類由生物機(jī)體產(chǎn)生的具有抑菌活性的陽離子多肽類物質(zhì), 是機(jī)體抵御病原菌感染的天然屏障之一。近年來,由于尋找抗生素替代物的迫切需求, 以及抗菌肽的抗菌活性高、抗菌譜廣、種類多、目標(biāo)菌株不易產(chǎn)生耐藥突變等特點(diǎn), 其作為一種潛在的抗生素替代物越來越受到研究者的重視[1-2]。
目前, 抗菌肽的獲得方式主要是從生物體中提取、人工化學(xué)合成和構(gòu)建基因工程菌大量表達(dá)。其中從生物體中提取只能獲得少量抗菌肽,且操作復(fù)雜;人工化學(xué)合成抗菌肽成本高且與天然抗菌肽的結(jié)構(gòu)有差異;而構(gòu)建基因工程菌大量表達(dá)則具效率高、成本低且易操作等優(yōu)點(diǎn)。 基因工程表達(dá)主要包括原核表達(dá)系統(tǒng)與真核表達(dá)系統(tǒng), 其中酵母表達(dá)系統(tǒng)作為常用的真核表達(dá)系統(tǒng), 表達(dá)的抗菌肽更接近天然狀態(tài), 并且操作簡單、 無毒副作用、 利于純化及工業(yè)化生產(chǎn)[3]。 Sun 等[4]利用畢赤酵母表達(dá)了融合蛋白抗菌肽乳鐵蛋白-溶菌酶, 具有良好的穩(wěn)定性。 Meng等[5]利用畢赤酵母重組表達(dá)的Hispidalin 具有廣譜的抗菌活性, 并且具有廣泛的熱穩(wěn)定性與酸堿穩(wěn)定性。
我們前期從歐洲鰻鱺中發(fā)現(xiàn)一個(gè)新型抗菌肽elecilin,并對(duì)其進(jìn)行了原核表達(dá),證實(shí)其對(duì)金黃色葡萄球菌具有抑菌作用(另文發(fā)表)。 本研究利用酵母表達(dá)系統(tǒng), 獲得了分泌到培養(yǎng)基中大量表達(dá)的elecilin, 為闡明其功能及其在生產(chǎn)實(shí)踐中的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。
1.1 材料 畢赤酵母X-33 和酵母分泌表達(dá)載體pPICZaA 由本實(shí)驗(yàn)室保存。 限制性內(nèi)切酶Xho Ⅰ和Not Ⅰ、Taq DNA polymerase、T4 DNA 連接酶、DNA ladder 購自TaKaRa 公司;抗生素Zeocin、抗體anti-His 單克隆抗體購自Invitrogen 公司。
1.2 方法
1.2.1 抗菌肽的序列特征分析 根據(jù)歐洲鰻鱺抗菌肽elecilin 基因編碼的氨基酸序列, 利用BioEdit 軟件預(yù)測蛋白質(zhì)的疏水區(qū)和親水區(qū),http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/在線預(yù)測信號(hào)肽信息,https://swissmodel.expasy.org/interactive 在線預(yù)測蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu),PROSITE 數(shù)據(jù)庫分析蛋白的活性區(qū)域。
1.2.2 基因序列合成與酵母分泌表達(dá)載體的構(gòu)建為利于抗菌肽的表達(dá), 根據(jù)獲得的歐洲鰻鱺抗菌肽elecilin 的基因序列,及酵母表達(dá)系統(tǒng)的密碼子偏好性, 在不改變編碼氨基酸序列的基礎(chǔ)上合成去除信號(hào)肽的elecilin 基因序列,并在其上游與下游分別引入Xho Ⅰ和Not Ⅰ酶切位點(diǎn)。 將合成的目的基因序列與Xho Ⅰ和Not Ⅰ雙酶切回收的pPICZaA 在T4 DNA 連接酶作用下進(jìn)行連接,經(jīng)鑒定后,獲得質(zhì)粒pPICZaA-elecilin。
1.2.3 酵母菌的電擊轉(zhuǎn)化和陽性轉(zhuǎn)化子的PCR 篩選 按照電擊轉(zhuǎn)化步驟, 將質(zhì)粒pPICZaA-elecilin轉(zhuǎn)化至畢赤酵母X-33 感受態(tài)中。 轉(zhuǎn)化后,均勻涂布于RDB 平板中,30 ℃培養(yǎng)3 d。 挑取若干單克隆酵母 菌, 用 引 物ɑ factor sequencing primer:TACTATTGCCAGCATTGCTGC 和 3' AOX primer:GCAAATGGCATTCTGACATCC 進(jìn)行PCR 驗(yàn)證。
1.2.4 抗菌肽的誘導(dǎo)表達(dá)及SDS-PAGE 鑒定 選取鑒定為陽性的克隆菌接種至BMGY 培養(yǎng)基,28 ℃培養(yǎng)至OD600為3.0 后,700 g/min 離心5 min, 收集菌體,并用新鮮的BMMY 培養(yǎng)基重懸菌體,至OD600為1.0,28 ℃繼續(xù)培養(yǎng), 每隔24 h 添加甲醇溶液(100%) 至終濃度為1 %誘導(dǎo)蛋白表達(dá), 誘導(dǎo)96 h后收集培養(yǎng)基, 用SDS-PAGE 鑒定抗菌肽表達(dá)情況。
1.2.5 表達(dá)產(chǎn)物的Western blot 鑒定 分泌蛋白經(jīng)SDS-PAGE 電泳后, 電轉(zhuǎn)移至PVDF 膜上, 半干轉(zhuǎn)90 min 后,將PVDF 膜用封閉液封閉2 h,然后洗脫液PBST 洗脫4 次,每次5 min,將膜與一抗(His-tag單克隆抗體) 在室溫孵育1~2 h 后, 洗脫液洗脫(4 次,每次5 min),然后將膜轉(zhuǎn)移到二抗溶液(含有辣根過氧化物酶標(biāo)記的馬抗鼠IgG)中,室溫孵育1~2 h, 接著洗脫液洗脫, 用ECL 顯色系統(tǒng)顯色,在BIO-RAD 中顯色后拍照。
2.1 歐洲鰻鱺抗菌肽elecilin 的基因序列特征分析歐洲鰻鱺抗菌肽elecilin 基因序列全長477 bp,編碼159 個(gè)氨基酸,理論分子量約為17.4 kDa(見圖1)。信號(hào)肽分析發(fā)現(xiàn), 前30 位氨基酸為信號(hào)肽區(qū)域;三維結(jié)構(gòu)預(yù)測, 該蛋白在84-106 區(qū)間是一個(gè)活性區(qū)域,含有2 個(gè)抗菌肽標(biāo)簽特征序列。
圖1 歐洲鰻鱺抗菌肽elecilin 的基因序列
2.2 酵母分泌表達(dá)載體的構(gòu)建與重組轉(zhuǎn)化子的PCR 鑒定 合成的elecilin 基因序列與酵母分泌表達(dá)載體pPICZaA 連接后, 得到elecilin 的酵母表達(dá)質(zhì)粒pPICZaA-elecilin。 將其電擊轉(zhuǎn)化至酵母菌X-33 中,在RDB 平板中培養(yǎng)3 d 后挑取單克隆,培養(yǎng)后, 用 引 物ɑ factor sequencing primer 和3' AOX primer 進(jìn)行PCR 鑒定,瓊脂糖凝膠電泳顯示陽性克隆菌株擴(kuò)增出與目的基因大小一致的片段 (見圖2)。 進(jìn)一步的測序結(jié)果表明,elecilin 基因已成功整合到酵母基因組中, 將陽性轉(zhuǎn)化子命名為X-33/pPICZaA-elecilin。
圖2 重組菌株X-33/pPICZaA-elecilin 的PCR 鑒定
2.3 抗菌肽的誘導(dǎo)表達(dá)及鑒定 將重組酵母進(jìn)行甲醇誘導(dǎo)培養(yǎng),收集培養(yǎng)基進(jìn)行SDS-PAGE 分析和Western 鑒定。 結(jié)果顯示,培養(yǎng)基中檢測到一個(gè)分子量約17 kDa 的蛋白表達(dá)(見圖3)。 進(jìn)一步根據(jù)表達(dá)產(chǎn)物攜帶6×His 標(biāo)簽的特點(diǎn),利用抗His-tag 單克隆抗體進(jìn)行Western blot 驗(yàn)證,在約17 kDa 處的蛋白與該抗體特異性結(jié)合(見圖4),證明目的蛋白在酵母菌X-33 中成功表達(dá)。
圖4 Western blot 鑒定elecilin 的表達(dá)
迄今為止,已發(fā)現(xiàn)的抗菌肽超過3 000 種,其中動(dòng)物源抗菌肽超過2 000 種。 雖然抗菌肽種類及數(shù)量在不斷增多,但是被廣泛應(yīng)用的卻很少,究其原因包括抗菌肽在機(jī)體內(nèi)的代謝情況尚不清楚、 安全性評(píng)價(jià)體系尚不完善、抗菌肽的生產(chǎn)成本高等[6]。 在抗菌肽的研究中, 畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)因其操作簡單、表達(dá)高效、 且活性高等特點(diǎn)被廣泛用于抗菌肽的表達(dá)[7]。 本研究根據(jù)畢赤酵母密碼子偏好性,在不改變elecilin 的編碼氨基酸序列基礎(chǔ)上,合成了去除信號(hào)肽的DNA 序列, 構(gòu)建了真核表達(dá)質(zhì)粒pPICZaAelecin,利用畢赤酵母X-33 進(jìn)行了表達(dá),用甲醇誘導(dǎo)表達(dá),經(jīng)SDS-PAGE 與Western blot 鑒定,成功在畢赤酵母中表達(dá)了elecilin。 在此基礎(chǔ)上,我們將分析其抗菌譜,進(jìn)一步研究其功能,評(píng)估其在水產(chǎn)和畜禽等領(lǐng)域的應(yīng)用價(jià)值。