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輪狀病毒感染對宿主天然免疫影響的研究進展

2021-03-31 00:57:09王晶瑩王春鳳葉麗萍楊桂連
動物醫(yī)學進展 2021年7期
關(guān)鍵詞:輪狀病毒宿主結(jié)構(gòu)域

王晶瑩,王春鳳,葉麗萍,楊桂連,曹 欣

(吉林農(nóng)業(yè)大學動物科學技術(shù)學院,吉林長春 130118)

輪狀病毒(Rotavirus,RV)屬呼腸孤病毒科,有A至H共8種,其中感染A種的最多,病毒顆粒無囊膜,由包裹著11個基因組雙鏈RNA片段的3層蛋白組成。感染RV可立即激活宿主天然免疫,主要表現(xiàn)為干擾素(interferon,IFN)的分泌,包括Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型IFN。IFN的分泌導致感染和未感染細胞中數(shù)百種具有抗病毒活性的干擾素刺激基因(IFN-stimulated gene,ISG)的表達。此過程需要模式識別受體(pattern recognition receptors,PRRs)的識別,為引起不同類型IFN和ISG的分泌,機體通過不同類型的PRRs來識別RNA病毒,主要有Toll樣受體(Toll like receptors,TLRs)、視黃醇誘導基因Ⅰ樣受體(RIG-I-like receptors,RLRs)、核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)樣受體(NOD-like receptors,NLR)。這些PRRs識別不同的病原相關(guān)分子模式(pathogen-associated molecular patterns,PAMPs),細胞分泌的IFN和其受體結(jié)合,通過自分泌和旁分泌,激活JAK-STAT通路,誘導大量ISGs的表達,ISGs可限制病毒生命周期的各個階段(進入、脫殼、轉(zhuǎn)錄、翻譯、組裝和釋放),從而建立抗病毒狀態(tài)。

雖然在病毒基因組合成過程中通常會激活I(lǐng)FN通路,但RV采取多種措施保護其感染期間不受天然免疫攻擊。病毒在與宿主長期的斗爭中,必須要通過各種機制逃避免疫系統(tǒng)的識別和攻擊,比如抑制IFN產(chǎn)生、破壞IFN的信號傳導、逃避宿主的識別、調(diào)節(jié)細胞凋亡及細胞自噬等。RV也可通過多種途徑來逃避天然免疫,其非結(jié)構(gòu)蛋白2(non-structural protein 2,NSP2)可介導干擾素調(diào)節(jié)因子(IFN regulatory factors,IRF)、RIG-Ⅰ、β轉(zhuǎn)導重復相容蛋白(β-transducin repeat-containing protein,β-TrCP)、腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子(tumor necrosis factor receptor-associated factors,TRAFs)和轉(zhuǎn)錄激活子(signal transducers and activators of transcription,STATs)等宿主免疫應(yīng)答通路中重要分子的降解;VP3可介導線粒體抗病毒信號蛋白(mitochondrial antiviral signaling protein,MAVS)降解、阻止2′-5′寡聚腺苷酸合成酶(OAS) / RNase L通路的激活以及作為蓋帽酶保護病毒轉(zhuǎn)錄過程中免受宿主識別;RV為了避免在復制過程中基因組被細胞識別,編碼了一些蛋白與RNA結(jié)合,如非結(jié)構(gòu)蛋白2(non-structural protein 2,NSP2)和結(jié)構(gòu)蛋白2(viral protein 2,VP2)。在體外,RV通過內(nèi)體-溶酶體途徑降解來消耗多種類型的干擾素受體(interferon receptor,IFNR),可抑制IFN介導的STAT1活化和轉(zhuǎn)錄[1]。

1 NSP1拮抗天然免疫

NSP1蛋白由RV的第5段基因編碼,對于病毒復制不是必須的,NSP1基因被截短的毒株與野生型相比,在細胞中的復制滴度相似,但噬菌斑較小,表明NSP1對于RV在細胞間的傳播至關(guān)重要。NSP1是RV蛋白質(zhì)組中保守程度最低的成員,不同來源毒株的NSP1差異較大。NSP1蛋白的C末端序列可變性最高,它通過C末端與不同宿主蛋白相互作用,以蛋白酶體依賴的方式誘導IRF3降解;N端有一個RING結(jié)構(gòu)域,使NSP1發(fā)揮E3泛素連接酶功能,降解IRFs和β-TrCP蛋白,阻斷IFN信號通路和NF-κB通路。

1.1 NSP1多種途徑拮抗干擾素應(yīng)答

干擾素調(diào)節(jié)因子(IRF)家族以其在干擾素誘導中的作用而得名,廣泛影響細胞免疫反應(yīng)。IRFs(IRF1-IRF9)N端含有保守的DBD結(jié)構(gòu)域,可識別IFN基因啟動子區(qū)域和ISGs中的干擾素刺激反應(yīng)元件(IFN-stimulated response elements,ISREs);IRF3-IRF9中C端IRF結(jié)合結(jié)構(gòu)域IAD1和IRF1/IRF2中的IAD2介導IRF的同源和異源二聚化以及與其他轉(zhuǎn)錄因子(包括STAT家族成員)的結(jié)合,來自PRRs的刺激信號誘導IAD磷酸化或二聚化,導致IRF核轉(zhuǎn)位和DBD與ISREs結(jié)合,上調(diào)ISGs的表達,發(fā)揮抗病毒作用。

研究顯示,野生型NSP1通過蛋白酶體途徑可使IRF3快速降解——IRF3二聚化和核轉(zhuǎn)位嚴重降低,缺乏IFN啟動子活性,而C端截短的NSP1不能誘導IRF3蛋白的降解,盡管N端RING結(jié)構(gòu)域?qū)SP1蛋白與IRF3的結(jié)合也是必須的[2]。之前的研究發(fā)現(xiàn),破壞NSP1的RING結(jié)構(gòu)域后,NSP1不能與IRF3相互作用使其降解,證明NSP1可能作為E3泛素連接酶發(fā)揮功能。IRF3是第一個被發(fā)現(xiàn)的被NSP1降解的宿主蛋白,IRF5、IRF7和IRF9也是NSP1介導降解的靶點,因為它們在結(jié)構(gòu)域上與IRF3相似[3]。通過將IRF3截短,證明IAD為SA11-4F NSP1降解所需的最小結(jié)構(gòu)域,且NSP1只識別含有IAD1的IRF[3]。IRF4、IRF6和IRF8也具有C末端IAD1結(jié)構(gòu)域,NSP1是否能介導它們的降解還需進一步研究。

1.2 NSP1拮抗核轉(zhuǎn)錄因子-κB信號通路

與IRFs一樣,在天然免疫反應(yīng)中,核轉(zhuǎn)錄因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)家族的轉(zhuǎn)錄因子p50、p52、p65、RelB和c-Rel發(fā)揮關(guān)鍵作用[4]。IκB是NF-κB的抑制體,當細胞處于靜息狀態(tài)時,與NF-κB形成無活性的復合物。來自PRRs和其他分子的信號激活I(lǐng)κB激酶復合物,IκB激酶復合物將IκB磷酸化,該磷酸二聚體被β-TrCP識別,為E3泛素連接酶的SCF家族提供靶向性,SCFβ-TrCP誘導磷酸化的IκB翻轉(zhuǎn),釋放NF-κB移位到細胞核,并在IFN和ISG啟動子區(qū)域與κB基因結(jié)合。

與大多數(shù)RVA毒株的NSP1蛋白不同,OSU NSP1誘導β-TrCP 的蛋白酶體依賴性降解[5]。β-TrCP是Wnt(wingless-type MMTV integration site family members)信號通路的中心靶標。因此,p65不會移位到細胞核,p50也不會與DNA結(jié)合,達到抑制NF-κB通路的作用。據(jù)報道,RV NSP1需要宿主Cullin-E3連接酶復合物來降解β-TrCP。對HT-29細胞宿主基因表達的微陣列分析表明,感染SA11-4F、Wa或牛A5-13 RVA上調(diào)腫瘤壞死因子-α誘導蛋白3(tumor necrosis factor alpha-inducible protein 3,TNFAIP3)基因的轉(zhuǎn)錄[6]。TNFAIP3(或A20)是一種鋅指蛋白,可在包括PRRs在內(nèi)的眾多刺激下抑制NF-κB的激活[7]。NSP1殘基101和C末端之間的NSP1區(qū)域(不包括N端RING域)介導與TRAF2的相互作用介導蛋白酶體依賴的TNF受體相關(guān)因子2(TNF receptor-associated factor 2,TRAF2)的降解,抑制NF-κB非經(jīng)典途徑的活化[8]。其他一些毒株的NSP1也可介導TRAF2的降解,如SA11和OSU毒株。

1.3 NSP1介導視黃醇誘導基因Ⅰ樣受體及其接頭蛋白的降解

RIG-Ⅰ、黑色素瘤分化相關(guān)基因5(melanoma differentiation associated gene-5,MDA5)和LGP2(laboratory of genetics and physiology2,LGP2)通過DExD/H-box解旋酶和C末端結(jié)構(gòu)域識別細胞質(zhì)中dsRNA。當與dsRNA結(jié)合時,RIG-Ⅰ和MDA5中的N末端caspase招募結(jié)構(gòu)域(CARD)介導與MAVS的結(jié)合和寡聚化,最終導致IRF和NF-κB的激活。與大多數(shù)RNA病毒在細胞內(nèi)與RIG-Ⅰ或MDA5相互作用不同,輪狀病毒可被RIG-Ⅰ和MDA5單獨或聯(lián)合識別,沉默RIG-Ⅰ或MDA5或它們的共同接頭蛋白MAVS可顯著降低感染的腸上皮細胞中IFN-β的產(chǎn)生,增加輪狀病毒滴度。SA11 NSP1通過其C末端與MAVS的CARD和TM結(jié)構(gòu)域相結(jié)合,與全長的NSP1相比,A5-16 NSP1 不能阻斷MAVS聚集體的形成和IFN-β的誘導,從而證實了NSP1 C末端在拮抗MAVS中的作用。

1.4 NSP1與細胞凋亡:NSP1介導的磷脂酰肌醇3激酶/絲氨酸蘇氨酸激酶(PI3K/Akt)通路的激活和p53的降解

細胞被病毒感染后,細胞啟動早期凋亡機制將病毒限制在少數(shù)細胞內(nèi),抑制病毒大量復制并感染其他細胞。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)很多病毒通過P13K/Akt通路來防止細胞過早凋亡。RVA A5-13可誘導蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)及其底物之一糖原合酶激酶3β(GSK3β)快速而持久的磷酸化,最終導致細胞凋亡的延遲[9]。但RVA A5-16在感染細胞中沒有此作用,A5-13 NSP1與PI3K的P85亞基相互作用,表明NSP1的C-末端區(qū)域可能是這種聯(lián)系所必需的。P13K由2個亞基組成,即p110和p85,其中2個異構(gòu)體(p85α和p85β)通常與病毒蛋白相互作用[7,10]。NSP1的N端和C端片段均可與P85α相互作用,但P85β優(yōu)先與全長NSP1結(jié)合。由于PI3K/Akt通路也可激活I(lǐng)SGs的轉(zhuǎn)錄,NSP1可能有助于中和這一反應(yīng),發(fā)揮拮抗天然免疫的效應(yīng)[10]。PI3K/Akt活性的靶標之一是p53,它是一種應(yīng)激反應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子,在細胞凋亡、細胞周期調(diào)節(jié)和其他過程中發(fā)揮重要作用。Bhowmick R等[11]研究表明,SA11-4F的NSP1介導了p53的轉(zhuǎn)錄后耗盡,且全長的NSP1誘導蛋白酶體途徑的p53降解,而C末端截短的NSP1沒有這種作用。NSP1通過C末端與p53的DBD結(jié)構(gòu)域相互作用。

1.5 NSP1與STAT家族

大多數(shù)ISG的表達依賴于STAT1,STAT1招募干擾素受體,隨后JAK磷酸化絡(luò)氨酸殘基(Y701),STAT1的磷酸化導致STAT1、STAT2和IRF9的復合物在Y701位點上形成,被稱為干擾素刺激因子3(interferon-stimulated factor 3,ISGF3),誘導包括ISRE和IFN-γ激活位點(GAS)的抗病毒ISGs的轉(zhuǎn)錄。Ⅲ型干擾素通過pY701-STAT1/ISGF3發(fā)揮作用。因此IFN下游的抗病毒反應(yīng)依賴于STAT-Y701的磷酸化。研究發(fā)現(xiàn),RV不僅可以抑制感染細胞中STAT-Y701的磷酸化,還可介導未感染細胞中的這種抑制作用。進一步研究表明,非結(jié)構(gòu)蛋白NSP1可抑制STAT-Y701的磷酸化,且不是通過RING結(jié)構(gòu)域[12]。另外有研究認為,NSP1的第47位氨基酸后的殘基可能對STAT有抑制作用。

2 除NSP1外其他蛋白拮抗天然免疫的機制

2.1 VP3拮抗天然免疫

完整的MAVS信號在誘導IFN對PAMPs的應(yīng)答中起著關(guān)鍵作用,并對后續(xù)適應(yīng)性免疫應(yīng)答也至關(guān)重要[13]。研究表明,VP3 通過N端結(jié)構(gòu)域可與MAVS直接作用,導致MAVS的降解,這種影響通過一種新的磷酸化基序SPLTSS完成,且似乎受宿主范圍限制[14]。C端的PDE結(jié)構(gòu)域可阻止RNaseL的激活[15]??偟膩碚f,VP3是兩種蛋白的綜合體,當病毒轉(zhuǎn)錄本從RV DLPs中出現(xiàn)時,VP3會對其進行封蓋,增加其轉(zhuǎn)譯活性,也可阻止宿主RNA傳感器的激活,它通過裂解信號分子2-5A直接拮抗dsRNA應(yīng)答的OAS/RNase L通路[16]。在感染期間,VP3也可能在細胞的兩個不同區(qū)域發(fā)揮作用,在病毒顆粒內(nèi)作為蓋帽酶,也可能在細胞質(zhì)內(nèi)作為直接的天然免疫拮抗劑。

2.2 NSP2、VP2、NSP3幫助病毒RNA逃避天然免疫

NSP2是一種非特異性的ssRNA結(jié)合蛋白。VP2有較強的RNA結(jié)合活性[17],可能因為NSP2和VP3與RNA相互作用形成復合物,避免了PRRs對RNA的識別。再加上VP3對RNA的封蓋作用,雖然可能并不完全,但一定程度上發(fā)揮了逃避天然免疫的作用。非結(jié)構(gòu)蛋白NSP3蛋白C末端取代多聚腺苷酸結(jié)合蛋白(poly(A)-binding protein,PABP)與真核細胞翻譯啟始因子elF4G相互作用,抑制細胞mRNA的翻譯,NSP3也可與病毒轉(zhuǎn)錄本3′端UGACC序列結(jié)合,刺激病毒mRNA翻譯[18]。

3 輪狀病毒激活天然免疫機制

3.1 NSP4激活天然免疫

NSP4是一種跨膜糖蛋白,參與病毒的復制,在體內(nèi)與一系列細胞相互作用,啟動一系列信號通路,并有助于輪狀病毒感染[19]。輪狀病毒新合成的雙層病毒粒子DLPs通過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)出芽獲得最外層的VP4和VP7,最后通過裂解或胞吐的方式將子代病毒粒子排出細胞[20],此過程需要NSP4蛋白參與[21]。

早期研究發(fā)現(xiàn),從輪狀病毒感染的細胞培養(yǎng)液中提取的NSP4蛋白可與不同細胞結(jié)合,包括免疫細胞。Kavanagh O V等[22]研究發(fā)現(xiàn),NSP4在小鼠體內(nèi)與模型抗原共同免疫時具有佐劑樣效應(yīng),進一步說明NSP4可能在調(diào)節(jié)機體免疫方面發(fā)揮作用。隨著研究的不斷深入,學者們發(fā)現(xiàn),NSP4可誘導巨噬細胞內(nèi)的信號傳導,刺激炎性因子的產(chǎn)生,此過程是通過TLR2受體以及MyD88接頭蛋白介導的,NSP4誘導IKKα和IKKβ亞單位,p38和JNK磷酸化,從而引起NF-κB通路的激活[23]。

3.2 其他病毒結(jié)構(gòu)及產(chǎn)物對天然免疫的激活

輪狀病毒入侵后激活細胞內(nèi)免疫反應(yīng)通常涉及的兩種PRRs為RIG-Ⅰ和MDA5,然后觸發(fā)MAVS的激活。激活這些受體的可能是RV的5′磷酸基團,不完全的甲基化5′Cap結(jié)構(gòu)和局部的dsRNA[24]。除了RIG-Ⅰ和MDA5外,RV還可激活LGP2(RLR家族的第3個成員)以及dsRNA依賴的蛋白激酶PKR,導致細胞分泌IFN[24]。

NOD樣受體(NOD-like receptors,NLR)蛋白炎癥體亞家族是NLRs家族成員中最豐富也是最復雜的亞家族,被激活后與凋亡相關(guān)斑點樣蛋白(apoptosis-associated speck-like protein,ASC)和半胱天冬氨酸蛋白酶-1(cysteiny laspartate-specific protease-1,caspase-1)形成炎癥小體復合物,并介導促炎因子分泌和細胞焦亡關(guān)鍵蛋白Gasdermin-D(GSDMD)誘導的細胞焦亡[25]。此過程不僅有助于宿主防御細菌及其他微生物感染,還能調(diào)節(jié)免疫系統(tǒng)的動態(tài)平衡。研究發(fā)現(xiàn),Nlrp9b在腸上皮細胞中表達,當RV短dsRNA延伸時,被RNA解旋酶Dhx9識別,與Nlrp9b形成復合物而激活Nlrp9b,限制RV的復制[26]。

4 結(jié)語

輪狀病毒必須克服宿主的抗病毒反應(yīng)才能成功復制,在復制的所有階段都與宿主相互作用,隨著宿主進化出防御病原體的機制,病毒反過來又進化出逃避宿主免疫反應(yīng)的策略。NSP1在拮抗先天免疫中扮演著重要作用,從逃避宿主PRRs的識別,到從各個方面抑制INF通路和NF-κB通路發(fā)揮抗病毒作用,還可抑制細胞過早凋亡,有助于輪狀病毒的復制和感染。關(guān)于NSP1還有許多問題,NSP1具有如此多的功能,但多種不同的宿主蛋白是如何結(jié)合到NSP1 C端同一位點的?仍有待深入探究。其次,VP3在逃避天然免疫的識別中也有著突出貢獻,N端和C端分別發(fā)揮作用,一方面防止病毒RNA被宿主識別,另一方面抑制IFN通路的激活。另外,還有其他蛋白在病毒復制中扮演著不同的角色。了解輪狀病毒與宿主先天免疫的相互作用,才能更好地對抗它們,研制新型抗病毒藥物,減少輪狀病毒給人類帶來的危害。

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