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D-氨基酸氧化酶的分子改造及應(yīng)用研究進展

2021-03-30 00:34居述云吳堅平楊立榮
化工進展 2021年3期
關(guān)鍵詞:殘基氧化酶底物

居述云,吳堅平,楊立榮

(1 浙江大學化學工程與生物工程學院,浙江杭州310027;2 浙江大學杭州國際科創(chuàng)中心,浙江杭州311200)

D- 氨基酸氧化酶(D-amino acid oxidase,DAAO,EC 1.4.3.3)是一類含有黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)的黃素蛋白。有氧條件下,該類酶能夠?qū)τ丑w選擇性催化D-氨基酸氧化脫氫,生成亞胺酸。后者自發(fā)水解生成相應(yīng)的α-酮酸和氨,見圖1。反應(yīng)過程中,還原型輔酶FADH2經(jīng)氧氣再氧化,產(chǎn)生過氧化氫。

圖1 DAAO催化D-氨基酸氧化脫氫反應(yīng)示意圖

迄今為止,已報道的DAAO主要來源于真核生物,如絲狀真菌、酵母菌、哺乳動物等[1]。其中,典型的DAAO 包括豬腎(porcine kidney)來源的pkDAAO[2]、紅酵母(Rhodotorula gracilis)來源的RgDAAO[3]和三角酵母(Trigonopsis variabilis)來源的TvDAAO[4]。此外,在放線菌屬的原核生物中也陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了DAAO[5],例如源自原玻璃蠅節(jié)桿菌(Arthrobacter protophormiae)的ApDAAO。這些不同來源的DAAO 不僅在D-氨基酸代謝過程中發(fā)揮重要作用[6],同時也為該類酶在生物技術(shù)中的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。

DAAO通常具有寬泛的底物譜和高度的對映體選擇性,已被成功用于多種生化反應(yīng)過程,相關(guān)研究引起了國內(nèi)外學者廣泛的關(guān)注[7-8]。多年來,DAAO在生物催化方面的應(yīng)用主要見于7-氨基頭孢烷酸、手性氨基酸以及α-酮酸的合成。最近,研究人員基于該類酶的蛋白結(jié)構(gòu)以及催化機制,通過蛋白質(zhì)工程改造酶的催化性能,使其能夠選擇性催化氧化胺類化合物并用于制備手性胺,不僅成功拓展了底物特異性,而且為后續(xù)以DAAO為蛋白骨架創(chuàng)制新的酶類提供了重要的理論依據(jù)。

本文介紹了DAAO的蛋白結(jié)構(gòu)特征及其催化機制,闡述了DAAO底物特異性和熱穩(wěn)定性分子改造的代表性成果。最后,總結(jié)了DAAO在生物催化與轉(zhuǎn)化中的應(yīng)用進展。

1 D-氨基酸氧化酶的結(jié)構(gòu)特征及催化機制

1.1 D-氨基酸氧化酶的蛋白結(jié)構(gòu)特征

到目前為止,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(protein data bank,PDB)中已披露的DAAO 登錄號共有39 個,包括4 個RgDAAO[9-10]、16 個pkDAAO[11-12]以及19 個人體來源的hDAAO[13]。這些結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)都是基于X 射線晶體衍射技術(shù)而獲得,分辨率在1.2~3.2?(1?=10-10m)。

RgDAAO、pkDAAO和hDAAO蛋白分子量大小相近,單個亞基所含有的氨基酸數(shù)目分別為368、347 和347,見表1。序列比對結(jié)果表明,pkDAAO(或hDAAO) 與RgDAAO 的序列一致性分別為28.73%(或27.73%)。

雖然RgDAAO、pkDAAO 和hDAAO 的氨基酸序列具有一定的差異,但在三維結(jié)構(gòu)上卻頗為相似[14-15]。一般而言,它們均為同源二聚體,每一個亞基都含有一個非共價結(jié)合的輔酶FAD。催化活性中心處與配體相互作用的氨基酸殘基具有高度的保守性。例如,在RgDAAO 與D-三氟丙氨酸的復合體晶體結(jié)構(gòu)(PDB登錄號:1C0L[9])中,D-三氟丙氨酸的α-羧基與R285位的精氨酸殘基以及Y223位的酪氨酸殘基相互作用,形成了鹽橋和氫鍵,見圖2(a)。pkDAAO與苯甲酸(PDB登錄號:1VE9[12])[見圖2(b)]以及hDAAO與2-氨基苯甲酸(PDB登錄號:2E4A[13])[見圖2(c)]的復合體晶體結(jié)構(gòu)解析結(jié)果表明,與配體羧基作用的正是R283 位的精氨酸殘基以及Y228 位的酪氨酸殘基。此外,配體的取代基團都朝向由疏水性氨基酸殘基(如苯丙氨酸、甲硫氨酸、異亮氨酸、亮氨酸等)形成的口袋。DAAO蛋白晶體結(jié)構(gòu)的解析不僅有利于該類酶催化機制的研究,而且為后續(xù)蛋白質(zhì)工程改造酶的催化性能提供了重要的理論支撐。

1.2 D-氨基酸氧化酶的催化機制

Walsh 等[16]和Hersh 等[17]早 期 針 對DAAO 催 化的氧化脫氫反應(yīng),分別提出了“負碳離子”和“Cα-H氫轉(zhuǎn)移”機制。隨著pkDAAO和RgDAAO的蛋白結(jié)構(gòu)相繼被解析,目前普遍認可的是“氫轉(zhuǎn)移”機制[9,18]。DAAO 利用輔酶FAD 在底物和O2之間進行電子和氫的轉(zhuǎn)運(見圖3),所催化的氧化脫氫反應(yīng)由兩個半反應(yīng)組成。①還原半反應(yīng),底物進入DAAO 的活性中心后,以兼性離子的狀態(tài)與活性中心底物結(jié)合口袋處的氨基酸殘基相互作用,形成氫鍵、離子鍵等。這種狀態(tài)會發(fā)生動態(tài)平衡,底物Cα上的氫轉(zhuǎn)移到輔酶FAD 異咯嗪環(huán)的N(5)上,而氨基上的一個氫則釋放到反應(yīng)體系中,從而形成亞胺酸。該化合物不穩(wěn)定,自發(fā)水解生成相應(yīng)的α-酮酸和氨。②氧化半反應(yīng),還原型輔酶被O2氧化,生成過氧化氫。整個反應(yīng)過程中,活性中心處的氨基酸殘基并沒有直接參與催化反應(yīng),僅僅與底物的結(jié)合及其保持正確定向有關(guān)[7,9,19]。

表1 RgDAAO、pkDAAO和hDAAO的基本性質(zhì)比較

圖2 RgDAAO、pkDAAO和hDAAO分別與不同配體相互作用的二維平面圖

圖3 DAAO催化D-氨基酸氧化脫氫的反應(yīng)機制示意圖

2 D-氨基酸氧化酶的蛋白質(zhì)工程

2.1 D-氨基酸氧化酶底物特異性的分子改造

2.1.1 基于理性設(shè)計改變底物結(jié)合口袋處關(guān)鍵氨基酸殘基的帶電性質(zhì)

RgDAAO 的底物特異性偏好中性或堿性D-氨基酸。為提高該酶對酸性氨基酸的催化活力,Pollegioni 等[20]將D-天冬氨酸(1,見表2)分別與牛腎來源D-天冬氨酸氧化酶DASPO(同源模建)和RgDAAO(PDB 登錄號:1C0L)進行分子對接,選取底物結(jié)合口袋處的M213進行定點突變。結(jié)果表明M213 位甲硫氨酸殘基對于RgDAAO 正確識別D-天冬氨酸側(cè)鏈基團中帶負電荷的羧基具有重要影響,而在DASPO 模擬結(jié)構(gòu)中,與之相對應(yīng)的是側(cè)鏈基團帶正電荷的精氨酸殘基。當甲硫氨酸被精氨酸取代后,突變體M213R對D-天冬氨酸(1)和D-谷氨酸(2)的催化效率(kcat/Km值)分別是原始酶的74倍和37倍,而對D-丙氨酸(3)的催化效率卻顯著降低。

近年來,Asano 等[21]通過分析苯甲酸與pkDAAO的復合物晶體結(jié)構(gòu),選取與苯甲酸的羧基形成鹽橋的R283作為定點飽和突變位點。當R283位側(cè)鏈基團帶正電荷的精氨酸殘基突變?yōu)椴粠щ姾傻母拾彼釟埢鶗r,突變體R283G 轉(zhuǎn)變成了具有嚴格(R)-構(gòu)型選擇性的胺氧化酶,能夠?qū)τ丑w選擇性識別(R)-α-苯乙胺(9),同時喪失了對天然底物D-苯丙氨酸的催化活力,從而將pkDAAO的底物特異性由氨基酸拓展到了胺類化合物。

上述研究表明,DAAO底物結(jié)合口袋處關(guān)鍵氨基酸殘基的帶電性質(zhì)能夠顯著影響該酶對底物的識別能力。因此,對這些位點進行改造可以進一步拓展DAAO的底物特異性。

2.1.2 基于理性設(shè)計改變底物結(jié)合口袋處關(guān)鍵氨基酸殘基側(cè)鏈基團的大小

Pollegioni等[22]基于已有的RgDAAO晶體結(jié)構(gòu)和虛擬篩選,發(fā)現(xiàn)M213位氨基酸殘基側(cè)鏈基團的大小顯著影響該酶對大位阻底物的催化活力。當M213 位側(cè)鏈基團較大的甲硫氨酸突變?yōu)檩^小的甘氨酸時,疏水性底物結(jié)合口袋的空間變大,突變體M213G對于D-1-萘基丙氨酸(4)和D-1-萘基甘氨酸(6)的催化效率相較于原始酶分別提高了8.4 倍和10.5倍。此外,對于結(jié)構(gòu)剛性較大的苯甘氨酸類衍生物(5)和(7),該突變體的催化效率也有不同程度的提高[23]。

Asano 等[21]在pkDAAO 突變體R283G 的基礎(chǔ)之上,對與苯甲酸羧基相互作用的另一位點Y228 進行突變。其中,突變體Y228L/R283G 對(R)-9 的催化活力提高到了21.5U/mg。蛋白晶體結(jié)構(gòu)解析結(jié)果表明在輔酶FAD 二甲苯環(huán)的旁邊產(chǎn)生了一個疏水口袋,從而有足夠的空間能夠容納(R)-9 的苯環(huán)。盡管底物特異性發(fā)生了改變,突變體Y228L/R283G依然通過α-質(zhì)子氫轉(zhuǎn)移機制來進行氧化脫氫反應(yīng)[24]。底物(R)-9 的Cα原子上的氫(α-質(zhì)子)更靠近輔酶FAD 的N(5)原子,而(S)-9 的α-質(zhì)子則朝向Y224,從而使得(R)-構(gòu)型底物的氧化脫氫反應(yīng)更容易進行。第一性原理計算結(jié)果表明,突變體Y228L/R283G 與(R)-9 的相互作用能比(S)-9 的相互作用能強達13kcal/mol(1kcal/mol=4.1840kJ/mol)。這些差異導致突變體Y228L/R283G 能夠特異性識別外消旋體中的(R)-構(gòu)型胺類化合物[25]。該課題組同時也發(fā)現(xiàn)pkDAAO 突變體Y228L/R283G 活性中心處F242 位氨基酸殘基側(cè)鏈基團的大小顯著影響該酶對較大位阻底物的催化活力,見表2。當該位點的苯丙氨酸突變?yōu)閭?cè)鏈基團較小的異亮氨酸時,活性中心處形成了更大的疏水口袋,突變體Y228L/R283G/F242I 對(R)-1-(2-萘基)-乙胺(10)的催化活力達4U/mg,催化效率相較于突變體Y228L/R283G 提高了0.6 倍[25]。雖然突變體Y228L/R283G 能夠催化氧化(R)-9 和(R)-10,但對于具有更大取代基的底物4-氯-二苯甲胺(11)卻沒有催化活力。Asano 等[26]根據(jù)已有的突變體Y228L/R283G晶體結(jié)構(gòu)以及構(gòu)效關(guān)系分析,推測活性中心處L51、I215和I230位氨基酸殘基可能在該酶催化大位阻底物氧化脫氫的反應(yīng)過程中起重要作用。因此,分別以突變體R283G 和Y228L/R283G 作為親本,對上述三個位點進行定點飽和突變。突變體I230A/R283G 對 rac-11 的催化效率最高(122.7mmol/L·min),并且具有嚴格(S)-對映體選擇性,見表2。

表2 DAAO底物特異性改造的代表性成果

續(xù)表2

由此可見,DAAO底物結(jié)合口袋的大小受關(guān)鍵氨基酸殘基側(cè)鏈基團空間位阻的影響。利用具有較小側(cè)鏈基團的氨基酸代替大位阻側(cè)鏈基團的氨基酸殘基,可以有效擴大底物結(jié)合口袋,增強酶與底物的相互作用,進而提高該類酶的催化活力。

2.1.3 基于理性設(shè)計改變底物結(jié)合口袋處氨基酸殘基的極性

到目前為止,TvDAAO的蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)還未有報道。因此,通過同源建模獲得較為可靠的三維模型,考察酶與底物的相互作用,在此基礎(chǔ)上進行突變,可以獲得具有目標性能的突變體。

為進一步提高TvDAAO 對頭孢菌素C(8)的催化活力,Wong 等[27]基于底物8 與TvDAAO(同源模建)的分子對接結(jié)果,選取底物結(jié)合口袋處鄰近底物氨基的F54 位苯丙氨酸殘基作為定點突變位點。當疏水性苯丙氨酸殘基變?yōu)闃O性相對較大的酪氨酸殘基時,側(cè)鏈基團中的酚羥基與底物8的氨基形成了氫鍵,穩(wěn)定了底物在結(jié)合口袋處的構(gòu)象,突變體F54Y 對底物8 的催化效率相較于原始酶提高了1倍。

2.1.4 基于定向進化改變非底物結(jié)合口袋處的氨基酸殘基

理性設(shè)計主要基于酶與底物相互作用的氨基酸殘基而展開改造工作。此外,通過定向進化,可以發(fā)掘一些非活性中心處的氨基酸殘基對DAAO底物特異性的影響。

除上述疏水性底物結(jié)合口袋處的氨基酸殘基以外,Sacchi 等[28]通過易錯PCR 構(gòu)建了隨機突變體庫,結(jié)合過氧化物酶/鄰聯(lián)茴香胺介導的顯色法,進行高通量篩選。結(jié)果表明:位于RgDAAO 蛋白表面的L118,T60 以及Q144 位氨基酸殘基能夠顯著影響該酶的催化活力,見表2。例如,突變體L118H對底物3和1的催化效率分別是原始酶的1.9倍和2 倍。突變體T60A/Q144R/K152E 對1 的催化效率是原始酶的5.6倍。

2.2 D-氨基酸氧化酶熱穩(wěn)定性的分子改造

酶的熱穩(wěn)定性是影響生物催化反應(yīng)的重要因素。Bakke 等[29]通過易錯PCR 建立突變體庫,利用過氧化物酶/4-氨基安替比林介導的顯色反應(yīng)進行高通量篩選,獲得了熱穩(wěn)定性顯著提高的pkDAAO。55℃條件下孵育1h 后,突變體F42C 對(R)-3的殘余酶活達70%以上,而原始酶僅為10%。此外,2.1.3 節(jié)中通過理性設(shè)計獲得的突變體TvDAAO F54Y 不僅提高了該酶對底物8 的催化活力,而且也增強了熱穩(wěn)定性。55℃條件下保溫30min,突變體F54Y 對8 的殘余活力幾乎沒有影響,而原始酶卻喪失了40%。

3 D-氨基酸氧化酶在生物催化中的應(yīng)用

3.1 D-氨基酸氧化酶介導的兩步酶法催化合成7-氨基頭孢烷酸

7-氨基頭孢烷酸(14)是制備半合成頭孢菌素類抗生素的前體化合物。自20 世紀90 年代以來,以DAAO 和戊二?;?7-氨基頭孢烷酸?;笧樯锎呋瘎殉晒⒘藘刹矫阜ù呋D(zhuǎn)化頭孢菌素C(8)合成14 的生產(chǎn)工藝(見圖4),并進行了工業(yè)化生產(chǎn)[30]。在此過程中,DAAO催化8的D-α-氨基己二?;鶊F氧化脫氫生成α-酮己二酰-7-氨基頭孢烷酸(12),后者經(jīng)脫羧反應(yīng)轉(zhuǎn)化成戊二酰-7-氨基頭孢烷酸(13)。最終,?;复呋?3進行脫?;磻?yīng)生成產(chǎn)物14[31-32]。

3.2 D-氨基酸氧化酶催化合成手性氨基酸和胺類化合物

手性氨基酸和胺類化合物是合成眾多醫(yī)藥、農(nóng)藥等高值化學品的前體化合物。例如,以(S)-1,2,3,4-四氫異喹啉-1-甲酸(16)為底物,經(jīng)多步化學反應(yīng),可合成一種靶向Keap1-Nrf2 相互作用的小分子抑制劑,從而有望用于癌癥、糖尿病等疾病的治療和預防[33]。(S)-1,2,3,4-四氫異喹啉-3-甲酸(17)是降壓藥喹那普利的重要組成部分[34],L-2-氨基丁酸(21)是抗癲癇藥物左乙拉西坦的前體化合物[35]。利用D-氨基酸氧化酶介導的去消旋化反應(yīng)制備該類化合物具有外消旋底物來源簡單、底物譜廣泛、反應(yīng)對映體選擇性高、反應(yīng)條件溫和等顯著特點。到目前為止,該方法主要有兩種反應(yīng)方式:①化學-酶法去消旋化;②多酶催化氧化還原級聯(lián)去消旋化。

圖4 兩步酶法合成7-氨基頭孢烷酸

3.2.1 化學-酶法去消旋化

DAAO 介導的化學-酶法去消旋化包含兩步反應(yīng)。①選擇性生物催化反應(yīng):以外消旋氨基酸或胺為底物,利用氧化酶選擇性催化其中的一個構(gòu)型進行Cα-N 鍵氧化脫氫反應(yīng)生成亞胺,另一構(gòu)型保持不變。②非選擇性化學還原反應(yīng):亞胺被非選擇性化學還原劑轉(zhuǎn)化為外消旋底物。兩步反應(yīng)在“一鍋”反應(yīng)體系中高效協(xié)同進行,見圖5。亞胺(特別是鏈狀亞胺)在水溶液中通常不穩(wěn)定,易水解開環(huán)生成醛(酮)和胺。因此,反應(yīng)需加入過量化學還原劑,如硼氫化鈉(NaBH4)[36]、氰基硼氫化鈉(NaCNBH3)[37]、氨硼烷(NH3·BH3)[38]等,以確保亞胺能夠直接轉(zhuǎn)化為外消旋底物,盡可能避免副產(chǎn)物(如酮或醇)的生成。

Chen 等[39]利用硅藻土固定化的TvDAAO 和NH3·BH3(10個當量)進行去消旋化反應(yīng),制備糖尿病藥物合成中間體(S)-α-氨基-6-(2-甲基苯)3-吡啶丙酸(15),產(chǎn)率為68%,ee值>99%。本文作者所在課題組[40]以來源于茄病鐮刀菌(Fusarium solani)M-0718 的FsDAAO 作為生物催化劑,構(gòu)建了“一鍋法”FsDAAO-NH3·BH3(4 個當量)去消旋化反應(yīng)體系,將外消旋四氫異喹啉羧酸類化合物轉(zhuǎn)化成了(S)-對映體,轉(zhuǎn)化率達98%以上,產(chǎn)率達82%,ee 值>99%。Asano 等[21]利用pkDAAO Y228L/R283G 和NaBH4(20 個當量)進行去消旋化反應(yīng),(R)-9完全轉(zhuǎn)化為(S)-對映體,產(chǎn)率為65%,ee值達99%。底物為rac-11 時,以pkDAAO I230A/R283G作為生物催化劑進行去消旋化反應(yīng),產(chǎn)物(R)-11的產(chǎn)率為46%,ee值為96%[26]。

該方法通常只需要一種氧化還原酶參與反應(yīng),并且所用化學還原劑來源簡單。不足之處在于反應(yīng)過程中通常需要加入過量的化學還原劑,不利于環(huán)境友好。反應(yīng)結(jié)束后,需要額外的分離純化步驟,用于除去剩余的化學還原劑,導致最終的產(chǎn)率有所下降。

3.2.2 多酶催化氧化還原級聯(lián)去消旋化

多酶催化氧化還原級聯(lián)去消旋化反應(yīng)是在上述D-氨基酸氧化酶介導的選擇性生物催化反應(yīng)的基礎(chǔ)上,利用生物催化不對稱還原反應(yīng)來代替非選擇性化學還原反應(yīng),從而將外消旋底物(通常為氨基酸及其衍生物)轉(zhuǎn)化成單一構(gòu)型的產(chǎn)物。當?shù)孜餅殒湢畎被釙r,其氧化脫氫產(chǎn)物亞胺酸通常不穩(wěn)定,易自發(fā)水解生成酮酸。后者可在氨基酸脫氫酶或者轉(zhuǎn)氨酶的催化下,進行不對稱還原胺化反應(yīng),見圖6。

Findrik 等[41]利 用 ApDAAO 和 紅 球 菌 屬(Rhodococcus sp.) 來源的L-苯丙氨酸脫氫酶(L-PheDH) 進行生物催化級聯(lián)反應(yīng),將D-甲硫氨酸(18)幾乎全部轉(zhuǎn)化成了L-甲硫氨酸。Chen等[39]以TvDAAO 和脲芽孢八疊球菌(Sporosarcina ureae)來源的(S)-選擇性氨基酸脫氫酶(AADH)作為催化劑進行去消旋化反應(yīng),產(chǎn)物(S)-15的最終分離產(chǎn)率為54%,ee 值>99%。此外,該作者也利用伯克霍爾德菌(Burkholderia sp.)來源的(S)-選擇性轉(zhuǎn)氨酶(TA)替代上述氨基酸脫氫酶,進行“一鍋法”去消旋化反應(yīng),產(chǎn)物(S)-15 的產(chǎn)率達73%,ee值>99%。Qi 等[42]以外消旋氨基酸為底物,利用TvDAAO 與谷氨酸棒狀桿菌(Corynebacterium glutamicum)來源的亮氨酸酸脫氫酶(CgLeuDH)進行“一鍋法”去消旋化反應(yīng),制備L-氨基酸。通過批次補料,反應(yīng)體系中產(chǎn)物L-正纈氨酸(19)的濃度達54.09g/L,轉(zhuǎn)化率>96%,ee 值>99%。Green等[43]利用RgDAAO和大腸桿菌來源轉(zhuǎn)氨酶EcgabT進行去消旋化反應(yīng),將DL-草銨膦(20)轉(zhuǎn)化成了L-草銨膦,轉(zhuǎn)化率達85%,ee 值>99%。Seo 等[44]在兩相體系中,利用表達VHb-RgDAAO 融合蛋白的全細胞與表達河流孤菌(Vibrio fluvialis)來源ω-轉(zhuǎn)氨酶(VfTA)的全細胞進行“一鍋法”去消旋化反應(yīng),將底物rac-21 (500mmol/L)轉(zhuǎn)化成了(S)-21,轉(zhuǎn)化率達97%,ee 值>99%。Liu 等[45]以基因組上攜帶有TvDAAO 和L-PheDH 基因的釀酒酵母作為宿主細胞,將前體化合物DL-甲硫氨酸經(jīng)L-甲硫氨酸轉(zhuǎn)化成了S-腺苷-L-甲硫氨酸,產(chǎn)物積累量達10.3g/L。

不同于上述鏈狀亞胺酸,環(huán)狀亞胺酸在水溶液中較為穩(wěn)定,可被(S)-選擇性還原酶直接轉(zhuǎn)化為(S)-構(gòu)型環(huán)狀氨基酸,見圖7。例如,Yasuda 等[46]以外消旋哌啶酸(22)為底物,利用pkDAAO 與惡臭假單胞菌(Pseudomonas putida)KT2440 來源的還原酶PpDpkA 進行去消旋化反應(yīng),產(chǎn)物為(S)-22,轉(zhuǎn)化率和ee 值均>99%。本文作者課題組[47]基于反應(yīng)可行性及兼容性評估,成功耦合FsDAAO催化的對映體選擇性氧化脫氫反應(yīng)和PpDpkA介導的不對稱還原反應(yīng),構(gòu)建了“一鍋法”多酶級聯(lián)去消旋化反應(yīng)體系,將底物rac-16轉(zhuǎn)化成了(S)-對映體,產(chǎn)率為89%,ee值>99%。相較于化學-酶法去消旋化反應(yīng),該反應(yīng)體系中的亞胺酸被直接轉(zhuǎn)化成了目標手性化合物,從而使得整個去消旋化反應(yīng)效率更高,并且反應(yīng)結(jié)束后,分離純化步驟簡單,產(chǎn)物的收率更高。不足之處在于具有相反對映體選擇性的氧化還原酶篩選困難,需要優(yōu)化獲得合適的反應(yīng)條件,以確保整個去消旋化反應(yīng)高效協(xié)同進行。

3.3 D-氨基酸氧化酶催化合成α-酮酸

圖7 DAAO介導的多酶催化級聯(lián)去消旋化制備手性環(huán)狀氨基酸

作為一種重要的化工原料,α-酮酸綠色高效的合成方法是近年來的熱點研究內(nèi)容之一。DAAO催化D-氨基酸氧化脫氫是合成相應(yīng)α-酮酸的重要途徑。例如,Orrego 等[48]以外消旋氨基酸為底物,利用霍亂弧菌(Vibrio cholera)來源的氨基酸消旋酶BsrV 將L-氨基酸轉(zhuǎn)化成D-氨基酸,后者經(jīng)TvDAAO 催化生成α-酮酸(23~25),轉(zhuǎn)化率>99%,見圖8。該方法的優(yōu)勢在于反應(yīng)效率高,環(huán)境友好,并且避免了使用價格昂貴的D-氨基酸作為原料。然而,相較于L-氨基酸氧化酶或氨基酸脫氨酶催化的“一步法”合成α-酮酸[49-52],該三酶體系仍然較為復雜。

圖8 DAAO催化合成α-酮酸

4 結(jié)語

DAAO作為一種重要的生物催化劑,已成功用于制備7-氨基頭孢烷酸、手性氨基酸和胺類化合物等過程?;钚灾行奶幣c底物相互作用的氨基酸殘基主要與底物的正確定向有關(guān)。目前DAAO的分子改造工作也主要基于該處關(guān)鍵氨基酸殘基的突變而展開,相關(guān)成果加深了該酶構(gòu)效關(guān)系的理解。然而,到目前為止,能夠滿足生物合成需求的DAAO種類仍然相對較少,底物范圍主要集中于頭孢菌素C 和結(jié)構(gòu)較為簡單的D-氨基酸及其衍生物。后續(xù)的研究工作或許可以從以下三方面展開。

(1)挖掘具有不同底物特異性的DAAO,解析蛋白結(jié)構(gòu),結(jié)合計算化學闡明其對映體選擇性及底物識別的分子機制。

(2)基于理性設(shè)計,對該類酶進行分子改造,以期獲得能夠催化不同非天然底物的突變體。此外,目前可用于生物催化過程的L-氨基酸氧化酶仍然稀少,如能翻轉(zhuǎn)現(xiàn)有DAAO 的對映體選擇性,使其能夠催化氧化L-氨基酸及其衍生物,必將擴大該類酶的應(yīng)用范圍。

(3)設(shè)計新穎的化學-酶或多酶耦合催化體系,以挖掘或改造獲得的DAAO作為催化劑,從而實現(xiàn)功能化學品生物催化合成新途徑的構(gòu)建。

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