陳美晴 陳 俊 蔣君梅 王營鍇 屈志廣 方遠鵬 任明見 謝 鑫
(1貴州大學(xué)農(nóng)學(xué)院,貴州 貴陽 550025;2國家小麥改良中心貴州分中心,貴州 貴陽 550025)
高粱[Sorghum bicolor(L.) Moench]是一種重要的耐旱禾本科植物,在中國已有近兩千年的種植歷史[1-2],是我國最早栽培種植的禾谷類作物之一。高粱具有較強的抗旱、耐澇、抗鹽堿的抗逆境特性和對環(huán)境的強適應(yīng)性,屬于高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的作物,也是飼料、釀酒、生產(chǎn)生物燃料以及造紙的重要原料[3-5]。但近年來,隨著種植規(guī)模的不斷擴大,各種病害對高粱的危害也越來越嚴重[6-7]。研究表明,植物可以通過啟動其抗病基因,改變體內(nèi)的生理生化途徑來抵抗病原菌的侵染[8-11]。因此,運用分子生物學(xué)技術(shù)對高粱重要抗病基因進行研究,對培育優(yōu)良高粱抗病品種具有重要意義。
SGT1(suppressor of G-Two allele of skp1)基因最早在酵母中發(fā)現(xiàn)[12]。研究報道,SGT1 基因起著正調(diào)控植物抗病性的作用[13]。SGT1 基因沉默或突變會導(dǎo)致多種植物R基因介導(dǎo)抗病性的喪失,相反,超表達SGT1 基因則會增強植物的抗病性[13-15]。此外,SGT1還參與調(diào)控植物的非宿主抗性[16-19]。同時,SGT1 是植物抗病反應(yīng)過程中的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控基因和防衛(wèi)反應(yīng)信號中的重要組件[20]。植物SGT1 蛋白的氨基酸序列包含5 個結(jié)構(gòu)域:1 個重復(fù)結(jié)構(gòu)域TPR、2 個可變區(qū)(VR1 和VR2)、1 個CS 基元以及1 個SGS 基元,其中TPR、CS、SGS 為保守區(qū)域。目前,人們已在水稻[21]、擬南芥[22-23]、大豆[24]、甘薯[25]、煙草[26]、中間偃麥草[27]、茄子[28]、甘藍[29]、小麥[30]等植物中克隆了SGT1 基因,但鮮見SGT1 基因在高粱中研究報道。
本研究在高粱品種BTx236 中克隆得到1 個SGT1基因,并將其命名為SbSGT1。通過對SbSGT1 序列進行生物信息學(xué)系統(tǒng)分析,構(gòu)建其原核表達載體pET-28a-SbSGT1,對蛋白可溶性表達條件進行優(yōu)化,并采用Western blot 對所表達的蛋白進行鑒定,以期為抗病高粱品種改良提供參考。
1.1.1 供試植物 高粱品種BTx623,由中國科學(xué)院植物研究所景海春老師饋贈。取健康的高粱種子于室溫下在清水中浸泡24 h 催芽,然后將其播種于滅菌營養(yǎng)土中,25℃光照/黑暗交替12 h 培養(yǎng)10 d。取整株材料用液氮速凍,置于-80℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.1.2 菌株和質(zhì)粒 大腸桿菌BL21(DE3)、JM109(DE3)和Rosetta(DE3)感受態(tài)細胞均購自上海唯地生物技術(shù)有限公司;中間載體pEASY-Blunt 購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細胞,原核表達載體pET-28a 由貴州大學(xué)植物病理教研室保存。
1.1.3 試劑、酶及抗體 RNA 提取試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒購自普洛麥格(北京)生物技術(shù)有限公司;蛋白質(zhì)分子量標準品購自賽默飛世爾科技(中國)有限公司;異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷 (isopropyl-beta- Dthiogalactopyranoside,IPTG)以及聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodeylsulphate polyacylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)有關(guān)試劑(過硫酸銨、四甲基乙二胺、丙烯酰胺、亞甲基雙丙烯胺)均購自生工生物工程(上海)股份有限公司;FastPfu 高保真酶購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;限制性內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶等均購自賽默飛世爾科技(中國)有限公司;一抗Anti His 和二抗Goat Anti-Mouse IgG(H+L)-HRP 購自北京華大蛋白質(zhì)研發(fā)中心有限公司。
1.2.1 高粱總RNA 提取及cDNA 的合成 取保存的高粱BTx623 品種材料,利用RNA 提取試劑盒提取苗期總RNA,并在RNA 中加入適量DNase Ⅰ消化RNA中殘留的DNA,參考Promega 反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書,以總RNA 為模板反轉(zhuǎn)錄得到cDNA。
1.2.2SbSGT1 基因的克隆 根據(jù)已報道的水稻SGT1 基因(基因號為LOC_Os01g43540)的蛋白序列,利用BLASTP 搜索高粱基因組數(shù)據(jù)庫(https:/ /phytozome)找到高粱同源基因SbSGT1(基因號為Sb03g028430)。根據(jù)其核酸序列設(shè)計引物,以SbSGT1-F: GCGAATTCATGGCCGCGTCGGATCT(下劃線為限制性核酸內(nèi)切酶EcoRⅠ酶切位點)和SbSGT1-R: CGCTCGAGTTAGTATTCCCACTTCTTGAGCT(下劃線為限制性核酸內(nèi)切酶XhoⅠ酶切位點)為引物對SbSGT1 基因進行擴增。
PCR 反應(yīng)體系(50 μL): FastPfu Fly DNA Polymerase 1 μL、5×buffer 10 μL、2.5 mmol·L-1dNTPs 4 μL、cDNA 模板1 μL、10 μmol·L-1上下游引物各1 μL,ddH2O 32 μL。PCR 擴增程序:95℃預(yù)變性2 min,95℃變性20 s,58℃退火20 s,72℃延伸1 min,循環(huán)35次。采用1%瓊脂糖對PCR 產(chǎn)物進行檢測。PCR 產(chǎn)物經(jīng)切膠回收、純化后,連接到pEASY-Blunt 克隆載體。連接產(chǎn)物通過熱激法轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細胞,轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂布于含有抗生素的LB(Luria-Bertani)平板上,37℃過夜培養(yǎng)后,挑選單克隆送至北京擎科生物科技有限公司測序。
1.2.3 序列的生物信息學(xué)分析 在 NCBI 的Genebank 數(shù)據(jù)庫中下載SGT1 相關(guān)物種的同源序列,利用DNAMAN 軟件中的Homology Tree 構(gòu)建不同植物的SGT1 蛋白系統(tǒng)進化樹,并將這些物種的同源SGT1蛋白進行氨基酸序列比對;采用Protparam(http:/ /web.expasy.org/protparam/)預(yù)測SbSGT1 蛋白的基本理化性質(zhì);利用Protscale (http:/ /web. expasy. org/protscale/)預(yù)測SbSGT1 蛋白的親水性及疏水性;使用在線網(wǎng)站(http:/ /www.softberry.com/cgi-bin/programs/proloc/protcompan.pl)進行蛋白的亞細胞定位。分別使用MLRC(https:/ /npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/secpred_mlr.pl)和SWISS-MODEL(http:/ /swissmodel. expasy.org/)預(yù)測SbSGT1 蛋白的二、三級結(jié)構(gòu);采用TMHMM Server(http:/ /www. cbs.dtu.dk/services/)對SbSGT1蛋白質(zhì)跨膜區(qū)進行預(yù)測分析。
1.2.4 pET-28a-SbSGT1 重組質(zhì)粒的構(gòu)建 以1.2.2中擴增正確的SbSGT1 基因為模板,采用酶切連接的方法進行重組載體的構(gòu)建。酶切體系(50 μL):10×buffer 5 μL、EcoRⅠ1 μL、XhoⅠ1 μL、質(zhì)粒5 μL(約1 μg),ddH2O 38 μL。酶切產(chǎn)物經(jīng)電泳鑒定,用瓊脂糖凝膠試劑盒回收?;厥蘸蟮漠a(chǎn)物通過T4 DNA 連接酶連接到經(jīng)相同雙酶切的pET-28a 表達載體中,16℃連接16 h,構(gòu)建pET-28a-SbSGT1 重組質(zhì)粒。
1.2.5 高粱SbSGT1 蛋白的可溶性表達 首先通過熱激法將重組質(zhì)粒pET-28a-SbSGT1 分別轉(zhuǎn)化到大腸桿菌表達菌株BL21(DE3)、JM109(DE3)和Rosetta(DE3)中,以0.8 mmol·L-1IPTG、25℃、10 h 誘導(dǎo)表達。收集6 mL 菌液,12 000 r·min-1離心2 min,向菌體加入400 μL 裂解液[50 mmol·L-1Tris(pH 值7.5)、1 mmol·L-1EDTA、100 mmol·L-1NaCl、1 mg·mL-1lysozyme、1% Triton X-100 以及蛋白酶抑制劑],用超聲破碎儀(vex130,美國Sonics 公司)進行細胞破碎,12 000 r·min-1離心10 min,分別取上清和沉淀,加入5×Loading Buffer(上樣緩沖液) 煮沸5 min,12 000 r·min-1離心2 min,取上清液用12% SDS-PAGE 電泳檢測目標蛋白的表達情況,從而確定最佳表達菌株。同時分析不同誘導(dǎo)溫度(16、20、25、30、37℃)、IPTG 濃度(0.4、0.6、0.8、1.0 mmol·L-1)對上述最佳表達菌株SbSGT1 蛋白表達的影響。
1.2.6 重組蛋白的Western blot 檢測 采用濕法轉(zhuǎn)印進行Western blot 試驗,具體步驟如下:原核表達的高粱SbSGT1 蛋白樣品經(jīng)過SDS-PAGE 電泳、聚偏氟乙烯膜(polyvinylidene fluoride,PVDF)轉(zhuǎn)膜后,用5%的脫脂奶粉封閉2 h,用Anti His 抗體室溫孵育2 h,隨后用1 × 吐溫20 磷酸鹽緩沖液(phosphate buffered solution tween-20,PBST)緩慢洗滌4 次,每次5 min;加入二抗室溫孵育1 h,1×PBST 緩慢洗滌4 次,每次5 min,棄去二抗;在PVDF 膜上加入辣根過氧化物酶(horseradish peroxidase,HRP)化學(xué)發(fā)光底物液,在天能5200 化學(xué)發(fā)光檢測儀(上海天能科技有限公司)上檢測蛋白表達信號。
以高粱BTx623 幼苗總RNA 反轉(zhuǎn)錄的cDNA 為模板,以高粱基因組數(shù)據(jù)庫(https:/ /phytozome) 的SbSGT1 基因序列為參考,用Primer Premier 5.0 設(shè)計的SbSGT1-F/SbSGT1-R 引物對進行PCR 擴增,擴增得到序列為1 095 bp 的目的基因,共編碼364 個氨基酸。采用1%瓊脂糖凝膠電泳對獲得的PCR 產(chǎn)物進行檢測,得到的條帶大小與數(shù)據(jù)庫中的一致(圖1)。
圖1 SbSGT1 基因的PCR 擴增Fig.1 PCR amplification of SbSGT1 gene
2.2.1 SbSGT1 蛋白質(zhì)序列同源性分析 在NCBI 比對下載SGT1 在其他物種的同源序列,與高粱SbSGT1 進行序列同源性分析。由圖2可知,SbSGT1 與玉米(Zea mays)同源性為94.87%,與水稻(Oryza sativa)的同源性為85.75%,與大麥(Hordeum vulgare) 的同源性為83.24%,與小麥(Triticum aestivum) 的同源性為81.82%,說明SGT1 在這幾種植物中都相對保守。
圖2 SbSGT1 與其他物種的同源氨基酸序列比對Fig.2 Amino acids alignment between SbSGT1 and other species
2.2.2 SbSGT1 基因系統(tǒng)進化樹分析 為進一步研究SbSGT1 與其他植物SGT1 的進化關(guān)系,使用DNAMAN軟件中的Homology Tree 構(gòu)建不同植物的SGT1 系統(tǒng)進化樹,結(jié)果表明,SbSGT1 與玉米的親緣關(guān)系最接近,為95%,與水稻的親緣關(guān)系也較接近,為86%,與麥類的親緣關(guān)系為84%,暗示與其具有相近或者相似的功能;而該基因與馬鈴薯、蓖麻、胡楊等其他植物的親緣關(guān)系較遠(圖3)。
圖3 SbSGT1 與其他物種的SGT1 系統(tǒng)進化樹Fig.3 Phylogenetic tree of SbSGT1 and other species SGT1
2.2.3 SbSGT1 蛋白的基本理化性質(zhì)分析 用Protparam 對SbSGT1 蛋白進行基本理化性質(zhì)分析,由表1可知,SbSGT1 編碼364 個氨基酸,分子量為40 441.52,蛋白質(zhì)理論等電點為5.0,帶負電荷的殘基總數(shù)(Asp +Glu)為65,帶正電荷的殘基總數(shù)(Arg +Lys)為50,該蛋白中酸、堿性氨基酸組成比例和理論等電點顯示兩者均呈弱酸性。不穩(wěn)定指數(shù)為41.19,說明該蛋白不穩(wěn)定;脂溶指數(shù)為69.81,說明該蛋白有較好的脂溶性。用Protparam 分析得到該蛋白的親水性的平均值(grand average of hydropathy,GRAVY)為-0.617,與Protscale 分析結(jié)果一致,該蛋白為親水性蛋白(圖4)。
圖4 SbSGT1 蛋白的親疏水性預(yù)測分析Fig.4 Prediction and analysis of hydrophobicity of SbSGT1 protein
2.2.4 SbSGT1 蛋白的亞細胞定位及二、三級結(jié)構(gòu)分析 用Softberry-Protcomp 分析SbSGT1 蛋白的亞細胞定位,結(jié)果顯示SbSGT1 蛋白可能定位于細胞質(zhì)中。用MLRC 對SbSGT1 蛋白的二級結(jié)構(gòu)進行預(yù)測分析,由圖5可知,SbSGT1 蛋白的二級結(jié)構(gòu)中α 螺旋占43.41%、延伸鏈占10.71%、無規(guī)則卷曲占45.88%。用SWISS-MODEL 預(yù)測SbSGT1 蛋白的三級結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)SbSGT1 與來自擬南芥(Arabidopsis thaliana)的5 型絲氨酸/蘇氨酸蛋白磷酸酶的晶體結(jié)構(gòu)模型覆蓋率為38.14%,三級預(yù)測結(jié)果與二級預(yù)測結(jié)果一致(圖6)。
表1 SbSGT1 蛋白的基本理化性質(zhì)Table1 Basic physical and chemical parameters of SbSGT1 protein
2.2.5 SbSGT1 蛋白信號肽及跨膜區(qū)預(yù)測分析 為確定SbSGT1 蛋白是否存在信號肽,用SignalP 5.0 對其進行預(yù)測。由圖7可知,SbSGT1 蛋白不存在信號肽剪切位點。用TMHMM Server 對SbSGT1 蛋白進行蛋白質(zhì)跨膜區(qū)進行預(yù)測,預(yù)測結(jié)果顯示SbSGT1 蛋白無跨膜區(qū),為非膜蛋白(圖8)。
圖5 SbSGT1 蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig.5 The secondary structure prediction of SbSGT1 protein
將2.1 中PCR 克隆得到的SbSGT1 擴增產(chǎn)物與原核表達載體pET-28a 分別采用EcoRⅠ和XhoⅠ進行酶切,回收酶切產(chǎn)物,將酶切產(chǎn)物進行連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細胞,并進行篩選、鑒定。由圖9可知,pET-28a-SbSGT1 融合表達載體經(jīng)EcoRⅠ/XhoⅠ雙酶切后,得到一條約1 kb 的條帶,表明SbSGT1 已成功構(gòu)建到pET-28a 載體上。
圖6 SbSGT1 蛋白的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig.6 The tertiary structure prediction of SbSGT1 protein
2.4.1 SbSGT1 表達菌株的分析 將重組質(zhì)粒pET-28a-SbSGT1 分別轉(zhuǎn)化到BL21(DE3)、Rosetta(DE3)和JM109(DE3)表達菌株中,37℃培養(yǎng),挑取單菌落進行小量誘導(dǎo)表達,用0.8 mmol·L-1IPTG,在25℃誘導(dǎo)10 h 后,經(jīng)12%SDS-PAGE 檢測,結(jié)果顯示在42 kDa 處有一條明顯條帶(圖10),蛋白大小與預(yù)期一致,說明重組蛋白SbSGT1 在大腸桿菌BL21(DE3)、Rosetta(DE3)和JM109(DE3)中均可以包涵體形式表達(泳道1、3 和5)。但對于SbSGT1 可溶性蛋白的獲得,在JM109(DE3)和Rosetta(DE3)菌株中,只有少量的SbSGT1 可溶性蛋白(泳道2 和4),而在BL21(DE3)菌株中有大量表達(泳道6),因此,選用BL21(DE3)菌株用于后續(xù)表達分析試驗。
圖7 SbSGT1 蛋白信號肽預(yù)測Fig.7 Signal peptide prediction of SbSGT1 protein
圖8 SbSGT1 蛋白跨膜區(qū)預(yù)測Fig.8 Transmembrane region prediction of SbSGT1 protein
2.4.2 溫度對SbSGT1 蛋白表達的影響 將重組質(zhì)粒pET-28a-SbSGT1 轉(zhuǎn)化到BL21(DE3)中,分別在16、20、25、30、37℃條件下對其進行誘導(dǎo)表達,確定最佳誘導(dǎo)溫度。由圖11可知,隨著誘導(dǎo)溫度的升高,SbSGT1 蛋白表達量呈先升高后降低的趨勢,其中在25℃誘導(dǎo)溫度下SbSGT1 蛋白表達量最高(泳道4)。因此,選用誘導(dǎo)溫度25℃用于后續(xù)SbSGT1 蛋白表達分析試驗。
圖9 pET-28a-SbSGT1 重組質(zhì)粒構(gòu)建的電泳圖譜Fig.9 The electrophoresis result of the recombinant expression plasmid of pET-28a-SbSGT1
圖10 SbSGT1 蛋白不同菌株表達分析Fig.10 Protein expression analysis of SbSGT1 in bacterial strains
圖11 不同溫度對SbSGT1 蛋白誘導(dǎo)表達分析Fig.11 SbSGT1 protein expression analysis under different temperatures
2.4.3 不同IPTG 濃度對SbSGT1 蛋白表達的影響將重組質(zhì)粒pET-28a-SbSGT1 轉(zhuǎn)化到BL21(DE3)中,25℃條件下分別在0.4、0.6、0.8、1.0 mmol·L-1IPTG濃度下進行誘導(dǎo)表達,確定最佳誘導(dǎo)濃度。由圖12可知,隨著IPTG 濃度的增大,SbSGT1 蛋白的表達量逐步升高,當IPTG 濃度為0.8 mmol·L-1時,SbSGT1 蛋白表達量最高(泳道4),當濃度為1.0 mmol·L-1時,蛋白表達量無明顯增加(泳道5)。
為進一步確定誘導(dǎo)表達的SbSGT1 蛋白,采用Western blot 對重組蛋白進行檢測。由圖13可知,當用Anti His 抗體對誘導(dǎo)的蛋白進行檢測時,可觀察到一條約42 kDa 的蛋白條帶,且條帶單一,說明成功誘導(dǎo)了His-SbSGT1 蛋白表達。
植物對病原菌的抗病性一直是植物病理學(xué)領(lǐng)域的熱門課題之一。SGT1 基因的發(fā)現(xiàn)使植物抗病機制的研究有了進一步的突破,近期的多項研究都表明SGT1是植物抗病反應(yīng)過程中的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的調(diào)控基因和防衛(wèi)反應(yīng)信號的重要調(diào)控因子[20],其功能是調(diào)節(jié)靶蛋白被26S 蛋白酶體降解[31]。SGT1 首先在酵母中報道[32],隨后在植物和動物中相繼被報道,并且在功能上存在保守性,即SGT1 是泛素連接酶SCF(Skp1-Cullin-FVOX protein)的重要組成[33],該蛋白可以對底物蛋白進行泛素化修飾,進而調(diào)節(jié)底物蛋白的降解。
圖12 不同IPTG 濃度對SbSGT1 蛋白表達的影響Fig.12 SbSGT1 protein expression analysis under different IPTG concentrations
圖13 SbSGT1 蛋白Western blot 檢測Fig.13 Detection of SbSGT1 protein by Western blot
SGT1 基因作為植物中一類重要的抗性基因,其在植物處于非生物脅迫時表達上調(diào),以增強植物的抗逆性。例如,擬南芥HSC70/SGT1 基因協(xié)同作用可減輕γ 射線以及高鹽脅迫造成的損傷[34];甘藍處于高鹽脅迫下,BolSGT1 基因表達量大幅上調(diào)[35]。當植物面對病原菌侵染時,也需要SGT1 的參與,推測SGT1 可能位于抗病信號通路的上游,因而調(diào)控著植物對病原菌的“廣譜抗性”[36]。在大麥中SGT1 與RAR1 蛋白相互作用,參與調(diào)節(jié)大麥對白粉病菌的抗性[37];在擬南芥中SGT1 與RAR1 蛋白、熱激蛋白HSP90 形成復(fù)合體,調(diào)節(jié)R基因介導(dǎo)的抗病反應(yīng)[38]。而高粱中,SbSGT1 能否與調(diào)控其抗病性尚待進一步研究。
白菜BcSGT1 基因編碼蛋白的大小為39 kDa,系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,其與擬南芥AtSGT1b親緣關(guān)系最近[39];花生AdSGT1 基因含有TRP、CS 和SGS 保守結(jié)構(gòu)域,編碼358 個氨基酸,進化分析表明,其與大豆GmSGT1 同源性達到82%,親緣關(guān)系較近[40];簇毛麥Hv-SGT1 基因編碼376 個氨基酸,包含2 個可變結(jié)構(gòu)域VR1、VR2 和1 個SGS,進化分析表明,其與大麥SGT1 同屬1 個分支,親緣關(guān)系最近[41]。本研究顯示,高粱SbSGT1 與玉米親緣關(guān)系最近。由此發(fā)現(xiàn),SGT1在不同植物中的蛋白大小、親緣關(guān)系都有所不同,說明其在進化中存在多樣性。
高粱作為重要的農(nóng)作物和工業(yè)原料,對其抗病機制的研究直接關(guān)系到高粱的產(chǎn)量和品質(zhì)的問題。研究SGT1 是否參與高粱抗病性的調(diào)控,以及研究SGT1 在高粱抗病機制中的互作關(guān)系,對高粱SGT1 的克隆與表達是非常必要的。原核表達是外源蛋白的常用研究方法之一,其表達菌株多為大腸桿菌及其改良菌株,具有表達背景低、操作簡便、成本低、繁殖快以及蛋白表達量高等優(yōu)點[42-44],且大腸桿菌表達系統(tǒng)是目前應(yīng)用范圍最廣的重組蛋白表達系統(tǒng)之一[45]。研究表明,表達菌株、IPTG 濃度和誘導(dǎo)溫度會影響靶標蛋白的表達[46]。水稻OsSGT1、大麥HvSGT1 和白菜BcSGT1 蛋白均可在BL21(DE3)菌株、1.0 mmol·L-1IPTG 以及37℃誘導(dǎo)溫度下表達[21,39,47],這與本研究SbSGT1 在BL21(DE3)菌株中表達結(jié)果一致;但本研究顯示SbSGT1 的最佳誘導(dǎo)溫度(25℃)和最佳IPTG 濃度(0.8 mmol·L-1)與上述報道有偏差,可能是所使用原核表達載體不一致所致。本研究中獲得的SbSGT1 蛋白相對分子質(zhì)量約為42 kDa,這與理論值(40.45 kDa)基本一致,且Western blot 也檢測到該條帶,推測該蛋白為表達的高粱SbSGT1 融合蛋白。
本研究對高粱SbSGT1 基因進行克隆,并對其原核表達條件進行了優(yōu)化,但SbSGT1 基因在真核的表達情況、蛋白互作以及結(jié)構(gòu)解析等仍需進一步研究。
本研究從高粱中成功克隆SbSGT1 基因,該基因全長1 095 bp,編碼364 個氨基酸。生物信息學(xué)分析結(jié)果與其他物種已報道的SGT1 基因信息基本一致,該基因編碼的蛋白質(zhì)分子量為40.45 kDa,等電點為5.0,具有親水性,發(fā)生信號肽剪切的可能性極小;亞細胞定位預(yù)測該蛋白主要定位在細胞質(zhì)中,進化樹分析發(fā)現(xiàn)其與玉米ZmSGT1 同源性較高。原核表達結(jié)果顯示,SbSGT1 蛋白在BL21(DE3)菌株中可溶性表達,最佳誘導(dǎo)溫度和 IPTG 濃度分別為 25℃和 0.8 mmol·L-1。本研究結(jié)果為SbSGT1 蛋白功能分析、結(jié)構(gòu)解析以及抗病功能的研究提供了一定的依據(jù)。